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Caracterização funcional de microRNAs em carcinoma pancreático

Felix, Tainara Francini January 2019 (has links)
Orientador: Patricia Pintor dos Reis / Resumo: Introdução: O carcinoma de pâncreas apresenta altas taxas de mortalidade, geralmente associadas ao diagnóstico tardio da doença. MicroRNAs (miRNAs) são importantes reguladores da expressão gênica e têm sido apontados como biomarcadores com valor diagnóstico, prognóstico no câncer. Objetivos: (1) identificar níveis de expressão de miRNAs em tumores de pacientes com câncer de pâncreas; (2) identificar, “in silico”, genes-alvo dos miRNAs e vias moleculares envolvendo miRNAs e genes-alvo correspondentes; (3) realizar estudos funcionais “in vitro” para demonstrar experimentalmente os efeitos da desregulação de miRNAs nos potenciais de migração e invasão celulares. Materiais e Métodos: Foram incluídas 19 amostras de adenocarcinoma ductal pancreático (PDAC) e 6 de adenocarcinoma de ampola de Vater (AMP), pareadas com tecido histologicamente normal. Além disso, 3 linhagens celulares de carcinoma pancreático (BxPC-3, Capan-2 e Panc-1) foram analisadas quanto ao seu perfil global de expressão de miRNAs. Em todas as amostras, o perfil de expressão de miRNAs foi determinado utilizando a plataforma GeneChip® 4.0 miRNAarrays. A validação “in silico” utilizou dados de transcriptoma do The CancerGenome Atlas (TCGA) (N=178 carcinomas pancreáticos e 4 tecidos histologicamente normais dos mesmos pacientes). A linhagem Panc-1 foi testada em ensaios de migração e invasão antes e depois da expressão dos miRNAs miR-148a-3p e miR-216b-5p por meio de moléculas miméticas. Análises computacionais utili... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Introduction: Pancreatic carcinoma is associated with high mortality rates, usually due to late disease diagnosis. MicroRNAs (miRNAs) are important gene expression regulators and have been identified as biomarkers with diagnostic, prognostic and therapeutic value in cancer. Objectives: (1) to identify miRNA expression levels in tumors of patients with pancreatic cancer; (2) to identify, in silico, miRNA target genes and molecular pathways involving miRNAs and corresponding target genes; (3) to perform in vitro functional studies to experimentally demonstrate the effects of miRNAdysregulation on cell migration and invasion. Materials and Methods: We included 19 pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) and 6 adenocarcinoma of Vater ampulla (AMP) samples, paired with histologically normal tissues. In addition, 3 pancreatic carcinoma cell lines (BxPC-3, Capan-2 and Panc-1) were analyzed for their global miRNA expression profile. miRNA expression profiles were determined using the GeneChip® 4.0 miRNA arrays platform. In silico validation used transcriptome data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) (N = 178 pancreatic carcinomas and 4 histologically normal tissues from the same patients). The Panc-1 cell line was used for migration and invasion assays before and after miR-148a-3p and miR-216b-5p expression by mimetic molecules. Computational analyzes used bioinformatics algorithms to identify target genes regulated by miRNAs (miRNA Data Integration Portal, mirDIP) and molecular pathw... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

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