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Non-centrosomal microtubule nucleation and organization in mitosisLecland, Nicolas, 1984- 10 April 2014 (has links)
During mitotic spindle assembly, γ-tubulin ring complexes (γTuRCs) nucleate
microtubules at the centrosome, around mitotic chromatin and, by augmindependent
recruitment, from pre-existing microtubules. The analysis of these
distinct pathways in somatic cells is challenging due to the predominance of
centrosomal nucleation. It is also unknown how microtubules derived from different
nucleation pathways are organized into the bipolar spindle structure. Minus ends
were shown to be present throughout the spindle with a higher concentration near
the poles. However, the analysis of minus end dynamics has been prevented by
lack of a suitable probe.
I have identified the γ-tubulin ring complex (γTuRC) as a reliable marker for noncentrosomal
microtubule minus ends in the spindle and have confirmed the
accumulation of minus ends in the pole-proximal region. Using cells stably
expressing γ-tubulin fused to photoactivatable GFP and mutants of γTuRC
subunits, I have demonstrated that the γTuRC is recruited preferentially in the poledistal
spindle region, where it associates with microtubule minus ends and then
moves poleward along the mitotic spindle. Poleward transport of γTuRC at minus
ends depends on the molecular motors dynein, KIFC1 and KIF11. I also
discovered that some of the γTuRC that reaches the poles is stably incorporated at
the centrosomes, complementing the microtubule-independent centrosome
targeting previously described.
Using laser ablation of centrosomes, I studied non-centrosomal spindle assembly.
At mitotic entry, in the absence of centrosomes, these cells could nucleate
microtubules from the nuclear area. These microtubules formed multipolar spindles
but cells eventually divided into two daughter cells. However, cells derived from
these abnormal mitoses were typically not viable.
In summary, by revealing the dynamics of the minus ends of non-centrosomal
microtubules, I have provided novel insight into assembly and architecture of the
mitotic spindle. In addition, I have shown that centrosomes, even though not
essential for somatic cell division, play an important role in the fidelity of spindle
assembly and function. / Durante la formación del huso mitótico, los complejos anulares de γ-tubulina
(γTuRCs, del ingles γ-tubulin ring complexes) nuclean microtúbulos alrededor de
la cromatina mitótica y, mediante la interacción con el complejo de la Augmina, a
partir de otros microtúbulos ya existentes. El estudio de estos mecanismos en
células somáticas es complejo, debido a la predominancia de la nucleación
centrosomal de los microtúbulos en estas células. En la actualidad, aun no se
sabe como microtúbulos procedentes de distintas vías de nucleación se
organizan en la estructura bipolar del huso mitótico.
Se ha observado que los extremos (-) están presentes a lo largo del huso,
detectándose una mayor concentración cerca de los polos. A pesar de esto, no
se conocen estudios detallados acerca de la dinámica del extremo (-) debido a la
ausencia de marcadores adecuados.
He observado que el complejo anular de γ-tubulina (γTuRC) es un marcador
fiable de los extremos (-) en los microtúbulos acentrosomales presentes en el
huso mitótico. Además, he confirmado la acumulación de estos extremos (-) en
la región próxima a los polos del huso.
Utilizando líneas celulares que expresan de forma estable γ-tubulina fusionada a
un GFP foto-activable, y que además han sido transfectadas con isoformas
mutantes de subunidades del γTuRC, he demostrado que el γTuRC se recluta
preferentemente en regiones del huso alejadas de los polos. Allí el γTuRC se
asocia con los extremos (-) de los microtúbulos, para ser transportado a lo largo
del huso mitótico en dirección a los polos.
El transporte del γTuRC presente en los extremos (-) en dirección a los polos lo
realizan los motores moleculares Dineina, KIFC1 y KIF11. También he
descubierto que una parte de las moléculas de γTuRC que alcanzan los polos
del huso se integran de forma estable en los centrosomas, complementando la
vía de incorporación al centrosoma independiente de microtúbulos que ha sido
previamente descrita.
Usando la técnica de ablación de centrosomas con laser, he estudiado la
formación acentrosomal del huso. Cuando estas células entran en mitosis en
ausencia de centrosomas, pueden nuclear microtúbulos desde el área nuclear.
Estos microtúbulos forman husos multipolares, aunque las células finalmente se
dividen en dos células hijas. Las células procedentes de estas mitosis anormales
no suelen ser viables.
