Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-17T13:30:46Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 538202 bytes, checksum: 6a2ab30e5bedc95cbf3e74191670f2c1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-17T13:30:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 538202 bytes, checksum: 6a2ab30e5bedc95cbf3e74191670f2c1 (MD5) Previous issue date: 2001-08-08 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O experimento, conduzido no Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Viçosa, teve como objetivo avaliar o ganho em peso, consumo, a conversão alimentar (CA) e as características de carcaça de bovinos Indubrasil e cruzados F1 Holandês-Gir (H-Gir) e Holandês-Guzerá (H-Guz), nas fases de recria e terminação, recebendo rações com dois níveis de proteína bruta (PB). Foram utilizados 36 bovinos machos castrados, sendo 12 Indubrasil, 12 H-Gir e 12 H-Guz. De cada grupo genético, foram alocados quatro animais para as categorias referência, recria e terminação. As médias de peso vivo inicial e peso vivo final foram de 256,83 kg e 339,71 kg; 292,17 kg e 452,15 kg, respectivamente, para as fases de recria e terminação. Os animais foram mantidos em regime de confinamento e receberam ração ad libitum, que apresentava uma relação volumoso:concentrado de 60:40, com base na matéria seca. Utilizou-se como volumoso o feno de capim Tifton (Cynodon dactylon). O início do período experimental foi precedido por um jejum de 16 h, com livre acesso à água, sendo que os 12 animais da categoria referência (quatro de cada grupo genético) foram abatidos, para se estimar o peso corporal vazio inicial e o ganho em carcaça dos 24 animais remanescentes. Não houve efeito dos grupos genéticos e níveis de proteína bruta sobre os consumos de matéria seca (CMS), proteína bruta (CPB), fibra em detergente neutro (CFDN), nutrientes digestíveis totais (CNDT) e conversão alimentar (CA), nas fases de recria e terminação, com exceção do CMS, CNDT e CFDN, expressos em kg/dia, e CMS (% do peso vivo), que foram maiores para os animais H- Guz, apenas na fase de recria. O ganho médio diário em peso vivo e peso corporal vazio dos animais H-Guz foi superior ao dos animais H-Gir e Indubrasil, apenas na fase de recria, não existindo influência dos grupos genéticos e níveis de PB sobre o ganho em carcaça e CA, tanto na fase de recria, como na terminação. As rações com 12% de PB foram mais eficientes economicamente que as com 15% de PB, na recria e terminação. Animais H-Guz, na recria, apresentaram menor rendimento de carcaça quente em relação ao peso vivo (RCPV) que os H-Gir e Indubrasil, que não diferiram entre si. Os grupos genéticos e os teores de PB nas rações não influenciaram os rendimentos de carcaça quente em relação ao peso corporal vazio, nem os rendimentos dos cortes básicos, dianteiro, traseiro total e especial, nas fases de recria e terminação. Na recria, os animais Indubrasil apresentaram menor porcentagem de músculos que os mestiços, que não diferiram entre si. Na terminação, os animais Indubrasil apresentaram maior porcentagem de gordura que os cruzados; os animais H-Gir apresentaram maiores proporções de ossos, seguidos dos Indubrasil e H-Guz, que não diferiram entre si. Rações com 15% de PB proporcionaram maior RCPV na recria. Os teores de PB das rações não influenciaram as proporções de músculo, gordura e ossos, tanto na recria quanto na terminação. As medidas de comprimento de carcaça, espessura de gordura subcutânea e a área do olho de lombo não foram influenciadas pelos grupos genéticos e teores de PB das rações. / A study was carried out at the Department of Animal Science of the Universidade Federal de Viçosa, aiming at evaluating the weight gain, consumption, food conversion (FC), and carcass characteristics of bovine Indubrasil and crossbred F1 Holstein-Gir (H-Gir) and Holstein-Guzera (H- Guz) at growing and finishing phases, given rations with two levels of crude protein (CP). Thirty-six male emasculate bovine were used, that is 12 Indubrasil, 12 H-Gir and 12 H-Guz. Four animals of each genetic group were allocated to reference, growing, and finishing categories. The averages of initial live weight and final live weight were 256.83 kg and 339.71 kg, and 292.17 kg and 452.15 kg for phases of growing and finishing respectively. The animals were maintained under feedlot regime and were allowed ad access libitum to ration presenting a feedstuff:concentrate relation of 60:40 based on dry matter. The grass hay Tifton (Cynodon dactylon) was used as feedstuff. The beginning of the experimental period was preceded by a 16 h fasting, and a free access to water, whereas 12 animals of the reference category were slaughtered (four from each genetic group) to estimate the initial empty body weight and the carcass gain of the 24 remaining animals. There were no significant effect of the genetic groups and crude protein levels on intake of dry matter (DMI), crude protein (CPI), neutral detergent fiber (NDFI), total digestible nutrients (TDNI) and food conversion (FC) at the growing and finishing phases, except for DMI, TDNI, and NDFI expressed in kg/day and DMI (% live weight), that were higher for the H-Guz animals only at the growing phase. The average daily gain for live weight and empty body weight of the H-Guz animals was higher to those of the H-Gir and Indubrasil animals only at growing phase, and there were no influence of the genetic groups and CP levels on carcass gain and FC, at both growing and finishing phases. The rations with 12% CP were more economically efficient than those with 15% CP at growing and finishing phases. At growing phase, H-Guz presented lower yield for warm carcass relative to live weight (CLWR) than H-Gir and Indubrasil animals, which did not differ to each other. The genetic groups and ration CP contents showed no influence on warm carcass yield in relation to empty body weight, as well as in yields of the basic cuttings, the anterior and the total and special posterior at the growing and finishing phases. At the growing phase, the Indubrasil animals showed lower percentage of muscles than the crossbred ones, which did not differ to each other. At the finishing phase, the Indubrasil animals presented higher fat percentage than the crossbred ones; the H-Gir animals presented higher bone proportions, following the Indubrasil and H-Guz which did not differ to each other. Rations with 15% CP provided higher CLWR at the growing phase. The ration CP contents had no influence on bones, fat and muscle proportions either at growing and finishing phases. The measures of carcass length, subcutaneous fat thickness and loin eye area were not influenced by the genetic groups and ration CP contents.

