Orientador : Dr. Jean Ricardo Simões Vitule / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Conservação. Defesa: Curitiba, 09/08/2016 / Inclui referências : f. 51-63;175-186 / Área de concentração / Resumo: O conhecimento sobre a avifauna no sul da Floresta Atlântica vem sendo acumulado por meio da reunião de informações provenientes das mais diversas fontes. Dados disponíveis em publicações e museus e, mais recentemente, produzidos pela Ciência Cidadã (CC) contribuem para que a avifauna desta região seja uma das mais bem conhecidas do Brasil. Por meio de informações acumuladas ao longo do tempo são descritas alterações na comunidade de aves que estão levando à substituição de espécies raras e especializadas por espécies generalistas. Este processo, que leva à homogeneização biótica, tem sido acelerado pela intensa substituição dos ambientes naturais por ambientes antropogênicos. Considerando a necessidade de uma avaliação qualitativa e quantitativa sobre a composição e estrutura da avifauna no sul da Floresta Atlântica para o entendimento dos processos que levam a homogeneização biótica i) consolidamos uma lista geral atualizada das aves com ocorrência no estado do Paraná; ii) identificamos espécies extintas, invasoras, colonizadoras recentes e indicadoras de cada tipologia vegetal; iii) avaliamos o grau de conhecimento sobre a avifauna entre diferentes regiões do estado e o efeito da inclusão de dados da CC sobre este conhecimento; iv) avaliamos como a composição da avifauna variou ao longo período de tempo e como e quanto esta variação afetou a similaridade entre diferentes tipologias vegetais; e v) avaliamos o papel de espécies invasoras nativas, invasoras não-nativas, colonizadoras recentes e de espécies extintas no processo de homogeneização. Foram obtidos 149.814 registros de 766 espécies, 70.346 registros de fontes tradicionais de informação c 79.468 da ciência cidadã. Os dados da ciência cidadã apresentaram um importante papel na caracterização da avifauna paranaense, contribuindo de forma significativa para o aumento do conhecimento sobre este grupo em todas as regiões do estado. Ainda, os dados mostram de forma clara um crescente e complexo processo de homogeneização. Tal processo pode ser associado à ampliação das populações de espécies adaptadas ou tolerantes a áreas alteradas e à redução das populações de espécies florestais. Os resultados ressaltam, também, que comunidades com aparente estabilidade ou aumento local na riqueza de espécies podem mascarar mudanças em suas composições que estão levando à homogeneização biótica. / Abstract: Information on bird species composition in the southern Atlantic Forest is available from several published sources. Data from traditional publishing, from museums, and, recently, from Citizen Science (CS) contributes to the Paraná avifauna being one of the most known of Brazil. Through this information accumulated over time are described changes in the bird community that are leading to the substitution of rare and specialized species by generalist species. This process, which leads to biotic homogenization, is accelerated by the intense replacement of natural habitats by disturbed habitats. Considering the need for a qualitative and quantitative assessment of the bird communities in the south of the Atlantic Forest for the understanding of the processes that lead to biotic homogenization i) we consolidate an unified and updated list of the bird species that occurs in Paraná; ii) we identified extinct species, invasive species, recently-colonizing species and indicators species of each vegetation types that occurs in Paraná; iii) we evaluated the avifaunal knowledge level within geopolitical regions of the state, and we evaluated the effect of including CS data on the avifaunal knowledge level; iv) we evaluated how the bird communities varies over time and how this variation affected the similarity between different vegetation types; and v) we evaluate the role of native invasive species, non-native invasive species, recently-colonizing species and extinct species in the homogenization process. We have compiled data on 766 bird species, based on 70,346 individual records from traditional sources, and 79,468 from CS. The CS data had an important role in the characterization of Paraná avifauna, contributing significantly to the increase of knowledge about this group in all regions of the state. Furthermore, the data show clearly an increasingly complex process of homogenization. This process can be associated with the expansion of populations of bird species adapted or tolerant to disturbed areas and the reduction of populations of forest bird species. The results also unveil that communities with apparent stability or local increase in species richness may mask changes in their compositions that are leading to biotic homogenization

