Orientador: Sandra Aidar de Queiroz / Coorientador: Roberto Carvalheiro / Banca: Fernando Sebastián Baldi Rey / Banca: Rúsbel Raúl Aspilcueta Borquis / Banca: Fernanda Brito / Banca: Fabyano Fonseca e Silva / Resumo: Esta tese compreende quatro diferentes estudos conduzidos a fim de avaliar estratégias alternativas para aumentar a eficiência de seleção genômica (GS) em programas de melhoramento animal. Um primeiro estudo foi desenvolvido com a finalidade de avaliar a performance preditiva de diferentes métodos estatísticos com base na informação de painéis de marcadores densamente distribuídos ao longo do genoma. Cinco diferentes características de uma população real de camundongos foram analisadas. Verificou-se que métodos com grandes diferenças conceituais apresentaram performance preditiva similar em algumas situações, também havendo variação na performance relativa dos métodos em função da característica analisada. O uso de diferentes variáveis resposta (pseudo-fenótipos) para estimação de efeitos de marcadores foi avaliado num segundo estudo, por meio da simulação de uma grande população de bovinos de corte, para a qual predições genômicas foram obtidas usando um procedimento de múltiplas etapas. Houve evidência de que provas desregredidas (dEBV) são mais apropriadas do que valores genéticos preditos (EBV) e médias ajustadas de desempenho da progênie (PYD), tanto para o treinamento de modelos quanto para a validação de predições genômicas. No terceiro estudo, procurou-se avaliar consequências em longo-prazo da aplicação de GS numa população de bovinos de corte sob seleção. Verificou-se grande benefício da aplicação de GS em cenários simulando seleção para características de qualidade de carne e reprodução de fêmeas. Houve evidência de que pode-se esperar maior benefício para GS, quando comparada à seleção por BLUP, no caso de características oligogênicas. Também foi possível inferir que em aplicações de GS, o uso de um critério de seleção em que se atribui maior peso a alelos favoráveis de menor frequência poderia proporcionar ... / Abstract: Improvements in production levels and product quality are needed in livestock systems to meet the growing world demand for animal-source foods. Besides this increasing demand, the productive sector must deal with constraints related to competition for land, greenhouse gas emissions and also due to hardening legislation in the fields of environment and animal welfare (FAO, 2011). In this context, animal breeding has played and will continue to play an important role to improve the efficiency of such production systems, especially in terms of competitiveness, safety, sustainability and biodiversity conservation (Harlizius et al., 2004). The main objective of animal breeding programs is to improve the performance of the next generations, through identification and reproduction of the animals with better genetic pool to efficiently produce in a specific environment (herein, superior animals). In the last decades, animal breeders succeeded in achieving this goal, mostly through the application of statistical tools grounded in quantitative genetics theory, what could be called as 'classical animal breeding'. In this case, the traditional prediction of the genetic merit of individuals (estimated breeding values, EBV) is obtained based on information of pedigree and phenotypes (own records and measures on relatives). With the advent of dense molecular marker panels, the implementation and design of breeding programs, especially in dairy cattle, had changed dramatically as a consequence of incorporating this new information to identify superior animals earlier and more precisely. Pioneer simulation studies drew attention of animal breeders to the possibility of making accurate predictions of the genetic merit of individuals by using genotypic information from dense marker panels, a process known as genomic selection (GS) (Nejati-Javaremi et al., 1997; Meuwissen et al., 2001). Other influential work ... / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-09-12Bitstream added on 2014-06-13T20:43:05Z : No. of bitstreams: 1 000736380.pdf: 3145920 bytes, checksum: eb9040463ecaf8a423ca7772cda63410 (MD5) / Esta tese compreende quatro diferentes estudos conduzidos a fim de avaliar estratégias alternativas para aumentar a eficiência de seleção genômica (GS) em programas de melhoramento animal. Um primeiro estudo foi desenvolvido com a finalidade de avaliar a performance preditiva de diferentes métodos estatísticos com base na informação de painéis de marcadores densamente distribuídos ao longo do genoma. Cinco diferentes características de uma população real de camundongos foram analisadas. Verificou-se que métodos com grandes diferenças conceituais apresentaram performance preditiva similar em algumas situações, também havendo variação na performance relativa