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Molecular ecology has already provided profound insights into behaviour, ecology and systematics of organisms improving our understanding of the relationship between genetic variation and biodiversity. The objectives of my PhD were to develop new genetic markers and use these markers to address fundamental issues in evolutionary biology using shorebirds as model organisms. Shorebirds are part of the ancient avian Charadriiformes order and are characterised by extraordinary ecological and behavioural diversity. However, due to the lack of appropriate genetic markers the molecular ecology of many shorebirds has not been investigated previously. Therefore, first, I developed polymorphic microsatellite markers from genomic libraries for a behaviourally diverse shorebird, the Kentish plover Charadrius alexandrinus (Chapter II). Second, using the genomic data-bases I expended this work to develop further markers that cannot only be used in the Kentish plover, but also a large number of other shorebird species (Chapter III). Third, I investigated population differentiation and genetic diversity of Eurasian and American Kentish plover populations using the newly developed microsatellite markers and further mitochondrial markers (Chapter IV). The genetic differences between Eurasian and American populations that are mirrored by phenotypic differences call for a reconsideration of the current taxonomic status of the species; Eurasian and American populations should be recognised as belonging to two separate species. Finally, I asked how genetic diversity influences the fitness of precocial Kentish plover young (Chapter V). I found that survival of chicks until fledging was associated with genetic diversity (measured as heterozygosity) at three of eleven marker loci. Genetic diversity at one marker locus had a positive effect on survival whilst it had negative effects at two loci. The results of my PhD have brought up many new questions and I propose promising lines that need to be explored in the future (Chapter VI).

Thesis (PhD)--Stellenbosch University, 2015. / ENGLISH ABSTRACT: How organisms respond to unpredictable environments is a fundamental question in evolutionary ecology. For example, plants may reduce the risk of reproductive failure by spreading their reproductive effort in space (dispersal) or in time (dormancy, iteroparity). Similarly, different plant breeding systems, (for example the ability to autonomously self-fertilise) may reduce the risk of reproductive failure in environments where pollination in particular is unreliable. Each of these strategies may be affected by selective pressures exerted by heterogeneous abiotic and biotic environments (e.g. unreliable rainfall patterns or range edge habitats). However, there is little theoretical or empirical consensus on how these strategies are related. In Chapter 2, I explore the association between dispersal and breeding system traits and range edge proximity. I show that annual daisies from Namaqualand, South Africa, are characterised by two discreet syndromes: high selfing ability associated with good dispersal and obligate outcrossing associated with lower dispersal, regardless of range position. This chapter illustrates that selection on both breeding system and dispersal traits may act consistently across distribution ranges. Because co-flowering plants often share pollinators, their fecundity is likely affected by changes in pollinator visitation rates or the transfer of conspecific relative to heterospecific pollen. In Chapter 3 I experimentally investigate the effects of con- and heterospecific density and spatial distribution pattern on pollination and fecundity in annual Namaqualand daisies. I show that increasing conspecific density and aggregation enhanced fecundity through increased mate availability and reduced heterospecific interference, independent of pollinator visitation rates. Moreover, I demonstrate the benefits of autonomous selfing when mates are limited and the potential for interspecific pollen transfer is high. In Chapter 4, I examine relative investment in dispersal vs. dormancy in seed heteromorphic Dimorphotheca (Asteraceae) species in relation to life history, rainfall unpredictability and range edge proximity. I show annuals and perennials differ significantly in the relative investment in different dispersal strategies. However, my findings provide little support for theoretical predictions of bet-hedging strategies in unpredictable or range edge habitats. This chapter emphasises the role of local environmental factors on fruit set that may obscure expected patterns across broad climatic gradients. Because of different costs and benefits of dispersal in space and time, we may expect negative patterns of covariation among dispersal and dormancy as alternative risk-reducing strategies. In Chapter 5, I provide evidence for a trade-off between these traits across 27 wind- dispersed daisy species from South Africa. This trade-off did not depend on life history effects, but was inconsistent at different levels of biological organisation. I also show that the effects of life history on spatial and temporal dispersal were inconsistent. Taken together, my research illustrates the importance of simultaneously investigating different risk-reducing strategies, because associations among them are clearly complex and often contradict theoretical expectations. Moreover I show that the effects of life history and phylogenetic relatedness cannot be disregarded. My findings underscore the importance of dispersal in space and time as well as autonomous selfing as risk-reducing responses to unreliable environments.

