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The behavioral dynamics and temporal evolution of wall-following behaviour in blind and sighted morphs of the species Astyanax fasciatus

Sharma, Saurabh. January 2008 (has links)
Thesis (M.S.)--Bowling Green State University, 2008. / Document formatted into pages; contains ix, 72 p. : ill. Includes bibliographical references.
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Ação tóxica da urease de Canavalia ensiformis e do peptídeo recombinante Jaburetox-2Ec sobre Oncopeltus fasciatus (Hemiptera: Lygaidade) :

Defferrari, Marina Schumacher January 2010 (has links)
A Canavalia ensiformis é uma leguminosa altamente resistente ao ataque de insetos, e contribuindo para essa resistência, a planta possui isoformas de urease, que são proteínas que apresentam atividade entomotóxica. Essa toxicidade é dependente de uma ativação proteolítica da molécula por enzimas digestivas do inseto, do tipo catepsinas, e subseqüente liberação de peptídeos internos, os quais possuem a ação inseticida. A partir dessa informação foi construído um peptídeo recombinante com base na seqüência da urease, chamado Jaburetox-2Ec, o qual é tóxico para insetos resistentes e suscetíveis a urease intacta. O hemíptero Oncopeltus fasciatus é um dos nossos modelos de estudo. O objetivo deste trabalho foi identificar as principais peptidases digestivas de ninfas de O. fasciatus, auxiliando na elucidação do mecanismo de ação inseticida dessas toxinas, além de estudar os efeitos da urease intacta e do peptídeo derivado sobre órgãos isolados. Quando alimentadas com diferentes concentrações da urease majoritária de C. ensiformis (JBU), ninfas de O. fasciatus apresentam uma taxa de mortalidade superior a 80% após duas semanas, assim como quando injetadas com Jaburetox-2Ec apresentam uma taxa de mortalidade de 100% após 48 horas. Ninfas de quarto instar foram dissecadas para retirada dos intestinos e obtenção de um extrato protéico bruto, o qual foi utilizado para a realização dos ensaios enzimáticos. O extrato bruto foi capaz de hidrolisar in vitro a JBU e liberar peptídeos com massa semelhante a peptídeos entomotóxicos já conhecidos, reconhecíveis pelo anticorpo anti-Jaburetox-2Ec. A atividade proteolítica majoritária sobre substratos protéicos, em pH 4.0, foi bloqueada por inibidores específicos de aspártico e cisteíno peptidases, não sendo afetada EDTA, inibidor de metalopeptidases. Ao utilizar-se um substrato específico para cisteíno peptidases, o pico majoritário observado foi em pH 5.0, sendo a atividade completamente inibida por E-64 (inibidor de cisteíno peptidases) em todos os valores de pH testados. Ao utilizarse um substrato desenhado para aspártico peptidases, a atividade majoritária foi novamente em pH 5.0, sendo parcialmente inibida por Pepstatina A (inibidor de aspártico peptidases) é parcial em todos os valores de pH testados. Substratos sintéticos correspondentes às regiões N e C-terminal que flanqueiam o peptídeo inseticida na molécula de urease também foram testados. O primeiro não foi hidrolisado pelo extrato bruto, enquanto que o segundo apresentou um pico de atividade majoritário em pH 4.0-5.0, com inibição total por E-64. O extrato bruto foi submetido a um processo de purificação de duas etapas, uma troca iônica e uma cromatografia de gel filtração. A purificação foi monitorada utilizando-se um substrato específico para cisteíno peptidases, e a fração da gel filtração com maior atividade apresentou massa molecular de 22 kDa. A fração ativa foi submetida a um gel de poliacrilamida, a banda foi excisada e digerida com tripsina, e os peptídeos resultantes foram então analisados por espectrometria de massas. Uma catepsina L foi identificada, com massa molecular semelhante ao previsto pela gel filtração. Os resultados sugerem que a susceptibilidade de ninfas de O. fasciatus a JBU é, como em outros modelos de insetos, relacionada à proteólise limitada da proteína ingerida e posterior liberação de peptídeos inseticidas por enzimas do tipo catepsinas. Diferentes tipos de catepsinas podem estar liberando os peptídeos inseticidas a partir da urease, sendo que um cisteíno peptidase, tipo Catepsina L, pode ter um papel importante na ativação da proteína em