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Sistemática molecular e biogeografia histórica do gênero Aratinga (Psittacidae, Aves) / Molecular systematics and historical biogeography of genus Aratinga (Psittacidae, Aves)

Freddi, André Murilo Magro 16 April 2012 (has links)
A família Psittacidae possui 332 espécies de papagaios, periquitos e afins, e os táxons Neotropicais formam um grupo monofilético (tribo Arini), dentro desta tribo está o gênero Aratinga. A sistemática deste gênero é mal resolvida, com poucos estudos morfológicos e algumas filogenias moleculares que apontam que não seja monofilético. Porém, é preciso destacar que esses estudos não amostraram uma quantidade representativa de espécies do gênero, o que deixa essas relações incertas. Para melhor compreender a história evolutiva do gênero Aratinga, realizamos uma análise filogenética com 21 das 22 espécies do gênero, o táxon monotípico Nandayus nenday que é proximamente relacionado a algumas espécies de Aratinga e representantes de outros gêneros da tribo Arini. Foram sequenciados cinco genes mitocondriais (12S, 16S, citocromo b, NADH2, COIII) e um nuclear (RAG-1). As filogenias obtidas por máxima verossimilhança e análise Bayesiana foram congruentes e indicam a ausência de monofilia do gênero Aratinga. A maioria das espécies do gênero foi posicionada em três clados com alto suporte, mas que não se apresentam agrupados em um clado monofilético. Estes três clados são congruentes com grupos previamente propostos com base em caracteres morfológicos. Nandayus nenday está dentro de um destes clados, que é grupo irmão de um clado que contém outros quatro gêneros da tribo Arini. A única espécie que não foi incluída em nenhum destes clados é Aratinga acuticaudata, que aparentemente é mais proximamente relacionada aos gêneros Diopsittaca e Guarouba. A maioria dos eventos de divergência das espécies do gênero Aratinga nesses diferentes clados parece ter ocorrido nos últimos 5 milhões de anos (Ma.). Enquanto as estimativas de datas de divergências entre os principais clados sugerem que elas ocorreram durante o Mioceno inicial. O padrão biogeográfico da diversificação dos clados de Aratinga foi complexo, possivelmente relacionado com o soerguimento dos Andes, com múltiplas colonizações da América Central antes e depois do fechamento do Istmo do Panamá e com ciclos glaciais do Pleistoceno. Esses resultados refutam a monofilia do gênero e uma revisão taxonômica do táxon parece ser necessária. / Family Psittacidae includes 332 species of parrots and all Neotropical taxa form a monophyletic group (tribe Arini), among those, is the parakeet genus Aratinga. This genus has an unresolved systematics, with few morphological studies and some molecular phylogenies suggest that it is not monophyletic. However, these phylogenies did not include a representative sample of species of the genus. To better understand the evolutionary history of genus Aratinga, we conducted a phylogenetic analysis that included 21 of 22 species of the genus, the monospecific taxon Nadayus nenday that is closely related to some Aratinga species, plus various taxa from tribe Arini. We sequenced five mitochondrial (12S, 16S, cytochrome b, NADH2, COIII) and one nuclear (RAG-1) genes. The phylogenies were reconstructed based on maximum likelihood analysis and Bayesian inference. Relaxed molecular clock estimates were conducted under a Bayesian analysis for inferring the divergence times of the phylogeny and to study the biogeographic history of these species. The phylogenies recovered by both methods were highly congruent and support the absence of monophyly for genus Aratinga. The majority of the species from the genus Aratinga was placed in three highly supported clades that did not group in a monophyletic clade. These three clades match previously suggested groups based on morphological characters. Nandayus nenday was included in one of these clades, that is closely related to a clade that contains four other Arini genera. The only species that was not included in any of these clades was Aratinga acuticaudata, that seems to be more closely related to the genera Diopsittaca and Guarouba with high support values. Most of the speciation within the Aratinga clades may have occurred during the last 5 Mya., but the divergence times between these clades seems to have occurred during the early Miocene. The biogeograhic pattern of the diversification of the Aratinga clades was complex, possibly related to the history of the Andes, multiple colonization of Central America before and after the closure of the Panama Isthmus and also Pleistocene glacial cycles. These results further refute the monophyly of genus Aratinga and a taxonomical revision may be necessary for the taxon.
