O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é um sistema genético reconhecidamente polimórfico em populações humanas. Em porções específicas dos genes que compõem o MHC de populações humanas também foi evidenciada a ação da seleção natural em nível molecular. Em várias espécies de vertebrados onde estes genes foram estudados diferentes níveis de variação, composição gênica e organização foram detectados, mantendo, entretanto, as características que os tornam tão interessante de ser estudados. Para mamíferos marinhos, as questões sobre a variação no MHC servem de pano de fundo para o entendimento sobre o sistema imunológico destas espécies e suas particularidades em relação ao ambiente marinho e a evolução destes genes em organismos não-modelos. No presente trabalho, duas espécies de cetáceos, a toninha ou franciscana (Pontoporia blainvillei) e a baleia-franca-austral (Eubalaena australis), foram investigadas quanto aos níveis de variação no gene DQB1 do MHC. O segundo exon da cadeia beta do gene DQ foi amplificado em 25 amostras de toninha e 18 amostras de baleia franca. Os fragmentos de 212pb (pares de base) resultantes do processo de amplificação foram clonados e, tiveram analisados por seqüenciamento 171pb correspondentes ao sítio de ligação ao peptídeo antigênico (PBR). Uma amostra de toninha e um par mãe-filhote de baleia-franca-austral foram analisadas quanto à expressão do gene DQB a partir de amostras de pele. A evidência de seleção natural a nível molecular nesta porção do gene é confirmada por um excesso de substituições não sinônimas em relação às substituições sinônimas (em um contexto de neutralidade as substituições sinônimas acumulam-se na mesma taxa de mutações) através da razão dN (não sinônimas) e dS (sinônimas). Para confirmar os desvios da neutralidade (Ho= dN/dS=1), foi usada a estatística z. Os valores de dN/dS para toninha e baleia-franca-austral foram, respectivamente, dN/dS = 2,32 (p=0,014) e dN/dS =3,75 (p= 0,001). Estes valores, as características das seqüências e a evidência de expressão desses genes na pele de cetáceos estão de acordo com os pressupostos de seleção positiva para esta região do gene e sugerem funcionalidade para estes genes nestas duas espécies. Há evidências de mais de uma cópia do gene para baleia-franca-austral. Foram descritos 6 alelos para toninha e 17 alelos para baleia-franca-austral sendo que um dos alelos é compartilhado entre as duas espécies, sugerindo que essa linhagem alélica é anterior à divergência entre odontocetos e misticetos. Paralelamente a este trabalho, o cariótipo de toninha foi descrito através de um processo de cultivo celular a partir da córnea de dois exemplares recém-mortos. Seu número cromossômico 2n=44 corrobora a estabilidade cariotípica descrita para cetáceos. / The Major Histocompatibility Complex is a highly polimorphic genetic system described to human populations. It is clear that a particular region from these genes is under natural selection which results in different patterns of variation from those expected under neutrality. In other vertebrates these genes were studied, these special characteristics seems to be preserved despite specific genomic organization and variation levels. In marine mammals, questions adressed to MHC molecular variation are focused in questions concerned on environmental restrictions and molecular evolution in non-model organisms. In the present study, two marine mammal species were surveyed concerning genetic variability using the gene DQB exon 2. Samples from 25 franciscana dolphins (Pontoporia blainvillei) and 18 southern right whales (Eubalaena australis) were used to amplify a 212bp (base pair) fragment from DQB exon 2. The 171bp resulting fragment was sequenced and analized in relation to the molecular level evidence of selection. Rates of nonsynonymous (dN) and synonymous (dS) base pair substitution and departures from neutrality for dN/dS (z statistics) were calculated. For both species examined, molecular evidence of selection was confirmed. The dN/dS ratios to franciscana and southern right whale were 2.32 (p=0.014) and 3.75 (p=0.001), respectively. These values, combined to data on DQB gene expression in franciscana and southern right whale skin and less restrictive aminoacid usage in both species, suggest a functional signature to sequences cetacean derived. Additionally, 6 alleles were described to franciscana dolphins and 17 to southern right whales. One more evidence of selection acting in this particular genomic region is provided from the fact that both species share one allele, suggesting that this allelic lineage was present before the splitting between mysticeti and odontoceti. To provide addtional information on franciscana dolphins the karyotype of P. blainvillei is presented. The karyotype was obtained from corneal culture of two dead animals. The diploid number 44 confirms the clear prevalence of this pattern among cetaceans.

