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Análise genética do tubarão-raposa Alopias superciliosus no Oceano Atlântico, utilizando região controle do DNA mitocondrial /

Morales, Millke Jasmine Arminini. January 2012 (has links)
Orientador: Fausto Foresti / Coorientador: Fernando Fernandes Mendonça / Banca: Maria Iracilda da Cunha Sampaio / Banca: Alexandre Wagner Silva Hilsdorf / Resumo: As populações de tubarões têm sofrido um acentuado declínio nas últimas décadas principalmente devido à pressão da pesca para provisão de alimento e à valorização das nadadeiras no mercado asiático. Como as espécies deste grupo se caracterizam por sua suscetibilidade aos efeitos da sobre-pesca, questões relacionadas ao status populacional são essenciais para o manejo correto dos estoques pesqueiros. Para a identificação destes estoques, ferramentas genéticas que acessam a variabilidade das espécies são eficientes e têm sido amplamente utilizadas. Considerando os fortes indícios de esgotamento populacional do tubarão-raposa Alopias superciliosus e a falta de informações que permitem viabilizar planos de conservação, o presente estudo buscou abordar questões relacionadas à dinâmica populacional da espécie no Oceano Atlântico utilizando a região controle do DNA mitocondrial como marcador molecular. Assim, 114 indivíduos de A. superciliosus foram analisados utilizando sequências nucleotídicas da região controle (D-loop) do DNA mitocondrial. Os 913 pares de bases analisáveis desta região do genoma permitiram a caracterização de apenas oito haplótipos em todas as amostras analisadas, sendo um único destes haplótipos compartilhado por 91,5% dos indivíduos. Os resultados indicam a ocorrência de uma baixa variabilidade genética (π = 0,00140 e h=0,152 ± 0,0046), a ausência de estruturação populacional (valores de FST e ΦST não significativos) e a caracterização de um único estoque pesqueiro na região abrangida pela amostragem no Oceano Atlântico. As análises também revelaram a existência de duas linhagens de DNAmt distintas, separadas por um mínimo de 9 mutações e com aproximadamente 1,2% de diferença genética, sendo uma delas composta por apenas 6 indivíduos, originando... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Populations of several shark species have decreased in the last decades, especially because of the fishing pressure and Asian demand for their fins. Since this group is susceptible to overfishing due to its biological traits, studies regarding its populations distribution are necessary for the appropriate management of their fish stocks. Genetic tools addressing species variability are efficient and widely used to the identification of fisheries stocks. Considering the lack of information about A. superciliosus populations, the remarkable decline in the abundance of this species around the world, and the lack of information management and conservation strategies, the aim of this study was solve issues about the populational dynamic of the species in the Atlantic Ocean. Using mitochondrial DNA control region (D-loop) sequences with 913 bp from 114 individuals of Alopias superciliosus, only eight haplotypes were found, which just one was shared by 91.5% of the analyzed sharks. The results suggest a low genetic variability (π = 0.00140 and h=0.152 ± 0.0046), no populational structure (FST values and ΦST no significant), and the characterization of a single A. superciliosus stock in the Atlantic Ocean. In addition, it was found two distinct mtDNA lineages, separated by a minimum of nine mutational steps and about 1.2% genetic difference, one of which consists of only six individuals, resulting in five distinct haplotypes. Thus, this lineage showing rare haplotypes could be related to recent migration events from the Indian Ocean, which would have occurred right after the last glaciations, in warming periods at the region of the Benguela Upwelling. At the other hand, migration processes also can be happening nowadays, with intermittent transference of warm waters from the Indian Ocean to the South Atlantic region. Such events could be... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Revisão taxonômica do gênero Thesea (Cnidaria : Octocorallia) do Atlântico Ocidental

Marques-Paraense , Ana Claudia 29 July 1996 (has links)
Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-06-15T17:44:47Z No. of bitstreams: 1 278027.pdf: 11727094 bytes, checksum: 6864d7236622370e4df86376219e440e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-15T17:44:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 278027.pdf: 11727094 bytes, checksum: 6864d7236622370e4df86376219e440e (MD5) Previous issue date: 1996-07-29 / FAPERJ / CAPES / Estudo do gênero Thesea Duchassaing & Michelotti, 1864, foi realizado através do exame de material tipo de suas espécies. O uso do nome Thesea apresenta problemas nomenclaturais referentes à designação da espécie-tipo. É fornecida chave de identificação, redescrição, ilustração e diagnose das espécies consideradas válidas. São elas: T. antiope Bayer, 1959, T. bicolor Deichmann, 1936, T. gracilis (Gray, 1868), T. grandiflora Deichmann, 1936, T. granulosa Deichmann, 1936, T. guadalupensis Duchassaing & Michelotti, 1864, T. hebes Deichmann, 1936, T. parviflora Deichmann, 1936, T. rubra Deichmann, 1936 e T. rugosa Deichmann, 1936. Além destas, Thesea sp. é distinta, ainda não formalmente descrita. São sinônimos: T. echinata Tixier-Durivault, 1970 (=T. bicolor), T. grandiflora rugulosa Deichmann, 1936 (=T. grandiflora), T. citrina Deichmann, 1936, e T. gracilis Deichmann, 1936 (=T. parviflora). Não pertencem ao gênero: T. gemmata Verrill, 1869, T. plana Deichmann, 1936, T. solitaria (Pourtalès, 1868) e T. nivea Deichmann, 1936. / The study of genus Thesea Duchassaing & Michelotti, 1864, was done by the examination of type material of its species. The name Thesea presents nomenclatural problems concerning the designation of type species. An identification key, illustrations, and diagnosis of validated species are given. The species are: T. antiope Bayer, 1959, T. bicolor Deichmann, 1936, T. gracilis (Gray, 1868), T. grandiflora Deichmann, 1936, T. granulosa Deichmann, 1936, T. guadalupensis Duchassaing & Michelotti, 1864, T. hebes Deichmann, 1936, T. parviflora Deichmann, 1936, T. rubra Deichmann, 1936, and T. rugosa Deichmann, 1936. Moreover, Thesea sp. is considered distinct but it has not been formally described. Synonyms: T. echinata Tixier-Durivault, 1970 (=T. bicolor), T. grandiflora rugulosa Deichmann, 1936 (=T. grandiflora), T. citrina Deichmann, 1936, and T. gracilis Deichmann, 1936 (=T. parviflora). The following species do not belong to the genus: T. gemmata Verrill, 1869, T. plana Deichmann, 1936, T. solitaria (Pourtalès, 1868) and T. nivea Deichmann, 1936.
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Efetividade de manejo de unidades de conservação costeiras: estudo de caso no litoral do Ceará (NE, Brasil)

Araruna, Rayza Ponce Leon January 2015 (has links)
ARARUNA, R. P. L. Efetividade de manejo de unidades de conservação costeiras: estudo de caso no litoral do Ceará (NE, Brasil). 2015. 111 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2015. / Submitted by Geovane Uchoa (geovane@ufc.br) on 2016-06-22T13:26:21Z No. of bitstreams: 1 2015_dis_rplararuna.pdf: 2311188 bytes, checksum: fe8cf5e448a4c99777b9874786e426ee (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2016-06-22T13:59:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_dis_rplararuna.pdf: 2311188 bytes, checksum: fe8cf5e448a4c99777b9874786e426ee (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-22T13:59:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_dis_rplararuna.pdf: 2311188 bytes, checksum: fe8cf5e448a4c99777b9874786e426ee (MD5) Previous issue date: 2015 / The human intervention causes different intensity changes in environmental systems and this often leads to degradation and burden on the environment. One of the measures employed to minimize those changes is the creation of Conservation Units. However, creating a Conservation Unit is not enough to ensure the environment protection. Therefore, the effectiveness analysis of Conservation Units is of great importance as it enables the improvement in environmental management, aiming for the effective management and the local sustainability. This work aims to analyze the management efficiency level of two Conservation Units located on the west coast of Ceará has the estuary (APA of river estuary Curu) and dunes (APA of Paracuru Dunes) like main environmental units, checking the weaknesses and potential of environmental management. Following the methodology of Cifuentes(2000), questionnaires were applied in 2014, for managers of protected areas, to assess the management effectiveness, in which ten environmental management indicators were analysed.Semi-structured interviews with the local community leaders and field visits were also conducted in the same year with a view to get additional data. The APA of Curu River estuary received a averagely satisfactory rating (54%). The following scopes received the worst