COSTA, Tatiana Gouveia Pinto. Avaliação do ganho de peso, desempenho, morfometria e características de carcaça de ovinos das raças Santa Inês e Somalis brasileiro, no Estado do Ceará. 2007. xiii, 45 f. : Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Departamento de Zootecnia, Programa de Pós-Graduação em Zootecnia. Fortaleza-CE, 2007. / Submitted by Eric Santiago (erichhcl@gmail.com) on 2016-08-09T15:15:24Z No. of bitstreams: 1 2007_dis_tgpcosta.pdf: 433028 bytes, checksum: acc2f127c4993cc615ee5da64b171ffd (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-09T15:42:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_dis_tgpcosta.pdf: 433028 bytes, checksum: acc2f127c4993cc615ee5da64b171ffd (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-09T15:42:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_dis_tgpcosta.pdf: 433028 bytes, checksum: acc2f127c4993cc615ee5da64b171ffd (MD5) Previous issue date: 2007 / The objective present work was to evaluate the weight earnings, the morfometric and the characteristics of carcass of two genotype of lambs fedlot hair, Santa Ines and Somalis. Two experiments were accomplished: I - for weight earnings and morfometric of males and females, in confinement, and II - for evaluation of the characteristics of carcass of the males. In the experiment I, 10 males and 10 females of the race Santa Ines, and 10 males and 06 females of the race Somalis, were used, in a completely randomized design, in factorial outline 2x2 (two races and two sexes), which totaled four treatments. The adopted alimentary handling was the supply of pricked grass-elephant and concentrated (400g/head/day), distributed in the morning and in the afternoon. The experimental period had duration of 60 days, where every fifteen days the animals were heavy and accomplished the following weight measures: withers height (HW), crop height (CH),thorax height (TH), length of the body (LB), thoracic perimeter (TP), width of the thorax (WT), width of the croup (WC), croup length (CL), ileum width (IW) and width isqueum (IW). In the experiment II, a completely randomized design, where nine males Santa Ines and six Somalis were abated when they reached an average of 28 kg of alive weight. The appraised characteristics were, the alive discount weight (DW), hot carcass weigh (HCW), cold carcass weigh (CCW), hot carcass revenues (HCR) and cold (CCR), cooling loss (CL), internal length of the carcass (CLI) and the index of compactness of the carcass (ICC). In the cold carcass they were appraised the revenue of the following commercial cuts: neck, palette, whole loin, leg, chest, rack, rib and flank. There was significant difference (P<0.05) among the races and enter the sexes so much for the corporal weight as for most of the accomplished measures, of the 150 to the 210 days of age, and the race Santa Ines was superior the race Somalis, and the superior males the females. Among the carcass characteristics, the race Somalis presented smaller averages for PR and ML (P<0.05) than Santa Ines. There were not significant differences for the other carcass characteristics, as well as for the revenues of the cuts, among the appraised races. Santa Ines presented larger weights, weight measures, internal length of the carcass and it breaks for cooling than Somalis. With relationship to the revenue of the commercial cuts accomplished in the carcass the races sheeps Santa Ines and Somalis they were similar to each other / O objetivo presente trabalho foi avaliar o ganho de peso, a morfometria e as características de carcaça de dois genótipos de ovinos deslanados, Santa Inês e Somalis. Foram realizados dois experimentos: I – para ganho de peso e morfometria de machos e fêmeas, em confinamento, e II – para avaliação das características de carcaça dos machos. No experimento I, foram utilizados 10 machos e 10 fêmeas da raça Santa Inês, e 10 machos e 06 fêmeas da raça Somalis Brasileiros, em um delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial 2x2 (duas raças e dois sexos), o qual totalizou quatro tratamentos. O manejo alimentar adotado foi o fornecimento de capim-elefante picado e concentrado (400g/ cabeça/dia), distribuídos pela manhã e à tarde. O período experimental teve duração de 60 dias, onde a cada quinze dias os animais foram pesados e realizadas as seguintes medidas corporais: altura da cernelha (ACE), altura da garupa (AGA), altura do tórax (ATO), comprimento do corpo (CCO), perímetro torácico (PTO), largura do tórax (LTO), largura da garupa (LGA), comprimento da garupa (CGA), largura do ílio (LIL) e largura do ísquio (LIS). No experimento II, foi utilizado um delineamento inteiramente casualizado, onde nove machos Santa Inês e seis Somalis foram abatidos quando atingiram uma média de 28 kg de peso vivo. As características avaliadas foram, o peso vivo ao abate (PVA), peso da carcaça quente (PCQ), peso da carcaça fria (PCF), rendimentos de carcaça quente (RCQ) e fria (RCF), perda por resfriamento (PR), comprimento interno da carcaça (ML) e o índice de compacidade da carcaça (ICC). Na carcaça fria foram avaliados o rendimento dos seguintes cortes comerciais: pescoço, paleta, lombo inteiro, perna, peito, carré, costela e fraldinha. Houve diferença significativa (p<0,05) entre as raças e entre os sexos tanto para o peso corporal como para a maioria das medidas realizadas, dos 150 aos 210 dias de idade, sendo que a raça Santa Inês foi superior a raça Somalis, e os machos superiores as fêmeas. Dentre as características de carcaça, a raça Somalis apresentou menores médias para PR e ML (p<0,05) do que a Santa Inês. Não houve diferenças significativas para as demais características de carcaça, como também para os rendimentos dos cortes, entre as raças avaliadas. A Santa Inês apresentou maiores pesos, medidas corporais, comprimento interno da carcaça e quebra por resfriamento do que a Somalis. Quanto ao rendimento dos cortes comerciais realizados na carcaça as raças ovinas Santa Inês e Somalis foram semelhantes entre si.

AGUIAR, Germana Costa. Programas de luz para codornas de corte criadas em região equatorial. 2016. 70 f. Dissertação (Mestrado em Zootecnia)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016. / Submitted by Aline Mendes (alinemendes.ufc@gmail.com) on 2017-01-16T20:52:43Z No. of bitstreams: 1 2016_dis_gcaguiar.pdf: 1449926 bytes, checksum: 3a818d26ea42a86f5bc3dc1ce2257527 (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2017-01-16T21:18:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_dis_gcaguiar.pdf: 1449926 bytes, checksum: 3a818d26ea42a86f5bc3dc1ce2257527 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-16T21:18:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_dis_gcaguiar.pdf: 1449926 bytes, checksum: 3a818d26ea42a86f5bc3dc1ce2257527 (MD5) Previous issue date: 2016 / Two experiments were carried out to evaluate the effect of light programs for quails (Coturnix coturnix) grown in equatorial region on performance and carcass characteristics at different slaughter ages, sexual maturity, performance and quality of eggs during the laying period. In the first experiment, 1500 sex quails were distributed in a completely randomized design according to a 2x3 factorial scheme, with two sexes (males and females) and three light programs, with five replicates of 50 birds. The light programs were applied in the period from 7 to 49 days old, being natural the natural light program consisting of 12 hours and 30 minutes of natural light and 11 hours and 30 minutes without artificial lighting during the night. The intermittent lighting program, consisting of 18 hours of light and 6 hours of darkness, the period of light composed of 12 hours and 30 minutes of natural light and 5 hours and 30 minutes of artificial light interspersed by periods of darkness (1 hour and 23 minutes of light and 1 hour and 23 minutes of dark) and the continuous light program the birds were subjected to 23 hours of constant light, being 12 hours and 30 minutes of natural light, 10 hours and 30 minutes of artificial light and 1 hour of dark. During the whole experimental period, the birds of the different treatments were submitted to the same feeding program. For the ration consumption, in all periods, there was no effect of the interaction (light x sex), however, the natural light program resulted in lower consumption in relation to intermittent and continuous illumination, which did not differ from each other. Although females showed higher consumption, there was a significant difference only in the periods of 7 to 42 days and 7 to 49 days. For weight gain, there was interaction effect (light x sex) in periods of 7 to 42 days and 7 to 49 days. While weight gain among males did not differ significantly, the natural light program resulted in lighter females relative to intermittent