O jacaré-de-papo-amarelo (Caiman latirostris) é um crocodiliano de médio porte que apresenta ampla distribuição na América do Sul. O avanço das atividades antrópicas pode afetar negativamente suas populações. No entanto, a espécie aparentemente apresenta capacidade de colonizar habitats alterados em resposta à destruição dos seus habitats naturais, por isso, estudos nestes ambientes são importantes a fim de orientar futuros programas de conservação da espécie. Este estudo apresentou como objetivos verificar a estrutura populacional, uso do espaço e variação de nicho no jacaré-de-papo-amarelo em paisagem silvicultural, além de determinar fatores de discriminação isotópicos. O presente estudo foi realizado em duas fazendas de silvicultura na bacia hidrográfica do Alto Paranapanema, estado de São Paulo. Os jacarés foram capturados por meio de armadilhas e com auxílio de laço de cabo de aço. No primeiro capítulo desta tese foram investigados aspectos da estrutura populacional da espécie. No total foram capturados 16 filhotes, 28 juvenis (?: 7; ?: 21) e 8 adultos (?: 4; ?: 4). A estimativa da abundância populacional foi de 51 indivíduos (I.C. 95%: 36 - 70 indivíduos), desconsiderando os filhotes nas análises. A densidade estimada foi 2,6 indivíduos/ha (I.C. 95%: 1,8 - 3,5 indivíduos/ha) e a biomassa estimada foi de 13,3 kg/ha (I.C. 95%: 9,2 - 17,9 kg/ha). A densidade linear 11,3 indivíduos/km (I.C. 95%: 7,9 - 15,5 indivíduos/km). No segundo capítulo foram abordados aspectos ligados à área de vida e movimentação da espécie. Oito animais adultos (4 ? e 4 ?) foram monitorados por meio de radiotelemetria. A média da área de vida da espécie foi estimada segundo o mínimo polígono convexo e kernel 95% em 96,6 ± 183,9 ha e 43,2 ± 78,6 ha, respectivamente. Não houve diferença entre os sexos. O deslocamento diário médio foi 37,6 ± 18,6 m/dia. Os animais apresentaram deslocamento diário marginalmente maior durante o período reprodutivo. A matriz da paisagem mostrou permeabilidade ao deslocamento dos animais. No terceiro capítulo foram descritos os fatores de discriminação entre a dieta e tecidos do jacaré-de-papo-amarelo e possíveis diferenças entre classes etárias. As razões isotópicas de carbono e nitrogênio foram determinadas em amostras de unha e pele coletadas de 18 animais de cativeiro e em 15 amostras de sua dieta. O ?13C foi 1,2 ± 0,1? para a unha e 0,9 ± 0,2? para a pele; o ?15N foi 1,1 ± 0,1? para a unha e 0,8 ± 0,2? para a pele. Estes valores são menores que os comumente assumidos em estudos ecológicos (3-5 ?). Os resultados deste estudo enfatizam a necessidade da determinação de fatores de discriminação específicos para cada táxon, ao contrário de assumir valores médios a partir da literatura. No quarto capítulo foram abordadas possíveis variações ontogenéticas e sexuais de nicho na espécie utilizando análises isotópicas das unhas dos animais capturados. Foi identificada variação ontogenética discreta de nicho isotópico e diferença sexual somente para os juvenis. Estes resultados podem indicar uma possível exploração distinta dos recursos, com consequente redução na competição intraespecífica. / The Broad-snouted caiman (Caiman latirostris) is a medium size crocodilian widely distributed in South America. The advancement of human activities can negatively affect their populations. However, the species apparently has ability to colonize anthropic environments in response to the destruction of their natural habitat, so study these environments are important in order to guide future conservation programs for specie. This study presented as objectives verify the population structure, space use and niche variation in Broad-snouted caiman in landscape silvicultural, besides determining discrimination isotopic factors. This study was conducted in two silvicultural farms in the Alto Paranapanema watershed, São Paulo state. The caimans were captured at night with baited traps and with the aid of steel cable. In the first chapter of this thesis we investigated aspects of the population structure. In total, were captured 16 hatchlings, 28 juveniles (?: 7; ?: 21) and 8 adults (?: 4; ?: 4). The estimation of population abundance for the study area was 51 individuals (C.I. 95%: 36 - 70 individuals), excluding the hatchlings in the analyzes. The estimated density was 2.6 individuals/ha (C.I. 95%: 1.8 - 3.5 individuals/ha) and biomass was 13.3 kg/ha (C.I. 95%: 9.2 - 17.9 kg/ha). The linear density was 11.3 individuals/km (C.I. 95%: 7.9 - 15.5 individuals/km). In the second chapter, we have discussed aspects related to the home range and movement. Eight adults animals (4 ?: 4 ?) were monitored by radio telemetry. The average home range was estimated according to the minimum convex polygon and kernel 95% in 96.6 ± 183.9 ha and 43.2 ± 78.6 ha, respectively. There was no