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Seleção de genótipos de Coffea arabica l. com resistência a Meloidogyne spp. em condições de casa de vegetação e a campo / Selection for resistance to meloidogyne spp. in coffea arabica accessions under greenhouse and field conditions

Peres, Ana Catarina Jesus 19 July 2013 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2014-01-21T11:29:36Z No. of bitstreams: 1 2013_AnaCatarinadeJesusPeres.pdf: 1266436 bytes, checksum: c245d1ac4c3f889edbe50f4072ec8072 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-02-11T14:02:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_AnaCatarinadeJesusPeres.pdf: 1266436 bytes, checksum: c245d1ac4c3f889edbe50f4072ec8072 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-11T14:02:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_AnaCatarinadeJesusPeres.pdf: 1266436 bytes, checksum: c245d1ac4c3f889edbe50f4072ec8072 (MD5) / O cultivo do cafeeiro no Brasil vem enfrentando sérios problemas em relação aos nematoides parasitas dessa cultura, com grandes perdas na produção e prejudicando econômicamente os cafeicultores. Os nematoides de galhas são os mais importantes, dentre eles, Meloidogyne paranaensis e M. incognita se destacam pela intensidade dos danos que causam e pela distribuição nas áreas produtoras. Até o presente momento, não há métodos de controle que sejam realmente eficazes para esses fitoparasitas, sendo a resistência genética um dos meios mais promissores. Dessa maneira, o que se objetivou com este experimento foi identificar acessos de cafeeiro com resistência a M. paranaensis e a M. incognita raça 1, que têm se mostrado promissores em condições de campo. Os materiais avaliados foram provenientes da seleção de genótipos de Coffea arabica do Banco de Germoplasma de Café da EPAMIG. Foram inoculadas com esses nematoides, plântulas de 18 diferentes cruzamentos ou acessos, mais uma cultivar padrão de resistência (IPR 100) e outra, padrão de susceptibilidade (Mundo Novo). Esses acessos foram avaliados quanto ao grau de resistência/suscetibilidade, usando a variável fator de reprodução. Dos tratamentos avaliados, foram considerados resistentes ao nematoide M. incognita, cinco acessos do cruzamento entre Catuaí Vermelho e Amphillo MR 2161 (tratamentos 2, 3, 4, 14, 19), um acesso do cruzamento entre Catuaí Vermelho x Amphillo MR 2474 (tratamento 5), dois acessos do Híbrido do Timor UFV 408-1 (tratamento 8 e 10), e a culivar padrão de resistência IPR-100 (tratamento 20). Para o nematoide M. paranaensis foram considerados resistentes, quatro acessos do cruzamento entre Catuaí Vermelho e Amphillo MR 2161 (tratamentos 3, 14, 16, 19), um acesso do cruzamento entre Catuaí Vermelho x Amphillo MR 2474 (tratamento 5), um acesso do Híbrido do Timor UFV 408-1 (tratamento 8), e a culivar padrão de resistência IPR-100 (tratamento 20). Resultados obtidos a campo, com as plantas matrizes dos acessos avaliados, demonstraram que as plantas que originaram as progênies dos tratamentos 3 e 16 (Catuaí Vermelho x Amphillo MR 2161) e 12 (Amphillo x H. Natural MR 36-349) foram resistentes e bastante produtivas, ao passo que as plantas que originaram as progênies avaliadas nos tratamentos 5 e 7 (Catuaí Vermelho x Amphillo MR 2474), no 8 (Híbrido do Timor UFV 408-01) e no 14 (Catuaí Vermelho x Amphillo MR 2161) também apresentaram resistência e boa produtividade. Com esse experimento pode-se concluir que existe resistência múltipla a Meloidogyne spp. nos materiais avaliados (3, 5, 8, 14, 19, 20) em condições de campo e casa de vegetação e boas perspectivas de produtividade para o desenvolvimento de novas cultivares de C. arabica, que possam ser usadas em programas de melhoramento para futura utilização em áreas infestadas por nematoides, visando a manutenção e a sustentabilidade da produção cafeeira. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Nematode parasitism significantly impact coffee production in Brazil with reducing yields and economic losses. Root-knot nematodes (RKN) are amongst the most economically important plant-parasitic nematodes infecting coffee in Brazil, particularly, Meloidogyne paranaensis and M. incognita due to their pronounced plant damage and widespread distribution throughout coffee-producing areas. Currently, there are no control methods that are really effective against coffee-associated RKNs and genetic resistance is considered the most promising one. The objective of this study was to identify coffee materials resistant to M. paranaensis and M. incognita race 1, which have shown promising agronomic traits in the field. Genotype selections (accessions) of Coffea arabica obtained from the Coffee Germoplasm Bank (EPAMIG) were used in this study. Seedlings of 18 different accessions, plus a resistant (cv. IPR-100) and a susceptible (cv. Mundo Novo) check, were inoculated with these two nematode species. Nematode reproduction factor was used to infer coffee accession responses (resistance/susceptibility) to nematode infection. Five accessions from crossing between Catuaí Vermelho x Amphillo MR 2161 (treatments 2, 3, 4, 14, 19), one accession from crossing between Catuaí Vermelho x Amphillo MR 2474 (treatment 5), two accessions from Timor Hybrid UFV 408-01 (treatment 8 and 10) and the resistant control cv. IPR-100 were resistant to M. incognita race 1. Four accessions from crossing between Catuaí Vermelho x Amphillo MR 2161 (treatments 3, 14, 16, 19), one accession from Timor Hybrid UFV 408-01 (treatment 8) and the cv IPR-100 were resistant to M. paranaensis. Field testing with parental genotypes showed that plants that originated progenies of Catuaí Vermelho x Amphillo MR 2161 (treatments 3 and 6) and Amphillo x H. Natural MR 36-349 (treatment 12) were resistant and highly productive, while plants that originated progenies from Catuaí Vermelho x Amphillo MR 2474 (treatments 5 and 7), Timor Hybrid UFV 408-01 (treatment 8) and Catuaí Vermelho x Amphillo MR 2161 (treatment 14) were also resistant and with good yield. Overall, materials from treatments (3, 5, 8, 14, 19 and 20) were resistant to both M. paranaensis and M. incognita race 1 under greenhouse/field conditions and showed promising agronomic traits which can be used in breeding programs to develop new cultivars of C. arabica and maintain sustainable coffee production.
