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Caracterização da anisotropia na permissividade complexa em compósitos de fibra de carbono.Francisco Eduardo de Carvalho 22 December 2009 (has links)
A caracterização da anisotropia na permissividade relativa complexa do Compósito de Fibra de Carbono (CFC) tornou-se importante para avaliar os efeitos diretos e indiretos causados por impacto de raio em aeronaves construídas com esse material. Esta importância está associada à relação que existe entre a blindagem eletromagnética utilizada para proteger os equipamentos de bordo e a permissividade do CFC. Devido a estas relações e sua relevância para a indústria aeronáutica, foi realizada uma extensa investigação da permissividade do CFC. Foram medidas as partes real e imaginária (e' e e") da permissividade na faixa de freqüência de 1 kHz a 10 MHz, a 25C, a partir de amostras cilíndricas extraídas de uma mesma placa multicamadas de CFC, com seus eixos ortogonais entre si e paralelos aos eixos cartesianos. Os resultados destas medidas foram compilados em uma base de dados para serem utilizados em um software de simulação baseado no Método das Diferenças Finitas no Domínio do Tempo (FDTD). Como resultado, foi possível representar em três eixos o campo próximo e a intensidade da energia eletromagnética a que pode ser submetida uma estrutura de CFC com geometria arbitrária no espaço tridimensional de uma placa de CFC do material iluminada pela componente elétrica. Além disso, foi observada a anisotropia entre os planos YZ e YX, apontando que a maior anisotropia ocorre na direção do eixo Y. O material analisado apresentou baixas perdas, com e" tendendo assintoticamente a zero.
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Mecanismos do processo de dobramento contínuo por rolos.Anselmo Monteiro Ilkiu 00 December 2000 (has links)
O presente trabalho apresenta um modelo matemático para o processo de dobramento contínuo por rolos em chapas metálicas. Para a análise do modelo proposto assume-se a região elastoplástica que, durante o processo, apresenta uma geometria não regular que é considerada, aproximadamente, constante do desenvolvimento do presente trabalho. Considera-se parâmetros importantes no desenvolvimento do modelo proposto, para o processo de dobramento contínuo por rolos, sendo os seguintes: a recuperação elástica da chapa após o processo de conformação; as forças principais do processo e a potência de acionamento. Esses parâmetros são determinados em função das propriedades mecânicas e geométricas de chapa metálica, da geometria da máquina para a execução do processo e dos parâmetros de anisotropia do material que, junto com os parâmetros de atrito entre o rolo e a superfície da chapa metálica, são condições necessárias para o desenvolvimento da presente teoria. No presente trabalho verifica-se, experimentalmente, a performance de vários materiais para diferentes condições de processo e espessuras de chapas. Os materiais analisados são os seguintes: aço inoxidável, cobre, ligas de alumínio e latão. Compara-se os resultados experimentais, obtidos para o processo de dobramento contínuo executado em duas máquinas, e os resultados obtidos por diferentes teorias desenvolvidas por pesquisadores da área de conformação, com os resultados obtidos pela presente teoria. Outros parâmetros relevantes ao processo são apresentados e discutidos durante o desenvolvimento do presente trabalho.