and continuous lighting, which didn’t differ from each other. Females were heavier than males, in all light programs and breeding seasons. The feed conversion was not influenced by the interaction (light x sex) in all periods and wasn’t influenced by the factors isolated in the period from 7 to 35 days old. However, in the periods from 7 to 42 days and from 7 to 49 days, the natural light program resulted in a better result in relation to the intermittent and continuous lighting, which did not differ between them, and the females showed better feed conversion. For the characteristics of carcass and viscera, there was interaction effect (light x sex) only for carcass and chest in the period from 7 to 49 days. Carcass yield among males did not differ significantly; For females, the natural light program resulted in higher yields relative to intermittent and continuous lighting, which did not differ from each other. Thus, the males submitted to intermittent and continuous illumination presented higher carcass yield in relation to females. For chest yield, there was no difference between females, whereas for males, the natural light program resulted in higher yield in relation to intermittent and continuous lighting, which did not differ from each other. Thus, males submitted to intermittent and continuous illumination had lower breast yield in relation to females. The thigh + drumstick yield was not influenced by the factors studied, while the proportion of abdominal fat was lower for birds subjected to natural light and was higher in females at 49 days old. The proportion of liver at 35 days old was not influenced by the factors studied, however, it was lower for birds subjected to natural light and for males at 42 and 49 days old. In the second experiment, it were used 240 females quails remaining from the first experiment. The birds were transferred to a production shed, according to a completely randomized experimental design, with three treatments and five replicates of 16 birds. The experimental period was divided into four periods of 21 days, during which the birds of all treatments were submitted to the same light and feeding program. For the statistical analysis of the production data and egg quality, besides the effect of the light programs of the growth phase, the effect of the posture cycle period was added to the model. The birds that in the growth phase were submitted to the continuous or intermittent light program were more precocious when compared to those that were submitted to the natural light program. For performance variables, except egg weight, there was interaction effect (light program x posture cycle period), however, this effect was not observed for egg quality variables. The birds submitted to the natural light program in the growth phase showed lower ration intake until the second period (71 to 92 days old), lower egg production during all periods, lower egg mass and worse feed conversion until the third period (93 to 114 days old). These variables did not differ between the continuous and the intermittent program from the second period (71 to 92 days old). Light programs in growth stage didn’t influence the quality characteristics of the eggs, however, as the age of the birds increased, there was egg yolk reduction and egg shell ad albumen increase, from the first (49 to 71 days old) for the remaining periods of the cycle, and worsening of albumen and shell quality, from the first (49 to 71 days old) to the third period (93 to 114 days old). It is concluded that in equatorial region it is possible to use a light program with only natural light for the creation of male and female quails intended for meat production from 7 to 49 days old. However, the natural lighting program increases the age of sexual maturity and worsens the performance of birds during the production cycle (49 to 136 days old). The intermittent lighting program maintains the sexual maturity, performance and egg quality during the production cycle. / Foram realizados dois experimentos para avaliar o efeito dos programas de luz para codornas de corte (Coturnix coturnix) criadas em região equatorial sobre o desempenho e características de carcaça, em diferentes idades de abate, e maturidade sexual, desempenho e qualidade dos ovos durante o período de postura. No primeiro experimento, 1500 codornas sexadas foram distribuídas em delineamento inteiramente casualizado segundo esquema fatorial 2x3, sendo dois sexos (machos e fêmeas) e três programas de luz, com cinco repetições de 50 aves. Os programas de luz foram aplicados no período de 7 a 49 dias de idade, sendo natural o programa de luz natural constituído de 12 horas e 30 minutos de luz natural e 11 horas e 30 minutos sem iluminação artificial durante o período da noite. O programa de luz intermitente, constituído de 18 horas de luz e 6 horas de escuro, sendo o período de luz composto de 12 horas e 30 minutos de luz natural e 5 horas e 30 minutos de luz artificial intercalada pelos períodos de escuro (1 hora e 23 minutos de luz e 1 hora e 23 minutos de escuro) e o programa de luz contínuo as aves foram submetidas a 23 horas de luz constante, sendo 12 horas e 30 minutos de luz natural, 10 horas e 30 minutos de luz artificial e 1 hora de escuro. Durante todo período experimental as aves dos diferentes tratamentos foram submetidas ao mesmo programa de alimentação. Para o consumo de ração, em todos os períodos, não houve efeito da interação (luz x sexo), entretanto, o programa de luz natural resultou em menor consumo em relação a iluminação intermitente e contínua, que não diferiram entre si. Embora as fêmeas am apresentado maior consumo, houve diferença significativa apenas nos períodos de 7 a 42 dias e 7 a 49 dias. Para o ganho de peso, houve efeito da interação (luz x sexo) nos períodos de 7 a 42 dias e 7 a 49 dias. Enquanto o ganho de peso entre os machos não diferiu significativamente, o programa de luz natural resultou em fêmeas mais leves em relação à iluminação intermitente e contínua, que não diferiram entre si. As fêmeas foram mais pesadas que os machos, em todos os programas de luz e períodos de criação. A conversão alimentar não foi influenciada pela da interação (luz x sexo) em todos os períodos e também não foi influenciada pelos fatores isolados no período de 7 a 35 dias de idade. Porém, nos períodos de 7 a 42 dias e 7 a 49 dias, o programa de luz natural resultou em melhor resultado em relação à iluminação intermitente e contínua, que não diferiram entre si, e as fêmeas apresentaram melhor conversão alimentar. Paras as características de carcaça e vísceras, houve efeito da interação (luz x sexo) apenas para o rendimento de carcaça e peito no período de 7 a 49 dias. O rendimento de carcaça entre os machos não diferiu significativamente; para fêmeas, o programa de luz natural resultou em maior rendimento em relação à iluminação intermitente e contínua, que não diferiram entre si. Com isso, os machos submetidos à iluminação intermitente e contínua apresentaram maior rendimento de carcaça em relação às fêmeas. Para o rendimento de peito, não houve diferença entre as fêmeas, enquanto para os machos, o programa de luz natural resultou em maior rendimento em relação à iluminação intermitente e contínua, que não diferiram entre si. Dessa forma, os machos submetidos à iluminação intermitente e contínua apresentaram menor rendimento de peito em relação às fêmeas. O rendimento de coxa + sobrecoxa não foi influenciado pelos fatores estudados, enquanto a proporção de gordura abdominal foi menor para as aves submetidas à iluminação natural e foi maior nas fêmeas aos 49 dias de idade. A proporção de fígado, aos 35 dias de idade, não foi influenciada pelos fatores estudados, porém, foi menor para aves submetidas à iluminação natural e para os machos, aos 42 e 49 dias de idade. No segundo experimento, foram utilizadas 240 codornas de corte fêmeas remanescentes do primeiro experimento. As aves foram transferidas para um galpão de produção, segundo delineamento experimental inteiramente casualizado, com três tratamentos e cinco repetições de 16 aves. O período experimental foi dividido em quatro períodos de 21 dias, durante os quais as aves de todos os tratamentos foram submetidas ao mesmo programa de luz e alimentação. Para análise estatística dos dados de produção e qualidade dos ovos, além do efeito dos programas de luz da fase de crescimento foi adicionado ao modelo o efeito do período do ciclo de postura. As aves que, na fase de crescimento, foram submetidas ao programa de luz contínuo ou intermitente foram mais precoces quando comparadas as que foram submetidas ao programa de luz natural. Para as variáveis de desempenho, exceto peso dos ovos, houve efeito da interação (programa de luz x período do ciclo de postura), entretanto, não foi