Orientador: Itamar Alves Martins / Banca: Fernando Rodrigues da Silva / Banca: Cynthia Peralta de Almeida Prado / Resumo: Neste estudo nós descrevemos pela primeira vez as vocalizações de H. laistriatus (Caramaschi & Cruz, 2004) da localidade tipo, Parque Nacional do Itatiaia (PNI), Itamonte, Minas Gerais, e do Parque Estadual de Campos do Jordão, São Paulo, ambas as localidades situadas na Serra da Mantiqueira. Adicionalmente, as vocalizações de H. laistriatus foram comparadas com os cantos descritos para as espécies do clado H. polytaenius... / Abstract: This study was the first to describe the vocalizations of H. laistriatus (Caramaschi & Cruz, 2004) from the type locality, Itatiaia National Park, Itamonte, Minas Gerais, and Campos do Jordão State Park (PECJ), São Paulo, both located in the Mantiqueira Mountains. In addition, the vocalizations of H. laistriatus were compared with the described vocalizations of the clade H. polytaenius species ... / Mestre

Orientador: Reginaldo José Donatelli / Banca: Manoel Dias Filho / Banca: Carolina Demetrio Ferreira / Resumo: Este trabalho teve como objetivo analisar e comparar as vocalizações entre indivíduos e subespécies de Thamnophilus doliatus de diferentes localizações da América Latina. Foram analisados 280 cantos de 140 indivíduos diferentes, e as variáveis levadas em consideração foram: número de notas, duração do trecho em sequência, taxa de notas por segundo, frequência de pico total do trecho, duração da nota terminal e frequência de pico da mesma. Os cantos também foram divididos em porções para se calcular a variação de velocidade e de tonalidade (frequência) ao longo dos trechos. As características do canto foram correlacionadas com dados geográficos como latitude, longitude e altitude a fim de se conferir se existe alguma padronização com a localização, e a amostra também foi agrupada em subespécies de acordo com suas localizações para comparações. As variáveis analisadas foram fortemente correlacionadas com a latitude, indicando que indivíduos de localização equatorial emitem cantos com mais notas, mais longos, mais rápidos e com uma nota terminal mais grave do que aqueles localizados ao sul da distribuição. As variáveis também foram correlacionadas com a longitude, incluindo também a frequência de pico. Foram identificadas sete subespécies de acordo com as localidades em que foram gravadas, porém apenas cinco foram utilizadas para comparações. Resultados mostraram uma separação das subespécies intermedius e radiatus pelas significativas diferenças no número de notas, duração do trecho, taxa de notas por segundo e frequência de pico. Também foram feitas comparações com a recém-separada espécie Thamnophilus capistratus, e só foram encontradas diferenças significativas na nota terminal e na variação de frequência ao longo do trecho. Devido às características do canto se mostrarem mais próximas entre diferentes espécies (T. doliatus e T. capistratus), que entre as subespécies de... / Abstract: The aim of this study was to analyze and to compare vocalizations of individuals of the species Thamnophilus doliatus from different locations of Latin America. 280 loudsongs from 140 individuals were analyzed and the variables taken into account were the following: number of notes, duration of the sequenced patch, note rate (notes per second), overall peak frequency, duration of the terminal note, and peak frequency of the terminal note. The loudsongs were also divided into portions in order to measure the variation of note rate (speed) and pitch (frequency) along the patch. The loudsong characteristics were correlated with geographic factors such as latitude, longitude and altitude to check if there is any acoustic pattern with the location. Also, the sample was clustered into subspecies for comparisons. The analyzed variables were strongly correlated with latitude, where individuals from equatorial locations had loudsongs with more notes, longer in duration, faster in note rate and a terminal note lower in peak frequency. The variables also appeared to be significantly correlated with longitude, including as well the overall peak frequency. Seven subspecies were identified according to their locations, however, only five of them were used for comparisons. Results showed a separation of the intermedius and radiatus subspecies due to their significant divergence in number of notes, patch duration, note rate and peak frequency. Comparisons with the recently separated species Thamnophilus capistratus were also made and no significant variation were found in the number of notes and total duration, but there were differences in note rate, overall peak frequency, peak frequency and duration of the terminal note. Because song characteristics between the different species (T. doliatus and T. capistratus) presented to be more similar than among the subspecies of T. doliatus, raises the question of the existence of more than one species within ... / Mestre

