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Fisisologia do florescimento e viabilidade do grão-de-pólen da cana-de-açúcar (Saccharum sp.) /

Melloni, Maria Letícia Guindalini. January 2012 (has links)
Orientador: Luciana Rossini Pinto / Coorientador: Maximiliano Salles Scarpari / Banca: Rinaldo César de Paula / Banca: Jose Antonio Bressiani / Resumo: Este trabalho teve por finalidade o estudo da fisiologia e a viabilidade do pólen para fins de melhoramento de cana-de-açúcar. Para isto três trabalhos foram realizados. No primeiro foi estimada a taxa de autofecundação de famílias obtidas por policruzamento envolvendo quatro genótipos (IACSP95-5000, IAC94-1099, RB867515, SP89-1115) além do impacto da taxa de autofecundação nas taxas de sobrevivência e seleção das progênies obtidas. O policruzamento foi realizado na cidade de Ribeirão Preto-SP. Após o teste de germinação das sementes obtidas, as que apresentaram viabilidade (sementes da IACSP95-5000 e SP89-1115) foram semeadas em campo onde permaneceram por 10 meses para avaliação da taxa de sobrevivência (4, 6 e 10 meses) e seleção (aos 10 meses). A taxa de autofecundação foi determinada por meio de marcadores microssatélites. Para as progênies da IACSP95-5000 e SP89-1115 as taxas de autofecundação foram de 98,5% e 0% respectivamente. A taxa da sobrevivência foi maior para as progênies da SP89-1115 nas duas últimas avaliações bem como a taxa de seleção no valor de 78,26% contra 28,18% das progênies da IACSP95-5000. O segundo trabalho teve como objetivo comparar dois corantes (iodo 0,1N e azul de lactofenol) utilizados para avaliar viabilidade do pólen de inflorescências de cana-de-açúcar com a germinação em meio de cultura. A leitura da viabilidade do pólen foi realizada em microscópio fotônico (250x) para cada corante, dentro de cada horário, para quatro genótipos de cana-de-açúcar na estação de hibridação do IAC em Uruçuca-Ba. O meio de cultura para germinação foi composto de água de chuva, sacarose (300g/L) e ágar-ágar (10g/L). O corante azul de lactofenol mostrou queda da viabilidade do pólen com o passar das horas de avaliação, o corante de iodo... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The present work aimed to investigate the flowering and the physiology of pollen viability for sugarcane breeding. For these purpose three studies were conduce. In the first one, the selfing rate of polycross derived families involving 4 parents (IACSP95-5000, IAC94-1099, RB867515, SP89-1115) was estimate as also as its impact on the survival and selection rate of the progenies. The polycross was done at Ribeirão Preto-SP. After the seed germination test, those that were viable (IACSP95-5000 and SP89-1115 seeds) were planted in the field where stayed for 10 months for the survival (4, 6 and 10 months) and selection rate (at 10 months) evaluation. The selfing rate was estimated through microsatellite markers. For the progenies derived from IACSP95-5000 and SP89-1115 the selfing rates were 98.5% and 0% respectively. The survival rate was higher for SP89-1115 derived progenies at the last two evaluations as well as the selection rate with 78.26% against 28.18% observed for IACSP95-5000 progenies. In the second study two dyes (iodine 0.1N and lactophenol blue) used to evaluate pollen viability from sugarcane tassels were compared with the pollen germination at culture media composed by rain water, sucrose (300g/l) and agar-agar. The read of pollen viability was done with a photonic microscope (250x) for each dye, in each time for 4 sugarcane genotypes at the IAC cross station (Uruçuca-BA). The lactophenol dye showed a degree of pollen viability with the evaluation time while the iodine dye did not. Compared with the germination in culture media at 6 hours, both dyes did not differ, but, over estimated the viability obtained through germination. At 8 and 9 hours, the iodine dye over estimate the pollen germination while the lactophenol blue under estimate. In the third study the behavior of 17 sugarcane... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Lixiviação de sulfentrazone e amicarbazone com adição de óleo em resposta à precipitação e emergência de Ipomea spp. em função da profundidade de semeadura e cobertura com palha /

Bachega, Tiago Furtado. January 2008 (has links)
