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Análise da expressão gênica da proteína homóloga à Scc1/Rad21 do complexo Coesina em Trypanosoma cruzi

Silva, Fabiana Brandão Alves 15 February 2012 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2012. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-17T10:18:34Z No. of bitstreams: 1 2012_FabiansBrandaoAlvesSilva.pdf: 3339585 bytes, checksum: 3a2b291213f89307c5254e99ccac67ea (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-17T10:18:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_FabiansBrandaoAlvesSilva.pdf: 3339585 bytes, checksum: 3a2b291213f89307c5254e99ccac67ea (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-17T10:18:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_FabiansBrandaoAlvesSilva.pdf: 3339585 bytes, checksum: 3a2b291213f89307c5254e99ccac67ea (MD5) / O complexo Coesina tem a função essencial de assegurar a correta segregação das cromátides irmãs após replicação do DNA. A Coesina atua tanto na mitose como na meiose e é mais bem descrita em leveduras e mamíferos. O complexo se forma pela interação das subunidades proteicas conhecidas como SMC (proteínas de manutenção estrutural dos cromossomos), SMC1 e SMC3, e duas proteínas SCC (proteínas de coesão das cromátides irmãs), a SCC1 (também conhecida como Mcd1 ou Rad21) e SCC3 (SA1 e SA2 em células de mamíferos). Existem poucos estudos sobre a Coesina e sua função em tripanossomatídeos, sendo que foi verificada a presença dos genes para todas as subunidades da Coesina em Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei e a Leishmania major. Em trabalhos recentes do nosso grupo, foi observado que a subunidade SCC1 do complexo Coesina em T. cruzi está presente nas formas amastigotas com localização nuclear, em menor quantidade em epimastigotas distribuída por toda a célula e ausente em tripomastigotas. Desse modo, essa diferença da presença da proteína TcSCC1 nas diferentes formas do parasita nos levou a estudar nesse trabalho a expressão gênica dessa proteína de T. cruzi e sua regulação. Inicialmente, foi realizada uma quantificação relativa do mRNA da proteína SCC1 nas diferentes formas do T. cruzi por RT-PCR em tempo real. As formas amastigotas e tripomastigotas apresentaram uma quantidade relativa semelhante entre si e equivalente à metade da quantidade das formas epimastigotas, o que diverge do observado para a presença da proteína. Assim, é possível que haja um mecanismo regulatório provavelmente pós-transcricional, já que é descrito que esse tipo de regulação é peça chave na modulação da expressão gênica em T. cruzi. Nos experimentos onde foi inibido a transcrição e a transcrição juntamente com a tradução nas formas epimastigotas e amastigotas, observamos uma estabilidade do mRNA da TcSCC1 mais longa em amastigotas e pouco afetada com a inibição da tradução. Essa observação pode explicar a causa da maior abundância da proteína nas formas amastigotas. Embora em epimastigotas o mRNA também seja relativamente estável, a quantidade relativa decresce mais acentuadamente, sugerindo uma meia vida mais curta em epimastigotas. É provável que a regulação pós-transcricional desse mRNA possa estar modulando a expressão do gene TcSCC1 entre as formas do T. cruzi e essa não é dependente da tradução. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The cohesin complex has the essential function of ensuring the correct segregation of sister chromatids after DNA replication. The cohesin acts both in mitosis as in meiosis and is best described in yeast and mammals. The complex is formed by the interaction of protein subunits known as SMC (structural maintenance of chromosomes), SMC1 and SMC3, and two proteins SCC (cohesion of sister chromatids), the SCC1 (also known as Mcd1 or Rad21) and SCC3 (SA1 and SA2 in mammalian cells). There are few studies of the cohesin and its function in trypanosomatids, and it was detected the presence of genes for all subunits of cohesin in Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei and Leishmania major. In recent work from our group, we observed that the SCC1 subunit of cohesin complex in T. cruzi amastigotes is present with nuclear localization, in epimastigotes with a lesser amount distributed throughout the cell and absent in trypomastigotes. Thus, this difference of the presence of TcSCC1 protein in the different forms of the parasite led us to study in this work the gene expression of this T. cruzi protein and its regulation. Initially, we performed a relative quantification of TcSCC1 mRNA in the different forms of T. cruzi by real time RT-PCR. The amastigotes and trypomastigotes forms presented a relative similar amount among themselves and as equivalent to half the amount of the epimastigote forms, which differs of that observed for presence of the protein. Thus, there may be a possible post-transcriptional regulatory mechanism, since it is reported that this type of regulation is a key part in the modulation of T. cruzi gene expression. In experiments where transcription was inhibited and transcription along with translation in epimastigotes and amastigotes, we observed longer stability of TcSCC1 mRNA in amastigotes and is not affected by the inhibition of the translation. This observation may explain why the protein is more abundant in amastigotes. Although in epimastigotes the mRNA is also relatively stable, the relative amount decreases more markedly, suggesting shorter half life in epimastigotes. It is likely that post-transcriptional regulation of this mRNA may be modulating the TcSCC1gene expression between the forms of T. cruzi and that is not dependent on translation.
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Análise fatorial

