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Modelagem lógica de senescência celular humana / Logic modeling of human cell senescence

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / After the progressive telomere shortening in successive cell divisions, normal
somatic cells undergo a growth arrest called cellular senescence that occurs due to
incomplete DNA replication. Senescence can also be activated by various types of
stressful stimuli, including aberrant oncogenic signaling, oxidative stress and DNA
damage. Senescent cells have limited proliferative capacity and seems to play an
important role in tumorigenesis. They are also involved in the inflammation
associated with aging and cancer progression. The process of senescence vary
significantly between cells, but the different paths for the aging, however, converge to
p53 and pRB. The network simulation is based on the model proposed by Porath
using a Boolean model to represent the state of activation of genes involved,
including the p16-pRb and p53-p21 pathways. The simulation includes 23 nodes
representing the genes of the regulatory network where one of them represents the
activation of the senescent state as a result of network processing. Experiments with
human fibroblasts indicate that inactivation of both genes, p53 and pRB is necessary
to block senescence. The simulations confirms that these pathways are able to
trigger senescence independently. The simulation shows that pRb is essential to
maintain the senescent state even when p16 and p53 are switched off, but the
simultaneous inactivation of both p53 and pRB blocks senescence. In addition, the
simulation shows that inactivation of the p16-pRb pathway is not essential to
preserve the senescent state, however when p53-p21 pathway is inactivated, the
senescent state is preserved. / Após o progressivo encurtamento dos telômeros em sucessivas divisões
celulares, as células somáticas normais se submetidas a uma parada do
crescimento chamado senescência celular que ocorre devido à replicação
incompleta do DNA. A senescência também pode ser ativada por diversos tipos de
estímulos estressantes, incluindo sinalização oncogênica aberrante, estresse
oxidativo e danos ao DNA. Células senescentes têm capacidade proliferativa
limitada e parecem desempenhar um papel importante na tumorigênese. Elas
também estão envolvidas na inflamação associada com o envelhecimento e
progressão do câncer. As vias de senescência variam significativamente entre as
células, mas os caminhos diversos para a senescência, no entanto, convergem para
p53 e pRb. A simulação é baseada no modelo proposto por Porath usando um
modelo booleano para representar o estado de ativação dos genes envolvidos,
incluindo as vias p16-pRb e a p53-p21. A simulação inclui 23 nós representando os
genes da rede regulatória onde um deles representa o estado celular senescente
que pode assumir estados Verdadeiro ou Falso como resultado do processamento
de rede Experiências com fibroblastos humanos indicam que a inativação de ambos
os genes, p53 e pRb, é necessária para bloquear a senescência. As simulações
confirmam que essas vias são capazes de acionar a senescência
independentemente. A simulação mostra que pRb é essencial para a manutenção
do estado senescente mesmo se p16 e p53 forem desligados, no entanto a
inativação simultânea de ambos p53 e pRb bloqueia senescência. Além disso, a
simulação mostra que a inativação da via p16-pRb não é essencial para preservar o
estado senescente, no entanto, quando a via p53-p21 é inativada, o estado
senescente é preservado.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufsm.br:1/9235
Date12 December 2012
CreatorsFerreira, Cecilia Perobelli
ContributorsMombach, Jose Carlos Merino, Zimmer, Fábio Mallmann, Vêncio, Ricardo Zorzetto Nicoliello
PublisherUniversidade Federal de Santa Maria, Programa de Pós-Graduação em Física, UFSM, BR, Física
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFSM, instname:Universidade Federal de Santa Maria, instacron:UFSM
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
Relation100500000006, 400, 500, 300, 300, 300, 3f068138-f520-468d-b0ab-7f831fb45733, 23fd4c63-409e-4b5a-a147-a9f7014ed210, d7b3340c-46e5-4175-a809-8538c22a1b92, d5dd3b8f-1fe6-464a-8d1a-9eb0bf929eda

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