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Modelos de antedependência para avaliação genética de características longitudinais /

Araujo Neto, Francisco Ribeiro de. January 2012 (has links)
Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Lucia Galvão de Albuquerque / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Newton Tamassia Pégolo / Banca: Lenira El Faro Zadra / Resumo: Em programas de melhoramento animal, diversas características utilizadas como critérios de seleção representam medidas repetidas do mesmo animal, sendo importante o estudo de metodologias que considere esta estrutura longitudinal. Assim, o objetivo deste trabalho foi implementar a metodologia de antedependência utilizando de inferência bayesiana, na estimação de componentes de variância para avaliação genética de características longitudinais. Foram realizados dois estudos de simulação a fim de verificar as propriedades da aplicação da metodologia. Para o primeiro estudo foram considerados apenas os efeitos fixos, o genético e resíduo, sendo empregado duas estruturas de (co)variância: uma de antedependência e outra de regressão aleatória. O segundo estudo apresenta adicionalmente o efeito de ambiente permanente, sendo utilizado para ambos os efeitos aleatórios. Os resultados demonstraram que a metodologia proposta apresentou capacidade de estimar valores próximos aos simulados, entretanto alguns parâmetros dos modelos apresentaram algumas dificuldades de convergência. Verificou-se por meio do estudo realizado, que a implementação da metodologia de antedependência utilizando de inferência bayesiana e amostrador de Gibbs em um modelo animal, possibilitou a obtenção de estimativas próximas aos valores simulados. Além disso, pode-se constatar algumas dificuldades inerentes a convergência dos parâmetros do modelo, sendo necessário a realização de novos estudos visando utilizar novas funções para a modelagem dos coeficientes autorregressivos e das variâncias das inovações, assim como outras estratégias de amostragem / Abstract: In animal breeding programs, several traits used as selection criteria represent repeated measurements of the same animal, thus the study of methodologies that consider this longitudinal structure. The objective of this study was to implement a antedependence model using Bayesian inference, in the estimation of variance components for genetic evaluation of longitudinal characteristics. Two studies were conducted simulation in order to verify the properties of application of the methodology. For the first study included only fixed effects, genetic and residual, being employed two structures (co)variance: one antedependence and other random regression. The second study further shows the effect of permanent environment, and is used for both random effects. The results demonstrated that the proposed methodology showed ability to estimate values close to those simulated, however, some parameters of the models presented convergence difficulties. It was found through the study, the implementation of the methodology antedependence using Bayesian inference and Gibbs sampling in an animal model, makes possible to get estimates close to the simulated values. Moreover, one can observe some convergence difficulties of the model parameters, it is necessary to conduct new studies to use new functions for modeling the autoregressive coefficients and variances of the innovations, as well as other sampling strategies / Doutor
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Análise da evapotranspiração de referência a partir de medidas lisimétricas e ajuste estatístico de estimativas de nove equações empírico-teóricas com base na equação de Penman-Monteith / Analysis of the reference evapotranspiration from lysimetric data and statistical tuning of nine empiric equations based on the Penman-Monteith equation

