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Aspectos genéticos de duas espécies de mamíferos marinhos da costa do Brasil : Pontoporia blainvillei e Eubalaena australis

Heinzelmann, Larissa Schemes January 2008 (has links)
O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é um sistema genético reconhecidamente polimórfico em populações humanas. Em porções específicas dos genes que compõem o MHC de populações humanas também foi evidenciada a ação da seleção natural em nível molecular. Em várias espécies de vertebrados onde estes genes foram estudados diferentes níveis de variação, composição gênica e organização foram detectados, mantendo, entretanto, as características que os tornam tão interessante de ser estudados. Para mamíferos marinhos, as questões sobre a variação no MHC servem de pano de fundo para o entendimento sobre o sistema imunológico destas espécies e suas particularidades em relação ao ambiente marinho e a evolução destes genes em organismos não-modelos. No presente trabalho, duas espécies de cetáceos, a toninha ou franciscana (Pontoporia blainvillei) e a baleia-franca-austral (Eubalaena australis), foram investigadas quanto aos níveis de variação no gene DQB1 do MHC. O segundo exon da cadeia beta do gene DQ foi amplificado em 25 amostras de toninha e 18 amostras de baleia franca. Os fragmentos de 212pb (pares de base) resultantes do processo de amplificação foram clonados e, tiveram analisados por seqüenciamento 171pb correspondentes ao sítio de ligação ao peptídeo antigênico (PBR). Uma amostra de toninha e um par mãe-filhote de baleia-franca-austral foram analisadas quanto à expressão do gene DQB a partir de amostras de pele. A evidência de seleção natural a nível molecular nesta porção do gene é confirmada por um excesso de substituições não sinônimas em relação às substituições sinônimas (em um contexto de neutralidade as substituições sinônimas acumulam-se na mesma taxa de mutações) através da razão dN (não sinônimas) e dS (sinônimas). Para confirmar os desvios da neutralidade (Ho= dN/dS=1), foi usada a estatística z. Os valores de dN/dS para toninha e baleia-franca-austral foram, respectivamente, dN/dS = 2,32 (p=0,014) e dN/dS =3,75 (p= 0,001). Estes valores, as características das seqüências e a evidência de expressão desses genes na pele de cetáceos estão de acordo com os pressupostos de seleção positiva para esta região do gene e sugerem funcionalidade para estes genes nestas duas espécies. Há evidências de mais de uma cópia do gene para baleia-franca-austral. Foram descritos 6 alelos para toninha e 17 alelos para baleia-franca-austral sendo que um dos alelos é compartilhado entre as duas espécies, sugerindo que essa linhagem alélica é anterior à divergência entre odontocetos e misticetos. Paralelamente a este trabalho, o cariótipo de toninha foi descrito através de um processo de cultivo celular a partir da córnea de dois exemplares recém-mortos. Seu número cromossômico 2n=44 corrobora a estabilidade cariotípica descrita para cetáceos. / The Major Histocompatibility Complex is a highly polimorphic genetic system described to human populations. It is clear that a particular region from these genes is under natural selection which results in different patterns of variation from those expected under neutrality. In other vertebrates these genes were studied, these special characteristics seems to be preserved despite specific genomic organization and variation levels. In marine mammals, questions adressed to MHC molecular variation are focused in questions concerned on environmental restrictions and molecular evolution in non-model organisms. In the present study, two marine mammal species were surveyed concerning genetic variability using the gene DQB exon 2. Samples from 25 franciscana dolphins (Pontoporia blainvillei) and 18 southern right whales (Eubalaena australis) were used to amplify a 212bp (base pair) fragment from DQB exon 2. The 171bp resulting fragment was sequenced and analized in relation to the molecular level evidence of selection. Rates of nonsynonymous (dN) and synonymous (dS) base pair substitution and departures from neutrality for dN/dS (z statistics) were calculated. For both species examined, molecular evidence of selection was confirmed. The dN/dS ratios to franciscana and southern right whale were 2.32 (p=0.014) and 3.75 (p=0.001), respectively. These values, combined to data on DQB gene expression in franciscana and southern right whale skin and less restrictive aminoacid usage in both species, suggest a functional signature to sequences cetacean derived. Additionally, 6 alleles were described to franciscana dolphins and 17 to southern right whales. One more evidence of selection acting in this particular genomic region is provided from the fact that both species share one allele, suggesting that this allelic lineage was present before the splitting between mysticeti and odontoceti. To provide addtional information on franciscana dolphins the karyotype of P. blainvillei is presented. The karyotype was obtained from corneal culture of two dead animals. The diploid number 44 confirms the clear prevalence of this pattern among cetaceans.