En conclusión, mediante el revelado la dinámica de los extremos (-) de los
microtúbulos no centrosomales, he proporcionado nueva información acerca del
ensamblaje y arquitectura del huso mitótico. Además, he demostrado que los
centrosomas, aunque no son esenciales para la división celular somática, juegan
un papel importante en el correcto ensamblaje y función del huso mitótico.
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A midzone-based ruler adjusts chromosome compaction to analphase spindle lengthNeurohr, Gabriel Erich 13 April 2012 (has links)
Partitioning of chromatids during mitosis requires that chromosome
compaction and spindle length scale appropriately with each other. However,
it is not clear whether chromosome condensation and spindle elongation are
linked. Here we have used chromosome fusions to examine the impact of
increased chromosome length during yeast mitosis. We find that yeast cells
could cope with a >50% increase in the length of their longest chromosome
arm by decreasing the physical length of the mitotic chromosome arm through
1) reducing the number of copies of the repetitive rDNA array and 2) by
increasing the level of mitotic condensation. Consistently, cells carrying the
fused chromosomes became more sensitive to loss of condensin- and its
regulator polo kinase/Cdc5. Length-dependent stimulation of condensation
took place during anaphase and depended on aurora/Ipl1 activity, its
localization to the spindle midzone, and phosphorylation of histone H3 on
Ser10, a known Ipl1 substrate. The anaphase spindle therefore may function
as a ruler to adapt the condensation of chromosomes to spindle length.
Consistent with this, chromosome condensation levels correlate with the
length of anaphase spindles.
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Chromatin fibers are formed by heterogeneous groups of nucleosomes in vivoRicci, Maria Aurelia, 1985- 05 June 2015 (has links)
La arquitectura del genoma y la estructura de la cromatina, junto con los factores de transcripción son actores clave para la autorenovación, la pluripotencia y la diferenciación de las células madre embrionarias (ESCs).
Combinando una microscopía cuantitativa de super-resolución (STORM) con simulaciones numéricas hemos sido capaz de definir cómo los nucleosomas están empaquetados en vivo, y hemos identificado un nuevo modelo de organización de la fibra de cromatina.
Encontramos que la fibra de cromatina está formada por grupos de nucleosomas de diferentes tamaños, que llamamos "nucleosome clutches" y que estos están intercalados con regiones sin nucleosomas. Además, el número medio de nucleosomas y su nivel de compactación dentro de los clutches, está relacionado con el estado celular. Células madre pluripotentes, tienen en promedio clutches con menos nucleosomas incluidos y de menos densidad con respecto a las células diferenciadas. / Nuclear architecture and chromatin structure, together with the transcriptional network are key players for self-renew, pluripotency and differentiation of embryonic stem cells (ESCs).
Combining quantitative super-resolution microscopy (STORM) with computer simulations we resolved how nucleosomes are arranged in vivo, identifying a novel model of organization of the chromatin fiber.
We found that chromatin fiber is formed by groups of nucleosomes of varying sizes, which we term “clutches” and these were interspersed with nucleosome-depleted regions. Moreover the median number of nucleosomes and their compaction inside clutches highly correlated with cellular state.
Ground-state pluripotent stem cells had, on average, less dense clutches containing fewer nucleosomes with respect to differentiated cells.