Orientador: Mateus José Rodrigues Paranhos da Costa / Banca: Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito / Banca: José Maurício Barbanti Duarte / Banca: Paulo Bahiense Ferraz Filho / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Resumo: Estudos recentes revelaram a estruturação de diversas populações de vertebrados a um nível local. Essa estruturação tem sido relacionada aos sistemas de acasalamento e padrões de filopatria-dispersão das espécies. Esse estudo objetivou estudar como a organização espacial contribui para a estruturação genética de uma população. Avaliamos os papéis da filopatria e da dispersão a partir do comportamento espacial e da estrutura genética de uma população de mouflons mediterrâneos. Localizações obtidas por radiotelemetria foram utilizadas para descrever o comportamento espacial de ambos os sexos durante o período reprodutivo. Fêmeas mostraram-se filopátricas e revelaram uma estruturação sócio-espacial em unidades de população. Parte dos machos manteve-se fiel ao domínio reprodutivo de um ano a outro, enquanto outros dispersaram para outro domínio. Domínios reprodutivos de machos não sobrepõem apenas uma unidade de fêmeas. Inferimos sobre os fluxos gênicos promovidos pelos machos que se deslocam entre as unidades, a partir do polimorfismo de microsatélites. O teste de Hardy-Weinberg sugeriu uma população em desequilíbrio. Os testes de diferenciação gênica e genotípica e o FST confirmaram a estruturação genética da população. Mas não houve perda de heterozigose a nível da população ou no interior das unidades. O comportamento individual dos animais aparece como um fator importante da estruturação genética da população. Fêmeas mostram-se fortemente filopátricas e a aleatoriedade dos acasalamentos parece assegurada por um sistema reprodutivo baseado na promiscuidade. O fluxo gênico é mantido pela dispersão de parte dos machos, mantendo a panmixia no interior das unidades / Abstract: Recent studies revealed the presence of fine-scale genetic structure in wild vertebrate populations. This structure has been related to breeding systems and specie's philopatry-dispersal pattern. The objective of this study was to examine how the spatial organization contributes to the genetic structure of a population. The role of philopatry and dispersion was evaluated from the spatial behaviour and genetic structure of a mouflon sheep population. Radio-tracking data was used to describe spatial behavior for both sexes during rut. Ewes were found to be partitioned in sociospatial units o which they were faithful. Movements patterns of rams were much more variable: some males remain faithful to the breeding area from one year to another, while others dispersed to other domain. Male rutting range can overlap more than once unit. We can infer about the male gene flow promoted by moving between the units from the polymorphism of microsatellites. Hardy-Weinberg test suggested disequilibrium in population. Genic and genotypic differentiation tests and FST confirmed the genetic structure of population. But there was no loss of heterozigosys neither at the population level nor within the units. The individual behavior of animals appears an important factor of population genetic structuring. Females are strongly phylopatrics. Randomness of matings would be assured by a reproductive system based on promiscuity. The gene flow between units and panmixia inside the units are maintained by some dispersal males / Doutor