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Aspectos genéticos de duas espécies de mamíferos marinhos da costa do Brasil : Pontoporia blainvillei e Eubalaena australis

Heinzelmann, Larissa Schemes January 2008 (has links)
O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é um sistema genético reconhecidamente polimórfico em populações humanas. Em porções específicas dos genes que compõem o MHC de populações humanas também foi evidenciada a ação da seleção natural em nível molecular. Em várias espécies de vertebrados onde estes genes foram estudados diferentes níveis de variação, composição gênica e organização foram detectados, mantendo, entretanto, as características que os tornam tão interessante de ser estudados. Para mamíferos marinhos, as questões sobre a variação no MHC servem de pano de fundo para o entendimento sobre o sistema imunológico destas espécies e suas particularidades em relação ao ambiente marinho e a evolução destes genes em organismos não-modelos. No presente trabalho, duas espécies de cetáceos, a toninha ou franciscana (Pontoporia blainvillei) e a baleia-franca-austral (Eubalaena australis), foram investigadas quanto aos níveis de variação no gene DQB1 do MHC. O segundo exon da cadeia beta do gene DQ foi amplificado em 25 amostras de toninha e 18 amostras de baleia franca. Os fragmentos de 212pb (pares de base) resultantes do processo de amplificação foram clonados e, tiveram analisados por seqüenciamento 171pb correspondentes ao sítio de ligação ao peptídeo antigênico (PBR). Uma amostra de toninha e um par mãe-filhote de baleia-franca-austral foram analisadas quanto à expressão do gene DQB a partir de amostras de pele. A evidência de seleção natural a nível molecular nesta porção do gene é confirmada por um excesso de substituições não sinônimas em relação às substituições sinônimas (em um contexto de neutralidade as substituições sinônimas acumulam-se na mesma taxa de mutações) através da razão dN (não sinônimas) e dS (sinônimas). Para confirmar os desvios da neutralidade (Ho= dN/dS=1), foi usada a estatística z. Os valores de dN/dS para toninha e baleia-franca-austral foram, respectivamente, dN/dS = 2,32 (p=0,014) e dN/dS =3,75 (p= 0,001). Estes valores, as características das seqüências e a evidência de expressão desses genes na pele de cetáceos estão de acordo com os pressupostos de seleção positiva para esta região do gene e sugerem funcionalidade para estes genes nestas duas espécies. Há evidências de mais de uma cópia do gene para baleia-franca-austral. Foram descritos 6 alelos para toninha e 17 alelos para baleia-franca-austral sendo que um dos alelos é compartilhado entre as duas espécies, sugerindo que essa linhagem alélica é anterior à divergência entre odontocetos e misticetos. Paralelamente a este trabalho, o cariótipo de toninha foi descrito através de um processo de cultivo celular a partir da córnea de dois exemplares recém-mortos. Seu número cromossômico 2n=44 corrobora a estabilidade cariotípica descrita para cetáceos. / The Major Histocompatibility Complex is a highly polimorphic genetic system described to human populations. It is clear that a particular region from these genes is under natural selection which results in different patterns of variation from those expected under neutrality. In other vertebrates these genes were studied, these special characteristics seems to be preserved despite specific genomic organization and variation levels. In marine mammals, questions adressed to MHC molecular variation are focused in questions concerned on environmental restrictions and molecular evolution in non-model organisms. In the present study, two marine mammal species were surveyed concerning genetic variability using the gene DQB exon 2. Samples from 25 franciscana dolphins (Pontoporia blainvillei) and 18 southern right whales (Eubalaena australis) were used to amplify a 212bp (base pair) fragment from DQB exon 2. The 171bp resulting fragment was sequenced and analized in relation to the molecular level evidence of selection. Rates of nonsynonymous (dN) and synonymous (dS) base pair substitution and departures from neutrality for dN/dS (z statistics) were calculated. For both species examined, molecular evidence of selection was confirmed. The dN/dS ratios to franciscana and southern right whale were 2.32 (p=0.014) and 3.75 (p=0.001), respectively. These values, combined to data on DQB gene expression in franciscana and southern right whale skin and less restrictive aminoacid usage in both species, suggest a functional signature to sequences cetacean derived. Additionally, 6 alleles were described to franciscana dolphins and 17 to southern right whales. One more evidence of selection acting in this particular genomic region is provided from the fact that both species share one allele, suggesting that this allelic lineage was present before the splitting between mysticeti and odontoceti. To provide addtional information on franciscana dolphins the karyotype of P. blainvillei is presented. The karyotype was obtained from corneal culture of two dead animals. The diploid number 44 confirms the clear prevalence of this pattern among cetaceans.
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Aspectos genéticos de duas espécies de mamíferos marinhos da costa do Brasil : Pontoporia blainvillei e Eubalaena australis

Heinzelmann, Larissa Schemes January 2008 (has links)
O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é um sistema genético reconhecidamente polimórfico em populações humanas. Em porções específicas dos genes que compõem o MHC de populações humanas também foi evidenciada a ação da seleção natural em nível molecular. Em várias espécies de vertebrados onde estes genes foram estudados diferentes níveis de variação, composição gênica e organização foram detectados, mantendo, entretanto, as características que os tornam tão interessante de ser estudados. Para mamíferos marinhos, as questões sobre a variação no MHC servem de pano de fundo para o entendimento sobre o sistema imunológico destas espécies e suas particularidades em relação ao ambiente marinho e a evolução destes genes em organismos não-modelos. No presente trabalho, duas espécies de cetáceos, a toninha ou franciscana (Pontoporia blainvillei) e a baleia-franca-austral (Eubalaena australis), foram investigadas quanto aos níveis de variação no gene DQB1 do MHC. O segundo exon da cadeia beta do gene DQ foi amplificado em 25 amostras de toninha e 18 amostras de baleia franca. Os fragmentos de 212pb (pares de base) resultantes do processo de amplificação foram clonados e, tiveram analisados por seqüenciamento 171pb correspondentes ao sítio de ligação ao peptídeo antigênico (PBR). Uma amostra de toninha e um par mãe-filhote de baleia-franca-austral foram analisadas quanto à expressão do gene DQB a partir de amostras de pele. A evidência de seleção natural a nível molecular nesta porção do gene é confirmada por um excesso de substituições não sinônimas em relação às substituições sinônimas (em um contexto de neutralidade as substituições sinônimas acumulam-se na mesma taxa de mutações) através da razão dN (não sinônimas) e dS (sinônimas). Para confirmar os desvios da neutralidade (Ho= dN/dS=1), foi usada a estatística z. Os valores de dN/dS para toninha e baleia-franca-austral foram, respectivamente, dN/dS = 2,32 (p=0,014) e dN/dS =3,75 (p= 0,001). Estes valores, as características das seqüências e a evidência de expressão desses genes na pele de cetáceos estão de acordo com os pressupostos de seleção positiva para esta região do gene e sugerem funcionalidade para estes genes nestas duas espécies. Há evidências de mais de uma cópia do gene para baleia-franca-austral. Foram descritos 6 alelos para toninha e 17 alelos para baleia-franca-austral sendo que um dos alelos é compartilhado entre as duas espécies, sugerindo que essa linhagem alélica é anterior à divergência entre odontocetos e misticetos. Paralelamente a este trabalho, o cariótipo de toninha foi descrito através de um processo de cultivo celular a partir da córnea de dois exemplares recém-mortos. Seu número cromossômico 2n=44 corrobora a estabilidade cariotípica descrita para cetáceos. / The Major Histocompatibility Complex is a highly polimorphic genetic system described to human populations. It is clear that a particular region from these genes is under natural selection which results in different patterns of variation from those expected under neutrality. In other vertebrates these genes were studied, these special characteristics seems to be preserved despite specific genomic organization and variation levels. In marine mammals, questions adressed to MHC molecular variation are focused in questions concerned on environmental restrictions and molecular evolution in non-model organisms. In the present study, two marine mammal species were surveyed concerning genetic variability using the gene DQB exon 2. Samples from 25 franciscana dolphins (Pontoporia blainvillei) and 18 southern right whales (Eubalaena australis) were used to amplify a 212bp (base pair) fragment from DQB exon 2. The 171bp resulting fragment was sequenced and analized in relation to the molecular level evidence of selection. Rates of nonsynonymous (dN) and synonymous (dS) base pair substitution and departures from neutrality for dN/dS (z statistics) were calculated. For both species examined, molecular evidence of selection was confirmed. The dN/dS ratios to franciscana and southern right whale were 2.32 (p=0.014) and 3.75 (p=0.001), respectively. These values, combined to data on DQB gene expression in franciscana and southern right whale skin and less restrictive aminoacid usage in both species, suggest a functional signature to sequences cetacean derived. Additionally, 6 alleles were described to franciscana dolphins and 17 to southern right whales. One more evidence of selection acting in this particular genomic region is provided from the fact that both species share one allele, suggesting that this allelic lineage was present before the splitting between mysticeti and odontoceti. To provide addtional information on franciscana dolphins the karyotype of P. blainvillei is presented. The karyotype was obtained from corneal culture of two dead animals. The diploid number 44 confirms the clear prevalence of this pattern among cetaceans.