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Comportamento tensão-deformação de dois horizontes de um solo residual de gnaisse / Stress-strain behavior of two horizons of a residual soil from gneissReis, Rodrigo Martins 06 August 2004 (has links)
Neste trabalho estuda-se o comportamento tensão-deformação de dois horizontes de um solo residual de gnaisse, pertencentes a um perfil típico da cidade de Viçosa-Minas Gerais, na condição saturada e sob diferentes valores de sucção. O estudo apóia-se em ensaios de caracterização física e mineralógica, em ensaios destinados às análises porosimétricas e morfológicas (lâminas delgadas), e em ensaios de compressão triaxial realizados em corpos de prova não saturados e saturados, estes sujeitos a diferentes direções de cisalhamento, em ambos solos, e distintas trajetórias de tensão, no solo jovem. Nos ensaios triaxiais saturados mostra-se que a resistência dos dois solos foi independente da direção de cisalhamento e que a deformabilidade revelou-se mais anisotrópica no solo maduro, que no solo jovem, este visualmente mais heterogêneo. Mostra-se, que o intercepto de coesão cresce com a sucção numa relação que pode ser bem representada por uma função hiperbólica e que o ângulo de atrito interno praticamente não apresentou variação com a sucção matricial. Apresenta-se uma alternativa de previsão da envoltória de resistência, baseada nos parâmetros de resistência do solo saturado e nos resultados de ensaio correspondente a uma sucção conhecida. A curva de plastificação do solo jovem pôde ser representada razoavelmente bem pela curva adotada nos modelos derivados da mecânica dos solos dos estados críticos (Cam-Clay modificado). A curva é centrada no eixo hidrostático e sua forma não apresenta mudança marcante durante o encruamento do solo, o qual foi obtido através da união de pontos com o mesmo trabalho plástico. / This thesis deals with the stress-strain behavior of a mature soil and a young soil from a typical residual soil of gneiss, as found in Viçosa-MG. This behavior is analyzed under saturated and non saturated conditions. The study rests on physical and mineralogical characterization tests, on porosimetric and morphological analyses (thin section) and on triaxial compression tests performed with saturated and non saturated soil. Saturated young and mature specimens were sheared according to different directions and saturated young soil was also sheared following various stress path. It is shown that the shear strength of saturated soil, both mature and young is independent of shearing direction. However, the visually more homogeneous mature soil showed to be more anisotropic, regarding the deformability, than the young residual soil that visually seems to be heterogeneous. The cohesion intercept tends to increase with soil suction according to a non linear relationship that can be adjusted through a hyperbolic function, while the angle of shearing stress was not influenced by soil suction. An alternative to forecast unsaturated shear strength envelope based on results of saturated soil and on tests performed at a known suction is also presented. The yielding curve of young soil was found to be fairly predicted using modified Cam-Clay model. The yield curve is centered along the hydrostatic axis of stress and its shape didnt change during soil strain hardening that was obtained by joining the points to that exhibited the same plastic work.
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Correspondência histológica de parâmetros de imagens de tensores de difusão / Correspondence of histological parameters from diffusion tensor imagesSilva, Rafael Emidio da 30 June 2014 (has links)
INTRODUÇÃO: Imagens por tensores de difusão (diffusion tensor imaging - DTI) do cérebro são parte fundamental de exames de ressonância magnética (RM) na rotina clínica. Entretanto, não há informação científica suficiente para inferir a base histológica de parâmetros de imagens de DTI. Um dos achados frequentes nos exames de RM são as áreas de alteração de sinal na substância branca (AASSB). Neste estudo, analisamos imagens de RM post-mortem, em particular as AASSB, e seus correlatos histológicos e imuno-histoquímicos. OBJETIVOS: Descrever os parâmetros quantitativos de imagens de DTI imagens obtidas in cranio post-mortem, comparar com parâmetros de relaxometria e transferência de magnetização e avaliar seus correlatos histológicos nas AASSB e AHAN, utilizando técnicas de correspondência espacial ponto-a-ponto. MÉTODOS: Analisamos áreas distribuídas na substância branca de encéfalos de quatro sujeitos submetidos ao exame de RM post-mortem, aproximadamente 12,87 horas (±2,59). A RM foi realizada em sistema com campo de 3,0 T, sendo utilizadas imagens FLAIR; T2 multi-eco, DTI, Densidade de Prótons para cálculo da taxa de transferência de magnetização (magnetization transfer ratio - MTR). Foram delimitadas regiões de interesse (ROI) em 20 áreas contendo AASSB e 20 áreas homólogas aparentemente normais (AHAN). Para cada área, foram obtidos valores de anisotropia fracional (FA), coeficiente de difusão aparente (ADC), MTR e tempo T2. Os encéfalos foram seccionados em fatias de 0,4mm e fotografados em alta resolução. Estas imagens foram co-registradas tridimensionalmente com as imagens de RM, utilizando técnica semi-automatizada para correlação ponto-a-ponto. Os fragmentos analisados foram corados por hematoxilina-eosina (HE), Kluverx Barrera (KB), galocianina (GALL), anti-neurofilamento (anti-NF), antiproteína básica de mielina (anti-MBP) e anti-proteína ácida fibrilar glial (anti- GFAP). RESULTADOS: Os valores de FA foram 0,40 ±0,12 nas AASSB, e 0,52±0,15 nas AHAN. Os valores de ADC foram nas AASSB de 0,129±0,04 x 10-3mm2/s, e 0,108±0,03 x10-3mm2/s nas AHAN. Os valores de MTR foram 51,59±0,88 % nas AASSB, e 52,88±4,09 % nas AHAN. Os valores de RT2 foram 91,79±1,95 % nas AASSB, e 69,94±4,54 % nas AHAN. Os valores de HE foram 162,9±20,0 nas AASSB, e 163,3±20,4 nas AHAN. Os valores de GALL foram de 181,8±4,36 nas AASSB, e 167,11±20,65 nas AHAN. Os valores de KB foram de 168,9±19,08 nas AASSB, e 182.82±20,65 nas AHAN. Os valores de NF médios mensurados foram de 131,6±12,23 nas AASSB, e 128,03±4,74 nas AHAN. Os valores de MBP médios mensurados foram de 153,9 ±13,67 nas AASSB, e 153,18±12,69 nas AHAN. Os valores de GFAP médios mensurados foram de 94.61±7,85 nas AASSB, e 81,23±6,29 nas AHAN. Os testes não paramétricos de correlação (Spearman) entre variáveis de imagens de RM e histologia apresentaram correlação apenas entre FA e GFAP (r=-0,59; p < 0,005). DISCUSSÃO E CONCLUSÕES: De acordo com os resultados obtidos, podemos inferir que a presença de gliose é um processo patológico que pode ser detectado utilizando os parâmetros de FA nas imagens de DTI. Os resultados apresentados demonstram que imagens de RM adquiridas post-mortem podem servir para compreender melhor as alterações estruturais do tecido cerebral / BACKGROUND: Diffusion tensor imaging (DTI) is part of magnetic resonance imaging (MRI) acquisition methods available in clinical exams. However, there are not enough scientific basis to infer the histological substract of DTI parameters. White matter hyperintensities (WMH) are frequent findings in clinical MRI routine. In the last years, scientific evidences show that these injuries are not just age-related benign changes, but they could be associated to pathological processes. In this study we analyzed post-mortem MRI DTI data, specifically investigating WMH, their histological and immunohistochemical correlates. OBJECTIVES : At present study, we aimed to analyze quantifiable DTI parameters - Fractional Anisotropy (FA) and Apparent Diffusion Coefficient (ADC) - relaxometry (RT2) and magnetization transfer ratio (MTR) in WMH compared and normal appearing white matter (NAWM) from images obtained postmortem and in situ, and assess their histological substracts at WMH and NAWM using a point-topoint correlation platform. METHODS : We analyzed 20 regions of interest (ROI) encompassing WMH and NAWM selected from four subjects using in situ post-mortem MRI data acquired in 3.0T MR system. The subjects were scanned with a post-mortem interval of approximately 12h54m (±2h36m). The MRI analysis included 3D T1, FLAIR; multi-echo T2, DTI, and proton density to calculate the rate of magnetization transfer (magnetization transfer ratio - MTR). In each ROI we obtained measures of FA, ADC, RT2 and MTR. Brain specimens were posteriorly fixed in celloidin, sectioned into 0.4mm slices and photographed in high resolution. These images were co-registered with three-dimensional MR images using semi-automated technique for correlation using a point-to-point method established in our group. WMH and NAWM ROIs from MRI were submitted to quantitative histological analysis based on optical density color-deconvolution technique. Histological section were stained in hematoxylin-eosin (HE) , Kluver-Barrera (KB) , galloccyanin (GALL), anti-neurofilament (anti-NF) , anti-basic myelin