Submitted by Rafael Vitor Ferreira null (raphael_vfe@hotmail.com) on 2016-10-30T22:23:27Z No. of bitstreams: 1 DiSSERTAÇÃO Rafael Vitor Ferreira.pdf: 927532 bytes, checksum: a411b3eb773aa86dde595844a8179323 (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-11-04T16:31:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ferreira_rv_me_ilha.pdf: 832160 bytes, checksum: a11ba065cb8c325bcc5466028cd03cc5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-04T16:31:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ferreira_rv_me_ilha.pdf: 832160 bytes, checksum: a11ba065cb8c325bcc5466028cd03cc5 (MD5) Previous issue date: 2016-09-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O objetivo deste trabalho é disponibilizar dados de desempenho reprodutivo e produtivo de suínos da raça Moura mantidos em sistema semi-intensivo, bem como avaliar o potencial de utilização do cruzamento de fêmeas Moura com macho sintético, MS115, para produção de leitões. Os dados utilizados no estudo fazem parte do banco de dados do setor de suínos da Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Unesp – Campus de Ilha Solteira - SP. No primeiro estudo foram selecionados e classificados resultados de desempenho reprodutivo (nascidos totais, nascidos vivos, perdas, mortalidade 1 a 21 dias, mortalidade do nascimento ao desmame, peso ao nascimento, peso aos 21 dias, peso aos desmame, ganho de peso até 21 dias e ganho de peso diário até o desmame) de 332 parições oriundas de acasalamento entre machos e fêmeas da raça Moura no período de 2006 a 2016. Para a classificação foram consideradas as ordens de parto (da primeira à sétima) e as estações do ano (primavera, verão, outono e inverno). A estação do ano pouco influenciou no desempenho das matrizes, mas os partos de 4ª e 5ª ordem apresentaram os melhores resultados para número de nascidos vivos e peso ao nascimento. No segundo estudo foram avaliados 60 partos, 30 provenientes do acasalamento de machos e fêmeas puros da raça Moura, e 30 provenientes do cruzamento entre fêmeas Moura e machos MS115, totalizando 526 leitões para avaliação até o desmame. Os partos foram classificados de acordo com a origem genética do macho, ordem de parto e estação do ano. De forma geral a origem do macho não interferiu (P>0,05) no número total de leitões nascidos/parto, leitões vivos/parto e taxas de mortalidade, porém o cruzamento da fêmea Moura com o macho MS115 promoveu melhor (P<0,05) desempenho das leitegadas até o desmame. Independente da origem genética do macho, para 3ª ordem de parto foi observado o maior de leitões nascidos e leitões vivos/parto (P<0,05), mas também a maior mortalidade até o desmame. / The objective of this study is to provide data for reproductive and productive performance Moura breed sows kept in semi-intensive system and to evaluate the potential use of Moura sows crossing with synthetic male, MS115, for the production of piglets. The data used in the study are part of the pig farm database of Farm Research, Education and Extension UNESP –Ilha Solteira - SP. In the first study were selected and classified results of reproductive performance (total number of piglets born/parturition, alive piglets/parturition, losses, mortality 1 to 21 days, mortality at weaning, birth weight, weight at 21 days, weight at weaning, daily weight gain up to 21 days and daily weight gain until weaning) 332 parities derived from mating between males and females of Moura breed from 2006 to 2016. For classification were considered the parturition order (the first to seventh) and seasons (spring, summer, autumn and winter). The season had little influence on the performance of the sows, but the 4th and 5th birth order showed the best results for number of live births and birth weight. In the second study we evaluated 60 births, 30 from the mating males and females of Moura breed and 30 from the cross between Moura sows and MS115males, totaling 526 piglets for evaluation until weaning. The births were classified according to genetic male, parturition order and season. In general, the male origin did not affect (P>0.05) the total number of piglets born/parturition, living piglets/parturition and mortality rates, but the crossing between Moura female and MS115male promoted better (P <0.05) performance of piglets until weaning. Regardless of the genetic male origin, in the 3rd parturition order occurred the largest number of piglets born/parturition and alive piglets/parturition(P<0.05), but also the highest mortality until weaning(P<0.05).