observado esse efeito para as variáveis de qualidade dos ovos. As aves submetidas ao programa de luz natural na fase de crescimento apresentaram menor consumo de ração até o segundo período (71 a 92 dias de idade), menor produção de ovos durante todos os períodos, menor massa de ovos e pior conversão alimentar até o terceiro período (93 a 114 dias de idade). Essas variáveis não diferiram entre o programa contínuo e o intermitente a partir do segundo período (71 a 92 dias de idade). Os programas de luz da fase de crescimento não influenciaram as características de qualidade dos ovos, porém, com o avançar da idade das aves houve redução na proporção de gema e aumento do albúmen e casca dos ovos, do primeiro (49 a 71 dias de idade) para os demais períodos do ciclo, e piora na qualidade do albúmen e da casca, do primeiro (49 a 71 dias de idade) até o terceiro período (93 a 114 dias de idade). Conclui-se que, em região equatorial, é possível utilizar um programa de luz com apenas iluminação natural para a criação de codornas machos e fêmeas destinadas a produção de carne no período de 7 a 49 dias de idade. Entretanto, o programa de luz natural aumenta a idade da maturidade sexual e piora o desempenho das aves durante o ciclo de produção (49 aos 136 dias de idade). O programa de luz intermitente mantém a maturidade sexual, o desempenho e qualidade dos ovos durante o ciclo de produção.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-06-23T16:38:13Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 187842 bytes, checksum: 837cc6df5ed88eea75cd541f83e654c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-23T16:38:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 187842 bytes, checksum: 837cc6df5ed88eea75cd541f83e654c3 (MD5) Previous issue date: 1999-02-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Avaliaram-se os consumos de matéria seca (CMS) e fibra em detergente neutro (CFDN), a conversão alimentar (CA), os dias de confinamento (DC), os ganhos médios diários de peso vivo (GMDPV), peso corporal vazio (GMDPVZ) e peso de carcaça (GCAR), os pesos dos conjuntos de órgãos, vísceras e cabeça-pés-rabo, sangue e couro, o comprimento de carcaça, os rendimentos de carcaça em relação ao peso vivo (RCPV) e peso corporal vazio (RCPVZ), os rendimentos dos cortes básicos: paleta, acém, ponta de agulha, alcatra completa e coxão, as porcentagens de músculo (MUS), gordura (GOR), ossos (OSS) e as quantidades de músculo (MUSC), gordura (GORC) e ossos (OSSC) na carcaça, além da área de olho de lombo e das relações músculo:osso e gordura:músculo, em experimento conduzido no Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Viçosa. Foram utilizados 45 bovinos F1 Limousin x Nelore, não-castrados, com peso vivo médio inicial de 330 kg e idade média de 14 meses. Cinco animais foram abatidos no início do experimento, sendo os demais distribuídos em delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial 2 x 5, com quatro repetições, sendo duas formas de balanceamento de rações e cinco níveis de concentrado na matéria seca, 25; 37,5; 50; 62,5; e 75%. A alimentação foi fornecida “ad libitum” uma vez ao dia e, como volumoso, utilizou-se o feno de capim coast-cross (Cynodon dactylon). O peso preestabelecido para o abate foi de 500 kg. Analisaram-se os dados por meio da análise de variância e regressão. As formas de balanceamento foram igualmente efetivas, à exceção do RCPVZ, cujas médias foram 66,89 e 67,27%, conforme normas norte- americanas de 1996 e 1984, respectivamente, não havendo interação entre estas e os níveis de concentrado. Os CMS, expressos em kg/dia, %PV e gMS/Kg0,75, foram influenciados quadraticamente pelos níveis de concentrado, estimando-se os respectivos valores máximos de 8,04 kg de MS, 1,99% PV e 89,22 gMS/Kg0,75, com os níveis de concentrado nas rações de 41,42; 36,71 e 37,96%, respectivamente. A CA, o CFDN e os DC decresceram linearmente em função do aumento dos níveis de concentrado. Os GMDPV e GCAR apresentaram resposta quadrática, estimando-se os valores máximos de 1,16 e 0,81 kg para 61,11 e 64,47% de concentrado, respectivamente. O GMDPVZ cresceu linearmente com o aumento dos níveis. O RCPV apresentou resposta linear crescente, à medida que se elevou o nível de concentrado, e o RCPVZ não foi influenciado pelo nível de concentrado. Os rendimentos dos cortes primários, as MUS e GOR e as MUSC e OSSC não responderam ao aumento de concentrado. A OSSC decresceu e a GORC cresceu de forma linear, com o aumento de concentrado. Os demais parâmetros não foram influenciados pelos níveis crescentes de concentrado nas rações. / Dry matter (DMI) and neutral detergent fiber (NDFI) intakes, feed:gain ratio (FGR), feedlot days (FD), average daily live weight (LWG), empty body (EBWG) and carcass (CG) gains, the groups of organs and visceras, head-feet- tail, blood and leather weights, carcass length, dressing percentage expressed as a function of live weight (DPLW) and empty body weight (DPEBW), yield of prime cuts: hindquarter, whole shoulder, spare ribs, whole rump, and pistol style cut, percentage of muscle (MP), fat (FP), and bone (BP) and quantity of muscle (MC), fat (FC) and bone (BC) in the carcass; loin eye area, muscle:bone and fat:muscle ratios were evaluated in a experiment conducted in the Department of Animal Science of Federal University of Viçosa. Forty five crossbreed intact males F1 Limousin X Nellore, with initial average live weight of 330 kg and age of 14 months, were used. Five animals were slaughtered in the beginning of the experiment and the remaining animals were randomly distributed in a factorial arrangement 2 x 5, with different dietary levels of concentrate (25,0; 37,5; 50,0; 62,5 and 75,0% in the dry matter) and two forms of counterbalancing. The animals were fed “ad libitum” until the preestablished weight of 500 kg. Coast- cross (Cynodon dactylon) grass hay was used. With exception for DPEBW, the two forms of counterbalancing were result in equal performance. DMI, in kg/day, %LW and gDM/Kg0,75, showed quadratic answer, estimating maximum values of 8,04 kg DM, 1,99%LW and 89,22 gDM/Kg0,75 for the concentrate levels of 41,42; 36,71 and 37,96%, respectively. The FGR, NDFI and FD decreased linearly in function of the dietary levels of concentrate. LWG and CG showed quadratic answer, estimating maximum values of 1,16 and 0,81 kg for 61,11 and 64,47% of concentrate, respectively. EBWG increased linearly in function of the dietary levels. For the DPLW, there was increasing linear answer, as soon as the level of concentrate in the rations increased and DPEBW, was not influenced by the levels. Cuts dressing percentage, MP, FP, BC and MC did not answers to the increase of concentrate in the rations. BP was decreasing linear answer and FC, had increasing linear answer, as soon as the level of concentrate in the rations increased. The other parameters were not influenced by the increasing levels of concentrate.

Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Daniel Gustavo Mansan Gordo / Banca: Lenira El Faro Zadra / Banca: Ricardo Vieira Ventura / Banca: Danisio Prado Munari / Banca: Gerardo Alves Fernandes Júnior / Resumo: O melhoramento genético animal visa melhorar a produtividade econômica das futuras gerações de espécies domésticas por meio da seleção. A maioria das características de interesse econômico na pecuária é de expressão quantitativa e complexa, isto é, são influenciadas por vários genes e afetadas por fatores ambientais. As análises estatísticas de informações de fenótipo e pedigree permite estimar os valores genéticos dos candidatos à seleção com base no modelo infinitesimal. Uma grande quantidade de dados genômicos está atualmente disponível para a identificação e seleção de indivíduos geneticamente superiores com o potencial de aumentar a acurácia de predição dos valores genéticos e, portanto, a eficiência dos programas de melhoramento genético animal. Vários estudos têm sido conduzidos com o objetivo de identificar metodologias apropriadas para raças e características específicas, o que resultará em estimativas de valores genéticos genômicos (GEBVs) mais acurados. Portanto, o objetivo deste estudo foi verificar a possibilidade de aplicação de modelos semiparamétricos para a seleção genômica e comparar a habilidade de predição com os modelos paramétricos para dados reais (características de carcaça, qualidade da carne, crescimento e reprodutiva) e simulados. As informações fenotípicas e de pedigree utilizadas foram fornecidas por onze fazendas pertencentes a quatro programas de melhoramento genético animal. Para as características de carcaça e qualidade da carne, o banco de da... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Animal breeding aims to improve economic productivity of future generations of domestic species through selection. Most of the traits of economic interest in livestock have a complex and quantitative expression i.e. are influenced by a large number of genes and affected by environmental factors. Statistical analysis of phenotypes and pedigree information allows estimating the breeding values of the selection candidates based on infinitesimal model. A large amount of genomic data is now available for the identification and selection of genetically superior individuals with the potential to increase the accuracy of prediction of genetic values and thus, the efficiency of animal breeding programs. Numerous studies have been conducted in order to identify appropriate methodologies to specific breeds and traits, which will result in more accurate genomic estimated breeding values (GEBVs). Therefore, the objective of this study was to verify the possibility of applying semi-parametric models for genomic selection and to compare their ability of prediction with those of parametric models for real (carcass, meat quality, growth and reproductive traits) and simulated data. The phenotypic and pedigree information used were provided by farms belonging to four animal breeding programs which represent eleven farms. For carcass and meat quality traits, the data set contained 3,643 records for rib eye area (REA), 3,619 records for backfat thickness (BFT), 3,670 records for meat tenderness (... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by RAFAEL ESPIGOLAN (espigolan@yahoo.com.br) on 2017-03-17T22:04:14Z No. of bitstreams: 1 Tese_Rafael_Espigolan.pdf: 1532864 bytes, checksum: c79ad7471b25137c47529f25762a83a2 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2017-03-22T12:50:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 espigolan_r_dr_jabo.pdf: 1532864 bytes, checksum: c79ad7471b25137c47529f25762a83a2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-22T12:50:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 espigolan_r_dr_jabo.pdf: 1532864 bytes, checksum: c79ad7471b25137c47529f25762a83a2 (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O melhoramento genético animal visa melhorar a produtividade econômica das futuras gerações de espécies domésticas por meio da seleção. A maioria das características de interesse econômico na pecuária é de expressão quantitativa e complexa, isto é, são influenciadas por vários genes e afetadas por fatores ambientais. As análises estatísticas de informações de fenótipo e pedigree permite estimar os valores genéticos dos candidatos à seleção com base no modelo infinitesimal. Uma grande quantidade de dados genômicos está atualmente disponível para a identificação e seleção de indivíduos geneticamente superiores com o potencial de aumentar a acurácia de predição dos valores genéticos e, portanto, a eficiência dos programas de melhoramento genético animal. Vários estudos têm sido conduzidos com o objetivo de identificar metodologias apropriadas para raças e características específicas, o que resultará em estimativas de valores genéticos genômicos (GEBVs) mais acurados. Portanto, o objetivo deste estudo foi verificar a possibilidade de aplicação de modelos semiparamétricos para a seleção genômica e comparar a habilidade de predição com os modelos paramétricos para dados reais (características de carcaça, qualidade da carne, crescimento e reprodutiva) e simulados. As informações fenotípicas e de pedigree utilizadas foram fornecidas por onze fazendas pertencentes a quatro programas de melhoramento genético animal. Para as características de carcaça e qualidade da carne, o banco de dados continha 3.643 registros para área de olho de lombo (REA), 3.619 registros para espessura de gordura (BFT), 3.670 registros para maciez da carne (TEN) e 3.378 observações para peso de carcaça quente (HCW). Um total de 825.364 registros para peso ao sobreano (YW) e 166.398 para idade ao primeiro parto (AFC) foi utilizado para as características de crescimento e reprodutiva. Genótipos de 2.710, 2.656, 2.749, 2.495, 4.455 e 1.760 animais para REA, BFT, TEN, HCW, YW e AFC foram disponibilizados, respectivamente. Após o controle de qualidade, restaram dados de, aproximadamente, 450.000 polimorfismos de base única (SNP). Os modelos de análise utilizados foram BLUP genômico (GBLUP), single-step GBLUP (ssGBLUP), Bayesian LASSO (BL) e as abordagens semiparamétricas Reproducing Kernel Hilbert Spaces (RKHS) e Kernel Averaging (KA). Para cada característica foi realizada uma validação cruzada composta por cinco “folds” e replicada aleatoriamente trinta vezes. Os modelos estatísticos foram comparados em termos do erro do quadrado médio (MSE) e acurácia de predição (ACC). Os valores de ACC variaram de 0,39 a 0,40 (REA), 0,38 a 0,41 (BFT), 0,23 a 0,28 (TEN), 0,33 a 0,35 (HCW), 0,36 a 0,51 (YW) e 0,49 a 0,56 (AFC). Para todas as características, os modelos GBLUP e BL apresentaram acurácias de predição similares. Para REA, BFT e HCW, todos os modelos apresentaram ACC similares, entretanto a regressão RKHS obteve o melhor ajuste comparado ao KA. Para características com maior quantidade de registros fenotípicos comparada ao número de animais genotipados (YW e AFC) o modelo ssGBLUP é indicado. Considerando o desempenho geral, para todas as características estudadas, a regressão RKHS é, particularmente, uma alternativa interessante para a aplicação na seleção genômica, especialmente para características de baixa herdabilidade. No estudo de simulação, genótipos, pedigree e fenótipos para quatro características (A, B, C e D) foram simulados utilizando valores de herdabilidade baseados nos obtidos com os dados reais (0,09, 0,12, 0,36 e 0,39 para cada característica, respectivamente). O genoma simulado consistiu de 735.293 marcadores e 1.000 QTLs distribuídos aleatoriamente por 29 pares de autossomos, com comprimento variando de 40 a 146 centimorgans (cM), totalizando 2.333 cM. Assumiu-se que os QTLs explicavam 100% da variação genética. Considerando as frequências do alelo menor maiores ou iguais a 0,01, um total de 430.000 marcadores foram selecionados aleatoriamente. Os fenótipos foram obtidos pela soma dos resíduos (aleatoriamente amostrados de uma distribuição normal com média igual a zero) aos valores genéticos verdadeiros, e todo o processo de simulação foi replicado 10 vezes. A ACC foi calculada por meio da correlação entre o valor genético genômico estimado e o valor genético verdadeiro, simulados da 12a a 15a geração. A média do desequilíbrio de ligação, medido entre os pares de marcadores adjacentes para todas as características simuladas foi de 0,21 para as gerações recentes (12a, 13a e 14a), e 0,22 para a 15a geração. A ACC para as características simuladas A, B, C e D variou de 0,43 a 0,44, 0,47 a 0,48, 0,80 a 0,82 e 0,72 a 0,73, respectivamente. Diferentes metodologias de seleção genômica implementadas neste estudo mostraram valores similares de acurácia de predição, e o método mais adequado é dependente da característica explorada. Em geral, as regressões RKHS obtiveram melhor desempenho em termos de ACC com menor valor de MSE em comparação com os outros modelos. / Animal breeding aims to improve economic productivity of future generations of domestic species through selection. Most of the traits of economic interest in livestock have a complex and quantitative expression i.e. are influenced by a large number of genes and affected by environmental factors. Statistical analysis of phenotypes and pedigree information allows estimating the breeding values of the selection candidates based on infinitesimal model. A large amount of genomic data is now available for the identification and selection of genetically superior individuals with the potential to increase the accuracy of prediction of genetic values and thus, the efficiency of animal breeding programs. Numerous studies have been conducted in order to identify appropriate methodologies to specific breeds and traits, which will result in more accurate genomic estimated breeding values (GEBVs). Therefore, the objective of this study was to verify the possibility of applying semi-parametric models for genomic selection and to compare their ability of prediction with those of parametric models for real (carcass, meat quality, growth and reproductive traits) and simulated data. The phenotypic and pedigree information used were provided by farms belonging to four animal breeding programs which represent eleven farms. For carcass and meat quality traits, the data set contained 3,643 records for rib eye area (REA), 3,619 records for backfat thickness (BFT), 3,670 records for meat tenderness (TEN) and 3,378 observations for hot carcass weight (HCW). A total of 825,364 records for yearling weight (YW) and 166,398 for age at first calving (AFC) were used as growth and reproductive traits of Nelore cattle. Genotypes of 2,710, 2,656, 