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Controle biológico de nematóides de galha do cafeeiro com fungos nematófagos /

Krzyzanowski, Alaíde Aparecida. January 2006 (has links)
Resumo: Os objetivos do trabalho foram isolar, identificar, comparar meios de cultura para crescimento, esporulação de fungos nematófagos e testá-los no controle de Meloidogyne exigua e M. paranaensis em laboratório, casa de vegetação e em cafezal infestado. Foram testados dois isolados de Arthrobotrys oligospora e um de Arthrobotrys sp., A. musiformis, Monacrosporium robustum e Paecilomyces liIacinus. Os dados obtidos revelaram que esses fungos ocorrem em diferentes agroecossistemas, têm exigências nutricionais especiais e apresentam diferentes níveis de predação para os nematóides estudados. Os meios, farelo de arroz, extrato de levedura e ágar, e o de fubá e ágar propiciaram crescimento e esporulação adequados para a maioria dos isolados estudados. A mistura de palha de café com farelo de arroz foi um substrato adequado para formulação desses fungos. Uma aplicação de 1 ou 2 L da mistura de partes iguais desse substrato colonizado pelos fungos, proporcionou a redução da população dos nematóides. No período estudado a cultura tratada não esboçou sinais de recuperação, indicando que cafezais depauperados, em solos degradados, não se recuperam com uma aplicação. Os dados também possibilitaram inferir que o controle biológico dos nematóides do cafeeiro será tanto mais efetivo quanto mais cedo forem iniciados os tratamentos, e a aplicação sistemática dos fungos, com isolados mais agressivos contra os nematóides presentes, deve ser efetuada. / Abstract: The objective of the research was to isolate, identify and compare culture media for growth and sporulation of nematode antagonistic fungi, and to evaluate the efficiency of these agents for biological control of Meloidogyne exigua and M. paranaensis under laboratory, greenhouse and field environmental conditions. Two isolates of Arthrobotrys oligospora, one of Arthrobotrys sp. and one of each species of A. musiformis, Monacrosporium robustum and Paecilomyces liIacinus, were also evaluated. It was observed that those fungi were very common under distinct agroecosystems, having special nutrition requirements, and also different pathogenicity levels for the nematodes above related. The culture media prepared with rice meal, malt extract and agar as well as the com meal agar favoured adequate growth and sporulation of most the isolates evaluated. The mixture of coffee straw with rice meal showed to be an adequate substrate for these fungi formulation under experimental trials. Just one application of one or two liters of a mixture of equal parts of the substrate colonized by the fungi, reduced the population of nematodes. However, the treated coffee trees did not show any sign of recovery during the period of study, indicating that weak coffee trees under poor soil conditions could not recover with just one treatment. The data also show that biological control of coffee nematodes can be more effective as early as the treatment with the fungi is applied, and, considering that it is a perennial crop, the fungi systematic application along with the selection of more aggressive isolates against the nematodes, must be done. / Orientador: Jaime Maia dos Santos / Coorientador: Rita de Cássia Panizzi / Banca: Marineide Mendonça Aguillera / Banca: Carlos Eduardo de Mendonça Otoboni / Banca: David Ariovaldo Banzatto / Banca: João Carlos de Oliveira / Doutor
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Incidência de fungos da pré-colheita ao armazenamento de café / Fungi incidence from the coffee pre-harvest to the storage

Parizzi, Fátima Chieppe 31 March 2005 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-03-07T18:39:38Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2084940 bytes, checksum: bf3a1b17ddb42eaba141b192a296bec1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-07T18:39:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2084940 bytes, checksum: bf3a1b17ddb42eaba141b192a296bec1 (MD5) Previous issue date: 2005-03-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As maiores preocupações dos países produtores de café estão voltadas, atualmente, para a qualidade intrínseca do produto, especialmente quanto à isenção de contaminantes, tais como as micotoxinas. A adoção da Análise de Perigos e Pontos Críticos de Controle APPCC na cadeia agroprodutiva do café é uma das medidas preventivas recomendadas, cujos princípios baseiam- se na avaliação sistemática dos perigos e na identificação dos Pontos Críticos de Controle (PCC). Objetivando a obtenção de informações que subsidiem a adoção da APPCC, estudou-se a incidência de fungos toxigênicos e de ochratoxina A (OTA) nas etapas de pré-colheita e processamento do café colhido em três áreas topograficamente diferentes e submetido à pré- secagem em terreiros de cimento e de chão e complementação da secagem em leito fixo. Amostras do produto foram coletadas antes da colheita, na saída do lavador, durante a secagem nos terreiros e ao ser transferido para o secador. Na detecção de fungos, a casca e o grão foram plaqueados separadamente, depois da desinfecção superficial dos frutos. O produto beneficiado, acondicionado em sacos de jutas, foi armazenado por 180 dias e amostrado para avaliações qualitativas, mediante análises de incidência de fungos, índice de OTA, conteúdo de água, acidez total do grão, acidez do óleo, condutividade elétrica, classificação física e qualidade de bebida. Na análise estatística dos dados foram usadas as análises de variáveis canônicas (CVA), de variância por medida repetida e de correlação canônica. Este estudo foi complementado com a execução de análises espectrais do café, com vistas ao desenvolvimento de discriminadores, na faixa do infravermelho próximo (NIR), para identificação de grãos de café intactos e com defeitos e de grãos de café intactos e colonizados por Aspergillus ochraceus. Os dados espectrais foram classificados por análise discriminante, com seleção de variáveis por stepwise. Os resultados obtidos nas etapas de pré-colheita e processamento indicaram que o tipo de terreiro afetou a incidência de todas as espécies de fungos e que a separação das partes do fruto foi significativa para A. ochraceus e Grupo Nigri no café secado no terreiro de cimento e A. flavus no café secado no terreiro de chão. De um modo geral, a incidência fungos no café foi considerada baixa e mostrou uma correlação negativa com a redução do conteúdo de água, atribuída ao comportamento xerofítico das espécies estudadas. Durante o armazenamento observou-se que o conteúdo de água, a acidez do óleo e a acidez do grão foram afetadas pelo tempo de armazenamento, pela área de plantio e pelo tipo de terreiro utilizado na secagem. A condutividade elétrica e o número de defeitos mostraram uma correlação positiva com a incidência de fungos, principalmente Penicillium sp., Fusarium sp e espécies do Grupo Nigri. A incidência de fungos foi baixa, não favorecendo a contaminação do produto por OTA. A variação do número de defeitos não afetou a tipificação, a coloração e a qualidade de bebida do café. Os resultados obtidos na análise espectral mostraram que aproximadamente 95% dos grãos foram corretamente classificados em intactos e danificados. Na classificação dos defeitos em categorias observou-se uma redução no percentual de acertos que ficou entre 55 e 60% para os grãos com defeitos gerais, quebrados e brocados e em torno de 75% para os grão com defeitos graves. Para os grãos de café inoculados, 100% dos grãos intactos (controle) foram classificados corretamente e na identificação da contaminação fúngica os resultados obtidos foram 77 e 75% para grãos severamente e levemente infectados, respectivamente. As curvas obtidas para os dois grupos de amostras mostrou a distinção do comportamento espectral dos grãos sadios e dos grãos danificados ou inoculados, observados pelos valores médios da absorvância (log 1/R). Em conformidade com outros estudos, os resultados indicaram que o café não se constitui em bom substrato à colonização fúngica. Entretanto, a constituição biológica do endosperma e a presença do inóculo podem representar fatores de predisposição à formação de OTA, cabendo, assim, a adoção de medidas preventivas durante a produção e processamento do café, bem como a implementação de técnicas e métodos rápidos de controle de qualidade, que possam atender às exigências do mercado e à dinâmica da comercialização. / Nowadays the most important concern of coffee country producers is the product quality, mainly the absence of contaminants such as mycotoxins. The adoption of Hazard Analyses of Critical Control Points HACCP by the coffee chain production is one of the recommended preventive procedures. Their principles