Medeiros, Patrick Valverde 24 April 2008 (has links)
A quantificação da evapotranspiração é uma tarefa essencial para a determinação do balanço hídrico em uma bacia hidrográfica e para o estabelecimento do déficit hídrico de uma cultura. Nesse sentido, o presente trabalho aborda a análise da evapotranspiração de referência (ETo) para a região de Jaboticabal-SP. O comportamento do fenômeno na região foi estudado a partir da interpretação de dados de uma bateria de 12 lisímetros de drenagem (EToLis) e estimativas teóricas por 10 equações diferentes disponíveis na literatura. A análise estatística de correlação indica que as estimativas da ETo por equações teóricas comparadas à EToLis medida em lisímetro de drenagem não apresentaram bons índices de comparação e erro. Admitindo que a operação dos lisímetros não permitiu a determinação da ETo com boa confiabilidade, propôs-se um ajuste local das demais metodologias de estimativa da ETo, através de auto-regressão (AR) dos ruídos destas equações em comparação com uma média anual estimada pela equação de Penman-Monteith (EToPM), tomada como padrão, em períodos quinzenal e mensal. O ajuste através de regressão linear simples também foi analisado. Os resultados obtidos indicam que a radiação efetiva é a variável climática de maior importância para o estabelecimento da ETo na região. A estimativa pela equação de Penman-Monteith apresentou excelente concordância com as equações de Makkink (1957) e do balanço de energia. Os ajustes locais propostos apresentaram excelentes resultados para a maioria das equações testadas, dando-se destaque às equações da radiação solar FAO-24, de Makkink (1957), de Jensen-Haise (1963), de Camargo (1971), do balanço de radiação, de Turc (1961) e de Thornthwaite (1948). O ajuste por regressão linear simples é de mais fácil execução e apresentou excelentes resultados. / The quantification of the evapotranspiration is an essential task for the determination of the water balance in a watershed and for the establishment of the culture´s water deficit. Therefore, the present work describes the analysis of the reference evapotranspiration (ETo) for the region of Jaboticabal-SP. The phenomenon behavior in the region was studied based on the interpretation of 12 drainage lysimeters data (EToLis) and on theoretical estimates for 10 different equations available in the Literature. An statistical analysis indicated that the theoretical ETo estimates compared with the EToLis did not present good indices of comparison and error. Admitting that the lysimeters operation did not allow a reliable ETo determination, a local adjustment of the theoretical methodologies for ETo estimate was considered. An auto-regression (AR) of the noises of these equations in comparison with the annual average estimate for the Penman-Monteith equation (EToPM), taken as standard, has been performed in fortnightly and monthly periods. The adjustment through simple linear regression has also been analyzed. The obtained results indicate that the effective radiation is the most important climatic variable for the establishment of the ETo in the region. The Penman-Monteith estimate presented excellent correlation to the estimates by Makkink (1957) equation and the energy balance. The local adjustments presented excellent results for the majority of the tested equations, specially for the solar radiation FAO-24, Makkink (1957), Jensen-Haise (1963), Camargo (1971), radiation balance, Turc (1961) and Thornthwaite (1948) equations. The adjustment by simple linear regression is of easier execution and also presented excellent results.
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Modelos de antedependência para avaliação genética de características longitudinais

Araujo Neto, Francisco Ribeiro de [UNESP] 04 July 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-04Bitstream added on 2014-06-13T18:43:26Z : No. of bitstreams: 1 araujoneto_fr_dr_jabo.pdf: 483862 bytes, checksum: 621ba6341f8e63b31e3db9bb69db36d2 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Em programas de melhoramento animal, diversas características utilizadas como critérios de seleção representam medidas repetidas do mesmo animal, sendo importante o estudo de metodologias que considere esta estrutura longitudinal. Assim, o objetivo deste trabalho foi implementar a metodologia de antedependência utilizando de inferência bayesiana, na estimação de componentes de variância para avaliação genética de características longitudinais. Foram realizados dois estudos de simulação a fim de verificar as propriedades da aplicação da metodologia. Para o primeiro estudo foram considerados apenas os efeitos fixos, o genético e resíduo, sendo empregado duas estruturas de (co)variância: uma de antedependência e outra de regressão aleatória. O segundo estudo apresenta adicionalmente o efeito de ambiente permanente, sendo utilizado para ambos os efeitos aleatórios. Os resultados demonstraram que a metodologia proposta apresentou capacidade de estimar valores próximos aos simulados, entretanto alguns parâmetros dos modelos apresentaram algumas dificuldades de convergência. Verificou-se por meio do estudo realizado, que a implementação da metodologia de antedependência utilizando de inferência bayesiana e amostrador de Gibbs em um modelo animal, possibilitou a obtenção de estimativas próximas aos valores simulados. Além disso, pode-se constatar algumas dificuldades inerentes a convergência dos parâmetros do modelo, sendo necessário a realização de novos estudos visando utilizar novas funções para a modelagem dos coeficientes autorregressivos e das variâncias das inovações, assim como outras estratégias de amostragem / In animal breeding programs, several traits used as selection criteria represent repeated measurements of the same animal, thus the study of methodologies that consider this longitudinal structure. The objective of this study was to implement a antedependence model using Bayesian inference, in the estimation of variance components for genetic evaluation of longitudinal characteristics. Two studies were conducted simulation in order to verify the properties of application of the methodology. For the first study included only fixed effects, genetic and residual, being employed two structures (co)variance: one antedependence and other random regression. The second study further shows the effect of permanent environment, and is used for both random effects. The results demonstrated that the proposed methodology showed ability to estimate values close to those simulated, however, some parameters of the models presented convergence difficulties. It was found through the study, the implementation of the methodology antedependence using Bayesian inference and Gibbs sampling in an animal model, makes possible to get estimates close to the simulated values. Moreover, one can observe some convergence difficulties of the model parameters, it is necessary to conduct new studies to use new functions for modeling the autoregressive coefficients and variances of the innovations, as well as other sampling strategies
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Análise da evapotranspiração de referência a partir de medidas lisimétricas e ajuste estatístico de estimativas de nove equações empírico-teóricas com base na equação de Penman-Monteith / Analysis of the reference evapotranspiration from lysimetric data and statistical tuning of nine empiric equations based on the Penman-Monteith equation

