La protéine Nef des virus de l’immunodéficience humaine (VIH-1 et VIH-2) joue un rôle essentiel dans la physiopathologie de l’infection et induction du SIDA. La capacité de Nef à perturber le trafic intracellulaire de protéines membranaires, et notamment du récepteur CD4, circulant entre les compartiments de la voie d’endocytose pourrait rendre compte de son importance comme facteur de virulence au cours de l’infection naturelle. Les mécanismes responsables des perturbations de la voie d’endocytose induites par Nef au cours de l’infection ne sont pas totalement élucidés, mais il est admis qu’elles résultent d’interactions avec les complexes adaptateurs (AP) associés à la clathrine et participant au transport vésiculaire entre les différents compartiments de la voie d’endocytose. Notre objectif était de déterminer les mécanismes par lesquels Nef influe positivement sur le pouvoir infectieux du VIH-1 en interagissant avec la machinerie cellulaire de la voie d’endocytose. Notre programme s’est organisé autour de deux axes principaux: le premier a consisté à étudier l’implication respective des différents types de complexes AP (AP-1, -2 et -3) sur les perturbations du fonctionnement de la voie d’endocytose induites par Nef en analysant son impact sur le niveau d’expression de surface de CD4; le deuxième axe a consisté à évaluer l’impact de l’interaction de Nef avec les complexes AP sur les capacités infectieuses des particules virales. Le rôle respectif des différents complexes AP dans ces fonctions de Nef a donc été étudié après déplétion de l’expression des complexes AP-1, AP-2 et AP-3 par une approche d’ARN interférence. Les résultats obtenus montrent que contrairement à certaines données de la littérature, la déplétion des complexes AP de la voie d’endocytose ne semble pas avoir un impact majeur sur la capacité de Nef à moduler l’expression de surface de CD4, même si une légère diminution de l’activité de Nef a pu être révélée dans notre étude réalisée sur des cellules HeLa-CD4 transduites par les shRNA ciblant les complexes AP-2. Inversement, nos résultats confirment que la déplétion des complexes AP-1, AP-2 et AP-3 dans les cellules productrices des particules virales se traduit par une diminution importante des propriétés infectieuses de ces particules sur lesquelles l’impact positif de Nef n’est plus alors capable de se manifester. En conclusion, ce travail a donc permis de montrer que les complexes AP de la voie d’endocytose sont indispensables pour que Nef puisse exercer son rôle positif sur le pouvoir infectieux du VIH-1. Il est maintenant important de confirmer ces résultats en analysant le rôle fonctionnel des complexes AP sur les activités de Nef dans les cibles cellulaires naturelles du VIH-1, lymphocytes et macrophages. / Nef protein of human immunodeficiency virus (HIV-1 and HIV-2) plays an essential role in the pathophysiology of infection and induction of AIDS. The ability of Nef to disrupt intracellular trafficking of membrane proteins, including the CD4 receptor, moving between the compartments of the endocytic pathway could account for its importance as a virulence factor during natural infection. The mechanisms responsible for disruption of the endocytic pathway induced by Nef during infection are not fully understood, but it is accepted that they arise from interactions with adaptor complexes (AP) associated with clathrin and participant in vesicular transport between the different compartments of the endocytic pathway. Our objective was to determine the mechanisms by which Nef positively affects the infectivity of HIV-1 by interacting with the cellular machinery of the endocytic pathway. Our program has been organized around two main axes: the first was to investigate the respective involvement of different types of complexes (AP-1, -2 and -3) on the Nef induced disruption of the endocytic pathway by analyzing its impact on the level of surface expression of CD4; the second axis was to evaluate the impact of the interaction of Nef with AP complexes on the infectious capacity of the viral particles. The respective roles of the different AP complexes in these functions of Nef has been studied after depletion of the expression of complex AP-1, AP-2 and AP-3 by RNA interference approach. The results show that, contrary to some literature data, depletion of AP complex endocytic pathway does not appear to have a major impact on the ability of Nef to modulate the surface expression of CD4, although a slight decreased activity of Nef could be revealed in our study on HeLa-CD4 cells transduced with the shRNA targeting complex AP-2. Conversely, our results confirm that the depletion of complex AP-1, AP-2 and AP-3 in the cells producing viral particles resulted in a significant decrease in infectious properties of these particles on which the positive impact of Nef is no longer able to manifest. In conclusion, this work has shown that complex AP of endocytic pathway are essential for Nef to exercise its positive role in the infectivity of HIV-1. It is now important to confirm these findings by analyzing the functional role of AP complexes on the activities of Nef in the natural cellular targets of HIV-1, lymphocytes and macrophages.