O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é um sistema genético reconhecidamente polimórfico em populações humanas. Em porções específicas dos genes que compõem o MHC de populações humanas também foi evidenciada a ação da seleção natural em nível molecular. Em várias espécies de vertebrados onde estes genes foram estudados diferentes níveis de variação, composição gênica e organização foram detectados, mantendo, entretanto, as características que os tornam tão interessante de ser estudados. Para mamíferos marinhos, as questões sobre a variação no MHC servem de pano de fundo para o entendimento sobre o sistema imunológico destas espécies e suas particularidades em relação ao ambiente marinho e a evolução destes genes em organismos não-modelos. No presente trabalho, duas espécies de cetáceos, a toninha ou franciscana (Pontoporia blainvillei) e a baleia-franca-austral (Eubalaena australis), foram investigadas quanto aos níveis de variação no gene DQB1 do MHC. O segundo exon da cadeia beta do gene DQ foi amplificado em 25 amostras de toninha e 18 amostras de baleia franca. Os fragmentos de 212pb (pares de base) resultantes do processo de amplificação foram clonados e, tiveram analisados por seqüenciamento 171pb correspondentes ao sítio de ligação ao peptídeo antigênico (PBR). Uma amostra de toninha e um par mãe-filhote de baleia-franca-austral foram analisadas quanto à expressão do gene DQB a partir de amostras de pele. A evidência de seleção natural a nível molecular nesta porção do gene é confirmada por um excesso de substituições não sinônimas em relação às substituições sinônimas (em um contexto de neutralidade as substituições sinônimas acumulam-se na mesma taxa de mutações) através da razão dN (não sinônimas) e dS (sinônimas). Para confirmar os desvios da neutralidade (Ho= dN/dS=1), foi usada a estatística z. Os valores de dN/dS para toninha e baleia-franca-austral foram, respectivamente, dN/dS = 2,32 (p=0,014) e dN/dS =3,75 (p= 0,001). Estes valores, as características das seqüências e a evidência de expressão desses genes na pele de cetáceos estão de acordo com os pressupostos de seleção positiva para esta região do gene e sugerem funcionalidade para estes genes nestas duas espécies. Há evidências de mais de uma cópia do gene para baleia-franca-austral. Foram descritos 6 alelos para toninha e 17 alelos para baleia-franca-austral sendo que um dos alelos é compartilhado entre as duas espécies, sugerindo que essa linhagem alélica é anterior à divergência entre odontocetos e misticetos. Paralelamente a este trabalho, o cariótipo de toninha foi descrito através de um processo de cultivo celular a partir da córnea de dois exemplares recém-mortos. Seu número cromossômico 2n=44 corrobora a estabilidade cariotípica descrita para cetáceos. / The Major Histocompatibility Complex is a highly polimorphic genetic system described to human populations. It is clear that a particular region from these genes is under natural selection which results in different patterns of variation from those expected under neutrality. In other vertebrates these genes were studied, these special characteristics seems to be preserved despite specific genomic organization and variation levels. In marine mammals, questions adressed to MHC molecular variation are focused in questions concerned on environmental restrictions and molecular evolution in non-model organisms. In the present study, two marine mammal species were surveyed concerning genetic variability using the gene DQB exon 2. Samples from 25 franciscana dolphins (Pontoporia blainvillei) and 18 southern right whales (Eubalaena australis) were used to amplify a 212bp (base pair) fragment from DQB exon 2. The 171bp resulting fragment was sequenced and analized in relation to the molecular level evidence of selection. Rates of nonsynonymous (dN) and synonymous (dS) base pair substitution and departures from neutrality for dN/dS (z statistics) were calculated. For both species examined, molecular evidence of selection was confirmed. The dN/dS ratios to franciscana and southern right whale were 2.32 (p=0.014) and 3.75 (p=0.001), respectively. These values, combined to data on DQB gene expression in franciscana and southern right whale skin and less restrictive aminoacid usage in both species, suggest a functional signature to sequences cetacean derived. Additionally, 6 alleles were described to franciscana dolphins and 17 to southern right whales. One more evidence of selection acting in this particular genomic region is provided from the fact that both species share one allele, suggesting that this allelic lineage was present before the splitting between mysticeti and odontoceti. To provide addtional information on franciscana dolphins the karyotype of P. blainvillei is presented. The karyotype was obtained from corneal culture of two dead animals. The diploid number 44 confirms the clear prevalence of this pattern among cetaceans.

O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é um sistema genético reconhecidamente polimórfico em populações humanas. Em porções específicas dos genes que compõem o MHC de populações humanas também foi evidenciada a ação da seleção natural em nível molecular. Em várias espécies de vertebrados onde estes genes foram estudados diferentes níveis de variação, composição gênica e organização foram detectados, mantendo, entretanto, as características que os tornam tão interessante de ser estudados. Para mamíferos marinhos, as questões sobre a variação no MHC servem de pano de fundo para o entendimento sobre o sistema imunológico destas espécies e suas particularidades em relação ao ambiente marinho e a evolução destes genes em organismos não-modelos. No presente trabalho, duas espécies de cetáceos, a toninha ou franciscana (Pontoporia blainvillei) e a baleia-franca-austral (Eubalaena australis), foram investigadas quanto aos níveis de variação no gene DQB1 do MHC. O segundo exon da cadeia beta do gene DQ foi amplificado em 25 amostras de toninha e 18 amostras de baleia franca. Os fragmentos de 212pb (pares de base) resultantes do