• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 3
  • Tagged with
  • 3
  • 3
  • 3
  • 3
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
1

Applying Model Selection on Ligand-Target Binding Kinetic Analysis / Tillämpad Bayesiansk statistik för modellval inom interaktionsanalys

Djurberg, Klara January 2021 (has links)
The time-course of interaction formation or breaking can be studied using LigandTracer, and the data obtained from an experiment can be analyzed using a model of ligand-target binding kinetics. There are different kinetic models, and the choice of model is currently motivated by knowledge about the interaction, which is problematic when the knowledge about the interaction is unsatisfactory. In this project, a Bayesian model selection procedure was implemented to motivate the model choice using the data obtained from studying a biological system. The model selection procedure was implemented for four kinetic models, the 1:1 model, the 1:2 model, the bivalent model and a new version of the bivalent model.Bayesian inference was performed on the data using each of the models to obtain the posterior distributions of the parameters. Afterwards, the Bayes factor was approximated from numerical calculations of the marginal likelihood. Four numerical methods were implemented to approximate the marginal likelihood, the Naïve Monte Carlo estimator, the method of Harmonic Means of the likelihood, Importance Sampling and Sequential Monte Carlo. When tested on simulated data, the method of Importance Sampling seemed to yield the most reliable prediction of the most likely model. The model selection procedure was then tested on experimental data which was expected to be from a 1:1 interaction and the result of the model selection procedure did not agree with the expectation on the experimental test dataset. Therefore no reliable conclusion could be made when the model selection procedure was used to analyze the interaction between the anti-CD20 antibody Rituximab and Daudi cells. / Interaktioner kan analyseras med hjälp av LigandTracer. Data från ett LigandTracer experiment kan sedan analyseras med avseende på en kinetisk modell. Det finns olika kinetiska modeller, och modellvalet motiveras vanligen utifrån tidigare kunskap om interaktionen, vilket är problematiskt när den tillgängliga informationen om en interaktion är otillräcklig. I det här projektet implementerades en Bayesiansk metod för att motivera valet av modell utifrån data från ett LigandTracer experiment. Modellvalsmetoden implementerades för fyra kinetiska modeller, 1:1 modellen, 1:2 modellen, den bivalenta modellen och en ny version av den bivalenta modellen. Bayesiansk inferens användes för att få fram aposteriorifördelningarna för de olika modellernas parametrar utifrån den givna datan. Sedan beräknades Bayes faktor utifrån numeriska approximationer av marginalsannolikeheten. Fyra numeriska metoder implementerades för att approximera marginalsannolikheten; Naïve Monte Carlo estimator, det harmoniska medelvärdet av likelihood-funktionen, Importance Sampling och Sekventiell Monte Carlo. När modellvalsmetoden testades på simulerad data gav metoden Importance Sampling den mest tillförlitliga förutsägelsen om vilken modell som generade datan. Metoden testades också på experimentell data som förväntades följa en 1:1 interaktion och resultatet avvek från det förväntade resultatet. Följaktligen kunde ingen slutsas dras av resultet från modelvalsmetoden när den sedan används för att analysera interaktionen mellan anti-CD antikroppen Rituximab och Daudi-celler.
2

Estimation of Loss Given Default Distributions for Non-Performing Loans Using Zero-and-One Inflated Beta Regression Type Models / Estimering av förluster vid fallissemang för icke-presterade lån genom applicering av utvidgad betaregression

Ljung, Carolina, Svedberg, Maria January 2020 (has links)
This thesis investigates three different techniques for estimating loss given default of non-performing consumer loans. This is a contribution to a credit risk evaluation model compliant with the regulations stipulated by the Basel Accords, regulating the capital requirements of European financial institutions. First, multiple linear regression is applied, and thereafter, zero-and-one inflated beta regression is implemented in two versions, with and without Bayesian inference. The model performances confirm that modeling loss given default data is challenging, however, the result shows that the zero-and-one inflated beta regression is superior to the other models in predicting LGD. Although, it shall be recognized that all models had difficulties in distinguishing low-risk loans, while the prediction accuracy of riskier loans, resulting in larger losses, were higher. It is further recommended, in future research, to include macroeconomic variables in the models to capture economic downturn conditions as well as adopting decision trees, for example by applying machine learning. / Detta examensarbete undersöker tre olika metoder för att estimera förlusten vid fallissemang för icke-presterande konsumentlån. Detta som ett bidrag till en kreditrisksmodell i enlighet med bestämmelserna i Baselregelverken, som bland annat reglerar kapitalkraven för europeiska finansiella institut. Inledningsvis tillämpas multipel linjär regression, därefter implementeras två versioner av utvidgad betaregression, med och utan bayesiansk inferens. Resultatet bekräftar att modellering data för förlust givet fallissemang är utmanande, men visar även att den utvidgade betaregressionen utan bayesiansk inferens är bättre de andra modellerna. Det ska dock tilläggas att alla modeller visade svårigheter att estimera lån med låg risk, medan tillförlitligheten hos lån med hög risk, vilka generellt sett medför större förluster, var högre. Vidare rekommenderas det för framtida forskning att inkludera makroekonomiska variabler i modellerna för att fånga ekonomiska nedgångar samt att implementera beslutsträd, exempelvis genom applicering av maskininlärning.
3

Optimization and Bayesian Modeling of Road Distance for Inventory of Potholes in Gävle Municipality / Optimering och bayesiansk modellering av bilvägsavstånd för inventering av potthål i Gävle kommun

Lindblom, Timothy Rafael, Tollin, Oskar January 2022 (has links)
Time management and distance evaluation have long been a difficult task for workers and companies. This thesis studies 6712 pothole coordinates in Gävle municipality, and evaluates the minimal total road distance needed to visit each pothole once, and return to an initial pothole. Road distance is approximated using the flight distance and a simple random sample of 113 road distances from Google Maps. Thereafter, the data from the sample along with a Bayesian approach is used to find a distribution of the ratio between road distance and flight distance. Lastly, a solution to the shortest distance is devised using the Nearest Neighbor algorithm (NNA) and Simulated Annealing (SA). Computational work is performed with Markov Chain Monte Carlo (MCMC). The results provide a minimal road distance of 717 km. / Tidshantering och distansutvärdering är som regel en svår uppgift för arbetare och företag. Den här uppsatsen studerar 6712 potthål i Gävle kommun, och utvärderar den bilväg som på kortast sträcka besöker varje potthål och återgår till den ursprungliga startpunkten. Bilvägsavståndet mellan potthålen uppskattas med hjälp av flygavståndet, där ett obundet slumpmässigt urval av 113 bilvägsavstånd mellan potthålens koordinatpunkter dras. Bilvägsdistanser hittas med hjälp av Google Maps. Därefter används data från urvalet tillsammans med en bayesiansk modell för att hitta en fördelning för förhållandet mellan bilvägsavstånd och flygavstånd. Slutligen framförs en lösning på det kortaste bilvägsavståndet med hjälp av en Nearest Neighbour algoritm (NNA) samt Simulated Annealing (SA). Statistiskt beräkningsarbete utförs med Markov Chain Monte Carlo (MCMC). Resultaten ger en kortaste bilvägssträcka på 717 km.

Page generated in 0.0729 seconds