Submitted by PPG Biologia Celular e Molecular (bcm@pucrs.br) on 2018-03-15T12:31:20Z No. of bitstreams: 1 Tese Doutorado Adilio.pdf: 2662669 bytes, checksum: 73c86d6d555c94d57c1f0714b5c2ccbc (MD5) / Approved for entry into archive by Tatiana Lopes (tatiana.lopes@pucrs.br) on 2018-03-23T11:44:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese Doutorado Adilio.pdf: 2662669 bytes, checksum: 73c86d6d555c94d57c1f0714b5c2ccbc (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-23T11:52:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese Doutorado Adilio.pdf: 2662669 bytes, checksum: 73c86d6d555c94d57c1f0714b5c2ccbc (MD5) Previous issue date: 2018-03-02 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Tuberculosis (TB), caused mainly by Mycobacterium tuberculosis, is an infectious disease responsible for a significant number of deaths worldwide. IQG-607 is an analog of isoniazid (INH). According to several experiments carried out by our research group, IQG-607 showed both in vitro and in vivo anti-TB activity. Initial studies showed that the compound INCT-TB551 (a quinoline derivative) also presents in vitro anti-TB activity. The aim of this study was to develop analytical methods by high performance liquid chromatography (HPLC-UV) for quantification of IQG-607 and INCT-TB551 in mice plasma, and therefore to perform pharmacokinetic studies. The analytical method for the determination of IQG-607 in mice plasma showed linearity (r = 0.9992) in 0.5? 50 ?g/mL concentration range. Intra- and inter-day precision was < 15%, and the recovery ranged from 92.07 to 107.68%, showing that the method provides a precise and accurate analysis of the compound. In addition, IQG-607 was stable in plasma for at least 30 days at ?80 ?C, and after plasma processing, for 4 h in the auto-sampler (6 ?C) and maintained on ice (recovery > 85%). The applicability of the method for pharmacokinetic studies was determined after intravenous (i.v.) and oral (fasted and fed conditions) administrations to mice. IQG-607 levels in plasma were quantified at time points for up to 2.5 h. A short half-life (t1/2) (1.14 h), a high clearance (CL) (3.89 L/h/kg), a moderate volume of distribution at steady state (Vdss, 1.22 L/kg), were observed after i.v. (50 mg/kg) administration. Similar results were obtained for oral administration (250 mg/kg) under fasted and fed conditions. The oral bioavailability (F), approximately 4%, was not altered by feeding. Plasma protein binding was 88.87 ? 0.9%. Recently, experiments in mice infected with M. tuberculosis have shown that the compound INCT-TB551 has no in vivo activity, unlike previous in vitro activity studies. An analytical method was developed for the determination of INCT-TB551 in mice plasma to assess compound absorption, if any, after oral administration. The analytical method presented linearity from 0.1-10 ?g/mL (r = 0.9999). After development of the analytical method, the compound was orally administered in mice and the plasma levels were quantified at time points for up to 1 h. The compound INCT-TB551 was detected in the plasma of animals, which indicated that INCT-TB551 was absorbed. Although absorbed when orally administered, the compound is not exhibiting activity against M. tuberculosis in this animal model. This finding may be associated with the formation of inactive metabolites and/or the plasma concentration of INCT-TB551 achieved may be inadequate to exert its therapeutic effect. However, these points require further investigations. The protocols described here may serve as support to initiate