Orientador: Rosemeira da Silva Filardi / Resumo: O objetivo deste trabalho é disponibilizar dados de desempenho reprodutivo e produtivo de suínos da raça Moura mantidos em sistema semi-intensivo, bem como avaliar o potencial de utilização do cruzamento de fêmeas Moura com macho sintético, MS115, para produção de leitões. Os dados utilizados no estudo fazem parte do banco de dados do setor de suínos da Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Unesp – Campus de Ilha Solteira - SP. No primeiro estudo foram selecionados e classificados resultados de desempenho reprodutivo (nascidos totais, nascidos vivos, perdas, mortalidade 1 a 21 dias, mortalidade do nascimento ao desmame, peso ao nascimento, peso aos 21 dias, peso aos desmame, ganho de peso até 21 dias e ganho de peso diário até o desmame) de 332 parições oriundas de acasalamento entre machos e fêmeas da raça Moura no período de 2006 a 2016. Para a classificação foram consideradas as ordens de parto (da primeira à sétima) e as estações do ano (primavera, verão, outono e inverno). A estação do ano pouco influenciou no desempenho das matrizes, mas os partos de 4ª e 5ª ordem apresentaram os melhores resultados para número de nascidos vivos e peso ao nascimento. No segundo estudo foram avaliados 60 partos, 30 provenientes do acasalamento de machos e fêmeas puros da raça Moura, e 30 provenientes do cruzamento entre fêmeas Moura e machos MS115, totalizando 526 leitões para avaliação até o desmame. Os partos foram classificados de acordo com a origem genética do... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

As informações existentes em torno da estrutura genética e do sistema reprodutivo das populações de Oryza glumaepatula são poucas e ainda precárias. Este estudo teve como objetivo caracterizar a estrutura genética de 11 populações provenientes dos Rios Japurá, Solimões, Purus, Negro, Xingú e Tapajós (provenientes da bacia Amazônica) e dos Rios Paraguai e Taquari (provenientes da bacia do Paraguai) amostrando-se 30 indivíduos por população e avaliar o sistema reprodutivo em três dessas populações (SO-6, XI-1 e PG-1) a partir de 10 progênies maternas, com 10 plantas por progênie, em cada população. O DNA dos indivíduos foi extraído, quantificado e avaliado com base em oito locos de microssatélites e uma média de 10 alelos/loco. Estimaram-se parâmetros de diversidade genética, as estatísticas F e o fluxo gênico, verificando-se a existência de estruturação espacial, por meio do coeficiente de correlação de Pearson (r), e teste de Mantel. O sistema reprodutivo foi avaliado pela taxa de cruzamento aparente (nas populações) e pela taxa multilocos para as famílias das três populações. Obtiveram-se as seguintes estimativas de parâmetros genéticos: 77,3% de locos polimórficos; Ho (heterozigosidade observada média)= 0,091; He (diversidade gênica) = 0,393; FST = 0,491 (e RST = 0,608); FIS = 0,780 e FIT = 0,888. Nenhuma população foi encontrava-se em equilíbrio de Hardy-Weinberg. A taxa média de cruzamento aparente foi de t a = 0,124 sugerindo sistema misto de reprodução com tendência a autogamia. Uma exceção foi a população do Rio Xingu (XI-1) que apresentou menos autogamia com ta = 0,454, Ho = 0,233, He = 0,369 e o mais baixo índice de fixação f = 0,371. Os resultados indicam haver grande diversidade genética entre as populações bem como níveis variáveis de autofecundação natural. As populações não se encontraram estruturadas no espaço, pois foi nula a correlação entre distâncias genéticas e geográficas (r = 0,03). O estudo do sistema reprodutivo foi baseado num número médio menor de alelos por loco e forneceu as seguintes estimativas para as três populações (XI-1, SO-6 e PG-1), respectivamente: número médio de alelos por loco: 3, 3 e 5; endogamia das plantas-mãe ( ˆF m): 0,399, 0,846 e 0,631; taxas de cruzamentos multiloco ( ˆt m): 0,160, 0,011 e 0,223; uniloco ( ˆt s): 0,078, 0,003 e 0,100; cruzamento biparental ( ˆt m - ˆt s): 0,083, 0,008 e 0,123; coeficiente de coancestria ( &#952;fam): 0,711, 0,846 e 0,748. Os resultados confirmam a desuniformidade no sistema reprodutivo das populações, que variou de autogamia absoluta até taxas de cruzamento de 22,3%. Essa desuniformidade bem como a alta diversidade genética interpopulacional e a ausência de estruturação espacial indicam que atividades de conservação devem abranger o maior número possível de populações. / Informations about genetic structure and breeding systems are little and poorly of natural O. glumaepatula populations. The objective of this study was the characterization of the genetic structure of 11 populations from Japura, Solimoes, Purus, Negro, Xingu and Tapajos rivers (from Amazon Hidrographic Basin) and from Paraguai and Taquari