processo de amplificação foram clonados e, tiveram analisados por seqüenciamento 171pb correspondentes ao sítio de ligação ao peptídeo antigênico (PBR). Uma amostra de toninha e um par mãe-filhote de baleia-franca-austral foram analisadas quanto à expressão do gene DQB a partir de amostras de pele. A evidência de seleção natural a nível molecular nesta porção do gene é confirmada por um excesso de substituições não sinônimas em relação às substituições sinônimas (em um contexto de neutralidade as substituições sinônimas acumulam-se na mesma taxa de mutações) através da razão dN (não sinônimas) e dS (sinônimas). Para confirmar os desvios da neutralidade (Ho= dN/dS=1), foi usada a estatística z. Os valores de dN/dS para toninha e baleia-franca-austral foram, respectivamente, dN/dS = 2,32 (p=0,014) e dN/dS =3,75 (p= 0,001). Estes valores, as características das seqüências e a evidência de expressão desses genes na pele de cetáceos estão de acordo com os pressupostos de seleção positiva para esta região do gene e sugerem funcionalidade para estes genes nestas duas espécies. Há evidências de mais de uma cópia do gene para baleia-franca-austral. Foram descritos 6 alelos para toninha e 17 alelos para baleia-franca-austral sendo que um dos alelos é compartilhado entre as duas espécies, sugerindo que essa linhagem alélica é anterior à divergência entre odontocetos e misticetos. Paralelamente a este trabalho, o cariótipo de toninha foi descrito através de um processo de cultivo celular a partir da córnea de dois exemplares recém-mortos. Seu número cromossômico 2n=44 corrobora a estabilidade cariotípica descrita para cetáceos. / The Major Histocompatibility Complex is a highly polimorphic genetic system described to human populations. It is clear that a particular region from these genes is under natural selection which results in different patterns of variation from those expected under neutrality. In other vertebrates these genes were studied, these special characteristics seems to be preserved despite specific genomic organization and variation levels. In marine mammals, questions adressed to MHC molecular variation are focused in questions concerned on environmental restrictions and molecular evolution in non-model organisms. In the present study, two marine mammal species were surveyed concerning genetic variability using the gene DQB exon 2. Samples from 25 franciscana dolphins (Pontoporia blainvillei) and 18 southern right whales (Eubalaena australis) were used to amplify a 212bp (base pair) fragment from DQB exon 2. The 171bp resulting fragment was sequenced and analized in relation to the molecular level evidence of selection. Rates of nonsynonymous (dN) and synonymous (dS) base pair substitution and departures from neutrality for dN/dS (z statistics) were calculated. For both species examined, molecular evidence of selection was confirmed. The dN/dS ratios to franciscana and southern right whale were 2.32 (p=0.014) and 3.75 (p=0.001), respectively. These values, combined to data on DQB gene expression in franciscana and southern right whale skin and less restrictive aminoacid usage in both species, suggest a functional signature to sequences cetacean derived. Additionally, 6 alleles were described to franciscana dolphins and 17 to southern right whales. One more evidence of selection acting in this particular genomic region is provided from the fact that both species share one allele, suggesting that this allelic lineage was present before the splitting between mysticeti and odontoceti. To provide addtional information on franciscana dolphins the karyotype of P. blainvillei is presented. The karyotype was obtained from corneal culture of two dead animals. The diploid number 44 confirms the clear prevalence of this pattern among cetaceans.

Made available in DSpace on 2015-08-25T02:02:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000473894-Texto+Completo-0.pdf: 1659057 bytes, checksum: 383308bc4b42bc590384f39d9acfbe42 (MD5) Previous issue date: 2015 / The Galapagos fur seal, Arctocephalus galapagoensis, shows one of the most restricted species distribution range under the Otariidae family, with its distribution restricted to northwest of Galapagos Islands. Among the major threats to the conservation of Galapagos fur seals was the exploitation, that almost drove the species to extinction in the early nineteenth century due to the high economic and subsistence value of its skin and blubber. Currently, the species faces frequents events of El Niño that affect the base of the food chain in the equatorial Pacific Ocean, consequently the predatory and top predatory species like the fur seals. Both hunting and El Niño events led the species to Red List of Endangered Species of International Union for Conservation of Nature, indicating a ≥50% of population in the last 30 years. However, until now, there are no studies related to conservation problems and genetic variability and how genetic variability is represented in the space along the distribution range of Galapagos fur seal. To access the information about genetic diversity, population structure and demographic oscillation as well as how genetic variability is represented in the space we used molecular techniques applying two kinds of markers: a mitochondrial marker (control region, maternal inheritance) and nuclear marker (18 microsatellites loci, bi parental inheritance). The fur seals were sampled in the three major Galapagos fur seals colonies: Cape Hammond (Fernandina Island), Banks Bay (Isabela Island) and Cape Marshall (Isabela Islands). Our results showed that there is a strong female natal fidelity with 33. 