O. fasciatus. Adicionalmente fizemos localização in situ de Jaburetox-2Ec após injeção na hemolinfa e observamos imunoreatividade no sistema nervoso central de ninfas de O. fasciatus, indicando que o peptídeo pode estar agindo neste local. Além dos efeitos tóxicos causados pelos peptídeos derivados da urease, já foram relatados em outros modelos, efeitos causados pela molécula intacta. Testamos, então, o efeito da JBU sobre contrações de intestinos ex vivo de O. fasciatus. Observamos que a urease tem a capacidade de inibir, em algumas concentrações, o efeito excitatório da serotonina sobre as contrações musculares, atividade que não é compartilhada com Jaburetox- 2Ec. Concluímos com os dados gerados nesse estudo, e em estudos prévios, que a toxicidade das ureases não só é devida à ativação proteolítica e liberação de peptídeos, mas também à proteína intacta, que parece estar causando distúrbios em processos de sinalização celular. / Jackbean (Canavalia ensiformis) is a legume highly resistant to insects. Contributing to this resistance, the plant contains urease isoforms that are entomotoxic upon the release of internal peptides by insect’s digestive cathepsin-like enzymes. A recombinant peptide, called Jaburetox-2Ec, was built based on urease’s sequence and this peptide is poisonous to all insects tested. The hemipteran bug Oncopeltus fasciatus is one of our models of study. In this work we aimed to identify the main digestive peptidases of O. fasciatus, helping to elucidate the insecticidal mechanism of action of these toxins, and to test the effects of urease and derived peptides upon isolated organs. When fed with different Jackbean major urease (JBU) concentrations, O. fasciatus nymphs showed a mortality rate higher than 80% after two weeks. When injected with Jaburetox-2Ec the mortality rate was 100% after 48 hours. Homogenates of midguts dissected from fourth instars were used to perform proteolytic activity assays. The homogenates hydrolyzed JBU in vitro, yielding a fragment similar in size to known entomotoxic peptides. The major proteolytic activity at pH 4.0 upon protein substrates was blocked by specific aspartic and cysteine peptidases inhibitors, but was not affected by a metalopeptidase inhibitor (EDTA). The optimal activity upon a fluorogenic substrate specific for cysteine peptidases was at pH 5.0, being completely inhibited by E-64 at all pH values tested. The optimal activity upon a fluorogenic substrate designed for aspartic peptidases was again at pH 5.0, being partially blocked by Pepstatin A in the pH range 2 to 10. Fluorogenic substrates corresponding to the Nand C-terminal regions flanking the entomotoxic peptide within urease sequence were also tested. While the N-terminal peptide was not hydrolyzed by the midguts homogenate, the C-terminal peptide was cleaved maximally at pH 4.0-5.0, with complete inhibition by E-64. The midguts homogenate was submitted to ion exchange chromatography followed by gel filtration yielding a 22 kDa protein peak. After SDSPAGE this band was excised from the gel, digested with trypsin and the peptides were analyzed by mass spectrometry. A Cathepsin L was identified. The results suggest that susceptibility of O. fasciatus nymphs to JBU is, like in other insect models, due to limited proteolysis of ingested protein and subsequent release of entomotoxic peptides by Cathepsin-like digestive enzymes. Moreover, we performed in situ localization of Jaburetox-2Ec after injection in the hemolymph, and we observed immunoreactive processes in O. fasciatus nymphs’ central nervous system, indicating that the peptide could be acting there. Besides the poisonous effects caused by urease derived peptides, effects caused by the intact molecule were already described. Hence we tested urease’s effect upon O. fasciatus isolated midguts contractions. We observed that urease is capable of inhibiting, at some concentrations, serotonin excitatory effect on muscular contractions, activity that was not shared with Jaburetox-2Ec. We concluded from the data of this study and previous studies, that urease’s toxicity is not only due to proteolytic activation and release of toxic peptides, but also to the intact molecule, which seems to be causing disturbances in cell signalling.
