Submitted by RODRIGO FERREIRA DE MORAIS null (morais_rf@yahoo.com.br) on 2018-02-02T20:42:19Z No. of bitstreams: 1 Tese-Final-Correção.pdf: 2669730 bytes, checksum: 576a54e50568133796232621abf36675 (MD5) / Rejected by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br), reason: - Fatla a capa. - Falta a ficha catalográfica, que deve ser solicitada pela home-page da biblioteca. - Verificar a folha de aprovação que não consta a data de defesa e a informação de aprovado. on 2018-02-05T10:18:25Z (GMT) / Submitted by RODRIGO FERREIRA DE MORAIS null (morais_rf@yahoo.com.br) on 2018-03-12T00:50:14Z No. of bitstreams: 1 Tese-Final-Correção.pdf: 2870079 bytes, checksum: 5202fec250145dfa46a6eaec7b5e486b (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br) on 2018-03-12T12:06:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 morais_rf_dr_rcla.pdf: 2562833 bytes, checksum: f79e474e4fef9378e024df78cf771f9e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-12T12:06:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 morais_rf_dr_rcla.pdf: 2562833 bytes, checksum: f79e474e4fef9378e024df78cf771f9e (MD5) Previous issue date: 2016-01-08 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Nas florestas tropicais os complexos fatores ambientais responsáveis pelos padrões de distribuição espacial da vegetação são de grande interesse de pesquisas em ecologia vegetal. O objetivo principal desta tese foi estudar a estrutura e a composição florística da comunidade arbórea da Floresta Pluvial Atlântica (Floresta Ombrófila Densa Montana) em um gradiente de altitude, e as possíveis correlações com fatores topográficos e edáficos no Parque Estadual da Serra do Mar, Núcleos de Picinguaba, Santa Virgínia e Cunha, no sudeste do Brasil. Para tanto, esta tese foi dividida em três capítulos. No primeiro analisamos as variações na estrutura, composição e a riqueza em escala local e as relações com as variáveis topográficas e edáficas. No segundo verificamos a similaridade florística, e variações na riqueza e estrutura da comunidade arbórea entre as altitudes de 600 e 1.100 m, e verificamos as relações dos padrões florísticos e de riqueza com os fatores topográficos e edáficos. Por fim, no terceiro capítulo analisamos as variações na estrutura, composição e riqueza de espécies da comunidade arbórea relacionadas as condições edáficas, e a contribuição na diversidade beta no gradiente de altitude (600, 800, 1.000 e 1.100 m). Em cada altitude foram implantadas 4 parcelas de 50 x 50 m, subdividas em 10 x 10 m. Realizamos os levantamentos florísco-fitossociológicos aos 600 e 1.100 m de altitude, e as medições das variáveis topográficas e amostragem do solo aos 600, 1.000 e 1.100 m. Compilamos os dados dos levantamentos aos 800 e 1.000 m de altitude, e para as variáveis edáficas e topográficas da cota de 800 m. Foram amostrados os indivíduos com PAP ≥ 15 cm. Os resultados indicam que as variáveis edáficas e topográficas não influenciaram nos parâmetros estruturais da comunidade arbórea, no entanto, estiveram relacionadas com a distribuição das espécies e riqueza local. Os efeitos do solo e da topografia na distribuição das espécies e na riqueza divergem parcialmente em diferentes altitudes (600 e 1.100), sendo estas divergências atribuídas às diferentes condições topográficas das florestas, nas quais os efeitos da topografia na comunidade arbórea e nas condições edáficas são mais pronunciados em ambientes com amplitudes de maior inclinação. As características florísticas e estruturais da floresta aos 1.100 m, indicam uma região de transição entre a Floresta Ombrófila Densa Montana e Altomontana. No gradiente de altitude verificamos diferenças na composição florística e alta substituição de espécies, sendo que as florestas de altitude mais elevadas (1.000 e 1.100 m) mais contribuem para diversidade beta. Diferenças na riqueza ao longo do gradiente não foram relacionadas com as variáveis edáficas, sendo as menores riquezas encontradas nos extremos do gradiente, já as diferenças na composição florísticas estiveram relacionadas às condições edáficas do gradiente de altitude. / In tropical forests, the complex environmental factors responsible for the spatial distribution patterns of vegetation are of great interest for research in plant ecology. The main objective of this research was to analyze the structure and floristic composition of the tree community of the Atlantic Rain Forest (Montana Rain Forest) in a gradient of altitude, and possible correlations with topographic and soil factors in the Atlantic Rain Forest in the State Park Serra do Mar, Núclo of Picinguaba, Santa Virgínia and Cunha, in Southeastern Brazil. To this purpose, we divided this research into three chapters. At first we examined the changes in the structure, composition and richness at the local level and relations with topographic and edaphic variables. In the second, we evaluated the floristic similarity and variations in richness and structure of the tree community between the altitudes of 600 and 1.100 m, and verify the relations of floristic patterns and richness with