This work deals with the possibility of dynamically configurable web applications. It compares the methods of dynamic web technologies, graphical user interfaces and principles of using templates. In other parts describes the analysis, design and implementation of applications, enabling change dynamically the structure of the website. The last part is focused on a description of the system and its operation from the user's point of view.

The diploma thesis deals with detailed look at the project Education 21 and so the teaching using new technologies, especially interactive whiteboards and netbooks, in Czech schools. The objective was observation of teaching mathematics, methods of using interactive whiteboards and netbooks in mathematics lessons at secondary schools participating project Education 21. Evaluation and conclusions are based on analyzes of lessons recorded in the academic year 2009/2010 and 2010/2011, which were investigated and further divided into shorter stories in case that interactive whiteboard or netbook was used in some way. I watched purpose and the way of use of interactive whiteboard or netbook in the episodes, then the material which this technology was used with the aid of and who worked with interactive whiteboard. Some episodes can serve as an example of "good" or interesting way of working with the IWB and NTB in mathematics lessons, or they can be an inspiration for other mathematics teachers but also teachers of other subjects. Keywords: interactive whiteboard (IWB), netbook (NTB), interactive textbook - e- books, applet, mathematics, Education 21, smart notebook, videos.

Αντικείμενο της Διπλωματικής εργασίας είναι η μεταφορά ενός παιχνιδιού στρατηγικής, πού έχει αναπτυχθεί με γνώμονα τους κανόνες της Ενισχυτικής Μάθησης (Reinforcement Learning) & των Νευρωνικών δικτύων (Neural Networks), σε πλατφόρμα κινητού τηλεφώνου 6ης γενιάς & μέσω διαδικτύου με σκοπό την εκπαίδευσης του συστήματος από τον απλό χρήστη. Σκοπός της διπλωματικής εργασίας είναι η σχεδίαση, ανάπτυξη του συστήματος λογισμικού βασισμένου σε τεχνολογίες διαδικτύου & κινητής τηλεφωνίας. Η Παρούσα εργασία επικεντρώνεται σε τρεις τομείς: • Έρευνα υφιστάμενων mobile τεχνολογιών • Δυνατότητα επανασχεδιασμού εφαρμογής με χρήση τεχνολογιών mobile internet • Έλεγχος υφιστάμενης δυνατότητας επανασχεδίασης και επαναϋλοποίησης του παιχνιδιού με χρήση άλλων συστημάτων (πλατφόρμων) σε συνδυασμό με χρήση ενισχυτικής μάθησης. / In this paper we review our work on th acquisition of game-playing capabilitiew by a computer , when the only source of knowledge comes from extended self-play and sparsely dispersed human-expert play. We summarily present experiment that showhow a reinforcement learning backbone coupled with neural networks for approximation can indeed serve as amechanism of the acquisition oof game playing skill and we derive game interestingness measures that are inexpensive and strightforward to compute, yert also capture the relative quality of the game playing engine.

Goal of this thesis is modernization and extension of established web portal serving to create and manage invoices. The design and implementation emphasis on feedback from users so changes are really a benefit and not a burden. Uses wide range of different technologies and implementation is done using incremental model. Analyzes the impact of changes to number of visitors and receives feedback from users.

This diploma thesis deals with the creation of interactive tools for 3D computer graphics. The introduction of the thesis focuses on general theory of curves and surfaces and its mathematical description. The topics of Geometric transformation, Perspective projection and Parametric description of 3-dimensional surface are analysed in more detail. The successive chapter deals with the subject of visualisation of spatial objects in Java platform interface. The practical part describes the implementation of individual applets. JAVA programming language, which uses the library functions JOGL, was employed for the very realization of the interactive tools. The goal of the diploma thesis is the creation of a set of interactive applets in the field of computer graphics. These applets will be placed on the website of the faculty and they will serve students of VUT in Brno to improve the quality of education.

