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Previous issue date: 2004-11-12 / Universidade Federal de Minas Gerais / The Brazilian coast extends over nearly 8,000km. Along the coastline, several marine
ecosystems can be found and determine a rich ichthyofauna, regarding both diversity
and number of species. The reef sites are characterized as the main reason for such
abundance. As a paradox, genetic studies aiming to characterize the several species and
populations from this environment are nearly absent in Brazil. Based on these
statements, the major goals of the present work were to analyze the population structure
and the relationship among marine fish species from a Perciform family, common at
coral reefs and important for aquarium trade Pomacanthidae. The selected species
were Centropyge aurantonotus, Holacanthus ciliaris, H. tricolor, Pomacanthus arcuatus
and P. paru, distributed over nearly all the Brazilian shore, besides another species
from the family Chaetodontidae, closely related to that focused in this work -
Chaetodon striatus. For that, molecular markers obtained from analyses of genomic
DNA by RAPD and microsatellites were adopted. The results based on RAPD profiles,
from a set of primers, indicate that species from both families show a high genetic
variability, with inter-specific and inter-populational differences. Specific marks were
found in all species, useful for the establishment of phylogenetic relationships and
taxonomical discrimination. The dendrogram generated allowed to distinguish each
species, revealing that those from a same genus are more closely related. Albeit the
values of gene flow and genetic identity were relatively high after inter-populational
comparisons, indications of structuring along the Brazilian Province were detected,
particularly if we consider φs t values. The most conspicuous species along the coast,
composing widely distributed populations, tended to exhibit greater genetic similarities
among samples. Animals from oceanic isolates were not quite differentiated from
inshore populations, but showed decreased variability. The isolation and
characterization of microsatellites in the species P. paru and H. ciliaris, according to
PIMA (PCR isolation of microsatellite arrays) methodology, allowed us to select several
microsatellite loci, useful for populational approaches. Primers flanking such regions
were designed and it was verified that one locus, called Pp02 was polymorphic and it is
present in Pomacanthus and Holacanthus representatives. The populational analyses of
the locus Pp02 in P. paru revealed significant values of Fst and genetic differentiation,
in agreement with population structure hypothesis. These data, described for the first
time, are useful for the conservation management of such exploited animals and for the
inferences of dispersal and populational composition of reef species from the Brazilian
Province. / A costa brasileira apresenta cerca de 8.000 Km de extensão. Ao longo do litoral, diversos ecossistemas marinhos podem ser encontrados e determinam uma ictiofauna rica tanto em diversidade quanto quantidade de espécies. Os ambientes recifais são caracterizados como os maiores responsáveis por tal abundância. Paradoxalmente, estudos genéticos que procurem caracterizar as muitas de suas espécies e populações são praticamente ausentes no Brasil. Com base nessas premissas, esse trabalho teve como objetivos básicos analisar a estrutura populacional e a relação entre espécies de peixes
marinhos em uma família de Perciformes comum nos recifes e importante para aquariofilia Pomacanthidae. As espécies selecionadas foram Centropyge aurantonotus, Holacanthus ciliaris, H. tricolor, Pomacanthus arcuatus e P. paru, com ocorrência ao longo de quase todo o litoral do Brasil, além de uma espécie adicional da família
Chaetodontidae, intimamente relacionada com a enfocada nesse trabalho - Chaetodon striatus. Para tal, marcadores moleculares a partir da análise do DNA genômico por RAPD e microssatélites foram adotados. Os resultados obtidos com as análises por
RAPD, a partir de um conjunto de primers, indicam que as espécies dessas famílias apresentam alta variabilidade genética, com diferenças interespecíficas e interpopulacionais. Marcas específicas foram detectadas em todas as espécies, úteis para a identificação e estabelecimento das relações filogenéticas das espécies. O dendrograma obtido permitiu distinguir cada espécie, revelando que aquelas do mesmo
gênero estão intimamente relacionadas. Embora os valores de fluxo gênico e de identidade genética tenham sido relativamente altos nas comparações
interpopulacionais, indícios de estruturação ao longo da Província do Brasil foram detectados, particularmente se considerarmos os valores de φs t. As espécies mais conspícuas ao longo do litoral, formando populações de distribuição mais ampla, foram as que apresentaram maior similaridade genética entre as regiões. Animais de isolados
oceânicos não se mostraram tão diferenciados de populações costeiras, mas apresentaram variabilidade reduzida. A prospecção de microssatélites nas espécies P. paru e H. ciliaris, pelo método PIMA (PCR isolation of microssatelite arrays) permi tiu a seleção de alguns locos microssatélites, informativos para abordagens populacionais. Os primers das regiões flanqueadoras desses locos foram desenhados e foi verificado
que um deles, denominado Pp02, é polimórfico e está presente nas espécies de Pomacanthus e Holacanthus. A análise populacional desse loco em P. paru revelou índices significativos de Fst e de diferenciação genética, condizentes com estruturação populacional. Esses dados, até então inéditos, são importantes para o manejo de
conservação desses animais comercialmente explorados e permitem inferir padrões de dispersão e composição populacional das espécies recifais da Província Brasileira.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/5392 |
| Date | 12 November 2004 |
| Creators | Affonso, Paulo Roberto Antunes de Mello |
| Contributors | Galetti Júnior, Pedro Manoel |
| Publisher | Universidade Federal de São Carlos, Programa de Pós-graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular, UFSCar, BR |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFSCAR, instname:Universidade Federal de São Carlos, instacron:UFSCAR |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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