Ο περιορισμός αλυσιδωτών μακρομορίων σε νανο-πόρους με διαστάσεις συγκρίσιμες με τις χαρακτηριστικές διαστάσεις της μοριακής αλυσίδας όπως και η δυνατότητα αποδέσμευσης (απελευθέρωσης) της αλυσίδας από το νανο-πόρο παίζουν σημαντικό ρόλο σε πολλές βιολογικές διαδικασίες και βιοτεχνολογικές εφαρμογές. Η διαδικασία της αποδέσμευσης μιας αρχικά εγκλωβισμένης πολυμερικής αλυσίδας εξαρτάται από μια σειρά παράγοντες όπως: το μοριακό βάρος της αλυσίδας, το μέγεθος του νανο-δοχείου σε σχέση με το μήκος της αλυσίδας, το σχήμα του νανο-δοχείου, το μέγεθος του πόρου διαφυγής/εισόδου της αλυσίδας στο νανοδοχείο, η ποιότητα του διαλύτη εντός και εκτός του νανοδοχείου κ.α. Το φαινόμενο και ο ρόλος των παραμέτρων που το επηρεάζουν θα μελετηθούν με αναλυτικές μεθόδους περιγράφοντας το μακρομόριο με μοντέλα ιδανικών αλυσίδων και το νανοδοχείο ως ένα αδιαπέραστο περιορισμό (σφαιρικού σχήματος) με ένα πόρο διαφυγής για την αλυσίδα. Η μελέτη αυτή αποτελεί το πρώτο βήμα για την εφαρμογή ρεαλιστικών μοντέλων για την περιγραφή των διαδικασιών δέσμευσης/αποδέσμευσης γραμμικών πολυμερών σε σφαιρικές κοιλότητες νανοσκοπικών μεγεθών. / The confinement of the macromolecules into nanopores with dimensions translocation of the chain through the nanopore has a key role in many biological processes and biotechnological applications. The process of packing/releasing of the polymer chain depends on many factors like molecular weight of the chain, the size of the nano-container in comparison with the length of the chain, the shape of the nano-container, the size of the nanopore, the quality of the solvent into and out of the nano-container etc.
In the present work we will study the translocation of an ideal chain, confined initially into an impenetrable spherical cavity, through a tiny pore on the surface of the spherical cavity. Using analytical tools and Monte Carlo simulations we examine the effects of the molecular weight and the size of the spherical cavity in the translocation process. This study is a first step towards more realistic descriptions of the confinement/translocation problem of linear polymers from nanopores.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:upatras.gr/oai:nemertes:10889/7254 |
| Date | 30 April 2014 |
| Creators | Χατζηάδη, Αργυρώ |
| Contributors | Βανακάρας, Αλέξανδρος, Chatziadi, Argiro, Φωτεινός, Δημήτριος, Μπακανδρίτσος, Άρης |
| Source Sets | University of Patras |
| Language | gr |
| Detected Language | Greek |
| Type | Thesis |
| Rights | 12 |
| Relation | Η ΒΚΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου της. |
Page generated in 0.0956 seconds