Orientador : Dr. Nei Moreira / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia. Defesa: Curitiba, 29/09/2016 / Inclui referências : f. 23-24;44-46;65-68;78-80 / Area de concentração: Zoologia / Resumo: O guará (Eudocimus ruber) é uma ave da família Threskiornithidae que ocupa ambientes aquáticos, no Brasil principalmente no manguezal. A espécie ocorre no Brasil, Colômbia, Venezuela, Trinidad, Suriname e Equador, porém na década de 70 sofreu um forte declínio populacional nos estados do sul e sudeste do Brasil (São Paulo, Rio de Janeiro, Paraná e Santa Catarina). No estado de Santa Catarina a espécie permaneceu próximo há 150 anos sem documentação. A partir de década de 1990 alguns indivíduos foram observados com maior frequência no litoral do estado de São Paulo, inclusive com a observação de ninhos e filhotes. Ao longo dos anos, a espécie começou a reaparecer nos estados onde anteriormente era observada, como Paraná, no ano de 2008. Em 2011 alguns indivíduos foram observados no norte de Santa Catarina, e na sequência alguns ninhos foram observados. Este estudo acompanha este processo de reaparecimento da espécie no litoral norte do Estado de Santa Catarina, ao longo de três anos consecutivos (2012 a 2014). Foram realizadas estimativas populacionais da espécie ao longo de três anos, assim como mapeamento das áreas de maior concentração da espécies no estuário da Babitonga. Também foram monitorados ninhos e filhotes, assim como coletados dados da dieta dos filhotes. Os resultados mostram um crescimento anual expressivo, de 7-10 indivíduos, para aproximadamente 600 em três anos. As porções mais internas do estuário são intensamente utilizadas, principalmente pela facilidade ao recurso alimentar. Ninhos monitorados na ilha Jarivatuba veem aumentando anualmente, contribuindo para aumento no número de indivíduos. A espécie vem reproduzindo com sucesso na região, mas depende de locais protegidos, pois a colônia reprodutiva vem ocupando cada vez áreas maiores. A presença da colônia reprodutiva na região e o crescimento no número de indivíduos traz esperança que esta espécie volte a ser comum na costa sul e sudeste do Brasil. Inclusive possa voltar a ocupar municípios mais ao sul do estado de Santa Catarina. Palavras-Chave: reaparecimento, reprodução, perspectivas. / Abstract: The scarlet ibis (Eudocimus ruber) is a bird of the family Threskiornithidae that inhabits aquatic environments, mainly mangrove areas in Brazil. The species occurs in Brazil, Colombia, Venezuela, Trinidad, Suriname and Ecuador, but in the 1970s a strong population decline were observed in southern and southeastern Brazilian coast. In Santa Catarina, the species has remained undocumented for 150 years. In 1990s decade, some individuals were observed on the coast of the State of São Paulo, including the observation of nests and offsprings. Over the last years, the species began to re-appear in locals where it was previously observed, such as the State of Paraná in 2008. In 2011, some individuals were observed in the north of Santa Catarina, incuding some nests. This study aimed to investigate this process of reappearance of the scarlet ibis in the northern coast of Santa Catarina, during three consecutive years (2012 to 2014). Population estimates over three years were performed, along with the mapping of the areas of high concentration of the species in the Babitonga estuary. In addition, nests and offsprings s were monitored and the diet of offsprings were described t. Results show an expressive annual growth, from 7-10 individuals, to approximately 600 individuals in three years. Inner areas of the estuary were extensively used, probably because of the large amount of feeding resources. Nests monitored on Jarivatuba Island increased annually, contributing to a raise in the number of individuals. The species has been reproducing successfully in the region, but it depends on protected sites, since the reproductive colony had been occupying larger areas. The presence of the reproductive colony in the region and the growth in the number of individuals brings hope that this species will once again be common on the south and southeast coast of Brazil. Keywords: return, reproduction, increase

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-09-08Bitstream added on 2014-06-13T18:40:09Z : No. of bitstreams: 1 dalbeto_ac_me_botib.pdf: 512250 bytes, checksum: 74cf55a9258484f70078078b132aeb9a (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Este estudo teve como objetivo analisar as comunidades de aves em duas variáveis topográficas de 480m Porção Norte (PN) e 520m Porção Sul (PS) na Estação Ecológicas dos Caetetus, verificando assim, suas relações ecológicas quanto a composição de espécies, abundância, estrutura trófica e estratificação da avifauna, bem como testar se há variações na detecção de espécies e indivíduos em períodos diferentes em dois períodos do dia (manhã e tarde) e do ano, sendo o período chuvoso (dezembro de 2007 a abril 2008) e seco (maio a setembro de 2008). O