In this master’s thesis we focus on the basic properties of computer curves and their practical applicability. We explain how the curve can be understood in general, what are polynomial curves and their composing possibilities. Then we focus on the description of Bezier curves, especially the Bezier cubic. We discuss in more detail some of fundamental algorithms that are used for modelling these curves on computers and then we will show their practical interpretation. Then we explain non uniform rational B-spline curves and De Boor algorithm. In the end we discuss topic rasterization of segment, thick line, circle and ellipse. The aim of master’s thesis is the creation of the set of interactive applets, simulating some of the methods and algorithm we discussed in theoretical part. This applets will help facilitate understanding and will make the teaching more effective.

Τα πεπτίδια, είτε ως πρωτεϊνικά θραύσματα είτε ως φυσικές οντότητες, χαρακτηρίζονται από την ακολουθία τους και από τα λειτουργικά τους χαρακτηριστικά. Ο σκοπός αυτής της Διδακτορικής Διατριβής είναι η ανάπτυξη μιας μεθοδολογίας εξόρυξης δεδομένων για μοναδικά tags και πεπτιδικά/πρωτεϊνικά χαρακτηριστικά του ανθρώπινου πρωτεώματος καθώς επίσης η ανάλυση και η εφαρμογή αυτών των βιολογικών δεδομένων σε πρωτεϊνες που σχετίζονται με τον καρκίνο. Δημιουργήθηκε μια αποθήκη αρχείων η οποία περιέχει μοριακά βάρη με ακρίβεια 0.01 Da που συνδέονται με τις αντίστοιχες πεπτιδικές ακολουθίες ανθρώπινων πρωτεϊνών της Swiss-Prot βάσης. Αυτές οι πρωτεϊνες διασπάστηκαν εξαντλητικά παρέχοντας ανεξαρτησία στις πεπτιδικές ακολουθίες από άλλες μεθόδους που βασίζονται στην ενζυματική διάσπαση. Από αυτήν την αποθήκη δεδομένων, διαχωρίστηκαν τα μοριακά βάρη που είναι μοναδικά και φτάνουν μέχρι τα 10 kDa καθώς και οι μοναδικές πεπτιδικές ακολουθίες (μέχρι 10 kDa). Στα πλαίσια της αξιοποίησης των δεδομένων εξόρυξης για την ταυτοποίηση των πρωτεϊνών, αναπτύχθηκε μια ευρέως διαθέσιμη διαδικτυακή εφαρμογή όπου γίνεται η αντιστοίχιση των μοριακών βαρών υψηλής ανάλυσης με πεπτίδια και πρωτεϊνες. Μια ακόμη διαδικτυακή εφαρμογή αναπτύχθηκε για να προσφέρει την πληροφορία της μοναδικότητας των μοριακών βαρών και των πεπτιδικών ακολουθιών στο ανθρώπινο πρωτέωμα. Η εφαρμογή μπορεί να αναζητήσει μοναδικά πρωτεϊνικά θραύσματα που προκύπτουν από την εζυματική διάσπαση πρωτεϊνών και να προσφέρει την πληροφορία για όλα τα μοναδικά μοριακά βάρη και τις μοναδικές πεπτιδικές ακολουθίες που περιέχονται σε μια πρωτεϊνη. Πολλές φορές χρειάζεται η μαζική διαχείριση των πεπτιδίων από λίστες. Για το σκοπό αυτό, αναπτύχθηκε ένας web server ο οποίος διαχειρίζεται τις πεπτιδικές λίστες, αναλύοντας τα χαρακτηριστικά των πεπτιδίων και ομαδοποιώντας τα πεπτίδια σύμφωνα μα αυτά τα χαρακτηριστικά, ενώ οπτικοποιείται η ομαδοποίηση με την χρήση ενός java applet. Το PepServe είναι ένα χρήσιμο εργαλείο για την κατανόηση της κατανομής των πεπτιδικών χαρακτηριστικών για ένα σύνολο πεπτιδίων. Τέλος, αναλύθηκαν σύνολα πρωτεϊνών που σχετίζονται με διάφορες περιπτώσεις καρκίνων, για πεπτιδικά χαρακτηριστικά. Αυτή η ανάλυση έχει σκοπό την εύρεση πιθανών προτιμήσεων σε χαρακτηριστικά και την εύρεση μοναδικών tags των πρωτεϊνών που σχετίζονται με καρκίνους. Τα μοναδικά tags μπορούν να χρησιμοποιηθούν στην ανακάλυψη βιοδεικτών και την ανάπτυξη νεων φαρμάκων για την πιο αποτελεσματική διάγνωση και θεραπεία. / Peptides, either as protein fragments or as naturally occurring entities are characterized by their sequence and function features. The purpose of the present Ph.D. thesis is to develop a datamining method for unique tags and peptide/protein characteristics in the human proteome and to analyze and apply the derived biological data in cancer-related proteins. A file repository has been created, containing indexed information that relates molecular masses with an accuracy of 0.01 Da to the corresponding peptides existing in human proteins. These proteins have been deposited in a completely digested protein database (Swiss-Prot) providing independence from any specific enzyme/digestion method. From this repository, the unique molecular masses, ranging from 1 to 10 kDa, and the unique peptide sequences from all the possible sequence fragments (up to 10 kDa) have been mined. A publicly available web application has been developed which facilitates a high resolution mapping of measured molecular masses to peptides and proteins, irrespectively of the enzyme/digestion method used. Μulti-filtering may be applied in terms of measured mass tolerance, molecular mass and isoelectric point range as well as pattern matching to refine the results In addition, another publicly available web application has been developed that offers information concerning the uniqueness of molecular masses and peptide sequences in the human proteome. The application is able to search for unique protein fragments derived computationally from enzymatic digestion driven by certain enzymes. Furthermore, the application can list all the unique masses and peptides of a given protein. Through this application, researchers are able to find unique tags, either on a molecular mass level or on a sequence level. A web server has beed developed that manages peptide lists in terms of feature analysis as well as interactive clustering and visualization of the given peptides. PepServe is a useful tool towards understanding peptide feature distribution among a group of peptides. Finally, cancer-related proteins have been analyzed producing peptide features and peptide feature’s sequence uniqueness resulting in some feature preferences and peptide unique tags. These unique tags can be used in biomarker discovery, and novel drug development for an efficient diagnosis and treatment.