Resumo: O presente trabalho objetivou avaliar a lixiviação dos herbicidas sulfentrazone e amicarbazone aplicados a campo, com e sem óleo mineral, e correlacioná-la com o controle de corda-de-viola (Ipomoea nil e I. hederifolia), oriundas de sementes depositadas em diferentes profundidades e sob diferentes camadas de palha de cana-de-açúcar. Em área de plantio de canade- açúcar, após acumuladas precipitações de 35, 67 e 106 mm, tubos de PVC de 10 cm de diâmetro, seccionados longitudinalmente, foram enterrados até a profundidade de 35 cm. Os tubos foram retirados e, depois da última amostragem (106 mm), foram semeadas as plantas testes sorgo e Ipomoea nil em toda a seção dos tubos. Foram realizadas avaliações visuais de intoxicação aos 7, 10 e 15 dias após a semeadura (DAS) e aos 20 DAS procedeu-se a determinação da matéria seca das plântulas. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso, em esquema de parcelas subdivididas com quatro repetições. As parcelas consistiram da aplicação de dois herbicidas (amicarbazone e sulfentrazone), adicionados ou não de óleo, e uma testemunha sem herbicida. Nas subparcelas estudou-se as profundidades de lixiviação (0,0-2,5; 2,5-5,0; 5,0-10; 10-15; 15-20; 20-25; 25-30; 30-35 cm). Pelo bioensaio, a presença do sulfentrazone foi estimada na camada superior até os 10 cm de profundidade, mesmo com 106 mm de precipitação e independentemente da adição do óleo. / Abstract: This study aimed to evaluate the lixiviation of sulfentrazone and amicarbazone applied to the field, with and without mineral oil, and its relationship with the control of morning glory (Ipomoea nil and I. hederifolia), from seed deposited at different depths and under different layers of sugar cane straw. In sugar cane field, after accumulated rainfall of 35, 67 and 106 mm, PVC pipes of 10 cm in diameter, sliced lengthwise, were buried by the depth of 35 cm. The tubes were removed and, after the last sampling (106 mm), the tests plants sorghum and Ipomoea nil were sown across the section of pipe. Visual assessments of intoxication were made at 7, 10 and 15 days after sowing (DAS) and 20 DAS the dry weight of the seedlings was determined. The experimental design was a randomized block in split plots scheme with four replications. The plot consisted of application of two herbicides (amicarbazone and sulfentrazone), with or without mineral oil, and a control without herbicide. In subplots was studied the depths of leaching (0,0-2,5; 2,5-5,0; 5,0-10, 10-15, 15-20, 20-25; 25-30; 30 - 35 cm). For the bioassay, the presence of sulfentrazone was estimated in the upper layer to the 10 cm deep, even with 106 mm of rainfall and whether adding the oil. / Orientador: Pedro Luís da Costa Aguiar Alves / Coorientadora: Maria do Carmo M. Damasceno Pavani / Banca: Marcelo da Costa Ferreira / Banca: Dagoberto Martins / Mestre
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Avaliação temporal e espacial do balanço de radiação, de energia e da evapotranspiraçâo no noroeste paulista, face a mudança no uso do solo /

Feitosa, Diego Gonçalves. January 2014 (has links)
Orientador: Fernando Braz Tangerino Hernandez / Banca: Ricardo Antonio Ferreira Rodrigues / Banca: Antônio Heriberto de Castro Teixeira / Resumo: Os municípios de Ilha Solteira, Itapura, Pereira Barreto, Sud Mennucci e Suzanápolis, localizados na região do noroeste paulista, desde 2006 vem passando por uma grande mudança no uso e ocupação do solo, com a cultura da cana-de-açúcar tendo uma grande expansão ocupando as áreas de pastagens. Essa drástica mudança do uso do solo pode levar a alterações no balanço de energia, interferindo assim no mesoclima da região. Neste contexto, esse trabalho teve como objetivo avaliar o balanço de radiação, de energia e evapotranspiração na região do noroeste paulista, utilizando técnicas de sensoriamento remoto através do algoritmo SAFER (Simple Algorithm For Evapotransporation Retrieving), que foi aplicado a 16 imagens divididas em dois períodos, sendo o primeiro de 2001 a 2004 e o segundo de 2008 a 2011. A área total de produção da cultura da cana-de-açúcar na região de estudo teve uma grande expansão principalmente entre anos de 2006 a 2007 e de 2007 a 2008, passando de 17.542 ha em 2006 para 58.541 ha em 2008, o que representa um aumento de 333,7%, com expansão de pouco mais de 15.000 ha em 2007 e 25.000 ha em 2008 e chegando a 2011 a 72.269 hectares. Nestas condições, avaliando os parâmetros do balanço de radiação, de energia e evapotranspiração para dois períodos citados, encontrou-se um aumento nos valores de Albedo e da relação H/Rn, após a expansão da cana-de-açúcar na região, enquanto os dados de NDVI, ETa/ET 0 e λE/Rn apresentaram uma redução nos valores médios para o mesmo período. Ao se relacionar o valor médio obtido para toda a área de estudo, com os valores médios para algumas classes de uso do solo, as áreas de cana-de-açúcar e de pastagem apresentaram elevados valores de R 2, demonstrando uma grande influência da expansão da cultura da cana-de-açúcar e da degradação das pastagens na alteração desses parâmetros do balanço de radiação e de energia. O consumo de água na... / Abstract: The municipalities of Ilha Solteira, Itapura, Pereira Barreto, Sud Mennucci and Suzanápolis located in the São Paulo northwestern region, since 2006 has undergone a major change in the use and occupation of land where the culture of sugar cane had a large expansion land use occupying areas that were once used for pasture. This drastic change of land use might lead to a alterations in the energy balance, just like that interfering with the climate of region. In this context, this study aimed to evaluate the radiation balance, energy and