estudo ocorreu entre os meses de dezembro de 2007 a janeiro de 2008, utilizou-se o método de Ponto de Escuta. O levantamento quantitativo registrou 125 espécies para PN e 156 espécies para PS. O Índice Pontual de abundância variou de 0,008 (1 contato) a 0,87 (210 contatos) na PN e de 0,004 (1 contato) a 0,91 (219 contatos) na PS. A diversidade para PN foi de = 3,76 e para PS H’ = 2,68. A comunidade de aves mostrou o mesmo padrão encontrado em outros fragmentos florestais de mata estacional semidecidual. Os insetívoros foram a categoria mais representativa, sendo a família Tyrannidae a que mais se destacou nas duas porções. As diferenças encontradas entre as duas porções foram resultantes das características da vegetação que garantiram boa parte das espécies exclusivas na PS, o que indica a forte influência da vegetação nas aves. O estudo da influencia do dia, mostrou os dados apóiam a idéia de maior atividade das aves se dá durante a manhã, sendo este período responsável pelo registro significativo de mais espécies e indivíduos. Já a analise da influência do regime de chuvas na EECa não influenciou a distribuição das aves / This study it had as objective to analyze the communities of birds in two topographical variable of 480m Porção Norte (PN) and 520m Porção Sul (PS) in the ecological Station Ecological of the Caetetus, thus verifying, its relations how much the species composition, abundance, structures of guildas and stratification of avifauna, as well as testing if it has variations in the species detention and individuals in different periods in two periods of the day (morning and late) and of the year, being the rainy period (December of 2007 April 2008) and dry (May the September of 2008). The study the January of 2008 occurred enters the months of December of 2007, used the method of Point of Listening. The quantitative survey registered 125 species for PN and 156 species for PS. The Prompt Index of abundance varied of 0,008 (1 contact) the 0,87 (210 contacts) in the PN and of 0,004 (1 contact) the 0.91 (219 contacts) in the PS. The diversity for PN was of = 3,76 and for PS H' = 2,68. The community of birds the same showed standard found in other forest fragmentos of semidecidual estacional bush. The insetívoros had been the category most representative, being the Tyrannidae family the one that more was distinguished in the two portions. The differences found between the two portions had been resultant of the characteristics of the vegetation that had guaranteed good part of the exclusive species in the PS, what it indicates the strong influence of the vegetation in the birds. The study of it influences of the day, it showed the data support the idea of bigger activity of the birds if of the one during the morning, being this responsible period for the significant register of more species and individuals. Already it analyzes it of the influence of the rain regimen in the EECa did not influence the distribution of the birds

Orientador: Reginaldo José Donatelli / Banca: Fátima do Rosário N. Knoll / Banca: Carolina Demetrio Ferreira / Resumo: Este estudo teve como objetivo analisar as comunidades de aves em duas variáveis topográficas de 480m Porção Norte (PN) e 520m Porção Sul (PS) na Estação Ecológicas dos Caetetus, verificando assim, suas relações ecológicas quanto a composição de espécies, abundância, estrutura trófica e estratificação da avifauna, bem como testar se há variações na detecção de espécies e indivíduos em períodos diferentes em dois períodos do dia (manhã e tarde) e do ano, sendo o período chuvoso (dezembro de 2007 a abril 2008) e seco (maio a setembro de 2008). O estudo ocorreu entre os meses de dezembro de 2007 a janeiro de 2008, utilizou-se o método de Ponto de Escuta. O levantamento quantitativo registrou 125 espécies para PN e 156 espécies para PS. O Índice Pontual de abundância variou de 0,008 (1 contato) a 0,87 (210 contatos) na PN e de 0,004 (1 contato) a 0,91 (219 contatos) na PS. A diversidade para PN foi de = 3,76 e para PS H' = 2,68. A comunidade de aves mostrou o mesmo padrão encontrado em outros fragmentos florestais de mata estacional semidecidual. Os insetívoros foram a categoria mais representativa, sendo a família Tyrannidae a que mais se destacou nas duas porções. As diferenças encontradas entre as duas porções foram resultantes das características da vegetação que garantiram boa parte das espécies exclusivas na PS, o que indica a forte influência da vegetação nas aves. O estudo da influencia do dia, mostrou os dados apóiam a idéia de maior atividade das aves se dá durante a manhã, sendo este período responsável pelo registro significativo de mais espécies e indivíduos. Já a analise da influência do regime de chuvas na EECa não influenciou a distribuição das aves / Abstract: This study it had as objective to analyze the communities of birds in two topographical variable of 480m Porção Norte (PN) and 520m Porção Sul (PS) in the