establish a current evaluation of hazards and a complete identification of Critical Control Points (CCP). In order to obtain information that subside the HACCP adoption, the incidence of toxigenic fungi and ochratoxin A (OTA) were studied from the pre-harvest procedures to the storage of coffee beans harvested on the cloth from three topographically distinct areas. At first, it was sun-dried on cement and ground floors. The drying was completed on mechanical dryer by low temperature. The product was sampled before the harvest, after passing the washing tank, during the sun-drying and before the mechanical drying. On the fungi detection test, beans and coffee peels were incubated separately after superficial disinfection. After dehulling, coffee beans on jute bags were stored during 180 days and sampled for qualitative analysis of fungi incidence, OTA level, moisture content, free fatty acids, total titrable acidity, electrical conductivity, grading and beverage quality. The data were submitted to canonical variable analysis (CVA), repeated measures analysis of variance and canonical correlations. This study was complemented by spectral analysis of coffee beans carried out to evaluate the potential of near infra-red (NIR) detection for identification of damage and fungi contamination on coffee beans. The spectral data were classified by discriminate analysis using stepwise selection. From the pre-harvest to the dehulling process, it was observed that the type of floor affected the fungi incidence for all fungi species. The separation of coffee fruit parts on Blotter test affected both A. ochraceus and Nigri Group incidence on the product dried on the cement floor, as well as A. flavus incidence on coffee dried on ground floor. The fungi incidence was considered low and showed a negative correlation with the reduction of coffee bean moisture. This probably happened due to the xerophilic behavior of the fungi species. There was no contamination by OTA on husk and coffee beans samples. During the storage period, it was observed that storage time, cultivated area and the type of sun-drier floor affected the moisture content, free fatty acids and total titrable acidity. Electrical conductivity and green coffee defects were a positively correlated with fungi incidence, mainly of Penicillium sp., Fusarium sp and the Nigri Group species. The fungi incidence was considered low, not resulting in contamination of coffee beans by OTA. Variation on green coffee defects did not affect the grade, color and beverage quality of coffee. On spectral analysis, it was verified that about 95% of the beans were correctly classified as intact and damaged. It was observed a reduction in the percentage for damaged beans when they were classified by categories. Only about 55 to 60% of damaged beans were correctly classified as slightly damaged, broken and insect damaged and about 75% on severely damaged. The results obtained for inoculated beans indicate a good accuracy and 100% of control beans were correctly distinguished. For inoculated bean categories, the results were 77 and 75% for severely and slightly infected beans, respectively. Plots of average spectra indicate differences on spectrum behavior for intact and damaged or inoculated beans which could be observed by the average absorbance values (log 1/R). In agreement with similar studies, the results indicate that green coffee is a poor substrate for fungi development, although the biological endosperm structure and the inoculum presence can favor the OTA production. Therefore, it is necessary the use of correct preventive procedures during coffee production and preparation, as well as fast quality control systems against contamination in order to attend the requirements of the trade and consumers. / Tese importada do Alexandria
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Characterization of LTR-Retrotransposons on Hemileia vastatrix genome

Rocha, Rafaela Leite Prado 31 March 2017 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-09-06T11:58:15Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 410924 bytes, checksum: de4370c4260d84bdd59fd21fbdd7f5a6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-06T11:58:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 410924 bytes, checksum: de4370c4260d84bdd59fd21fbdd7f5a6 (MD5) Previous issue date: 2017-03-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O Brasil é o maior produtor e exportador de café do mundo. O país, como o resto das regiões produtoras de café, sofre com a doença da ferrugem do cafeeiro. A ferrugem é causada pelo fungo biotrófico Hemileia vastatrix. Esta doença pode levar a quedas drásticas na produtividade quando não controlada. Esse patógeno apresenta altos níveis de variabilidade genética, o que resulta em aparecimento de novas raças fisiológicas e, consequentemente, a suplantação da resistência de variedades de café obtidas pelos programas de melhoramento genético. O mecanismo que causa essa variabilidade ainda não é conhecido, uma vez que o fungo tem reprodução assexuada e o estádio sexual não foi observado na natureza. Tem sido relatado que os genomas das ferrugens apresentam alta porcentagem de elementos repetitivos, incluido os elementos transponíveis (ET). Como a atividade de ET tem sido sugerida como uma fonte importante de geração de variabilidade, existe a possibilidade de que os ETs sejam um dos responsáveis pela grande variabilidade genética encontrada em H. vastatrix. Portanto, este estudo teve como objetivo identificar a presença, a frequência e a localização de LTR retrotransposons no genoma de H. vastatrix, bem como verificar a relação entre LTR retrotransposons e a variabilidade encontrada nesse patógeno. Foram identificados no genoma analisado 6.516 genes codificadores de proteínas e 1.109 retrotransposons do tipo LTR completos. Dos genes codificadores de proteínas, 65 estavam próximos de retrotransposons do tipo LTR. Observou-se que os retrotransposons LTR geralmente se inserem a 5.000 pb de um gene codificador de proteínas no genoma desse patógeno. Os resultados encontrados demonstraram que retrotransposons LTR inserem-se em regiões conservadas ricas em AT. Assim, os dados sugerem que a inserção dos retrotransposons LTR em H. vastatrix podem se direcionar com base na composição nucleotídica de uma região. Além disso, foram identificados retrotransposons próximos de regiões codificadoras, o que poderia contribuir para modulação da expressão gênica e, consequentente, afetar a variabilidade do patógeno. / Brazil is the biggest producer and exporter of coffee in the world. The country, as the rest of coffee growing regions, suffers with coffee rust disease. Rust, one of the earliest coffee diseases studied scientifically, is caused by the obligate biotrophic fungus Hemileia vastatrix. This disease is the most harmful that affects coffee trees, which may cause drastic drops in productivity if not controlled. The fungus infects coffee leaves penetrating through stomata and develops powdery orange pustules on the abaxial surface. The pathogen displays high levels of genetic variability leading to appearance of new physiological races and supplanting the resistance of coffee varieties obtained in breeding programs. The mechanism that causes such variability is yet not known, since it is accepted that the fungus relies on asexual reproduction and the sexual stage has not been observed in nature. The genome of H. vastatrix has been reported as one of the largest known rust genome. A very large fraction of the published rust genomes has shown a high percentage of repetitive elements, such as transposable elements (TEs). In this sense, TEs activity is suggested as an important source for generation of variability. Thus, there is a chance that the transposable DNA elements are responsible for increasing genetic variability of H. vastatrix. Therefore, this study aimed to identify presence, frequency and location of transposable elements, as well as verify the relationship between transposable elements and the high variability found on genome of H. vastatrix. We found 6,516 gene- coding proteins and 1,109 complete LTR retrotransposons in the genome. From these gene-coding proteins, 65 were close to LTR retrotransposons. The results suggested that LTR retrotransposon generally insert itself 5,000bp from a gene-coding protein. Also, LTR retrotransposons identified insert itself on AT-rich conserved regions. Thus, the found data suggest that insertion of LTR retrotransposons in H. vastatrix genome could be targeting its integration site based on nucleotide composition. Moreover, we identified LTR retrotransposons located close to coding regions, which could be contributing with gene expression modulation and hence affecting pathogen variability. / O autor não apresentou título em português.