pharmacokinetic studies of promising compounds, collaborating to advance in earlier stages of drug development. / A tuberculose (TB) ? uma doen?a infecto-contagiosa, causada principalmente pelo Mycobacterium tuberculosis, respons?vel por um n?mero consider?vel de mortes em todo o mundo. O composto IQG-607 ? um an?logo da isoniazida (INH) que, de acordo com diversos experimentos realizados pelo grupo de pesquisa envolvido no seu estudo, apresenta atividade anti-TB in vitro e in vivo. Estudos iniciais do mesmo grupo demonstraram que o composto INCT-TB551 (um derivado quinol?nico) tamb?m apresenta promissora atividade anti-TB. O objetivo deste estudo foi desenvolver metodologias anal?ticas por cromatografia l?quida de alta efici?ncia (CLAE-UV) para a quantifica??o do composto IQG-607 e do INCT-TB551, em plasma de camundongos, para a realiza??o de estudos de farmacocin?tica. O m?todo anal?tico para a determina??o do composto IQG-607 em plasma de camundongos apresentou linearidade (r = 0.9992) na faixa de 0.5?50 ?g/mL. Os valores de precis?o intra e interensaio (CV < 15%) e de recupera??o (92.07-107.68%) demonstram que o m?todo ? preciso e exato para a an?lise do composto. Al?m disso, o IQG-607 se mostrou est?vel no plasma por at? 30 dias, quando armazenado no freezer -80 ?C, e est?vel ap?s o tratamento da amostra do plasma, por at? 4 horas (h) na bancada (gelo) e no autosampler do equipamento (6 ?C). A aplicabilidade do m?todo anal?tico para o estudo de farmacocin?tica foi determinada ap?s a administra??o i.v. e oral em camundongos (animais em jejum e animais alimentados). As concentra??es plasm?ticas de IQG-607 foram quantificadas por at? 2,5 h ap?s a administra??o nos animais. Quando administrado pela via i.v. foi observado um tempo de meia vida (t1/2) curto (1,14 h), elevado clearance (CL) (3,89 L/h/kg), e um moderado volume de distribui??o (Vdss) (1,22 L/kg). Resultados similares foram obtidos ap?s a administra??o oral (250 mg/kg) em camundongos que estavam em jejum ou alimentados. A biodisponibilidade oral (F) foi de aproximadamente 4 %, valor que n?o foi alterado pela alimenta??o. A taxa de liga??o a prote?nas plasm?ticas do IQG-607 ? de aproximadamente 88 ? 0.9%. Experimentos recentes em camundongos infectados com M. tuberculosis demonstraram que o composto INCT-TB551 n?o apresentou atividade neste modelo in vivo, ao contr?rio dos estudos de atividade in vitro realizados anteriormente. Um m?todo anal?tico para a determina??o do composto INCT-TB551 em plasma de camundongos foi desenvolvido para avaliar se o composto estava sendo absorvido ap?s a administra??o oral. O m?todo anal?tico apresentou linearidade na faixa de 0.1-10 ?g/mL (r = 0.9999). Ap?s o m?todo ter sido padronizado, o composto foi administrado por via oral em camundongos, e as concentra??es plasm?ticas foram quantificadas por at? 1 h ap?s a administra??o. O composto INCT-TB551 foi detectado no plasma dos animais, indicando que estava sendo absorvido. Apesar de absorvido quando administrado por via oral, o composto n?o est? apresentando atividade contra M. tuberculosis neste modelo animal, o que pode estar relacionado, por exemplo, com a forma??o de metab?litos inativos e/ou ainda, o n?vel plasm?tico atingido pode ser inadequado para que o composto consiga exercer o seu efeito terap?utico, e isto precisa ser melhor investigado. Os protocolos apresentados neste trabalho poder?o servir como suporte para estudos de farmacocin?ticoa de compostos que se apresentam promissores, colaborando para o avan?o nas etapas necess?rias para o desenvolvimento de poss?veis f?rmacos.