evapotranspiration in the São Paulo northwest region using remote sensing techniques through the SAFER algorithm, which was applied to 16 images divided into two periods, the first being 2001 to 2004 and the second of 2008 to 2011. The total area of crop production of sugar cane in the study region had a major expansion mainly between 2006 to 2007 and 2007 to 2008, increasing from 17.542 ha in 2006 to 58.541 ha in 2008, representing a increase of 333.7%, an increase of just over 15.000 ha in 2007 to 25.000 ha in 2008 and reaching 72.269 ha in 2011. Accordingly, evaluating the parameters of the radiation balance, energy and evapotranspiration for the periods aforementioned, we found an increase in the albedo values and H/Rn, after the expansion of cane sugar in the region, while NDVI data, and ETa/ET0, λE/Rn showed a decrease in mean values for the same period. When related to the average value obtained for the entire study area, with the average values for some classes of land use, areas of sugar cane and pasture had high R 2 values, evidencing a strong influence of the of the sugar cane expansion and pasture degradation in the radiation and energy balance. Water consumption in the region, considering the entire study area of 280.591 ha and using the average value of ETa of 1.73 mm day -1 refers to average throughout the period evaluated for the entire study is approximately 4.854.224.3 m 3 dia -1 / Mestre
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Identificação de marcadores microssatélites genômicos e funcionais associados a parâmetros agroindustriais em cana-de-açúcar /

Leite, Daniel Carvalho. January 2010 (has links)
Resumo: A produção de açúcar por hectare constitui o foco principal dos programas de melhoramento de cana-de-açúcar e depende tanto da produção da cana colhida no campo como da concentração de açúcar (sacarose) contida no colmo. O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores microssatélites genômicos e funcionais associados aos componentes de produção (altura, diâmetro, peso e número de colmos), produtividade e parâmetros de qualidade em cana-de-açúcar (Brix, Fibra, Pol%Cana), com base em uma progênie proveniente do cruzamento entre o clone IACSP95-3018 e a cultivar IACSP93-3046 ambos do Programa de Melhoramento Cana IAC. O mapa de ligação foi composto por 175 marcadores em dose única distribuídos em 58 grupos de ligação (GL) com cobertura de 1525 centiMorgans e distância média entre os marcadores de 8,71 centiMorgans. O comprimento dos grupos de ligação variou de 1 a 72 centiMorgans. Os 58 GL deram origem a 9 grupos de homologia. Com os marcadores em dose única foi feita uma análise de marca simples para a identificação de QTLs putativos associados as medidas fenotípicas obtidas em cana planta e cana soca. No total foram detectadas 69 (25%) associações marcador/característica fenotípica (P<0.05) das quais, 32 (46%) em cana planta, 37 (54%) cana soca e 6 (9%) em ambos os ciclos. Estas associações foram derivadas de 47 locos de microssatélites. Para os componentes de produção e produtividade foram encontradas 38 associações e duas em ambos os ciclos (planta e soca) enquanto para os parâmetros de qualidade foram detectadas 22 associações e duas em ambos os ciclos. Para os marcadores derivados de seqüências expressas, algumas associações mostraram uma relação entre a função do gene do qual o marcador foi derivado com à característica fenotípica associada. Para estas associações, apesar dos marcadores terem apresentado... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sugar production per hectare is the main focus of sugarcane breeding programs and depends on the sugarcane production harvest in the field and the sugar content (sucrose) of the stalk juice. The objective of the present work was to identify genomic and functional microsatellites markers associated to yield components (height, diameter, weight and stalk number), productivity and quality parameters (Brix, Fibre, Pol%Cane) in a progeny derived from a cross of the elite clone IACSP95-3018 and the variety IACSP93-3046, both from the IAC Sugarcane Breeding Program. The genetic map was composed by 175 single dose markers distributed onto 58 linkage groups (LG). The map coverage was 1525 centiMorgans with an average distance between markers of 8.71 centiMorgans (cM) and length of the LG ranging from 1 to 72 cM. The 58 LG gave rise to 9 homology groups. Single marker trait association analysis was performed with the single dose markers to identify putative QTLs associated with the phenotypic measures obtained at plant cane and ratoon cane. A total of 69 (25%) maker/trait associations (P<0.05) was detected, of which, 32 (46%) at plant cane, 37 (54%) at ratoon cane and 6 (9%) at both cycles. These associations were derived from 47 microsatellite loci. For the yield components and productivity 38 associations was found and 2 at both cycles while for the quality parameters 22 associations were detected and 2 at both cycles. For the EST derived markers, some associations showed a relation between the function of de gene of which it was derived with the phenotypic trait. For such associations, although the marker effects were low, it is probable that these markers contribute to the respective phenotypic trait / Orientador: Dilermando Perecin / Coorientadora: Luciana Rossini Pinto / Banca: Silvana Aparecida Creste Dias de Souza / Banca: Sandra Helena Unêda Trevisoli / Mestre
