Orientador : Prof. Dr. Rodrigo de Almeida Teixeira / Co-orientadora : Profª. Drª. Laila Talarico Dias / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Zootecnia. Defesa: Curitiba, 29/03/2016 / Inclui referências : f. 96-102 / Área de concentração : Meio ambiente / Resumo: Após as mudanças introduzidas no sistema de classificação linear para tipo para vacas da raça Holandesa no Brasil, ocorridas a partir 01 de julho de 2010, é importante e necessária reavaliar a estimação dos parâmetros de herdabilidade para características de tipo (CT), produção de leite (PL), gordura (PG) e proteína (PP), bem como as correlações genéticas e fenotípicas. Foram analisados dados de 25.574 animais de primeiro parto, com lactações encerradas e ajustadas para 305 dias (kg). Todos os animais foram controlados oficialmente pelo Serviço de Controle Leiteiro da Associação Paranaense de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa. Destes, 11.641 animais foram classificados para tipo; avaliados por classificadores oficiais da Associação Brasileira de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa, entre julho de 2010 a dezembro de 2014. Para a estimativa dos componentes de variância e covariância foi empregado o método da Máxima Verossimilhança Restrita (REML), adotando-se modelo animal unicaracterística para as estimativas dos coeficientes de herdabilidade e bicaracterística para as correlações genéticas de produção e tipo. As médias e os respectivos desvios-padrão para PL, PG e PP em kg, foram 9.105,89 ± 2.017,22; 302,99 ± 77,79 e 280,54 ± 59,51 e pontuação final (PF) de 81,47 ± 2,34. As características de produção tiveram herdabilidades moderadas, respectivamente, 0,30 ± 0,018 PL; 0,33 ± 0,019 para PG; 0,25 ± 0,017 PP. Para as 23 características lineares de tipo, estimativas de baixa a moderadas magnitudes foram observadas, variando de 0,04 ± 0,013 para ângulo de casco (AC); 0,31 ± 0,029 para comprimento de tetos (CT) e para pontuação final o valor foi moderado, de 0,21 ± 0,02. Essas estimativas demostram que quando inseridas em programas de melhoramento genético animal, pode-se esperar respostas à seleção. Para as correlações genéticas e fenotípicas entre características de produção e tipo a variação foi ampla e de baixas magnitudes variando de -0,26 a 0,32. Correlações genéticas negativas e baixas foram obtidas entre PL e inserção anterior de úbere (IUA) de -0,18 e de -0,13 para profundidade de úbere (PU), indicando que vacas com maiores volumes de produção têm leve tendência a apresentar úberes anteriores mais fracos e profundos. Entretanto correlações genéticas positivas entre PL e altura e largura de úbere posterior (0,24 e 0,14) foram observadas, indicando que vacas de maior PL, tendem a úberes mais altos e largos. As estimativas de parâmetros interferem direta ou indiretamente na avaliação de touros e na elaboração de índices de seleção de vacas. O estudo dos parâmetros genéticos para dados de produção e conformação funcional permite melhorar a seleção para características como a vida produtiva, saúde e rentabilidade, pois permitem estabelecer critérios com maior confiança a serem combinados em índices de seleção para os programas de melhoramento genético animal que estão sendo implementados no Brasil. / Abstract: After the changes, which started being introduced on July 1st 2010, in the classification system for linear type in Holstein cows in Brazil, it has been important and necessary to reassess the heritability estimates for linear type traits, milk yield (MY) fat yield (FY) and protein yield (PY) as well as genetic and phenotypic correlations. Data of 25,574 first calving animals, with completed adjusted 305-day lactation (kg), were analyzed period from 2010 to 2014. All animals were controlled by the Official Milk Recording Service of Associação Paranaense de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa (APCBRH). Of these, 11,641 animals were classified for type, evaluated by official classifiers of the Associação Brasileira de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa (ABCBRH), between evaluated in this period. Restricted Maximum Likelihood (REML) was the method used for the estimation of variance and covariance components, using a univariate animal model for estimation of heritability coefficients and a bivariate model for estimation of genetic correlations between type and production traits. The means and standard deviations for MY, FY and PY in kg were 9,105.89 ± 2,017.22; 302.99 ± 77.79 and 280.54 ± 59.51, respectively and the final score (FS) was 81.47 ± 2.34. Production traits showed moderate heritability, 0.30 ± 0.018 MY, 0.33 ± 0.019 FY, and 0.25 ± 0.017 PY, respectively. The 23 linear type traits estimates ranged from low to