Fachel, Jandyra Maria Guimarães January 1976 (has links)
Resumo não disponível
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The C-type distribution as an underlying model for categorical data and its use in factorial analysis

Fachel, Jandyra Maria Guimarães January 1986 (has links)
The 'surface of constant association' was introduced by Pearson (1913) and termed ' Contingency-type distribution', or briefly 'C-type' by Mardia (1967).
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Métodos computacionais para o cálculo de raízes reais de equações polinomiais

Marins, Jussara Maria January 1982 (has links)
Este trabalho trata de métodos computacionais utilizados para o cálculo numérico das raízes reais de equações polinomiais. Para isso fazemos uma introdução ao estudo da aritmética computacional, dos limites de erro, dos dígitos significantes exatos e da eficiência computacional para o estudo dos algoritmos básicos para o cálculo numérico de polinômios. A estratégia é enumerar, localizar e separar as raízes da equação polinomial para após realizar os cálculos que podem ser feitos por diversos métodos. Além dos métodos tradicionais como Newton, Secante, Muller, etc., apresentamos os métodos desenvolvidos após o advento da Teoria de Intervalos e também os métodos híbridos, que utilizam enfoque intervalar sem a aritmética de intervalos, com o intuito de diminuir os custos de processamento. / This work describes some computational methods for numerical evaluation of real roots of polynomialequations. We make an introduction to computational arithmetic, error bounds, exact significant digits and computational efficiency necessary for the study of basic algorithms for numerical computation of polynomials. The strategy is to count, localize, separate anu then to compute the real roots of polynomial equations. Besides the traditional methods like Secant, Newton, Muller e.g., we present also some Interval Methods. Finally we present a new class of methods that utilize the intervalor aproach without to make use the interval aritmetic. The new class of methods presents the same advantages as the interval methods and reduces the computational costs. In this class we obtain a method that is always convergent and provides directly the error bounds.
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Desenvolvimento de conjuntos de base GTO para calculos ab initio e algumas aplicações de calculos teoricos em alcaloides pirrolizidinicos

Santos, Marcelo Giordan 22 July 2018 (has links)
Orientador: Rogerio Custodio / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-22T04:20:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos_MarceloGiordan_D.pdf: 7033134 bytes, checksum: 0abc8929f131301d13c809f4bb366a3d (MD5) Previous issue date: 1997 / Doutorado
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Auxilios a interpretação na analise discriminante de Fisher