ecological Station Ecological of the Caetetus, thus verifying, its relations how much the species composition, abundance, structures of guildas and stratification of avifauna, as well as testing if it has variations in the species detention and individuals in different periods in two periods of the day (morning and late) and of the year, being the rainy period (December of 2007 April 2008) and dry (May the September of 2008). The study the January of 2008 occurred enters the months of December of 2007, used the method of Point of Listening. The quantitative survey registered 125 species for PN and 156 species for PS. The Prompt Index of abundance varied of 0,008 (1 contact) the 0,87 (210 contacts) in the PN and of 0,004 (1 contact) the 0.91 (219 contacts) in the PS. The diversity for PN was of = 3,76 and for PS H' = 2,68. The community of birds the same showed standard found in other forest fragmentos of semidecidual estacional bush. The insetívoros had been the category most representative, being the Tyrannidae family the one that more was distinguished in the two portions. The differences found between the two portions had been resultant of the characteristics of the vegetation that had guaranteed good part of the exclusive species in the PS, what it indicates the strong influence of the vegetation in the birds. The study of it influences of the day, it showed the data support the idea of bigger activity of the birds if of the one during the morning, being this responsible period for the significant register of more species and individuals. Already it analyzes it of the influence of the rain regimen in the EECa did not influence the distribution of the birds / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-09-23Bitstream added on 2014-06-13T19:39:31Z : No. of bitstreams: 1 ovinha_fam_me_botib.pdf: 1308319 bytes, checksum: aaa6cbf7c42422d7a652e2a3d3f4538a (MD5) / A fragmentação florestal é uma das principais causas do declínio da biodiversidade mundial. Assim, o presente estudo teve como objetivo analisar a estrutura das comunidades de aves de dois fragmentos florestais no interior paulista através de levantamentos quali-quantitativos - a Mata dos Maias (MM - 350 ha) e a Mata do Instituto de Zootecnia (MIZ – 250 ha). O levantamento qualitativo foi realizado através de caminhadas nos fragmentos e áreas adjacentes. Para o levantamento quantitativo foi utilizada a metodologia de pontos de contagem com distância ilimitada. Foram registradas 151 espécies de aves na MM e 162 na MIZ, durante o período de janeiro a dezembro de 2010. A maior parte da avifauna apresentou frequência de ocorrência de até 50%. Foram registradas seis espécies ameaçadas e sete quase ameaçadas para o estado de São Paulo. Os resultados do índice pontual de abundância (IPA) indicam um padrão já conhecido, no qual poucas espécies ocorrem com abundância relativa alta e a maioria das espécies apresenta abundância relativa de média a baixa. O índice de diversidade foi de H’= 3,36 na MM e H’= 3,46 na MIZ. Estes valores encontram-se dentro dos padrões observados em outros levantamentos em áreas fragmentadas do interior paulista. A distribuição das categorias alimentares seguiu o padrão para matas da região tropical, com maior porcentagem de aves insetívoras. O atual panorama da fragmentação florestal do estado de São Paulo e os resultados obtidos neste trabalho apontam a importância dos fragmentos para a conservação das biodiversidades locais / Forest fragmentation is one of the main cause of biodiversity loss world-wide. Thus, this study aimed to analyse the structure of birds communities in two forest fragments in São Paulo state through qualitative and quantitative surveys – the Mata dos Maias (MM – 350 ha) and The Forest of the Instituto de Zootecnia (MIZ – 250 ha). The qualitative survey was made by walking in fragments and adjacent areas. For the quantitative survey we used the point counts with unlimited distance methodology. We recorded 151 bird species in the MM and 162 in the MIZ during the period of January to December 2010. Most of the birds showed occurrence frequency of up to 50%. Were recorded six endangered species and seven almost threatened for São Paulo state. The results of abundance index values (IPA) indicate a familiar pattern, in which few species occur in high relative abundance and a large number of species with intermediate and low rates. The diversity index was H’= 3.36 in MM and H’= 3.46 in the MIZ. These values are within the patterns observed in other surveys in fragmented areas of São Paulo state. The distribution of food items followed the pattern for tropical forest regions, with the highest percentage of insectivorous birds. The current panorama of forest fragmentation in São Paulo state and the results of this study indicate the importance of the fragments on conservation of local biodiversity