protein (anti-MBP) and anti-glial fibrillary acidic protein (anti-GFAP). RESULTS: The mean FA values were 0.40±0.12 in WMH, and 0.52±0.15 in NAWM. ADC in WMH was 0.1290±0.04, x10-3mm2/s and 0.1081± 0.03 x10-3mm2/s in NAWM. MTR was 51.59± 0.88% in WMH, and 52.88±4.09% in NAWM. RT2 was 91.79±1.95% in WMH, and 69.94±4.54% in NAWM. FA, ADC and RT2 values were different between WMH and NAWM in a non-parametric analysis. On the quantitative histological analysis, the HE was 162.9±20.0 in WMH , and 163.3±20.4% in NAWM. GALL values at WMH was 181.8±4.36 and 167.11±20.65 at NAWM. KB was 168.9±19.08 in WMH, and 182.82±20.65 at NAWM. NF mean were 131.6 ±12.23 in WMH, and 128.03 ±14.74 at NAWM. MBP was 153.9±13.67 at WMH, and 153.18±12.69 at NAWM. Only GFAP values were different between WMH and NAWM. Mean GFAP was 94.61±7.85 in WMH, and 81.23±6.29 at NAWM. Non-parametric test (Spearman) between MR images and histology, showed correlation only for FA vs GFAP (r=-0.594, p < 0.005). DISCUSSION AND CONCLUSIONS: DTI FA and ADC parameters (and RT2 values) showed different patterns in WMH compared to NAWM, indicating that MR images acquired post-mortem may serve to understand the structural changes of the brain tissue. The presence of gliosis is a pathological process seems to be related to FA value from DTI
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Estudo do fenômeno da auto-intersecção em um anel anisotrópico / Study of the self-intersection anomaly in an anisotropic ringGarcía Sánchez, Jesús Antonio 17 November 2008 (has links)
Estuda-se numericamente uma placa circular homogênea com furo centrado sob estado plano de deformação. A placa está fixa ao longo do contorno interno e está sob compressão radial uniforme ao longo do contorno externo. O material da placa é elástico-linear e anisotrópico. Apresenta-se a solução analítica do problema, a qual satisfaz as equações governantes de equilíbrio, no contexto da elasticidade linear clássica. Esta solução prediz o comportamento espúrio da auto-intersecção em uma região central da placa. Para evitar este comportamento, utiliza-se uma teoria que propõe encontrar um campo de deslocamento que minimize a energia potencial total do corpo sujeito à restrição de injetividade local para o campo da deformação correspondente. Esta teoria, juntamente com o método das penalidades interiores, permite encontrar uma solução numérica que preserva a injetividade. Esta solução corresponde a um campo de deslocamento radialmente simétrico. Estuda-se a possibilidade de encontrar uma solução rotacionalmente simétrica do problema restrito, em que o campo de deslocamento possua as componentes radial e tangencial, ambas funções somente do raio. Os resultados desta última modelagem mostram que a componente tangencial é nula, indicando que o campo de deslocamento é, de fato, radialmente simétrico. Mostra-se também que a solução do problema do anel converge para a solução do problema de um disco sem furo à medida que o raio do furo tende a zero. / This work concerns a numerical study of a homogeneous circular plate with a centered hole that is under a state of plane strain. The plate is fixed at its inner surface and is under uniform radial compression at its outer surface. The plate is linear, elastic, and anisotropic. An analytical solution for this problem, which satisfies the governing equations of equilibrium, is presented in the context of classical linear elasticity. This solution predicts the spurious behavior of self-intersection in a central region of the plate. To avoid this behavior, a constrained minimization theory is used. This theory concerns the search for a displacement field that minimizes the total potential energy of the body, which is a quadratic functional from the classical linear theory, subjected to the constraint of local injectivity for the associated deformation field. This theory together with an interior penalty method and a standard finite element methodology yield a numerical solution, which is radially symmetric, that preserves injectivity. Here, it is investigated the possibility of finding a rotationally symmetric solution to the constrained problem; one for which the associated displacement field has radial and tangential components, which are both functions of the radius only. The numerical results show, however, that the tangential component is zero. It is also shown that, as the radius of the hole tends to zero, the corresponding sequence of solutions tends to the solution of a solid disk.
