Las Glicosiltransferasas (GTs) son las enzimas responsables de la síntesis de
glicanos, las moléculas orgánicas más abundantes en la naturaleza. Su relevancia
biológica hace necesario el conocimiento de su mecanismo catalítico, que es todavía
cuestión de debate en el caso de las GTs con retención de configuración.
La presente tesis doctoral se centra en el mecanismo catalítico de estas enzimas
desde un punto de vista computacional. Más específicamente, se realizó un estudio
utilizando aproximaciones de la Mecánica Cuántica y la Mecánica Molecular
(QM/MM) para tres GTs con retención de configuración: Lipopolisacaril-α-1,4-
galactosiltransferasa C de Neisseria meningitides (LgtC), α-1,3-galactosiltransferasa
bovina (α1,3-GalT) y UDP-N-acetilgalactosamina:polipeptido N-acetil-α-
galactosaminiltransferasa 2 humana (ppGalNAcT-2). Los diferentes mecanismos
catalíticos propuestos en la literatura son considerados y los factores responsables de
la eficiencia catalítica de las GTs con retención de configuración son analizados. / Glycosyltransferases (GTs) are responsible for glycans’ biosynthesis, the most
abundant organic molecules in nature. Their biological relevance makes necessary the
knowledge of their catalytic mechanism, which in the case of retaining GTs is still a
matter of debate.
The present thesis is focused on the catalytic mechanism of these enzymes
from the computational point of view. More specifically, a full-enzyme hybrid
quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) study is performed for three
retaining GTs: Lipopolysaccharyl-α-1,4-galactosyltransferase C from Neisseria
meningitides (LgtC), bovine α-1,3-galactosyltransferase (α1,3-GalT) and human
UDP-N-acetylgalactosamine:polypeptide N-acetyl-α-galactosaminyltransferase 2
(ppGalNAcT-2). The different proposed mechanisms are considered and the factors
responsible for the catalytic efficiency of ret-GTs are analyzed.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:TDX_UAB/oai:www.tdx.cat:10803/133280 |
| Date | 18 October 2013 |
| Creators | Gómez Martínez, Hansel |
| Contributors | Masgrau i Fontanet, Laura, Lluch López, Josep M., Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Química |
| Publisher | Universitat Autònoma de Barcelona |
| Source Sets | Universitat Autònoma de Barcelona |
| Language | English |
| Detected Language | Spanish |
| Type | info:eu-repo/semantics/doctoralThesis, info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| Format | 200 p., application/pdf |
| Source | TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) |
| Rights | ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs., info:eu-repo/semantics/openAccess |
Page generated in 0.0124 seconds