Orientador: Itamar Alves Martins / Banca: Rodrigo Lingnau / Banca: Thais Helena Condez / Resumo: Scinax perereca foi descrita originalmente no município de Ribeirão Branco, localizado na região sudoeste do Estado de São Paulo. Suas populações ocupam uma extensa distribuição geográfica, desde o sul do Estado de São Paulo ao norte do Rio Grande do Sul, no Brasil, em regiões florestadas de Mata Atlântica. Esta espécie é morfologicamente semelhante as espécies S. hayii e S. dolloi, dentre as quais exibem grandes conflitos taxonômicos. Informações de diversas naturezas, como morfologia, morfometria, bioacústica do canto de anúncio e sequencias moleculares, foram utilizadas para investigar a identidade taxonômica das populações de S. perereca. As análises de similaridades das sequencias moleculares do gene COI mostrou um clado monofilético bem suportado entre as três espécies. O clado S. perereca está fortemente estruturado por dois subclados principais: clado perereca A e clado perereca B. O clado perereca A agrupa as populações da localidade-tipo, Ribeirão Branco, SP, e as populações da região leste do Estado do Paraná. O clado perereca B inclui as populações de todo Estado de Santa Catarina e do norte do Rio Grande do Sul. As populações do Alto do Paranapanema, do Vale do Ribeira e do litoral norte do Estado de São Paulo mostram claramente estar mais próximas de S. hayii. S. perereca pode ser distinguida claramente de S. dolloi por meio das sequencias moleculares do COI e das informações bioacústicas do canto de anúncio. Talvez as populações identificadas como S. aff.... / Abstract: Scinax perereca was originally described in Ribeirão Branco city, located in the southwest region of São Paulo State in Brazil. Their populations occupy an extensive geographic distribution, from the South of São Paulo State to the North of Rio Grande do Sul, in Brazil, in forested regions of Atlantic Forest. This species is morphologically similar to S. hayii and S. dolloi species, among them there are great taxonomic conflicts. Information of various natures, such as morphology, morphometry, advertisement call, and molecular sequences, were used to assess the taxonomy of S. perereca population. The analysis of similarities of the molecular sequences of the gene COI showed a monophyletic clade well supported among the three species. The clade S. perereca is strongly structured by two major subclades: clade perereca A and clade perereca B. Clade perereca A puts the following population in a group locality-type: Ribeirão Branco, SP, and the populations of the Eastern region of Paraná State. Clade perereca B includes the populations of all Santa Catarina State and the North of Rio Grande do Sul. The populations of Alto do Paranapanema, Vale do Ribeira and the Northern coast of São Paulo clearly show to be closer to S. hayii. Scinax perereca can be clearly distinguished from S. dolloi through the molecular sequences of the COI and also by advertisement call. Maybe the populations identified as S. aff. perereca in the State of Minas Gerais may actually represent the geographic extension of S. dolloi populations. Morphological, morphometric and bioacoustics analyses of S. perereca corroborate the results of molecular analyses. The morphological, morphometric, advertisement call and molecular variations indicate that this species has a well-defined population structure throughout their distribution. In State of São Paulo, its geographical distribution is restricted to ... / Mestre

Made available in DSpace on 2015-08-20T17:10:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-03. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:26:02Z : No. of bitstreams: 1 000840982.pdf: 1252667 bytes, checksum: 7069bb98ea402999ba81d7d978408194 (MD5) / Este trabalho teve como objetivo analisar e comparar as vocalizações entre indivíduos e subespécies de Thamnophilus doliatus de diferentes localizações da América Latina. Foram analisados 280 cantos de 140 indivíduos diferentes, e as variáveis levadas em consideração foram: número de notas, duração do trecho em sequência, taxa de notas por segundo, frequência de pico total do trecho, duração da nota terminal e frequência de pico da mesma. Os cantos também foram divididos em porções para se calcular a variação de velocidade e de tonalidade (frequência) ao longo dos trechos. As características do canto foram correlacionadas com dados geográficos como latitude, longitude e altitude a fim de se conferir se existe alguma padronização com a localização, e a amostra também foi agrupada em subespécies de acordo com suas localizações para comparações. As variáveis analisadas foram fortemente correlacionadas com a latitude, indicando que indivíduos de localização equatorial emitem cantos com mais notas, mais longos, mais rápidos e com uma nota terminal mais grave do que aqueles localizados ao sul da distribuição. As variáveis também foram correlacionadas com a longitude, incluindo também a frequência de pico. Foram identificadas sete subespécies de acordo com as localidades em que foram gravadas, porém apenas cinco foram utilizadas para comparações. Resultados mostraram uma separação das subespécies intermedius e radiatus pelas significativas diferenças no número de notas, duração do trecho, taxa de notas por segundo e frequência de pico. Também foram feitas comparações com a recém-separada espécie Thamnophilus capistratus, e só foram encontradas diferenças significativas na nota terminal e na variação de frequência ao longo do trecho. Devido às características do canto se mostrarem mais próximas entre diferentes espécies (T. doliatus e T. capistratus), que entre as subespécies de... / The aim of this study was to analyze and to compare vocalizations of individuals of the species Thamnophilus doliatus from different locations of Latin America. 