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MÃtodo de Monte Carlo para o estudo de Sistemas MagnÃticos Bidimensionais. / Monte Carlo Method for the Study of two-dimensional Magnetic SystemsGeorge Frederick Tavares da Silva 20 June 2008 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / Employing the Monte Carlo Method,
studied is two-dimensional magnetic systems.
The phase transition that occurs in Ising model was also investigated for
the two-dimensional XY model, or also called 2D XY in the literature.
There is this model
an unusual transition type Kosterlitz-Thouless-Berezinskii, involving
vortices of spins which unbinding
in a temperature T_{KT}. However, you can see the transition without
the presence of vortices for small systems as was done in this work.
The implementation of the method cited in the two models will be detailed
and then used in the study of magnetic bylayers systems
characterized by the existence of planning ferromagnetic (FM) and antiferromagnetic (AFM). They will be then reproduced through simulations,
curves of magnetization in relation to the magnetic field, with the goal of
find the conditions in which the phenomenon known as
Exchange Bias occurs. This is because the existence of an
interface FM-AFM, which will be the focus of research. / Empregando o MÃtodo de Monte Carlo,
estudamos sistemas magnÃticos bidimensionais.
A transiÃÃo de fase, que ocorre no modelo de Ising, foi tambÃm investigada para
o modelo XY bidimensional, ou geralmente chamado na literatura de 2D
XY. Observa-se neste modelo
uma transiÃÃo nÃo-usual do tipo Kosterlitz-Thouless-Berezinskii, envolvendo
vÃrtices de spins que se descorrelacionam em uma temperatura T_{KT}. Contudo, pode-se observar a transiÃÃo sem
a presenÃa de vÃrtices para sistemas pequenos como foi feito neste trabalho.
A implementaÃÃo do mÃtodo nos dois modelos citados serà detalhada
e posteriormente utilizada no estudo de sistemas com bicamadas magnÃticas
caracterizados pela existÃncia de ordenamento ferromagnÃtico (FM) e antiferromagnÃtico (AFM). SerÃo entÃo reproduzidas, atravÃs das simulaÃÃes,
curvas de magnetizaÃÃo em relaÃÃo ao campo magnÃtico com o objetivo de
encontrar as condiÃÃes nas quais o fenÃmeno conhecido como
exchange bias ocorre. Este deve-se a existÃncia de uma interface FM-AFM, que serà o foco nas investigaÃÃes.
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Comportamento tensão-deformação de dois horizontes de um solo residual de gnaisse / Stress-strain behavior of two horizons of a residual soil from gneissRodrigo Martins Reis 06 August 2004 (has links)
Neste trabalho estuda-se o comportamento tensão-deformação de dois horizontes de um solo residual de gnaisse, pertencentes a um perfil típico da cidade de Viçosa-Minas Gerais, na condição saturada e sob diferentes valores de sucção. O estudo apóia-se em ensaios de caracterização física e mineralógica, em ensaios destinados às análises porosimétricas e morfológicas (lâminas delgadas), e em ensaios de compressão triaxial realizados em corpos de prova não saturados e saturados, estes sujeitos a diferentes direções de cisalhamento, em ambos solos, e distintas trajetórias de tensão, no solo jovem. Nos ensaios triaxiais saturados mostra-se que a resistência dos dois solos foi independente da direção de cisalhamento e que a deformabilidade revelou-se mais anisotrópica no solo maduro, que no solo jovem, este visualmente mais heterogêneo. Mostra-se, que o intercepto de coesão cresce com a sucção numa relação que pode ser bem representada por uma função hiperbólica e que o ângulo de atrito interno praticamente não apresentou variação com a sucção matricial. Apresenta-se uma alternativa de previsão da envoltória de resistência, baseada nos parâmetros de resistência do solo saturado e nos resultados de ensaio correspondente a uma sucção conhecida. A curva de plastificação do solo jovem pôde ser representada razoavelmente bem pela curva adotada nos modelos derivados da mecânica dos solos dos estados críticos (Cam-Clay modificado). A curva é centrada no eixo hidrostático e sua forma não apresenta mudança marcante durante o encruamento do solo, o qual foi obtido através da união de pontos