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Expressão diferencial do gene FLA 14 em tegumento de sementes de soja / Differential expression of the gene FLA 14 in soybean seed tegument

Monzón, Daisy Leticia Ramirez 07 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_daisy_leticia-ramirez_monzon.pdf: 495372 bytes, checksum: 4109f5d12e44f58ba6cd6d0affc3d675 (MD5) Previous issue date: 2012-02-07 / The soybean (Glycine max L. Max) is one of the main crops grown in Brazil, the second largest world producer. Its evolution has been strongly supported by the development of technologies that allowed the acreage increase. Currently, the use of biotechnology tools aims to contribute to the development of new genotypes with characteristics that can continue increase the production. The identification of genes responsible for characters that can assist in developing varieties with improved seed quality may constitute something innovative. The seed tegument has an important function as for the seeds resistance to deterioration. In this sense, the partial characterization of the protein expression FLA 14 (Arabinogalactan), directly related to the cell wall synthesis in the seed tegument may contribute to the advancement of these studies. The aim of this work was to generate and validate primers capable of quantifying the gene expression of the FLA 14 protein in four soybean genotypes, two with black tegument (TP and IAC 222) and higher lignin content and two with yellow tegument (CD 202 and Potência) and lower lignin content. The plant tissue (tegument) was collected 50 days after the anthesis. In order to obtain the gene expression among genotypes, it was used the qRT-PCR technique, where it was tested four combinations of primers, constructed from sequence models of soybeans ESTs. With the validation results, the primers that were found within the standards were the FLA 14p1, FLA 14p2 and β-Actina. They were all used at the expression studies. The results of the relative expression showed that soybean genotypes with black tegument and higher lignin content express the FLA 14 protein quantitatively superior to the genotypes with yellow tegument and lower lignin content. / A soja (Glycine max L. Merr.) é uma das principais culturas produzidas no Brasil, sendo considerado o segundo maior produtor mundial. Sua evolução foi fortemente amparada pelo desenvolvimento de tecnologias que possibilitaram o aumento da área cultivada. Atualmente o emprego de ferramentas da biotecnologia busca contribuir para o desenvolvimento de novos genótipos com características que possam continuar incrementando a produção. A identificação de genes responsáveis por caracteres que possam auxiliar no desenvolvimento de variedades com melhor qualidade da semente, pode se constituir em algo inovador. O tegumento apresenta uma função importante quanto à resistência das sementes à deterioração. Nesse sentido, a caracterização parcial da expressão do gene da proteína FLA 14 (Arabinogalactano), relacionadas diretamente com a síntese da parede celular no tegumento da semente pode contribuir para o avanço dos estudos. O objetivo do trabalho foi gerar e validar primers capazes de quantificar a expressão gênica da proteína FLA 14 em quatro genótipos de soja, dois desses com tegumento preto (TP e IAC 222) e maior conteúdo de lignina, e outros dois com tegumento amarelo (CD 202 e Potência) e menor conteúdo de lignina. O tecido vegetal (tegumentos) foi coletado aos 50 dias após a antese. Para a análise da expressão gênica entre os genótipos, utilizou-se a técnica de qRT-PCR, onde foram testadas quatro combinações de primers construídos a partir de modelos de sequência de ESTs da soja. Com os resultados da validação, os primers que se encontraram dentro dos padrões foram os FLA 14p1, FLA 14p2 e β-Actina utilizando-se no estudo de expressão. Os resultados da expressão relativa permitiram concluir a expressão do gene da proteína FLA 14 é quantitativamente superior nos genótipos de soja com tegumento preto e conteúdo superior de lignina em relação aos genótipos com tegumento amarelo e menos teor de lignina.
