Orientador : Prof. Dr. Fábio Meurer / Coorientador : Profª. Drª. Lilian Carolina Rosa da Silva / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia. Defesa: Curitiba, 29/02/2016 / Inclui referências : f. 17-21;37-40;52-56 / Area de concentração: Zoologia / Resumo:O crescimento na produção mundial de biodiesel tem gerado um grande excedente de glicerina bruta, seu principal subproduto. No Brasil, a produção de peixes já superou a pesca extrativista, com predominância da espécie tilápia do Nilo. Para tentar mitigar o impacto ambiental causado pela introdução de espécies exóticas é necessário estimular a criação das nativas, nas mesmas bacias hidrográficas em que ocorrem. No intuito de aproximar as duas cadeias produtivas e conhecer as vantagens e desvantagens de sua utilização, a presente tese teve como objetivo avaliar o efeito da inclusão da glicerina bruta nas dietas de juvenis de pacu (Piaractus mesopotamicus), curimbatá (Prochilodus lineatus) e jundiá (Rhamdia quelen), todas espécies nativas da bacia do rio Paraná. Inicialmente, por meio do método indireto de coleta de fezes e uso do marcador inerte óxido de cromo III (Cr2O3) na concentração de 0,1% da dieta, foi demonstrado que a energia bruta fornecida pela glicerina bruta é bem aproveitada pelo jundiá e pelo pacu, haja vista os valores dos coeficientes de digestibilidade aparente obtidos, de 0,89 e 0,97, respectivamente, sugerindo que este composto fornece energia digestível superior a de outros alimentos energéticos convencionalmente utilizados nas dietas de ambas as espécies. Posteriormente, foi avaliado o efeito da substituição do milho pela glicerina bruta na dieta de juvenis de jundiá. Para tanto, 432 espécimes de jundiá R. quelen (peso inicial de 14,39 ± 3,46g) foram distribuídos em 24 caixas de fibra de vidro (1000 L) em um delineamento inteiramente ao acaso, com seis tratamentos e quatro repetições. Os tratamentos consistiram de dietas contendo seis níveis de substituição do milho pela glicerina bruta (0, 20, 40, 60, 80 e 100%), com base em suas energias digestíveis. Houve influência dos tratamentos (p<0,05) sobre a altura, rendimento de carcaça sem cabeça, rendimento de tronco limpo e conteúdo de gordura do corpo inteiro. Sobre a gordura corporal foi observado, ainda, efeito quadrático (y = 0,000213x2 - 0,03270x + 1,961; r2 = 0,71) da substituição, com a menor percentagem sendo estimada no nível de 76,76%. Concluiu-se que a substituição de 76,76% do milho pela glicerina bruta na dieta de jundiá promove menor teor de gordura na carcaça, sem afetar o crescimento, desempenho produtivo e os parâmetros bioquímicos do sangue de juvenis. Por fim, foi estudada a digestibilidade aparente e o efeito da inclusão da glicerina bruta sobre o crescimento de juvenis de curimbatá (P. lineatus). No ensaio de digestibilidade, foram coletadas fezes de 35 espécimes alimentados com uma dieta referência e uma dieta-teste constituída por 71,1% de uma dieta referência e 28,9% de glicerina bruta, tendo o Cr2O3 como marcador inerte. No experimento de inclusão, foram utilizados 750 juvenis (peso inicial de 18,71 ± 2,70 g), em um delineamento experimental inteiramente casualizado, com seis tratamentos (dietas com níveis de inclusão de glicerina bruta de 0, 4, 8, 12, 16 e 20%) e cinco repetições. Foi observado que o coeficiente de digestibilidade aparente da glicerina bruta para o curimbatá foi de 0,76, e ocorreu efeito dos tratamentos (p<0,05) sobre os parâmetros de crescimento peso final médio, comprimento total, comprimento padrão, altura e largura, e sobre os parâmetros de desempenho ganho de peso, conversão alimentar aparente e taxa de crescimento específico. Ocorreu efeito linear (p<0,01) das dietas sobre o peso final, comprimento total, ganho de peso e conversão alimentar. Em relação aos parâmetros bioquímicos do sangue, os níveis de glicerina afetaram (p<0,05) apenas a concentração plasmática de glicose e de triglicérides. A inclusão de 4% de glicerina bruta na dieta favoreceu o crescimento e o desempenho produtivo de curimbatá, não interferindo na sobrevivência e proporcionando suprimento energético para os juvenis. Desse modo, os resultados obtidos sugerem que a glicerina bruta derivada da produção de biodiesel pode ser utilizada como fonte de energia na alimentação de P. mesopotamicus, P. lineatus e R. quelen. Palavras-chave: Alimento alternativo. Characiformes. Glicerol. Piscicultura. Siluriformes. / Abstract: The growth in world production of biodiesel has generated a large surplus of crude glycerin, its main byproduct. In Brazil, the production of fish has already surpassed the extractive fishing, with predominance of Nile tilapia species. To try to mitigate the environmental impact caused by the introduction of exotic species is necessary to stimulate the farming of