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Mapeamento de caracteres do tegumento da semente de soja e análise in silico dos marcadores microssatélites / Genetic mapping of soybean seed and in silico analysis of the microssatelites markersHenning, Fernando Augusto 30 April 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-04-30 / The use of quality seeds is preponderant to obtain productive success in farming.
Several are the factors that influence in the quality of seeds, and among these the
flotations can be mentioned in the humidity of seeds and even the use of inadequate
techniques in the crop. The coat of soybean seeds is the responsible for the
protection of the embryo, therefore, more resistance to you factor that they will take
the quality loss, minor will be the damages for the whole productive chain of soybean
seeds. The introduction of characters of larger resistance of coat of soybean seed is
related to the characteristic of the permeability of coat. Several studies demonstrate
to exists soybean genotypes with different permeability characteristics. Based on
these information took place the crossing among to cultivate commercial CD202
(yellow and permeable coat) with a lineage TP (black and semi-permeable coat). In
the population generated by the crossing, grew this work with the following
objectives: i) to Build a genetic map of the coat of soybean seed using markers
microssatélites, RAPD and AFLP; ii) to Relate the markers microssatélites used in
the construction of the genetic map of the coat of soybean, with the possible proteins
codified by the sequences anchored by these markers in the bank of ESTs of the
soybean. For the construction of the genetic map of the coat of soybean 600 primers
microssatélites, 50 RAPD and 64 AFLP were tested. The markers selected as
polimórficos, they were submitted to the analysis of Qui-square and contained in
connection groups using the program MapMaker. The alignment among the sequences of the microssatélites with the database of ESTs was made through
analyses in silico being used the program BLAST. Of the total of tested markers, they
were used in the construction of the map 20 markers microssatélites, 2 RAPD and 11
AFLP, which were efficient in the formation of 13 connection groups. Among the 20
markers selected microssatélites, 4 presented homology with sequences of ESTs
deposited in the database of the soybean, and some of these sequences possess
indirect relationship with the quality of soybean seeds. / A utilização de sementes de qualidade é preponderante para se obter sucesso
produtivo em uma lavoura. Diversos são os fatores que influenciam na qualidade das
sementes, sendo que dentre estes podem-se citar as flutuações na umidade das
sementes e até mesmo a utilização de técnicas inadequadas na colheita. O
tegumento das sementes de soja é o responsável pela proteção do embrião, logo,
quanto maior sua resistência a fatores que irão levar a perda de qualidade, menores
serão os prejuízos para toda a cadeia produtiva de sementes de soja. A introdução
de caracteres de maior resistência do tegumento da semente de soja está
relacionada à característica da permeabilidade do tegumento. Diversos estudos
demonstram existir genótipos de soja com diferentes características de
permeabilidade. Baseado nestas informações realizou-se o cruzamento entre a
cultivar comercial CD202 (tegumento amarelo e permeável) com uma linhagem TP
(tegumento preto e semi-permeável). Na população gerada pelo cruzamento,
desenvolveu-se este trabalho com os seguintes objetivos: i) Construir um mapa
genético do tegumento da semente de soja utilizando marcadores microssatélites,
RAPD e AFLP; ii) Relacionar os marcadores microssatélites utilizados na construção
do mapa genético do tegumento da soja, com as possíveis proteínas codificados
pelas seqüências ancoradas por estes marcadores no banco de ESTs da soja. Para
a construção do mapa genético do tegumento da soja foram testados 600 primers
microssatélites, 50 RAPD e 64 AFLP. Os marcadores selecionados como polimórficos, foram submetidos à análise de Qui-quadrado e agrupados em grupos
de ligação utilizando o programa MapMaker. O alinhamento entre as seqüências dos
microssatélites com o banco de dados de ESTs foi feito via análises in silico
utilizando-se o programa BLAST. Do total de marcadores testados, foram utilizados
na construção do mapa 20 marcadores microssatélites, 2 RAPD e 11 AFLP, os quais
foram eficientes na formação de 13 grupos de ligação. Dentre os 20 marcadores
microssatélites selecionados, 4 apresentaram homologia com seqüências de ESTs
depositadas no banco de dados da soja, sendo que algumas destas seqüências
possuem relação indireta com a qualidade de sementes de soja.
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