com o mesmo trabalho plástico. / This thesis deals with the stress-strain behavior of a mature soil and a young soil from a typical residual soil of gneiss, as found in Viçosa-MG. This behavior is analyzed under saturated and non saturated conditions. The study rests on physical and mineralogical characterization tests, on porosimetric and morphological analyses (thin section) and on triaxial compression tests performed with saturated and non saturated soil. Saturated young and mature specimens were sheared according to different directions and saturated young soil was also sheared following various stress path. It is shown that the shear strength of saturated soil, both mature and young is independent of shearing direction. However, the visually more homogeneous mature soil showed to be more anisotropic, regarding the deformability, than the young residual soil that visually seems to be heterogeneous. The cohesion intercept tends to increase with soil suction according to a non linear relationship that can be adjusted through a hyperbolic function, while the angle of shearing stress was not influenced by soil suction. An alternative to forecast unsaturated shear strength envelope based on results of saturated soil and on tests performed at a known suction is also presented. The yielding curve of young soil was found to be fairly predicted using modified Cam-Clay model. The yield curve is centered along the hydrostatic axis of stress and its shape didnt change during soil strain hardening that was obtained by joining the points to that exhibited the same plastic work.
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Modelagem 1D e 2,5D de dados do método CSEM marinho em meios com anisotropia transversal inclinadaSANTOS, Walleson Gomes dos 28 February 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / INCT/GP - Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Geofísica do Petróleo / Neste trabalho apresentamos a solução do campo eletromagnético gerado por um dipolo elétrico horizontal em meios transversalmente isotrópicos com eixo de simetria vertical (TIV) e com eixo de simetria inclinado (TII). Para modelos unidimensionais, o campo eletromagnético foi obtido por duas metodologias distintas: (1) solução semi-analítica das equações de Maxwell com auxílio de potenciais vetores no caso TIV e (2) em modelos com anisotropia transversal inclinada o campo eletromagnético foi separado em primário e secundário, e então, o campo secundário foi calculado pelo método de elementos finitos no domínio (kx, ky, z) da transformada de Fourier. Para estruturas bidimensionais, foi aplicada a mesma metodologia usado nos modelos TII unidimensionais, onde o campo secundário foi calculado pelo método de elementos finitos no domínio (x, ky, z), da transformada de Fourier, com a utilização de malhas não estruturadas para discretização dos modelos. Estas respostas foram usados para avaliar os efeitos da anisotropia elétrica nos dados CSEM marinho 1D e 2,5D. / In this work I present the solution to the electromagnetic field generated by a horizontal electric dipole in transversally isotropic media with vertical (TIV) as well as inclined (TII) symmetry axis. In one-dimensional models the electromagnetic field was obtained with two distinct methods: (1) For the TIV case, I have written a semi-analytical solution to the Maxwell’s equations, by using a vector potential formulation; (2) For the TII case, the field was represented as the composition of primary and secondary fields, where primary fields are those found in an underlying isotropic layered medium, and the secondary field is calculated numerically via the finite element method in the spatial Fourier transform domain (kx, ky, z). This last methodology was also used to calculate the fields in two-dimensional structures, including inclined anisotropy in any region of the models. In this 2,5D case, I have applied the finite element method in the (x, ky, z) do main. Here I have used unstructured meshes to discretise the media, and parallel programming to solve the linear systems of equations. The responses were used to study the effects of electrical anisotropy in marine CSEM data.
