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Mapeamento físico de sequências repetitivas de DNA em cromossomos mitóticos e micronúcleos de Hoplosternum littorale (Callichthyidae, Siluriformes) provenientes de ambientes antropizados e não antropizados de Manaus, AM

Silva, Francijara Araújo da 17 April 2015 (has links)
Submitted by Kamila Costa (kamilavasconceloscosta@gmail.com) on 2015-06-15T18:03:22Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Francijara A da Silva.pdf: 1901335 bytes, checksum: 63a828902b8662bb981d3bdba355356d (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-06-15T18:43:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Francijara A da Silva.pdf: 1901335 bytes, checksum: 63a828902b8662bb981d3bdba355356d (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-06-15T18:45:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Francijara A da Silva.pdf: 1901335 bytes, checksum: 63a828902b8662bb981d3bdba355356d (MD5) / Made available in DSpace on 2015-06-15T18:45:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Francijara A da Silva.pdf: 1901335 bytes, checksum: 63a828902b8662bb981d3bdba355356d (MD5) Previous issue date: 2015-04-17 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Several studies have shown that adaptive processes are associated with genetic variability found in regions of repetitive DNAs, and this genomic portion may be largely responsible for the adaptability of amazonian fishes in several natural and anthropogenic aquatic environments. Hoplosternum littorale, known as tamoatá fish, is found in polluted and unpolluted environments as in rivers, streams and floodplains, which is showing its great adaptability. Thus, the main goal of this work has been mapped DNAs repetitive sequences in mitotic chromosomes and micronuclei as like as differential banding and to measure the possibility of genotoxic actions of these environments. Seventy-two individuals were collected for micronuclei analysis which were 16 from Catalão lake and 16 from Marchantaria lake; these environments were chosen because they presented a large parcel of water which contribute to not display detectable chemical pollutants. Still, 25 from Mindu stream and 15 from Quarenta stream were identified as most critical points of environmental pollution in Manaus, Amazonas. Were cytogenetically analyzed 40 individuals to the total, which five males and five females from each locality. Mitotic chromosomes were obtained from kidney cells, detection of heterochromatin by action of barium hydroxide and nucleolus organizer regions (NORs) by silver nitrate stain. Fluorescent in situ hybridization (FISH) was performed with 18S rDNA probes, 5S rDNA Rex 3 and telomeric sequences. Both individuals of polluted and unpolluted environments had diploid number as 2n= 60 chromosomes (4m + 4sm + 52a). Simple NORs were localized in the short arms of pair 5 which is in the same localization of 18 rDNA sites. However, 5S rDNA sites were localized in pericentromeric regions of the pairs 23 and 27 with a fifth additional mark in interstitial region of one of homologue pair 8 for individuals from unpolluted environments. Interstitial telomeric sites were not showed. As to as heterochromatin markings were found in the centromeric region, and pericentromeric terminal of the chromosomes with more conspicuous blocks in individuals from polluted environment. As for heterochromatin, markings were found in the centromeric region, and pericentromeric terminal of the chromosomes, with more conspicuous blocks in individuals of polluted environment. The retroelement Rex 3 showed dispersed up in the chromosomes of individuals from unpolluted environment and compartmentalized in individuals from polluted environment. The micronucleus test revealed no significant differences in comparisons pair-to-pair between environments and sampling locations. The mapping of repetitive DNA sequences revealed that the micronuclei have differential composition, intra and inter individuals. These data indicate that the environment is promoting a differential genome organization, where different portions are lost in micronucleus formation and there is no single fragile region suffering breaks, although involving of repetitive DNA elements in this process. / Diversos estudos demonstram que processos adaptativos estão relacionados com a variabilidade genética encontrada em regiões de DNAs repetitivos, e que esta porção genômica seja a grande responsável pela adaptabilidade de peixes amazônicos nos diversos ambientes aquáticos, tanto naturais quanto antropizados. Hoplosternum littorale, conhecido como tamoatá é encontrado em rios, igarapés e áreas de inundação, tanto em ambiente poluído quanto não poluído, mostrando grande capacidade de adaptação. Assim, o objetivo do trabalho foi mapear sequências repetitivas de DNA em cromossomos mitóticos e em micronúcleos, bem como os bandeamentos diferenciais e a avaliar a possível ação