2,749, 2,495, 4,455 and 1,760 animals were available for REA, BFT, TEN, HCW, YW and AFC, respectively. After quality control, approximately 450,000 single nucleotide polymorphisms (SNP) remained. Methods of analysis were genomic BLUP (GBLUP), single-step GBLUP (ssGBLUP), Bayesian LASSO (BL) and the semi-parametric approaches Reproducing Kernel Hilbert Spaces (RKHS) regression and Kernel Averaging (KA). A five-fold cross-validation with thirty random replicates was carried out and models were compared in terms of their prediction mean squared error (MSE) and accuracy of prediction (ACC). The ACC ranged from 0.39 to 0.40 (REA), 0.38 to 0.41 (BFT), 0.23 to 0.28 (TEN), 0.33 to 0.35 (HCW), 0.36 to 0.51 (YW) and 0.49 to 0.56 (AFC). For all traits, the GBLUP and BL models showed very similar prediction accuracies. For REA, BFT and HCW, models provided similar prediction accuracies, however RKHS regression had the best fit across traits considering multiple-step models and compared to KA. For traits which have a higher number of animals with phenotypes compared to the number of those with genotypes (YW and AFC), the ssGBLUP is indicated. Judged by overall performance, across all traits, the RKHS regression is particularly appealing for application in genomic selection, especially for low heritability traits. Simulated genotypes, pedigree, and phenotypes for four traits A, B, C and D were obtained using heritabilities based on real data (0.09, 0.12, 0.36 and 0.39 for each trait, respectively). The simulated genome consisted of 735,293 markers and 1,000 QTLs randomly distributed over 29 pairs of autosomes, with length varying from 40 to 146 centimorgans (cM), totaling 2,333 cM. It was assumed that QTLs explained 100% of genetic variance. Considering Minor Allele Frequencies greater or equal to 0.01, a total of 430,000 markers were randomly selected. The phenotypes were generated by adding residuals, randomly drawn from a normal distribution with mean equal to zero, to the true breeding values and all simulation process was replicated 10 times. ACC was quantified using correlations between the predicted genomic breeding value and true breeding values simulated for the generations of 12 to 15. The average linkage disequilibrium, measured between pairs of adjacent markers for all simulated traits was 0.21 for recent generations (12, 13 and 14), and 0.22 for generation 15. The ACC for simulated traits A, B, C and D ranged from 0.43 to 0.44, 0.47 to 0.48, 0.80 to 0.82 and 0.72 to 0.73, respectively. Different genomic selection methodologies implemented in this study showed similar accuracies of prediction, and the optimal method was sometimes trait dependent. In general, RKHS regressions were preferable in terms of ACC and provided smallest MSE estimates compared to other models. / FAPESP: 2014/00779-0 / FAPESP: 2015/13084-3

Este trabalho avaliou a utilização de níveis crescentes de Nutri Energia® (T0=0; T1=10; T2=20 e T3=30), em substituição a polpa cítrica (35; 23; 12 e 0), ocasionando níveis crescentes de gordura (1,5; 3,7; 5,9 e 8,0%), em dietas para cordeiros, em recria e terminação, no sistema de confinamento, sobre o desempenho produtivo, digestibilidade dos nutrientes, ambiência e características de carcaça. O experimento foi realizado na FZEA/USP. Foram utilizados 40 cordeiros machos Suffolk com 60 dias de idade e 22 kg em média, que foram abatidos após um período experimental de 77 dias. Todos os tratamentos foram isoproteícos e isoenergéticos. A partir da inclusão de 10% de Nutri Energia® na dieta, a ingestão de matéria seca, a digestibilidade da fibra em detergente ácido e neutro diminuíram; a partir de 20%, o ganho de peso e a digestibilidade de fibra bruta diminuíram e a partir de 30% a eficiência alimentar e a digestibilidade da proteína bruta diminuíram. Não foi significativa (P>0,05), a variação da digestibilidade do extrato etéreo e do extrativo não nitrogenado. Assim observamos que o uso de Nutri Energia® em dietas para cordeiros em terminação em confinamento, tem seu limite de inclusão em torno de 10%, para alcançar boas características de carcaça e desempenho animal. Elevando o nível de inclusão acima de 10%, obtém-se alto teor de extrato etéreo, o que irá prejudicar o desempenho produtivo dos animais. / Alternative sources of energy for feedlot animals have been tested to improve the animal performance and decrease the production expenses. In this way, this research evaluated the use of increasing Nutri Energy® levels (T0=0; T1=10; T2=20 e T3=30) in the citric pulp substitution. (35; 23; 12 and 0%) as the main energy source, causing an increasing fat levels (1,5; 3,7; 5,9 e 8,0) in lambs diet during rearing and finishing phases in feedlot system, over the performance, nutrients digestibility , environment and carcass characteristics. The experiment was conducted in FZEA/USP. 40 Suffolk breed male lambs were used with 60 day old and an average of 22Kg weight that were slaughtered after a 52 day experimental period. All the treatments were isoprotein and isoenergy. Starting from the inclusion of 10% of Nutri Energy® in the diet, the ingestion of dry matter, the fiber\'s digestibility in acid and neutral detergent decreased; starting from 20%, the weight earnings and the digestibility of rude fiber decreased; starting from 30% the alimentary efficiency and the digestibility of the rude protein decreased. It was not significant (P>0,05), the digestibility variation of ethereal extract and of the extractive no nitrogen. Like this, we observed that the use of Nutri Energy® in diets for lambs, in ending in confinement, it inclusion limit around 10%, to reach good carcass characteristics and animal acting. Elevating the inclusion level above 10%, it is obtained high tenor of ethereal extract, what will harm the productive acting of the animals.

Este trabalho avaliou a utilização de níveis crescentes de Nutri Energia® (T0=0; T1=10; T2=20 e T3=30), em substituição a polpa cítrica (35; 23; 12 e 0), ocasionando níveis crescentes de gordura (1,5; 3,7; 5,9 e 8,0%), em dietas para cordeiros, em recria e terminação, no sistema de confinamento, sobre o desempenho produtivo, digestibilidade dos nutrientes, ambiência e características de carcaça. O experimento foi realizado na FZEA/USP. Foram utilizados 40 cordeiros machos Suffolk com 60 dias de idade e 22 kg em média, que foram abatidos após um período experimental de 77 dias. Todos os tratamentos foram isoproteícos e isoenergéticos. A partir da inclusão de 10% de Nutri Energia® na dieta, a ingestão de matéria seca, a digestibilidade da fibra em detergente ácido e neutro diminuíram; a partir de 20%, o ganho de peso e a digestibilidade de fibra bruta diminuíram e a partir de 30% a eficiência alimentar e a digestibilidade da proteína bruta diminuíram. Não foi significativa (P>0,05), a variação da digestibilidade do extrato etéreo e do extrativo não nitrogenado. Assim observamos que o uso de Nutri Energia® em dietas para cordeiros em terminação em confinamento, tem seu limite de inclusão em torno de 10%, para alcançar boas características de carcaça e desempenho animal. Elevando o nível de inclusão acima de 10%, obtém-se alto teor de extrato etéreo, o que irá prejudicar o desempenho produtivo dos animais. / Alternative sources of energy for feedlot animals have been tested to improve the animal performance and decrease the production expenses. In this way, this research evaluated the use of increasing Nutri Energy® levels (T0=0; T1=10; T2=20 e T3=30) in the citric pulp substitution. (35; 23; 12 and 0%) as the main energy source, causing an increasing fat levels (1,5; 3,7; 5,9 e 8,0) in lambs diet during rearing and finishing phases in feedlot system, over the performance, nutrients digestibility , environment and carcass characteristics. The experiment was conducted in FZEA/USP. 40 Suffolk breed male lambs were used with 60 day old and an average of 22Kg weight that were slaughtered after a 52 day experimental period. All the treatments were isoprotein and isoenergy. Starting from the inclusion of 10% of Nutri Energy® in the diet, the ingestion of dry matter, the fiber\'s digestibility in acid and neutral detergent decreased; starting from 20%, the weight earnings and the digestibility of rude fiber decreased; starting from 30% the alimentary efficiency and the digestibility of the rude protein decreased. It was not significant (P>0,05), the digestibility variation of ethereal extract and of the extractive no nitrogen. Like this, we observed that the use of Nutri Energy® in diets for lambs, in ending in confinement, it inclusion limit around 10%, to reach good carcass characteristics and animal acting. Elevating the inclusion level above 10%, it is obtained high tenor of ethereal extract, what will harm the productive acting of the animals.

Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Resumo: Registros de características quantitativas e informações genotípicas cole- tadas para cada animal são utilizados para identificar regiões do genoma associadas à variação fenotípica. No entanto, essas investigações são, geralmente, realizadas com base em testes estatísticos de correlação ou associação, que não implicam em causalidade. A fim de explorar amplamente essas informações, métodos poderosos de inferência causal foram desenvolvidos para estimar os efeitos causais entre as variáveis estudadas. Apesar do progresso significativo neste campo, inferir os efeitos causais entre variáveis aleatórias contínuas ainda é um desafio e poucos estudos têm explorado as relações causais em genética quantitativa e no melhoramento animal. Neste contexto, dois estudos foram realizados com os seguintes objetivos: 1) Buscar as relações causais entre as características de carcaça e qualidade de carne usando um modelo de equação estrutural (MEE), sob modelo linear misto em bovinos da raça Nelore, e 2) Reconstruir redes de genes-fenótipos e realizar análise de rede causal por meio da integração de dados fenotípicos, genotípicos e transcriptômicos em bovinos da raça Nelore. Para o primeiro estudo, um total de 4.479 animais com informação fenotípica para o peso da carcaça quente (PCQ), área de olho lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), força de cisalhamento (FC) e marmoreio (MAR) foram usados. Os animais foram genotipados usando os painéis BovineHD Bead- Chip e GeneSeek Genomic Pro... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Quantitative traits and genotypes information have been collected for each animal and used to identify genome regions related to phenotypes variation. However, these investigations are, usually, performed based on correlation or association statistical tests, which do not imply in causation. In order to fully explore these information, powerful causal inference methods have been developed to estimate causal effects among the variables under study. Despite significant progress in this field infer causal effect among random variables remains a challenge and some few studies have explored causal relationships in quantitative genetics and animal breeding. In this context, two studies were performed with the following objectives: 1) Search for the causal relationship among carcass yield and meat quality traits using a structural equation model (SEM), under linear mixed model context in Nelore cattle, and 2) Reconstruct gene-phenotype networks and perform causal network analysis through the integrating of phenotypic, genotypic, and transcriptomic data in Nelore cattle. For the first study, a total of 4,479 animals with phenotypic information for hot carcass weight (HCW), longissimus muscle area (LMA), backfat thickness (BF), Warner-Bratzler shear force (WBSF), and marbling score (MB) traits were used. Animals were genotyped using BovineHD BeadChip and GeneSeek Genomic Profiler Indicus HD - GGP75Ki. For causal inference using SEM a multistep procedure methodology was used as follow:... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-05T19:36:34Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 613046 bytes, checksum: 69755ddb1c7cf5d4131bbf4a7ac18473 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-05T19:36:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 613046 bytes, checksum: 69755ddb1c7cf5d4131bbf4a7ac18473 (MD5) Previous issue date: 2001-03-05 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Foram utilizados 40 novilhos Nelore inteiros, com peso vivo médio inicial de 240 kg, sendo quatro novilhos de referência e quatro alimentados para mantença, o restante distribuído em oito tratamentos, com quatro diferentes níveis de concentrado nas dietas (20, 40, 60 e 80%) e dois níveis de proteína bruta (PB), (15 e 18%). As fases de recria e de engorda foram avaliadas até 360 e 450 kg de peso vivo, respectivamente. O volumoso utilizado foi feno de capim Tifton (Cynodon dactylon). Avaliaram-se os consumos dos nutrientes, os ganhos médios diários de peso vivo (GMD), de peso de corpo vazio (GMCPVZ) e de carcaça (GC) e a conversão alimentar (CA). Após o abate, foram determinados os rendimentos de carcaça, as porcentagens dos cortes básicos, o comprimento de carcaça, a área de olho de lombo, a espessura de gordura subcutânea, as composições física e química da carcaça. Foram selecionadas oito meia- carcaças, uma de cada tratamento com 15% de PB, para a realização de uma dissecação completa e determinação das composições física e química da carcaça, que foram seção HH. cada órgãos e De vísceras. As comparadas animal com abatido, a foram composição obtida da pesados todos os amostras de todas as partes do corpo do animal foram liofilizadas e determinados os teores de nitrogênio total, extrato etéreo, macrominerais e aminoácidos. Os conteúdos de proteína, gordura, energia, macrominerais e aminoácidos retidos no corpo foram estimados por meio de equações de regressão do logaritmo do conteúdo corporal de proteína, gordura, energia, macrominerais ou aminoácidos em função do logaritmo do PCVZ. Obtiveram-se as exigências líquidas de proteína, energia, macrominerais ou aminoácidos, para ganho de 1 kg de PCVZ, a partir de equação Y’ = b. 10 a . X b- , sendo “a” e “b” o intercepto e o coeficiente de regressão das equações de predição dos conteúdos corporais dos nutrientes. As exigências líquidas de energia para mantença (ELm) foram estimadas como o anti-log do intercepto da equação obtida pela regressão linear entre o logaritmo da produção de calor (PC) e o consumo de energia metabolizável. As eficiências de utilização da EM (EUEM) para mantença (k m ) e ganho de peso (k f ) foram estimadas a partir da relação entre os teores de energia líquida, para mantença ou ganho, respectivamente, em função da EM da dieta. Foram tirados dados parciais ou totais de vários trabalhos sobre exigências nutricionais de bovinos. Em todos os experimentos, foi usada a técnica do abate comparativo, abate de uma amostra de animais referência e determinação da composição do corpo vazio. A determinação dos teores de extrato etéreo, proteína e macrominerais foi realizada segundo métodos tradicionais. Para estudo das exigências, os animais foram agrupados em categorias raciais, como: Zebuínos, F1 (E x Z), Mestiços leiteiros e Holandeses. As determinações das exigências nutricionais e das EUEM foram realizadas de forma semelhante ao citado anteriormente. O consumo de MS foi influenciado (P<0,01) pelo nível de concentrado na fase de recria, com consumo máximo de 2,59% PV com 42,60% de concentrado e na fase de engorda, apresentou média de 1,80% PV. O aumento do teor de proteína bruta da dieta, de 15 para 18%, aumentou (P<0,01) o consumo de MS, na fase de recria, mas não influenciou o consumo na fase de engorda. Os níveis de concentrado das dietas não influenciaram (P>0,01) os consumos de MO, PB e NDT, nas fases de recria e de engorda. Os GMD, GMPCVZ, GC e CA não foram influenciados (P>0,01) pelos níveis de concentrado da dieta. O teor de PB da dieta influenciou positivamente (P< 0,01) o GMD nas duas fases. Na fase de recria, os níveis de concentrado da dieta não influenciaram (P> 0,01) os rendimentos xde carcaça, já na fase de engorda, o aumento da inclusão de concentrado na dieta aumentou linearmente (P< 0,01) o rendimento de carcaça em relação ao PV. Não foi verificado efeito dos níveis de concentrado e dos teores de PB da dieta (P> 0,01) sobre os cortes básicos estudados. Foram ajustadas equações para estimar a porcentagem de lipídios e de água na carcaça, a partir da porcentagem de lipídios na seção HH: % lipídios na carcaça = 1,5113 + 0,6832*X, r 2 = 0,752; % água na carcaça = 71,8989 - 0,6006*X, r 2 = 0,864; onde, X = % de lipídio na seção HH. Os teores de PB influenciaram positivamente (P<0,01) apenas os pesos absolutos e relativos dos rins, pulmões e fígado. Os pesos relativos do rúmen+retículo, estômagos e trato gastrintestinal apresentaram comportamento linear decrescente com o aumento dos níveis de concentrado, não ocorrendo nenhum efeito dos níveis de concentrado e de PB sobre a maioria dos órgãos e vísceras. As exigências de energia líquida para ganho de peso de zebuínos não- castrados podem ser obtidas pela equação: ELg = 0,0413 x PCVZ 0,75 x GDPCVZ 0,978 . A ELm foi de 83,70 kcal/PCVZ 0,75 , para animais Nelore não- castrados. Foi obtida a seguinte equação para estimativa da proteína retida (PR): PR = - 39,0169 + 200,638 GMD + 0,4166 ER. A eficiência de utilização da EM para mantença (km) foi calculada em 0,63. E as eficiências de utilização