Made available in DSpace on 2015-03-13T17:08:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AndersonMS.pdf: 2705590 bytes, checksum: 7d53920a98feb50686c5961b691c4ce2 (MD5) Previous issue date: 2008-02-29 / Petr?leo Brasileiro SA - PETROBRAS / This project was developed as a partnership between the Laboratory of Stratigraphical Analyses of the Geology Department of UFRN and the company Millennium Inorganic Chemicals Minera??o Ltda. This company is located in the north end of the paraiban coast, in the municipal district of Mataraca. Millennium has as main prospected product, heavy minerals as ilmenita, rutilo and zircon presents in the sands of the dunes. These dunes are predominantly inactive, and overlap the superior portion of Barreiras Formation rocks. The mining happens with the use of a dredge that is emerged at an artificial lake on the dunes. This dredge removes sand dunes of the bottom lake (after it disassembles of the lake borders with water jets) and directs for the concentration plant, through piping where the minerals are then separate. The present work consisted in the acquisition external geometries of the dunes, where in the end a 3D Static Model could be set up of these sedimentary deposits with emphasis in the behavior of the structural top of Barreiras Formation rocks (inferior limit of the deposit). The knowledge of this surface is important in the phase of the plowing planning for the company, because a calculation mistake can do with that the dredge works too close of this limit, taking the risk that fragments can cause obstruction in the dredge generating a financial damage so much in the equipment repair as for the stopped days production. During the field stages (accomplished in 2006 and 2007) topographical techniques risings were used with Total Station and Geodesic GPS as well as shallow geophysical acquisitions with GPR (Ground Penetrating Radar). It was acquired almost 10,4km of topography and 10km of profiles GPR. The Geodesic GPS was used for the data geopositioning and topographical rising of a traverse line with 630m of extension in the stage of 2007. The GPR was shown a reliable method, ecologically clean, fast acquisition and with a low cost in relation to traditional methods as surveys. The main advantage of this equipment is obtain a continuous information to superior surface Barreiras Formation rocks. The static models 3D were elaborated starting from the obtained data being used two specific softwares for visualization 3D: GoCAD 2.0.8 and Datamine. The visualization 3D allows a better understanding of the Barreiras surface behavior as well as it makes possible the execution of several types of measurements, favoring like calculations and allowing that procedures used for mineral extraction is used with larger safety / Este projeto foi desenvolvido como forma de uma parceria entre o Laborat?rio de An?lises Estratigr?ficas do Departamento de Geologia da UFRN e a empresa Millennium Inorganic Chemicals Minera??o Ltda. Esta mina localiza-se no extremo norte do litoral paraibano, no munic?pio de Mataraca, tendo como principal produto prospectado, minerais pesados como ilmenita, rutilo e zirc?o presentes nas areias das dunas. Tais dunas, predominantemente inativas, repousam sobre a por??o superior das rochas silicicl?sticas da Forma??o Barreiras. A minera??o se d? atrav?s do uso de uma draga que fica emersa em um lago artificial sobre as dunas. Esta retira a areia das dunas do fundo do lago (ap?s o desmonte das bordas do lago com jatos de ?gua) e encaminha para a planta de concentra??o, atrav?s de tubula??es onde os minerais s?o ent?o separados. O presente trabalho consistiu na aquisi??o das geometrias externa e interna das dunas, de forma que ao final se pudesse montar um Modelo Est?tico 3D destes dep?sitos sedimentares, com ?nfase no comportamento do topo estrutural das rochas da Forma??o Barreiras (limite inferior da jazida). O conhecimento detalhado desta superf?cie ? de fundamental import?ncia na fase do planejamento da lavra pela empresa, visto que um erro de c?lculo pode fazer com que a draga trabalhe pr?ximo demais deste limite, correndo o risco de que fragmentos possam causar obstru??o na draga gerando um preju?zo financeiro tanto no reparo do equipamento como pelos dias parados de produ??o. Durante as etapas de campo (realizadas nos anos de 2006 e 2007) foram utilizadas t?cnicas de levantamentos topogr?ficos com Esta??o Total e GPS Geod?sico bem como aquisi??es geof?sicas rasas com GPR (Ground Penetrating Radar). Foram adquiridos aproximadamente 10,5Km de topografia e 10Km de perfis GPR. O GPS Geod?sico foi utilizado