genotóxica destes ambientes. Setenta e dois indivíduos foram coletados para análise de micronúcleos, sendo 16 do lago Catalão e 16 do lago da Marchantaria, sendo estes ambientes escolhidos por apresentar um grande volume de água, o que contribui para não apresentar poluentes químicos detectáveis. Ainda, 25 no igarapé do Mindu e 15 no igarapé do Quarenta apontados como pontos mais críticos de poluição ambiental em Manaus, AM. Foram analisados citogeneticamente 40 exemplares ao total, sendo amostrados cinco machos e cinco fêmeas de cada localidade. Os cromossomos mitóticos foram obtidos a partir de células renais, a detecção de heterocromatina pela ação do hidróxido de bário e as regiões organizadoras de nucléolo (RONs) por meio da impregnação com nitrato de prata. A técnica de hibridização in situ por fluorescência (FISH) foi efetuada utilizando sondas de DNAr 18S, DNAr 5S, Rex 3 e sequências teloméricas. Tanto para os exemplares de ambiente poluído quanto não poluído o número diploide foi de 2n = 60 cromossomos (4m + 4sm + 52a). RON simples foram localizadas nos braços curtos do par 5, coincidentes com sítios de DNAr 18S. Já os sítios de DNAr 5S foram localizados na região pericentromérica dos pares 23 e 27, com uma quinta marcação adicional evidenciada na região intersticial de um dos homólogos do par 8 para indivíduos de ambiente não poluído. Sítios teloméricos intersticiais não foram evidenciados. Quanto à heterocromatina, foram encontradas marcações na região centromérica, pericentromérica e terminal dos cromossomos, com blocos mais conspícuos em indivíduos do ambiente poluído. O retroelemento Rex 3 apresentou-se disperso nos cromossomos dos indivíduos de ambiente não poluído e compartimentalizado nos indivíduos de ambiente poluído. O teste do micronúcleo não revelou diferenças significativas nas comparações par a par entre os ambientes e entre os locais de coleta. O mapeamento de sequências repetitivas de DNA revelou que os micronúcleos possuem composição diferencial, intra e interindividualmente. Estes dados indicam que o ambiente está promovendo uma organização diferencial do genoma, onde diferentes porções são perdidas na formação de micronúcleos e não há uma única região frágil que sofre quebras, apesar de elementos repetitivos de DNA estarem envolvidos neste processo.
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Biodiversidade dos metazoários parasitos das espécies dominantes de peixes Siluriformes do rio Batalha, médio rio Tietê, São Paulo, Brasil

Pelegrini, Larissa Sbeghen January 2018 (has links)
Orientador: Vanessa Doro Abdallah / Resumo: No presente estudo é apresentada uma análise da diversidade de parasitos presentes em peixes da ordem Siluriformes, coletados durante os anos de 2014 a 2016 no rio Batalha, pertencente à bacia hidrográfica do Tietê-Batalha (BH-TB), localizada na Região Centro-Oeste do Estado de São Paulo. Os parasitos de organismos aquáticos, particularmente os de peixes, são subestimados quanto à sua importância no impacto das populações hospedeiras. Tem-se observado um aumento nas pesquisas com esta temática, com estudos mais aprofundados envolvendo a dinâmica populacional destes organismos ao longo do tempo-espaço em hospedeiros em seu ambiente natural, ampliando assim o conhecimento sobre as estratégias de adaptação nas relações parasito-hospedeiro-ambiente. Em regiões impactadas, como é o caso da maioria dos corpos d’água do Estado de São Paulo, e dependendo do tipo de alteração ambiental em seus arredores, toda a cadeia trófica dos organismos aquáticos será influenciada por tais mudanças, e os parasitos responderão mais rapidamente do que os seus hospedeiros a estas alterações. A diversidade de organismos aquáticos no rio Batalha ainda é pouco conhecida com estudos restritos na região, e os peixes da ordem Siluriformes se destacam tanto em riqueza de espécies quanto em abundância, cuja importância se dá nas práticas desportivas, na alimentação local e, principalmente, com finalidade ornamental. São organismos amplamente diversificados e complexos, distribuídos em vários tipos de ambient... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The present study analyzes the parasites diversity present in fish species of the order Siluriformes, collected during the years 2014 to 2016 in the Batalha River, Tietê-Batalha river basin (BH-TB), in the Central-West Region of the State of São Paulo. Parasites of aquatic organisms, particularly those parasitizing fish, are underestimated as to their importance in the impact of host populations. The studies on this theme has grown over time, with more in-depth studies involving the population dynamics of these organisms over time-space in hosts in their natural environment, thus increasing knowledge on adaptation strategies in parasite-host-environment relationship. In degraded regions, as is the case with most water bodies in the State of São Paulo, and depending on the type of environmental change in their surroundings, the entire trophic chain of aquatic organisms will be influenced by such changes, and the parasites will respond more than your hosts to these changes. The diversity of aquatic organisms in the Batalha River is still little known with restricted studies in the region, and the Siluriformes species stand out both in species richness and in abundance, whose importance is given in sports, local feeding and ornamental purpose. They are widely diversified and complex organisms, distributed in several types of environment, with preference for cloudy water, between rocks and vegetation of the bottom of the rivers, with predominantly nocturnal habits, mainly in trop... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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A pesca do tamoatá Haplosternum litorale (Hancock, 1828) (Siluriformes : Callichthyidae), na ilha de Marajó-Foz Amazônica

ALBUQUERQUE, Adna Almeida de January 2005 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-09-04T13:13:55Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PescaTamoataHoplosternum.pdf: 6228892 bytes, checksum: 5cc2f5428040a626ee00d138c20e2643 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-09-05T13:42:30Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PescaTamoataHoplosternum.pdf: 6228892 bytes, checksum: 5cc2f5428040a626ee00d138c20e2643 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-05T13:42:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PescaTamoataHoplosternum.pdf: 6228892 bytes, checksum: 5cc2f5428040a626ee00d138c20e2643 (MD5) Previous issue date: 2005 / Hoplosternum littorale (Hancock, 1828) (Siluriformes, Callichthyidae) é um peixe de médio porte, conhecido na Amazônia brasileira como tamoatá, sendo o principal recurso pesqueiro da ilha de Marajó. A pesca do tamoatá é realizada de forma artesanal, principalmente na região do lago Arari, Município de Santa Cruz do Arari, sendo que sua comercialização nos centros urbanos é feita por intermédio de barcos conhecidos como geleiras. O objetivo deste trabalho foi descrever os aspectos da pesca do tamoatá na ilha de Marajó e relacionar a abundância desta espécie com os dias gastos pelas geleiras para completar a sua carga e com a quantidade de chuva. A pesca artesanal comercial do tamoatá é aqui descrita com base em observações de campo e entrevistas com pescadores, sendo realizada basicamente por redes de arrasto e no período de estiagem, quando o nível da água do rio e do lago Arari está baixo. A estimativa de abundância do tamoatá na ilha de Marajó foi baseada na relação entre o total desembarcado no porto do Ver-O-Peso, em Belém, e o número de dias que os barcos geleira esperam para encher suas urnas. A precipitação foi medida pela estação meteorológica de Soure, situada na porção leste da ilha de Marajó. A análise de covariância (ANCOVA) dos dados mensais referentes aos anos 1994 a 2004 apontou uma relação significativa entre estas variáveis, sendo o total desembarcado apresentando-se diretamente proporcional ao número de dias-geleiras e inversamente proporcional à chuva mensal. Por outro lado, observou-se ainda uma relação significativa entre o volume de chuva anual e o peso total de pescado capturado. Esta relação parece explicar a diminuição do desembarque do tamoatá nos dois períodos amostrados. / Hoplosternum littorale (Hancock, 1828) (Siluriformes, Callichthyidae) is a small catfish known in Brazilian Amazon as tamoatá. It is the main fisheries resources in the swamps and floodplain of the Marajó Island, especially in the Arari Lake and Arari River, near the Santa Cruz do Arari city. The inland Marajó fishery is described based in the field observation and local fishermen interview. The seine and gillnet are the most important fishing gears used by the fishermen with the canoe with paddle. The fish is stocked in boats with ice box called as geleiras. The managers of those boats buy the fish caught by the local fishermen. The boats wait some days to complete the ice box of fish and then transport the fish to be sold in the urban centers. The tamoatá caught in the Marajó Island between 1993 and 2004 and yielded in the Ver-O-Peso fish port was related with the total days spent by the geleiras in the Marajó by month and with the monthly rainfall measured in the meteorological station of the Soure city. The dry season is the most productive period, when the fish are concentrated in the remains water pools in the lake and river. The analysis of covariance (ANCOVA) indicates a significant relationship between the monthly tamoatá yield and days and rainfall factors. The relationship is positive to the days and negative to the rainfall. However, the relationship between the annual tamoatá yield and the rainfall is significant and positive. The lower amount of rainfall measured in the last years may explain the recent low caught of tamoatá in Marajó Island.

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