Orientador: Adriane Pinto Wasko / Coorientador: Mercival Roberto Francisco / Coorientador: Luis Fábio Silveira / Banca: Cristina Yumi Miyaki / Banca: Ricardo Belmonte-Lopes / Resumo: Populações pequenas são mais susceptíveis aos efeitos causados por deriva genética e endocruzamento o que, geralmente, está associado à perda de variabilidade genética. Baixos níveis de diversidade genética podem resultar em drásticas consequências nos indivíduos, como alterações nas taxas de fertilidade e capacidade de se adaptar a mudanças ambientais. Embora estes fatores possam elevar o risco de extinção, o fluxo gênico pode balancear estes efeitos, mantendo a variabilidade genética e diminuindo a divergência entre populações. Deste modo, conhecer as características genéticas intra e interpopulacionais é essencial quando se trata da conservação de espécies ameaçadas. Marcadores moleculares, como microssatélites e SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), são importantes ferramentas para acessar níveis de variabilidade genética e padrões de fluxo gênico em populações e vêm sendo amplamente utilizados em espécies alvo de programas de conservação. O bicudinho-do-brejo-paulista (Formicivora paludicola) é uma pequena ave restrita a brejos da Mata Atlântica que foi recentemente descrita na região metropolitana da cidade de São Paulo. Ocorre em 15 localidades isoladas situadas nas bacias do Alto Tietê e do rio Paraíba do Sul e, especialmente devido à destruição do seu hábitat, já está classificada como "Criticamente em Perigo" no estado de São Paulo. Ações prioritárias para a conservação da espécie incluem estudos genéticos para estabelecer o monitoramento e o manejo das populações naturais. Visto isso, o presente trabalho teve como objetivo avaliar os níveis de variabilidade genética e os padrões de fluxo gênico de duas populações de bicudinho-do-brejo-paulista, visando fornecer subsídios para futuras estratégias de conservação a serem desenvolvidas para a espécie. Para tanto, foram analisados 9 loci de microssatélites espécie-específicos e ... / Abstract: Small populations are more susceptible to genetic drift and inbreeding effects which, generally, can be associated to loss of genetic variability. Low levels of genetic diversity can result in severe effects in the individuals, as fertility alterations and capability of adaption to environmental changes. Although these factors can, in turn, increase the risk of extinction, gene flow may balance these effects, maintaining the genetic variability and reducing genetic divergences among populations. Therefore, it is essential to understand intra and inter population genetic data, in order to conserve threatened species. Molecular markers, such as microsatellites and SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), are reliable tools for assessing levels of genetic variability and patterns of gene flow in populations and have been widely used to analyze target species on conservation programs. The São Paulo marsh antwren (Formicivora paludicola) is a small bird restricted to marshes of Atlantic Forest that was recently described in the metropolitan region of São Paulo city. It occurs in 15 isolated localities spread on High Tietê and Paraíba do Sul River basins and, especially due to its habitat destruction, it is already considered as "Critically Endangered" in São Paulo State. Priorities actions for this species' conservation include genetic studies to establish the monitoring and management of natural populations. Therefore, the present study aimed to evaluate the genetic variability levels and the gene flow patterns of two populations of F. paludicola in order to support future conservation strategies for the species. As so, we analyzed 9 species-specific microsatellite loci and 8 additional heterologous loci, and also 1.227 SNPs loci that were developed by a RAD-seq (Restriction-site Associated DNA sequencing) approach. A total of 44 animals were collected in two marsh areas near Mogi das Cruzes city (MC) (N = 26) and Salesópolis city (SL) ... / Mestre

Orientador: Reginaldo José Donatelli / Banca: Fátima do Rosário Naschenveng Knoll / Banca: Carolina Demétrio Ferreira / Resumo: A fragmentação florestal é uma das principais causas do declínio da biodiversidade mundial. Assim, o presente estudo teve como objetivo analisar a estrutura das comunidades de aves de dois fragmentos florestais no interior paulista através de levantamentos quali-quantitativos - a Mata dos Maias (MM - 350 ha) e a Mata do Instituto de Zootecnia (MIZ - 250 ha). O levantamento qualitativo foi realizado através de caminhadas nos fragmentos e áreas adjacentes. Para o levantamento quantitativo foi utilizada a metodologia de pontos de contagem com distância ilimitada. Foram registradas 151 espécies de aves na MM e 162 na MIZ, durante o período de janeiro a dezembro de 2010. A maior parte da avifauna apresentou frequência de ocorrência de até 50%. Foram registradas seis espécies ameaçadas e sete quase ameaçadas para o estado de