rivers (from Paraguai Hidrographic Basin), sampling 30 individuals per population and analisys of breeding system of three populations SO-6, XI-1 and PG-1, from 10 mother progeny with 10 plants per progeny in each population. Individuals DNA were extracted quantified and analyzed utilizing eigth microsatellite loci with a mean of 10 alleles per loci. Genetic diversity parameters, Wright’s F-statistics and gene flow were stimated. Space structure was also verified using Pearson’s correlation coefficient (r) and Mantel’s test. The breeding system was examined by the apparent outcrossing rate (in the populations) and multilocus outcrossing rate obtained for the progenies of three populations.The following estimates of parameters were obtained: 77.3% polymorphic loci; Ho (observed heterozigosity) = 0.091; He (diversidade gênica) = 0.393; FST = 0.491 (e RST = 0.608); FIS = 0.780 e FIT = 0.888. Neither population was in Hardy-Weinber equilibrium. The average of apparent outcrossing rate was t a = 0.124, suggesting mixed mating system with predominance of inbreeding. One exception was the Xingu’s river population (XI-1), which have presented the lowest autogamy indices with ta = 0.459, Ho = 0.233, He = 0.369, and the lowest fixation index f = 0.371. These results pointed for a high genetic divesity between populations also variable natural inbreeding degrees. These populations were not structured on space, because were null the correlations between genetic and geographic distances (r = 0.003). The study of breeding system was based on lowest average alleles number per loci and to provide the following estimates for the three populations (XI-1, SO-6 e PG-1) respectively: average number of alleles per loci: 3, 3 and 5; maternal inbreeding ( ˆF m): 0.399, 0.846 and 0.631; multilocus outcrossing rate ( ˆt m): 0.160, 0.011 and 0.223; single-locus ( ˆt s): 0.078, 0.003 and 0.100; biparental inbreeding ( ˆt m - ˆt s): 0.083, 0.008 and 0.123; coancestry coefficient ( &#952;fam): 0.711, 0.846 and 0.748. These results confirm the population desuniform mating system, which had varied from perfect autogamy to 22.3% of outcrossing rates. That desuniformity as well as the high interpopulation genetic diversity and the absence of space structuring indicate that conservation activities should include the largest possible number of populations.

[Truncated abstract] In the last two decades, the use of microsatellites has revolutionized the study of ecology and evolution. Microsatellites, or short tandem repeats (STRs), are stretches of DNA repeats, 1 to 5 nucleotides long, where the number of repeats varies between individuals. They are co-dominant, highly variable, neutral markers, and are inherited in a Mendelian fashion. Microsatellite loci were isolated from Dawson’s burrowing bee, Amegilla dawsoni, a large, fast-flying solitary nesting bee endemic to the arid zone of Western Australia. Twelve polymorphic loci were found with an observed number of alleles ranging from two to 24 and observed heterozygosities between 0.17 and 0.85. These loci were used to examine two aspects of this bee’s molecular ecology; its population structure and mating system ... The molecular data were also used to show that the nesting female is the mother of all her offspring and that brood parasitism is unlikely in this species. The data indicate that females make daughters at the beginning of the season followed by large sons in the middle, and then small sons at the end. Females often place one brood cell directly above another. The distribution of sex and morph in these doublets follows a pattern with most containing a female on the bottom and a minor male on the top, followed by almost equal numbers of female on top of female and minor male on top of major male. This pattern is likely favoured by emergence patterns, with males emerging before females and minor males emerging before major males. I suggest that although minor males have low reproductive success, their production may nonetheless be beneficial in that minor males open up emergence tunnels for their larger and reproductively more valuable siblings. In addition, minor males may represent the ‘best of a bad job’ provisioning tactic arising from changes in the costs to nesting females of gathering brood provisions over the course of the flight season. This thesis demonstrates that microsatellites can be used to answer many questions regarding the molecular ecology of a species from the behaviour of the bees on a population scale to the mating behaviour of individual bees and how they allocate resources for the next generation. Many other aspects of the bee’s ecology could also be examined now that suitable molecular markers exist.