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Acurácia da diagnose da composição nutricional (CND) para diagnóstico de fósforo em cana-de-açúcar /

Silva, Gilmara Pereira da. January 2016 (has links)
Orientador: Renato de Mello Prado / Coorientador: Paulo Guilherme Salvador Wadt / Banca: Cássio Hamilton Abreu Junior / Banca: Anelisa de Aquino Vidal Lacerda Soares / Banca: Wanderley José de Melo / Banca: Manoel Evaristo Ferreira / Resumo: Apesar da utilização do método da Diagnose da Composição Nutricional (CND) para a interpretação do estado nutricional de diversas culturas, especialmente da cana-de-açúcar, muitos fatores ainda precisam ser mais bem estudados, como os critérios de escolha das populações de referência e estudos para validar os critérios de interpretação dos índices nutricionais a partir da acurácia dos diagnósticos nutricionais. Objetivou-se avaliar medidas de acurácia sob diferentes populações de referência e fatores de ajuste na interpretação de índices nutricionais do método CND para diagnóstico nutricional do fósforo em cana-de-açúcar. Para os estudos, utilizaram-se dados coletados em cinco áreas experimentais cultivadas com cana-de-açúcar do primeiro ciclo (safra 2013), localizadas em três municípios do Estado de São Paulo, Brasil. As variedades de cana-de-açúcar cultivadas foram a CTC 15 e RB 855453. Para gerar o banco de dados, foi considerado o fatorial 3x4x2x2, sendo três fontes de fósforo (superfosfato triplo, fosfato natural de Araxá, fosfato natural reativo Bayóvar ou fosfato natural reativo Gafsa), quatro doses de P2O5 (0; 90; 180 e 360 kg ha-1 de P2O5 solúvel em ácido cítrico a 2%); na ausência e na presença de torta de filtro decomposta na dose de 7,5 t ha-1, em base seca (equivalente a 15 t ha-1, em base úmida) e duas épocas de amostragem foliar (4 e 8 meses após a brotação), em delineamento experimental de blocos ao acaso, com três repetições por tratamento. Obteve-se o banco ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Despite use of the Compositional Nutrient Diagnosis (CND) method for interpretation of the nutritional status of various crops, especially sugarcane, many factors still need to be better studied including the criteria for selection of reference populations, as well as studies to validate the interpretation criteria of nutritional indices from accuracy of the nutritional diagnosis. This study sought to evaluate accuracy measures in different reference populations and adjustment factors in the interpretation of nutritional indices of the CND method for nutritional diagnosis of phosphorus in sugarcane. For the studies, data was used as collected from five experimental areas cultivated with sugarcane in the first cycle (safra 2013), located in three municipalities in the state of São Paulo, Brazil. The sugarcane varieties cultivated were CTC 15 and RB 855453. To generate the database, the 3x4x2x2 factorial was considered with three phosphorus sources (triple superphosphate, Araxá rock phosphate, Bayóvar reactive phosphate rock or Gafsa reactive phosphate rock), four doses of P2O5 (0, 90, 180 and 360 kg ha-1 P2O5 soluble in 2% citric acid), in the absence and presence of decomposed filter cake at a dose of 7.5 t ha-1 dry basis (equivalent to 15 t ha-1 wet basis) and two leaf sampling periods (4 and 8 months after budding), in a randomized block experimental design with three replicates per treatment. A database was obtained from the values of stalk yield and foliar N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn and Zn for the sugarcane, for a total 720 samples. In study I the variables determined were the mean Nutritional Balance Index (NBIm), the CND index and productivity, the degree of agreement between the standards and the nutritional diagnosis accuracy for P. Based on the assessed reference populations, it was not possible to define the best set of standards from ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Influência das características do sulco de plantio de cana-de-açúcar (Saccharum spp. L.) na uniformidade de deposição da pulverização de herbicidas em pré-emergência /

Carvalho, Fernando Tadeu de. January 1999 (has links)