São Paulo. Os resultados do índice pontual de abundância (IPA) indicam um padrão já conhecido, no qual poucas espécies ocorrem com abundância relativa alta e a maioria das espécies apresenta abundância relativa de média a baixa. O índice de diversidade foi de H'= 3,36 na MM e H'= 3,46 na MIZ. Estes valores encontram-se dentro dos padrões observados em outros levantamentos em áreas fragmentadas do interior paulista. A distribuição das categorias alimentares seguiu o padrão para matas da região tropical, com maior porcentagem de aves insetívoras. O atual panorama da fragmentação florestal do estado de São Paulo e os resultados obtidos neste trabalho apontam a importância dos fragmentos para a conservação das biodiversidades locais / Abstract: Forest fragmentation is one of the main cause of biodiversity loss world-wide. Thus, this study aimed to analyse the structure of birds communities in two forest fragments in São Paulo state through qualitative and quantitative surveys - the Mata dos Maias (MM - 350 ha) and The Forest of the Instituto de Zootecnia (MIZ - 250 ha). The qualitative survey was made by walking in fragments and adjacent areas. For the quantitative survey we used the point counts with unlimited distance methodology. We recorded 151 bird species in the MM and 162 in the MIZ during the period of January to December 2010. Most of the birds showed occurrence frequency of up to 50%. Were recorded six endangered species and seven almost threatened for São Paulo state. The results of abundance index values (IPA) indicate a familiar pattern, in which few species occur in high relative abundance and a large number of species with intermediate and low rates. The diversity index was H'= 3.36 in MM and H'= 3.46 in the MIZ. These values are within the patterns observed in other surveys in fragmented areas of São Paulo state. The distribution of food items followed the pattern for tropical forest regions, with the highest percentage of insectivorous birds. The current panorama of forest fragmentation in São Paulo state and the results of this study indicate the importance of the fragments on conservation of local biodiversity / Mestre

Made available in DSpace on 2015-01-26T13:21:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-04-23Bitstream added on 2015-01-26T13:30:32Z : No. of bitstreams: 1 000797009.pdf: 866532 bytes, checksum: b5f097eddd5228ec546977ffbbc583aa (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Populações pequenas são mais susceptíveis aos efeitos causados por deriva genética e endocruzamento o que, geralmente, está associado à perda de variabilidade genética. Baixos níveis de diversidade genética podem resultar em drásticas consequências nos indivíduos, como alterações nas taxas de fertilidade e capacidade de se adaptar a mudanças ambientais. Embora estes fatores possam elevar o risco de extinção, o fluxo gênico pode balancear estes efeitos, mantendo a variabilidade genética e diminuindo a divergência entre populações. Deste modo, conhecer as características genéticas intra e interpopulacionais é essencial quando se trata da conservação de espécies ameaçadas. Marcadores moleculares, como microssatélites e SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), são importantes ferramentas para acessar níveis de variabilidade genética e padrões de fluxo gênico em populações e vêm sendo amplamente utilizados em espécies alvo de programas de conservação. O bicudinho-do-brejo-paulista (Formicivora paludicola) é uma pequena ave restrita a brejos da Mata Atlântica que foi recentemente descrita na região metropolitana da cidade de São Paulo. Ocorre em 15 localidades isoladas situadas nas bacias do Alto Tietê e do rio Paraíba do Sul e, especialmente devido à destruição do seu hábitat, já está classificada como “Criticamente em Perigo” no estado de São Paulo. Ações prioritárias para a conservação da espécie incluem estudos genéticos para estabelecer o monitoramento e o manejo das populações naturais. Visto isso, o presente trabalho teve como objetivo avaliar os níveis de variabilidade genética e os padrões de fluxo gênico de duas populações de bicudinho-do-brejo-paulista, visando fornecer subsídios para futuras estratégias de conservação a serem desenvolvidas para a espécie. Para tanto, foram analisados 9 loci de microssatélites espécie-específicos e ... / Small populations are more susceptible to genetic drift and inbreeding effects which, generally, can be associated to loss of genetic variability. Low levels of genetic diversity can result in severe effects in the individuals, as fertility alterations and capability of adaption to environmental changes. Although these factors can, in turn, increase the risk of extinction, gene flow may balance these effects, maintaining the genetic variability and reducing genetic divergences among populations. Therefore, it is essential to understand intra and inter population genetic data, in order to conserve