topographic and edaphic factors. Finally, in the third chapter we examined the changes in the structure, composition and species richness of tree community related to soil conditions, and the contribution in the beta diversity in altitude gradient (600, 800, 1.000 and 1.100 m). At each altitude, we implanted four plots of 50 x 50 m, subdivided into 10 x 10 m. We conducted flora-Phytosociological surveys at the 600 and 1.100 m a.s.l, took measurements of the environmental variables and soil sampling of the 600, 1.000 and 1.100 m. We compiled data from surveys at 800 and 1.000 m a.s.l, and the soil and topographic variables quota of 800 m. Individuals with PBH ≥ 15 cm were sampled. The results indicate that soil and topographic variables did not influence the structural parameters of the tree community, however, they were related to the distribution of species and the local richness. The effects of soil and topography in species distribution and richness partially diverge at different altitudes (600 and 1.100), and these differences attributed to the different topographical conditions of the forests, where the effects of topography on the tree community and the soil conditions are more pronounced in environments with greater inclination amplitudes. The floristic and structural characteristics of the forest at 1.100 m, indicate a transition region between the Atlantic Rain Forest and Upper Montane and Montana. In the elevation gradient, we found differences in the floristic composition and high turnover of species, and the forests at greater altitudes (1.000 to 1.100 m) contributed more to beta diversity. Differences in richness over gradient were not related to the edaphic variables, and the lowest richness found in the extremes of the gradient. In the other hand, the differences in floristic composition were related to soil conditions of altitude gradient.

Orientador: Sandra Maria Carmello-Guerreiro, Fernando Roberto Martins / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-17T07:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Uehara_LucianaYukari_M.pdf: 4862542 bytes, checksum: ad70cd04421ec86d5f001965c62d9a94 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Características morfológicas e anatômicas da folha de espécies vegetais são importantes indicadores de sua ecologia e dos habitats que ocupam. A variação das características anatômicas das folhas relacionadas às diferentes condições ambientais como deficiência hídrica, luminosidade, tipo de solo e disponibilidade de nutrientes é interpretada como resposta ecofisiológica da planta às diferenças microclimáticas. Dentre as características morfo-anatômicas, a área foliar, a área foliar específica (AFE), a densidade estomática, a espessura total da lâmina, a espessura do parênquima paliçádico, a espessura da epiderme, a quantidade de tecido esclerenquimático e a razão entre o tecido paliçádico e lacunoso, são alguns caracteres que podem ser utilizados para avaliar o grau de escleromorfismo de uma vegetação. Características edáficas, como disponibilidade de água e de nutrientes, pH, textura, podem sofrer variações devido a condições do relevo, como declividade. As variações do relevo estão intrinsecamente relacionadas com a disponibilidade hídrica e nutricional, exercendo grande influência em características da vegetação local. O objetivo deste estudo foi descrever e analisar características da morfológicas e anatômicas de folhas de espécies em diferentes microrrelevos, em um fragmento de Floresta Ombrófila Densa Submontana, na região da Serra do Mar, Estado de São Paulo. / Abstract: Plant species morphological and anatomical leaf traits are important indicators of their ecology and habitats. The variation of leaf anatomical traits, in relation to different environmental conditions, such as water stress, light, soil type, nutrient availability, is interpreted as ecophysiological response of plants to microclimatic differences. Among the morpho-anatomical traits, leaf area, specific leaf area (SLA), stomatal density, total thickness of leaf blade, the thickness of palisade parenchyma, thickness of epidermis, the amount of sclerenchyma, the ratio of palisade and spongy tissue, are some traits that can be used to assess the degree of scleromorphy of vegetation. Soil characteristics, such as availability of water and nutrients, pH, texture, may vary due to relief conditions, such as slope. Relief variations are intrinsically related to water and nutrient availability, exercising great influence on the characteristics of local vegetation. The aim of this study was to describe and analyze morphological and anatomical characteristics of leaves of herbaceous species on different micro-relief in a fragment Lower Montane Rain Forest in the Serra do Mar, State of Sao Paulo. / Mestrado / Biologia Vegetal / Mestre em Biologia Vegetal