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Ação tóxica da urease de Canavalia ensiformis e do peptídeo recombinante Jaburetox-2Ec sobre Oncopeltus fasciatus (Hemiptera: Lygaidade) :

Defferrari, Marina Schumacher January 2010 (has links)
A Canavalia ensiformis é uma leguminosa altamente resistente ao ataque de insetos, e contribuindo para essa resistência, a planta possui isoformas de urease, que são proteínas que apresentam atividade entomotóxica. Essa toxicidade é dependente de uma ativação proteolítica da molécula por enzimas digestivas do inseto, do tipo catepsinas, e subseqüente liberação de peptídeos internos, os quais possuem a ação inseticida. A partir dessa informação foi construído um peptídeo recombinante com base na seqüência da urease, chamado Jaburetox-2Ec, o qual é tóxico para insetos resistentes e suscetíveis a urease intacta. O hemíptero Oncopeltus fasciatus é um dos nossos modelos de estudo. O objetivo deste trabalho foi identificar as principais peptidases digestivas de ninfas de O. fasciatus, auxiliando na elucidação do mecanismo de ação inseticida dessas toxinas, além de estudar os efeitos da urease intacta e do peptídeo derivado sobre órgãos isolados. Quando alimentadas com diferentes concentrações da urease majoritária de C. ensiformis (JBU), ninfas de O. fasciatus apresentam uma taxa de mortalidade superior a 80% após duas semanas, assim como quando injetadas com Jaburetox-2Ec apresentam uma taxa de mortalidade de 100% após 48 horas. Ninfas de quarto instar foram dissecadas para retirada dos intestinos e obtenção de um extrato protéico bruto, o qual foi utilizado para a realização dos ensaios enzimáticos. O extrato bruto foi capaz de hidrolisar in vitro a JBU e liberar peptídeos com massa semelhante a peptídeos entomotóxicos já conhecidos, reconhecíveis pelo anticorpo anti-Jaburetox-2Ec. A atividade proteolítica majoritária sobre substratos protéicos, em pH 4.0, foi bloqueada por inibidores específicos de aspártico e cisteíno peptidases, não sendo afetada EDTA, inibidor de metalopeptidases. Ao utilizar-se um substrato específico para cisteíno peptidases, o pico majoritário observado foi em pH 5.0, sendo a atividade completamente inibida por E-64 (inibidor de cisteíno peptidases) em todos os valores de pH testados. Ao utilizarse um substrato desenhado para aspártico peptidases, a atividade majoritária foi novamente em pH 5.0, sendo parcialmente inibida por Pepstatina A (inibidor de aspártico peptidases) é parcial em todos os valores de pH testados. Substratos sintéticos correspondentes às regiões N e C-terminal que flanqueiam o peptídeo inseticida na molécula de urease também foram testados. O primeiro não foi hidrolisado pelo extrato bruto, enquanto que o segundo apresentou um pico de atividade majoritário em pH 4.0-5.0, com inibição total por E-64. O extrato bruto foi submetido a um processo de purificação de duas etapas, uma troca iônica e uma cromatografia de gel filtração. A purificação foi monitorada utilizando-se um substrato específico para cisteíno peptidases, e a fração da gel filtração com maior atividade apresentou massa molecular de 22 kDa. A fração ativa foi submetida a um gel de poliacrilamida, a banda foi excisada e digerida com tripsina, e os peptídeos resultantes foram então analisados por espectrometria de massas. Uma catepsina L foi identificada, com massa molecular semelhante ao previsto pela gel filtração. Os resultados sugerem que a susceptibilidade de ninfas de O. fasciatus a JBU é, como em outros modelos de insetos, relacionada à proteólise limitada da proteína ingerida e posterior liberação de peptídeos inseticidas por enzimas do tipo catepsinas. Diferentes tipos de catepsinas podem estar liberando os peptídeos inseticidas a partir da urease, sendo que um cisteíno peptidase, tipo Catepsina L, pode ter um papel importante na ativação da proteína em O. fasciatus. Adicionalmente fizemos localização in situ de Jaburetox-2Ec após injeção na hemolinfa e observamos imunoreatividade no sistema nervoso central de ninfas de O. fasciatus, indicando que o