difference between the sexes. The average daily movement was 37.6 ± 18.6 m/day. The animals daily movement marginally higher during the reproductive period. The matrix showed some landscape permeability displacement of animals. In the third chapter we have described the discrimination factors between diet and tissues of Broad-snouted caiman and possible differences between age groups. The isotopic ratios of carbon and nitrogen were determined in claw and scute samples collected from 18 captive animals and in 15 samples of their diet. The ?13C was 1.2 ± 0.1 ? for claw and 0.9 ± 0.2 ? for scutes; the ?15N was 1.1 ± 0.1 ? for claw and 0.8 ± 0.2 ? for scutes. These values were much lower than the values commonly assumed in ecological studies (3-5 ?) and similar to a previous study with crocodilians. The results of this study emphasize the need to determine discrimination factors specific to taxa instead of assuming average values derived from the literature. In the fourth chapter, were addressed possible ontogenetic and sexual niche differences in species using isotope analysis of animals claws. We identified a discrete ontogenetic variation in the isotopic niche and sexual difference only for juveniles. These results may indicate differences in the exploitation of food resources and a consequent reduction in intraspecific competition.

Submitted by Kamila Costa (kamilavasconceloscosta@gmail.com) on 2015-06-15T18:03:22Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Francijara A da Silva.pdf: 1901335 bytes, checksum: 63a828902b8662bb981d3bdba355356d (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-06-15T18:43:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Francijara A da Silva.pdf: 1901335 bytes, checksum: 63a828902b8662bb981d3bdba355356d (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-06-15T18:45:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Francijara A da Silva.pdf: 1901335 bytes, checksum: 63a828902b8662bb981d3bdba355356d (MD5) / Made available in DSpace on 2015-06-15T18:45:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Francijara A da Silva.pdf: 1901335 bytes, checksum: 63a828902b8662bb981d3bdba355356d (MD5) Previous issue date: 2015-04-17 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Several studies have shown that adaptive processes are associated with genetic variability found in regions of repetitive DNAs, and this genomic portion may be largely responsible for the adaptability of amazonian fishes in several natural and anthropogenic aquatic environments. Hoplosternum littorale, known as tamoatá fish, is found in polluted and unpolluted environments as in rivers, streams and floodplains, which is showing its great adaptability. Thus, the main goal of this work has been mapped DNAs repetitive sequences in mitotic chromosomes and micronuclei as like as differential banding and to measure the possibility of genotoxic actions of these environments. Seventy-two individuals were collected for micronuclei analysis which were 16 from Catalão lake and 16 from Marchantaria lake; these environments were chosen because they presented a large parcel of water which contribute to not display detectable chemical pollutants. Still, 25 from Mindu stream and 15 from Quarenta stream were identified as most critical points of environmental pollution in Manaus, Amazonas. Were cytogenetically analyzed 40 individuals to the total, which five males and five females from each locality. Mitotic chromosomes were obtained from kidney cells, detection of heterochromatin by action of barium hydroxide and nucleolus organizer regions (NORs) by silver nitrate stain. Fluorescent in situ hybridization (FISH) was performed with 18S rDNA probes, 5S rDNA Rex 3 and telomeric sequences. Both individuals of polluted and unpolluted environments had diploid number as 2n= 60 chromosomes (4m + 4sm + 52a). Simple NORs were localized in the short arms of pair 5 which is in the same localization of 18 rDNA sites. However, 5S rDNA sites were localized in pericentromeric regions of the pairs 23 and 27 with a fifth additional mark in interstitial region of one of homologue pair 8 for individuals from unpolluted environments. Interstitial telomeric sites were not showed. As to as heterochromatin markings were found in the centromeric region, and pericentromeric terminal of the chromosomes with more conspicuous blocks in individuals from polluted environment. As for heterochromatin, markings were found in the centromeric region, and pericentromeric terminal of the chromosomes, with more conspicuous blocks in individuals of polluted environment. The retroelement Rex 3 showed dispersed up in the chromosomes of individuals from unpolluted environment and compartmentalized in individuals from polluted environment. The micronucleus test revealed no significant