moderate magnitudes, from 0.04 ± 0.013 for foot angle (FA) to 0.31 ± 0.029 for teat length (TL) and moderate value of 0.21 ± 0.02 was observed for final score. These estimates indicate for such characteristics and responses to selection can be expected when they are introduced in genetic improvement programs. The variation for genetic and phenotypic correlations between type and production traits was wide and of low magnitudes, ranging from -0.26 to 0.32. Negative and low genetic correlations were obtained between MY and fore udder attachment (FUA), -0.18 and -0.13 between MY and udder depth (UD), indicating that high yielding dairy cows have a slight tendency to present weaker anterior udders and deep udders. However, positive genetic correlations were observed between MY and height and width of rear udder (0.24 and 0.14), indicating that high yielding cows tend to have higher and wider udders. The estimates of parameters affect directly or indirectly the assessment of bulls and the development of selection index for cows. The study of genetic parameters for data on production and functional conformation of the animals allow better selection for traits such as productive life, health and profitability, as they allow establishing criteria with greater confidence to be combined in selection indexes for the genetic improvement programs that are being implemented in Brazil.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-10-31T18:16:10Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 317209 bytes, checksum: f65a937c86fae98c78b29974509988cb (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-31T18:16:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 317209 bytes, checksum: f65a937c86fae98c78b29974509988cb (MD5) Previous issue date: 2016-05-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Objetivou-se com este trabalho estimar parâmetros genéticos para características de produção de leite (produção de leite em até 305 dias – PL305), peso (peso aos 120 – P120, aos 365 – P365 e aos 550 dias – P550) e reprodutiva (idade ao primeiro parto - IPP) em bovinos da raça Guzerá utilizando modelos multicaracterísticos e comparar metodologias que se baseiam na utilização de dados censurados de idade ao primeiro parto. Os dados foram cedidos pela Associação Brasileira dos Criadores de Zebu (ABCZ) e Embrapa Gado de Leite em parceria com o Centro Brasileiro de Melhoramento do Guzerá (CBMG 2 ). O arquivo de pedigree (120.599 animais) incluiu animais com registros fenotípicos e todos os ancestrais conhecidos. Registros censurados foram definidos como dados de IPP que extrapolaram os limites de 740 e 1860 dias. Os registros de IPP (69.157 informações) foram analisados por meio de sete diferentes metodologias: método linear convencional (LM); de simulação (SM); de penalidade (PM); modelos bicaracterística limiar-linear em que se considerou (TLcens) ou não (TLmiss) informações prévias sobre os registros censurados; e a metodologia de análise de sobrevivência por meio do modelo de riscos proporcionais de Weibull segmentado em que se considerou (PWPHcens) ou não (PWPH) os registros censurados. Para as análises de sobrevivência, os valores para o critério de informação da deviance (DIC) sugerem o uso de 0 e 2 nós na função base para os métodos PWPH e PWPHcens, respectivamente. Os componentes de variância genética aditiva estimados para os métodos LM, PM e TLmiss foram similares. As estimativas de herdabilidade para IPP variaram de 0,19 (TLcens) à 0,28 (SM) e 0,40 (PWPH) e 0,46 (PWPHcens). De forma geral, as correlações entre os valores genéticos obtidos por meio das diferentes metodologias e a porcentagem de touros selecionados em comum variaram de -0,28 (SM x PWPH) à 0,99 (TLmiss x LM), indicando reordenamento moderado entre os animais. As comparações baseadas na metodologia de validação cruzada, indicam a metodologia TLmiss como a melhor opção para predição dos valores genéticos dos animais para a característica IPP na população Guzerá. Para estimação dos parâmetros genéticos utilizando modelos multicaracterísticos, foram considerados os efeitos sistemáticos de sexo e idade ao parto. Os efeitos aleatórios genético aditivo e de grupo de contemporâneo (rebanho, ano e estação de parto) foram considerados. Adicionalmente, os efeitos aleatórios genético aditivo materno e de ambiente permanente materno foram considerados para a característica peso à desmama. As estimativas de herdabilidade foram 0,29 (PL305), 0,42 (P120), 0,49 (P365), 0,56 (P550) e 0,25 (IPP). As correlações genéticas entre as características de peso foram maiores que 0,83 e entre PL305 e as demais foram de 0,25 (PL305 x P205), 0,32 (PL305 x P365) e 0,36 (PL305 x P550). A característica IPP foi negativamente