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Unravelling integrated kinetics during spindle assemblyCavazza, Tommaso, 1985- 30 October 2015 (has links)
To ensure faithful segregation of the genetic material, during mitosis the cell assembles the mitotic spindle, a macromolecular machine made of dynamic microtubules and associated proteins. Spindle microtubules are assembled de novo by the centrosomes and through the RanGTP pathway that is sufficient for spindle self-organization. In this thesis I used a proteomics approach to study the RanGTP pathway induced microtubules and spindle self-organization and I propose that it occurs through a multi-step mechanism. I then addressed how the centrosomal and acentrosomal microtubule assembly pathways are integrated to build the bipolar spindle. My data suggest that, in small cells, centrosome maturation defines an optimal and essential balance between these two pathways due to a competition for limiting amounts of tubulin. Interestingly in big cells, I found that centrosome maturation ensures the correct positioning of each centrosome to a spindle pole and thereby assures proper centrosome segregation to the daughter cells. Finally, I present molecular insights about the interaction of the microtubule polymerase XMAP215 with its mitotic interactor TACC3. / Durant la mitosi, per assegurar que el material genètic es segrega correctament, la cèl•lula construeix el fus mitòtic, una maquinària macromolecular formada de microtúbuls dinàmics i proteïnes associades. Els microtúbuls del fus són formats de novo pels centrosomes o a través de la “RanGTP pathway”, la qual és autosuficient per promoure l'autoorganització del fus mitòtic. En aquesta tesi he utilitzat tècniques de proteòmica per estudiar com la “RanGTP pathway” indueix l'autoorganització dels microtúbuls i del fus mitòtic a través d’un procés amb múltiples passos (tal i com indiquen els resultats obtinguts). Paral•lelament he estudiat com els microtúbuls formats per ambdues vies (centrosomes i “RanGTP pathway”) es coordinen per la construcció del fus bipolar. Els meus resultats suggereixen que, en cèl•lules petites, la maduració dels centrosomes defineix un equilibri òptim i essencial entre els dos sistemes, com a conseqüència de la disponibilitat limitada de tubulina. Per altra banda, en cèl•lules grans la maduració dels centrosomes condiciona la correcta localització d’aquests als pols del fus mitòtic, assegurant-ne la segregació a les dues cèl•lules filles. Finalment, exposo els detalls moleculars de la interacció entre la polimerasa de microtúbuls XMAP215 i el seu interactor mitòtic TACC3.
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Role of mTOR in the activation of marginal zone B cells by TACIGentile, Maurizio, 1981- 19 September 2014 (has links)
The marginal zone (MZ) of the spleen contains an innate-like subset of B cells that
mount rapid protective antibody responses to polysaccharides and lipids from bloodborne
viruses and bacteria. These antigens activate MZ B cells by engaging
somatically recombined B cell receptors (BCRs) and germline-encoded patternrecognition
receptors, including Toll-like receptors (TLRs). MZ B cells receive additional
co-stimulatory signals from a proliferation-inducing ligand (APRIL) and B cellstimulating
factor of the TNF family (BAFF), two tumor necrosis factor (TNF)-related
cytokines released mainly by macrophages, dendritic cells and neutrophils in response
to microbes. BAFF and APRIL stimulate MZ B cells through a poorly characterized
receptor called transmembrane activator and CAML interactor (TACI). Here we show
that TACI induces antibody production and class switching by activating the kinase
mammalian target of rapamycin (mTOR) through MyD88, an adaptor protein usually
associated with TLRs. The discovery of this rapamycin-sensitive signalling pathway
may facilitate the development of novel strategies for the modulation of protective or
pathogenic antibody responses emanating from MZ B cells. / La zona marginal (ZM) de la melsa conté un subgrup de cèl∙lules B de tipus innat que
organitzen de forma ràpida respostes d’anticossos protectors contra polisacàrids i
lípids de virus i bacteris transmesos per la sang. Aquests antígens activen les cèl∙lules
B de la ZM en interaccionar amb receptors de les cèl・lules B (BCR) que han patit
recombinació somàtica i receptors de reconeixement de patrons, incloent els receptors
de tipus Toll (TLR). Les cèl・lules B de la ZM reben senyals co-estimuladores
addicionals del lligand inductor de proliferació (APRIL) i el factor estimulant de
cèl・lules B de la família del TNF (BAFF), dos citocines relacionades amb el factor de
necrosis tumoral (TNF) alliberades principalment per macròfags, cèl∙lules dendrítiques
i neutròfils en desposta a microbis. BAFF i APRIL estimulen les cèl∙lules B de la ZM
mitjançant un receptor poc caracteritzat anomenat activador de transmembrana i
interactor de CAML (TACI). En aquest estudi demostrem que TACI indueix producció
d’anticossos i canvi de classe de la cadena pesada de les immunoglobulines activant
la quinasa diana de la rapamicina dels mamífers (mTOR) mitjançant MyD88, una
proteïna adaptadora habitualment associada amb els TLRs. El descobriment d’aquesta
via de senyalització sensible a la ramapicina podria facilitar el desenvolupament de
noves estratègies per la modulació de les respostes protectores o patogèniques dels
anticossos produïts per les cèl・lules B de la ZM.