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Mapeamento de caracteres do tegumento da semente de soja e análise in silico dos marcadores microssatélites / Genetic mapping of soybean seed and in silico analysis of the microssatelites markers

Henning, Fernando Augusto 30 April 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_fernando_henning.pdf: 464142 bytes, checksum: dafd04da655722e31d27a17fb98fb36d (MD5) Previous issue date: 2007-04-30 / The use of quality seeds is preponderant to obtain productive success in farming. Several are the factors that influence in the quality of seeds, and among these the flotations can be mentioned in the humidity of seeds and even the use of inadequate techniques in the crop. The coat of soybean seeds is the responsible for the protection of the embryo, therefore, more resistance to you factor that they will take the quality loss, minor will be the damages for the whole productive chain of soybean seeds. The introduction of characters of larger resistance of coat of soybean seed is related to the characteristic of the permeability of coat. Several studies demonstrate to exists soybean genotypes with different permeability characteristics. Based on these information took place the crossing among to cultivate commercial CD202 (yellow and permeable coat) with a lineage TP (black and semi-permeable coat). In the population generated by the crossing, grew this work with the following objectives: i) to Build a genetic map of the coat of soybean seed using markers microssatélites, RAPD and AFLP; ii) to Relate the markers microssatélites used in the construction of the genetic map of the coat of soybean, with the possible proteins codified by the sequences anchored by these markers in the bank of ESTs of the soybean. For the construction of the genetic map of the coat of soybean 600 primers microssatélites, 50 RAPD and 64 AFLP were tested. The markers selected as polimórficos, they were submitted to the analysis of Qui-square and contained in connection groups using the program MapMaker. The alignment among the sequences of the microssatélites with the database of ESTs was made through analyses in silico being used the program BLAST. Of the total of tested markers, they were used in the construction of the map 20 markers microssatélites, 2 RAPD and 11 AFLP, which were efficient in the formation of 13 connection groups. Among the 20 markers selected microssatélites, 4 presented homology with sequences of ESTs deposited in the database of the soybean, and some of these sequences possess indirect relationship with the quality of soybean seeds. / A utilização de sementes de qualidade é preponderante para se obter sucesso produtivo em uma lavoura. Diversos são os fatores que influenciam na qualidade das sementes, sendo que dentre estes podem-se citar as flutuações na umidade das sementes e até mesmo a utilização de técnicas inadequadas na colheita. O tegumento das sementes de soja é o responsável pela proteção do embrião, logo, quanto maior sua resistência a fatores que irão levar a perda de qualidade, menores serão os prejuízos para toda a cadeia produtiva de sementes de soja. A introdução de caracteres de maior resistência do tegumento da semente de soja está relacionada à característica da permeabilidade do tegumento. Diversos estudos demonstram existir genótipos de soja com diferentes características de permeabilidade. Baseado nestas informações realizou-se o cruzamento entre a cultivar comercial CD202 (tegumento amarelo e permeável) com uma linhagem TP (tegumento preto e semi-permeável). Na população gerada pelo cruzamento, desenvolveu-se este trabalho com os seguintes objetivos: i) Construir um mapa genético do tegumento da semente de soja utilizando marcadores microssatélites, RAPD e AFLP; ii) Relacionar os marcadores microssatélites utilizados na construção do mapa genético do tegumento da soja, com as possíveis proteínas codificados pelas seqüências ancoradas por estes marcadores no banco de ESTs da soja. Para a construção do mapa genético do tegumento da soja foram testados 600 primers microssatélites, 50 RAPD e 64 AFLP. Os marcadores selecionados como polimórficos, foram submetidos à análise de Qui-quadrado e agrupados em grupos de ligação utilizando o programa MapMaker. O alinhamento entre as seqüências dos microssatélites com o banco de dados de ESTs foi feito via análises in silico utilizando-se o programa BLAST. Do total de marcadores testados, foram utilizados na construção do mapa 20 marcadores microssatélites, 2 RAPD e 11 AFLP, os quais foram eficientes na formação de 13 grupos de ligação. Dentre os 20 marcadores microssatélites selecionados, 4 apresentaram homologia com seqüências de ESTs depositadas no banco de dados da soja, sendo que algumas destas seqüências possuem relação indireta com a qualidade de sementes de soja.