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Modelagem de dados MT 2D em multicamadas com anisotropia arbitráriaCOSTA, Marcus Danilo Ferreira Borges da 19 December 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Neste trabalho apresentamos a modelagem direta bidimensional do método Magnetotelúrico (MT) com anisotropia arbitrária na condutividade elétrica para modelos de multicamadas estratificadas horizontalmente, separando a resposta do campo resultante em duas partes, primária e secundária. A parte primária refere-se ao campo 1D do modelo na ausência de heterogeneidades; a secundária, à contribuição no campo resultante gerada pela anomalia. Esta modelagem foi feita via técnica numérica dos Elementos Finitos (EF). Apresentamos também a modelagem direta do caso MT 1D para o mesmo modelo e anisotropia arbitrária, porém, com solução analítica pelo método da matriz de propagação; tal resultado é usado como fonte na formulação 2D. No estudo a respeito do comportamento dos campos 1D em profundidade na presença da anisotropia, verificamos nas componentes horizontais que suas curvas dentro de cada camada se assemelham a de um campo na presença de fontes, pois experimentam um aumento na amplitude; além de verificar o surgimento da componente normal Ez do campo, sem que haja uma densidade de corrente nesta direção. Com arbitrariedade na anisotropia queremos dizer que seus eixos principais podem assumir qualquer orientação em relação ao eixo de referência adotado para o problema; tal orientação é descrita sob três rotações consecutivas, chamadas de strike, dip e slant, que simulam inclinações bastante presentes na geologia dos ambientes terrestres. Verificamos que a anisotropia provoca alterações no comportamento das pseudo-seções de resistividades aparentes, interferindo na interpretação correta dos dados. / We present in this work the bidimensional Magnetotelluric method modelling with arbitrary anisotropy in the electrical conductivity for horizontally stratified multilayers models,
separating the total field into primary and secondary fields. The primary field is the 1D
MT field in the absence of heterogeneity. The secondary field is the field generated by the
heterogeneity, in other words, it is the difference between the total field and the primary
field. The numerical technique of Finite Elements (FE) is used for this 2D Modelling. In
addition we include the MT 1D modelling case with arbitrary 3D conductivity anistropy
using the propagation matrix method. This result is used as the source in the bidimensional
formulation. When we studied the horizontal fields in layered media; there seems to exist
sources in each anisotropic layer, because there is an increase of amplitude in these layers,
also we verify the appearence of the normal component Ez of the field, without a current
density in this direction. The arbitrary anisotropy allows the principals anisotropic axes
to have any orientation in relation to cartesian referencial system choosen for the problem.
This orientation is defined by three consecutive rotations, the first being strike, the second
dip and the third slant. These rotations simulate common geological environments in the
earth. This type of anisotropy changes the pseudo-sections of apparent resistivity, making
data interpretation more challenging.
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Mobilidade da hélice 12 de receptores nucleares: comparação entre simulações de dinâmica molecular e experimentos de anisotropia de fluorescência / Nucler receptor\'s helix 12 mobility: comparison between molecular dynamics simulations and fluorescence anisotropy experimentsBatista, Mariana Raquel Bunoro 15 February 2013 (has links)
Receptores nucleares formam uma superfamília de proteínas responsáveis pela regulação da expressão de genes. Estruturalmente, são formados por três domínios: um domínio N-terminal bastante variável, um domínio altamente conservado de ligação com o DNA e um domínio C-terminal, menos conservado, denominado domínio de ligação com o ligante (LDB). Diversos experimentos mostram que a interação com o ligante afeta a estrutura e a mobilidade da hélice C-terminal dos receptores nucleares (hélice 12 do domínio de ligação com o ligante), sendo o principal mecanismo de ativação e repressão da transcrição. As primeiras estruturas de LBDs de receptores nucleares revelaram importantes diferenças entre estruturas contendo ligantes (holo) e estruturas apo, principalmente no que diz respeito a posição da hélice 12: em estruturas apo, foi observada a H12 em uma conformação aberta, expondo o sítio de ligação com o