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Análises biológicas, sorológicas e moleculares de plantas de amendoim infectadas por vírus obtidas em áreas produtoras de São PauloPANTOJA, Michelle Barros 26 February 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-02-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The peanut (Arachis hypogaea) is an oleaginous plant belonging to the Fabaceae family,
native to South America. Its kernels are widely used as a food source and the production of
oil. The main producing countries are China, India and the United States, which occupy the
1st, 2nd and 3rd places, respectively, in the ranking of world production. Brazil occupies the
17th position, in which the State of São Paulo stands out with 95% of total production of
the country. The peanut is infected by several virus species, which limit the development
of the crop in different parts of the world. The objective of this study was to detect the
presence of virus in peanut plants in 10 counties of the State of São Paulo. Thirty-five
samples (s) from 18 fields (f) were analyzed from Santa Adélia (3f/6s), Lusitânia (1f/1s),
Jaboticabal (3f/6s), Itápolis e Pindorama (1f/2s, each), Tupã (4f/8s), Rancharia e
Marília (1f/2s, each), Guaimbê (2f/4s) and Guarantã (1f/2s). The maintenance of the
virus isolates was done in peanut plants graft inoculated. The isolates were submitted to
biological, serological e molecular analyses. For host range study, Lactuca sativa,
Capisicum annuum, C. annuum var. 679, C. annuum var. Ikeda, Chenopodium
amaranticolor, C. quinoa, Datura stramonium, Gomphrena globosa, Nicotiniana tabacum,
N. benthamiana, N. rustica, N. glutinosa, Physalis floridana and Solanum sculentum were
mechanically inoculated and the symptoms analyzed. Based on Dot-ELISA results, the
presence of the tospoviruses Groundnut ringspot virus (GRSV) (16s), Tomato chlorotic
spot virus (TCSV) (6s) and do Tomato spotted wilt virus (TSWV) (3s) was detected. The
comparison of the sequence obtained in the RT-PCR test with those deposited in the
GenBank, revealed the occurrence of the GRSV. Furthermore, the metagenomic analysis
showed the presence of the GRSV, as well as, the potyvirus Peanut motlle virus (PeMoV),
both with complete genome. / O amendoim (Arachis hypogaeae L.) é uma oleaginosa pertencente à família Fabaceae, originária da América do Sul. Seus grãos são muito utilizados como fonte de alimento e na produção de óleo. Os principais países produtores são China, Índia e Estados Unidos, que ocupam o 1°, 2° e 3º lugar, respectivamente. O Brasil situa-se na 17ª posição, tendo o Estado de São Paulo contribuído com 95% da produção total do país. O amendoim é hospedeiro de um grande número de espécies de vírus, que limitam o desenvolvimento da cultura em diferentes partes do mundo. O objetivo deste trabalho foi detectar a presença de vírus em plantas de amendoim oriundas de 10 municípios paulistas, sendo analisadas amostras (am) de campos (cam) de Santa Adélia (3cam/6am), Lusitânia (1cam/1am), Jaboticabal (3cam/6am), Itápolis e Pindorama (1cam/2am, cada), Tupã (4cam/8am), Rancharia e Marília (1cam/2am, cada), Guaimbê (2cam/4am) e Guarantã (1cam/2am). Plantas de amendoim foram usadas para manutenção dos isolados virais, empregando-se transmissão sucessivas por meio de enxertias. Os isolados foram submetidos a análises biológicas em gama de hospedeiros, sorológicas pelo método Dot-ELISA e moleculares por RT-PCR e metagenômica. Os hospedeiros indicadores testado foram: Lactuca sativa, Capisicum annuum, C. annuum var. 679, C. annuum var. Ikeda, Chenopodium amaranticolor, C. quinoa, Datura stramonium, Gomphrena globosa, Nicotiniana tabacum, N. benthamiana, N. rustica, N. glutinosa, Physalis floridana e Solanum sculentum. Com base nos resultados do teste Dot-ELISA foi detectada a presença dos tospovírus Groundnut ringspot virus (GRSV) (16am), Tomato chlorotic spot virus (TCSV)
(6am) e do Tomato spotted wilt virus (TSWV) (3am). Ao ser comparado os resultados obtidos no sequenciamento (Macrogen) do fragmento obtido no teste RT-PCR, com as sequências disponíveis no GenBank, ficou comprovada ocorrência do GRSV. Por outro lado, a análise metagenômica confirmou a presença do GRSV e detectou o potyvírus Peanut motlle virus PeMoV), ambos com genoma completo.
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