Whereas manually drawn contours could contain artifacts related to hand tremor, automatically detected contours could contain noise and inaccuracies due to limitations or errors in the procedures for the detection and segmentation of the related regions. To improve the further step of description, modeling procedures are desired to eliminate the artifacts in a given contour, while preserving the important and significant details present in the contour. In this work, are presented a couple of polygonal modeling methods, first a method applied direct on the original contour and other derived from the turning angle function. Both methods use the following parametrization Smin e µmax to infer about removing or maintain a given segment. By the using of the mentioned parameters the proposed methods could be configured according to the application problem. Both methods have been shown eficient to reduce the influence of noise and artifacts while preserving relevant characteristic for further analysis. Systems to support the diagnosis by images (CAD) and retrieval of images by content (CBIR) use shape descriptor methods to make possible to infer about factors existing in a given contour or as base to classify groups with dierent patterns. Shape factors methods should represent a value that is aected by the shape of an object, thus it is possible to characterize the presence of a factor in the contour or identify similarity among contours. Shape factors should be invariant to rotation, translation or scale. In the present work there are proposed the following shape features: index of the presence of convex region (XRTAF ), index of the presence of concave regions (V RTAF ), index of convexity (CXTAF ), two measures of fractal dimension (DFTAF e DF1 TAF ) and the index of spiculation (ISTAF ). All derived from the smoothed turning angle function. The smoothed turning angle function represent the contour in terms of their concave and convex regions. The polygonal modeling and the shape descriptors methods were applied on the breast masses classification issue to evaluate their performance. The polygonal modeling procedure proposed in this work provided higher compression and better polygonal fitness. The best classification accuracies, on discriminating between benign masses and malignant tumors, obtain for XRTAF , V RTAF , CXTAF , DFTAF , DF1 TAF and ISTAF , in terms of area under the receiver operating characteristics curve, were 0:92, 0:92, 0:93, 0:93, 0:92 e 0:94, respectively. / Contornos obtidos manualmente podem conter ruídos e artefatos oriundos de tremores da mão bem como contornos obtidos automaticamente podem os conter dado a problemas na etapa de segmentação. Para melhorar os resultados da etapa de representação e descrição, são necessários métodos capazes de reduzir a influência dos ruídos e artefatos enquanto mantém características relevantes da forma. Métodos de aproximação poligonal têm como objetivo a remoção de ruídos e artefatos presentes nos contornos e a melhor representação da forma com o menor número possível de segmentos de retas. Nesta disserta ção são propostos dois métodos de aproximação poligonal, um aplicado diretamente no contorno e outro que é obtido a partir da função tangencial do contorno original. Ambos os métodos fazem uso dos parâmetros Smin e µmax para inferirem sobre a permanência ou remoção de um dado segmento. Com a utilização destes parâmetros os métodos podem ser configurados para serem utilizados em vários tipos de aplicações. Ambos os métodos mostram-se eficientes na remoção de ruídos e artefatos, enquanto que características relevantes para etapas de pós-processamento são mantidas. Sistemas de apoio ao diagnóstico por imagens e de recuperação de imagens por conte údo fazem uso de métodos descritores de forma para que seja possível inferir sobre características presentes em um dado contorno ou ainda como base para medir a dissimilaridade entre contornos. Métodos descritores de características são capazes de representar um contorno por um número, assim é possível estabelecer a presença de uma característica no contorno ou ainda identificar uma possível similaridade entre os contornos. Métodos para extração de características devem ser invariantes a rotação, translação e escala. Nesta dissertação são propostos os seguintes métodos descritores de características: índice de presença de regiões convexas (XRTAF ), índice da presença de regiões côncavas (V RTAF ), índice de convexidade (CXTAF ), duas medidas de dimensão fractal (DFTAF e DF1 TAF ) e o índice de espículos (ISTAF ). Todos aplicados sobre a função tangencial suavizada. A função tangencial suavizada representa o contorno em termos de suas regiões côncavas e regiões convexas. Os métodos de aproximação poligonal e descritores de características foram aplicados para o problema de classificação de lesões de mama. Os resultados obtidos, mostraram que os métodos de aproximação poligonal propostos neste trabalho resultam em polígonos mais compactos e com melhor representação do contorno original. Os melhores resultados de classificação, na discriminação entre lesões benignas e tumores malignos, obtidos por XRTAF , V RTAF , CXTAF , DFTAF , DF1 TAF e ISTAF , em termos da área sob a curva ROC, foram 0:92, 0:92, 0:93, 0:93, 0:92 e 0:94, respectivamente. / Mestre em Ciência da Computação