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Organoclorados em Toninhas, Pontoporia blainvillei (MAMMALIA: CETACEA) da região costeira do Estado de São Paulo, Brasil / Organochlorines in Franciscana dolphins, Pontoporia blainvillei (MAMMALIA: CETACEA) from the coast off São Paulo State, Brazil

Alonso, Mariana Batha 04 August 2008 (has links)
Os organoclorados constituem um dos principais grupos de poluentes que afetam os ecossistemas devido a sua grande persistência no ambiente e toxicidade para os organismos. A toninha, Pontoporia blainvillei, é um cetáceo costeiro, o único golfinho brasileiro considerado ameaçado de extinção por conta das atividades antrópicas. O objetivo desse trabalho foi avaliar a ocorrência de organoclorados em amostras de gordura subcutânea de indivíduos de Pontoporia blainvillei coletados na região costeira do Estado de São Paulo. A metodologia de extração e purificação das amostras foi testada e otimizada conforme procedimentos descritos na literatura. Foram realizadas as análises em 53 amostras de toninha (Pontoporia blainvillei): 29 machos e 24 fêmeas. Todas as concentrações de organoclorados apresentaram valores maiores nos machos, em comparação com as fêmeas de mesma maturidade. As concentrações dos compostos organoclorados nas toninhas do litoral paulista variaram, em ng.g-1 lipídios nos PCBs de 326 a 42.185, DDTs de 107 a 7.185, HCHs n.d. a 46, CHLs n.d. a 126, HCB < 2 a 133 e Mirex < 7 a 259. A razão DDTs/PCBs foi menor que 0,6 indicando uma maior contribuição industrial do que agrícola na área de estudo. Houve diferenças significativas dos valores dos OCs nas toninhas das localidades do litoral de São Paulo, com as maiores concentrações ocorrendo na Baixada Santista. / Organochlorines are one of the main pollutant groups that affect the ecosystems due to their environmental persistence and toxicity to the organisms. Franciscana dolphin, Pontoporia blainvillei, is a coastal cetacean, the only Brazilian dolphin considered threatened with extinction, due to the human activities. The aim of this work was evaluate the occurrence of organochlorines in the blubber samples of Pontoporia blainvillei collected on the coast of São Paulo State. The extraction and purification methodology was tested and optimized according to proceedings described in literature. A total of 53 individuals were analyzed: 29 males and 24 females. Organochlorine concentrations were higher in males when comparing to females with the same sexual maturity. PCBs were the predominant compounds (326 - 42185 ng g-1 lipid weight), followed by DDTs (107 - 7185 ng g-1 lipid wt), HCHs (n.d. - 46 ng g-1 lipid wt), CHLs (n.d. - 126 ng g-1 lipid wt), HCB (< 2 - 133 ng g-1 lipid wt) and Mirex (< 7 - 259 ng g-1 lipid wt). The ratio DDTs/PCBs was lesser than 0.6 indicating a major industrial than agricultural contribution in the study area. There were significant differences between the OCs values in franciscanas from 3 localities of São Paulo State coast: with the higher concentrations occurring in Baixada Santista.
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Helmintos gastrointestinais de toninha, Pontoporia blainvillei (Cetartiodactyla; Pontoporiidae), do litoral de São Paulo, Brasil. / Gastrointestinal helminths of porpoise, Pontoporia blainvillei (Cetartiodactyla; Pontoporiidae), of the coast São Paulo, Brazil.