Les services Web ont émergé comme un support de développement et d'intégration d'applications ou de systèmes d'information. Dans ce cadre, les interactions entre deux applications consommateur et fournisseur, encapsulées par des services Web se font par échanges de messages. Ces échanges s'appuient sur la notion d'interfaces, qui décrivent les interactions dans lesquelles un service peut s'engager et les dépendances entre ces interactions. Dans le Web actuel, il arrive très fréquemment que de nombreux services répondent à un même ensemble de besoins fonctionnels. Ces services sont souvent offerts par le biais d'interfaces différentes. Des nombreuses raisons, telles que la panne du service fournisseur, peuvent amener un consommateur à substituer son fournisseur habituel par un autre fournisseur qui offre la même fonctionnalité. Cette substitution provoque des incompatibilités entre l' interface du service consommateur et celle du service fournisseur substitut. Cela est dû au fait que le service consommateur n'a pas été fait en fonction de ce nouveau service fournisseur. Les recherches que nous menons dans cette thèse visent à résoudre le problème des incompatibilités dans des interactions entre deux services consommateur et fournisseur substitut. En particulier, notre contribution s'étend, tant sur le plan théorique que sur le plan pratique. Il s'agit d'une part d'un canevas pour la génération automatique des adaptateurs des interactions entre deux services. D'autre part, nous proposons une architecture logicielle multicouche fournissant un cadre permettant une substitution transparente et flexible d'un service fournisseur par un autre service vis-à-vis du consommateur du premier. Dans notre canevas pour la génération automatique des adaptateurs, une modélisation des interfaces de services en des automates a été adoptée. Puis, une étape de détection des incompatibilités entre ceux-ci est réalisée. Ensuite, un adaptateur des interactions entre les deux services est généré automatiquement sur la base d'incompatibilités détectées. La génération de l'adaptateur est guidée par le modèle d' automates. Cela permet de modéliser l' adaptateur indépendamment de son implémentation cible, permettant ainsi une bonne réutilisation des modèles. Une fois généré, l'automate de l'adaptateur suffisamment détaillé est projeté sur la technologie CEP (Complexe Event Processing). Cette projection est réalisée à l'aide des composants cartouches (en anglais : Templates) que nous avons mis en œuvre. Chaque cartouche étant conçue pour générer du code exécutable (en termes de requêtes continues) pour la technologie CEP. Notre architecture proposée pour la substitution de services Web s'intègre d'une part la notion de communauté de services, et d'autre part un progiciel nommé OSC (Open Service Connectivity). Une communauté de service est perçue comme un moyen d'exposer des descriptions communes d'un caractère fonctionnel désiré sans explicitement se référer à un service spécifique. L'OSC est un composant logiciel dont l'objectif est d'appliquer le principe de pilotes ODBC et JDBC dans un environnement à base de services Web. Plus précisément, il est responsable de gérer les interactions entre les consommateurs des communautés d'une part et les communautés d'autre part, en fournissant des fonctions permettant la sélection et la substitution de services.

Les services Web ont émergé comme un support de développement et d’intégration d’applications ou de systèmes d’information. Dans ce cadre, les interactions entre deux applications consommateur et fournisseur, encapsulées par des services Web se font par échanges de messages. Ces échanges s’appuient sur la notion d’interfaces, qui décrivent les interactions dans lesquelles un service peut s’engager et les dépendances entre ces interactions. Dans le Web actuel, il arrive très fréquemment que de nombreux services répondent à un même ensemble de besoins fonctionnels. Ces services sont souvent offerts par le biais d’interfaces différentes. Des nombreuses raisons, telles que la panne du service fournisseur, peuvent amener un consommateur à substituer son fournisseur habituel par un autre fournisseur qui offre la même fonctionnalité. Cette substitution provoque des incompatibilités entre l’interface du service consommateur et celle du service fournisseur substitut. Cela est dû au fait que le service consommateur n’a pas été fait en fonction de ce nouveau service fournisseur. Les recherches que nous menons dans cette thèse visent à résoudre le problème des incompatibilités dans des interactions entre deux services consommateur et fournisseur substitut. En particulier, notre contribution s’étend, tant sur le plan théorique que sur le plan pratique. Il s’agit d’une part d’un canevas pour la génération automatique des adaptateurs des interactions entre deux services. D’autre part, nous proposons une architecture logicielle multicouche fournissant un cadre permettant une substitution transparente et flexible d’un service fournisseur par un autre service vis-à-vis du consommateur du premier. Dans notre canevas pour la génération automatique des adaptateurs, une modélisation des interfaces de services en des automates a été adoptée. Puis, une étape de détection des incompatibilités entre ceux-ci est réalisée. Ensuite, un adaptateur des interactions entre les deux services est généré automatiquement sur la base d’incompatibilités détectées. La génération de l’adaptateur est guidée par le modèle d’automates. Cela permet de modéliser l’adaptateur indépendamment de son implémentation cible, permettant ainsi une bonne réutilisation des modèles. Une fois généré, l’automate de l’adaptateur suffisamment détaillé est projeté sur la technologie CEP (Complexe Event Processing). Cette projection est réalisée à l’aide des composants cartouches (en anglais : Templates) que nous avons mis en oeuvre. Chaque cartouche étant conçue pour générer du code exécutable (en termes de requêtes continues) pour la technologie CEP / Web services have emerged as a support for development and integration of applications and information systems. In this context, the interactions between two consumer and supplier applications, encapsulated by Web services are done by exchanging messages. These exchanges are based on the concept of interfaces, which describe the interactions in which a service can handle and dependencies between these interactions. In the current Web, it is very often that many services meet the same set of functional requirements. These services are often delivered through different interfaces. For many reasons, such as failure of the service provider, the consumer has to replace his usual supplier with another supplier that offers the same functionality. This substitution leads to incompatibilities between the interfaces of the service consumer and new service provider. This is because the customer service was not been developed according to the new service provider. The research we conduct in this thesis aims to solve the problem of incompatibility in the interaction between two services; consumer and new provider. In particular, our contribution extends both in theory and in practice. It is a part of a framework for the automatic generation of adapters for interactions between two services. On the other hand, we propose a multi-layer software architecture providing a framework for transparent and flexible substitution of a service provider by another with respect to an existed consumer. In our framework for automatic generation of adapters, services interfaces modeling using automata has been adopted. Then, a step of detecting incompatibilities between them is achieved. After that, an adapter of the interactions between the two services is generated automatically based on the detected incompatibilities. The generation of the adapter is based on the automata model. The generated adapter automaton contains a sufficient detail for the projected technology CEP (Complex Event Processing). This projection is performed using components templates that are implemented by us. Each template is designed to generate executable code (in terms of continuous requests) for the CEP technology