rating and were considered little satisfactory: illegal use and legal use. The agriculture and civil construction works, that cause the APA considerable damage. None of the ten scopes achieved the satisfatory rating, which shows fragility in the management as a whole. The interviewed local leaders mentioned shrimp farming and sand extraction as the major threats to the APA. The APA of Paracuru dunes earned the averagely satisfactory rating (63%) and the knowledge scope achieved the highest rating, witch is satisfactory. None of the scopes achieved the unsatisfactory rating and most of them received the averagely satisfactory rating. The scope that achieved the smallest rating (not too satisfactory) was the “management programs” scope, because only a small part of the scheduled activities are performed. The interviewed local leaders mentioned slash-andburn technique, desforestation and the wind energy plant construction as the major threats to the APA. Despite the socio-environmental importance of the exisisting tropical ecosystems (dunes, mangroves, sandy beaches, etc.) and the commitment (by the managers and the involved community) to finding an effective environmental management much remains to be done so that the Conservation Units achieve and keep their environmental preservation goals. Only the creation of protected areas is not enough for environmental protection being essential the increase the availability of human and material resources, and so is promoting the shared management to improve the supervision and administration aspects of Conservation Units in the coastal zones. / A intervenção antrópica causa modificações de diferentes intensidades nos sistemas ambientais, acarretando por vezes a sobrecarga ou a degradação ambiental. Um dos mecanismos utilizados para minimizar essas modificações negativas, é a criação de Unidades de Conservação. Entretanto, somente o fato de criar uma UC não assegura a proteção do ambiente. Dessa forma, a análise da efetividade de UC’s é de grande importância, pois permite a melhoria na gestão ambiental visando o manejo efetivo e a sustentabilidade local. Esse trabalho teve como objetivo analisar o grau de efetividade de gestão de duas UCs na costa oeste do Ceará que tem o estuário (APA do estuário do rio Curu) e dunas (APA das dunas do Paracuru) como principais unidades ambientais, verificando as fragilidades e potencialidades do gerenciamento ambiental. Para avaliar a efetividade de manejo das UCs, foram aplicados, no ano de 2014, questionários com as gestoras seguindo a metodologia de Cifuentes (2000) onde foram analisados dez indicadores da gestão ambiental. Foram feitas também, no mesmo ano, visando obter dados complementares entrevistas semiestruturadas com os líderes comunitários e visitas de campo. A APA do estuário do rio Curu recebeu uma classificação de medianamente satisfatória (54%). Os âmbitos usos ilegais e usos legais tiveram a pior classificação, sendo considerados pouco satisfatórios, o que contribuiu para essa baixa classificação foram a agricultura e obras civis que causam um notável impacto na APA. Dos dez âmbitos nenhum obteve satisfatório, o que revela fragilidade na gestão como um todo. Os líderes entrevistados citaram a carcinicultura e a extração de areia como as principais ameaças que ocorrem dentro da APA. A APA das dunas do Paracuru recebeu uma classificação de medianamente satisfatória (63%). Dos dez âmbitos analisados o âmbito conhecimentos atingiu a maior classificação, ou seja, satisfatória. Nenhum atingiu a classificação de insatisfatória e a maioria recebeu a classificação de medianamente satisfatória. O âmbito que atingiu a menor classificação (pouco satisfatória) foi o “programas de gestão”, pois somente uma pequena parte das atividades programadas são executadas. Os líderes entrevistados citaram as queimadas, desmatamentos e a construção da usina eólica como as principais ameaças que ocorrem dentro da APA. Apesar da importância socioambiental dos ecossistemas tropicais existentes (dunas, manguezais, praias arenosas, etc.) e do empenho (por parte dos gestores e parte da comunidade envolvida) na busca de uma gestão ambiental efetiva ainda há muito que se fazer para que as UCs atinjam e mantenham seus objetivos de preservação ambiental. Somente a criação das Unidades de Conservação não é suficiente para a proteção ambiental, sendo fundamental aumentar a disponibilidade de recursos humanos e material, bem como promover a gestão compartilhada para melhorar aspectos do gerenciamento e fiscalização das UCs na zona costeira.