Submitted by Edineia Teixeira (edineia.teixeira@unioeste.br) on 2018-09-27T14:36:57Z No. of bitstreams: 2 Andressa_Grosbelli_2018.pdf: 1311256 bytes, checksum: ea09960676f17abb9d174deb55efda93 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-27T14:36:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Andressa_Grosbelli_2018.pdf: 1311256 bytes, checksum: ea09960676f17abb9d174deb55efda93 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-02-22 / Besides the concern with the exhaustion of energy sources and environmental consequences, it is necessary to know the potential that these sources of energy (swine manure) can present. The present work has had the objective of discussing and analyzing, on the basis of field and laboratory studies, the production of biogas in different breeding types and stages of pigs, being the treatments: two nursery units (T1 and T2), three growth and termination units (T3, T4 and T5) and two piglets production units (T6 and T7). ST and SV analyzes were performed, reducing the organic load of the swine manure used. The biodigestors used were batch type, made of PVC pipes and fed with the waste from different types of pig farming. The HRT was 45 days and significant averages of biogas production, ST and SV removal were found, good volume yield related to SVs removed and added. The T5 treatment presented the best removal of COD (72.3%), being also the one that produced the most biogas during the 45 days (5.3L), nevertheless it presented a low efficiency in the removal of the volatile solids, being necessary a time of HRT higher for better treatment efficiency. On the other hand, the T7 treatment presented the best values of removal efficiency of volatile solids during the study period, with 71.48% / Além da preocupação com o esgotamento das fontes de energias fosséis e com consequências ambientais, hoje, se faz necessário saber o potencial que as fontes alternativas podem apresentar. O presente trabalho teve com objetivo discutir e analisar com base em estudos a campo e em laboratório, a produção de biogás em diferentes sistemas de criação e fases de suínos em: duas unidades de creche (T1 e T2), três unidades de crescimento e terminação (T3, T4 e T5) e duas unidades de produção de leitões (T6 e T7). Foram realizadas análises de ST, SV e DQO. Os biodigestores utilizados foram do tipo batelada, feitos de tubos de PVC e o TRH foi de 45 dias. Foram encontradas médias significativas de produção de biogás, remoção dos ST e SV, bom rendimento de volume relacionado aos SV removidos e adicionados. O tratamento T5 apresentou a melhor remoção de DQO (72,3%), sendo também o que mais produziu biogás ao longo dos 45 dias (5,3L), no entanto apresentou uma baixa eficiência na remoção dos sólidos voláteis, sendo necessário um TRH maior para a melhor eficiência do tratamento. Em contrapartida, o tratamento T7 apresentou os melhores valores de eficiência de remoção de sólidos voláteis durante o período de estudo, com 71,48%.

As informações existentes em torno da estrutura genética e do sistema reprodutivo das populações de Oryza glumaepatula são poucas e ainda precárias. Este estudo teve como objetivo caracterizar a estrutura genética de 11 populações provenientes dos Rios Japurá, Solimões, Purus, Negro, Xingú e Tapajós (provenientes da bacia Amazônica) e dos Rios Paraguai e Taquari (provenientes da bacia do Paraguai) amostrando-se 30 indivíduos por população e avaliar o sistema reprodutivo em três dessas populações (SO-6, XI-1 e PG-1) a partir de 10 progênies maternas, com 10 plantas por progênie, em cada população. O DNA dos indivíduos foi extraído, quantificado e avaliado com base em oito locos de microssatélites e uma média de 10 alelos/loco. Estimaram-se parâmetros de diversidade genética, as estatísticas F e o fluxo gênico, verificando-se a existência de estruturação espacial, por meio do coeficiente de correlação de Pearson (r), e teste de Mantel. O sistema reprodutivo foi avaliado pela taxa de cruzamento aparente (nas populações) e pela taxa multilocos para as famílias das três populações. Obtiveram-se as seguintes estimativas de parâmetros genéticos: 77,3% de locos polimórficos; Ho (heterozigosidade observada média)= 0,091; He (diversidade gênica) = 