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The Cytokinetic inhibitors Boi1 and Boi2 are required for activation of the exocyst complex by Rho GTPasesMasgrau Fortuny, Aina, 1986- 05 September 2014 (has links)
Cell growth and division requires delivery of new membrane and remodelling factors to
the cell surface. In budding yeast, this involves actin-dependent transport of secretory
vesicles to sites of growth, followed by vesicle fusion to the plasma membrane. Rho-type
GTPases regulate actin polarization and vesicle fusion, but how they signal to diverse
effectors controlling these separate processes is not well understood. Here, we show that
the cortical proteins Boi1 and Boi2 work together with Rho GTPase signalling to
regulate the exocyst, a complex that mediates the tethering of secretory vesicles to the
plasma membrane. Cells lacking both Boi proteins show normal actin polarity but are
defective in bud emergence, bud growth, and fusion of Bgl2-containing vesicles to the
plasma membrane. A gain-of-function version of Exo70, a component of the exocyst
and effector of Cdc42 and Rho3, restores growth of boi1 boi2 mutant cells. Furthermore,
hyperactivation of Rho-GTPase signalling rescues boi defects, suggesting that the
essential function of Boi proteins is to mediate Rho-dependent activation of the exocyst
during cell growth. Finally, we find that Boi1 and Boi2-dependent inhibition of
abscission in cells with chromatin bridges, via their function in the NoCut checkpoint, is
bypassed by expression of gain-of-function EXO70, suggesting the NoCut pathway also
involves regulation of the exocyst. / Tant el creixement com la divisió cel·lular requereix el transport de membrana i altres
factors a la superfície cel·lular. En cèl·lules de S. cerevisiae, aquests processos necessiten el
transport de vesícules de secreció a través dels cables d’actina fins a les zones de
creixement actiu, on es fusionen. Les Rho GTPases regulen la polarització de l’actina i la
fusió de vesícules, però es desconeix com les GTPases senyalitzen els diversos efectors i
com regulen els dos tipus de funcions.
En aquest estudi, demostrem que les proteines Boi1 i Boi2 treballen conjuntament amb
la senyalització de les Rho GTPases, per tal de regular la funció del complexe “exocyst”
que media els contactes inicials entre vesícules de secreció i la membrana plasmàtica.
Cèl·lules sense Boi1/2 tenen el citoesquelet d’actina polaritzat, però la cèl·lula filla no pot
emergir ni créixer. Un al·lel d’Exo70, una subunitat de l’”exocyst”, que és efector de les
GTPases Rho3 i Cdc42, restaura el creixement de cel·lules defectuoses en la funció de
Boi1/2. A més a més, l’hiperactivació de GTPases rescata defectes dels mutants de
Boi1/2, suggerint que la funció essencial de Boi1 i Boi2 és promoure l’activació de
l’”exocyst”, depenent de Rho, durant el creixement cel·lular.
Finalment, hem demostrat que la inibició de la divisió cel·lular que controlen via NoCut
els efectors Boi1/2 en cèl·lules amb defectes en la segregació de cromosomes, es rescata
amb l’al·lel d’Exo70 descrit anteriorment. Aquestes observacions suggereixen que NoCut
podria funcionar també a través de la regulació de l’”exocyst”.
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The Role of p63 and the chromatin remodeler Lsh in senescence, tumor development and lymphangiogenesisPecoraro, Matteo, 1984- 02 October 2014 (has links)
La senescencia celular es una detención irreversible del ciclo celular que tiene lugar en respuesta a diversos estímulos de estrés, actuando como un mecanismo supresor de tumores para impedir la proliferación de células con riesgo de transformación maligna. Así, mutaciones que interfieren con el proceso de la senescencia pueden favorecer la formación tumoral. De todas formas, cada vez hay más pruebas que sugieren que las células senescentes también pueden ejercer efectos pro-tumorigénicos en el tejido circundante mediante el fenotipo secretor asociado a senescencia (SASP). Así, descifrar los mediadores moleculares de la senescencia y el SASP es crítico para entender los estadios tempranos de la formación y progresión tumoral. Aquí mostramos que la isoforma ΔNα de p63, un factor de transcripción relacionado con p53, es un oncogén que promueve la iniciación tumoral en colaboración con Ras mediante la inhibición de la senescencia inducida por oncogenes (OIS). Efectivamente, el incremento en la expresión de ΔNp63α en queratinocitos primarios de ratón bloquea la OIS y directamente conduce a la formación de un carcinoma de células escamosas (SCC). También identificamos la Helicasa Específica Linfoide (Lsh), un miembro de la familia SNF2 de remodeladores de la cromatina, como nueva diana de p63 necesaria para la inhibición de la senescencia. Posteriormente, demostramos que Lsh es suficiente para iniciar la formación tumoral independientemente de p63, y que el aumento en su expresión conduce a un desarrollo tumoral más agresivo. Sorprendentemente, mostramos que Lsh tiene un papel en la inducción de la linfangiogénesis, un proceso característico de la progresión maligna y la metástasis. Es interesante notar que las pruebas apuntan hacia Lsh