L'étude porte sur l'allocation de ressources aux œufs d’oiseaux selon les caractéristiques du mâle partenaire. Les données étudiées sont la taille de la ponte et les caractéristiques des œufs (masse, volume, masse des constituants, concentration de testostérone). Les caractéristiques du mâle prises en compte sont s'il est choisi ou non par la femelle, son statut social et la qualité de ses émissions sonores. Trois expériences ont été menées sur le canari domestique (Serinus canaria) en laboratoire, au sein du LECC de Paris Ouest Nanterre La Défense. Deux expériences portant sur la perdrix grise (Perdix perdix) ont eu lieu en milieu semi-naturel au DISAV de l’Università degli Studi del Piemonte Orientale (Italie). Chez le canari, nous observons un effet positif de la préférence et du statut social sur la masse du vitellus, ce qui peut permettre aux nouveau-nés de continuer leur développement précoce même en l'absence de nourrissage. Chez la perdrix, l'effet positif porte sur la concentration de testostérone du vitellus. Cette hormone peut rendre les oisillons nidifuges plus compétitifs vis-à-vis des couvées voisines. Les femelles de canari écoutant un chant supra naturel pondent des œufs plus lourds et volumineux, avec plus de vitellus et d'albumen, ce qui permet un meilleur développement embryonnaire. De plus, chez le canari, la concentration de testostérone augmente tout au long de la ponte, améliorant probablement la compétitivité des derniers-nés de la couvée vis-à-vis de leurs aînés. En conclusion, la femelle n'est pas seule à déterminer les caractéristiques des œufs. Le mâle partenaire a aussi une influence sur leur composition et donc sur le développement des jeunes. / The study concerns female birds' allocation of resources into bird eggs as a function of characteristics of the males. The data collected are the number of eggs and the eggs' characteristics (mass, volume, component mass, yolk testosterone concentration). The manipulated characteristics of the partner are female preference, male social status and song quality. Three experiments were conducted on the domesticated canary (Serinus canaria) in laboratory conditions, with the LECC of the University Paris Ouest Nanterre La Défense (France). Two other experiments were conducted on the grey partridge (Perdix perdix) in a semi-natural environment, at the DISAV of the University degli Studi del Piemonte Orientale (Italy). We found a positive effect of female preference and male social status on yolk mass in the canary. With extra yolk, hatchlings can continue their development even if they are not fed in the first few days after hatching. In the partridge, the positive effect was in yolk testosterone concentration. Increased testosterone level can help precocial chicks compete with neighbouring chicks. Female canaries exposed to artificially enhanced songs laid larger and heavier eggs, with heavier yolks and albumens that enhance embryonic development. Moreover, in canaries, testosterone concentration increased with laying order. Chicks hatched from eggs laid last would be better competitors in the nest to get food from their parents. To conclude, eggs characteristics depend on the male as well as the female.

Les poules pondeuses sont susceptibles d’être exposées à des polluants organiques persistants (POP) potentiellement présents dans leur environnement. Dans un contexte de sécurisation des systèmes d’élevage avicole vis-à-vis des POP, nous avons étudié les facteurs influençant le transfert des POP ingérés vers l’œuf. Ces facteurs sont liés à la nature de la matrice ingérée (sol ou aliment), aux caractéristiques de l’animal (taux de ponte, état d’engraissement) et aux caractéristiques de la molécule (lipophilicité, susceptibilité à la métabolisation). Pour cette étude, différentes approches scientifiques ont été mobilisées : l’expérimentation in vivo et la modélisation mathématique. Les expérimentations in vivo ont permis d’étudier la biodisponibilité relative des PCB d’un sol