Patrick Valverde Medeiros 24 April 2008 (has links)
A quantificação da evapotranspiração é uma tarefa essencial para a determinação do balanço hídrico em uma bacia hidrográfica e para o estabelecimento do déficit hídrico de uma cultura. Nesse sentido, o presente trabalho aborda a análise da evapotranspiração de referência (ETo) para a região de Jaboticabal-SP. O comportamento do fenômeno na região foi estudado a partir da interpretação de dados de uma bateria de 12 lisímetros de drenagem (EToLis) e estimativas teóricas por 10 equações diferentes disponíveis na literatura. A análise estatística de correlação indica que as estimativas da ETo por equações teóricas comparadas à EToLis medida em lisímetro de drenagem não apresentaram bons índices de comparação e erro. Admitindo que a operação dos lisímetros não permitiu a determinação da ETo com boa confiabilidade, propôs-se um ajuste local das demais metodologias de estimativa da ETo, através de auto-regressão (AR) dos ruídos destas equações em comparação com uma média anual estimada pela equação de Penman-Monteith (EToPM), tomada como padrão, em períodos quinzenal e mensal. O ajuste através de regressão linear simples também foi analisado. Os resultados obtidos indicam que a radiação efetiva é a variável climática de maior importância para o estabelecimento da ETo na região. A estimativa pela equação de Penman-Monteith apresentou excelente concordância com as equações de Makkink (1957) e do balanço de energia. Os ajustes locais propostos apresentaram excelentes resultados para a maioria das equações testadas, dando-se destaque às equações da radiação solar FAO-24, de Makkink (1957), de Jensen-Haise (1963), de Camargo (1971), do balanço de radiação, de Turc (1961) e de Thornthwaite (1948). O ajuste por regressão linear simples é de mais fácil execução e apresentou excelentes resultados. / The quantification of the evapotranspiration is an essential task for the determination of the water balance in a watershed and for the establishment of the culture´s water deficit. Therefore, the present work describes the analysis of the reference evapotranspiration (ETo) for the region of Jaboticabal-SP. The phenomenon behavior in the region was studied based on the interpretation of 12 drainage lysimeters data (EToLis) and on theoretical estimates for 10 different equations available in the Literature. An statistical analysis indicated that the theoretical ETo estimates compared with the EToLis did not present good indices of comparison and error. Admitting that the lysimeters operation did not allow a reliable ETo determination, a local adjustment of the theoretical methodologies for ETo estimate was considered. An auto-regression (AR) of the noises of these equations in comparison with the annual average estimate for the Penman-Monteith equation (EToPM), taken as standard, has been performed in fortnightly and monthly periods. The adjustment through simple linear regression has also been analyzed. The obtained results indicate that the effective radiation is the most important climatic variable for the establishment of the ETo in the region. The Penman-Monteith estimate presented excellent correlation to the estimates by Makkink (1957) equation and the energy balance. The local adjustments presented excellent results for the majority of the tested equations, specially for the solar radiation FAO-24, Makkink (1957), Jensen-Haise (1963), Camargo (1971), radiation balance, Turc (1961) and Thornthwaite (1948) equations. The adjustment by simple linear regression is of easier execution and also presented excellent results.

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