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Caracterização morfo-fisiológica e identificação de fragmentos de cDNA diferencialmente expressos de tegumentos de sementes de soja com permeabilidade contrastante / Morpho-physiologic characterization and identification of fragments of cDNA distinguishing expressed in soybean seed coat with contrasting permeability

Mertz, Liliane Márcia 22 March 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_liliane_mertz.pdf: 5055852 bytes, checksum: b6922bc49af5dfa5f81f10ad3f997443 (MD5) Previous issue date: 2007-03-22 / Some works have reported the existence of contrasting soybean genotypes for physiological quality of seeds. There are such differences because of the presence of seeds with total or partial impermeability for water absorption into the coat that make them less susceptible to mechanical damages, weather adversities, deterioration by humidity and pathogen occurrence. The characteristic of semi-permeable coat can be used in programs of soybean crop breeding to be incorporated in genotypes of high production, aiming at the physiologic quality of the seed. The objectives of this study were: Identify structural differences among the coat of the genotypes CD-202 (permeable) and TP (semi-permeable); obtain fragments of genes distinguishingly expressed among the coat of those genotypes; characterize the physiological quality of soybean seeds produced. Morphologic characterization of the coats was carried out by optic microscope BX 51 with increase of 40x. In order to obtain the fragments of genes distinguishingly expressed among the coats of the two genotypes, the technique cDNA AFLP was used. The physiological quality of the seeds was obtained by germination tests and vigour (accelerated ageing and electrical conductivity). Besides, structural differences were observed among the coats of the two genotypes, however, the genotype TP presented higher thickness in the layers of the epidermis and hypodermis of the coat in relation to the genotype CD 202, beside differences in the format and organization of the cells. Regarding the molecular genetic studies, 47 fragments distinguishingly expressed in the coats in the formation of genotypes CD - 202 and TP, were identified. In agreement with the results, soybean seeds with semi-permeable coat presented better physiological quality in relation to the seeds with permeable coat. / Alguns trabalhos têm evidenciado a existência de genótipos de soja contrastantes para qualidade fisiológica de semente. Tais diferenças podem existir em virtude da presença de sementes com total ou parcial impermeabilidade à penetração de água no tegumento, o que as tornam menos susceptíveis aos danos mecânicos, as adversidades climáticas e a deterioração por umidade. A característica de tegumento semi-permeável pode ser utilizada nos programas de melhoramento de soja para ser incorporada às cultivares de alta produção visando à qualidade fisiológica da semente. Diante do exposto, os objetivos desse estudo foram: identificar diferenças estruturais entre os tegumentos de sementes de soja dos genótipos CD-202 (tegumento permeável) e TP (tegumento semi-permeável); obter fragmentos de genes diferencialmente expressos entre os tegumentos dos dois genótipos; avaliar a qualidade fisiológica das sementes produzidas. A caracterização morfológica dos tegumentos foi realizada através de avaliações em microscópio ótico BX 51 com aumento de 40x. Para obtenção dos fragmentos de genes diferencialmente expressos entre os tegumentos dos dois genótipos, utilizou-se a técnica cDNA AFLP. A avaliação da qualidade fisiológica das sementes foi através dos testes de germinação e vigor (condutividade elétrica e envelhecimento acelerado). Na avaliação morfológica, foram observadas diferenças estruturais entre os tegumentos de semente dos dois genótipos, sendo que, os tegumentos do genótipo TP, apresentaram maior espessura nas camadas da epiderme e hipoderme, além de outras diferenças no formato e organização das células. Com relação aos estudos genéticos moleculares, foram identificados 47 fragmentos de genes diferencialmente expressos entre os tegumentos dos dois genótipos. Na avaliação da qualidade fisiológica das sementes, o genótipo TP apresentou qualidade fisiológica superior em relação ao genótipo CD-202.

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