Resumo: O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de estimar a deposição da pulverização na superfície do sulco de plantio da cana-de-açúcar composto por patamar, parede e fundo do sulco, através de dois métodos de aplicação: tratorizada, com volume de calda de 200 L/ha e aérea, com volume de calda de 40 L/ha, com o avião voando no sentido da linha e perpendicularmente à linha de plantio. Analisou-se também a região da parede do sulco onde a deposição é mais irregular e identificou-se os tipos de sulcos mais adequados à aplicação de herbicidas. As análises do perfil do terreno de áreas das plantio de cana-de-açúcar, foram realizadas em nove usinas do Estado de São Paulo, sendo três em áreas de solo de textura arenosa, três em solo de textura média e três em solo de textura argilosa. Os dados foram coletados em dez sulcos seguidos e a média permitiu estabelecer o perfil médio do sulco de plantio de cada usina. A análise da deposição da calda foi realizada na Usina Unialco. A calda foi preparada diluindo-se sulfato de cobre em água, na dose de 1 kg / ha. As gotas da calda pulverizada, foram coletadas em lâminas de vidro, que foram distribuídas nos patamares, paredes e fundos dos sulcos dos vários sulcos avaliados. A análise da concentração de cobre nas lâminas, realizada no aparelho espectrofotômetro de absorção atômica, proporcionou a quantificação do volume de calda pulverizada nas diferentes regiões do sulco. Os dados foram analisados estatisticamente através do teste t. Observou-se que a irregularidade do terreno em áreas de plantio de cana-de-açúcar, desuniformiza a deposição da calda de pulverização. A quantidade de produto depositada na parede do sulco, depende do seu ângulo de inclinação e pode ser estimada multiplicando-se a dose aplicada pelo cosseno do...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The present work was developed with the objective of estimating the deposition of the spray solution in the surface of the furrow of plantation of the sugar-cane composition for landing, wall and fund of the furrow, through two application methods: for tractor, with 200 L/ha and aerial, with 40 L/ha, with the airplane flying in the sense of the line and perpendicular to the plantation line. It was also analyzed the area of the wall of the furrow where the deposition is more irregular and was identified the types of profiles more adapted to the herbicidas application. The analyses of the profile of the land of areas of sugar-cane plantation, they were accomplished in nine mills of the State of São Paulo, being three in areas of soil of sandy texture, three in soil of medium texture and three in soil of loamy texture. The data were collected in ten followed furrows, in each mill and the average of the ten furrows provided the medium profile of the furrow of plantation of each mill. The analysis of the deposition of the spray solution was accomplished in Mill Unialco. The solution was prepared being diluted copper sulfate, in water, in the dose of 1 kg / ha. The drops of the sprayed were collected in glass sheets, that were distributed in the landings, walls and funds of the furrows of the several appraised furrows. The analysis of the copper concentration in the sheets, accomplished in the apparel spectrum-fotometro of atomic absorption, provided the identification of the values of the volume of sprayed in the different areas of the furrow. The data were analyzed through the test t. Was observed that the irregularity of the land, in areas of plantation of sugar-cane doesn't make the deposition of the spray solution. The amount of product deposited in the wall of the furrow, depends on its inclination angle and it can...(Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Edivaldo Domingues Velini / Coorientador: Dagoberto Martins / Banca: Carlos Gilberto Raetano / Banca: Julio Cezar Durigan / Banca: Luiz Malcoln Mano de Mello / Banca: Jamil Constantin / Doutor
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Fungos na compostagem da torta de filtro : diversidade, genômica e potencial biotecnológico /

Oliveira, Tássio Brito de. January 2016 (has links)
Orientador: Andre Rodrigues / Banca: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli / Banca: Daniela AlonsoBocchini Martins / Banca: Darlene Attili de Angelis / Banca: Daiane Cristina Sass / Resumo: A torta de filtro é gerada após o processo de filtração do caldo de cana (cerca de 26 a 40 kg por t de cana) e geralmente é utilizada como fertilizante nas lavouras sem qualquer tratamento prévio. A diversidade de fungos presentes na torta de filtro fresca e no processo de compostagem desse substrato foi acessada utilizando sequenciamento em larga escala. Além disso, fungos tolerantes ao calor foram isolados e avaliados quanto à capacidade de produzir enzimas de degradação da biomassa (celulase, xilanase, lacase e poligalacturonase). Considerando que esse grupo de fungos carece de uma revisão taxonômica atual, aproveitamos as recentes mudanças proporcionadas pelo Código de Nomenclatura para Algas, Fungos e Plantas para gerar uma revisão taxonômica do grupo. Uma gama de patógenos oportunistas foi encontrada entre os taxa mais abundantes na torta de filtro fresca, como Lomentospora prolificans (43,13%), Trichosporon sp. (10,07%), Candida tropicalis (7,91%) e Hormographiella aspergillata (8,19%). Isso indica que a torta de