Seabra, Camila Brandão 20 February 2018 (has links)
Submitted by Camila Brandão Seabra null (cah_brandao@hotmail.com) on 2018-03-17T20:03:34Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Camila_ versão FINAL.pdf: 2400383 bytes, checksum: 5a0565b074f6f5c5b438fa06ae1b821e (MD5) / Rejected by Disleide Silvia Valerio Gounella null (disleide@clp.unesp.br), reason: Boa tarde. Favor fazer as seguintes alterações e inclusões: - alterar o título do arquivo, o mesmo deve ter o nome do trabalho; - Incluir palavras chaves em inglês; - Incluir resumo em inglês. Qualquer dúvida, entre em contato. abs. Disleide Silvia Valerio Gounella Bibliotecária CLP - São Vicente Fone: (13)3569-7154 Mailto: disleide@clp.unesp.br skype: disleidesilviavaleriogounella on 2018-03-19T20:13:46Z (GMT) / Submitted by Camila Brandão Seabra null (cah_brandao@hotmail.com) on 2018-03-20T15:13:01Z No. of bitstreams: 1 Helmintos gastrointestinais de toninha, Pontoporia blainvillei..pdf: 2400383 bytes, checksum: 5a0565b074f6f5c5b438fa06ae1b821e (MD5) / Rejected by Disleide Silvia Valerio Gounella null (disleide@clp.unesp.br), reason: boa tarde. O arquivo com o nome do título do trabalho não está aparecendo corretamente. Em alguns lugares aprece como"dissertação de mestrado". Favor alterar. abs. Disleide on 2018-03-20T19:19:11Z (GMT) / Submitted by Camila Brandão Seabra null (cah_brandao@hotmail.com) on 2018-03-24T00:04:14Z No. of bitstreams: 1 Helmintos gastrointestinais de toninha Pontoporia blainvillei do litoral de São Paulo Brasil.pdf: 1190582 bytes, checksum: 129440c881f7848abe0640e15defd45a (MD5) / Rejected by Disleide Silvia Valerio Gounella null (disleide@clp.unesp.br), reason: Bom dia. Por favor, coloque as palavras chaves em português e depois em inglês, mesmo que os termos se repitam; Não estou conseguindo abrir o arquivo com o texto da dissertação, favor, retira-lo e inseri-lo novamente. Tirar o nome "dissertação:" do nome do arquivo. Deixar somente o título do trabalho. abs. Disleide Silvia Valerio Gounella Bibliotecária CLP - São Vicente Fone: (13)3569-7154 Mailto: disleide@clp.unesp.br skype: disleidesilviavaleriogounella on 2018-03-26T14:54:25Z (GMT) / Submitted by Camila Brandão Seabra null (cah_brandao@hotmail.com) on 2018-04-02T14:53:38Z No. of bitstreams: 1 Helmintos gastrointestinais de toninha Pontoporia blainvillei do litoral de São Paulo Brasil.pdf: 1190582 bytes, checksum: 129440c881f7848abe0640e15defd45a (MD5) / Approved for entry into archive by Disleide Silvia Valerio Gounella null (disleide@clp.unesp.br) on 2018-04-03T13:56:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 seabra_cb_me_svic.pdf: 1190582 bytes, checksum: 129440c881f7848abe0640e15defd45a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-03T13:56:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 seabra_cb_me_svic.pdf: 1190582 bytes, checksum: 129440c881f7848abe0640e15defd45a (MD5) Previous issue date: 2018-02-20 / As infecções parasitárias são muito comuns em mamíferos marinhos e o estudo da helmintofauna em cetáceos tem sido utilizado como uma ferramenta para determinar aspectos biológicos e ecológicos dos hospedeiros, entre eles a definição de nichos, rotas de dispersão, hábitos alimentares e diferenciação de estoques populacionais. A toninha, Pontoporia blainvillei, pequeno cetáceo endêmico do Atlântico Sul Ocidental tem como principal causa de mortalidade em toda sua área de distribuição a captura acidental. O trato gastrointestinal de 87 toninhas, coletados de carcaças provenientes de captura acidental ou encalhe, no período de 2005 a 2017, no litoral de São Paulo foram analisados para identificar as espécies componentes da fauna parasitária gastrointestinal e avaliar variações nos níveis de infecção conforme o sexo, fase de desenvolvimento, sazonalidade e área de distribuição dos hospedeiros. Foram coletados 4.171 espécimes de helmintos, classificadas em cinco espécies: Anisakis sp. (Nematoda: Anisakidae); Andracantha sp., Bolbosoma turbinella, Corynosoma cetaceum (Acanthocephala: Polymorphidae), e Synthesium pontoporiae (Trematoda: Brachycladiidae). Os helmintos C. cetaceum, exclusivo do estômago e S. pontoporiae, encontrado tanto no estômago quanto no intestino apresentaram os maiores índices parasitológicos, enquanto as outras três espécies foram consideradas raras devido aos baixos índices parasitários. Houve diferença significativa na carga parasitária apenas para as fases de desenvolvimento, na qual indivíduos adultos e juvenis apresentaram maiores índices parasitológicos do que indivíduos filhotes. Os índices parasitológicos não variaram significativamente entre os sexos, sazonalidade ou área de distribuição dos hospedeiros. A comunidade parasitária componente do trato gastrointestinal de P. blainvillei no litoral de São Paulo difere parcialmente daquela descrita anteriormente, compreendendo duas espécies: Corynosoma cetaceum (Acanthocephala: Polymorphidae) e Synthesium pontoporiae (Digenea: Brachycladiidae). As espécies Anisakis sp., Bolbosoma turbinella e Andracantha sp. consistem em infecção acidental por ingestão de presa infectada e, portanto, não fazem parte da fauna parasitária do hospedeiro nesta área de estudo. Foram observadas variações de comprimento e forma em 18% (n= 377) dos helmintos Synthesium pontoporiae coletados, tratando-se de espécimes sexualmente maduros com tamanho inferior e superior ao descrito para a espécie. São necessários estudos moleculares para complementar a investigação sobre as causas da diferenciação de Synthesium pontoporiae em três morfotipos distintos no litoral de São Paulo, Brasil. / Parasitic infections are very common in marine mammals and the study of helminthfauna in cetaceans has been used as a tool to determine biological and ecological aspects of the hosts, as the definition of niches, dispersal routes, feeding habits and differentiation of population stocks. The franciscana dolphin, Pontoporia blainvillei, is a small cetacean endemic to the Western South Atlantic, beeing the bycath events the main cause of mortality throughout its distribution area. The gastrointestinal tract of 87 franciscanas, collected from carcasses from bycatch or stranding, from 2005 to 2017, in the coast of São Paulo were analyzed to identify the component species of parasitic gastrointestinal fauna and to evaluate variations in levels of infection according to sex, stage of development, seasonality and range of the hosts. A total of 4,171 specimens of helminths were collected and classified into five species: Anisakis sp. (Nematoda: Anisakidae); Andracantha sp., Bolbosoma turbinella, Corynosoma cetaceum (Acanthocephala: Polymorphidae), and Synthesium pontoporiae (Trematoda: Brachycladiidae). The helminths C. cetaceum, exclusive to the stomach and S. pontoporiae, found in both, stomach and intestine, presented the highest parasitological indexes, while the other three species were considered rare due to the low parasitic indexes. There was a significant difference in parasite load only for the developmental stages, in which adult and juvenile individuals had higher parasitological indexes than calves. Parasitological indices did not vary significantly between the sexes, seasonality or range of the hosts. The parasite community component of the gastrointestinal tract of P. blainvillei on the São Paulo coast differs partially from that described previously, comprising two species: Corynosoma cetaceum (Acanthocephala: Polymorphidae) and Synthesium pontoporiae (Digenea: Brachycladiidae). The species Anisakis sp., Bolbosoma turbinella and Andracantha sp. consists of accidental infection by ingestion of infected prey and, therefore, are not part of the host parasitic fauna in this area of study. Length and shape variations were observed in 18% (n= 377) of the collected Synthesium pontoporiae parasites, being sexually mature specimens with inferior and superior sizes to those described for the species. Molecular studies are needed to complement the research on the causes of the differentiation of Synthesium pontoporiae in three distinct morphotypes in the coast of São Paulo.