naturellement contaminé, et de renseigner les paramètres de la cinétique de transfert vers l’œuf de molécules non encore étudiées chez la poule pondeuse telles que des molécules émergentes (exemple d’un retardateur de flammes bromé, HBCD) ou les HAP. Nos résultats montrent en particulier l’importance de l’impact du degré de métabolisation de la molécule sur l’allure de la cinétique et le niveau du transfert. L’élaboration d’un modèle mathématique dynamique a permis d’explorer l’influence des caractéristiques de l’animal sur le transfert de POP vers l’œuf. Le niveau de ponte influence directement, et de façon proportionnelle, le niveau de contamination des tissus de la poule à l’état d’équilibre. Le niveau d’engraissement a un rôle de dilution en cas de période de non ponte et influence de façon marquée la vitesse de décontamination des tissus lors d’une période d’épuration suivant une exposition / Laying hens are likely to be exposed to a wide range of persistent organic pollutants (POPs) potentially present in their environment. In the context of securing poultry farming systems regarding POPs, our research has focused on identifying and grading factors likely to influence the transfer of ingested POPs to eggs. These factors are related to the nature of the ingested matrix (soil or feed), to the characteristics of the animal (laying rate, fatness) and to the properties of the molecule (lipophilicity, sensitivity to metabolism). Different scientific approaches have been implemented: in vivo experimentation and mathematical modeling. In the frame of in vivo experiments we have assessed the relative bioavailability of PCBs from one naturally contaminated soil. In addition, we have calculated parameters of the kinetics of transfer to eggs of molecules that had never been studied in laying hens, such as emerging molecules (for example a brominated flame retardant, HBCD), or PAHs. Our results point out the dominant impact of the molecule metabolism on the shape of its kinetics and on its rate of transfer to eggs.The developed dynamic mathematical model makes it possible to pilot variations with time of the size of the lipid compartments in the animal and of the frequency of laying. It was used to assess the influence of these animal characteristics on the transfer of POPs to eggs. Laying rate proportionally influences the contamination level of eggs and of animal tissues at steady state. Body fat dilutes absorbed POPs in absence of laying and significantly influences the rate of decontamination of tissues during depuration subsequent to an exposure period

La plupart des études sur l’hybride naturel entre Schistosoma haematobium (S.) et S. guineensis sont réalisées sur les vers adultes et contrairement aux études expérimentales sur l’hybridation, on ne retrouve pas de vers adultes hybrides après analyse de leur ADN. Avec cette étude, nous souhaitons mettre en évidence la présence d’hybride naturel entre ces deux espèces au Gabon à partir du premier élément suspect : l’œuf. Nous avons suivi l’œuf de son observation morphologique, à sa coloration par la technique de Ziehl-Neelsen jusqu’à l’amplification par PCR de son ADN et on a pu montrer qu’un œuf de morphologie suspecte observé dans les urines est capable d’amplifier à la fois une région spécifique de S. haematobium et de S. guineensis. / Most studies on the natural hybrid between Schistosoma haematobium (S.) and S.guineensis are performed on adult worms and contrary to experimental studies of hybridization, we do not find an adult hybrid worm after analysis of their DNA. With this study, we wish to highlight the presence of a natural hybrid between these two species in Gabon from the first suspect element: the egg. We followed the egg from its morphological observation to its staining using Ziehl-Neelsen technique until PCR amplification of its DNA and it has been shown that a suspected egg morphology seen in the urine is able to amplify both a specific region of S. haematobium and S. guineensis.