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A bifurcação da corrente do Brasil no embaiamento de Tubarão e seu papel na formação de vórtices ciclônicos

Servino, Ricardo Nogueira 13 October 2014 (has links)
Submitted by Morgana Andrade (morgana.andrade@ufes.br) on 2016-06-15T20:35:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) tese_8287_SERVINO_Dissertao_DIGITAL.pdf: 3302649 bytes, checksum: dab1f8314488f044d4ee8415c659d58b (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2016-08-16T18:22:20Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) tese_8287_SERVINO_Dissertao_DIGITAL.pdf: 3302649 bytes, checksum: dab1f8314488f044d4ee8415c659d58b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-16T18:22:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) tese_8287_SERVINO_Dissertao_DIGITAL.pdf: 3302649 bytes, checksum: dab1f8314488f044d4ee8415c659d58b (MD5) / Agência Nacional do Petróleo (ANP) / A região de transição entre a costa leste e a costa sudeste brasileira, entre 19°S e 21°S, apresenta feições geomorfológicas que caracterizam uma linha de quebra de plataforma complexa. O Banco de Abrolhos e os montes submarinos da Cadeia Vitória-Trindade (CVT) são irregularidades que promovem influências no sistema de correntes de contorno oeste local, em especial ao fluxo da Corrente do Brasil (CB), induzindo a formação de meandramentos e vórtices na região. Confinado por essas estruturas ao seu redor, o Embaiamento de Tubarão (ET) compreende uma região em frente à Vitória (20,3°S; 40,3°W) que abriga vórtices ciclônicos cuja formação foi investigada no presente trabalho como sendo influenciada por uma bifurcação da CB nesse sítio. A bifurcação de uma corrente geostrófica é um processo geofísico de interação de um jato e uma parede continental, com a consequente formação de dois jatos secundários – um em cada direção – e que pode ser responsável pela formação de vórtices em bacias parcialmente confinadas (e.g. Mar de Alborão e Mar do Japão). Esse processo foi encontrado no ET a partir de uma recorrente incidência da CB em seu talude continental, identificada com base em resultados de uma simulação numérica de alta resolução espacial e batimetria tratada. Ao que se tenha conhecimento, esta é a primeira descrição de tal processo na região. Os resultados encontrados sugerem que o jato secundário desviado para o interior do ET tenha um papel indispensável na formação e manutenção de dois tipos de vórtices ciclônicos, diferenciados entre si principalmente em tamanho, duração e período de ocorrência. As características desses vórtices e da própria bifurcação mostraram estar sensivelmente ligadas ao padrão de escoamento da CB pelos canais formados entre os montes da CVT. / The transition region from the east to the southeast Brazilian coast, between 19°S and 21°S, shows remarkable geomorphological features that characterizes a complex shelf-break line. The Abrolhos Banks and the Vitória-Trindade Ridge’s (VTR) seamounts are irregularities that promote influences on the system of western boundary currents in this region, specially to the Brazil Current (BC), inducing its meandering and the developing of eddies locally. Confined by these structures around it, the Tubarão Bight (TB) is a region in front of Vitória (20.3°S; 40.3°W) that shelters cyclonic eddies which formation was investigated in this work as influenced by a bifurcation of the BC in this site. The bifurcation of a geostrophic current is a geophysical process of interaction between a jet and a continental boundary that results in the formation of two secondary jets – one in each direction – and that can be responsible for the developing of eddies inside partially confined oceanic basins (e.g Alboran Sea and Sea of Japan). The occurrence of this process was found inside the TB following the impinging of the BC on its continental slope, identified based on numerical modelling results derived from a high-resolution and refined topography simulation. To the extent of our knowledge, this is the first description of such process in this region. This work’s findings suggest that the secondary jet deflected to the TB’s interior is necessary to the developing and maintenance of two kinds of eddies with different size, duration and date of occurrence. These eddies’ characteristics and the bifurcation’s itself were significantly linked to the flowing pattern of the BC through the VTR’s seamounts.

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