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Avaliação morfofuncional do testículo e do processo espermatogênico do periquitão-maracanã (Aratinga leucophthalma MULLER, 1776) adulto, mantido em cativeiro, nas diferentes estações do ano / Morphofunctional evaluation of the testicle and the spermatogenic process of white-eyed parakeet (Aratinga leucophthalma MULLER, 1776), adult, in captivity, during the different seasons of the year

Peixoto, Juliano Vogas 30 November 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:47:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1375953 bytes, checksum: 3ac86e7ae358657b9a411be671fd6137 (MD5) Previous issue date: 2006-11-30 / Universidade Federal de Viçosa / For this experiment it was utilized testicles fragments from 14 adults White-Eyed Parakeet (Aratinga leucophthalma), proceeding from the Centro de Triagem de Animais Silvestres - Universidade Federal de Viçosa, Minas Gerais, Brazil. The fragments were evaluated for seasonal reproductive activities using the following parameters: average thickness of testicular tunica albuginea, volumetric proportion of tubular and extratubular compartment, average diameter of the seminiferous tubules, and in addition the average of corporal weight. For this experiment the animals were distributed into four groups and had collected testicular fragments on the following dates: February 6, 2006, May 11, 2006, August 16, 2006 and November 7, 2006. These dates corresponded to the seasons of Summer, Fall, Winter and Spring respectively. The animals were submitted to general anesthesia, using a volatile gas, and a incisional biopsy was made using celioscopy. The fragments collected were processed histologically, the slides were prepared and later evaluated using an optical microscope. The average seasonal values of body weight increased starting at the Winter and reaching the peak during the Spring. A seasonal testicle cycle was observed in Aratinga leucophthalma, since increased significant values of volumetric proportion of seminiferous tubules, average diameter of the seminiferous tubules and degree of spermatogenic development were observed during the Spring, in contrast with the minimum values of these same parameters observed during the Fall. Furthermore, the average thickness of the testicular tunica albuginea was significantly greater during the Fall, showing a significant and gradual decrease of the values during the Spring. The evaluated parameters of spermatic production in Aratinga leucophthalma, during the different seasons, showed strong positive correlations with the average daily light (p<0,1) and strong negative correlation with the relative air humidity (p<0,1). In conclusion, during the Spring the testicles of the Aratinga leucophthalma show the values of the quantitative parameters of spermatic production, compatible with the period of greater activity, the opposite happening during the Fall. / Para o presente experimento foram utilizados fragmentos testiculares de 14 periquitões-maracanã (Aratinga leucophthalma) adultos, provenientes do Centro de Triagem de Animais Silvestres da UFV, para a avaliação sazonal da atividade reprodutiva através dos seguintes parâmetros: espessura média da albugínea testicular, proporção volumétrica dos compartimentos tubular e extratubular, diâmetro médio do túbulo seminífero, além do peso corporal. Para tal, os animais foram distribuídos em quatro grupos e tiveram fragmentos testiculares coletados nas seguintes datas: 06/02/2006, 11/05/2006, 16/08/2006 e 07/11/2006, correspondendo ao período intermediário das estações de verão, outono, inverno e primavera, respectivamente. Os animais submetidos à anestesia geral volátil foram biopsiados por meio de celioscopia. Os fragmentos coletados foram processados histologicamente para confecção de lâminas, que foram avaliadas ao microscópio de luz. Os valores médios sazonais de peso corporal foram crescentes a partir do inverno, culminando com as maiores médias durante a primavera. Um ciclo testicular sazonal foi observado em A. leucophthalma, uma vez que valores significativamente maiores de proporção volumétrica de túbulos seminíferos, diâmetro médio dos túbulos seminíferos e grau de desenvolvimento espermatogênico foram observados na primavera, em relação aos valores mínimos destes parâmetros observados no outono. A espessura média da albugínea testicular foi significativamente maior durante o outono, apresentando decréscimo gradativo até atingir valores significativamente menores na primavera. Os parâmetros da produção espermática avaliados em A. leucophthalma, nas diferentes estações do ano, apresentaram alta correlação positiva com a luminosidade média diária (p<0,1) e alta correlação negativa com a umidade relativa do ar (p<0,1). Conclui-se que durante a primavera, os testículos de A. leucophthalma apresentam os valores dos parâmetros qualiquantitativos de produção espermática compatíveis com período de maior atividade reprodutiva, o inverso acontecendo durante o outono.