280 loudsongs from 140 individuals were analyzed and the variables taken into account were the following: number of notes, duration of the sequenced patch, note rate (notes per second), overall peak frequency, duration of the terminal note, and peak frequency of the terminal note. The loudsongs were also divided into portions in order to measure the variation of note rate (speed) and pitch (frequency) along the patch. The loudsong characteristics were correlated with geographic factors such as latitude, longitude and altitude to check if there is any acoustic pattern with the location. Also, the sample was clustered into subspecies for comparisons. The analyzed variables were strongly correlated with latitude, where individuals from equatorial locations had loudsongs with more notes, longer in duration, faster in note rate and a terminal note lower in peak frequency. The variables also appeared to be significantly correlated with longitude, including as well the overall peak frequency. Seven subspecies were identified according to their locations, however, only five of them were used for comparisons. Results showed a separation of the intermedius and radiatus subspecies due to their significant divergence in number of notes, patch duration, note rate and peak frequency. Comparisons with the recently separated species Thamnophilus capistratus were also made and no significant variation were found in the number of notes and total duration, but there were differences in note rate, overall peak frequency, peak frequency and duration of the terminal note. Because song characteristics between the different species (T. doliatus and T. capistratus) presented to be more similar than among the subspecies of T. doliatus, raises the question of the existence of more than one species within ...

CNPq / Os atuais métodos de classificação automática dos pássaros pelo canto apresentam lacunas que justificam um aprofundamento do estudo do tema. Entre estas lacunas, por exemplo, observa-se a necessidade da evolução da pesquisa para uma maior abrangência de espécies. Outra lacuna, que será o foco deste trabalho, é observada nas etapas iniciais dos processos de classificação automática em ambientes reais e práticos (e.g. habitat natural). Considerando-se que as etapas de coleta de amostras, pré-processamento, processamento e análise dos resultados estão presentes em um processo de classificação sonora de pássaros, observa-se uma carência de contribuições na etapa de coleta de amostras e, particularmente, na etapa de pré-processamento. Neste âmbito, as rotinas projetadas nos trabalhos científicos de classificação sonora são muitas vezes dependentes de uma amostra ideal, que por sua vez não são encontradas em um ambiente real. Ou seja, para obter respostas corretas e acertos na classificação, tais rotinas renecessitam de amostras filtradas e também de um escopo do ambiente previamente restrito. Com o objetivo de prover soluções para este conjunto de deficiências, foi proposta e materializada uma plataforma de coleta e processamento dos sons coletados,cobrindo as duas primeiras etapas de classificação automática. Em suma, este trabalho apresenta uma plataforma de aquisição e préprocessamento de cantos de pássaros. No trabalho também são discutidas vantagens e desvantagens das metodologias utilizadas, bem como são dissertados contextos pertinentes para aplicação da plataforma. As validações se dão por meio de testes práticos e comparações das amostras processadas pela plataforma, com amostras resultantes das ferramentas de processamento e análise sonora previamente existentes. / The current methods for birdsong automatic classification present gaps which justify a deeper study of the theme. Among these shortcomings, for example, there is the need for the development of research for a wider range of species. Another gap that will be the focus of this work, is observed in the initial stages of the process of automatic classification in real environments and practical (e. g. nature). Considering that the stages of sample collection, preprocessing, processing and analysis of results are present in a birdsong classification process, there is a deficiency of contributions in the stage of sample collection and, particularly, in the preprocessing step. In this context, the routines designed on the scientific papers of sound classification are often dependent on an ideal sample, which are not found in a real environment. That is, to achieve correct answers and successes in classification such routines require filtered samples and also a scope of environment previously restricted. With the objective of providing solutions to this set of deficiencies, it was proposed and implemented a platform for collecting and processing of sounds collected, covering the first two steps of automatic classification. In summary, this paper presents a platform for acquisition and preprocessing of bird songs. On paper are also discussed about the advantages and disadvantages of the methodologies used, as well as the contexts relevant to the application of the platform. The validation occurs through practical tests and comparisons between the samples processed by the platform, with samples arising from the previously existing tools of sound processing and analysis.