9% of mtDNA occurring among partitioned colonies. In this sense, this natal philopatry, was converted in fine-scale matrilineal population structure. In the other hand, the population structure inferred by nuclear loci was week. This suggests that males are the main responsible by gene flow among sampled localities, even in a highly mobile species like Galapagos fur seal. Here we discuss the importance of natal philopatry and fine-scale matrilineal population structure of Galapagos fur seal species and their implications for management and conservation in the one of the most representative wildlife sanctuaries, the Galapagos archipelago. / O lobo-marinho-de-Galápagos, Arctocephalus galapagoensis, apresenta uma das mais restritas distribuições geográficas dentro da família Otariidae, distribuindo-se especialmente à região noroeste das Ilhas Galápagos. Entre as principais ameaças à conservação da espécie está a caça, responsável pela quase extinção da espécie no início do século XIX, devido ao alto valor econômico e de subsistência da pele e gordura destes animais; e também os recorrentes eventos do fenômeno El Niño, o qual afeta toda a base da cadeia trófica do Pacífico equatorial e, por consequência, as espécies predadoras e de topo de cadeia trófica como o lobo-marinho-de-Galápagos. Tanto a caça, quanto os recorrentes eventos de El Niño, levaram a espécie à Lista Vermelha de Espécies Ameaçadas de Extinção da União Internacional para a Conservação da Natureza (do inglês IUCN), indicando que houve ≥50% de redução populacional observada nos últimos 30 anos. No entanto, até o momento, não há estudos que verificaram possíveis efeitos dos problemas mencionados sobre a variabilidade genética da espécie, nem como esta variabilidade está representada espacialmente ao longo da área de distribuição do lobo-marinho-de-Galápagos. Para obter as informações de diversidade genética, estruturação populacional e para verificar possíveis oscilações demográficas, bem como verificar como a variabilidade está distribuída no espaço nós utilizamos de técnicas moleculares, aplicando o uso de dois tipos de marcadores de DNA: um mitocondrial (mtDNA - de herança exclusivamente materna), através da aplicação de parte da região controladora, e outro nuclear (herança bi-parental), através da aplicação de 18 loci de microssatélites de DNA em amostras coletadas nas três maiores colônias da espécie: Cabo Hammond (Ilha Fernandina), Baía Banks (Ilha Isabela) e Cabo Marshall (Ilha Isabela).Verificamos com nossos resultados que mesmo as colônias analisadas estando distante cerca de 70 Km há uma forte fidelidade das fêmeas ao sítio de nascimento, com 33,9% da variação no mtDNA estando particionada entre colônias. Por outro lado, a estrutura populacional inferida através dos loci nucleares foi fraca. Nossos resultados além de mostrar uma forte fidelidade das fêmeas ao sítio de nascimento, mostrou que os machos são os principais responsáveis pelo fluxo gênico e que a fidelidade ao sítio de nascimento das fêmeas pode ser convertida em estruturação genética espacial em fina escala, mesmo em espécies que apresentam alta capacidade de deslocamento como é o caso de diversas espécies de pinípedes e, em especial, o lobo-marinho-de-Galápagos. Neste sentido, discutimos também neste estudo a importância da filopatria natal e consequente estruturação genética em fina escala para o manejo e conservação do lobo-marinho-de-Galápagos, neste que um dos maiores e mais representativos santuários da vida silvestre, o arquipélago de Galápagos.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:13:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000431772-Texto+Completo-0.pdf: 662662 bytes, checksum: 03d09987b626e32b1598af236814d904 (MD5) Previous issue date: 2011 / The South American fur Seal, Arctocephalus australis, is distributed along Southern Hemisphere coast with breeding colonies located since Peru until Uruguay. This work focuses on the Atlantic ESU and covers most of the colonies of the Atlantic coast. In recent past, several colonies underwent strong size reduction with hunting and El Niño events. Most studies have focused on investigate the Pacific ESU, little being known about the Atlantic populations. The population structure and genetic variability in this area were assayed with mitochondrial DNA control region and eleven microsatellite loci. The results found high levels of genetic diversity in the region, without evidence of recent genetic bottleneck but with evidence of a population expansion around 200-100 thousand years ago. A sign of genetic structure were found between colonies from Uruguay and Chubut when evaluated by the mtDNA. This is likely due to their strong female philopatry. However, microsatellite analysis did not revealed any existing structure, even between distant areas, supporting that most gene flow is mediated by males. For conservation purposes, these results shows that the South American fur seal Atlantic ESU is a single population and because of that, conservation measures should be aligned among the countries of its distribution. / O lobo-marinho sul-americano, Arctocephalus australis, está distribuído ao longo da costa do hemisfério sul com colônias reprodutivas localizadas desde o Peru até o Uruguai. Este trabalho foca na UES do Atlântico e cobre a maioria de suas colônias. No passado recente, várias colônias sofreram drásticas reduções populacionais com a caça e os eventos de El Niño. Muitos estudos focaram na análise da UES do Pacífico, no entanto, pouco se sabe sobre a UES do Atlântico. Neste estudo a estrutura populacional e a variabilidade genética destas populações foram avaliadas através da região controle do DNA mitocondrial e 11 loci de microssatélites. Os resultados encontraram alto nível de diversidade genética nesta região, sem sinal de gargalo genético recente, mas com sinais de uma expansão populacional iniciada entre 200. 000 e 100. 000 anos atrás. Um sinal de estruturação foi encontrado entre as colônias do Uruguai e Chubut quando avaliado a partir do DNA mitocondrial, provavelmente causado pela forte filopatria das fêmeas. No entanto, a análise de microssatélite não revelou a existência de estruturação, mesmo entre as diversas subpopulações mais distantes, sugerindo que o fluxo gênico seja mediado pelos machos. Para fins de conservação, estes resultados mostram que o lobo-marinho sul-americano da UES do Atlântico é uma única população, e por causa disso, medidas de segurança devem ser alinhadas entre os países de sua distribuição.