dos métodos em função da característica analisada. O uso de diferentes variáveis resposta (pseudo-fenótipos) para estimação de efeitos de marcadores foi avaliado num segundo estudo, por meio da simulação de uma grande população de bovinos de corte, para a qual predições genômicas foram obtidas usando um procedimento de múltiplas etapas. Houve evidência de que provas desregredidas (dEBV) são mais apropriadas do que valores genéticos preditos (EBV) e médias ajustadas de desempenho da progênie (PYD), tanto para o treinamento de modelos quanto para a validação de predições genômicas. No terceiro estudo, procurou-se avaliar consequências em longo-prazo da aplicação de GS numa população de bovinos de corte sob seleção. Verificou-se grande benefício da aplicação de GS em cenários simulando seleção para características de qualidade de carne e reprodução de fêmeas. Houve evidência de que pode-se esperar maior benefício para GS, quando comparada à seleção por BLUP, no caso de características oligogênicas. Também foi possível inferir que em aplicações de GS, o uso de um critério de seleção em que se atribui maior peso a alelos favoráveis de menor frequência poderia proporcionar... / Improvements in production levels and product quality are needed in livestock systems to meet the growing world demand for animal-source foods. Besides this increasing demand, the productive sector must deal with constraints related to competition for land, greenhouse gas emissions and also due to hardening legislation in the fields of environment and animal welfare (FAO, 2011). In this context, animal breeding has played and will continue to play an important role to improve the efficiency of such production systems, especially in terms of competitiveness, safety, sustainability and biodiversity conservation (Harlizius et al., 2004). The main objective of animal breeding programs is to improve the performance of the next generations, through identification and reproduction of the animals with better genetic pool to efficiently produce in a specific environment (herein, superior animals). In the last decades, animal breeders succeeded in achieving this goal, mostly through the application of statistical tools grounded in quantitative genetics theory, what could be called as 'classical animal breeding'. In this case, the traditional prediction of the genetic merit of individuals (estimated breeding values, EBV) is obtained based on information of pedigree and phenotypes (own records and measures on relatives). With the advent of dense molecular marker panels, the implementation and design of breeding programs, especially in dairy cattle, had changed dramatically as a consequence of incorporating this new information to identify superior animals earlier and more precisely. Pioneer simulation studies drew attention of animal breeders to the possibility of making accurate predictions of the genetic merit of individuals by using genotypic information from dense marker panels, a process known as genomic selection (GS) (Nejati-Javaremi et al., 1997; Meuwissen et al., 2001). Other influential work ...

Made available in DSpace on 2015-07-13T12:10:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-12-17. Added 1 bitstream(s) on 2015-07-13T12:25:14Z : No. of bitstreams: 1 000835692.pdf: 541240 bytes, checksum: bec6b6659cf4eaceddcb3c897b0c930f (MD5) / Em bovinos da raça Brahman criados no Brasil a diversidade genética pode diminuir ao longo dos anos e pode ser ainda menor para animais estabulados, além disso, espera-se que a variância fenotípica de características reprodutivas pode ser pouco explicada pela variância genética. Portanto, objetivou-se avaliar o comportamento da diversidade genética durante um período de 18 anos e de animais estabulados por meio da análise de pedigree e estimar os parâmetros genéticos para as características idade ao primeiro parto (IPP), intervalo entre partos (IEP), reconcepção (REC) e habilidade de permanência (HABP) em bovinos da raça Brahman, visando o desenvolvimento de estratégias de seleção para o progresso genético da raça. O pedigree foi analisado de três maneiras: considerando toda a informação de pedigree (Pt); dividindo as informações de pedigree em dois períodos de 1994 a 2004 (P1) e de 2005 a 2012 (P2), de acordo com nível médio endogâmico; e dividindo os dados de pedigree de acordo com a condição de criação dos animais, a pasto (Ppasto) e estabulado (Pest). Os valores dos coeficientes endogâmicos (F) foram de 0,31%, 0,07%, 0,50%, 0,30% e 0,22% para Pt, P1, P2, Ppasto, Pest, respectivamente. Os intervalos de geração (IG) para Pt, P1, P2, Ppasto, Pest foram de 4,73, 3,35, 4,50, 4,65, 4,81 anos, respectivamente. Para os resultados dos parâmetros com base na probabilidade de origem do gene: número de fundadores (Nf), número efetivo de fundadores (fe), número efetivo de ancestrais (fa) e número efetivo de genomas remanescentes (fg), fe > fa > fg em todas as situações e ocorreu uma diminuição nos valores dos parâmetros estimados entre períodos (P1 e P2) e entre condição de criação (Ppasto e Pest). As razões fe/fa e fg/fe foram próximas de 1, indicando que não houve gargalo genético e que o processo de deriva genética foi pequeno. Para estimar os parâmetros... / The genetic diversity in Brahman cattle in Brazil may decrease over the years and can be even lower for stabled animals, moreover, it is expected that the phenotypic variance of reproductive characteristics can be little explained by genetic variance. The aims of this study were to evaluate the behavior of genetic diversity over a period of 18 years and stabled animals by pedigree analysis and estimates genetic parameters for ge at first interval (IPP), calving interval (IEP), reconception (REC) and stayability (HABP) reproductive traits of Brahman cattle in Brazil, aiming to develop selection strategies for genetic progress of breed. The pedigree was analyzed in three ways: considering all the pedigree information (Pt); dividing the pedigree information in two periods from 1994 to 2004 (P1) and from 2005 to 2012 (P2), according inbreeding; and dividing the pedigree data according to breeding management of animals on pasture (Ppasto) and stabled (Pest). Coefficient inbreeding (F) values were 0,31%, 0,07%, 0,50%, 0,30% and 0,22% for Pt, P1, P2, Ppasto, Pest, respectively. Generation intervals (IG) values for Pt, P1, P2, Ppasto, Pest were 4,73, 3,35, 4,50, 4,65, 4,81 years, respectively. For the results of the parameters based on the probability of gene origin: number of founders (Nf), effective number of founders (f e ), effective number of ancestors (f a ) and founder genome equivalents (f g ), in all situations f e > f a > f g and there was a decrease in values of estimated parameters between periods (P1 e P2) and between breeding management (Ppasto e Pest). Values close to 1 observed for f e /f a and f g /f e show no genetic bottleneck and the process of genetic drift was small. For estimate the genetic parameters for reproductive traits, two-trait analyzes were used, using the linear animal model for IEP and IPP and the animal threshold model for REC and HABP. The mean heritability were ...

Orientador: Ricardo da Fonseca / Co-orientador: Fabiana Martins Costa Maia / Banca: Claudia Maria Bertan Membrive / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Resumo: Em bovinos da raça Brahman criados no Brasil a diversidade genética pode diminuir ao longo dos anos e pode ser ainda menor para animais estabulados, além disso, espera-se que a variância fenotípica de características reprodutivas pode ser pouco explicada pela variância genética. Portanto, objetivou-se avaliar o comportamento da diversidade genética durante um período de 18 anos e de animais estabulados por meio da análise de pedigree e estimar os parâmetros genéticos para as características idade ao primeiro parto (IPP), intervalo entre partos (IEP), reconcepção (REC) e habilidade de permanência (HABP) em bovinos da raça Brahman, visando o desenvolvimento de estratégias de seleção para o progresso genético da raça. O pedigree foi analisado de três maneiras: considerando toda a informação de pedigree (Pt); dividindo as informações de pedigree em dois períodos de 1994 a 2004 (P1) e de 2005 a 2012 (P2), de acordo com nível médio endogâmico; e dividindo os dados de pedigree de acordo com a condição de criação dos animais, a pasto (Ppasto) e estabulado (Pest). Os valores dos coeficientes endogâmicos (F) foram de 0,31%, 0,07%, 0,50%, 0,30% e 0,22% para Pt, P1, P2, Ppasto, Pest, respectivamente. Os intervalos de geração (IG) para Pt, P1, P2, Ppasto, Pest foram de 4,73, 3,35, 4,50, 4,65, 4,81 anos, respectivamente. Para os resultados dos parâmetros com base na probabilidade de origem do gene: número de fundadores (Nf), número efetivo de fundadores (fe), número efetivo de ancestrais (fa) e número efetivo de genomas remanescentes (fg), fe > fa > fg em todas as situações e ocorreu uma diminuição nos valores dos parâmetros estimados entre períodos (P1 e P2) e entre condição de criação (Ppasto e Pest). As razões fe/fa e fg/fe foram próximas de 1, indicando que não houve gargalo genético e que o processo de deriva genética foi pequeno. Para estimar os parâmetros... / Abstract: The genetic diversity in Brahman cattle in Brazil may decrease over the years and can be even lower for stabled animals, moreover, it is expected that the phenotypic variance of reproductive characteristics can be little explained by genetic variance. The aims of this study were to evaluate the behavior of genetic diversity over a period of 18 years and stabled animals by pedigree analysis and estimates genetic parameters for ge at first interval (IPP), calving interval (IEP), reconception (REC) and stayability (HABP) reproductive traits of Brahman cattle in Brazil, aiming to develop selection strategies for genetic progress of breed. The pedigree was analyzed in three ways: considering all the pedigree information (Pt); dividing the pedigree information in two periods from 1994 to 2004 (P1) and from 2005 to 2012 (P2), according inbreeding; and dividing the pedigree data according to breeding management of animals on pasture (Ppasto) and stabled (Pest). Coefficient inbreeding (F) values were 0,31%, 0,07%, 0,50%, 0,30% and 0,22% for Pt, P1, P2, Ppasto, Pest, respectively. Generation intervals (IG) values for Pt, P1, P2, Ppasto, Pest were 4,73, 3,35, 4,50, 4,65, 4,81 years, respectively. For the results of the parameters based on the probability of gene origin: number of founders (Nf), effective number of founders (f e ), effective number of ancestors (f a ) and founder genome equivalents (f g ), in all situations f e > f a > f g and there was a decrease in values of estimated parameters between periods (P1 e P2) and between breeding management (Ppasto e Pest). Values close to 1 observed for f e /f a and f g /f e show no genetic bottleneck and the process of genetic drift was small. For estimate the genetic parameters for reproductive traits, two-trait analyzes were used, using the linear animal model for IEP and IPP and the animal threshold model for REC and HABP. The mean heritability were ... / Mestre

Orientador: Josineudson Augusto II de Vasconcelos Silva / Coorientador: Fábio Morato Monteiro / Banca: Lenira El Faro Zadra / banca: André Michel de Castilhos / Resumo: O maior custo da produção de bovinos de corte é a alimentação, para isto tem se estudado melhorar a eficiência alimentar com maior ênfase na característica consumo alimentar residual (CAR), mas se faz necessário conhecer a relação desta com a fertilidade dos touros utilizados em programas de melhoramento genético. O objetivo do presente estudo foi avaliar touros jovens da raça Nelore, classificados em baixo e alto CAR e seus parâmetros reprodutivos. Foram utilizados 946 touros do programa de melhoramento Nelore Qualitas, participantes dos testes de eficiência alimentar nos anos de 2010 a 2017. As imagens termográficas e ultrassonográficas dos testículos foram realizadas em 114 animais ao final do teste do ano de 2017, e as avalições andrológicas foram realizadas em 54 animais dos testes de 2011 a 2015, na Central de reprodução Alta Genetics e 29 animais do teste de 2016 e 2017, na Central Bela Vista. A divisão dos animais em baixo e alto CAR, foi dentro de ano de prova e considerando os participantes que tinham valores acima da média do CAR mais (baixo) ou menos (alto) meio desvio padrão. O peso final (PESOF), peso metabólico (PMET) e ganho médio diário (GMD) não apresentaram diferença quando comparados nos grupos divergentes de CAR (GCAR). A temperatura da parte superior (TEMP_SUP) dos testículos apresentou diferença entre os GCAR e, a temperatura inferior (TEMP_INF) dos testículos, bem como o gradiente de temperatura do escroto (GTE) não apresentaram diferença. Nas imagens ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / The highest cost of beef cattle producing is the feed, for this has been studied to improve feed efficiency with a greater emphasis on the characteristic residual feed intake (RFI), but it is necessary to know the relationship of this with the fertility of the bulls used in programs genetic improvement. The objective of the present study was to evaluate efficient and non-efficient Nelore bulls and their reproductive parameters. A total 946 bulls were used from the Nelore Qualitas breeding program, participants in feed efficiency tests from 2010 to 2017. Thermographic and ultrasonographic images of the testicles were performed in 114 animals at the end of 2017 test, and andrological evaluations were performed in 54 animals from the tests of 2011 to 2015, in the Center of reproduction Alta Genetics, and 29 animals of the test of 2016 and 2017, in Central Bela Vista. The division of the animals into low and high RFI, was within the year of test and considering the participants who had values above the average of the RFI more (low) or less (high) half standard deviation. The final body weight (FBW), metabolic body weight (MBW) and average daily gain (ADG) didn't present statistical difference when compared in the divergent groups of RFI (GRFI). The upper temperature (TEMP_UP) of the testicles showed a significant difference between the GRFI and, the bottom temperature (TEMP_BO) of the testicles, as well as the temperature gradient of the scrotum (TGE) didn't present statistical difference. In the ultrasound images the pixel intensity (PI) and the andrological evaluations using motility (MOT), vigor (VIG), concentration (CONC), major defects (MAD), minor defects (MID) total defects (TOD), didn't present significance between the GRFI. The TEMP_UP and TEMP_BO had significant correlations wi... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Lucia Galvão de Albuquerque / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Newton Tamassia Pégolo / Banca: Lenira El Faro Zadra / Resumo: Em programas de melhoramento animal, diversas características utilizadas como critérios de seleção representam medidas repetidas do mesmo animal, sendo importante o estudo de metodologias que considere esta estrutura longitudinal. Assim, o objetivo deste trabalho foi implementar a metodologia de antedependência utilizando de inferência bayesiana, na estimação de componentes de variância para avaliação genética de características longitudinais. Foram realizados dois estudos de simulação a fim de verificar as propriedades da aplicação da metodologia. Para o primeiro estudo foram considerados apenas os efeitos fixos, o genético e resíduo, sendo empregado duas estruturas de (co)variância: uma de antedependência e outra de regressão aleatória. O segundo estudo apresenta adicionalmente o efeito de ambiente permanente, sendo utilizado para ambos os efeitos aleatórios. Os resultados demonstraram que a metodologia proposta apresentou capacidade de estimar valores próximos aos simulados, entretanto alguns parâmetros dos modelos apresentaram algumas dificuldades de convergência. Verificou-se por meio do estudo realizado, que a implementação da metodologia de antedependência utilizando de inferência bayesiana e amostrador de Gibbs em um modelo animal, possibilitou a obtenção de estimativas próximas aos valores simulados. Além disso, pode-se constatar algumas dificuldades inerentes a convergência dos parâmetros do modelo, sendo necessário a realização de novos estudos visando utilizar novas funções para a modelagem dos coeficientes autorregressivos e das variâncias das inovações, assim como outras estratégias de amostragem / Abstract: In animal breeding programs, several traits used as selection criteria represent repeated measurements of the same animal, thus the study of methodologies that consider this longitudinal structure. The objective of this study was to implement a antedependence model using Bayesian inference, in the estimation of variance components for genetic evaluation of longitudinal characteristics. Two studies were conducted simulation in order to verify the properties of application of the methodology. For the first study included only fixed effects, genetic and residual, being employed two structures (co)variance: one antedependence and other random regression. The second study further shows the effect of permanent environment, and is used for both random effects. The results demonstrated that the proposed methodology showed ability to estimate values close to those simulated, however, some parameters of the models presented convergence difficulties. It was found through the study, the implementation of the methodology antedependence using Bayesian inference and Gibbs sampling in an animal model, makes possible to get estimates close to the simulated values. Moreover, one can observe some convergence difficulties of the model parameters, it is necessary to conduct new studies to use new functions for modeling the autoregressive coefficients and variances of the innovations, as well as other sampling strategies / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-16Bitstream added on 2014-06-13T18:29:30Z : No. of bitstreams: 1 guidolin_dgf_me_jabo.pdf: 239613 bytes, checksum: 25503ca97d099f8707e7f0c6cd325324 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A identificação de interação genótipo-ambiente em bovinos de corte pode auxiliar o processo de seleção, aumentando a eficiência da avaliação genética de reprodutores submetidos à ambientes distintos. Características medidas pós-desmame estão mais sujeitas aos efeitos da interação genótipoambiente do que na fase pré-desmame. Assim, o objetivo deste trabalho foi verificar a existência do efeito da interação genótipo-ambiente sobre os pesos corporais aos 365 (P365), 450 (P450) e aos 550 (P550) dias de idade de bovinos Nelore criados nos estados de Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerais, Pará e São Paulo. Os componentes de (co)variância, parâmetros genéticos e os valores genéticos preditos foram estimados para cada característica, por estado e para o conjunto total de dados, pelo método da máxima verossimilhança restrita. Correlações de Spearman entre as classificações dos touros por estado quanto ao valor genético para cada característica ou considerando cada estado individualmente e em conjunto (todos os estados), assim como a correlação genética entre observações da mesma característica, medida em dois estados distintos foram utilizadas para avaliar o efeito da interação genótipo-ambiente sobre as