peptídeo pode estar agindo neste local. Além dos efeitos tóxicos causados pelos peptídeos derivados da urease, já foram relatados em outros modelos, efeitos causados pela molécula intacta. Testamos, então, o efeito da JBU sobre contrações de intestinos ex vivo de O. fasciatus. Observamos que a urease tem a capacidade de inibir, em algumas concentrações, o efeito excitatório da serotonina sobre as contrações musculares, atividade que não é compartilhada com Jaburetox- 2Ec. Concluímos com os dados gerados nesse estudo, e em estudos prévios, que a toxicidade das ureases não só é devida à ativação proteolítica e liberação de peptídeos, mas também à proteína intacta, que parece estar causando distúrbios em processos de sinalização celular. / Jackbean (Canavalia ensiformis) is a legume highly resistant to insects. Contributing to this resistance, the plant contains urease isoforms that are entomotoxic upon the release of internal peptides by insect’s digestive cathepsin-like enzymes. A recombinant peptide, called Jaburetox-2Ec, was built based on urease’s sequence and this peptide is poisonous to all insects tested. The hemipteran bug Oncopeltus fasciatus is one of our models of study. In this work we aimed to identify the main digestive peptidases of O. fasciatus, helping to elucidate the insecticidal mechanism of action of these toxins, and to test the effects of urease and derived peptides upon isolated organs. When fed with different Jackbean major urease (JBU) concentrations, O. fasciatus nymphs showed a mortality rate higher than 80% after two weeks. When injected with Jaburetox-2Ec the mortality rate was 100% after 48 hours. Homogenates of midguts dissected from fourth instars were used to perform proteolytic activity assays. The homogenates hydrolyzed JBU in vitro, yielding a fragment similar in size to known entomotoxic peptides. The major proteolytic activity at pH 4.0 upon protein substrates was blocked by specific aspartic and cysteine peptidases inhibitors, but was not affected by a metalopeptidase inhibitor (EDTA). The optimal activity upon a fluorogenic substrate specific for cysteine peptidases was at pH 5.0, being completely inhibited by E-64 at all pH values tested. The optimal activity upon a fluorogenic substrate designed for aspartic peptidases was again at pH 5.0, being partially blocked by Pepstatin A in the pH range 2 to 10. Fluorogenic substrates corresponding to the Nand C-terminal regions flanking the entomotoxic peptide within urease sequence were also tested. While the N-terminal peptide was not hydrolyzed by the midguts homogenate, the C-terminal peptide was cleaved maximally at pH 4.0-5.0, with complete inhibition by E-64. The midguts homogenate was submitted to ion exchange chromatography followed by gel filtration yielding a 22 kDa protein peak. After SDSPAGE this band was excised from the gel, digested with trypsin and the peptides were analyzed by mass spectrometry. A Cathepsin L was identified. The results suggest that susceptibility of O. fasciatus nymphs to JBU is, like in other insect models, due to limited proteolysis of ingested protein and subsequent release of entomotoxic peptides by Cathepsin-like digestive enzymes. Moreover, we performed in situ localization of Jaburetox-2Ec after injection in the hemolymph, and we observed immunoreactive processes in O. fasciatus nymphs’ central nervous system, indicating that the peptide could be acting there. Besides the poisonous effects caused by urease derived peptides, effects caused by the intact molecule were already described. Hence we tested urease’s effect upon O. fasciatus isolated midguts contractions. We observed that urease is capable of inhibiting, at some concentrations, serotonin excitatory effect on muscular contractions, activity that was not shared with Jaburetox-2Ec. We concluded from the data of this study and previous studies, that urease’s toxicity is not only due to proteolytic activation and release of toxic peptides, but also to the intact molecule, which seems to be causing disturbances in cell signalling.