actuando sobre el SASP para dirigir la formación y la progresión tumoral. En conjunto, en este trabajo se identifican nuevos mediadores críticos de la senescencia y funciones de la desregulación de la senescencia durante la formación y la progresión tumoral. / Cellular senescence is an irreversible cell cycle arrest that occurs in response to various stresses, acting as a tumor-suppressive mechanism to impede the proliferation of cells at risk for malignant transformation. As such, mutations that interfere with the senescence process can favor tumor formation. However, increasing evidence suggests that senescent cells can also exert pro-tumorigenic effects on the surrounding tissue, through the senescence-associated secretory phenotype (SASP). As such, understanding the molecular mediators of senescence and the SASP is critical to unravel the early stages of tumor formation and progression. Here we show that the ΔNα isoform of p63, a p53-related transcription factor, is an oncogene that promotes tumor initiation in cooperation with Ras, through the inhibition of oncogene-induced senescence (OIS). Indeed, increased expression of Np63 in primary mouse keratinocytes blocks OIS and directly leads to the formation of squamous cell carcinoma (SCC). We also identify Lymphoid Specific Helicase (Lsh), a member of the SNF2 family of chromatin remodelers, as a novel target of p63, required for senescence bypass. Subsequently, we demonstrate that Lsh is sufficient to initiate tumor formation independently of p63, and that its increased expression leads to aggressive tumor development. Surprisingly, we show a role for Lsh in the induction of lymphangiogenesis, a hallmark of malignant progression and metastasis. Interestingly, the evidence points towards Lsh acting on the SASP to instruct tumor formation and progression. Together, this work identifies critical new mediators of senescence, and functional roles for senescence deregulation during tumor formation and progression.
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Cross-talk between iron starvation and H202 signaling pathways in Schizosaccharomyces pombeGabrielli, Natalia, 1978- 04 December 2012 (has links)
Hydrogen peroxide (H2O2), a reactive oxygen species (ROS), is involved in both oxidative stress and signaling cascades in a dosage dependent manner. Its toxicity is partially explained through reactivity with iron via the Fenton reaction. Iron, indispensible for many cellular processes, is thus tightly regulated to balance between need and toxicity. Using fission yeast as a model system, we explored the relationship between H2O2 and the iron starvation response system, specifically whether cross-talk allowed mutual regulation that could prevent synergistic toxicity of ROS via diminishing iron quantity. We screened around of 2700 haploid Schizosaccharomyces pombe deletion mutants in different oxidative stress agents, identifying new genes amongst which fep1, pcl1 and sib2 are involved in iron homeostasis. H2O2, unexpectedly, triggers transcriptional iron starvation response, including enhanced iron import and decreased iron consumption. Over-expression of several antioxidant proteins, in particular heme-containing catalase, causes strong iron consumption within the cell, triggering the iron starvation pathway accidentally. Furthermore, glutaredoxin Grx4 contains an iron-sulfur cluster (ISC) involved in iron sensing, underpinning regulation of the iron starvation response. Finally, we identify and characterize the frataxin homolog gene in S. pombe, pfh1. Deficiencies in frataxin provoke a neurodegenerative disease called Friedreich ataxia; the function of this protein remains controversial. We create ∆pfh1 strain as a new model system to elucidate the molecular events leading to the disease. / El peróxido de hidrógeno (H2O2) es un agente oxidante que además de participar en cascadas de señalización produce toxicidad por daño oxidativo. Parte de su toxicidad se explica por su reactividad con hierro. Así, las concentraciones de hierro en el interior celular han de estar estrictamente reguladas. Usando la levadura de fisión, Schizosaccharomyces pombe, como un sistema modelo, estudiamos las relaciones entre H2O2 y el sistema de respuesta a déficit de hierro. Genes como fep1, pcl1 y sib2, importantes para mantener su homeostasis, fueron encontrados en un análisis de 2700 mutantes de S. pombe, tras tratamiento con diferentes agentes oxidantes. Inesperadamente encontramos que H2O2 desencadena una respuesta transcripcional de déficit de hierro, incluyendo aumento de su entrada y disminución de su consumo. Ésta es una respuesta accidental debido a la sobreexpresión de proteínas como catalasa, una hemoproteína, consumidoras masivas de hierro. Encontramos además que la glutaredoxina Grx4 contiene un clúster de hierro-azufre implicado en sensar hierro. Finalmente, identificamos, caracterizamos y delecionamos el homólogo de frataxina en S. pombe, pfh1. Deficiencias en frataxina provocan ataxia de Friedreich. Los mecanismos por los cuales se desencadena esta enfermedad están todavía por elucidar, pero S. pombe es un buen sistema modelo para su estudio.