características estudadas. Correlações de Spearman não significativas indicaram mudança de posição na classificação de touros e conseqüente existência de interação genótipo-ambiente. A ocorrência desta interação também foi constatada em algumas ocasiões por estimativas de correlação genética entre observações da mesma característica em estados diferentes, para P365 foi observada indícios de interação entre SP e GO (0,71), SP e MT (0,68) e também entre SP e PA (-0,11), para P450, MT e MG (-0,28), GO e PA (0,62) e SP e PA (0,66), para a característica P550, MT e MG (-0,38), MG e PA (0,73), MG e SP (-0,34) e para... / The properly identification of genotype-environment interaction in beef cattle herds can help the selection process and improve genetic evaluation of sires submitted in different environments. Post weaning traits may be more influenced by the genotype-environment interactions than others. So, this paper objective was verify genotype-environment interaction in, beef cattle, body weight at 365 (P365), 450 (P450) and 550 (P550) days of age in herds distributed in six Brazilian states, Goiás (GO), Mato Grosso (MT), Mato Grosso do Sul (MS), Minas Gerais (MG), Pará (PA) and São Paulo (SP). Genetic parameters, (co)variance components and genetic values were estimated for each trait, each state and for all states together, using maximum restricted likelihood method. Spearman correlations among sire’s classifications due to its genetic value, for each trait, by state individually or in group (using data from all states), genetic correlation between the same trait measured in two different states were used to evaluate genetic-environment interaction over the traits studied. Non significant Spearman’s correlation indicated position changes at sires classification and consequently genotype-environment interaction. This interaction occurrence was also observed between genetic correlations of the same trait measured in two different states. Genetic correlation for P365, between SP and GO states were (0, 71), SP and MT (0, 68) and also between SP and PA (-0, 11). For P450, MT and MG (-0, 28), GO and PA (0, 62) and SP and PA (0, 66). P550, MT and MG (-0, 38), MG and PA (0, 73), MG and SP (-0, 34) and SP and PA (-0, 86). There so, selection conduced considering data obtained in one state could be different than one based in others. Beef cattle summary organized by state would be indicated if this one would be economically viable.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-04Bitstream added on 2014-06-13T18:43:26Z : No. of bitstreams: 1 araujoneto_fr_dr_jabo.pdf: 483862 bytes, checksum: 621ba6341f8e63b31e3db9bb69db36d2 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Em programas de melhoramento animal, diversas características utilizadas como critérios de seleção representam medidas repetidas do mesmo animal, sendo importante o estudo de metodologias que considere esta estrutura longitudinal. Assim, o objetivo deste trabalho foi implementar a metodologia de antedependência utilizando de inferência bayesiana, na estimação de componentes de variância para avaliação genética de características longitudinais. Foram realizados dois estudos de simulação a fim de verificar as propriedades da aplicação da metodologia. Para o primeiro estudo foram considerados apenas os efeitos fixos, o genético e resíduo, sendo empregado duas estruturas de (co)variância: uma de antedependência e outra de regressão aleatória. O segundo estudo apresenta adicionalmente o efeito de ambiente permanente, sendo utilizado para ambos os efeitos aleatórios. Os resultados demonstraram que a metodologia proposta apresentou capacidade de estimar valores próximos aos simulados, entretanto alguns parâmetros dos modelos apresentaram algumas dificuldades de convergência. Verificou-se por meio do estudo realizado, que a implementação da metodologia de antedependência utilizando de inferência bayesiana e amostrador de Gibbs em um modelo animal, possibilitou a obtenção de estimativas próximas aos valores simulados. Além disso, pode-se constatar algumas dificuldades inerentes a convergência dos parâmetros do modelo, sendo necessário a realização de novos estudos visando utilizar novas funções para a modelagem dos coeficientes autorregressivos e das variâncias das inovações, assim como outras estratégias de amostragem / In animal breeding programs, several traits used as selection criteria represent repeated measurements of the same animal, thus the study of methodologies that consider this longitudinal structure. The objective of this study was to implement a antedependence model using Bayesian inference, in the estimation of variance components for genetic evaluation of longitudinal characteristics. Two studies were conducted simulation in order to verify the properties of application of the methodology. For the first study