para o georreferenciamento dos dados e levantamento topogr?fico de uma linha transversal com 630m de extens?o na etapa de 2007. O GPR mostrou-se um m?todo confi?vel, ecologicamente limpo, de r?pida aquisi??o e com um baixo custo em rela??o a m?todos tradicionais como sondagens. A principal vantagem do uso deste equipamento ? obter uma informa??o cont?nua da superf?cie superior da Forma??o Barreiras. Os modelos est?ticos 3D foram elaborados a partir dos dados obtidos utilizando-se dois softwares espec?ficos para ambientes 3D: GoCAD 2.0.8 e o Datamine. A visualiza??o em ambiente 3D permite uma melhor compreens?o do comportamento da superf?cie do Barreiras bem como possibilita a execu??o de diversos tipos de medi??es, favorecendo assim uma melhor cubagem da jazida e permitindo que os procedimentos utilizados para extra??o mineral sejam utilizados com maior seguran?a

Made available in DSpace on 2015-03-13T17:08:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ThalesESJ_DISSERT.pdf: 669387 bytes, checksum: 33a20d208304804215535ed96770330f (MD5) Previous issue date: 2012-04-27 / In this study, the methodological procedures involved in digital imaging of collapsed paleocaves in tufa using GPR are presented. These carbonate deposits occur in the Quixer? region, Cear? State (NE Brazil), on the western border of the Potiguar Basin. Collapsed paleocaves are exposed along a state road, which were selected to this study. We chose a portion of the called Quixer? outcrop for making a photomosaic and caring out a GPR test section to compare and parameterize the karst geometries on the geophysical line. The results were satisfactory and led to the adoption of criteria for the interpretation of others GPR sections acquired in the region of the Quixer? outcrop. Two grids of GPR lines were acquired; the first one was wider and more spaced and guided the location of the second grid, denser and located in the southern part of the outcrop. The radargrams of the second grid reveal satisfactorily the collapsed paleocaves geometries. For each grid has been developed a digital solid model of the Quixer? outcrop. The first model allows the recognition of the general distribution and location of collapsed paleocaves in tufa deposits, while the second more detailed digital model provides not only the 3D individualization of the major paleocaves, but also the estimation of their respective volumes. The digital solid models are presented here as a new frontier in the study of analog outcrops to reservoirs (for groundwater and hydrocarbon), in which the volumetric parameterization and characterization of geological bodies become essential for composing the databases, which together with petrophysical properties information, are used in more realistic computer simulations for sedimentary reservoirs. / Nesse trabalho s?o apresentados os procedimentos metodol?gicos envolvidos no imageamento digital de paleocavernas colapsadas em tufas carbon?ticas que ocorrem na borda oeste da Bacia Potiguar com GPR. Foi mapeada uma ?rea em Quixer? (CE) e selecionado um afloramento em um corte de estrada, denominado de Afloramento Quixer?. Foi escolhida uma por??o deste afloramento para confec??o de um fotomosaico e levantamento de uma se??o-teste com o GPR para a compara??o e parametriza??o das geometrias c?rsticas aflorantes e imageadas na linha geof?sica. Os resultados foram satisfat?rios e permitiram a ado??o de crit?rios para a interpreta??o das paleocavernas colapsadas em outras se??es GPR, levantadas na regi?o do afloramento. Foram adquiridas duas malhas de linhas GPR, a primeira mais ampla e espa?ada norteou a loca??o da segunda, mais adensada, na por??o sul do Afloramento Quixer?. Nos radargramas foram interpretadas e parametrizadas as geometrias das principais paleocavernas colapsadas. Para cada malha foi elaborado um modelo de s?lido digital do Afloramento Quixer?, sendo que o primeiro modelo permitiu o reconhecimento da distribui??o geral das tufas e a localiza??o das paleocavernas colapsadas, enquanto o segundo modelo digital, por ser mais detalhado, possibilitou n?o apenas a individualiza??o 3D das principais paleocavernas, mas tamb?m o c?lculo dos seus respectivos volumes. Os modelos de s?lidos digitais s?o aqui apresentados como uma nova fronteira no estudo de afloramentos an?logos a reservat?rios (h?dricos ou petrol?feros), na qual a parametriza??o e a caracteriza??o volum?trica dos corpos geol?gicos passam a ser fundamental para compor bancos de dados, que conjuntamente com informa??es de propriedades petrof?sicas s?o utilizados em simula??es computacionais mais real?sticas de reservat?rios.