Tato práce popisuje přehled standardních a pokročilých metod používaných k diagnose glaukomu v ranném stádiu. Na základě teoretických poznatků je implementován internetově orientovaný informační systém pro oční lékaře, který má tři hlavní cíle. Prvním cílem je možnost sdílení osobních dat konkrétního pacienta bez nutnosti posílat tato data internetem. Druhým cílem je vytvořit účet pacienta založený na kompletním očním vyšetření. Posledním cílem je aplikovat algoritmus pro registraci intenzitního a barevného fundus obrazu a na jeho základě vytvořit internetově orientovanou tři-dimenzionální vizualizaci optického disku. Tato práce je součásti DAAD spolupráce mezi Ústavem Biomedicínského Inženýrství, Vysokého Učení Technického v Brně, Oční klinikou v Erlangenu a Ústavem Informačních Technologií, Friedrich-Alexander University, Erlangen-Nurnberg.

In this master’s thesis we focus on the basic properties of computer curves and their practical applicability. We explain how the curve can be understood in general, what are polynomial curves and their composing possibilities. Then we focus on the description of Bezier curves, especially the Bezier cubic. We discuss in more detail some of fundamental algorithms that are used for modelling these curves on computers and then we will show their practical interpretation. Then we explain non uniform rational B-spline curves and De Boor algorithm. In the end we discuss topic rasterization of segment, thick line, circle and ellipse. The aim of master’s thesis is the creation of the set of interactive applets, simulating some of the methods and algorithm we discussed in theoretical part. This applets will help facilitate understanding and will make the teaching more effective.