0,393; FST = 0,491 (e RST = 0,608); FIS = 0,780 e FIT = 0,888. Nenhuma população foi encontrava-se em equilíbrio de Hardy-Weinberg. A taxa média de cruzamento aparente foi de t a = 0,124 sugerindo sistema misto de reprodução com tendência a autogamia. Uma exceção foi a população do Rio Xingu (XI-1) que apresentou menos autogamia com ta = 0,454, Ho = 0,233, He = 0,369 e o mais baixo índice de fixação f = 0,371. Os resultados indicam haver grande diversidade genética entre as populações bem como níveis variáveis de autofecundação natural. As populações não se encontraram estruturadas no espaço, pois foi nula a correlação entre distâncias genéticas e geográficas (r = 0,03). O estudo do sistema reprodutivo foi baseado num número médio menor de alelos por loco e forneceu as seguintes estimativas para as três populações (XI-1, SO-6 e PG-1), respectivamente: número médio de alelos por loco: 3, 3 e 5; endogamia das plantas-mãe ( ˆF m): 0,399, 0,846 e 0,631; taxas de cruzamentos multiloco ( ˆt m): 0,160, 0,011 e 0,223; uniloco ( ˆt s): 0,078, 0,003 e 0,100; cruzamento biparental ( ˆt m - ˆt s): 0,083, 0,008 e 0,123; coeficiente de coancestria ( &#952;fam): 0,711, 0,846 e 0,748. Os resultados confirmam a desuniformidade no sistema reprodutivo das populações, que variou de autogamia absoluta até taxas de cruzamento de 22,3%. Essa desuniformidade bem como a alta diversidade genética interpopulacional e a ausência de estruturação espacial indicam que atividades de conservação devem abranger o maior número possível de populações. / Informations about genetic structure and breeding systems are little and poorly of natural O. glumaepatula populations. The objective of this study was the characterization of the genetic structure of 11 populations from Japura, Solimoes, Purus, Negro, Xingu and Tapajos rivers (from Amazon Hidrographic Basin) and from Paraguai and Taquari rivers (from Paraguai Hidrographic Basin), sampling 30 individuals per population and analisys of breeding system of three populations SO-6, XI-1 and PG-1, from 10 mother progeny with 10 plants per progeny in each population. Individuals DNA were extracted quantified and analyzed utilizing eigth microsatellite loci with a mean of 10 alleles per loci. Genetic diversity parameters, Wright’s F-statistics and gene flow were stimated. Space structure was also verified using Pearson’s correlation coefficient (r) and Mantel’s test. The breeding system was examined by the apparent outcrossing rate (in the populations) and multilocus outcrossing rate obtained for the progenies of three populations.The following estimates of parameters were obtained: 77.3% polymorphic loci; Ho (observed heterozigosity) = 0.091; He (diversidade gênica) = 0.393; FST = 0.491 (e RST = 0.608); FIS = 0.780 e FIT = 0.888. Neither population was in Hardy-Weinber equilibrium. The average of apparent outcrossing rate was t a = 0.124, suggesting mixed mating system with predominance of inbreeding. One exception was the Xingu’s river population (XI-1), which have presented the lowest autogamy indices with ta = 0.459, Ho = 0.233, He = 0.369, and the lowest fixation index f = 0.371. These results pointed for a high genetic divesity between populations also variable natural inbreeding degrees. These populations were not structured on space, because were null the correlations between genetic and geographic distances (r = 0.003). The study of breeding system was based on lowest average alleles number per loci and to provide the following estimates for the three populations (XI-1, SO-6 e PG-1) respectively: average number of alleles per loci: 3, 3 and 5; maternal inbreeding ( ˆF m): 0.399, 0.846 and 0.631; multilocus outcrossing rate ( ˆt m): 0.160, 0.011 and 0.223; single-locus ( ˆt s): 0.078, 0.003 and 0.100; biparental inbreeding ( ˆt m - ˆt s): 0.083, 0.008 and 0.123; coancestry coefficient ( &#952;fam): 0.711, 0.846 and 0.748. These results confirm the population desuniform mating system, which had varied from perfect autogamy to 22.3% of outcrossing rates. That desuniformity as well as the high interpopulation genetic diversity and the absence of space structuring indicate that conservation activities should include the largest possible number of populations.