Made available in DSpace on 2015-03-13T17:08:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DanielSG_Capa_ate_pag62.pdf: 4484256 bytes, checksum: d74828e0a4e19ed96a1cddf2063832fb (MD5) Previous issue date: 2008-08-17 / This work shows a integrated study of modern analog to fluvial reservoirs of A?u Formation (Unit 3). The modern analog studied has been Assu River located in the same named city, Rio Grande do Norte State, Northeast of Brazil. It has been developed a new methodology to parameterizating the fluvial geological bodies by GPR profile (by central frequency antennas of 50, 100 and 200 MHz). The main parameters obtained were width and thickness. Still in the parameterization, orthophotomaps have been used to calculate the canal sinuosity and braided parameters of Assu River. These information are integrated in a database to supply input data in 3D geological models of fluvial reservoirs. It was made an architectural characterization of the deposit by trench description, GPR profile interpretation and natural expositions study to recognize and describe the facies and its associations, external and internal geometries, boundary surfaces and archtetural elements. Finally, a three-dimensional modeling has been built using all the acquired data already in association with real well data of a reservoir which Rio Assu is considered as analogous. Facies simulations have been used simple kriging (deterministic algorithm), SIS and Boolean (object-based, both stochastics). And, for modeling porosities have used the stochastic algorithm SGS / Esta disserta??o engloba o estudo integrado de an?logo recente aos reservat?rios petrol?feros fluviais da forma??o A?u (Unidade A?u-3). O an?logo estudado ? o Rio Assu, em um segmento localizado pr?ximo ? cidade hom?nima no Estado do Rio Grande do Norte, Brasil. Foi desenvolvida uma nova metodologia para a parametriza??o dos corpos sedimentares (canais fluviais) com base em perfis GPR (utilizando antenas com freq??ncia central de 200, 100 e 50 MHz). Os principais par?metros obtidos foram largura e espessura. Na parametriza??o foram utilizadas ainda ortofotocartas para o c?lculo dos par?metros de sinuosidade e entrela?amento dos canais. Estas informa??es est?o inclusos em um banco de dados que tem como finalidade principal a de servir como dado de entrada na modelagem geol?gica de reservat?rios fluviais. Foi realizada, tamb?m, a caracteriza??o arquitetural deste dep?sito com base na descri??o de trincheiras, interpreta??o de perfis GPR e estudo de exposi??es naturais do dep?sito para o reconhecimento e descri??o das f?cies e suas associa??es, al?m dos elementos arquiteturais e superf?cies limitantes. Por ?ltimo, foi realizada a modelagem tridimensional do an?logo, no software PETRELTM, com base na associa??o de todos os dados obtidos neste trabalho com dados reais de po?os de um reservat?rio ao qual o Rio Assu ? aqui adotado como an?logo, utilizando os algoritmos Krigagem Simples (determin?stico), SIS e Booleano (ambos estoc?sticos) para a modelagem de f?cies e o algoritmo estoc?stico SGS para modelagem de porosidadesa

Made available in DSpace on 2015-02-24T19:48:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AndersonMS_TESE_inicio_pag69.pdf: 4445825 bytes, checksum: 1053632581a0015bab09d4146df22458 (MD5) Previous issue date: 2013-01-31 / Petr?leo Brasileiro SA - PETROBRAS / The aim of this work was to describe the methodological procedures that were mandatory to develop a 3D digital imaging of the external and internal geometry of the analogue outcrops from reservoirs and to build a Virtual Outcrop Model (VOM). The imaging process of the external geometry was acquired by using the Laser Scanner, the Geodesic GPS and the Total Station procedures. On the other hand, the imaging of the internal geometry was evaluated by GPR (Ground Penetrating Radar).The produced VOMs were adapted with much more detailed data with addition of the