主題檔案館是檔案館分類之一，具有檔案館基本屬性，因館藏內容特殊性及專業性，而有不同類型之主題檔案館；主題檔案館同時保存檔案與資料，致使檔案與資料一體化管理，形成主題檔案館最主要之特色。軍事檔案館屬於主題檔案類型，以軍事或戰爭資料為主要典藏對象，因其典藏媒體多樣化，且有許多實體武器之保存與展示，因此，軍事檔案館所使用名稱依據典藏資料特性而異。如：戰爭紀念館、國防檔案館、軍事博物館等，以文獻資產觀念而言，均屬於軍事檔案館之範疇。 本研究使用「文獻分析法」與「深度訪談法」進行研究，由文獻分析中探討法國、德國、英國、美國、澳洲、日本等國及我國國軍歷史文物館、海軍軍史館、空軍軍史館、八二三及古寧頭戰史館等軍事檔案館建置歷程、館藏及其組織架構與人力。 深度訪談對象包括國軍歷史文物館、海軍軍史館、空軍軍史館、八二三及古寧頭戰史館、國防部、檔案管理局等七個單位，藉以瞭解各相關單位對建置軍事檔案館之看法與意見。同時結合各國軍事檔案館建置、發展，及我國軍史館與戰史館現況，研擬我國建置軍事檔案館方案，以供未來建置規劃之參考。 本研究提出六點結論：一、設置軍事檔案館之必要性，主要有下列五點：（一）軍事檔案館典藏資料具有特殊性及專業性，以主題方式管理及應用，具有良好之效益；（二）就風險管理而言，可以分擔風險；（三）在政府組織再造之際，可避免組織架構重疊；（四）臺灣地理位置極具地緣戰略價值，國防軍事資料為國內及國際所重視；（五）配合檔案開放應用之規定，成立軍事檔案館不但可以確保資料安全，同時滿足檔案開放應用之需求；二、確立主題檔案館定位，以利後續發展；三、主題檔案館缺乏法源依據，檔案館組織、人員及預算編制法制化以利未來檔案館館務運作長期穩定發展；四、先進國家對特定檔案多設置主題檔案館，我國應朝向設立綜合性國家檔案館及主題性檔案館併行之發展；五、國防部檔案管理機制健全，在軟體方面已具有國防軍事主題檔案館之雛型；六、軍史館與戰史館具分別存在價值。 依據研究結果提出之建議：一、制定主題檔案館相關法源依據，以利未來檔案館館務正常運作之發展；二、軍事檔案館檔案屬於國家檔案，方能化解建置過程中可能遭遇之窒礙因素；三、建置國防檔案專責單位，統籌管理與執行國防檔案及軍事主題檔案館相關政策；四、主題檔案館應與休憩結合，提升民眾使用檔案之興趣，並提高軍事主題檔案館在國際之知名度。