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Sistemática molecular e biogeografia histórica do gênero Aratinga (Psittacidae, Aves) / Molecular systematics and historical biogeography of genus Aratinga (Psittacidae, Aves)

André Murilo Magro Freddi 16 April 2012 (has links)
A família Psittacidae possui 332 espécies de papagaios, periquitos e afins, e os táxons Neotropicais formam um grupo monofilético (tribo Arini), dentro desta tribo está o gênero Aratinga. A sistemática deste gênero é mal resolvida, com poucos estudos morfológicos e algumas filogenias moleculares que apontam que não seja monofilético. Porém, é preciso destacar que esses estudos não amostraram uma quantidade representativa de espécies do gênero, o que deixa essas relações incertas. Para melhor compreender a história evolutiva do gênero Aratinga, realizamos uma análise filogenética com 21 das 22 espécies do gênero, o táxon monotípico Nandayus nenday que é proximamente relacionado a algumas espécies de Aratinga e representantes de outros gêneros da tribo Arini. Foram sequenciados cinco genes mitocondriais (12S, 16S, citocromo b, NADH2, COIII) e um nuclear (RAG-1). As filogenias obtidas por máxima verossimilhança e análise Bayesiana foram congruentes e indicam a ausência de monofilia do gênero Aratinga. A maioria das espécies do gênero foi posicionada em três clados com alto suporte, mas que não se apresentam agrupados em um clado monofilético. Estes três clados são congruentes com grupos previamente propostos com base em caracteres morfológicos. Nandayus nenday está dentro de um destes clados, que é grupo irmão de um clado que contém outros quatro gêneros da tribo Arini. A única espécie que não foi incluída em nenhum destes clados é Aratinga acuticaudata, que aparentemente é mais proximamente relacionada aos gêneros Diopsittaca e Guarouba. A maioria dos eventos de divergência das espécies do gênero Aratinga nesses diferentes clados parece ter ocorrido nos últimos 5 milhões de anos (Ma.). Enquanto as estimativas de datas de divergências entre os principais clados sugerem que elas ocorreram durante o Mioceno inicial. O padrão biogeográfico da diversificação dos clados de Aratinga foi complexo, possivelmente relacionado com o soerguimento dos Andes, com múltiplas colonizações da América Central antes e depois do fechamento do Istmo do Panamá e com ciclos glaciais do Pleistoceno. Esses resultados refutam a monofilia do gênero e uma revisão taxonômica do táxon parece ser necessária. / Family Psittacidae includes 332 species of parrots and all Neotropical taxa form a monophyletic group (tribe Arini), among those, is the parakeet genus Aratinga. This genus has an unresolved systematics, with few morphological studies and some molecular phylogenies suggest that it is not monophyletic. However, these phylogenies did not include a representative sample of species of the genus. To better understand the evolutionary history of genus Aratinga, we conducted a phylogenetic analysis that included 21 of 22 species of the genus, the monospecific taxon Nadayus nenday that is closely related to some Aratinga species, plus various taxa from tribe Arini. We sequenced five mitochondrial (12S, 16S, cytochrome b, NADH2, COIII) and one nuclear (RAG-1) genes. The phylogenies were reconstructed based on maximum likelihood analysis and Bayesian inference. Relaxed molecular clock estimates were conducted under a Bayesian analysis for inferring the divergence times of the phylogeny and to study the biogeographic history of these species. The phylogenies recovered by both methods were highly congruent and support the absence of monophyly for genus Aratinga. The majority of the species from the genus Aratinga was placed in three highly supported clades that did not group in a monophyletic clade. These three clades match previously suggested groups based on morphological characters. Nandayus nenday was included in one of these clades, that is closely related to a clade that contains four other Arini genera. The only species that was not included in any of these clades was Aratinga acuticaudata, that seems to be more closely related to the genera Diopsittaca and Guarouba with high support values. Most of the speciation within the Aratinga clades may have occurred during the last 5 Mya., but the divergence times between these clades seems to have occurred during the early Miocene. The biogeograhic pattern of the diversification of the Aratinga clades was complex, possibly related to the history of the Andes, multiple colonization of Central America before and after the closure of the Panama Isthmus and also Pleistocene glacial cycles. These results further refute the monophyly of genus Aratinga and a taxonomical revision may be necessary for the taxon.