Diaz Consul, Celeste Maria 05 May 2000 (has links)
Orientador: Regina C. C. P. Moran / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-07-26T17:06:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DiazConsul_CelesteMaria_M.pdf: 13045060 bytes, checksum: 87008c2228305529a1a34e9b1801f5c9 (MD5) Previous issue date: 2000 / Resumo: Cada vez mais a análise multivariada é empregada para resolver problemas nas ciências biológicas, a indústria, estudos demográficos, etc. A análise discriminante de Fisher é uma das técnicas mais usadas quando se trata de dados com estrutura de grupo. A interpretação dos coeficientes nas funções lineares discriminantes de Fisher apresenta especificidades adicionais em relação, por exemplo, à técnica de componentes principais, A razão para estas é a presença das fontes de variação entre grupos e dentro dos grupos, levando a mais de uma métrica e portanto mais de uma padronização. Neste trabalho os coeficientes da função linear discriminante de Fisher são estudados através de diferentes configurações para estruturas de grupo. Desta forma, através de estruturas conhecidas, foi possível focalizar as relações das estruturas com os coeficientes; conseqüentemente mais clareza para a partir dos coeficientes inferir possíveis estruturas de grupo. Também construímos, como auxílio à interpretação, os círculos de correlação para a análise discriminante de Fisher. Estes permitem inferir a direção e magnitude das contribuições das variáveis na separação dos grupos, bem como recuperar as direções e magnitudes relativamente ã estrutura de variabilidade dentro dos grupos. Foi desenvolvido o uso de pontos suplementares na análise discriminante de Fisher, recurso que se tem mostrado muito importante quando se quer estudar indivíduos que não participem dos critérios de agrupamento iniciais dos dados. Finalmente, uma aplicação ilustra todo o desenvolvimento metodológico deste trabalho e um roteiro para auxiliar na interpretação foi produzido / Abstract: Multivariable analysis is increasingly being used to solve problems in biological science, in industry, demographic studies, etc. The Fisher's discriminant analysis is one of the more frequently used techniques for analysis of data with group structure. The interpretation of the coefficients in the Fisher's discriminant linear functions present additional specifications in relation, for example, to the technique of principal components. The reason for these is the presence of sources of variation between and inside the groups. Resulting in more than one metric and therefore more than one standardization. In this work the coefficients of Fisher's discriminant linear function are studied through the different configurations for the structures of the group. In this way, through known structures, it was possible to focus on the relations of the structures with the coefficients; consequently making it easier to infer possible structures of the group from the coefficients. As an aid to this interpretation the correlation circles for Fisher's discriminant analysis were constructed. These allow us to infer the direction and the magnitude of the contributions of variables in group separation, as well as to recover the directions and magnitudes relatively to the variability structure inside the groups. The use of supplementary points in the Fisher's discriminant analysis was developed, a resource that has been shown to be very important when we want to study individuals that do not participate of the initial grouping criteria of the data. Finally, an application illustrates all the methodological development of this work and a guide to help with the interpretation was produced / Mestrado / Mestre em Estatística
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Calculo de Malliavin e analise no espaço de Wiener

Andrade, Alexandre de 28 July 2018 (has links)
Orientador: Paulo Regis Caron Ruffino / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-07-28T14:07:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andrade_Alexandrede_M.pdf: 1129471 bytes, checksum: f13b8c2ce490c27d075a0df365aa780a (MD5) Previous issue date: 1999 / Resumo: A presente monografia contém um estudo de aspectos fundamentais da análise no espaço de Wiener. Os tópicos abordados são: a decomposição em Caos de Wiener, Integrais Múltiplas de Wiener, Derivada de Malliavin e Integral de Skorohod. Também são apresentadas as principais relações destes com a Integral de Itô e algumas aplicações ao cálculo antecipativo. / Abstract: This monograph contains a study on the fundamentaIs aspects of analysis in the Wiener space. Subjects are: Wiener chaos decomposition, Multiple Wiener integraIs, Malliavin derivative and Skorohod integral. We also present the relations between this elements and Ito integral. Some aplications of this tools to antecipative stochastic calculus are showed. / Mestrado / Mestre em Matemática
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Consequências radiológicas ambientais devido a um acidente de perda de refrigerante