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Caracterização de raças fisiológicas e análise de proteínas candidatas a efetoras em população de Hemileia vastatrix no Brasil / Characterization of physiological races and analysis of effector candidate proteins in the population of Hemileia vastatrix in Brazil

Silva, Rosemeire Alves da 31 July 2017 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-01-24T13:20:44Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1041271 bytes, checksum: e6cb275e1e3701318178f9c961a02320 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-24T13:20:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1041271 bytes, checksum: e6cb275e1e3701318178f9c961a02320 (MD5) Previous issue date: 2017-07-31 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A ferrugem do cafeeiro, causada pelo fungo Hemileia vastatrix Berkeley & Broome, é considerada a principal doença da cultura. O fungo está amplamente distribuído nas regiões produtoras de café, causando severos danos econômicos. Novas raças fisiológicas de H. vastatrix tem surgido, com frequência em todo mundo, infectando algumas cultivares de café lançadas comercialmente como resistentes à ferrugem. Dessa forma, a obtenção de cafeeiros resistentes tem sido um desafio devido ao alto potencial adaptativo do fungo e tem se tornado cada vez mais difícil a caracterização dos patótipos por meio da coleção de cafeeiros diferenciadores de raça. Além disso, as informações acerca da interação de cafeeiros com as raças existentes são escassas, embora o processo infeccioso de H. vastatrix seja bem estudado. Estudos genômicos estão ajudando no entendimento dos mecanismos moleculares envolvidos no processo de interação entre planta e patógeno e no desenvolvimento de técnicas moleculares para a identificação de isolados. Nosso objetivo foi caracterizar as raças de H. vastatrix encontradas nas principais regiões produtoras de café do Brasil, e estudar as proteínas candidatas a efetoras preditas para H. vastatrix que possam contribuir para patogenicidade nas diferentes raças do fungo. Foram utilizados 56 isolados monopustular coletados de diferentes espécies de café, Coffea canephora, C. arabica e Híbrido de Timor (C. canephora x C. arabica) e multiplicados em cafeeiro suscetível C. arabica variedade Caturra. Cada isolado foi inoculado em cafeeiros que compõe a série diferenciadora de raças, com três repetições. O DNA dos 56 isolados monopustulares foram extraídos para os estudos genômico. Foram utilizadas 47 combinações de primer para amplificar genes de candidatos a efetores. Sete genes foram amplificados, sequenciados e tiveram sua expressão validada em cafeeiros resistente e suscetível. As sequências obtidas foram alinhadas para os 46 isolados, usando o programa DNA Baser. Estudo de domínio conservado foram realizados no programa Pfam e a categorização das proteínas no Blast2GO. O alinhamento das sequências de nucleotídeos, proteínas e agrupamento dos isolados foi feito no programa Clustalw e as diferença de nucleotídeo foi analisada no Weblogo. Os dados obtidos foram usados para o estudo de diversidade. Por meio da inoculação na série diferenciada, foram identificadas sete raças, sendo cinco já descritas no Brasil e duas pela primeira vez (raça XXIX e XXX). Não foi possível caracterizar 15 combinações dos genes de virulência, sendo assim consideradas novas raças. A análise da coleção de isolados permitiu inferir a presença de pelo menos seis novos genes na série diferenciadora, o que possibilitou diferenciar dois isolados descritos como raças III. Na análise genômica, os 47 genes candidatos a efetores estudados se mostraram conservados em todos os isolados e estão ligados a 15 processos biológicos do desenvolvimento do fungo. Foram identificados 14 domínios nas proteínas provenientes desses genes. Para os sete genes sequenciados nos diferentes isolados, observou-se diferença na sequência dos nucleotídeos e presença de indivíduos heterozigoto e homozigoto. Com análise de diversidade foi possível discriminar os indivíduos, sendo o isolado Hv-09 o mais divergente. As informações geradas nesta pesquisa poderão ampliar o entendimento da interação entre H. vastatrix e o cafeeiro. O conhecimento dos genes que estão envolvidos no processo infeccioso auxiliará o entendimento dos mecanismos moleculares que levam à suplantação da resistência por novas raças do fungo. / Coffee rust, caused by the fungus Hemileia vastatrix Berkeley & Broome, is considered the main disease of the crop. The fungus is widely distributed in the coffee producing regions, causing severe economic damage. New physiological races of H. vastatrix have arisen, often all over the world, infecting some commercially released coffee cultivars as resistant to rust. Thus, obtaining resistant coffee trees has been a challenge due to the high adaptive potential of the fungus and it has become increasingly difficult to characterize the pathotypes through the collection of coffee races. In addition, information on the interaction of coffee trees with the existing races is scarce, although the infectious process of H. vastatrix is well studied. Genomic studies are helping to understand the molecular mechanisms involved in the process of interaction between plant and pathogen and in the development of molecular techniques for the identification of isolates. Our objective was to characterize the H. vastatrix race found in the main coffee producing regions of Brazil and to study the effector candidate proteins predicted for H. vastatrix that may contribute to pathogenicity in the different fungus races. Fifty six monopustular isolates collected from different coffee species, Coffea canephora, C. arabica and Hybrid of Timor (C. canephora x C. arabica) were used and multiplied in susceptible coffee C. arabica variety Caturra. Each isolate was inoculated in coffee plants that make up the differentiating series of races, with three replicates. The DNA of the 56 monopustular isolates were extracted for genomic studies. We used 47 primer combinations to amplify effector candidate genes. Seven genes were amplified, sequenced and had their validated expression in resistant and susceptible coffee trees. The sequences obtained were aligned for the 46 isolates using the DNA Baser program. A conserved domain study was performed on the Pfam program and the protein categorization in Blast2GO. The alignment of the nucleotide sequences, proteins and clustering of the isolates was done in the Clustalw program and the nucleotide differences were analyzed in Weblogo. The data obtained were used for the study of diversity. Through inoculation in the differentiated series, seven races were identified, five of which were already described in Brazil and two for the first time (races XXIX and XXX). It was not possible to characterize 15 combinations of the virulence genes, thus being considered new races. The analysis of the collection of isolates allowed to infer the presence of at least six new genes in the differentiator series, which made it possible to differentiate two isolates described as breeds III. In genomic analysis, the 47 candidate effector genes studied have been conserved in all isolates and are linked to 15 biological processes of fungus development. 14 domains were identified in proteins from these genes. For the seven genes sequenced in the different isolates, we observed a difference in nucleotide sequence and presence of heterozygous and homozygous individuals. With diversity analysis it was possible to discriminate individuals, being the Hv-09 isolate the most divergent. The information generated in this research may broaden the understanding of the interaction between H. vastatrix and the coffee tree. The knowledge of the genes that are involved in the infectious process will help the understanding of the molecular mechanisms that lead to the supplanting of resistance by new races of the fungus.