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Planejamento biorregional : uso da terra e política de gestão em unidades de conservação estaduais da Mata Atlântica, Rio Grande do Sul, Brasil

Ramos, Ricardo Aranha January 2008 (has links)
A Mata Atlântica é um dos ecossistemas mais ameaçados do planeta, estando hoje reduzida a menos de 8% de sua extensão original, segundo dados desenvolvidos pela Fundação SOS Mata Atlântica e o Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais. Este bioma, considerado um dos ecossistemas com maior biodiversidade do mundo, está parcialmente protegido em algumas unidades de conservação ao longo da costa brasileira. Este trabalho visa discutir alguns dos conflitos existentes entre a política de conservação e a preservação da Mata Atlântica no entorno de três unidades de conservação estaduais no Rio Grande do Sul: Reserva Biológica Estadual da Serra Geral, Estação Ecológica Estadual Aratinga e Parque Estadual do Tainhas. Através de ferramentas do sensoriamento remoto e geoprocessamento, foi elaborada uma classificação da cobertura vegetal e dos diferentes tipos de uso da terra, utilizando imagens de satélite, fotografias aéreas de pequeno formato, trabalhos de campo e análises espaciais. O mapeamento de uso e cobertura da terra abrangeu uma área total de 350.137,68 ha, gerando 36 classes divididas em três categorias: cobertura vegetal, uso da terra e hidrografia. A cobertura vegetal totalizou 259.197,71 ha., representando 74,03% da área de estudo, o uso da terra 75.661,35 ha, com 21,61% e a hidrografia 15.278,61 ha com 4,38%. Nas análises foram geradas informações de distância e densidade dos fragmentos, além de classes de declividade e características do entorno das unidades de conservação. Foi elaborada então uma análise de multicritérios, que indicou as áreas com maiores conflitos socioambientais, e áreas com potencial de conservação. Os resultados permitiram analisar e sugerir alterações na política de conservação das unidades existentes. As áreas estudadas mostraram um alto potencial para práticas de uso associadas à conservação dos recursos naturais. O extrativismo da samambaiapreta (Rumohra adiantiformis) e o turismo ecológico são bons exemplos desta potencialidade. Neste sentido a estratégia de planejamento e a gestão biorregional seria fundamental para contemplar os interesses das populações locais, de uma forma mais sustentável e organizada. / The Atlantic rainforest is one of the most endangered ecosystems of the world, with only 8% of its original area remaining today, according to data from the SOS Mata Atlântica Foundation and the National Institute for Space Research (INPE). This biome, one of the world’s richest in biodiversity, is partially protected in a few conservation units along the Brazilian coast. The objective of the present work is to discuss some of the conflicts between conservation policy and the preservation of the Atlantic Forest around three conservation units in the State of Rio Grande do Sul: Serra Geral Biological Reserve, Aratinga Ecological Station e State Park of Tainhas. Using remote sensing and geoprocessing tools, a vegetation cover and land use map classification was produced using satellite imagery, aerial photographs, field work and spatial analysis. The total extent of the land use map was 350.137,68 ha, with 36 classes divided in three categories: vegetation cover, land use, and hydrography. Total vegetation cover was 259.197,71 ha (74,03% of the studied area), total land use area was 75.661,35 ha (21,61%) and hidrography was 15.278,61 ha (4,38% of the total area). The spatial analyses produced data on distance and density of forest fragments, slope classes, and characteristics around the conservation units. A multicriteria analysis indicated the area with the highest degree of socio-environmental conflicts and the areas that are potentially interesting for conservation. The results provided the basis for the suggestion of shifts in the present policy for protected areas. The studied region presents a high potential for land use practices associated with natural resource conservation. Extractivism of a native fern, called samambaia-preta (Rumohra adiantiformis), and ecoturism are examples of such potential activities. Bioregional planning and management would be a fundamental approach for taking into account the interests of the local populations in a more sustainable and organized way.