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Helmintos gastrointestinais de toninha, Pontoporia blainvillei (Cetartiodactyla; Pontoporiidae), do litoral de São Paulo, Brasil. /

Seabra, Camila Brandão. January 2018 (has links)
Orientador: Carolina Pacheco Bertozzi / Resumo: As infecções parasitárias são muito comuns em mamíferos marinhos e o estudo da helmintofauna em cetáceos tem sido utilizado como uma ferramenta para determinar aspectos biológicos e ecológicos dos hospedeiros, entre eles a definição de nichos, rotas de dispersão, hábitos alimentares e diferenciação de estoques populacionais. A toninha, Pontoporia blainvillei, pequeno cetáceo endêmico do Atlântico Sul Ocidental tem como principal causa de mortalidade em toda sua área de distribuição a captura acidental. O trato gastrointestinal de 87 toninhas, coletados de carcaças provenientes de captura acidental ou encalhe, no período de 2005 a 2017, no litoral de São Paulo foram analisados para identificar as espécies componentes da fauna parasitária gastrointestinal e avaliar variações nos níveis de infecção conforme o sexo, fase de desenvolvimento, sazonalidade e área de distribuição dos hospedeiros. Foram coletados 4.171 espécimes de helmintos, classificadas em cinco espécies: Anisakis sp. (Nematoda: Anisakidae); Andracantha sp., Bolbosoma turbinella, Corynosoma cetaceum (Acanthocephala: Polymorphidae), e Synthesium pontoporiae (Trematoda: Brachycladiidae). Os helmintos C. cetaceum, exclusivo do estômago e S. pontoporiae, encontrado tanto no estômago quanto no intestino apresentaram os maiores índices parasitológicos, enquanto as outras três espécies foram consideradas raras devido aos baixos índices parasitários. Houve diferença significativa na carga parasitária apenas para as fases d... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Parasitic infections are very common in marine mammals and the study of helminthfauna in cetaceans has been used as a tool to determine biological and ecological aspects of the hosts, as the definition of niches, dispersal routes, feeding habits and differentiation of population stocks. The franciscana dolphin, Pontoporia blainvillei, is a small cetacean endemic to the Western South Atlantic, beeing the bycath events the main cause of mortality throughout its distribution area. The gastrointestinal tract of 87 franciscanas, collected from carcasses from bycatch or stranding, from 2005 to 2017, in the coast of São Paulo were analyzed to identify the component species of parasitic gastrointestinal fauna and to evaluate variations in levels of infection according to sex, stage of development, seasonality and range of the hosts. A total of 4,171 specimens of helminths were collected and classified into five species: Anisakis sp. (Nematoda: Anisakidae); Andracantha sp., Bolbosoma turbinella, Corynosoma cetaceum (Acanthocephala: Polymorphidae), and Synthesium pontoporiae (Trematoda: Brachycladiidae). The helminths C. cetaceum, exclusive to the stomach and S. pontoporiae, found in both, stomach and intestine, presented the highest parasitological indexes, while the other three species were considered rare due to the low parasitic indexes. There was a significant difference in parasite load only for the developmental stages, in which adult and juvenile individuals had higher parasito... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Organoclorados em Toninhas, Pontoporia blainvillei (MAMMALIA: CETACEA) da região costeira do Estado de São Paulo, Brasil / Organochlorines in Franciscana dolphins, Pontoporia blainvillei (MAMMALIA: CETACEA) from the coast off São Paulo State, Brazil

Mariana Batha Alonso 04 August 2008 (has links)
Os organoclorados constituem um dos principais grupos de poluentes que afetam os ecossistemas devido a sua grande persistência no ambiente e toxicidade para os organismos. A toninha, Pontoporia blainvillei, é um cetáceo costeiro, o único golfinho brasileiro considerado ameaçado de extinção por conta das atividades antrópicas. O objetivo desse trabalho foi avaliar a ocorrência de organoclorados em amostras de gordura subcutânea de indivíduos de Pontoporia blainvillei coletados na região costeira do Estado de São Paulo. A metodologia de extração e purificação das amostras foi testada e otimizada conforme procedimentos descritos na literatura. Foram realizadas as análises em 53 amostras de toninha (Pontoporia blainvillei): 29 machos e 24 fêmeas. Todas as concentrações de organoclorados apresentaram valores maiores nos machos, em comparação com as fêmeas de mesma maturidade. As concentrações dos compostos organoclorados nas toninhas do litoral paulista variaram, em ng.g-1 lipídios nos PCBs de 326 a 42.185, DDTs de 107 a 7.185, HCHs n.d. a 46, CHLs n.d. a 126, HCB < 2 a 133 e Mirex < 7 a 259. A razão DDTs/PCBs foi menor que 0,6 indicando uma maior contribuição industrial do que agrícola na área de estudo. Houve diferenças significativas dos valores dos OCs nas toninhas das localidades do litoral de São Paulo, com as maiores concentrações ocorrendo na Baixada Santista. / Organochlorines are one of the main pollutant groups that affect the ecosystems due to their environmental persistence and toxicity to the organisms. Franciscana dolphin, Pontoporia blainvillei, is a coastal cetacean, the only Brazilian dolphin considered threatened with extinction, due to the human activities. The aim of this work was evaluate the occurrence of organochlorines in the blubber samples of Pontoporia blainvillei collected on the coast of São Paulo State. The extraction and purification methodology was tested and optimized according to proceedings described in literature. A total of 53 individuals were analyzed: 29 males and 24 females. Organochlorine concentrations were higher in males when comparing to females with the same sexual maturity. PCBs were the predominant compounds (326 - 42185 ng g-1 lipid weight), followed by DDTs (107 - 7185 ng g-1 lipid wt), HCHs (n.d. - 46 ng g-1 lipid wt), CHLs (n.d. - 126 ng g-1 lipid wt), HCB (< 2 - 133 ng g-1 lipid wt) and Mirex (< 7 - 259 ng g-1 lipid wt). The ratio DDTs/PCBs was lesser than 0.6 indicating a major industrial than agricultural contribution in the study area. There were significant differences between the OCs values in franciscanas from 3 localities of São Paulo State coast: with the higher concentrations occurring in Baixada Santista.
