La recherche a été initiée par l'observation d'efflorescences de Planktothrix agardhii, une cyanobactérie dulçaquicole potentiellement toxique, dans deux étangs saumâtres, les étangs de l'Olivier et de Bolmon, avec dans ce dernier le déclin de l'espèce concomitamment à une augmentation de salinité. L'objectif de l'étude consistait à évaluer l'influence de la salinité du milieu sur la performance, l'hégémonie et la production de toxine de Planktothrix agardhii au sein de la communauté phytoplanctonique.La réalisation de suivis pluriannuels in situ couplés à des expérimentations en milieu contrôlé a permis de démontrer (i) la capacité d'acclimatation et d'adaptation à la salinité de Planktothrix agardhii, laquelle garantit sa suprématie et sa production toxinique en milieu saumâtre ; et (ii) la modification structurale et fonctionnelle de la communauté phytoplanctonique suite à une augmentation de salinité supérieure au seuil d'halotolérance de Planktothrix agardhii. La recherche témoigne ainsi de la versatilité des cyanobactéries qui renforce leur aptitude à être de bons compétiteurs, laissant présager leur persistance, la continuité de leurs nuisances, et leur expansion dans le futur. / The research was launched by the observation of Planktothrix agardhii blooms, a potentially toxic freshwater cyanobacterium, in two brackish ponds, the Olivier and Bolmon ponds, with in the latter, the concomitantly collapse of P. agardhii with an increase in salinity. The goal of the study was to assess the salinity influence on the performance, the dominance and the toxin production of P. agardhii within the phytoplankton community.The achievement of a long-term monitoring in situ combined with batch cultures experiments has demonstrated (i) the ability of P. agardhii to acclimate and adapt to salinity, which ensure its supremacy and its toxin production in brackish areas, and (ii) the structural and functional changes of the phytoplankton community with the exceeding of the salt-tolerance threshold of P. agardhii .The research reflects the cyanobacteria versatility that enhances their suitability for being good performers, suggesting their persistence along with their nuisances, and their expansion in the future.

No description available.

L'acide succinique est une molécule linéaire, bi-fonctionnelle qui possède de nombreuses applications alimentaires, chimiques et pharmaceutiques etc. Les connaissances de la régulation des voies métaboliques d’organismes d’intérêt industriel, le génie génétique et le génie des procédés ont permis à des microorganismes recombinants (C. glutamicum) de produire jusqu'à 100 g.L-1 de succinate avec des rendements intéressants. C. glutamicum est largement connu comme l'un des meilleurs producteurs industriels de nombreux acides aminés (glutamate, lysine etc.). Cependant, des études de C. glutamicum ont démontré sa capacité à produire plusieurs acides organiques (succinate, lactate, acétate, etc.). Au cours de ce travail, nous avons supprimé le gène ldhA de C. glutamicum en utilisant le plasmide pk19mobsacBΔldhA. Nous avons démontré que la délétion de ce gène n’avait pas d’incidence sur la capacité de croissance de la bactérie. Par ailleurs, nous avons étudié les effets de l’oxygénation sur la réponse physiologique de C. glutamicum 2262ΔldhA à travers des expériences de cultures en fioles en verre lisses en imposant différentes conditions de kLa. Les résultats ont montré que des faibles kLa (<33 h-1) favorisaient la production d’acides organiques tandis que les kLa élevés amélioraient surtout l’accumulation de la biomasse. Nous avons également mis en œuvre un procédé de production très efficace avec une phase de transition aérobiose-anaérobiose basée sur la régulation de la concentration en oxygène dissous. Avec ce procédé, 327 mM de succinate avec un rendement de 0,94 mole par mole de glucose ont pu être produits avec le mutant ΔldhA. En outre, nous avons vérifié l’efficacité de ce nouveau procédé en l’appliquant à la souche sauvage qui normalement produit 10 fois plus de lactate que de succinate. Ces résultats ont montré une production de 793 mM (94 g.L-1) de succinate et 785 mM (71 g.L-1) de lactate. Ils soulignent ainsi, l'importance de la phase de transition aérobiose-anaérobiose lors des procédés de production de succinate par des bactéries aérobie facultatif. Enfin, des expériences en système bi-étagé ont montré que C. glutamicum 2262 pouvait s’adapter très facilement aux gradients et hétérogénéités en oxygène dissous dans les cultures à grande échelle / Succinic acid is a linear and bi-functional molecule that has several practical applications including food, chemical and pharmaceutical industries. Thanks to increased knowledge on metabolism and pathway regulation of industrially relevant organisms, to the development of performant genetic tools and process engineering, recombinants strains (Escherichia coli, Corynebacterium glutamicum etc.) have been reported to be able to produce up to 100 g.L-1 with interesting yields (> 1.5 mole per mole glucose). C. glutamicum is well known as one of the best industrial producers of numerous amino acids (glutamate, lysine etc.). However, recent studies of C. glutamicum revealed its capability to produce several organic acids (succinate, lactate, acetate, etc.). In this work, we have deleted the ldhA gene of C. glutamicum by using a plasmid vector pk19mobsacBΔldhA. We demonstrated that the mutant and the wild type presented similar growth kinetics with maximal growth rate of about 0.7 h-1. We studied also the effects of oxygenation on C. glutamicum 2262 ΔldhA through cultures at different kLa and it appeared that lower kLa (<33 h-1) favored organic acids production wile higher favored bacterial growth. Furthermore, we designed a tri-phasic process with transition phase by regulation of dissolved oxygen concentration which resulted in the production of 327 mM of succinic acid with a yield of 0.94 mole per mole glucose. The application of the designed process to C. glutamicum 2262 wild type that normally produces lactate with a lactate to succinate production ratio up to 13.3 mol.mol-1, resulted in succinate concentration up to 793 mM (94 g.L-1) and 785 mM (71 g.L-1) of lactate. The succinate production yield was 1.1 mole per mole glucose and acetate production was negligible. These results underlined the importance of aerobic to anaerobic transition in succinate production processes of facultative aerobes and the necessity to engineer not only the microorganism but also the process. Finally, scale-down study have demonstrated the robustness of C. glutamicum against the oxygen gradients in bioreactor