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Distribuição espacial de Quesada gigas (Oliver, 1790) (Hemiptera: Cicadidae) na cultura do café

Pereira, Nirélcio Aparecido [UNESP] 25 February 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-25Bitstream added on 2014-06-13T19:52:55Z : No. of bitstreams: 1 pereira_na_me_jabo.pdf: 364260 bytes, checksum: d1631a7d1f5b0fd3a034d899762088d6 (MD5) / As cigarras da espécie Quesada gigas são consideradaspragas chave nacultura do café, principalmente nos Estados de São Paulo e Minas Gerais. Atualmente, estas cigarras é a espécie principal e a mais prejudicial aocafeeiro einfesta principalmenteo plantiodestes doisEstados. Oobjetivo do trabalho foi estudar a distribuição espacial de Q.gigas de ovos, ovos por postura e ninfas na cultura do café. O experimento foi conduzido na Estação Experimental da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais –EPAMIG, no município de São SebastiãodoParaíso – MG,onde foram selecionadostrês áreas de 10.000 m2, subdivididos em 100 parcelas de 10 m x 10m. As cultivares utilizadas foram Rubi MG-1192, Acácia Cerrado MG-1474,Catuaí-30 Vermelho IAC-15, MundoNovo IAC- 501 e Melhoramento Genético. Nas amostragens foram coletados três ramos secos do terço superior de uma planta por parcela, colocadosem sacos depapel, devidamenteetiquetados e transportados para o laboratório. Para se verificar a existência depostura e o número de ovos por postura,foramrealizadas uma abertura longitudinal dosramos secos, com o auxílio deuma lâmina cortante e o auxilio do microscópio esteroscópico.Para oestudo dasninfas vivas, realizou-se a abertura detrincheiras num total de 300 covas de 0,50x0, 50x0, 50m/cova adjacente aotroncodas plantas e em seguida, procedeu à contagem. Para o estudoda dispersão das posturas, ovos por posturas e ninfas no solo foram utilizados os seguintes índices: razão variância/média, índice de Morisita, Coeficiente de Green e expoente k da distribuição binomial negativa. Com relação aos modelos probabilísticos que descrevem a distribuição espacial, foram testados os ajustes às distribuições de Poisson e Binomial Negativa. Concluindo, após a realização dos testes de ajustes aos dados é possível afirmar que a postura e ovos por posturas de... / Cicadas are considered key pests in coffee culture, mainly in the states of São Paulo and Minas Gerais. Currently, the species which is more damaging to coffee is Quesada gigas, which infests mainly the planting of these two states. The objective of this work was to study the oviposition behavior (laying and eggs) and the spatial distribution of Q.gigas in coffee culture. The experiment was conducted at the Experimental Station of the Agricultural Research Corporation of Minas Gerais - EPAMIG, in São Sebastião do Paraíso - MG, where we selected three areas of 10,000 m2, divided into 100 plots of 10 m x 10 m. The cultivars used were Rubi MG-1192, Acácia Cerrado MG-1474 and Catuaí-30 Vermelho IAC-15, Mundo Novo IAC-501, and cultivar Melhoramento Genético (Genetic Enhancement). Three dry branches of the upper third of a plant per plot were collected, placed in paper bags, properly labeled and transported to the laboratory. To verify the existence of oviposition, disposed endophytically, a longitudinal opening of the dry branches was carried out, with the aid of a cutting blade and stereoscopic microscope. For the study of the dispersion of cicada alive nymphs were made trenches of 0.50x0.50x0.50m per hole adjacent to the trunk plants and later, the couting was performed. For this study the following indexes were used: variance/ mean ratio, Morisita index, coefficient of Green k exponent of negative binomial distribution. In relation to the probabilistic models that describe the spatial distribution, the adjustments to distributions of Poisson and negative binomial were tested. In conclusion, after the accomplishment of the adjustments data tests is possible to affirm the...(Complete abstract click electronic access below)
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Rogadinae e Orgilinae (Hymenoptera, Braconidae) em cultura de café em Cravinhos, SP, Brasil

Tango, Maria Flora de Almeida [UNESP] 28 February 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-28Bitstream added on 2014-06-13T19:32:18Z : No. of bitstreams: 1 tango_mfa_me_jabo.pdf: 802435 bytes, checksum: 64e0b120910b2ab654a518519f8fc4b0 (MD5) / Os objetivos deste estudo foram identificar os Rogadinae e Orgilinae (Hymenoptera: Braconidae) em uma cultura comercial de café cv. Obatã, Cravinhos, SP; comparar os métodos de amostragem, determinar a flutuação populacional e correlacioná-las com os fatores abióticos (temperatura e pluviosidade) e bióticos (larvas e minas de L. coffeella). A amostragem foi realizada semanalmente entre maio de 2005 e abril de 2007 com 60 armadilhas Moericke instaladas nos terços inferiores e médio das plantas, distribuídas em 20 pontos de amostragem, ativas por 48 horas/semana e, duas armadilhas luminosas modelo Jermy fixadas na altura do dossel do cafeeiro, operadas com lâmpadas de tungstênio de 100W, ativas por dois períodos consecutivos, do anoitecer até o amanhecer. Foram obtidos 1717 exemplares de Orgilinae e Rogadinae. Dos 860 exemplares de Orgilinae, 693 exemplares (80,6% do total) foram coletados no primeiro ano de amostragem e, dos 857 exemplares de Rogadinae, 650 (75,8%), também ocorreram no mesmo período. As condições climáticas no período amostrado foram muito diferentes: no segundo ano foi registrado maior volume de chuvas em alguns meses do ano e temperaturas máximas elevadas e mínimas abaixo da média que, possivelmente, resultaram na menor frequência de captura de Orgilinae e Rogadinae naquele período. De Orgilinae, foram identificadas três espécies: Orgilus niger Penteado-Dias (757 exemplares / 88,0% do total de Orgilinae), Orgilus sp. 1 (71 / 8,3%) e Stantonia longicornis (Achterberg) (32 / 3,7%); a primeira foi a mais frequente com picos populacionais em agosto e setembro de 2005. De Rogadinae foram identificadas três espécies nominais: Stiropius reticulatus Penteado-Dias (95 / 11,1%), Choreborogas puteolus Achterberg (19 / 2,2%), Aleiodes melanopteurus (Erichson) (6 / 0,7%) e... / The aim of this study