correlacionada com as características de leite e de peso. Os resultados sugerem que a seleção para a produção de leite não compromete a seleção para características de peso e reprodutivas, bem como é passível a inclusão de dados censurados de IPP na avaliação genética por meio do uso de um modelo de limiar-linear em bovinos da raça Guzerá. / We aimed to estimate genetic parameters for 305-d milk yield (MY305), growth (weaning – WW, yearling – YW and long yearling weights - LYW) and reproductive (age at first calving - AFC) traits in Guzerá cattle by using Bayesian multi-trait models and compare methodologies for handling censored data of age at first calving by Bayesian models. Data were provided by Brazilian Association of Zebu Cattle (ABCZ) and Embrapa Dairy Cattle Research Unit in partnership with the Brazilian Center of Guzerá Genetic Improvement (CBMG 2 ). The pedigree file (120,599 animals) included animals with phenotypic records and their known ancestors. Censored records were defined as AFC records out of range of 740 and 1860 days. Data including 69,157 AFC records were analyzed using seven different methods: conventional linear method (LM), simulation method (SM), penalty method (PM), a bitrait threshold-linear model considering (TLcens) or not (TLmiss) any prior information about censored records; and piecewise Weibull proportional hazards methodology considering (PWPHcens) or not (PWPH) censored records. For survival analyses, deviance information criterion (DIC) values suggested 0 and 2 piecewise change points in the baseline function of PWPH and PWPHcens methods, respectively. The additive genetic variance components estimated from LM, PM and TLmiss were similar. Heritability estimates for AFC ranged from 0.19 (TLcens) to 0.28 (SM) in non-survival approaches, and 0.40 and 0.46 to PWPH and PWPHcens methods, respectively. In general, genetic breeding values correlations from different methods and the percentage of selected bulss in common indicated moderate reranking, ranging from -0.28 (SM x PWPH) to 0.99 (TLmiss and LM). Comparisons based on cross-validation analyses, indicated TLmiss as a suitable alternative for predicting breeding values for AFC in this Guzerá population. In second chapter, systematic effects included sex and age at calving. The additive genetic and contemporary group (herd, year and season of birth) were included as random effects. Additionally, maternal genetic and permanent effects were included as random effects for weaning weight trait. Heritability estimates were 0.29 (MY305), 0.42 (WW), 0.49 (YW), 0.56 (LYW) and 0.25 (AFC). Genetic correlations between weight measures were higher than 0.83 and 0.25 (MY305 x WW), 0.32 (MY305 x YW) and 0.36 (MY305 x LYW) for other traits. AFC trait was negatively genetically correlated with milk and weight measures. These results suggest that selection for milk yield do not jeopardize selection for beef and reproductive efficiency and AFC censored data could be included in genetic evaluation considering a threshold-linear model in Guzerá cattle. / Tese enviada por e-mail em 31/10/2018 pela secretaria do curso. Versão impressa não foi enviada.(Não foi encontrada no departamento)

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-11T18:57:23Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 282158 bytes, checksum: 4bd636dbaba1628cd7695d7dd7912001 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T18:57:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 282158 bytes, checksum: 4bd636dbaba1628cd7695d7dd7912001 (MD5) Previous issue date: 2003-05-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Utilizaram-se 49.927 registros de produção de leite de 27.209 vacas da raça Holandesa, filhas de 889 touros, pertencentes a 360 rebanhos, no período de 1980 a 2002, provenientes do Serviço de Controle Leiteiro da Associação dos Criadores de Gado Holandês de Minas Gerais. Os valores genéticos de vacas e touros foram obtidos por meio de um modelo animal e usados para estimação das médias dos diferenciais de seleção e tendências genéticas considerando-se quatro trilhas conectas a duas gerações. As análises foram realizadas por meio do sistema MTDFREML. O modelo de análise incluiu: os efeitos fixos de rebanho- ano-estação de parto, grupo genético, idade da vaca no parto como co-variável (efeitos linear e quadrático) e os efeitos aleatórios de animal, permanente de meio e erro. As estimativas do diferencial de seleção médio para as trilhas touros pais de touros (SB) e touros pais de vacas (SC), ponderadas pelo número de filhos foram, respectivamente, -55,82 e 46,72 e não-ponderadas foram -62,89 e 18,33 kg, respectivamente. A estimativa do diferencial de seleção médio para as trilhas vacas mães de touros (DB) e vacas mães de vacas (DC) foram, respectivamente, - 33,48 e 11,29 kg. O ganho genético anual foi de 6,71 kg. Os diferenciais de seleção indicaram maior eficiência na seleção de touros pais de vacas e vacas mães de vacas. As estimativas de tendências genéticas obtidas estão muito aquém do possível, sugerindo que as práticas de seleção no período deixaram a desejar. A partir do conjunto de dados iniciais foram selecionados registros de produção e reprodução de 7.601 vacas, filhas de 489 touros, nascidas de 1977 a 1993, pertencentes a 217 rebanhos, cujo objetivo era estimar parâmetros genéticos, fenotípicos e de meio ambiente para medidas de longevidade, estimar correlações, predizer valores genéticos para os animais e sugerir uma medida de longevidade apropriada para avaliações genéticas. As medidas de longevidade analisadas relacionadas à vida produtiva ou útil dos animais foram: número de lactações iniciadas, produção total nas lactações, número total de dias durante todas as lactações, tempo entre o nascimento e o último controle leiteiro e tempo entre a data do primeiro parto e o último dia de controle leiteiro. As outras medidas de longevidade analisadas relacionaram-se à capacidade de sobrevivência até um determinado tempo: sobrevivência até 36, 48, 60, 72 e 84 meses e sobrevivência até 12, 24, 36, 48 e 54 meses após o primeiro parto. As análises foram realizadas por meio do sistema MTDFREML, com modelo animal que incluiu os efeitos fixos de rebanho-ano-estação do parto, grupo genético e os efeitos aleatórios de animal e erro. As herdabilidades estimadas para medidas de longevidade, relacionadas à vida produtiva ou útil dos animais variaram de 0,07 a 0,10. Para as medidas relacionadas à capacidade de sobrevivência até um determinado tempo, as herdabilidades estimadas foram de 0,01 a 0,12. As correlações genéticas e fenotípicas entre as medidas de longevidade variaram de 0,72 a 1,0 e de -0,11 a 0,83, respectivamente. Em virtude de sua importância na economicidade dos sistemas de produção, devem ser viabilizadas maneiras de contemplar longevidade, em avaliações genéticas de bovinos para produção de leite. / Milk production records of 49,927 lactations from 27,209 Holstein cows daughters of 889 sires born from 1980 to 2002 in 360 herds supervised by the Holstein Association of the State of Minas Gerais were used. Sire and cow breeding values from an animal model were used to estimate average genetic selection differentials and genetic trends for the four paths of selection connecting two generations. MTDFREML was used. The model of analysis accounted for the fixed effects of herd-year-season of calving, genetic group, age of calving as covariate (linear and quadratic) and the random effects of animal, permanent environment and error. The average selection differentials for sire of bulls (SB) and sires of cows (SC), weighted by number of progenies, were, respectively, -55.82 and 46.72 and unweighted -62,89 and 18,33 kg, respectively. The estimates for dams of bulls (DB), and dams of cows (DC) were, respectively, -33.48, and 11.29 kg. The annual genetic gain was 6.71 kg. Selection differentials indicated greater efficiency for paths of sires of cows and dams of cows. xiEstimates of genetic trend were much less than theoretically possible, suggesting that the selection practices in the period of study were far from the optimum for maximum improvement of milk production. Production and breeding records of 7,601 cows born from 1977 to 1993, daughters of 489 sires in 217 herds were obtained from the initial data set to estimate genetic, phenotypic and environmental parameters for longevity measures, to predict animal breeding values and to suggest a measure of longevity appropriate for genetic evaluations. The measures of longevity related to productive life of the animals were number of lactations initiated, production over all lactations, days in lactation over all lactations, time between birth and last test day and time between first calving and last test day. Other lifetime measures were stayabilities (dead or alive) to 36, 48, 60, 72, and 84 month of age and stayability until 12, 24, 36, 48 or 54 months after first calving. MTDFREML with animal model that included the fixed effects of herd-year-season of calving, genetic group and the random effects of animal and error were used. Heritability estimates for longevity measures related to productive life were 0.07 to 0.10 and related to stayability were 0.01 to 0.12. Genetic and phenotypic correlations among measures of stayability were 0.72 to 1.0 and -0.11 to 0.83, respectively. Since longevity is important for the profitability of dairy production systems it should be considered in dairy cattle genetic evaluations.