differences in comparisons pair-to-pair between environments and sampling locations. The mapping of repetitive DNA sequences revealed that the micronuclei have differential composition, intra and inter individuals. These data indicate that the environment is promoting a differential genome organization, where different portions are lost in micronucleus formation and there is no single fragile region suffering breaks, although involving of repetitive DNA elements in this process. / Diversos estudos demonstram que processos adaptativos estão relacionados com a variabilidade genética encontrada em regiões de DNAs repetitivos, e que esta porção genômica seja a grande responsável pela adaptabilidade de peixes amazônicos nos diversos ambientes aquáticos, tanto naturais quanto antropizados. Hoplosternum littorale, conhecido como tamoatá é encontrado em rios, igarapés e áreas de inundação, tanto em ambiente poluído quanto não poluído, mostrando grande capacidade de adaptação. Assim, o objetivo do trabalho foi mapear sequências repetitivas de DNA em cromossomos mitóticos e em micronúcleos, bem como os bandeamentos diferenciais e a avaliar a possível ação genotóxica destes ambientes. Setenta e dois indivíduos foram coletados para análise de micronúcleos, sendo 16 do lago Catalão e 16 do lago da Marchantaria, sendo estes ambientes escolhidos por apresentar um grande volume de água, o que contribui para não apresentar poluentes químicos detectáveis. Ainda, 25 no igarapé do Mindu e 15 no igarapé do Quarenta apontados como pontos mais críticos de poluição ambiental em Manaus, AM. Foram analisados citogeneticamente 40 exemplares ao total, sendo amostrados cinco machos e cinco fêmeas de cada localidade. Os cromossomos mitóticos foram obtidos a partir de células renais, a detecção de heterocromatina pela ação do hidróxido de bário e as regiões organizadoras de nucléolo (RONs) por meio da impregnação com nitrato de prata. A técnica de hibridização in situ por fluorescência (FISH) foi efetuada utilizando sondas de DNAr 18S, DNAr 5S, Rex 3 e sequências teloméricas. Tanto para os exemplares de ambiente poluído quanto não poluído o número diploide foi de 2n = 60 cromossomos (4m + 4sm + 52a). RON simples foram localizadas nos braços curtos do par 5, coincidentes com sítios de DNAr 18S. Já os sítios de DNAr 5S foram localizados na região pericentromérica dos pares 23 e 27, com uma quinta marcação adicional evidenciada na região intersticial de um dos homólogos do par 8 para indivíduos de ambiente não poluído. Sítios teloméricos intersticiais não foram evidenciados. Quanto à heterocromatina, foram encontradas marcações na região centromérica, pericentromérica e terminal dos cromossomos, com blocos mais conspícuos em indivíduos do ambiente poluído. O retroelemento Rex 3 apresentou-se disperso nos cromossomos dos indivíduos de ambiente não poluído e compartimentalizado nos indivíduos de ambiente poluído. O teste do micronúcleo não revelou diferenças significativas nas comparações par a par entre os ambientes e entre os locais de coleta. O mapeamento de sequências repetitivas de DNA revelou que os micronúcleos possuem composição diferencial, intra e interindividualmente. Estes dados indicam que o ambiente está promovendo uma organização diferencial do genoma, onde diferentes porções são perdidas na formação de micronúcleos e não há uma única região frágil que sofre quebras, apesar de elementos repetitivos de DNA estarem envolvidos neste processo.

O jacaré-de-papo-amarelo (Caiman latirostris) é um crocodiliano de médio porte que apresenta ampla distribuição na América do Sul. O avanço das atividades antrópicas pode afetar negativamente suas populações. No entanto, a espécie aparentemente apresenta capacidade de colonizar habitats alterados em resposta à destruição dos seus habitats naturais, por isso, estudos nestes ambientes são importantes a fim de orientar futuros programas de conservação da espécie. Este estudo apresentou como objetivos verificar a estrutura populacional, uso do espaço e variação de nicho no jacaré-de-papo-amarelo em paisagem silvicultural, além de determinar fatores de discriminação isotópicos. O presente estudo foi realizado em duas fazendas de silvicultura na bacia hidrográfica do Alto Paranapanema, estado de São Paulo. Os jacarés foram capturados por meio de armadilhas e com auxílio de laço de cabo de aço. No primeiro capítulo desta tese foram investigados aspectos da estrutura populacional da espécie. No total foram capturados 16 filhotes, 28 juvenis (?: 7; ?: 21) e 8 adultos (?: 4; ?: 4). A estimativa da abundância populacional foi de 51 indivíduos (I.C. 95%: 36 - 70 indivíduos), desconsiderando os filhotes nas análises. A densidade estimada foi 2,6 indivíduos/ha (I.C. 95%: 1,8 - 3,5 indivíduos/ha) e a biomassa estimada foi de 13,3 kg/ha (I.C. 95%: 