Os compostos organoclorados causam grande impacto na natureza devido a três características básicas: persistência ambiental, bioacumulação e alta toxicidade. Os mamíferos marinhos estão entre os organismos mais vulneráveis à toxicidade crônica desses contaminantes porque, além de concentrá-los em grande quantidade, a fêmea transfere parte de sua carga ao filhote durante a gestação e a lactação. Assim, o presente trabalho teve como objetivos otimizar uma metodologia para determinação de organoclorados (pesticidas e PCBs) em matrizes gordurosas e verificar a ocorrência dos mesmos na gordura subcutânea de mamíferos marinhos amostrados na costa de São Paulo (Brasil) e na Ilha Rei George (Antártica). No protocolo metodológico otimizado, a extração foi realizada em extrator Soxhlet (8 h) com uma mistura de n-hexano e diclorometano. A etapa de purificação foi feita através de tratamento ácido e o extrato final analisado em cromatógrafo a gás equipado com detector de captura de elétrons (GC-ECD). A performance do método foi avaliada com material de referência certificado, enquadrando-se dentro de padrões internacionais de controle de qualidade. O limite de detecção do método foi em média 2 ng g-1. As análises apontaram DDTs e PCBs como os grupos que mais causam impacto nos cetáceos da costa de São Paulo. Isso refletiu o histórico de ambos no Brasil, tanto em indústria como em agricultura e saúde pública. Em contrapartida, HCHs e HCB não apresentaram concentrações elevadas, fato que pode ser atribuído à volatilidade dos mesmos em regiões de clima tropical. Da mesma maneira, a-clordano, g-clordano e mirex não foram detectados em níveis significativos. A foca de Weddell (Leptonychotes weddelli), habitante do continente antártico, evidenciou as menores cargas de contaminante entre os animais estudados. As toninhas (Pontoporia blainvillei) e o golfinho-nariz-de-garrafa (Tursiops truncatus) também apresentaram baixos níveis de organoclorados. Os botos-cinza (Sotalia fluviatilis) revelaram concentrações de DDT iguais ou superiores a cetáceos da Índia, país onde esse pesticida ainda não está proibido. Já o golfinho-de-dentes-rugosos (Steno bredanensis) mostrou a maior contaminação entre os animais analisados, comparável a espécies estudadas em águas costeiras de países desenvolvidos (onde os organoclorados foram muito utilizados). / Organochlorine compounds cause strong impact on the nature, as a consequence of three basic characteristics: environmental persistence, bioaccumulation, and high toxicity. The marine mammals are one of the most vulnerable organisms to the chronic toxicity of these contaminants. Besides the high concentration in the body, the female transfers part of her load to the offspring during gestation and lactation. The aim of this study was (1) the optimization of a methodology for determining chlorinated hydrocarbons (pesticides and PCBs) in fatty biological matrices and (2) the analysis of organochlorines in marine mammals blubber sampled along São Paulo coast (Brazil) and King George Island (Antarctica). According to the optimized methodology, the extraction was carried out in Soxhlet apparatus (8 h) with a mixture of n-hexane and dichloromethane. The clean-up was carried out with acid treatment and the resulting extract injected into gas chromatography coupled to electron capture detector (GC-ECD). The method performance was evaluated with certified reference material and fitted for international standards of control quality. The mean method detection limit was 2 ng g-1. DDTs and PCBs were the most concentrated organochlorines in the cetaceans from São Paulo coast. These findings reflected their past usage in Brazil by industry, agriculture, and public health. On the other hand, both HCHs and HCB were not found in high concentration likely due to their volatility in tropical climate areas. Mirex, a-chlordane and g-chlordane were not detected in elevated levels. The Weddell seal (Leptonychotes weddelli), from Antarctic continent, presented the smallest load among the studied animals. As the same way, the franciscanas (Pontoporia blainvillei) and the bottlenose dolphin (Tursiops truncatus) presented low organochlorine levels. The marine tucuxi (Sotalia fluviatilis) showed equal or higher DDT concentration than Indian cetaceans where that pesticide is still in use. The rough-toothed dolphin (Steno bredanensis) revealed the greatest contamination among the analyzed animals, comparable to species studied in the coastal waters of developed countries (where organochlorines were extensively used).

Submitted by JOSIANE SANTOS DE OLIVEIRA (josianeso) on 2018-12-12T12:19:07Z No. of bitstreams: 1 Suliano Ferrasso_.pdf: 13509868 bytes, checksum: db714eb0da38099d01211d65c9c973e6 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-12-12T12:19:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Suliano Ferrasso_.pdf: 13509868 bytes, checksum: db714eb0da38099d01211d65c9c973e6 (MD5) Previous issue date: 2018-10-26 / UNISINOS - Universidade do Vale do Rio dos Sinos / Os pinípedes são carnívoros marinhos que iniciam sua história evolutiva no Oligoceno médio, em torno de 65 milhões de anos. Eles ocorrem em praticamente todos os oceanos do mundo e vem interagindo com populações humanas desde a pré-história em várias regiões do globo. Para a costa brasileira já foram registradas oito espécies de pinípedes, das quais sete já foram encontradas no litoral do Rio Grande do Sul (RS). A partir da análise de remanescentes ósseos resgatados em sítios arqueológicos, sugere-se que os registros pretéritos de pinípedes na costa do Brasil estariam associados aos depósitos do Quaternário. Para o RS são poucos os trabalhos versando sobre osteologia de pinípedes, na maioria são estudos cranianos com amostras atuais sobre diagnose ou ainda dimorfismo sexual, mas muito pouco relacionado à remanescentes arqueológicos. Neste sentido é necessário um aprofundamento sobre a composição das espécies, abundância de indivíduos, ocorrência e tipo de interação destas espécies com grupos humanos pré-históricos. Para tanto o presente estudo foi realizado em cinco sítios