geological data and the gamma ray and permeability profiles. As a model for the use of the methodological procedures used on this work, the adapted VOM, two outcrops, located at the east part of the Parnaiba Basin, were selected. On the first one, rocks from the aeolian deposit of the Piaui Formation (Neo-carboniferous) and tidal flat deposits from the Pedra de Fogo Formation (Permian), which arises in a large outcrops located between Floriano and Teresina (Piau?), are present. The second area, located at the National Park of Sete Cidades, also at the Piau?, presents rocks from the Cabe?as Formation deposited in fluvial-deltaic systems during the Late Devonian. From the data of the adapted VOMs it was possible to identify lines, surfaces and 3D geometry, and therefore, quantify the geometry of interest. Among the found parameterization values, a table containing the thickness and width, obtained in canal and lobes deposits at the outcrop Pared?o and Biblioteca were the more relevant ones. In fact, this table can be used as an input for stochastic simulation of reservoirs. An example of the direct use of such table and their predicted radargrams was the identification of the bounding surface at the aeolian sites from the Piau? Formation. In spite of such radargrams supply only bi-dimensional data, the acquired lines followed of a mesh profile were used to add a third dimension to the imaging of the internal geometry. This phenomenon appears to be valid for all studied outcrops. As a conclusion, the tool here presented can became a new methodology in which the advantages of the digital imaging acquired from the Laser Scanner (precision, accuracy and speed of acquisition) were combined with the Total Station procedure (precision) using the classical digital photomosaic technique / Neste trabalho s?o apresentados os procedimentos metodol?gicos necess?rios para realizar o imageamento digital 3D da geometria externa e interna de afloramentos an?logos a reservat?rios, e elaborar seus Modelos Virtuais de Afloramentos (MVA). Para imagear a geometria externa foram utilizados o Laser Scanner, o GPS Geod?sico e a Esta??o Total, enquanto que para imagear a geometria interna foi utilizado o GPR. Nos MVA elaborados foram acrescidas ainda as informa??es geol?gicas e as obtidas nas perfilagens com raios gama e de permeabilidade. Como estudo de caso, para exemplificar os procedimentos metodol?gicos propostos, foram escolhidos dois conjuntos de afloramentos na borda leste da Bacia do Parna?ba. Na primeira ?rea ocorrem rochas de origem e?lica da Forma??o Piau? (Neocarbon?fero) e plan?cie de mar? da Forma??o Pedra de Fogo (Permiano), que afloram em um amplo corte de estrada, situado entre Floriano e Teresina (Piau?). A segunda ?rea, situada no Parque Nacional de Sete Cidades, tamb?m no Piau?, envolve rochas da Forma??o Cabe?as depositadas em sistemas fl?vio-deltaicos, durante o Neodevoniano. Com os MVA elaborados foi poss?vel identificar, linhas, superf?cies e geometrias 3D e, assim, quantificar as geometrias de interesse. Dentre as parametriza??es mais relevantes, ressaltam-se a tabela com valores de espessura e largura, obtidas em dep?sitos de canais e em lobos, nos afloramentos Pared?o e Biblioteca. Esta tabela pode ser utilizada como entrada (input) para simula??o estoc?stica de reservat?rios. Um exemplo da aplica??o direta dos radargramas interpretados foi a identifica??o de superf?cies limitantes, em dep?sitos e?licos, da Forma??o Piau?. Apesar dos radargramas oferecerem apenas dados bidimensionais, a aquisi??o de linhas distribu?das segundo uma malha acrescentou a terceira dimens?o ao imageamento das geometrias internas em todos os afloramentos estudados. ? ainda proposta uma nova metodologia que busca conciliar as vantagens obtidas com o imageamento digital com Laser Scanner (precis?o, acur?cia e velocidade de aquisi??o) e a Esta??o Total (precis?o), com o uso cl?ssico de fotomosaicos digitais