Les échantillons archivés dans les banques d'échantillons de l’environnement (Environmental Specimen Banks en anglais, ESB) sont, parmi les échantillons disponibles pour effectuer des recherches sur l'environnement, les mieux caractérisés géographiquement et issues de longues séries chronologiques. Le mercure (Hg) est un métal lourd hautement toxique et très répandu qui reste l'un des contaminants majeur de l'environnement; les ESB ont joué un rôle de premier plan dans les recherches effectuées sur ce dernier. Ce travail de thèse résume et discute dans un premier temps les modes d’emplois classiques des ESB pour l'étude du mercure dans les écosystèmes aquatiques. Une étude, issue du projet “Seabird Tissue Archival and Monitoring Project” (STAMP), est ainsi présentée pour illustrer comment les œufs d'oiseaux marins peuvent être utilisés pour surveiller les concentrations en Hg environnemental dans les écosystèmes marins subarctique et Arctique. Ce travail présente également un panel d’échantillons archivés dans les ESB du monde entier ; ces échantillons étant estimés comme les plus robustes, fournissent une ressource précieuse pour mener des recherches dans le domaine émergent de la chimie des isotopes stables de mercure. Les signatures isotopiques de fractionnement du mercure sont utilisées pour la répartition des sources et le traçage du cycle biogéochimique du Hg. Ceci est illustré par les résultats de deux études effectuées sur des œufs d'oiseaux marins d’Alaska archivés. Etant donné que les recherches sur les isotopes stables du mercure continuent d'évoluer, les ESB peuvent fournir une source d’échantillons robuste et économique pour élargir et diversifier l'inventaire des mesures des isotopes de Hg, et être utilisées pour développer et tester des hypothèses. Les échantillons archivés dans les ESB sont disponibles à des collaborateurs externes afin d'effectuer des recherches à fort impact, et devraient être pleinement exploités pour répondre aux nouvelles préoccupations environnementales. / The specimens archived in Environmental Specimen Banks (ESBs) are among the longest time-series, most geographically robust, and highest integrity samples available for performing environmental research. Mercury (Hg) is a highly toxic and ubiquitous heavy metal that remains one of the world’s most prominent environmental contaminants, and ESBs have played a prominent role in Hg research. We review and discuss some of the ways in which ESBs have traditionally been used to study Hg in aquatic ecosystems, and show an example of how seabird eggs from the Seabird Tissue Archival and Monitoring Project (STAMP) are used for monitoring environmental Hg concentrations in subarctic and Arctic marine ecosystem. We also highlight some of the most robust sample sets archived in ESBs worldwide, which provide a valuable resource for conducting research in the emerging field of Hg stable isotope chemistry. Signatures of Hg isotope fractionation are used for source apportionment and for tracing biogeochemical cycling of Hg. We present results from two additional studies in Alaska that show how banked seabird eggs can be used for each of these purposes. As the research surrounding Hg stable isotopes continues to mature, ESBs can provide a robust and economical sample archive to expand and diversify the inventory of Hg isotope measurements, and be used to develop and test hypotheses. Samples archived in ESBs are available for request by external collaborators in order to perform high impact research, and should be fully utilized to address emerging environmental concerns.

Nous avons étudié les mécanismes d'impact de l'algue envahissante Caulerpa taxifolia (Vahl) C. Agardh sur les poissons en Méditerranée, en particulier à l'aide d'une étude approfondie sur une espèce « modèle » : Symphodus ocellatus (Forsskål). Un suivi des peuplements de poissons ainsi que des expérimentations in situ ont été réalisés au niveau du département des Alpes-Maritimes, sur des milieux colonisés par l'algue et des milieux témoins. Caulerpa taxifolia qui forme des prairies de frondes très denses et hautes, de la fin de l'été jusqu'au début de l'hiver, représente une gêne physique pour l'accès à la nourriture benthique et aux microhabitats. Le suivi de deux récifs artificiels crées in situ a montré que l'envasement et l'obstruction de cavités par C. taxifolia diminuent la capacité d'accueil d'un milieu rocheux pour la faune ichtyologique. La raréfaction d'abris convenables mène à une augmentation de la mortalité des petits individus par prédation. L'étude de contenus digestifs ainsi que des acides gras corporels chez S. ocellatus montre un changement de régime alimentaire sur les milieux envahis (augmentation de la consommation de plancton au détriment des proies benthiques). En aquarium, nous avons montré que l'accessibilité aux proies benthiques diminue avec la densification de l'algue. Nous avons observé in situ que C. taxifolia pose également le problème de l'accès et de la détection des proies benthiques pour les rougets de roche Mullus surmuletus. Sur les milieux colonisés, le bilan énergétique global se traduit par des déficits de 21% dans le contenu lipidique corporel chez les jeunes S. ocellatus et de 59% dans les lipides de stockage du foie ainsi que par un déficit pondéral au niveau du foie et des ovaires chez les femelles reproductrices. Cependant, la qualité des œufs n'est pas affectée. Par ailleurs, in situ, les toxines de C. taxifolia n'ont pas d'influence sur le succès de développement embryonnaire de S. ocellatus.