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Poluentes Orgânicos Persistentes (POPs) em toninhas (Pontoporia blainvillei; Cetacea, Pontoporiidae) acidentalmente capturadas em operações de pesca no litoral sul de São Paulo / Persistent Organic Pollutants (POPs) in franciscana (Pontoporia blainvillei; Cetacea, Pontoporiidae) accidentally caught in fishing operations in the south coast of São Paulo

Barbosa, Ana Paula Moreno 06 May 2015 (has links)
Os poluentes orgânicos persistentes (POPs) são acumulados em tecidos gordurosos dos organismos vivos em concentrações relativamente altas em animais do topo da cadeia alimentar, como os golfinhos. Os objetivos deste trabalho foram avaliar a distribuição e acumulação de POPs em tecidos (gordura, fígado, rim e músculo) de toninhas (Pontoporia blainvillei) do litoral sul de São Paulo, bem como as diferenças/similaridades entre gênero e maturidade sexual e a transferência via placenta. Os valores de concentração mediana (ng g-1; peso úmido) para as 16 amostras de gordura, fígado, rim e músculo, respectivamente, foram: PCBs (987; 19,2; 5,08; 4,41); DDTs (550; 10,3; 2,67; 1,89); PBDEs (32,7; 0,230; 0,095; 0,050); Mirex (21,5; 0,457; 0,168; 0,083); HCB (15,4; <0,360; <0,360; <0,144); HCHs (<0,870; 2,20; <0,218; <0,087); Clordanas (<1,45; <0,362; <0,362; <0,145). Os machos jovens apresentaram as maiores concentrações dos POPs, seguidos pelos machos adultos, fêmeas jovens, fêmeas adultas e fetos. Foi observada transferência dos contaminantes das fêmeas gestantes para seus fetos entre 14 a 28% para PCBs e 19 a 45% para DDTs. A gordura apresentou correlação significativa com os demais tecidos estudados para acumulação dos PCBs, DDTs e PBDEs sugerindo a sua representatividade para estudos desses POPs em toninhas. / Persistent organic pollutants (POPs) are accumulated in fatty tissues of organisms in relatively high concentrations in animals in high position of the food chain such as dolphins. The aims of this study were to evaluate the distribution and accumulation of POPs in tissues (blubber, liver, kidney and muscle) of franciscana dolphin (Pontoporia blainvillei) collected on the southern coast of São Paulo as well as differences/similarities between genre and sexual maturity and the transplacental transfer. The values of median concentration (ng g-1; wet weight) for 16 samples of blubber, liver, kidney and muscle, respectively, were: PCBs (987; 19,2; 5,08; 4,41); DDTs (550; 10,3; 2,67; 1,89); PBDEs (32,7; 0,230; 0,095; 0,050); Mirex (21,5; 0,457; 0,168; 0,083); HCB (15,4; <0,360; <0,360; <0,144); HCHs (<0,870; 2,20; <0,218; <0,087); Chlordanes (<1,45; <0,362; <0,362; <0,145). POPs concentrations were higher in young males followed by adult males, young females, adult females and fetuses. Maternal transfer of POPs to the fetuses was between 14 to 28% for PCBs and 19 to 45% for DDTs. Blubber showed a significant correlation with the other tissues studied for PCBs, DDTs and PBDEs suggesting its representativeness for evaluation of these POPs in franciscana dolphin.
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Interação com a pesca: implicações na conservação da toninha, Pontoporia blainvillei (Cetacea, Pontoporiidae) no litoral do estado de São Paulo, SP / Fisheries interactions: implications on the conservation of franciscana, Pontoporia blainvillei (Cetacea, Pontoporiidae) in the coastal area of São Paulo state

Carolina Pacheco Bertozzi 14 December 2009 (has links)
Este trabalho tem por objetivo investigar a interação da pescaria de espera e as capturas acidentais de Pontoporia blainvillei, bem como a implicação da atividade na conservação da espécie. Para tanto, foram descritas e analisadas a atividade pesqueira, avaliadas as capturas acidentais, estimadas a mortalidade e estudados alguns aspectos da estrutura populacional, como a estimativa da idade, do crescimento e de parâmetros de algumas variáveis reprodutivas das toninhas acidentalmente capturadas no litoral do Estado de São Paulo. O monitoramento sistemático da frota pesqueira do município da Praia Grande durante o período de julho de 1999 a dezembro de 2008 permitiu uma avaliação temporal das capturas acidentais e dos índices de captura por unidade de esforço de pesca. Cinco tipos de redes de espera e um tipo de rede de arrastão de praia foram utilizados pela frota pesqueira da Praia Grande, sendo observadas capturas em quatro tipos de redes de espera. Um total de 91 toninhas foram acidentalmente capturadas e os valores de CPUE indicam que as redes de superfície boeira e a rede demersal fundo grossa são as responsáveis pelos maiores valores de captura nos meses de outono e inverno. Ao longo de todo o litoral paulista foi verificado o uso de redes de emalhe de espera em áreas costeiras, totalizando cerca de 1.192 embarcações operando redes de emalhe. A partir do monitoramento sistemático de quatro comunidades pesqueiras estimou-se um esforço de pesca total para a frota de emalhe do Estado de São Paulo em 4.684.981 km x dia de pesca, o qual foi multiplicado pela captura por unidade de esforço de pesca média (0,00008 toninhas/km x dia de pesca) resultando em uma estimativa de mortalidade de 372 toninhas para o período de junho de 2004 a abril de 2005. As idades estimadas dos animais capturados variaram de 0 a 14 anos, sendo que 80,0 % possuíam idade entre 0 e 3 anos. As fêmeas tiveram distribuição de idade 0 a 7 anos e os machos de 0 a 14 anos. O comprimento máximo assintótico estimado pelo modelo de von Bertalanffy ajustado aos dados de comprimento total e idade foi de 117,5 cm para machos e 135,6 cm para fêmeas 135,6 cm. O valor da taxa de crescimento estimado para os