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Detección y caracterización genotípica de circovirus porcino tipo 2 en Chile

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario. / El circovirus porcino tipo 2 (PCV2, del Inglés Porcine Circovirus Type 2)
pertenece a la familia circoviridae, la cual está constituida por virus pequeños y sin
envoltura, con un genoma de ADN circular de hebra simple. El genoma de PCV2
codifica en forma divergente para dos marcos de lectura abiertos (ORFs, del Inglés Open
Reading Frames) involucrados en la formación de la cápside (cap) y el complejo de
replicación viral. Este virus es considerado el agente etiológico principal de una
enfermedad emergente en nuestro país, denominada Síndrome del Desmedro
Multisistémico Postdestete (PMWS, del Inglés Postweaning Multisystemic Wasting
Sindrome) en cerdos, el cual se caracteriza por generar una inmunosupresión severa, con
pérdida progresiva de peso y deterioro general de la condición corpórea, lo que
acompañado por una serie de infecciones concomitantes, llevan a la muerte prematura
del animal, con las consecuentes pérdidas económicas en los países productores.
Si bien es un síndrome ampliamente distribuido en el mundo y muy común en
todos los planteles productores de cerdos, la presencia de PCV2 en Chile no ha sido del
todo demostrada. El objetivo de esta memoria de título fue detectar la presencia de
circovirus porcino tipo 2 en Chile y caracterizar su genotipo.
La detección del virus se realizó por medio de PCR desde muestras de linfonodos
inguinales superficiales de cerdos con signología PMWS, pertenecientes a 3 planteles
porcinos de la zona central de Chile, analizándose al menos 5 casos por plantel.
El gen orf2 del virus fue detectado en el 100 % de las muestras analizadas, tanto
por PCR simple como por PCR semi-cuantitativo. Por otra parte, con el fin de realizar
una caracterización genotípica del virus, el gen orf2 fue sometido a un análisis de la
longitud de los polimorfismos de los fragmentos de restricción (RFLP, del inglés
restriction fragment length polymorphism), no encontrándose diversidad genética, intrae
inter-planteles, entre las muestras analizadas, las cuales presentaron un patrón RFLP
igual a un clon europeo usado como control.
Posteriormente se realizó la secuenciación nucleotídica en ambos sentidos, tras el
clonamiento, de cuatro secuencias aisladas de los diferentes predios. Las secuencias
presentaron un 94% de identidad nucleotídica entre si y su análisis filogenético las
agrupó en un clado específico, junto con aislados suecos y algunos aislados chinos.
Además, este análisis junto a revisión bibliográfica reciente, permitió diferenciar las
secuencias en dos subgrupos o subgenotipos del virus, 1 y 2. De esta manera fue posible
concluir que el circovirus porcino tipo 2 esta presente en nuestro país y que las cepas
analizadas corresponden al subgrupo 1, presentando una estrecha relación con genotipos
de origen Europeo. / Porcine Circovirus pig type 2 belong to the family circoviridae, constituted by
small virus without envelope, with a simple circular strand DNA genome, which
codifies in divergent form for two open reading frames (ORFs) involved in the capsid
formation (Cap) and the viral replication complex. This virus is considered the mayor
the etiologic agent of an emergent disease in our country, denominated Postweaning
Multisystemic Wasting Syndrome, PMWS, in pigs, which is characterized to generate a
severe immunosupression, with a progressive weight loss and general decline in the
fitness condition, which is accompanied by a series of concomitant infections, with the
premature death of the animal, and the consequent economic losses in the pig-producing
countries. Although it is a syndrome wide world distributed and very common in all the
pig-producing establishments, the presence of PCV2 in Chile has not absolutely been
demonstrated. The goal of this thesis was to detect the presence of porcine circovirus
type 2 in Chile and to characterize its genotype.
The detection of the virus was performed by PCR from lymph nodes samples of
PMWS-pigs, bellowing to 3 pig- producing establishments from the central zone of
Chile, analyzing 5 cases per establishment at least. The orf2 gene virus was detected in
100% of the analyzed samples, by simplex PCR and by semi-quantitative PCR. On the
other hand, in order to perform the virus genotypic characterization, the orf2 gene
amplified was analyzed by RFLP, not founding genetic diversity among the analyzed
samples intra- and inter-establishments; which presented the same RFLP pattern than
european isolated clone used as ingroup.
The nucleotide sequenciation, after cloning, was performed in both strand in four
isolated sequences from different pig-producing establishment. The sequences presented
a 94% of nucleotidic identity each other. The phylogenetic analysis clustered them in
specific clade, near to some swedish and chinese isolated. This analysis, together to
recent bibliographical revision, allowed to differentiate the sequences in two sub-groups,
1 and 2. Taken together these results shows that porcine circovirus type 2 is present in
our country and that the analyzed isolated correspond to sub-group 1, presenting a near
relation with european isolated. / Trabajo financiado por los proyectos: Bicentenario Banco Mundial-Conicyt PSD2; Iniciación en Investigación de la Vicerrectoría de Investigación y Desarrollo de la Universidad de Chile VID I07/15-2 y el Fondo de Investigación Veterinaria FIV 2007 de la Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias de la Universidad de Chile.

Identiferoai:union.ndltd.org:UCHILE/oai:repositorio.uchile.cl:2250/144364
Date January 2008
CreatorsNoriega Alvarado, Jorge Andrés
ContributorsBucarey Vivanco, Sergio, Sáenz Iturriaga, Leonardo, Celedón Venegas, María Orfelia
PublisherUniversidad de Chile
Source SetsUniversidad de Chile
LanguageSpanish
Detected LanguageSpanish
TypeTesis
RightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Chile, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/cl/

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