filtro pode ser uma potencial fonte de fungos patogênicos, apresentando riscos para a saúde humana se aplicado como fertilizante sem qualquer tratamento. No entanto, o processo de compostagem reduz efetivamente a carga desses fungos. Além disso, cria um ambiente interessante para fungos capazes de produzir enzimas com potencial aplicação biotecnológica, uma vez que todos os 110 isolados avaliados foram capazes de produzir, pelo menos, uma das enzimas avaliadas. Além disso, a análise comparativa de genes codificantes para peptidases presentes nos genomas de fungos termofílicos (encontrados em sistemas de compostagem) e mesofílicos mostrou que a termofilia levou à várias adaptações para a termoestablidade enzimática / Abstract:Pressmud is derived from sugarcane juice filtrate (around 26 to 40 kg per ton of sugarcane) and it is mainly used as fertilizer in crops without prior treatment. Here, the fungal diversity present in both fresh and composting pressmud was revealed by 454 pyrosequencing. In addition, heat-tolerant fungi were isolated and surveyed for their repertoire of biomass-degrading enzymes (cellulase, xylanase, laccase and polygalacturonase). The fact that the taxonomy of such organisms is still obscure, we revised their taxonomy in the light of the recent changes adopted in the Code of Nomenclature for Algae, Fungi and Plants. A wide range of opportunistic pathogens was found among the most abundant taxa in fresh pressmud, such as Lomentospora prolificans (43.13%), Trichosporon sp. (10.07%), Candida tropicalis (7.91%), and Hormographiella aspergillata (8.19%). This indicates that fresh pressmud may be a source of human pathogenic fungi, presenting a potential threat to human health if applied as fertilizer without treatment. Composting of the pressmud effectively reduces the load of such fungi. Furthermore, the composting system creates an interesting environment for fungi able to produce enzymes with biotechnological applications, since all the 110 isolates screened were able to produce at least one of the tested enzymes.Furthermore, comparative analysis of peptidases genes encoded by thermophilic (generally found in composting systems) and mesophilic fungi showed that thermophyly selected for thermostable enzymes / Doutor
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Controle de Sphenophorus levis e Conotrachelus humeropictus pelo uso combinado de nematoides e fungos entomopatogênicos /

Simi, Lucas Detogni, 1984. January 2014 (has links)
Orientador: Antonio Batista Filho / Banca: Luis Garrigós Leite / Banca: Dinalva Alves Mochi / Banca: Silvia Renata Siciliano Wilcken / Banca: Regiane Cristina O. Freitas Bueno / Resumo: O presente trabalho avaliou o uso combinado de fungos e nematoides entomopatogênicos contra o bicudo-da-cana-de-açúcar, Sphenophorus levis, e contra a broca do cupuaçu, Conotrachelus humeropictus. Contra S. levis, foi feita seleção de isolados de Beauveria bassiana e Metarhizium anisopliae em adultos da praga, e testes de uso combinado em laboratório contra as fases de larva e adulto. Em campo, em área de cana-de-açúcar infestada naturalmente com S. levis, foram realizados 5 tratamentos (nematoide Steinernema brazilense, Bio NEP®; fungo B. bassiana; combinação nematoide + fungo; inseticida químico Regent Duo® e testemunha) foi avaliada a infestação de larvas de S. levis nas soqueiras de cana-de-açúcar, antes e após um ano da aplicação. Para verificação do tipo de interação, foram coletadas amostras de solo em 3 tempos. Na pré-aplicação, após uma semana e um mês da aplicação, e avaliada a mortalidade de larvas de Galleria mellonella expostas às amostras de solo. Nos experimentos com C. humeropictus, foi feita seleção de isolados de B. bassiana em larvas de Conotrachelus psidii, usado como inseto teste. Os experimentos de campo avaliou-se a combinação de B. bassiana e S. brazilense, contra a larva de C. humeropictus. Também foi avaliada a capacidade do nematoide S. brazilense de carrear conídios de B. bassiana e M. anisopliae em solo arenoso. No resultado obtido na seleção de isolados de fungos para S. levis, IBCB 170 de B. bassiana e IBCB 383 de M. anisopliae foram os mais eficientes, promovendo 80% e 72% de mortalidade, respectivamente. No ensaio contra larva de S. levis, observou-se efeito aditivo na mistura de S. brazilense com B. bassiana, promovendo 80% de mortalidade. No ensaio contra adultos ... / Abstract:This study evaluated the combined use of entomopathogenic fungi and nematodes against the sugarcane weevil, Sphenophorus levis, and against the cupuaçu fruit borer, Conotrachelus humeropictus. To S. levis, we made a strain selection of Beauveria bassiana and Metarhizium anisopliae against adults, and a testing of combined use in laboratory in larvae and adults of the pest. In field experiments, were applied the treatments: 1) nematode Steinernema brazilense (Bio NEP®); B. bassiana; S. brazilense + B. bassiana; chemical treatment with Regent Duo®; and control treatment. We evaluated