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Systematic and quantitative analysis of the early embryonic development of Caenorhabditis elegansKrüger, Angela 14 December 2012 (has links)
The embryo of Caenorhabditis elegans is a model system in which development can be studied at single cell resolution. In this thesis I describe the use of a semi-automatic nuclear tracking algorithm to analyze cellular movements in the early embryo, as well as how embryos respond to mechanical deformation and to genetic perturbation. During gastrulation cells were observed to not only ingress into the interior of the embryo, but also to egress onto the surface. Moreover, cell lineages were identified that undergo both directional movements, i.e. first internalize and then continue to move until finally reemerging on the surface, “transgressing” or “tunnelling” through the embryo. The previously described stereotypical early rotation movements in compressed embryos were found to be highly variable in uncompressed embryos, with this variable global rotation largely determining the final embryonic axes. In addition to constraining this early rotation, compression of the embryo was found to alter the relative positions of cell groups. A compensatory mechanism was identified consisting of a global rotation of cells initiating more than an hour after the four-cell stage that realigns the relative positions of cell groups and results in a further rotation of the embryonic axes. Possible mechanisms that drive these corrective cell movements are discussed. Inhibiting the expression of 20 general regulators of chromatin and analyzing the phenotypic consequences at single cell resolution revealed functions in chromosome segregation, mitotic cell cycle progression, cellular movements and lineage-specific development, and suggested the existence of functionally diverse chromatin-modifying protein complexes in the embryo. Moreover, a global re-arrangement of nuclear architecture was observed upon the inhibition of zygotic gene expression. Taken together, these analyses illustrate the power of single cell resolution phenotyping, identify previously unrecognized cell behaviors during early development, and identify regulative cell movements as a mechanism that confers robustness to the effects of mechanical deformation. / El nemátodo Caernorhabditis elegans ofrece la posibilidad de estudiar el desarrollo embrionario con una resolución celular. En esta tesis, describo el uso de un algoritmo semi-automático de seguimiento nuclear para analizar movimientos celulares en el embrión temprano, así como la manera en que el embrión responde a deformaciones mecánicas y a perturbaciones genéticas. Durante el proceso de gastrulación, observamos que ciertas células no solo ingresan al interior del embrión, pero también egresan hasta la superficie. Asimismo, identificamos linajes celulares que llevan a cabo ambos tipos de movimientos direccionales, esto es, primero internalizan y luego la continuan su movimiento hasta finalmente re-emerger en la superficie, “transgressing” o “tunneling” a través del embrión. Hemos descubierto que los movimientos estereotípicos de rotación en el embrión temprano, descritos previamente, son altamente variables en ausencia de compresión y esta variabilidad total en la rotación determina los ejes finales del embrión. Además de limitar esta rotación temprana, la compresión del embrión altera la posición relativa de grupos celulares. Hemos identificado un mecanismo compensatorio que consiste en la rotación global de células el cual tiene lugar mas de una hora después del estadio de cuatro células. Ese mecanismo re-alinea la posición relativa de los grupos celulares resultando en una rotación adicional de los ejes embrionarios. Posibles mecanismos responsables de estos movimientos correctivos son discutidos. La inhibición de la expresión de 20 reguladores generales de la cromatina y el análisis de las consecuencias fenotípicas con resolución celular ha revelado funciones en la segregación de cromosomas, la progresión mitótica del ciclo celular, movimientos celulares y desarrollo linaje-especifico, sugiriendo la existencia de diversos complejos de proteínas modificadoras de la cromatina en el embrión. Además, hemos observado una re-organización global de la arquitectura nuclear al inhibir la expresión zigótica en el embrión. En conclusión, estos análisis han permitido ilustrar el poder de la fenotipificación con resolución celular, así como la identificación de comportamientos celulares previamente desconocidos durante el desarrollo temprano y movimientos celulares regulativos como un mecanismo que confiere robustez a los efectos de deformaciones mecánicas.