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Ação tóxica da urease de Canavalia ensiformis e do peptídeo recombinante Jaburetox-2Ec sobre Oncopeltus fasciatus (Hemiptera: Lygaidade) :

Defferrari, Marina Schumacher January 2010 (has links)
A Canavalia ensiformis é uma leguminosa altamente resistente ao ataque de insetos, e contribuindo para essa resistência, a planta possui isoformas de urease, que são proteínas que apresentam atividade entomotóxica. Essa toxicidade é dependente de uma ativação proteolítica da molécula por enzimas digestivas do inseto, do tipo catepsinas, e subseqüente liberação de peptídeos internos, os quais possuem a ação inseticida. A partir dessa informação foi construído um peptídeo recombinante com base na seqüência da urease, chamado Jaburetox-2Ec, o qual é tóxico para insetos resistentes e suscetíveis a urease intacta. O hemíptero Oncopeltus fasciatus é um dos nossos modelos de estudo. O objetivo deste trabalho foi identificar as principais peptidases digestivas de ninfas de O. fasciatus, auxiliando na elucidação do mecanismo de ação inseticida dessas toxinas, além de estudar os efeitos da urease intacta e do peptídeo derivado sobre órgãos isolados. Quando alimentadas com diferentes concentrações da urease majoritária de C. ensiformis (JBU), ninfas de O. fasciatus apresentam uma taxa de mortalidade superior a 80% após duas semanas, assim como quando injetadas com Jaburetox-2Ec apresentam uma taxa de mortalidade de 100% após 48 horas. Ninfas de quarto instar foram dissecadas para retirada dos intestinos e obtenção de um extrato protéico bruto, o qual foi utilizado para a realização dos ensaios enzimáticos. O extrato bruto foi capaz de hidrolisar in vitro a JBU e liberar peptídeos com massa semelhante a peptídeos entomotóxicos já conhecidos, reconhecíveis pelo anticorpo anti-Jaburetox-2Ec. A atividade proteolítica majoritária sobre substratos protéicos, em pH 4.0, foi bloqueada por inibidores específicos de aspártico e cisteíno peptidases, não sendo afetada EDTA, inibidor de metalopeptidases. Ao utilizar-se um substrato específico para cisteíno peptidases, o pico majoritário observado foi em pH 5.0, sendo a atividade completamente inibida por E-64 (inibidor de cisteíno peptidases) em todos os valores de pH testados. Ao utilizarse um substrato desenhado para aspártico peptidases, a atividade majoritária foi novamente em pH 5.0, sendo parcialmente inibida por Pepstatina A (inibidor de aspártico peptidases) é parcial em todos os valores de pH testados. Substratos sintéticos correspondentes às regiões N e C-terminal que flanqueiam o peptídeo inseticida na molécula de urease também foram testados. O primeiro não foi hidrolisado pelo extrato bruto, enquanto que o segundo apresentou um pico de atividade majoritário em pH 4.0-5.0, com inibição total por E-64. O extrato bruto foi submetido a um processo de purificação de duas etapas, uma troca iônica e uma cromatografia de gel filtração. A purificação foi monitorada utilizando-se um substrato específico para cisteíno peptidases, e a fração da gel filtração com maior atividade apresentou massa molecular de 22 kDa. A fração ativa foi submetida a um gel de poliacrilamida, a banda foi excisada e digerida com tripsina, e os peptídeos resultantes foram então analisados por espectrometria de massas. Uma catepsina L foi identificada, com massa molecular semelhante ao previsto pela gel filtração. Os resultados sugerem que a susceptibilidade de ninfas de O. fasciatus a JBU é, como em outros modelos de insetos, relacionada à proteólise limitada da proteína ingerida e posterior liberação de peptídeos inseticidas por enzimas do tipo catepsinas. Diferentes tipos de catepsinas podem estar liberando os peptídeos inseticidas a partir da urease, sendo que um cisteíno peptidase, tipo Catepsina L, pode ter um papel importante na ativação da proteína em O. fasciatus. Adicionalmente fizemos localização in situ de Jaburetox-2Ec após injeção na hemolinfa e observamos imunoreatividade no sistema nervoso central de ninfas de O. fasciatus, indicando que o