arqueológicos do litoral Norte do Rio Grande do Sul (LNRS), localizados entre Xangri-lá (29°47'23.72"S; 50°02'1824"W) e Arroio do Sal (29°27'0.27"S; 49°49'1.74"W), os quais estavam vinculados á Tradição Sambaqui. O método de prospecção (escavação) seguiu o de cortes horizontais artificiais nivelados, aprofundando verticalmente, formando níveis artificiais sucessivos para assegurar a profundidade e origem dos remanescentes faunísticos. O volume de material prospectado nos cinco sítios variou entre 0,30 m3 e ± 15,18 m3. Neste estudo, foram selecionadas seis quadrículas com remanescentes faunísticos dos cinco sítios para análise, cada uma diferindo em tamanho e espessura estratigráfica arqueológica. Todos os remanescentes ósseos encontrados em cada quadrícula foram coletados nas trincheiras escavadas e levados para triagem e tombamento na Reserva Técnica de Arqueologia do Instituto Anchietano de Pesquisas/Universidade do Vale do Rio dos Sinos (IAP-UNISINOS). Durante a triagem em laboratório foram selecionados para este estudo exclusivamente os remanescentes de pinípedes, com base na comparação com esqueletos de espécimes de espécies atuais e da literatura. Como resultado de riqueza taxonômica sob a ótica da zooarqueologia (NISP), foram encontrados 159 remanescentes de pinípedes nos sítios do LNRS, totalizando um MNI de 17 indivíduos. O sítio RS-LN-19 de Xangri-lá apresentou o maior NISP com 130 remanescentes, unicamente da família Otariidae e com pelo menos duas espécies identificadas (Arctocephalus australis e Otaria flavescens). A análise dos remanescentes ósseos do gênero Arctocephalus revelou o predomínio de indivíduos jovens, e adultos em O. flavescens. Este resultado na composição pretérita das espécies de pinípedes encontrados nos sambaquis no litoral do RS sugere que são as mesmas que ocorrem na atualidade, além de indicar que as antigas populações humanas já interagiam com estes animais. Contudo, não se descarta a hipótese de que otariídeos antárticos e subantárticos também tenham ocorrido na região no passado, já que em alguns casos só foi possível chegar até a identificação de gênero nos remanescentes analisados. Por fim, é importante salientar que em 19,53% (n = 25) dos remanescentes ósseos encontrados, foram identificadas marcas de manipulação antrópica como corte (pequenas incisões oblíquas, transversais e subparalelas) e 5,46% (n = 7) coloração enegrecida possivelmente oriunda da queima. Desta forma sugere-se que as antigas populações humanas do LNRS poderiam utilizar os pinípedes como recurso alimentar ocasional. / Pinnipeds are marine carnivores that emerged in the mid-Oligocene, around 65 million years ago. They occur in virtually every ocean in the world and have been interacting with human populations since prehistory in various regions of the globe. For the Brazilian coast eight species of pinnipeds have already been recorded, of which seven have been found on the coast of Rio Grande do Sul. Based on the analysis of bone remnants recovered at archaeological sites, it is suggested that the past records of pinnipeds on the coast of Brazil would be associated with Quaternary deposits. For the Rio Grande do Sul state coast there are few studies on osteology of pinnipeds, mostly diagnostic or sexual dimorphism studies base on skull samples of current species but there is very little information related to archaeological remnants of pinnipeds. In this context, it is still necessary the analyses of the species composition, abundance of individuals, occurrence and type of interaction of these species with prehistoric humans in the region. The present study was carried out in five archaeological sites on the north coast of Rio Grande do Sul (NCRS), between Xangri-la (29 ° 47'23.72 "S, 50 ° 02'1824" W) and Arroio do Sal 29 ° 27'0.27 "S, 49 ° 49'1.74" W), which were linked to the Sambaqui Tradition. The method of prospecting (excavation) was used in order to obatin several artificial horizontal levels, deepening vertically, forming successive artificial levels to assure the depth and origin of the faunistic remnants. The volume of material prospected at these five sites ranged from 0.30 m3 to ± 15.18 m3. In this study, six squares with faunal remnants of the five sites were selected for analysis, each differing in size and archaeological stratigraphic thickness. All the bone remains found in each square were collected in the excavated trenches and taken to the Archaeological Technical Reserve of the Instituto Anchietano de Pesquisas / Vale do Rio dos Sinos (IAP-UNISINOS). During the laboratory screening, only the remnants of pinnipeds were selected for this study, based on the comparison with skeletons of specimens of current species and the literature. As a result of taxonomic richness from the perspective of zooarchaeology, 159 remnants of pinnipeds were found as number of idenfied specimens (NISP) in the NCRS sites, totaling a minimum number of individuals (MNI) of 17. The RS-LN-19 site of Xangri-la presented the largest NISP, with 130 remnants only for the Otariidae Family, and with at least two identified species (Arctocephalus australis and Otaria flavescens). The analysis of the bone remnants of the genus Arctocephalus revealed the predominance of young individuals, and mainly adults of O. flavescens. This result in the past composition of the pinniped species found in the sambaquis in the RS coast suggests that they are the same that occur today, besides indicating that the ancient human populations already interacted with these animals. However, it is not ruled out that Antarctic and subantarctic antarctic have also occurred in the region in the past, since in some cases it was only possible to identify until the genus in the remnants analyzed. Finally, it is important to note that in 19.53% (n = 25) of the remaining bone remnants, anthropic manipulation marks were identified as cut (small oblique, transverse and subparallel incisions) and 5.46% (n = 7) blackened spots, possibly dut to burning. In this way, it is suggested that the ancient human populations of NCRS could use pinnipeds as an occasional food resource.

