MiRNR molekulės yra 21-24 nukleotidų ilgio dvigrandės RNR molekulės. Jos pačios nieko nekoduoja. Viena svarbiausių jų funkcijų yra genų raiškos valdymas potranskripciniame lygmenyje. Jas koduoja daugelis organizmų. miRNR brendimas skiriasi priklausomai nuo ląstelės tipo (gyvūninė ar augalinė). Augalų ląstelėse yra papildomas etapas, kuriu metu dvigrandė miRNR yra metilinama HEN1 baltymo. HEN1 metiltransferazė yra neseniai augaluose identifikuotas baltymas. HEN1 baltymas yra didelis (106,6 kDa), daugiadomeninis baltymas, kurio savybės mažai ištirtos. Jis vienintelis sugeba modifikuoti mažąsias RNR molekules pernešdama metilo grupę nuo kofaktoriaus S-adenozil-L-metionino ant 3′ galinio nt 2′ -OH grupės. HEN1 baltymas yra labai specifiškas savo substratui, kurį atpažįsta ne pagal nt seką, o pagal jo antrinę struktūrą ir ilgį. (Chen, 2005) Pagal homologiją su kitais baltymais HEN1 buvo nustatyti konservatyvūs motyvai. (Č. Venclovas) N-galinėje dalyje nustatyti du RNR prijungiantys (dvRNR-PD ir La- tipo) motyvai. Naudojant sutrumpintus baltymus ir išanalizavus juos elektroforetinio judrumo poslinkio PAA gelyje metodu buvo nustatyta, kad dvRNR-PD atlieka RNR prijungimo funkciją. dvRNR-PD buvo sumodeliuota erdvinė struktūra. Išanalizavus ją buvo nustatytos keturios aminorūgščių liekanos (12K, 22K, 69K ir 70K), kurios gali būti svarbios formuojantis baltymo ir RNR kompleksui. Ištyrus mutantinius baltymus, turinčius šių lizinų pakaitas buvo nustatyta, kad 12-as lizinas... [toliau žr. visą tekstą] / MiRNAs are 21-24 nt length double-stranded RNA molecules which do not encode anything. They play mayor role in post-transcriptional gene regulation level. These molecules are encoded by various organisms. miRNA maturation depends on the type of the cell (animal or plant). There is an additional step in plants when double stranded miRNA is methylated by HEN1 protein. HEN1 methyltransferase is a novel protein identified in plants. HEN1 protein has high molecular weight (106,6 kDa) and it is multistructural. Its features are not yet investigated. This is the only protein which modifies small RNA molecules by transferring methyl group from cofactor S-adenosil-L-methyonin to the 2′ -OH group of the last 3′ nt. HEN1 proteins is very specific to its substrate and recognizes it not by the nt sequence but by the molecule length and structure. After analysis of homologous proteins HEN1 conservative motives were identified. (Č. Venclovas) Two RNA binding motives (dsRNA-BM and La-type) were identified in the N-terminal region. By using shortened proteins and analyzing those by electrophoretic gel mobility in PAA gel shift it was find out that dsRNA-BM is responsible for binding miRNA. Theoretical structure model was made for dsRNA-BM. After analyzing it four amino acid residues (12K, 22K, 69K, and 70K) which can be important for the formation of protein and RNA complex were identified. After examination of mutant proteins with changed lysines it was determined that 12th... [to full text]
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LABT_ETD/oai:elaba.lt:LT-eLABa-0001:E.02~2009~D_20101125_190741-63207 |
| Date | 25 November 2010 |
| Creators | Juknaitė, Lina |
| Contributors | Vilkaitis, Giedrius, Vilnius University |
| Publisher | Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), Vilnius University |
| Source Sets | Lithuanian ETD submission system |
| Language | Lithuanian |
| Detected Language | Unknown |
| Type | Master thesis |
| Format | application/pdf |
| Source | http://vddb.laba.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2009~D_20101125_190741-63207 |
| Rights | Unrestricted |
Page generated in 0.0026 seconds