CNPq / Os atuais métodos de classificação automática dos pássaros pelo canto apresentam lacunas que justificam um aprofundamento do estudo do tema. Entre estas lacunas, por exemplo, observa-se a necessidade da evolução da pesquisa para uma maior abrangência de espécies. Outra lacuna, que será o foco deste trabalho, é observada nas etapas iniciais dos processos de classificação automática em ambientes reais e práticos (e.g. habitat natural). Considerando-se que as etapas de coleta de amostras, pré-processamento, processamento e análise dos resultados estão presentes em um processo de classificação sonora de pássaros, observa-se uma carência de contribuições na etapa de coleta de amostras e, particularmente, na etapa de pré-processamento. Neste âmbito, as rotinas projetadas nos trabalhos científicos de classificação sonora são muitas vezes dependentes de uma amostra ideal, que por sua vez não são encontradas em um ambiente real. Ou seja, para obter respostas corretas e acertos na classificação, tais rotinas renecessitam de amostras filtradas e também de um escopo do ambiente previamente restrito. Com o objetivo de prover soluções para este conjunto de deficiências, foi proposta e materializada uma plataforma de coleta e processamento dos sons coletados,cobrindo as duas primeiras etapas de classificação automática. Em suma, este trabalho apresenta uma plataforma de aquisição e préprocessamento de cantos de pássaros. No trabalho também são discutidas vantagens e desvantagens das metodologias utilizadas, bem como são dissertados contextos pertinentes para aplicação da plataforma. As validações se dão por meio de testes práticos e comparações das amostras processadas pela plataforma, com amostras resultantes das ferramentas de processamento e análise sonora previamente existentes. / The current methods for birdsong automatic classification present gaps which justify a deeper study of the theme. Among these shortcomings, for example, there is the need for the development of research for a wider range of species. Another gap that will be the focus of this work, is observed in the initial stages of the process of automatic classification in real environments and practical (e. g. nature). Considering that the stages of sample collection, preprocessing, processing and analysis of results are present in a birdsong classification process, there is a deficiency of contributions in the stage of sample collection and, particularly, in the preprocessing step. In this context, the routines designed on the scientific papers of sound classification are often dependent on an ideal sample, which are not found in a real environment. That is, to achieve correct answers and successes in classification such routines require filtered samples and also a scope of environment previously restricted. With the objective of providing solutions to this set of deficiencies, it was proposed and implemented a platform for collecting and processing of sounds collected, covering the first two steps of automatic classification. In summary, this paper presents a platform for acquisition and preprocessing of bird songs. On paper are also discussed about the advantages and disadvantages of the methodologies used, as well as the contexts relevant to the application of the platform. The validation occurs through practical tests and comparisons between the samples processed by the platform, with samples arising from the previously existing tools of sound processing and analysis.