ligante, enquanto que em estruturas holo, foi observada a H12 em uma conformação fechada, dobrada sobre o corpo do LBD e envolvendo completamente o ligante. Essa diferença sugeriu um mecanismo para a entrada e saída de ligantes do sítio de ligação denominado modelo da ratoeira, entretanto, esse modelo apresenta diversas inconsistências e tem sido desacreditado. Estudos experimentais e teóricos recentes mostram que a hélice 12 é mais móvel na ausência de ligantes, entretanto, esses estudos não fornecem evidencias de que o aumento da mobilidade da está associado com o deslocamento da H12 em relação ao corpo do LBD, como sugerido pelo modelo da ratoeira. Embora esteja claro que a hélice 12 é mais móvel na ausência de ligantes, a dimensão da variação conformacional sofrida pela hélice 12 ainda não está clara. Nesse trabalho buscamos a construção de um modelo capaz de dimensionar a mobilidade da hélice 12 através da comparação direta entre simulações de dinâmica molecular e experimentos de anisotropia de fluorescência resolvida no tempo. Utilizando simulações de dinâmica molecular reproduzimos experimentos de anisotropia de fluorescência acoplando a sonda cys-flúor a hélice 12 do PPARγ para estudar sua mobilidade. Mostramos que as observações experimentais só podem ser explicadas por conformações onde a sonda fluorescente permanece presa a superfície do LBD. Foi mostrado também que curvas de anisotropia com decaimentos comparáveis com os decaimentos experimentais estão associados a pequenas variações conformacionais de hélice 12. Simulações para dois modelos de apo-PPARγ com a H12 aberta em relação ao corpo do LBD e para as estruturas cristalográficas de apo-RXR e apo-ER, onde a H12 também adota uma conformação aberta, revelaram curvas de anisotropia com decaimentos mais rápidos que os experimentais. Esses resultados implicam em um modelo onde a H12 sofre alterações conformacionais locais, não apresentando variações tão dramáticas como o proposto pelo modelo da ratoeira. / Nuclear Hormone Receptors comprise a protein superfamily responsible for regulation of gene expression. Structurally, they are composed by three domains: a variable N-terminal domain, a highly conserved DNA-binding domain (DBD), and a less conserved C-terminal domain, known as ligand binding domain (LBD). Many experiments have shown that the interaction with ligands affects the structure and the mobility of nuclear receptors C-terminal helix (LBDs Helix 12), being the main mechanism of transcription activation and repression. The first nuclear receptor LBDs structures revealed important differences between ligand bound (holo) and apo-structures concerning the position of the H12: in apo structures, H12 adopted an open conformation, exposing the ligand binding pocket, whereas in holo structures, the H12 was closed, packed over the body of the LBD, burying completely the ligand. This difference suggested a mechanism for ligand entry and exit from the binding pocket called mouse-trap model, however this model has several inconsistencies and has been discredited. Recent experimental and theoretical studies have shown that H12 is more labile in the absence of ligand, but these studies dont provide evidences that the increase in the mobility is associated with the detachment of H12 from the body of the LBD as suggested by the mouse-trap model. Although its clear that H12 is more flexible in the absence of ligands, the size of the conformational changes undergone by H12 is not yet clear. In this work we seek to construct a definitive model for the range of motions that H12 may undergo in the presence or absence of ligand using molecular dynamics simulations. Through direct comparison between molecular dynamics simulations and time-resolved fluorescence anisotropy experiments, we show that experimental observation can only be explained by conformations where the fluorescent probe is interacting with the surface of the PPARγ surface. We also show that simulations with anisotropy decay rates comparable to the experimental decay are associated with small helix 12 conformational changes. Simulations with two models of apo-PPARγ with H12 detached from the body of the LBD and with crystallographic structures of apo-RXR and apo-ER, where the H12 also is in an open conformation, display anisotropy decay rates significantly faster than the experimental ones. These results imply a model for the molecular mobility of the LBD where H12 undergoes local conformational changes and should exhibit dynamic properties less dramatic than proposed by the mouse trap model.
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