peptídeo pode estar agindo neste local. Além dos efeitos tóxicos causados pelos peptídeos derivados da urease, já foram relatados em outros modelos, efeitos causados pela molécula intacta. Testamos, então, o efeito da JBU sobre contrações de intestinos ex vivo de O. fasciatus. Observamos que a urease tem a capacidade de inibir, em algumas concentrações, o efeito excitatório da serotonina sobre as contrações musculares, atividade que não é compartilhada com Jaburetox- 2Ec. Concluímos com os dados gerados nesse estudo, e em estudos prévios, que a toxicidade das ureases não só é devida à ativação proteolítica e liberação de peptídeos, mas também à proteína intacta, que parece estar causando distúrbios em processos de sinalização celular. / Jackbean (Canavalia ensiformis) is a legume highly resistant to insects. Contributing to this resistance, the plant contains urease isoforms that are entomotoxic upon the release of internal peptides by insect’s digestive cathepsin-like enzymes. A recombinant peptide, called Jaburetox-2Ec, was built based on urease’s sequence and this peptide is poisonous to all insects tested. The hemipteran bug Oncopeltus fasciatus is one of our models of study. In this work we aimed to identify the main digestive peptidases of O. fasciatus, helping to elucidate the insecticidal mechanism of action of these toxins, and to test the effects of urease and derived peptides upon isolated organs. When fed with different Jackbean major urease (JBU) concentrations, O. fasciatus nymphs showed a mortality rate higher than 80% after two weeks. When injected with Jaburetox-2Ec the mortality rate was 100% after 48 hours. Homogenates of midguts dissected from fourth instars were used to perform proteolytic activity assays. The homogenates hydrolyzed JBU in vitro, yielding a fragment similar in size to known entomotoxic peptides. The major proteolytic activity at pH 4.0 upon protein substrates was blocked by specific aspartic and cysteine peptidases inhibitors, but was not affected by a metalopeptidase inhibitor (EDTA). The optimal activity upon a fluorogenic substrate specific for cysteine peptidases was at pH 5.0, being completely inhibited by E-64 at all pH values tested. The optimal activity upon a fluorogenic substrate designed for aspartic peptidases was again at pH 5.0, being partially blocked by Pepstatin A in the pH range 2 to 10. Fluorogenic substrates corresponding to the Nand C-terminal regions flanking the entomotoxic peptide within urease sequence were also tested. While the N-terminal peptide was not hydrolyzed by the midguts homogenate, the C-terminal peptide was cleaved maximally at pH 4.0-5.0, with complete inhibition by E-64. The midguts homogenate was submitted to ion exchange chromatography followed by gel filtration yielding a 22 kDa protein peak. After SDSPAGE this band was excised from the gel, digested with trypsin and the peptides were analyzed by mass spectrometry. A Cathepsin L was identified. The results suggest that susceptibility of O. fasciatus nymphs to JBU is, like in other insect models, due to limited proteolysis of ingested protein and subsequent release of entomotoxic peptides by Cathepsin-like digestive enzymes. Moreover, we performed in situ localization of Jaburetox-2Ec after injection in the hemolymph, and we observed immunoreactive processes in O. fasciatus nymphs’ central nervous system, indicating that the peptide could be acting there. Besides the poisonous effects caused by urease derived peptides, effects caused by the intact molecule were already described. Hence we tested urease’s effect upon O. fasciatus isolated midguts contractions. We observed that urease is capable of inhibiting, at some concentrations, serotonin excitatory effect on muscular contractions, activity that was not shared with Jaburetox-2Ec. We concluded from the data of this study and previous studies, that urease’s toxicity is not only due to proteolytic activation and release of toxic peptides, but also to the intact molecule, which seems to be causing disturbances in cell signalling.