Made available in DSpace on 2016-08-31T13:29:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AnaPDB_DISSERT.pdf: 5575228 bytes, checksum: a1c79702c349b805acdba52d04a353ce (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Pathological examination of marine mammals carcasses is an important tool to understand the natural morphophysiology as well as the morphological changes associated with some diseases and thus highlight the potential anthropogenic impacts. This work had as aim conduct studies on histopathology of the organs of the dead stranded cetaceans and Sirenia in the Brazilian northeast coast, or that died during the rehabilitation process in Specialized Centers of the Region. For this, samples were taken belonging to the biological collection of Projeto Cetáceos da Costa Branca (PCCB), Associação de Pesquisa e Preservação de Ecossistemas Aquáticos (AQUASIS) and from Centro de Mamíferos Aquáticos (CMA). The tissue samples were submitted to the conventional method of preparing histological slides. Whereas the studied animals belong to different species, age and sex, a general descriptive analysis of the pathological aspects found in each case was carried out. From a total of 237 samples belonging to 66 individuals of the Cetacea order (n = 28) and Sirenia (n = 38), 34,17% (n = 81) exhibited microscopic changes, 54,85% (n = 130) were normal and 10,97% (n = 26) were autolysed. Among the obvious microscopic changes was diagnosed 50% of stomatitis in the oral system (n = 1), the heart showed 6.66% of interstitial fibrosis (n = 2), 10% of haemorrhage (n = 3) and 6.66% myocarditis (n = 2). The lungs showed pulmonary edema in 19% of the analyzes (n = 11), 10% of vascular congestion% (n = 6), 13% of haemorrhage (n = 8), 3% of emphysema (n = 2), 7% full of hemosiderin (n = 4), 3% of interstitial pneumonia (n = 2), 2% of eosinophilic pneumonia (n = 1), 2% of parasitic granuloma (n = 1), 2% of parasitic cyst (n = 1), 2% of traqueíte (n = 1). In the stomach was visualized a hemorrhage (16.66%; n = 1) and in the gut was detected nodular lymphoid hyperplasia (7%; n = 2), enteritis (4%; n = 1), blood vessels congestion (4%; n = 1) and vacuolar degeneration (4%; n = 1). The livers analysis showed 23% of vacuolar degeneration (n = 5), 9% of hepatocellular necrosis (n = 2), 9% moderate deposit of melanin granules (n = 2), 4.54 % of chronic hepatitis (n = 1), 9% of periportal fibrosis (n = 2), 4.54% of abscess (n = 1), 4.54% of congestion (n = 1), 4.54 % of bilestase (n = 1), and 4.54% proliferation of the bile ducts (n = 1). It was possible to observe in the spleen 20% white pulp rarefaction (n = 2), 10% white and red pulp rarefaction (n = 1), and 30% moderate deposition of melanin granules (n = 3). In the pancreas was observed a 50% of centroacinosas cells rarefaction (n = 1). In the kidneys was found 14% of toxix tube nephrosis (n = 4), 7% of multifocal hemorrhaging (n = 2), 14% of vascular congestion (n = 4), 3.44% presence of bacteria (n = 1), 3.44% of proliferative glomerulonephritis (n = 1), 3.44% of micro abscesses (n = 1), 3.44% of severe edema (n = 1), 3.44% of renal cysts (n = 1) and 3.44% of chronic interstitial nephritis (n = 1). In the uteri evaluated were observed 25% of a focal dystrophic calcification (n = 1) and 25% of metritis (n = 1). In the lymph nodes were observed suggestive abnormalities of immunosuppression (25%; n = 1), bleeding (25%; n = 1) and melanose (50%; n = 2). Other findings include rarefaction of the adrenal cells (50%, n = 1), fewer sperm cells into the lumen (14,28%; n = 2) or presence of only spermatogonia in the seminiferous tubules (21,42%; n = 3), and 25% focal hyperplasia of the bladder (n = 1). Despite the changes present in many systems, lung diseases were higher in cetaceans bodies and sirenians stranded on the Brazilian northeast coast / O estudo anatomopatológico das carcaças dos mamíferos marinhos é uma ferramenta importante para conhecer a morfofisiologia natural, bem como as alterações morfológicas associadas com algumas doenças e, desta forma, evidenciar os possíveis impactos antropogênicos. O presente trabalho teve como intuito realizar estudos sobre histopatologia dos órgãos de cetáceos e sirênios. Para isso, foram utilizadas amostras pertencentes ao acervo biológico do Projeto Cetáceos da Costa Branca (PCCB), da Associação de Pesquisa e Preservação de Ecossistemas Aquáticos (AQUASIS) e do Centro de Mamíferos Aquáticos (CMA). Os fragmentos teciduais foram submetidos ao método convencional de preparação de lâminas histológicas. As peças passaram pelos processos de desidratação e diafanização, banho em parafina líquida, inclusão em bloco, e posterior corte em micrótomo rotativo. Os cortes, de quatro a cinco micra de espessura, foram colocados em lâminas lapidadas e submetidos ao método de coloração Hematoxilina-eosina (H.E.), sendo então montados utilizando-se lamínula e resina sintética. Considerando que os animais em estudo pertencem a diferentes espécies, faixas etárias e sexo, foi realizada uma análise descritiva geral dos aspectos patológicos encontrados em cada caso. De um total de 