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Contribució del receptor domini discoidina 1 (ddr1) en el procés de mielinització. Aplicació de diferents models experimentalsTomàs Roig, Jordi 20 July 2010 (has links)
S'ha demostrat que la mielina està alterada en el cervell de pacients amb esquizofrènia. El gen domini discoidina 1 (DDR1), que s'expressa en mielina, s'ha trobat associat a esquizofrènia. Ambdues troballes fetes al grup de recerca on he desenvolupat el treball de tesi doctoral.· Contribucions i coneixements nous que aporta la tesiEn síntesi podem afirmar que DDR1 és clau en el procés de mielinització. Una regulació a la baixa d'aquest gen podria estar associat a malalties de mielina.Estudi1.Caracterització conductual durant el segon període de remielinització de ratolins tractats amb cuprizona al 0.2% durant 6 setmanes.-Pèrdua de la compactació i síntesi de la mielina en el procés de desmielinització.-Increment de la compactació i síntesi de la mielina durant el pic de remielinització.1. Alteracions estructurals dels mitocondris pel tractament de la cuprizona.2. Alteracions en el comportament.a. Període d'exposició a la cuprizona: menor activitat del SNC, deteriorament de les funcions motores i menys ansietat.b. Període de recuperació: major activitat del SNC, deteriorament de les funcions motores, menys ansietat i una menor activitat exploratòria. Estudi 2. Estudi 2. Caracterització conductal i estructural de la mielina en el ratolí deficient per DDR1 i estudi de la seva capacitat de remielinització. D'aquest estudi es desprenen els següents resultats:1. Alteracions en l'àrea, la densitat de l'axó i el gruix de la beina de mielina.2. Disminució del potencial remielinitzador.Alteracions en el comportament: disfuncions motores, hiporeactivitat del SNC, increment de l'ansietat i de l'activitat exploratòria. Els efectes de la cuprizona accentuen el comportament ansiós d'aquests animals.Estudi 3. El receptor domini discoidina 1 es troba sobre expressat durant la diferenciació de la línia cel·lular oligodendroglial HOG16.-Augment de l'expressió del gen DDR1 paral·lel a l'augment de gens de la mielina.· Metodologia emprada i conclusions més rellevantsLa present tesi doctoral es centra en dos models per aprofundir en el coneixement del paper de DDR1 en la mielina. Per una banda s'ha estudiat l'expressió de DDR1 en línies cel·lulars oligodendroglials sotmeses a diferenciació. Per altra banda s'ha caracteritzat tant histològicament com funcionalment el ratolí deficient en DDR1. El treball es divideix en tres estudis.Estudi 1. Caracterització conductual durant el segon període de remielinització de ratolins tractats amb cuprizona al 0.2% durant 6 setmanes. Desenvolupat a la Facultat de Medicina i Ciències de la Salut. Estudi descriptiu dels canvis ultraestructurals i de comportament dels ratolins alimentats amb una dieta 0.2% v/v de cuprizona durant 6 setmanes.Estudi 2. Caracterització conductal i estructural de la mielina en el ratolí deficient per DDR1 i estudi de la seva capacitat de remielinització. Desenvolupat a la Facultat de Medicina i Ciències de la Salut i a la Universitat de Toronto, Canadà. Estudi descriptiu del ratolí deficient en DDR1 i resposta a la demielinització per tractament amb cuprizona Estudi 3. El receptor domini discoidina 1 es troba sobre expressat durant la diferenciació de la línia cel·lular oligodendroglial HOG16. Desenvolupat a la Facultat de Medicina i Ciències de la Salut. Estudi in vitro de diferenciació del llinatge cel·lular oligodendroglial HOG16.· Resultats tangibles de la investigació: llibres, articles, comunicacions a congressos,...1. Franco-Pons N, Tomàs J, Roig B, Auladell C, Martorell L, Vilella E. Discoidin domain receptor 1, a tyrosine kinase receptor, is upregulated in an experimental model of remyelination and during oligodendrocyte differentiation in vitro. J Mol Neurosci. 2009 May;38(1):2-11. Epub 2008 Oct 4. PubMed PMID: 18836851. 2. Tomas-Roig J, Torrente M, Roig B, Moyano S, Vogel W, Colomina T, Vilella E. Brain deficits and impaired experimentally-induced remyelination in disocidin domain receptor 1 null mice. Enviat per a la seva publicació. * Estades de la persona que es doctora a altres grups de recercaL'estudi del model de desmielielinització i remielinització induït per cuprizona al 0.2% en ratolins deficients pel gen DDR1 ha tingut lloc amb la col·laboració i participació del doctorant en el grup de recerca encapçalat pel Dr. Wolfgang F. Vogel (Universitat de Toronto, Canadà) * Altres comentaris Participació en articles relacionats:Roig B, Franco-Pons N, Martorell L, Tomàs J, Vogel WF, Vilella E. Expressionof the tyrosine kinase discoidin domain receptor 1 (DDR1) in human centralnervous system myelin. Brain Res. 2010 Apr 6. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 20380825. / We have demonstrated that myelin is deteriorated in schizophrenic patients. Discoidin domain 1 gene (DDR1) is expressed in myelin and it's also associated with schizophrenia. Both findings were made by our research group.· Contributions and knowledge provided by the thesisIn summary we can say that DDR1 is a key process of myelinazation. A down regulation of this gene might be associated with diseases of myelin.Study 1. It has been described a loss of myelin compaction and synthesis during the demyelination process. It has carried out an increase of compaction and synthesis of myelin during remielinization peak.1. Structural alterations of mitochondria for the treatment of cuprizona.2. Alterations in behavior.a. Period of exposure to cuprizone: less activity of the CNS, impairment function motor and less anxiety.b. Recovery period: increased activity of the CNS, impaired motor functions, less anxiety and less exploratory activity.3. mRNA analysis have showed an increase of DDR1 expression during the remyelinization peak in parallel to another myelin gene.Study 2. From this study derived the following results:1. Alterations in the area, the density of the axon and the thickness of the myelin sheath.2. Decrease of the remyelinization potential. Alterations in behaviour: motor dysfunctions, hiporeactivity of the CNS, increase of anxiety and exploratory activity. Cuprizone accentuates the effects of anxious behaviour of these animals.Study 3.We described an increased expression of DDR1gene parallel to myelin genes.· Methodology used and most important conclusions This thesis focuses on two models to improve our knowledge of the role of DDR1 in myelinization. On one hand we have studied the expression of DDR1 in oligodendroglial cell lines undergoing differentiation. On the other hand has been characterized both histologically and functionally DDR1deficient mouse. The work was divided into three studies. Study 1. Behavioural features and ultrastructural myelin characterization during the second remyelinization period in those mice treated with cuprizone 0.2% for 6 weeks. It has been developed at the Faculty of Medicine and Health Sciences (Reus, Spain). Study 2. Behavioural characterization and myelin structure in knock-out mice for DDR1 and study its ability to carry out the remyelinization. It has been developed at the Faculty of Medicine and Health Sciences (Reus, Spain) and at the University of Toronto (Toronto, Canada). Descriptive study of DDR1 knock-out mice and their response to cuprizone treatment. Study 3. The discoidin domain receptor 1 is expressed during differentiation of the oligodendroglial cell line HOG16. It has been developed at the Faculty of Medicine and Health Sciences. In vitro study to evaluate changes in mRNA expression and changes in cells morphology. · Published papers:1. Franco-Pons N, Tomàs J, Roig B, Auladell C, Martorell L, Vilella E. Discoidin domain receptor 1, a tyrosine kinase receptor, is upregulated in an experimental model of remyelination and during oligodendrocyte differentiation in vitro. J Mol Neurosci. 2009 May;38(1):2-11. Epub 2008 Oct 4. PubMed PMID: 18836851. 2. Tomas-Roig J, Torrente M, Roig B, Moyano S, Vogel W, Colomina T, Vilella E. Brain deficits and impaired experimentally-induced remyelination in disocidin domain receptor 1 null mice. Submitted for its publication.· Stays in other countriesThe study of demyelinization and remyelinization model induced by cuprizone 0.2% on knock-out DDR1 mice has taken place with the collaboration and participation of the PhD student in the research group led by Dr. Wolfgang F. Vogel (University of Toronto, Canada). · Other commentsParticipation in related papers:Roig B, Franco-Pons N, Martorell L, Tomàs J, Vogel WF, Vilella E. Expression of the tyrosine kinase discoidin domain receptor 1 (DDR1) in human central nervous system myelin. Brain Res. 2010 Apr 6. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 20380825.
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