Cada capítulo da tese apresenta resumo e abstract. O resumo que segue é referente ao primeiro capítulo / Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Luís Olímpio Menta Giasson / Banca: Cynthia Peralta de Almeida Prado / Resumo: Vocalizações são muito importantes para atração de fêmeas e delimitação de territórios em anuros de reprodução prolongada. Machos de Hypsiboas prasinus apresentam atividade de vocalização noturna ao longo de todo o ciclo anual na Serra do Japi, utilizando principalmente a vegetação marginal arbustiva e herbácea como sítios de vocalização. O padrão de atividade de vocalização dessa espécie foi acompanhado em um ciclo de 12 meses, de julho de 2011 a junho de 2012 e foram feitas gravações de suas vocalizações para análise bioacústica. Aqui são apresentados os parâmetros físicos de quatro das cinco vocalizações identificadas para esta espécie, sendo uma nota de anúncio introdutória (nota A), uma nota de anúncio utilizada em atividade de coro (nota B), uma nota de anúncio utilizada para retomada da atividade de vocalização (nota C) e uma nota agonística (nota D). Foi encontrada uma concentração de atividade de vocalização no mês de julho e não foi encontrada correlação significativa entre temperatura do ar e atividade de vocalização, sugerindo uma regulação da atividade baseada em interações comportamentais e não em limitações fisiológicas, conforme verificado por outros autores. Foi observado que alguns indivíduos passam a vocalizar a partir da superfície da água durante a estação fria e seca e aqui são discutidas as prováveis vantagens deste comportamento / Abstract: Vocalizations have great importance for female attraction and territory delimitation in prolonged breeding anurans. Males of Hypsiboas prasinus present a year-round nocturnal calling activity, using mainly marginal herbaceous and bushy vegetation as calling sites. The temporal pattern of calling activity was monitored for a twelve-month period, from July 2011 to June 2012 and vocalizations were recorded for bioacoustics analysis. Herein are shown physical parameters for four of the five types of vocalizations found in this species, being one introductory advertisement call (note A), one chorus advertisement call (note B), one resuming activity advertisement call (note C) and one agonistic call (note D). A significant activity concentration was found in July and there was no significant correlation between air temperature and calling activity, suggesting a behaviorally-controlled calling pattern instead of a physiologically-controlled one, as observed by previous authors. During the cold dry season, some individuals were observed to shift their calling sites to the water surface and the plausible advantages of such behavior are discussed / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-04-02Bitstream added on 2014-06-13T20:40:02Z : No. of bitstreams: 1 delgado_db_me_rcla.pdf: 856081 bytes, checksum: 0cd12b17e339c0315e379d1312fe09c7 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Vocalizações são muito importantes para atração de fêmeas e delimitação de territórios em anuros de reprodução prolongada. Machos de Hypsiboas prasinus apresentam atividade de vocalização noturna ao longo de todo o ciclo anual na Serra do Japi, utilizando principalmente a vegetação marginal arbustiva e herbácea como sítios de vocalização. O padrão de atividade de vocalização dessa espécie foi acompanhado em um ciclo de 12 meses, de julho de 2011 a junho de 2012 e foram feitas gravações de suas vocalizações para análise bioacústica. Aqui são apresentados os parâmetros físicos de quatro das cinco vocalizações identificadas para esta espécie, sendo uma nota de anúncio introdutória (nota A), uma nota de anúncio utilizada em atividade de coro (nota B), uma nota de anúncio utilizada para retomada da atividade de vocalização (nota C) e uma nota agonística (nota D). Foi encontrada uma concentração de atividade de vocalização no mês de julho e não foi encontrada correlação significativa entre temperatura do ar e atividade de vocalização, sugerindo uma regulação da atividade baseada em interações comportamentais e não em limitações fisiológicas, conforme verificado por outros autores. Foi observado que alguns indivíduos passam a vocalizar a partir da superfície da água durante a estação fria e seca e aqui são discutidas as prováveis vantagens deste comportamento / Vocalizations have great importance for female attraction and territory delimitation in prolonged breeding anurans. Males of Hypsiboas prasinus present a year-round nocturnal calling activity, using mainly marginal herbaceous and bushy vegetation as calling sites. The temporal pattern of calling activity was monitored for a twelve-month period, from July 2011 to June 2012 and vocalizations were recorded for bioacoustics analysis. Herein are shown physical parameters for four of the five types of vocalizations found in this species, being one introductory advertisement call (note A), one chorus advertisement call (note B), one resuming activity advertisement call (note C) and one agonistic call (note D). A significant activity concentration was found in July and there was no significant correlation between air temperature and calling activity, suggesting a behaviorally-controlled calling pattern instead of a physiologically-controlled one, as observed by previous authors. During the cold dry season, some individuals were observed to shift their calling sites to the water surface and the plausible advantages of such behavior are discussed