machos (0,859) foi superior ao das fêmeas (0,779). Não foi constatada diferença significativa entre comprimento, peso e largura entre as gônadas do mesmo animal, confirmado a hipótese de simetria. Os valores médios das medidas macroscópicas das gônadas, assim como o Índice de Maturidade Testicular (IMT) e Ovariano (IMO) foram significativamente diferentes entre indivíduos maduros, púberes e imaturos e apresentaram nítido aumento dos valores para os indivíduos maduros, demonstrando o aumento em tamanho e peso das gônadas com a chegada da maturidade gonadal. A análise microscópica de 45 testículos revelou que 33,3% dos machos eram imaturos, 15,6% púberes e 51,1% maduros. A análise microscópica dos ovários de 42 fêmeas resultou uma proporção de 54,8% fêmeas imaturas, 4,8% púberes e 40,5% maduras. Do total de fêmeas maduras capturadas nove estavam prenhas e apresentaram corpo lúteo de gravidez de grande dimensão. O número máximo de corpos albicans e lúteos observados nos ovários das fêmeas maduras foi três, ocorrendo 61,9% no ovário esquerdo. O comprimento médio e a idade média de maturidade para os machos foram estimados em 103,6 e 107,83 cm e 1,31 e 1,48 anos, respectivamente e para as fêmeas em 119 cm e 1,2 a 1,83 anos, dependo do método utilizado. O tempo de gestação estimado 10,22 meses, taxa de prenhez anual de 0,56, comprimento de nascimento de 72,05 cm, taxa de crescimento fetal de 0,27 cm/dia e o intervalo reprodutivo de 1,77 anos. Os resultados obtidos para o litoral do estado de São Paulo indicam que a pescaria de emalhe incide principalmente nos indivíduos imaturos de ambos os sexos, com 0 a 2 anos de idade, mas que um percentual significativo de adultos maduros também vem sendo capturados. Além disso, foi constatado que não há padrão latitudinal das variáveis estudadas. / The scope of this study is to investigate the interactions of gillnet fishing and the accidental captures of the Pontoporia blainvillei, as well as the implications of this activity in species conservation. Therefore, fishing activities are described and analyzed, accidental captures are evaluated, mortality is estimated and some aspects of population structure are studied, such as growth and age estimates, besides criteria estimates of reproduction variables in franciscana dolphin accidentally caught on the coast of the State of São Paulo. Continuous monitoring of the fishing boats in Praia Grande County, from July 1999 to December 2008 allowed both the chronological evaluation of accidental catching and capture per unit effort. Five different types of gillnets and one of trawl net for shallow areas were used by the fishing boats in Praia Grande, of which four types of gillnets registered catching. A total number of 91 franciscana dolphins were accidentally captured and the values of catch per unit effort (CPUE) indicate that \"boeira\" surface nets and \"bottom thick\" demersal nets are responsible for the highest capture numbers during autumn and winter time. The use of drift nets was observed along the coast of the São Paulo State where a total of 1,192 boats have used such nets. Through the systematic monitoring of four fishing communities, the total fishing effort concerning drift nets, in the State of São Paulo, was 4,684,981 km per fishing day. This value was then multiplied by the catch per unit of average fishing (0.00008 Franciscana dolphins/km x fishing day), which resulted in an estimate mortality of 372 dolphins between June 2004 and April 2005. Estimated age of captured animals varied from 0 to 14 years, 80.0% ranged between 0 and 3 years. Age distribution among female dolphins was from 0 to 7 years, while among male dolphins it was from 0 to 14 years. The maximum asymptotic lenght, estimated according to the von Bertalanffy model and adjusted to the length and age data, was of 117.5 cm for males and 135.6 cm for females. The estimated growth rate for males (0.859) was higher than for females (0.779). No significant difference regarding length, weight, and width between the gonads of the same animal was noticed, confirming the symmetry hypothesis. The average values of the gonads macroscopic measures, as well as both the Testicular (TIM) and Ovarian (OIM) Index of Maturity were significantly different among mature, pubescent and immature individuals. There was a clear increase in value for mature individuals, which demonstrates the gonads size and weight increase as they reach maturity. Microscopic analysis of 45 testicles showed that 33.3% of males were immature, 15.6% pubescent, and 51.1% mature. Microscopic analysis of 42 female ovaries showed that 54.8% of females were immature, 4.8% pubescent, and 40.5% mature. Nine out of the total mature females captured were pregnant and presented a pregnancy corpus luteum of greater size. The maximum corpus albicans and corpus luteum numbers observed in mature female ovaries was three - 61.9% occurring in the left ovary. Both average length and average sexual maturity age for male individuals were estimated between 103.6 107.83 cm and 1.31 1.48 years, respectively. For female individuals these numbers were 119 cm and 1.2 1.83 years, depending on the method used. The estimated pregnancy period was 10.22 months; the annual pregnancy rate was 0.56; the birth length was 72.05 cm; the fetal growth rate was 0.27 cm/day, and the reproduction interval was 1.77 year. The results obtained in the State of São Paulo indicate that drift nets affect mainly immature individuals of both sexes, from 0 to 2 years old. However, a significant percentage of mature adults have also been captured. Besides, no latitude pattern in the variables studied was confirmed.