threatened species. Molecular markers, such as microsatellites and SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), are reliable tools for assessing levels of genetic variability and patterns of gene flow in populations and have been widely used to analyze target species on conservation programs. The São Paulo marsh antwren (Formicivora paludicola) is a small bird restricted to marshes of Atlantic Forest that was recently described in the metropolitan region of São Paulo city. It occurs in 15 isolated localities spread on High Tietê and Paraíba do Sul River basins and, especially due to its habitat destruction, it is already considered as Critically Endangered in São Paulo State. Priorities actions for this species' conservation include genetic studies to establish the monitoring and management of natural populations. Therefore, the present study aimed to evaluate the genetic variability levels and the gene flow patterns of two populations of F. paludicola in order to support future conservation strategies for the species. As so, we analyzed 9 species-specific microsatellite loci and 8 additional heterologous loci, and also 1.227 SNPs loci that were developed by a RAD-seq (Restriction-site Associated DNA sequencing) approach. A total of 44 animals were collected in two marsh areas near Mogi das Cruzes city (MC) (N = 26) and Salesópolis city (SL) ... / FAPESP: 12/09105-7

Orientador: Reginaldo José Donatelli / Banca: Fátima Knoll / Banca: Carolina Demétrio Ferreira / Resumo: Este trabalho teve como objetivo analisar e comparar as assembleias de aves em dois fragmentos florestais no interior do estado de São Paulo, a partir de levantamentos qualitativos e quantitativos. E também comparar os resultados dos parâmetros estudados com outros trabalhos da mesma natureza e esforço amostral e analisar o uso da comunidade de aves como bio-indicadores da qualidade ambiental e estado de conservação dos fragmentos florestais estudados. Foram estudados dois fragmentos florestais no oeste do estado, com aproximadamente 300 hectares de área, variando em forma, distância de outros fragmentos e isolamento destes. O levantamento qualitativo se constituiu de estudos exaustivos na área propriamente dita e áreas adjacentes, onde todas as espécies de aves vistas e ouvidas foram registradas e informações como riqueza, frequência de ocorrência e similaridade foram registradas. Já o levantamento qualitativo foi realizado a partir da metodologia de contagem por pontos de escuta, onde foram analisados parâmetros como riqueza, abundância, similaridade, diversidade, abundância relativa e grupos funcionais. As coletas foram desenvolvidas por 12 meses em cada área e comparadas a trabalhos similares realizados por outros pesquisadores a fim de se compreender melhor os dados observados. O levantamento demonstrou que o número de espécies registradas no fragmento Mata do Peixe foi superior ao fragmento Cristal, e também superior em relação a trabalhos com comunidades de aves em fragmentos de florestas estacionais semideciduais realizados por outros autores. O fragmento Cristal apresentou um menor número de espécies exclusivas e sua grande maioria tratou-se de espécies de hábitos florestais com delineadas exigências ambientais. Diferente do fragmento Cristal, onde muitas espécies têm poucos registros e em sua maioria as espécies são de áreas abertas e de baixa sensibilidade à perturbações ambientais. Constatou-se... / Abstract: The aim of this study was to analyze and to compare birds' communities in two forest fragments in the state of São Paulo, from qualitative and quantitative surveys. And also compare the results of the parameters studied with other works of the same nature and sampling effort and analyze the use of the bird community as environmental quality bio-indicators and state of conservation of forest fragments studied. Forest fragments were studied in the west of the state, with approximately 300 hectares, varying in shape, distance and isolation of these other fragments. The qualitative survey consisted of extensive studies in the area itself and surrounding areas, where all species of birds seen and heard were recorded and information as wealth, frequency of occurrence and similarity were recorded. But the qualitative survey was based on the methodology of counting by listening posts, which analyzed parameters such as wealth, abundance, similarity, diversity and functional groups. The field work have been developed for 12 months in each area and compared to similar works by other researchers in order to better understand the observed data. The survey showed that the number of species recorded in the Mata do Peixe fragment was higher than the Cristal fragment, and also higher than in work on bird communities in secondary forests fragments made by other authors. This fragment had a lower number of unique species and mostly treated forest species habits outlined environmental requirements. Unlike Cristal fragment, where many species have few records and mostly species are open areas and low sensitivity to environmental disturbances. It was found that the two areas suffer from forest fragmentation when presenting many species of birds living in forest edges and population imbalances in your community of birds, as poor results of detritivores birds and nectarivores. Due to the characteristics of the fragments and the comparison with similar work, ... / Mestre