the infestation of S. levis larvae in sugarcane ratoon, before and after one year of the application. To evaluate interactions between agents, soil samplings were performed one week, and one month after application, and evaluated the mortality of Galleria mellonella larvae exposed to these soil samples. To C. humeropictus, a strain selection of B. bassiana was made on larvae of Conotrachelus psidii (used as preliminary test), and field experiments using B. bassiana and S. brazilense against larvae of C. humeropictus. We also evaluated the ability of the nematode S. brazilense carrying conidia of B. bassiana and M. anisopliae in sandy soil. The results of strain selection to S. levis, B. bassiana IBCB 170 and M. anisopliae IBCB 383 were the most efficient, providing 80% and 72% of mortality, respectively. In tests against larvae of S. levis, additive effect was observed in the treatment S. brazilense + B. bassiana, providing 80% mortality. Against adults of S. levis, the best treatment was B. bassiana + S. brazilense, causing 40% of mortality, showing additive interaction. In the field experiments, the infestation S. levis larvae in sugarcane ratoon was reduced by all treatments, except for control. The assessment of mortality of G. mellonella exposed to soils samples showed synergistic and additive effects, one week an on ... / Doutor
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Estudo do "Mobile-metagenome" a partir de biblioteca metagenômica proveniente de solo com cultivo de cana-de-açúcar e solo de floresta /

Pinto, Alessandra dos Santos. January 2015 (has links)
Orientador: Alessandro de Mello Varani / Coorientador: Elisângela Soares Gomes / Banca: Marcos Túlio Oliveira / Banca: Mariana Carina Frigieri / Resumo: Os Elementos Genéticos Móveis (EGMs) são segmentos de DNA presentes em todos os domínios, e que apresentam a capacidade de mobilização em um genoma. São considerados agentes chaves na evolução e diversificação dos seres vivos. Sequências de Inserção (IS) são os EGMs mais abundantes dos procariotos. IS são elementos compactos, que codificam o gene responsável pela mobilização, a transposase. Estudos de genômica comparativa indicam que a transposase é o gene mais abundante presente em banco de dados públicos de genomas e metagenomas. O presente estudo avaliou a abundância e diversidade de transposases a partir de dados de sequenciamento de alto rendimento provenientes de duas bibliotecas metagenômicas, a primeira originada de solo com cultivo de cana-de-açúcar e a segunda de solo de floresta. Os metagenomas foram analisados através de duas frentes de investigação. Na primeira frente de investigação foram identificadas as transposases em um conjunto de 267.879.464 reads paired-end (2x100bp) através da ferramenta MG-RAST. Na segunda frente de investigação, os reads de cada metagenoma foram montados (de novo assembly) e posteriormente anotados através da plataforma MG-RAST e da ferramenta ISsaga 2.0. A plataforma MG-RAST identificou 902.982 (reads) com função atribuída para transposases, enquanto que a ferramenta ISsaga 2.0 recuperou 592 (scaffolds) contendo quadros aberto de leitura (ORFs) codificando para transposases. Um total de 120 (22%) scaffolds e 767.534 (85%) reads anotados foram classificados em grupos taxonômicos distintos, onde o filo Proteobacteria (48% - MG-RAST e 34,3% - ISsaga 2.0) foi predominante. Análises comparativas e biocuração indicam que 695.296 (77%) dos reads foram incorretamente atribuídos com função transposase pela ferramenta MG-RAST. Dentre as famílias de transposases classificadas pelo ISsaga 2.0 destacam-se as famílias: IS110 (76/13,9%), IS3 (74/13,6%), e em particular... / Abstract: Mobile Genetic Elements (MGE) are segments of DNA present in the biological domains that have the ability to move around within a genome. They are considered key player in the evolution and diversification of living things. Insertion Sequences (IS) are the most abundant MGEs of prokaryotes. IS are compact elements that encode the gene responsible for the mobilization, the transposase. Comparative genomic studies indicate that the transposase is the most abundant gene found in public database of genomes and metagenomes. This study evaluated the abundance and diversity of transposases from high-throughput sequencing data originated from two metagenomic libraries, one from soil with sugarcane cultivation and the other from forest soil. The metagenomes were analyzed through two research fronts. In the first one, transposases were identified in a set of 267. 879. 464 reads paired-end (2x100bp) by MG RAST tool. In the second front of research, the reads of each metagenome were fitted (de novo assembly) and subsequently recorded by ISsaga 2.0 tool and platform MG-RAST. The platform MG- RAST identified 902.982 (reads) with allocated transposase function, whereas the 2.0 ISsaga tool recovered 592 (scaffolds) containing open reading frames (ORFs) coding for transposase. A total of 120 (22%) scaffolds and 767.534 (85%) reads noted were classified in different taxonomic groups resulting the phylum Proteobacteria (48% - MG-RAST and 34.3% - Issaga 2.0). Comparative analysis and biocuration indicate that 695.296 (77%) of the reads were incorrectly assigned with transposase function by MG-RAST tool. Among the families of transposase classified by Issaga 2.0, feature the families: IS110 (76 / 13.9%), IS3 (74 / 13.6%), and particularly 65 scaffolds (11.9%) from ISNCY family (not classified yet). Another noticeable result is that no IS previously described in the literature has been identified in these metagenomic data. This study revealed: (a) MG-RAST ... / Mestre