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Planejamento biorregional : uso da terra e política de gestão em unidades de conservação estaduais da Mata Atlântica, Rio Grande do Sul, Brasil

Ramos, Ricardo Aranha January 2008 (has links)
A Mata Atlântica é um dos ecossistemas mais ameaçados do planeta, estando hoje reduzida a menos de 8% de sua extensão original, segundo dados desenvolvidos pela Fundação SOS Mata Atlântica e o Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais. Este bioma, considerado um dos ecossistemas com maior biodiversidade do mundo, está parcialmente protegido em algumas unidades de conservação ao longo da costa brasileira. Este trabalho visa discutir alguns dos conflitos existentes entre a política de conservação e a preservação da Mata Atlântica no entorno de três unidades de conservação estaduais no Rio Grande do Sul: Reserva Biológica Estadual da Serra Geral, Estação Ecológica Estadual Aratinga e Parque Estadual do Tainhas. Através de ferramentas do sensoriamento remoto e geoprocessamento, foi elaborada uma classificação da cobertura vegetal e dos diferentes tipos de uso da terra, utilizando imagens de satélite, fotografias aéreas de pequeno formato, trabalhos de campo e análises espaciais. O mapeamento de uso e cobertura da terra abrangeu uma área total de 350.137,68 ha, gerando 36 classes divididas em três categorias: cobertura vegetal, uso da terra e hidrografia. A cobertura vegetal totalizou 259.197,71 ha., representando 74,03% da área de estudo, o uso da terra 75.661,35 ha, com 21,61% e a hidrografia 15.278,61 ha com 4,38%. Nas análises foram geradas informações de distância e densidade dos fragmentos, além de classes de declividade e características do entorno das unidades de conservação. Foi elaborada então uma análise de multicritérios, que indicou as áreas com maiores conflitos socioambientais, e áreas com potencial de conservação. Os resultados permitiram analisar e sugerir alterações na política de conservação das unidades existentes. As áreas estudadas mostraram um alto potencial para práticas de uso associadas à conservação dos recursos naturais. O extrativismo da samambaiapreta (Rumohra adiantiformis) e o turismo ecológico são bons exemplos desta potencialidade. Neste sentido a estratégia de planejamento e a gestão biorregional seria fundamental para contemplar os interesses das populações locais, de uma forma mais sustentável e organizada. / The Atlantic rainforest is one of the most endangered ecosystems of the world, with only 8% of its original area remaining today, according to data from the SOS Mata Atlântica Foundation and the National Institute for Space Research (INPE). This biome, one of the world’s richest in biodiversity, is partially protected in a few conservation units along the Brazilian coast. The objective of the present work is to discuss some of the conflicts between conservation policy and the preservation of the Atlantic Forest around three conservation units in the State of Rio Grande do Sul: Serra Geral Biological Reserve, Aratinga Ecological Station e State Park of Tainhas. Using remote sensing and geoprocessing tools, a vegetation cover and land use map classification was produced using satellite imagery, aerial photographs, field work and spatial analysis. The total extent of the land use map was 350.137,68 ha, with 36 classes divided in three categories: vegetation cover, land use, and hydrography. Total vegetation cover was 259.197,71 ha (74,03% of the studied area), total land use area was 75.661,35 ha (21,61%) and hidrography was 15.278,61 ha (4,38% of the total area). The spatial analyses produced data on distance and density of forest fragments, slope classes, and characteristics around the conservation units. A multicriteria analysis indicated the area with the highest degree of socio-environmental conflicts and the areas that are potentially interesting for conservation. The results provided the basis for the suggestion of shifts in the present policy for protected areas. The studied region presents a high potential for land use practices associated with natural resource conservation. Extractivism of a native fern, called samambaia-preta (Rumohra adiantiformis), and ecoturism are examples of such potential activities. Bioregional planning and management would be a fundamental approach for taking into account the interests of the local populations in a more sustainable and organized way.