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:22:27Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-02. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:28:33Z : No. of bitstreams: 1 000850419_20160227.pdf: 262630 bytes, checksum: cecbe19e2bb3e1088ea954119577535a (MD5) Bitstreams deleted on 2016-02-29T12:16:29Z: 000850419_20160227.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-29T12:17:27Z : No. of bitstreams: 1 000850419.pdf: 559182 bytes, checksum: b385ba22312219a599fe7122182aeace (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Este trabalho teve como objetivo analisar e comparar as assembleias de aves em dois fragmentos florestais no interior do estado de São Paulo, a partir de levantamentos qualitativos e quantitativos. E também comparar os resultados dos parâmetros estudados com outros trabalhos da mesma natureza e esforço amostral e analisar o uso da comunidade de aves como bio-indicadores da qualidade ambiental e estado de conservação dos fragmentos florestais estudados. Foram estudados dois fragmentos florestais no oeste do estado, com aproximadamente 300 hectares de área, variando em forma, distância de outros fragmentos e isolamento destes. O levantamento qualitativo se constituiu de estudos exaustivos na área propriamente dita e áreas adjacentes, onde todas as espécies de aves vistas e ouvidas foram registradas e informações como riqueza, frequência de ocorrência e similaridade foram registradas. Já o levantamento qualitativo foi realizado a partir da metodologia de contagem por pontos de escuta, onde foram analisados parâmetros como riqueza, abundância, similaridade, diversidade, abundância relativa e grupos funcionais. As coletas foram desenvolvidas por 12 meses em cada área e comparadas a trabalhos similares realizados por outros pesquisadores a fim de se compreender melhor os dados observados. O levantamento demonstrou que o número de espécies registradas no fragmento Mata do Peixe foi superior ao fragmento Cristal, e também superior em relação a trabalhos com comunidades de aves em fragmentos de florestas estacionais semideciduais realizados por outros autores. O fragmento Cristal apresentou um menor número de espécies exclusivas e sua grande maioria tratou-se de espécies de hábitos florestais com delineadas exigências ambientais. Diferente do fragmento Cristal, onde muitas espécies têm poucos registros e em sua maioria as espécies são de áreas abertas e de baixa sensibilidade à perturbações ambientais. Constatou-se... / The aim of this study was to analyze and to compare birds' communities in two forest fragments in the state of São Paulo, from qualitative and quantitative surveys. And also compare the results of the parameters studied with other works of the same nature and sampling effort and analyze the use of the bird community as environmental quality bio-indicators and state of conservation of forest fragments studied. Forest fragments were studied in the west of the state, with approximately 300 hectares, varying in shape, distance and isolation of these other fragments. The qualitative survey consisted of extensive studies in the area itself and surrounding areas, where all species of birds seen and heard were recorded and information as wealth, frequency of occurrence and similarity were recorded. But the qualitative survey was based on the methodology of counting by listening posts, which analyzed parameters such as wealth, abundance, similarity, diversity and functional groups. The field work have been developed for 12 months in each area and compared to similar works by other researchers in order to better understand the observed data. The survey showed that the number of species recorded in the Mata do Peixe fragment was higher than the Cristal fragment, and also higher than in work on bird communities in secondary forests fragments made by other authors. This fragment had a lower number of unique species and mostly treated forest species habits outlined environmental requirements. Unlike Cristal fragment, where many species have few records and mostly species are open areas and low sensitivity to environmental disturbances. It was found that the two areas suffer from forest fragmentation when presenting many species of birds living in forest edges and population imbalances in your community of birds, as poor results of detritivores birds and nectarivores. Due to the characteristics of the fragments and the comparison with similar work, ...