was to identify the Rogadinae and Orgilinae (Hymenoptera: Braconidae) in a commercial crop of coffee cv. Obatã, at Cravinhos, São Paulo State, Brazil; compare the sampling methods, determine their population fluctuations and to correlate them with abiotic (temperature and rainfall) and biotic (larvae and mines of Leucoptera coffeella (Guérin-Mèneville) (Lepidoptera: Lyonetiidae)) factors. The samplings were performed weekly between May 2005 and April 2007 with 60 Moericke traps installed at the lower and middle thirds of the coffee plants, distributed in 20 sampling points, and active for 48 hours / week and with two light traps (Jermy Model) operated with 100W tungsten lamps active for two consecutive periods, from nightfall until dawn. A total of 1717 Orgilinae and Rogadinae were obtained. Of the 860 specimens of Orgilinae, 693 (80.6% of total) were collected in the first year of sampling, and of the 857 specimens of Rogadinae, 650 (75.8%) also occurred in the same period. The climatic conditions in the sample period were very different: the second year was recorded more rainfall in some months of the year and higher maximum temperatures and below average minimum which possibly resulted in lower frequency of capture of Orgilinae and Rogadinae in that period. Three species of Orgilinae were identified: Orgilus niger Penteado-Dias (757 specimens / 88.0% of the total of Orgilinae collected), Orgilus sp. 1 (71 / 8.3%) and Stantonia longicornis (Achterberg) (32 / 3.7%), the first species was the most frequent, with population peaks in August and September 2005. From Rogadinae were identified three nominal species: Stiropius reticulatus Penteado-Dias (95 / 11.1%), Choreborogas puteolus Achterberg (19 / 2.2%), Aleiodes melanopteurus (Erichson) (6 / 0.7%) and 11 morpho-species of Aleiodes (729 / 85.1%) and one morpho-species of Yelicones (1 / 0.1%)...(Complete abstract click electronic access below)
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Aspectos morfológicos dos aparelhos reprodutores, maturação de ovários e avaliação do desenvolvimento de ninfas de Quesada gigas (Olivier, 1790) (Hemíptera: Cicadidae) em relação a diferentes hospedeiros

Andrade, Samuel de Carvalho [UNESP] 27 February 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:49:12Z : No. of bitstreams: 1 000829269.pdf: 824206 bytes, checksum: b23ba10d40ae243604b3d167478622d5 (MD5) / Quesada gigas (Olivier, 1790) (Hemiptera: Cicadidae) é uma espécie de cigarra com ampla distribuição geográfica no continente americano, cujas ninfas se alimentam de fluidos do xilema. Além dos hospedeiros nativos, Q. gigas também pode ser encontrada em cafeeiros, sendo as fases imaturas consideradas praga na região cafeeira do Sul do Estado de Minas Gerais e Nordeste do Estado de São Paulo. A emergência da maior quantidade de adultos de Q. gigas está concentrada no período entre setembro e novembro, período em que também acontecem o acasalamento e a postura. A postura de Q. gigas é do tipo endofítica e é realizada no interior de ramos secos, preferencialmente na parte superior das plantas de café. Entretanto, muitos aspectos biológicos de Q. gigas ainda não estão determinados, dentre eles processos ligados à reprodução e aqueles envolvidos na interação das ninfas (fase causadora de danos) com seus hospedeiros. Sendo assim oobjetivo da pesquisa foi determinar aspectos morfológicos dos aparelhosreprodutores de Q. gigas, observando a maturação de ovários, bem como avaliar o desenvolvimento de ninfas dessa espécie em relação a diferentes plantas hospedeiras. Os estudos foram conduzidos na área da Estação Experimental da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (EPAMIG) (20º57‟54.32‟‟S; 47º04‟16.07‟‟O) e em laboratórios da UNESP/FCAV. Através de análise estereomicroscópica e de microscopia eletrônica de varredura pôde-se observar as estruturas presentes nos aparelhos reprodutores de Q. gigas. Pôde-se verificar a partir do início da emergência de adultos 30/09/2013, a diferença entre ovários imaturos e maduros nas fêmeas em relação ao primeiro e segundo período de coleta 14/10/2013 e 29/10/2013, respectivamente. O número de oócitos encontrados por fêmea na segunda coleta 29/10/2013 variou de 112 a 1.017 com média de 428,2±45,7 ovos/fêmea. O ovipositor da fêmea é ... / Quesada gigas (Olivier, 1790) (Hemiptera: Cicadidae) is a species of cicada widely distributed in the America continent, which the nymphs feed on xylem fluid. In addition to the native host, Q. gigas can also be found in coffee plants, being the immature stages considered pest in the coffee producer region of southern Minas Gerais state and Northeast of São Paulo state. The emergence of the large amount of Q. gigas adults is concentrated in the period between September and November, during which also happen mating and laying. The posture of Q. gigas eggs is endophytic type and is implemented inside dry branches, preferably at the the upper canopy of coffee plants. Despite, many biological aspects of Q. gigas are not yet determined, including processes related to reproduction, and those involved the interaction of the nymphs (stage causing damage), with their hosts. The main goal of the research was to determine morphology of the reproductive apparatus of Q. gigas, watching the maturation of ovaries, as well as assess nymphs development in relation to different host plants. The studies were conducted in the field of Experimental Station of Agricultural Research Company of Minas Gerais (EPAMIG) (20º57‟54.32‟‟S; 47º04‟16.07‟‟W) and in UNESP/FCAV laboratories. Through stereomicroscopic analysis and scanning electron microscopy we can observe the structures present in the Q. gigas female reproductive apparatus. It can be seen from the beginning of emergency 30/09/2013 adults, difference between immature and mature ovaries in females compared to the first and second collect period 10/14/2013 and 29/10/2013 respectively. The number of eggs per female found in the second collect 29/10/2013 varied 112-1017 averaging 428.2 ± 45.7 eggs/female. The female's ovipositor is characterized by apical teeth, pre-apical and dorsal. Eggs have elongated and cylindrical structure. The exochorion consists of tubers united by furrows and ...