da EM para ganho (kf) foram estimadas em 0,30; 0,35; 0,38 e 0,43, respectivamente, para as concentrações de EM da dieta de 2,65; 2,84; 2,92 e 2,90 Mcal/kg de MS. Houve diminuição nas concentrações dos cinco macroelementos estudados no corpo vazio e no ganho de corpo vazio, com a elevação do peso vivo. As relações g Ca/100g de proteína retida e g P/100g de proteína retida foram iguais a 6,44 e 4,78. As exigências líquidas para ganho de aminoácidos diminuíram com o aumento do peso vivo do animal. A exigência total de aminoácidos metabolizáveis, expresso em % do total de aminoácidos essenciais, não variaram muito com o aumento do peso vivo e os valores médios foram 2,66; 15,11; 6,09; 8,64; 9,26; 18,48; 8,33; 12,01 e 19,41 para metionina, lisina, histidina, fenilalanina, treonina, leucina, isoleucina, valina e arginina, respectivamente. A relação ganho de PCVZ/ganho de peso vivo em jejum (GPVJ) dos animais zebuínos, F1, mestiços leiteiros e Holandeses foi 0,96; 1,00; 0,94 e 0,86, respectivamente. As equações obtidas para estimativa da PR, em função do GPVJ e da energia retida (ER) foram: PR = - 17,6968 + 192,31 GPVJ – 3,8441 xiER, para animais zebuínos e PR = 31,4045 + 107,039 GPVJ + 5,632 ER, para F1. As energias líquidas para ganho (ELg) podem ser obtidas pelas equações ELg = 0,0435 * PCVZ 0,75 * GDPCVZ 0,8241 , para animais zebuínos e ELg = 0,0377 * PCVZ 0,75 * GDPCVZ 1,0991 , para animais F1. A média dos valores de ELm para zebuínos, F1, mestiços leiteiros e Holandeses foram 71,30; 70,77; 79,65 e 88,97, respectivamente. As EUEM para mantença (km) e ganho (kf), variaram de 0,65 a 0,63 e de 0,25 a 0,37, respectivamente, para dietas com concentração de EM variando de 2,2 a 2,7 Mcal/kg de matéria seca. A exigência de P foi superior e as de Na e K foram inferiores às recomendações do NRC (1996). As exigências de Ca e Mg foram semelhantes às do NRC (1996). / Forty Nellore bulls, with 240 kg initial LW, were used. Four were used as reference bulls, four were fed for maintenance and the remaining were distributed to eight treatments, with four different concentrate levels in the diets (20; 40; 60 and 80%) and two crude protein (CP) levels (15 and 18%). The growing phase was evaluated up to 360 kg of LW, and the fattening phase up to 450 kg of LW. The Tyfton grass hay (Cynodon dactylon) was the forage used. The nutrients intakes, the average LW (LWG), empty body (EBWG) and carcass (CG) gains and the feed:gain conversion (FC) were determined. After the slaughter, the carcass dressing percentage, the basic cuts percentages, the carcass length, the loin eye area, the subcutaneous fat thickness, and the physical and chemical carcass compositions were evaluated. Eight half-carcasses were selected for the accomplishment of a complete dissection and the determination of the physical and chemical carcass compositions, which were compared with the composition of the HH section. From each slaughtered animal, all the organs and visceral and total were weighted. nitrogen, ether All animal body parts were freeze dried extract, macrominerals and amino acids concentrations were determined. The protein, fat, energy, macrominerals and xiiiamino acids contents retained in the body were estimated by regression equations of the logarithm of protein, fat, energy, macrominerals or amino acids body content, in function of the logarithm of empty body weight (EBW). The net protein, energy, macrominerals and amino acids requirements, for gains of 1 kg EBW, were determined by the equation Y = b. 10 a . X b-1 , being a and b intercept and regression coefficient, respectively, of the prediction equations of the nutrients contents in the body. Net energy requirement for maintenance (NEm) was estimated as the intercept anti-log of the equation obtained by linear regression among the logarithm of heat production and the metabolizable energy intake. The ME efficiencies of utilization (MEEU) for maintenance (km) and for weight gain (kf) were calculated from the relationship among the net energy concentration, for maintenance or gain, respectively, in function of the ME of the diet. Partial or total data, from several works, on nutritional requirements of bovine, were utilized. In all the experiments, the comparative slaughter technique was used, with the slaughter of a sample of the reference animals and the determination of the empty body composition. The determination of the ethereal extract, protein and macrominerals contents was accomplished according to traditional methods. To study the nutrients requirements, the animals were grouped in breed categories, as: Zebu, F1 (E x Z), Dairy crossbreds and Holstein. The nutrients requirements and the MEEU determinations were realized the same way as cited before. The dry matter intake was influenced (P>0.01) by the concentrate level, in the growing phase, with maximum consumption of 2.59% LW with 42.60% of concentrate, and, in the fattening phase, it presented a mean value of 1.80% LW. The increase in the diet CP level, from 15 to 18%, caused a significant (P<0,01) increase in the growing phase DMI, but it did not influence the consumption in the fattening phase. The diets concentrate levels did not influence (P>0,01) the OM, CP and TND intakes, in the growing and fattening phases. The LWG, EBWG, CG and FC were not influenced (P>0.01) by the concentrate levels of the diet. The diet CP level had a positive influence (P<0.01) on the LWG in both phases. In the growing phase, the concentrate levels of the diet did not influence (P>0.01) the carcass dressing percentage; in the fattening phase, the increase in the diet concentrate inclusion caused a linear increase (P<0.01) in the carcass dressing percentage in relation to the LW. It was not verified any effect of the concentrate xivlevel and the CP level (P>0.01) on the studied basic cuts. Equations were built to estimate the carcass lipids and water percentages, using the lipids percentage in the HH section: carcass % lipids = 1.5113 + 0.6832*X, r 2 = 0.752; carcass % water = 71.8989 – 0.6006*X, r 2 = 0.864; where, X = lipid % in the HH section. The CP level had a positive influence (P<0.01) only on the kidneys, lungs and liver absolute and relative weights. The rumen+reticulum, stomaches and GIT relative weights presented a decreasing linear behavior with the increase of the concentrate levels, but there was no effect of the concentrate and CP levels on the major of the organs and visceral. The net energy requirement for weight gain of zebu bulls can be obtained by the equation: NEg = 0.0413 x EBW 0.75 x gain of EBW 0.978 . The NEm for these animals was 83.70 kcal/EBW 0.75 . The following equation was obtained to estimate the retained protein (RP): RP = - 39.0169 + 200.638 gain of EBW + 0.4166 RE. The MEEU for maintenance (km) was 0.63 and the MEEU for gain (kf) were 0.30; 0.35; 0.38 and 0.43, respectively, for diet ME concentrations of 2.65; 2.84; 2.92 and 2.90 Mcal/kg of DM. There was a decrease in the concentrations of the five macrominerals studied in the empty body and in the empty body gain, with the elevation of the live weight. The relationships g Ca/100g of retained protein and g P/100g of retained protein were 6.44 and 4.78, respectively. The net amino acids requirements for gain decreased with the increase of the live weight of the animal. The total metabolizable amino acids requirements, expressed in percentage of the total essential amino acids, did not vary a lot as the live weight increased, and the mean values were 2.66; 15.11; 6.09; 8.64; 9.26; 18.48; 8.33; 12.01 and 19.41 for methionine, lysine, histidine, phenylalanine, threonine, leucine, isoleucine, valine and arginine, respectively. The zebu, F1, dairy crossbred and Holstein animals EBW gain/BW gain relationship were 0.96, 1.00, 0.94 and 0.86, respectively. The equations to estimate the RP, in function of BW gain (BWG) and retained energy (RE), were: RP = - 17.6968 + 192.31 BWG – 3.8441 RE, for zebu and RP = 31.4045 + 107.039 BWG + 5.632 RE, for F1 animals. The net energy for gain (NEg) can be obtained by the equations NEg = 0.0435 * EBW 0.75 * EBWG 0.8241 , for zebu animals, and NEg = 0.0377 * EBW 0.75 * EBWG 1.0991 , for F1 animals. The NEm mean values for zebu, F1, dairy crossbred and Holstein were 71.30; 70.77; 79.65 and 88.97, respectively. The MEEU for maintenance (km) and for gain (kf) varied from 0.65 to 0.63 and from 0.25 to 0.37, respectively, for diets with ME concentration varying from 2.2 to 2.7 Mcal/kg of dry matter. The P requirement was superior and xvNa and K were inferior to the NRC (1996) recommendations. The Ca and Mg requirements were similar to that of NRC (1996).