included only fixed effects, genetic and residual, being employed two structures (co)variance: one antedependence and other random regression. The second study further shows the effect of permanent environment, and is used for both random effects. The results demonstrated that the proposed methodology showed ability to estimate values close to those simulated, however, some parameters of the models presented convergence difficulties. It was found through the study, the implementation of the methodology antedependence using Bayesian inference and Gibbs sampling in an animal model, makes possible to get estimates close to the simulated values. Moreover, one can observe some convergence difficulties of the model parameters, it is necessary to conduct new studies to use new functions for modeling the autoregressive coefficients and variances of the innovations, as well as other sampling strategies

Resumo: A identificação de interação genótipo-ambiente em bovinos de corte pode auxiliar o processo de seleção, aumentando a eficiência da avaliação genética de reprodutores submetidos à ambientes distintos. Características medidas pós-desmame estão mais sujeitas aos efeitos da interação genótipoambiente do que na fase pré-desmame. Assim, o objetivo deste trabalho foi verificar a existência do efeito da interação genótipo-ambiente sobre os pesos corporais aos 365 (P365), 450 (P450) e aos 550 (P550) dias de idade de bovinos Nelore criados nos estados de Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerais, Pará e São Paulo. Os componentes de (co)variância, parâmetros genéticos e os valores genéticos preditos foram estimados para cada característica, por estado e para o conjunto total de dados, pelo método da máxima verossimilhança restrita. Correlações de Spearman entre as classificações dos touros por estado quanto ao valor genético para cada característica ou considerando cada estado individualmente e em conjunto (todos os estados), assim como a correlação genética entre observações da mesma característica, medida em dois estados distintos foram utilizadas para avaliar o efeito da interação genótipo-ambiente sobre as características estudadas. Correlações de Spearman não significativas indicaram mudança de posição na classificação de touros e conseqüente existência de interação genótipo-ambiente. A ocorrência desta interação também foi constatada em algumas ocasiões por estimativas de correlação genética entre observações da mesma característica em estados diferentes, para P365 foi observada indícios de interação entre SP e GO (0,71), SP e MT (0,68) e também entre SP e PA (-0,11), para P450, MT e MG (-0,28), GO e PA (0,62) e SP e PA (0,66), para a característica P550, MT e MG (-0,38), MG e PA (0,73), MG e SP (-0,34) e para... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The properly identification of genotype-environment interaction in beef cattle herds can help the selection process and improve genetic evaluation of sires submitted in different environments. Post weaning traits may be more influenced by the genotype-environment interactions than others. So, this paper objective was verify genotype-environment interaction in, beef cattle, body weight at 365 (P365), 450 (P450) and 550 (P550) days of age in herds distributed in six Brazilian states, Goiás (GO), Mato Grosso (MT), Mato Grosso do Sul (MS), Minas Gerais (MG), Pará (PA) and São Paulo (SP). Genetic parameters, (co)variance components and genetic values were estimated for each trait, each state and for all states together, using maximum restricted likelihood method. Spearman correlations among sire's classifications due to its genetic value, for each trait, by state individually or in group (using data from all states), genetic correlation between the same trait measured in two different states were used to evaluate genetic-environment interaction over the traits studied. Non significant Spearman's correlation indicated position changes at sires classification and consequently genotype-environment interaction. This interaction occurrence was also observed between genetic correlations of the same trait measured in two different states. Genetic correlation for P365, between SP and GO states were (0, 71), SP and MT (0, 68) and also between SP and PA (-0, 11). For P450, MT and MG (-0, 28), GO and PA (0, 62) and SP and PA (0, 66). P550, MT and MG (-0, 38), MG and PA (0, 73), MG and SP (-0, 34) and SP and PA (-0, 86). There so, selection conduced considering data obtained in one state could be different than one based in others. Beef cattle summary organized by state would be indicated if this one would be economically viable. / Orientador: João Ademir de Oliveira / Coorientador: Danísio Prado Munari / Coorientadora: Cládudia Cristina Paro de Paz / Banca: Sandra Aidar de Queiroz / Banca: Ruy Alberto Caetano Correa Filho / Mestre