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Espécies de Ralstonia no Brasil : caracterização fenotípica, molecular, novas fontes de resistência em tomateiro e patogenicidade em cafeeiro / Ralstonia species in Brazil : phenotypical and molecular characterization, new sources of resistance in tomato and pathogenicity to coffee plants

Rossato, Maurício 05 October 2016 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2017-01-05T14:35:38Z No. of bitstreams: 1 2016_MaurícioRossato.pdf: 3410176 bytes, checksum: deb7c72c5b63bb15ba465dfeee816c69 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-02-08T21:24:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_MaurícioRossato.pdf: 3410176 bytes, checksum: deb7c72c5b63bb15ba465dfeee816c69 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-08T21:24:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_MaurícioRossato.pdf: 3410176 bytes, checksum: deb7c72c5b63bb15ba465dfeee816c69 (MD5) / A murcha bacteriana, atualmente reconhecida como sendo causada por um complexo de espécies do gênero Ralstonia (Ralstonia solanacearum, R. pseudosolanacearum e R. syzygii) apresenta uma ampla diversidade, podendo ser dividida em raças, biovares, filotipos e sequevares. O objetivo deste trabalho foi: (i) ampliar os conhecimentos sobre o importante complexo de espécies de Ralstonia por meio da caracterização biológica, bioquímica e molecular do isolado CNPH-RS 488, que se mostrou capaz de suplantar a resistência da linhagem ‘Hawaii 7996’; (ii) gerar um novo protocolo de identificação de biovares por meio de técnicas moleculares, visando aumentar a eficiência do processo e reduzir os custos associados com o teste de biovar; (iii) identificar novas fontes de resistência em tomateiro à murcha bacteriana em germoplasma selvagem de Solanum, considerando o melhoramento antecipatório contra possíveis novos variantes do patógeno, como o isolado CNPH-RS 488; (iv) gerar informações sobre o patossistema Coffea – Ralstonia. No presente estudo, o isolado CNPH-RS 488 foi classificado quanto ao biovar e filotipo, e foram caracterizados o seu perfil de virulência, a capacidade de suplantar de resistência da linhagem ‘Hawaii 7996’, a produção de EPS e de biofilme, bem como a sensibilidade a antibióticos e sua gama de hospedeiras. Os sistemas de marcadores RAPD/SCAR em associação com a estratégia de bulk segregant analysis foram inicialmente empregados visando o desenvolvimento de primers específicos para identificação de biovares. Para a busca por novas fontes de resistência avaliou-se uma coleção de 75 genótipos de Solanum peruvianum em comparação com as linhagens controle ‘Hawaii 7996’ (resistente) e ‘L390’ (suscetível). Os genótipos foram inoculados com os isolados CNPH-RS 488 (biovar 2A) e CNPH-RS 489 (biovar 1). O status do cafeeiro como hospedeira do complexo de espécies de Ralstonia foi demonstrado em bioensaios com nove isolados em três cultivares de Coffea arabica, comparando com a resposta do tomateiro suscetível ‘San Vito’. A confirmação da capacidade de suplantação da resistência do ‘Hawaii 7996’ pelo CNPH-RS 488 não pôde ser explicada pelos testes de produção de exopolissacarídeo e biofilme. Foi também constatado que o isolado apresenta uma maior virulência sobre espécies mais resistentes como jiló e berinjela. Onze primers RAPD foram selecionados com potencial valor diagnóstico para identificação de biovares. Amplicons obtidos com quatro primers que geraram marcadores estáveis foram clonados e a informação de sequência foi utilizada para o desenho dos primers do tipo SCAR. Os primers J1-B1-B e SCAR-i18-B2A apresentaram especificidade parcial para isolados de biovar 1 e 2A, respectivamente. Para a biovar 3, foi empregada uma estratégia de subtração in silico que permitiu o desenho de um par de primers específico para a região do gene polS (codificador da enzima sorbitol desidrogenase). Sete genótipos dos 75 de S. peruvianum foram considerados como promissoras fontes para o melhoramento do tomateiro visando à resistência à murcha bacteriana. O cafeeiro se mostrou suscetível exclusivamente a isolados de R. pseudosolanacearum, indicando os potenciais riscos que a murcha bacteriana pode apresentar para a cafeicultura brasileira. O presente trabalho destaca que a existência de isolados capazes de suplantar a resistência do tomateiro, como o CNPH-RS 488, e isso implica em potenciais riscos da disseminação dos mesmos pelo país, podendo inviabilizar as cultivares de tomateiro atualmente disponíveis no mercado e que usam a linhagem ‘Hawaii 7996’ como parental. Estudos adicionais sobre esse variante do patógeno serão necessários bem como o desenvolvimento de programas de melhoramento com novas fontes de resistência efetivas contra isolados com um perfil de virulência similar ao apresentado pelo CNPH-RS 488. / The bacterial wilt is currently recognized as being caused by a complex of three species: Ralstonia solanacearum, R. pseudosolanacearum, and R. syzygii. The causal agents of the bacterial wilt display a wide diversity, being classified in races, biovars, phylotypes, and sequevars. The objective of the present thesis was: (i) add new information about this important bacterial complex via biological, biochemical and molecular characterization of the isolate R. solanacearum CNPH-RS 488, which was found to be able to break down the resistance of the tomato (Solanum lycopersicum) inbred line ‘Hawaii 7996’; (ii) develop a new protocol for molecular characterization of biovars, focusing on making a faster and cheaper biovar identification test; (iii) search for new sources of resistance to bacterial wilt disease within a germplasm collection of wild Solanum (section Lycopersicon) species, using the preemptive breeding and developing new resistant cultivar to new and atypical strains like the CNPH-RS 488; (iv) study and characterize a new pathosystem: Coffea – Ralstonia. Studies with the isolate R. solanacearum CNPH-RS 488 involved different approaches: (1) determination of its biovar and phylotype; (2) determination of its virulence profile, including the capability of breaking down the resistance of ‘Hawaii 7996’; (3) production of exopolysaccharides (EPS) and biofilm; (4) antibiotic sensitivity, and (5) host range. The RAPD/SCAR marker systems in association with bulk segregant analysis was the strategy initially employed aiming to develop biovar-specific PCR-based markers. The search for new sources of resistance to bacterial wilt was carried using 75 Solanum peruvianum accessions and two standard