9,2 - 17,9 kg/ha). A densidade linear 11,3 indivíduos/km (I.C. 95%: 7,9 - 15,5 indivíduos/km). No segundo capítulo foram abordados aspectos ligados à área de vida e movimentação da espécie. Oito animais adultos (4 ? e 4 ?) foram monitorados por meio de radiotelemetria. A média da área de vida da espécie foi estimada segundo o mínimo polígono convexo e kernel 95% em 96,6 ± 183,9 ha e 43,2 ± 78,6 ha, respectivamente. Não houve diferença entre os sexos. O deslocamento diário médio foi 37,6 ± 18,6 m/dia. Os animais apresentaram deslocamento diário marginalmente maior durante o período reprodutivo. A matriz da paisagem mostrou permeabilidade ao deslocamento dos animais. No terceiro capítulo foram descritos os fatores de discriminação entre a dieta e tecidos do jacaré-de-papo-amarelo e possíveis diferenças entre classes etárias. As razões isotópicas de carbono e nitrogênio foram determinadas em amostras de unha e pele coletadas de 18 animais de cativeiro e em 15 amostras de sua dieta. O ?13C foi 1,2 ± 0,1? para a unha e 0,9 ± 0,2? para a pele; o ?15N foi 1,1 ± 0,1? para a unha e 0,8 ± 0,2? para a pele. Estes valores são menores que os comumente assumidos em estudos ecológicos (3-5 ?). Os resultados deste estudo enfatizam a necessidade da determinação de fatores de discriminação específicos para cada táxon, ao contrário de assumir valores médios a partir da literatura. No quarto capítulo foram abordadas possíveis variações ontogenéticas e sexuais de nicho na espécie utilizando análises isotópicas das unhas dos animais capturados. Foi identificada variação ontogenética discreta de nicho isotópico e diferença sexual somente para os juvenis. Estes resultados podem indicar uma possível exploração distinta dos recursos, com consequente redução na competição intraespecífica. / The Broad-snouted caiman (Caiman latirostris) is a medium size crocodilian widely distributed in South America. The advancement of human activities can negatively affect their populations. However, the species apparently has ability to colonize anthropic environments in response to the destruction of their natural habitat, so study these environments are important in order to guide future conservation programs for specie. This study presented as objectives verify the population structure, space use and niche variation in Broad-snouted caiman in landscape silvicultural, besides determining discrimination isotopic factors. This study was conducted in two silvicultural farms in the Alto Paranapanema watershed, São Paulo state. The caimans were captured at night with baited traps and with the aid of steel cable. In the first chapter of this thesis we investigated aspects of the population structure. In total, were captured 16 hatchlings, 28 juveniles (?: 7; ?: 21) and 8 adults (?: 4; ?: 4). The estimation of population abundance for the study area was 51 individuals (C.I. 95%: 36 - 70 individuals), excluding the hatchlings in the analyzes. The estimated density was 2.6 individuals/ha (C.I. 95%: 1.8 - 3.5 individuals/ha) and biomass was 13.3 kg/ha (C.I. 95%: 9.2 - 17.9 kg/ha). The linear density was 11.3 individuals/km (C.I. 95%: 7.9 - 15.5 individuals/km). In the second chapter, we have discussed aspects related to the home range and movement. Eight adults animals (4 ?: 4 ?) were monitored by radio telemetry. The average home range was estimated according to the minimum convex polygon and kernel 95% in 96.6 ± 183.9 ha and 43.2 ± 78.6 ha, respectively. There was no difference between the sexes. The average daily movement was 37.6 ± 18.6 m/day. The animals daily movement marginally higher during the reproductive period. The matrix showed some landscape permeability displacement of animals. In the third chapter we have described the discrimination factors between diet and tissues of Broad-snouted caiman and possible differences between age groups. The isotopic ratios of carbon and nitrogen were determined in claw and scute samples collected from 18 captive animals and in 15 samples of their diet. The ?13C was 1.2 ± 0.1 ? for claw and 0.9 ± 0.2 ? for scutes; the ?15N was 1.1 ± 0.1 ? for claw and 0.8 ± 0.2 ? for scutes. These values were much lower than the values commonly assumed in ecological studies (3-5 ?) and similar to a previous study with crocodilians. The results of this study emphasize the need to determine discrimination factors specific to taxa instead of assuming average values derived from the literature. In the fourth chapter, were addressed possible ontogenetic and sexual niche differences in species using isotope analysis of animals claws. We identified a discrete ontogenetic variation in the isotopic niche and sexual difference only for juveniles. These results may indicate differences in the exploitation of food resources and a consequent reduction in intraspecific competition.