Guimarães, Antonio Cesar Ferreira, Instituto de Engenharia Nuclear 01 1900 (has links)
Submitted by Marcele Costal de Castro (costalcastro@gmail.com) on 2017-09-29T18:54:02Z No. of bitstreams: 1 ANTONIO CESAR F. GUIMARÃES M.pdf: 5079038 bytes, checksum: 9576eb4fa35427697710cdb7ae1663b0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-29T18:54:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ANTONIO CESAR F. GUIMARÃES M.pdf: 5079038 bytes, checksum: 9576eb4fa35427697710cdb7ae1663b0 (MD5) Previous issue date: 1981-01 / O presente estudo constou da preparação de um modelo de cálculo para a determinação de “áreas de segurança” de centrais nucleares, que são denominadas Zona de Exclusão e Zona de Baixa População. Estas áreas são determinadas a partir do cálculo de doses radioativas as quais estarão sujeitas a população que habita ao redor de centrais nucleares em caso de ocorrência de um acidente hipotético, denominado de “Máximo Acidente Crível” (MAC). O MAC é definido como um acidente de perda completa do refrigerante provocado por ruptura do circuito primário de refrigeração com consequente fusão de parte do núcleo reator. Os cálculos realizados foram baseados nos projetos da central Angra I, estando o presente estudo inserido no contexto de licenciamento de Instalações Nucleares de Potência. Os resultados provenientes do uso da hipótese mais pessimista (sem uso de filtros) fornecem valores de 410m e 1000m para raios de Zonas de Exclusão e Zonas de Baixa População, respectivamente.
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Determinação de urânio IV em soluções clorídricas de colunas de enriquecimento por espectrometria com injeção em fluxo

Bastos, Margarida Bethlem Rodrigues, Instituto de Engenharia Nuclear January 1988 (has links)
Submitted by Marcele Costal de Castro (costalcastro@gmail.com) on 2017-12-08T13:15:20Z No. of bitstreams: 1 MARGARIDA BETHLEM RODRIGUES BASTOS M.pdf: 1923122 bytes, checksum: 3653d37688ce6ab889b6b33708c7795b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-08T13:15:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MARGARIDA BETHLEM RODRIGUES BASTOS M.pdf: 1923122 bytes, checksum: 3653d37688ce6ab889b6b33708c7795b (MD5) Previous issue date: 1988 / O presente método consiste na utilização de Análise por Injeção em Fluxo para determinação espectrofotométrica de U(IV) pela cor do complexo em solução clorídrica. A espectrofotometria convencional consiste na leitura direta das absorvâncias em λ 650nm de soluções de U(IV) em HC1-2M. O método mostrou-se linear entre 0,3 e 2,8 g/l U(IV). o coeficiente de extinção molar é 57 ± 2. A adaptação do método a sistemas FIA, devido as suas inúmeras alternativas possibilitou ampliar este limite para análise de concentrações de U(IV) até 35,7 q/l U(IV) e as velocidades analíticas obtidas estiveram entre 63 e 95 amostras/hora. Os íons U(VI), Ti(IV) e Fe(II) mostraram não interferir até limites de U(VI):U(IV) = 20, Ti(IV):U(IV) = 6 e Fe (II):U(IV) = 10. O método mostrou-se reprodutível no intervalo de concentração e condições empregadas, com um desvio padrão médio em torno de 0,3.
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Um metodo de estimação para a função intensidade do processo Poisson não homogeneo

Crestana, Cassiana 07 June 1991 (has links)
Orientador : Mauro S. de F. Marques / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Ciencia da Computação / Made available in DSpace on 2018-07-13T23:44:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Crestana_Cassiana_M.pdf: 1654222 bytes, checksum: fafc58864d03ac514250966b7b85b2eb (MD5) Previous issue date: 1991 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed / Mestrado / Mestre em Estatística

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