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Interação com a pesca: implicações na conservação da toninha, Pontoporia blainvillei (Cetacea, Pontoporiidae) no litoral do estado de São Paulo, SP / Fisheries interactions: implications on the conservation of franciscana, Pontoporia blainvillei (Cetacea, Pontoporiidae) in the coastal area of São Paulo state

Bertozzi, Carolina Pacheco 14 December 2009 (has links)
Este trabalho tem por objetivo investigar a interação da pescaria de espera e as capturas acidentais de Pontoporia blainvillei, bem como a implicação da atividade na conservação da espécie. Para tanto, foram descritas e analisadas a atividade pesqueira, avaliadas as capturas acidentais, estimadas a mortalidade e estudados alguns aspectos da estrutura populacional, como a estimativa da idade, do crescimento e de parâmetros de algumas variáveis reprodutivas das toninhas acidentalmente capturadas no litoral do Estado de São Paulo. O monitoramento sistemático da frota pesqueira do município da Praia Grande durante o período de julho de 1999 a dezembro de 2008 permitiu uma avaliação temporal das capturas acidentais e dos índices de captura por unidade de esforço de pesca. Cinco tipos de redes de espera e um tipo de rede de arrastão de praia foram utilizados pela frota pesqueira da Praia Grande, sendo observadas capturas em quatro tipos de redes de espera. Um total de 91 toninhas foram acidentalmente capturadas e os valores de CPUE indicam que as redes de superfície boeira e a rede demersal fundo grossa são as responsáveis pelos maiores valores de captura nos meses de outono e inverno. Ao longo de todo o litoral paulista foi verificado o uso de redes de emalhe de espera em áreas costeiras, totalizando cerca de 1.192 embarcações operando redes de emalhe. A partir do monitoramento sistemático de quatro comunidades pesqueiras estimou-se um esforço de pesca total para a frota de emalhe do Estado de São Paulo em 4.684.981 km x dia de pesca, o qual foi multiplicado pela captura por unidade de esforço de pesca média (0,00008 toninhas/km x dia de pesca) resultando em uma estimativa de mortalidade de 372 toninhas para o período de junho de 2004 a abril de 2005. As idades estimadas dos animais capturados variaram de 0 a 14 anos, sendo que 80,0 % possuíam idade entre 0 e 3 anos. As fêmeas tiveram distribuição de idade 0 a 7 anos e os machos de 0 a 14 anos. O comprimento máximo assintótico estimado pelo modelo de von Bertalanffy ajustado aos dados de comprimento total e idade foi de 117,5 cm para machos e 135,6 cm para fêmeas 135,6 cm. O valor da taxa de crescimento estimado para os machos (0,859) foi superior ao das fêmeas (0,779). Não foi constatada diferença significativa entre comprimento, peso e largura entre as gônadas do mesmo animal, confirmado a hipótese de simetria. Os valores médios das medidas macroscópicas das gônadas, assim como o Índice de Maturidade Testicular (IMT) e Ovariano (IMO) foram significativamente diferentes entre indivíduos maduros, púberes e imaturos e apresentaram nítido aumento dos valores para os indivíduos maduros, demonstrando o aumento em tamanho e peso das gônadas com a chegada da maturidade gonadal. A análise microscópica de 45 testículos revelou que 33,3% dos machos eram imaturos, 15,6% púberes e 51,1% maduros. A análise microscópica dos ovários de 42 fêmeas resultou uma proporção de 54,8% fêmeas imaturas, 4,8% púberes e 40,5% maduras. Do total de fêmeas maduras capturadas nove estavam prenhas e apresentaram corpo lúteo de gravidez de grande dimensão. O número máximo de corpos albicans e lúteos observados nos ovários das fêmeas maduras foi três, ocorrendo 61,9% no ovário esquerdo. O comprimento médio e a idade média de maturidade para os machos foram estimados em 103,6 e 107,83 cm e 1,31 e 1,48 anos, respectivamente e para as fêmeas em 119 cm e 1,2 a 1,83 anos, dependo do método utilizado. O tempo de gestação estimado 10,22 meses, taxa de prenhez anual de 0,56, comprimento de nascimento de 72,05 cm, taxa de crescimento fetal de 0,27 cm/dia e o intervalo reprodutivo de 1,77 anos. Os resultados obtidos para o litoral do estado de São Paulo indicam que a pescaria de emalhe incide principalmente nos indivíduos imaturos de ambos os sexos, com 0 a 2 anos de idade, mas que um percentual significativo de adultos maduros também vem sendo capturados. Além disso, foi constatado que não há padrão latitudinal das variáveis estudadas. / The scope of this study is to investigate the interactions of gillnet fishing and the accidental captures of the Pontoporia blainvillei, as well as the implications of this activity in species conservation. Therefore, fishing activities are described and analyzed, accidental captures are evaluated, mortality is estimated and some aspects of population structure are studied, such as growth and age estimates, besides criteria estimates of reproduction variables in franciscana dolphin accidentally caught on the coast of the State of São Paulo. Continuous monitoring of the fishing boats in Praia Grande County, from July 1999 to December 2008 allowed both the chronological evaluation of accidental catching and capture per unit effort. Five different types of gillnets and one of trawl net for shallow areas were used by the fishing boats in Praia Grande, of which four types of gillnets registered catching. A total number of 91 franciscana dolphins were accidentally captured and the values of catch per unit effort (CPUE) indicate that \"boeira\" surface nets and \"bottom thick\" demersal nets are responsible for the highest capture numbers during autumn and winter time. The use of drift nets was observed along the coast of the São Paulo State where a total of 1,192 boats have used such nets. Through the systematic monitoring of four fishing communities, the total fishing effort concerning drift nets, in the State of São Paulo, was 4,684,981 km per fishing day. This value was then multiplied by the catch per unit of average fishing (0.00008 Franciscana dolphins/km x fishing day), which resulted in an estimate mortality of 372 dolphins between June 2004 and April 2005. Estimated age of captured animals varied from 0 to 14 years, 80.0% ranged between 0 and 3 years. Age distribution among female dolphins was from 0 to 7 years, while among male dolphins it was from 0 to 14 years. The maximum asymptotic lenght, estimated according to the von Bertalanffy model and adjusted to the length and age data, was of 117.5 cm for males and 135.6 cm for females. The estimated growth rate for males (0.859) was higher than for females (0.779). No significant difference regarding length, weight, and width between the gonads of the same animal was noticed, confirming the symmetry hypothesis. The average values of the gonads macroscopic measures, as well as both the Testicular (TIM) and Ovarian (OIM) Index of Maturity were significantly different among mature, pubescent and immature individuals. There was a clear increase in value for mature individuals, which demonstrates the gonads size and weight increase as they reach maturity. Microscopic analysis of 45 testicles showed that 33.3% of males were immature, 15.6% pubescent, and 51.1% mature. Microscopic analysis of 42 female ovaries showed that 54.8% of females were immature, 4.8% pubescent, and 40.5% mature. Nine out of the total mature females captured were pregnant and presented a pregnancy corpus luteum of greater size. The maximum corpus albicans and corpus luteum numbers observed in mature female ovaries was three - 61.9% occurring in the left ovary. Both average length and average sexual maturity age for male individuals were estimated between 103.6 107.83 cm and 1.31 1.48 years, respectively. For female individuals these numbers were 119 cm and 1.2 1.83 years, depending on the method used. The estimated pregnancy period was 10.22 months; the annual pregnancy rate was 0.56; the birth length was 72.05 cm; the fetal growth rate was 0.27 cm/day, and the reproduction interval was 1.77 year. The results obtained in the State of São Paulo indicate that drift nets affect mainly immature individuals of both sexes, from 0 to 2 years old. However, a significant percentage of mature adults have also been captured. Besides, no latitude pattern in the variables studied was confirmed.

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