lines ‘Hawaii 7996’ (resistant) and ‘L390’ (susceptible). Bioassays were carried out with two isolates, CNPH-RS 488 (biovar 2A) and CNPH-RS 489 (biovar 1). For the study of coffee as a host of the Ralstonia species complex, plants of three C. arabica cultivars were inoculated with a collection of nine isolates and their reactions were compared with that of the susceptible standard (tomato ‘San Vito’). The ‘Hawaii 7996’-resistant breaking ability of the isolate CNPH-RS 488 could not be explained by EPS and biofilm production. In addition, it was found that this isolate displayed a wider virulence profile being also able to infect accessions of scarlet eggplant and eggplant (which are naturally more tolerant to bacterial wilt). Eleven RAPD primers with potential diagnostic value for biovar were selected. Four stable amplicons (generated by four RAPD primers) were gel-purified and cloned. The sequence information was used for the design of SCAR-like primers. The primers J1-B1-B and SCAR-i18-B2A displayed partial specificity to isolates biovar 1 and 2A, respectively. For the biovar 3, it was employed the in silico subtraction technique, which allowed the design of a polS (sorbitol dehydrogenase) gene-specific primer. Seven out of the 75 S. peruvianum accessions were considered as promising sources for future use in tomato breeding programs to bacterial wilt resistance. Coffee accessions were susceptible exclusively to R. pseudosolanacearum isolates, indicating the potential risk of the bacterial wilt for the Brazilian coffee production. The present work emphasizes the existence of isolates (such as the CNPH-RS 488), which are able to break down the major sources of resistance available in tomato breeding programs. The present work also points out the potential risks of the spread of isolates with similar virulence profile across the country, which may preclude the employment of ‘Hawaii 7996’ as parental material. More studies on these variants will be necessary aiming to help the tomato breeding programs in the search for new sources of resistance to isolates with virulence profiles similar to CNPH-RS 488.
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Aspectos morfológicos dos aparelhos reprodutores, maturação de ovários e avaliação do desenvolvimento de ninfas de Quesada gigas (Olivier, 1790) (Hemíptera: Cicadidae) em relação a diferentes hospedeiros /

Andrade, Samuel de Carvalho. January 2015 (has links)
Orientador: Nilza Maria Martinelli / Coorientador: Guilherme Duarte Rossi / Banca: Douglas Henrique Bottura Maccagnan / Banca: Arlindo Leal Boiça Junior / Resumo: Quesada gigas (Olivier, 1790) (Hemiptera: Cicadidae) é uma espécie de cigarra com ampla distribuição geográfica no continente americano, cujas ninfas se alimentam de fluidos do xilema. Além dos hospedeiros nativos, Q. gigas também pode ser encontrada em cafeeiros, sendo as fases imaturas consideradas praga na região cafeeira do Sul do Estado de Minas Gerais e Nordeste do Estado de São Paulo. A emergência da maior quantidade de adultos de Q. gigas está concentrada no período entre setembro e novembro, período em que também acontecem o acasalamento e a postura. A postura de Q. gigas é do tipo endofítica e é realizada no interior de ramos secos, preferencialmente na parte superior das plantas de café. Entretanto, muitos aspectos biológicos de Q. gigas ainda não estão determinados, dentre eles processos ligados à reprodução e aqueles envolvidos na interação das ninfas (fase causadora de danos) com seus hospedeiros. Sendo assim oobjetivo da pesquisa foi determinar aspectos morfológicos dos aparelhosreprodutores de Q. gigas, observando a maturação de ovários, bem como avaliar o desenvolvimento de ninfas dessa espécie em relação a diferentes plantas hospedeiras. Os estudos foram conduzidos na área da Estação Experimental da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (EPAMIG) (20º57‟54.32‟‟S; 47º04‟16.07‟‟O) e em laboratórios da UNESP/FCAV. Através de análise estereomicroscópica e de microscopia eletrônica de varredura pôde-se observar as estruturas presentes nos aparelhos reprodutores de Q. gigas. Pôde-se verificar a partir do início da emergência de adultos 30/09/2013, a diferença entre ovários imaturos e maduros nas fêmeas em relação ao primeiro e segundo período de coleta 14/10/2013 e 29/10/2013, respectivamente. O número de oócitos encontrados por fêmea na segunda coleta 29/10/2013 variou de 112 a 1.017 com média de 428,2±45,7 ovos/fêmea. O ovipositor da fêmea é ... / Abstract: Quesada gigas (Olivier, 1790) (Hemiptera: Cicadidae) is a species of cicada widely distributed in the America continent, which the nymphs feed on xylem fluid. In addition to the native host, Q. gigas can also be found in coffee plants, being the immature stages considered pest in the coffee producer region of southern Minas Gerais state and Northeast of São Paulo state. The emergence of the large amount of Q. gigas adults is concentrated in the period between September and November, during which also happen mating and laying. The posture of Q. gigas eggs is endophytic type and is implemented inside dry branches, preferably at the the upper canopy of coffee plants. Despite, many biological aspects of Q. gigas are not yet determined, including processes related to reproduction, and those involved the interaction of the nymphs (stage causing damage), with their hosts. The main goal of the research was to determine morphology of the reproductive apparatus of Q. gigas, watching the maturation of ovaries, as well as assess nymphs development in relation to different host plants. The studies were conducted in the field of Experimental Station of Agricultural Research Company of Minas Gerais (EPAMIG) (20º57‟54.32‟‟S; 47º04‟16.07‟‟W) and in UNESP/FCAV laboratories. Through stereomicroscopic analysis and scanning electron microscopy we can observe the structures present in the Q. gigas female reproductive apparatus. It can be seen from the beginning of emergency 30/09/2013 adults, difference between immature and mature ovaries in females compared to the first and second collect period 10/14/2013 and 29/10/2013 respectively. The number of eggs per female found in the second collect 29/10/2013 varied 112-1017 averaging 428.2 ± 45.7 eggs/female. The female's ovipositor is characterized by apical teeth, pre-apical and dorsal. Eggs have elongated and cylindrical structure. The exochorion consists of tubers united by furrows and ... / Mestre

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