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Comportamento de genótipos de cana-de-açúcar com irrigação de salvamento em Goianésia-GO /

Silva, Daniel Nunes da. January 2015 (has links)
Orientador: Dilermando Perecin / Coorientador: Marcos Guimarães de Andrade Landell / Coorientador: Vinícius Bof Bufon / Banca: Alexandre Barcellos Dalri / Banca: Samira Domingues Carlin Cavallari / Resumo: A irrigação de salvamento é uma prática agronômica muito utilizada nos canaviais, nas regiões que apresentam altos déficits hídricos. O Estado de Goiás faz uso desta prática para evitar quedas acentuadas de produtividades após ciclo nos canaviais cortados em períodos de déficits hídricos. A partir de mudas pré-brotadas, este trabalho teve por objetivo estudar qual (ais) dos 16 genótipos apresenta (m) maior resposta e tolerância quando exposto (s) a diferentes frequências de aplicação (7; 14; 28 dias e sem irrigação) da irrigação de salvamento no ciclo de cana-soca de 1º corte. O período de avaliação foi de novembro de 2013 a junho de 2015. O experimento foi instalado na Usina Jalles Machado, no município de Goianésia-GO, localizada no norte do Estado de Goiás, em delineamento quadrado latino 4 x 4, com 16 genótipos e 4 repetições. Os atributos analisados foram: notas visuais de brotação de soqueira, número de colmos, diâmetro e altura dos colmos, produtividades (TCH final) e suas respectivas quedas percentuais (%) quando comparado aos tratamentos com a frequência de 7 dias e sem irrigação. A lâmina- -padrão utilizada na irrigação de salvamento foi de 60 mm. Os resultados obtidos mostraram que os genótipos mais responsivos à irrigação de salvamento foram: CTC4, IACSP93-3046 e RB867515, e os menos responsivos foram CTC9003, RB98710 e IAC87-3396. Os genótipos IACSP95-5094 e CTC9003 foram os mais tolerantes ao déficit hídrico. A frequência da aplicação da irrigação de salvamento após a colheita, com intervalos de aplicação variando entre 7; 14 e 28 dias, não promoveu incremento na TCH final, promovendo maior flexibilidade (em dias) no momento de execução na lavoura comercial. O atributo produtividade (TCH final) só obteve impacto negativo quando não foi aplicada nenhuma lâmina de irrigação de salvamento. O atributo biométrico perfilhos finais, avaliado no momento da colheita... / Abstract: The salvage irrigation is an agronomic practice widely used in the cane fields in regions with high water deficits. The state of Goiás is done using this practice to avoid sharp drops in yields cycle after cycle in sugarcane cut in periods of water deficits. From pre-sprouted seedlings, this study aimed to study what (es) of 16 genotypes had higher responses and tolerance when exposed to different application frequency (7, 14 and 28 days and without irrigation) Rescue irrigation in the cycle cane ratoon 1st cut. The evaluation period was from November 2013 to June 2015. The experiment was installed in Jalles Machado plant in Goianésia-GO, municipality located in the northern state of Goiás, in Latin square design 4 x 4, with 16 genotypes and four repetitions. The attributes were analyzed: visual notes sprouting from the stump, number of stems, diameter and height of the stems, productivity (final TCH) and their respective falls (%) compared to treatment with the frequency of 7 days and without irrigation. The standard blade used in rescue irrigation was 60 mm. The results showed that the most responsive to salvage irrigation genotypes were CTC4, IACSP93-3046 and RB867515, and were less responsive CTC9003, RB98710 and IAC87-3396. The IACSP95-5094 and CTC9003 genotypes were the most tolerant to drought. The frequency of application of salvage irrigation after harvest with application intervals ranging from 7, 14 and 28 days, did not cause an increase in the final TCH promoting greater flexibility (in days) at the time of execution in commercial farming. The productivity attribute (final TCH) only obtained negative impact when it was not applied any blade salvage irrigation. The biometric attribute final tiller, valued at harvest, showed no statistical differences in the application of frequencies rescue irrigation with 7, 14 and 28 days and without irrigation. Biometric attributes examined (final height and final diameter) evaluated ... / Mestre

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