237 amostras pertencentes a 66 indivíduos da ordem Cetacea (n=28) e Sirenia (n=38), 34,17% (n=81) apresentaram alterações microscópicas, 54,85% (n=130) estavam normais e 10,97% (n=26) se encontravam autolisadas. Dentre as alterações microscópicas evidentes foi diagnosticado no sistema bucal 50% de estomatite (n=1), o coração apresentou 6,66% de fibrose intersticial (n=2), 10% de hemorragia (n=3) e 6,66% de miocardite (n=2). Os pulmões mostraram em 19% das análises edema pulmonar (n=11), 10% de congestão vascular (n=6), 13% de hemorragia (n=8), 3% de enfisema (n=2), 7% hemossiderose (n=4), 3% pneumonia intersticial (n=2), 2% de pneumonia eosinofílica (n=1), 2% de granuloma parasitário (n=1), 2% de cisto parasitário (n=1), 2% de traqueíte (n=1). No estômago foi visualizado em um sirênio áreas extensas de hemorragia (16,66%; n=1) e no intestino foi detectado hiperplasia nodular linfóide (7%; n=2), enterite (4%; n=1), congestão dos vasos (4%; n=1) e degeneração vacuolar (4%; n=1). Os fígados analisados mostraram 23% de degeneração vacuolar (n=5), 9% de necrose hepatocelular (n=2), 9% de depósito moderado de grânulos de melanina (n=2), 4,54% de hepatite crônica (n=1), 9% de fibrose periportal (n=2), 4,54% de abscesso (n=1), 4,54% de congestão (n=1), 4,54% de bilestase (n=1), e 4,54% de proliferação dos ductos biliares (n=1). Nos baços foi possível constatar 20% de rarefação de polpa branca (n=2), 10% de rarefação de polpa branca e vermelha (n=1), e 30% de deposição moderada de grânulos de melanina (n=3). No pâncreas foi observado uma rarefação das células centroacinosas em 50% (n=1) das amostras. Nos rins foi encontrado 14% de nefrose tubular tóxica (n=4), 7% de hemorragia multifocal (n=2), 14% de congestão vascular (n=4), 3,44% de presença de bactérias (n=1), 3,44% de glomerulonefrite proliferativa (n=1), 3,44% de microabscessos (n=1), 3,44% de edema severo (n=1), 3,44% de cistos renais (n=1) e 3,44% de nefrite intersticial crônica (n=1). Nos úteros avaliados foi observado 25% de calcificação distrófica focal (n=1) e 25% de metrite (n=1). Nos linfonodos foram observados alterações sugestivas de imunossupressão (25%; n=1), hemorragia (25%; n=1), e melanose (50%; n=2). Outros achados incluíram rarefação das células da adrenal (50%, n=1), poucos espermatozoides no lúmen (14,28%; n=2) ou presença apenas de espermatogônias nos túbulos seminíferos (21,42%; n=3), e 25% de hiperplasia focal da bexiga (n=1). Apesar das alterações presentes em diversos sistemas, as patologias pulmonares foram superiores as demais tanto em órgãos de cetáceos como em sirênios encalhados no litoral do nordeste brasileiro

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O MHC (Major Histocompatibility Complex) é um sistema genético importante para a manutenção de espécies ameaçadas, uma vez que baixa variabilidade para locos MHC tem sido associada a uma menor capacidade de resposta a doenças e diminuição do sucesso reprodutivo. Deste modo, pesquisas sobre a variabilidade genética do MHC têm demonstrado ser bastante informativas em estudos populacionais voltados para aspectos referentes à conservação. No presente trabalho foi investigada a variabilidade genética do MHC para três espécies de mamíferos marinhos (toninha, baleia franca austral e lobo marinho sul-americano) do sul do Brasil, com intensa mortalidade provocada por atividades humanas atuais ou passadas. As amostras foram coletadas de animais mortos encalhados na costa, de animais capturados acidentalmente por barcos pesqueiros, e também através de um sistema de biópsia. A região variável do exon 2 do gene DQB do MHC foi amplificada por PCR (Polymerase Chain Reaction) em 109 amostras de toninhas (Rio de Janeiro n=32, Rio Grande do Sul n=52, Argentina n=25), 35 amostras de lobo marinho sul-americano e 30 amostras de baleia franca austral, utilizando-se um par de primers heterólogos. O fragmento resultante de 172 pares de bases foi analisado quanto ao polimorfismo de seqüência através da técnica de SSCP (Polimorfismo de Conformação de Fita Simples) em todas as amostras de toninha e de lobo marinho sul-americano e 14 amostras de baleia franca austral. Dificuldades associadas à amplificação resultaram em padrões de SSCP pouco informativos para as amostras de lobo marinho sul-americano e baleia franca austral Todas as amostras de toninha apresentaram um padrão de pelo menos 4 bandas por indivíduo. As 4 bandas de um único indivíduo do Rio Grande do Sul foram seqüenciadas, tendo sido possível verificar que 2 seqüências relacionadas ao genes DQB estão sendo amplificadas com estes primers. Pelas análises de SSCP foi possível detectar ausência de variabilidade para as amostras de toninha provenientes do Rio de Janeiro e diferenciá-las da população da Argentina, que é polimórfica. A população do Rio Grande do Sul parece apresentar níveis intermediários de variação em relação aos extremos da distribuição da espécie. Analisando as três populações amostradas, conclui-se que a espécie apresenta baixos níveis de variabilidade para o loco DQB, a exemplo do que é reportado para os genes de MHC de outros mamíferos marinhos.