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The study of benthic community structure and protein expression pattern of four benthic species in effluent areas of sewage treatment plants (STP) in Kaohsiung, Taiwan

Candra, Dwi 06 September 2011 (has links)
The study of benthic community structure and protein expression pattern of four benthic species in effluent areas of sewage treatment plants in Kaohsiung, Taiwan Dwi Candra Pratiwi Advisor: Dr. Li-Lian Liu Institute of Marine Biology, National Sun Yat-sen University, Kaohsiung, Taiwan, R.O.C. Abstract In order to gain better understanding on the impacts of sewage treatment plant (STP) effluent on marine environment, the present study was undertaken to investigate the structure of benthic community and protein expression patterns of 4 benthic species in STP effluent areas in Kaohsiung, Taiwan. Six sites were selected, 3 near Jhong Jhou STP, 2 near NSYSU STP and one reference site. Samples were collected in December 2009 (winter) and July 2010 (summer) by bottom trawling. In winter, temperature was 26.8oC; salinity and pH were 32. 2‰ and 8.1. In summer, environmental data were 33.7oC, 31.5‰ and 8.0, respectively. In all, 5 phyla, 31 families and 48 different species were captured in two seasons. Proteomic approach by one-dimensional sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (1D SDS-PAGE) was conducted on 3 fishes, Leiognathus splendens, Apogon fasciatus, Engyprosopon multisquama, and one crab Portunus hastatoides. Environment characteristics and structure of benthic community had no significant difference among the 6 sampling sites. Protein expression patterns based on the four examined species also indicated no significant difference among sites. The complexity of pollutants in Kaohsiung Harbor is probably the main reason affecting all sampling sites. In other words, contaminated area in Kaohsiung Harbor may cover a wide range, at least III over the present sampling distance, i.e. 8km which causes no difference in community structure and protein expression pattern among control, Jhong Jhou STP and NSYSU STP sites. Key words: 1D SDS-PAGE, Leiognathus splendens, Apogon fasciatus, Engyprosopon multisquama, Portunus hastatoides
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Spatiotemporal distribution of apogonids and the biology of Apogon fasciatus in southwestern coastal waters off Taiwan

Wu, Hsin-ju 27 April 2009 (has links)
The species composition and recruitment of apogonids in the coastal waters off southwestern Taiwan were investigated, in order to understand their spatiotemporal variation and the biology of the dominant species, Apogon fasciatus. From June 2000 to August 2005, samples were collected by a beam trawl, operating at seven stations, including Jiading, Zouying, Jhongjhou, Linyuan, Dapeng, Linbian and Fangliao. In total, 33 cruises with 411 nets were included. A total of 4,540 specimens of Apogonidae were collected, belonging to 2 genus and 15 species. There were 6 species, including Apogon fraenatus, Apogon moluccensis, Apogon nigripinnis, Apogon nigrifasciatus, Apogon notatus and Apogon semilineatus, which were first recorded in the sandy or muddy habitats. The number of species was highest at Fangliao (11 species) and lowest at Dapeng and Jiading (5 spp.). Abundance and biomass were highest at Zouying (15.3 ind./net ) and Jhongjhou (60.0 g/net), respectively, whereas, the lowest abundance and biomass were both at Jiading (2.1 ind./net; 11.1 g/net). The most abundant species was Apogon fasciatus (86.6%), which also was the dominant species at each station, following by Apogon pleuron (4.5%), Apogon striatus (2.7%), Archamia bleekeri (2.7%) and Apogon niger (1.2%), comprising 97.7% of the apogonids. Although A. fasciatus and A. pleuron resemble similarly in shape and decorative pattern, the length-weight relationships are significantly different (ANOCA, p<0.001). The former is BW = 1.7 ¡Ñ (10^-6)(TL^3.488), the later is 3.4¡Ñ(10^-6)(TL^3.312) . The parameters, K, L¡Û, t0, of von Bertalanffy growth function of A. fasciatus were 1.88 yr^-1, 105.5 mm TL and -0.04. Showing that A. fasciatus growths much quicker before Age 1 than thereafter. The minimum size of mature female A. fasciatus was found 46.39 mm TL, and the size at maturity (L50) is estimated 75.39 mm TL, approximately 7 month-old. The frequency distribution of egg diameter indicated it is a multiple spawner. In May and October which were transit period between dry and rainy seasons, the abundance of A. fasciatus was normally higher than rest months reflecting the annual recruitment of this species. The GSI variation showed that the major breeding season was form on March to September. However, the small A. fasciatus (< 30 mm TL, about 1 month-old) were found throughout the year that implied A. fasciatus may reproduce annually. Moreover, coastal southward waters of Linyuan was the mainly habitat of A. fasciatus in southwestern coastal waters off Taiwan.
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Feeding habits of the yellowtail flounder and production of its invertebrate prey on Georges Bank /

Collie, Jeremy S. January 1900 (has links)
Thesis (Ph. D.)--Massachusetts Institute of Technology and Woods Hole Oceanographic Institution, 1985. / Vita. "October 1985." Includes bibliographical references (p. 135-142).