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Planejamento biorregional : uso da terra e política de gestão em unidades de conservação estaduais da Mata Atlântica, Rio Grande do Sul, Brasil

Ramos, Ricardo Aranha January 2008 (has links)
A Mata Atlântica é um dos ecossistemas mais ameaçados do planeta, estando hoje reduzida a menos de 8% de sua extensão original, segundo dados desenvolvidos pela Fundação SOS Mata Atlântica e o Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais. Este bioma, considerado um dos ecossistemas com maior biodiversidade do mundo, está parcialmente protegido em algumas unidades de conservação ao longo da costa brasileira. Este trabalho visa discutir alguns dos conflitos existentes entre a política de conservação e a preservação da Mata Atlântica no entorno de três unidades de conservação estaduais no Rio Grande do Sul: Reserva Biológica Estadual da Serra Geral, Estação Ecológica Estadual Aratinga e Parque Estadual do Tainhas. Através de ferramentas do sensoriamento remoto e geoprocessamento, foi elaborada uma classificação da cobertura vegetal e dos diferentes tipos de uso da terra, utilizando imagens de satélite, fotografias aéreas de pequeno formato, trabalhos de campo e análises espaciais. O mapeamento de uso e cobertura da terra abrangeu uma área total de 350.137,68 ha, gerando 36 classes divididas em três categorias: cobertura vegetal, uso da terra e hidrografia. A cobertura vegetal totalizou 259.197,71 ha., representando 74,03% da área de estudo, o uso da terra 75.661,35 ha, com 21,61% e a hidrografia 15.278,61 ha com 4,38%. Nas análises foram geradas informações de distância e densidade dos fragmentos, além de classes de declividade e características do entorno das unidades de conservação. Foi elaborada então uma análise de multicritérios, que indicou as áreas com maiores conflitos socioambientais, e áreas com potencial de conservação. Os resultados permitiram analisar e sugerir alterações na política de conservação das unidades existentes. As áreas estudadas mostraram um alto potencial para práticas de uso associadas à conservação dos recursos naturais. O extrativismo da samambaiapreta (Rumohra adiantiformis) e o turismo ecológico são bons exemplos desta potencialidade. Neste sentido a estratégia de planejamento e a gestão biorregional seria fundamental para contemplar os interesses das populações locais, de uma forma mais sustentável e organizada. / The Atlantic rainforest is one of the most endangered ecosystems of the world, with only 8% of its original area remaining today, according to data from the SOS Mata Atlântica Foundation and the National Institute for Space Research (INPE). This biome, one of the world’s richest in biodiversity, is partially protected in a few conservation units along the Brazilian coast. The objective of the present work is to discuss some of the conflicts between conservation policy and the preservation of the Atlantic Forest around three conservation units in the State of Rio Grande do Sul: Serra Geral Biological Reserve, Aratinga Ecological Station e State Park of Tainhas. Using remote sensing and geoprocessing tools, a vegetation cover and land use map classification was produced using satellite imagery, aerial photographs, field work and spatial analysis. The total extent of the land use map was 350.137,68 ha, with 36 classes divided in three categories: vegetation cover, land use, and hydrography. Total vegetation cover was 259.197,71 ha (74,03% of the studied area), total land use area was 75.661,35 ha (21,61%) and hidrography was 15.278,61 ha (4,38% of the total area). The spatial analyses produced data on distance and density of forest fragments, slope classes, and characteristics around the conservation units. A multicriteria analysis indicated the area with the highest degree of socio-environmental conflicts and the areas that are potentially interesting for conservation. The results provided the basis for the suggestion of shifts in the present policy for protected areas. The studied region presents a high potential for land use practices associated with natural resource conservation. Extractivism of a native fern, called samambaia-preta (Rumohra adiantiformis), and ecoturism are examples of such potential activities. Bioregional planning and management would be a fundamental approach for taking into account the interests of the local populations in a more sustainable and organized way.

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