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Citotaxonomia de populações do gênero Astyanax (Characiformes, Characidae) da bacia do rio Doce / Cytotaxonomy of populations of genus Astyanax (Characiformes, Characidae) of the Doce Basin

Ramos, Fabrício Oliveira 17 June 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T11:03:57Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 703389 bytes, checksum: 1197f7672503105fdcb75cdd0aca1d60 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T11:03:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 703389 bytes, checksum: 1197f7672503105fdcb75cdd0aca1d60 (MD5) Previous issue date: 2004-06-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Foram realizados estudos citogenéticos em três espécies pertencentes à subfamília Tetragonopterinae, provenientes de seis localidades na bacia do rio Doce. Astyanax fasciatus apresentou 2n=50 (4m+14sm+34a) e um par de cromossomos com regiões organizadoras do nucléolo, sugerindo se tratar de uma nova espécie, por apresentar um cariótipo diferente aos indicados para a espécie até o momento. As populações de Astyanax scabripinnis apresentaram 2n=50 (4m+10sm+20st+16a) no rio Casca, 2n=50 (4m+12sm+18st+16a) no rio Das Pacas e 2n=48 (8m+20sm+14st+6a) no rio Turvo e respectivamente um, três e dois pares cromossômicos portadores de regiões organizadoras do nucléolo, confirmando a extensa variabilidade cariotípica existente nesse complexo de espécies na região neotropical. Os resultados de Astyanax bimaculatus confirmam a estabilidade cariotípica característica da espécie, apresentando 2n=50 (14m+22sm+6st+8a) no rio Turvo e rio Piranga e 2n=50 (14m+24sm+4st+8a) no rio Santo Antônio. Os resultados sugerem que a bacia do rio Doce tem sido um cenário de evolução cariotípica independente para as espécies do gênero Astyanax. / Three species of Tetragonopterinae from six locales in the rio Doce basin were subject to cytogenetic analyses. Astyanax fasciatus showed a diploid number of 2n=50 (4m+14sm+18st+14a) and one pair of NOR-bearing chromosomes, this unique karyotype suggests that this population represents a new species within the A. fasciatus species complex. Populations of Astyanax scabripinnis were 2n=50 (4m+10sm+20st+16a) in rio Casca, 2n=50 (4m+12sm+34a) in rio das Pacas, and 2n=48 (8m+20sm+14st+6a) in rio Turvo, while chromosome bearing pairs varied from one, three and two for each population, showing high levels of variation characteristic of this species complex elsewhere in the Neotropical region. Patterns of variation in Astyanax bimaculatus indicated stability of diploid number 2n=50 (14m+22sm+6st+8a) in the Turvo and Piranga rivers, and 2n=50 (14m+24sm+4st+8a) in rio Santo Antônio. The results suggest that the rio Doce basin has been a scenario of independent karyotypic evolution for fish populations of the genus Astyanax.
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The energetic consequences of tail loss to juvenile lizards

Fredericksen, Nell Jefferson 08 September 2012 (has links)
l evaluated the hypothesis that juveniles of species whose tail is important for predator deflection should allocate energy preferentially to tail growth at the expense of body growth. Relative linear tail growth (linear tail growth/linear body growth) and relative mass tail growth (tail mass growth/body mass growth) were measured for juveniles of two species of skinks: <u>Eumeces Fasciatus</u> that use the tail for predator deflection, and <u>Chalcides ocellatus</u> that does not use the tail for predator deflection. Experimental conditions produced an energy limiting situation under which the priority of energy allocation to tail regeneration should be exhibited. For <u>E. fasciatus</u>, relative linear tail growth was higher for the energy limited than control group and for the tail-removal than the tailed lizards. For <u>C. ocellatus</u>, relative linear tail growth was not affected by energy level but was lower for tail-removal than tailed lizards. For both species, relative tail mass growth was lower for the tail-removal than tailed lizards. The greater relative linear tail growth of regenerating than normal tails of <u>E. fasciatus</u> supports the hypothesis that rapid tail regeneration is important for a species whose tail is used for predator deflection. However, the low rate of tail regenerartion in mass suggests that mass gains in the regeneration process. In contrast, lower relative linear and mass tail growth of <u>C. ocellatus</u> that were regenerating tails suggests that tail regeneration has a low priority for this species. / Master of Science
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Dispersión natal y estructura de la población de águila-azor perdicera Hieraaetus fasciatus en la Península Ibérica / Natal dispersal and population structure of Bonelli's eagle Hieraaetus fasciatus in the Iberian Peninsula

Cadahía Lorenzo, Luis 06 July 2007 (has links)
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