native fish in the same river basins in which they occur. In order to bring the two supply chains and know the advantages and disadvantages of their use, this thesis aimed to evaluate the effect of the inclusion of crude glycerin in diets of juvenile pacu (Piaractus mesopotamicus), curimbatá (Prochilodus lineatus), and jundiá (Rhamdia quelen), all native species of the Paraná river basin. Initially, through the indirect method of feces collection and use of inert marker chromium oxide III (Cr2O3) at a concentration of 0.1% of the diet, it was demonstrated that the gross energy supplied by crude glycerin is well used by jundiá and pacu, given the values of the apparent digestibility coefficients of 0.89 and 0.97, respectively, suggesting that this compound provides high digestible energy than other energy foods conventionally used in the diets of both species. Subsequently, it was evaluated the effect of corn replacement by crude glycerin in jundiá juveniles diets. Therefore, 432 specimens of jundiá R. quelen (initial weight of 14.39 ± 3,46g) were distributed in 24 fiberglass boxes (1000L) in a completely randomized design with six treatments and four replications. The treatments consisted of diets containing six levels of corn replacement by crude glycerin (0, 20, 40, 60, 80, and 100%), based on its digestible energy. There was influence of the treatments (p<0.05) on the height, headless gutted carcass yield, dressed out yield, and whole body fat content. On body fat was observed also quadratic effect (y = 0,000213x2 - 0,03270x + 1,961; r2 = 0.71) of replacement, with the lowest percentage being estimated at the level of 76.76%. It was concluded that the replacement of 76.76% of corn by crude glycerin in jundiá diet promotes low-fat on the body without affecting growth, productive performance and blood biochemical parameters of juveniles. Finally, it was studied the apparent digestibility and the effect of the inclusion of crude glycerin on the growth performance of juvenile curimbatá (P. lineatus). In the digestibility assay were collected feces from 35 specimens fed a reference diet and a test diet composed of 71.1% of a reference diet and 28.9% of crude glycerin, and Cr2O3 was an inert marker. In the inclusion experiment were used 750 juveniles (initial weight of 18.71 ± 2.70 g), in a completely randomized design with six treatments (diets with inclusion levels of crude glycerin of 0, 4, 8, 12 16, and 20%) and five replications. It was observed that the apparent digestibility coefficient of crude glycerin to curimbatá was 0.76 and there was effect of the treatments (p<0.05) on the growth average final weight, total length, standard length, height, and width parameters, and on the performance weight gain, feed conversion, and specific growth rate parameters. There was a linear effect (p<0.01) of diet on the final weight, total length, weight gain and feed conversion. Regarding the blood biochemical parameters, glycerine levels affected (p<0.05) only the plasma glucose and triglycerides concentration. The inclusion of 4% crude glycerin in the diet favored the growth and productive performance of curimbatá, not interfering with the survival and providing energy supply for juveniles. Thus, the results suggest that crude glycerin derived from biodiesel production can be used as an energy source in the feeding of P. mesopotamicus, P. lineatus, and R. quelen. Key-words: Alternative food. Characiformes. Glycerol. Fish farming. Siluriformes.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-21Bitstream added on 2014-06-13T19:39:32Z : No. of bitstreams: 1 tagliacollo_va_me_botib.pdf: 696657 bytes, checksum: 38fcfa7941eec57c79cee0e5fc106dc8 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / The subfamily Aphyocharacinae comprises the genera Aphyocharax, Prionobrama, Paragoniates, Phenagoniates, Leptagoniates, Xenagoniates, Rachoviscus, and Inpaichthys. This current arrangement based on a morphological analysis is congruent with most proposed morphological phylogenetic analyses, except for the inclusion of Rachoviscus and Inpaichthys which is tenuous and not always supported by data. In this current work the goal was to investigate the monophyly of the subfamily Aphyocharacinae and to recover relationships within it using molecular and morphological analyses. Using separate parsimony and Bayesian analyses of morphological, nuclear and mitochondrial genes, I recover new relationships within Aphyocharacinae. Independent analyses recovered similar topologies for molecular and morphologic datasets. Molecular based topologies showed common generic relationships: Aphyocharacinae, excluding the genus Rachoviscus and Inpaichthys, constitutes a monophyletic group. Moreover, Aphyocharacinae has two well–marked major branches. One composed by (Paragoniates (Phenagoniates (Leptagoniates+Xenagoniates))), while the other includes Aphyocharax and Prionobrama. Also, relationships among the genera were completely resolved and supported by strong statistical indexes. Based on molecular hypotheses, I had a specific monophyletic framework to conduct morphological analysis. This approach suggests that Aphyocharacidium sp. and Microschemobrycon cf. casiquiare are most probably the sister group of Aphyocharacinae. The morphological analysis conducted with 25 unweighted and unordered characters recovers one tree, resolved at generic–species level. A similar hypothesis found using molecular data is recovered with three well–marked... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-27Bitstream added on 2014-08-13T18:00:53Z : No. of bitstreams: 1 000750761.pdf: 697080 bytes, checksum: d41443497b35d1c9e1731e35f82b3583 (MD5) / A ordem Characiformes reúne aproximadamente 1.670 espécies de água doce, das quais pelo menos 1.300 ocorrem no Brasil. Até o momento relativamente poucos estudos genéticos foram realizados com espécies desse grupo, particularmente na Amazônia. Uma questão importante para o momento atual é saber se há algum isolamento entre populações locais separadas por corredeiras ou rápidos na Amazônia, dado o potencial hidrelétrico estimado para esses ambientes. Nesse sentido, no presente estudo, conduzido no âmbito do Programa de Conservação da Ictiofauna da Santo Antônio Energia, foram avaliadas duas populações locais de duas espécies: Pygocentrus nattereri e Potamorhina latior. Empregamos sequências da região controle (D-loop) do DNA mitocondrial, pela maior taxa de mutação que esse gene apresenta em relação aos demais genes. As amostras foram tomadas a montante e a jusante da antiga cachoeira de Teotônio visando testar a hipótese de que essa cachoeira servia de barreira para essas espécies. Foram analisados 54 espécimes de P. nattereri (25 montante e 29 jusante) e 45 de P. latior (25 montante e 20 jusante). Os resultados mostraram que os espécimes da montante de P. nattereri apresentam maior variabilidade genética (haplótipos = 5, Hd = 0,607, π = 0,00105) que os da jusante (haplótipos = 2, Hd = 0,379, π = 0,00046), No caso de P. latior, esses valores foram similares tanto a montante (haplótipos = 23, Hd = 0,993, π = 0,01232) como a jusante (haplótipos = 17, Hd = 0,984, π = 0,01865). Ambas as espécies apresentaram haplótipos compartilhados nas duas localidades. A divergência genética entre as localidades de P. nattereri (0,1%) foi menor que em P. latior (1,9%). A análise de variância molecular revelou diferenças significativas entre as localidades de P. nattereri (Φst = 0,11448, P = 0,018) e P. latior (Φst = 0,16408, P = 0,000). Os resultados sugerem que entre as duas localidades amostradas existia uma ... / The order Characiformes gathers approximately 1,670 freshwater species, of which at least 1,300 occur in Brazil. To date relatively few genetic studies have been conducted with species of this group, particularly in the Amazon. An important question for the moment is whether there is some isolation between local populations separated by rapids or fast in the Amazon, given the hydroelectric potential estimated for these environments. Accordingly, in this study, conducted under the Conservation Program Ichthyofauna of Santo Antônio Energia, were evaluated two local populations of two species: Pygocentrus nattereri and Potamorhina latior. We employ sequences of the control region (D-loop) of the mitochondrial DNA, the higher rate of this gene mutation present in relation to other genes. The samples were taken upstream and downstream of the old waterfall Teotônio to test the hypothesis that this waterfall served as a barrier for these species. Were examined 54 specimens of P. nattereri (25 upstream and 29 downstream) and 45 of P. latior (25 upstream and 20 downstream). The results showed that the amount of specimens of P. nattereri have greater genetic variability (Haplotypes = 5, Hd = 0607, π = 0.00105) that the downstream (Haplotypes = 2, Hd = 0379, π = 0.00046). In the case of P. latior, these values were similar both upstream (Haplotypes = 23, Hd = 0993, π = 0.01232) and downstream (Haplotypes = 17, Hd = 0.984, π = 0.01865). Both species have shared haplotypes in the two localities. The genetic divergence between the localities of P. nattereri (0.1%) was lower than in P. latior (1.9%). The analysis of molecular variance revealed significant differences between the localities of P. nattereri (Φst = 0.11448, P = 0.018) and P. latior (Φst = 0.16408, P = 0.000). The results suggest that a possible population structure existed between the two localities sampled both by differences in genetic variability as well as by allelic ...

Made available in DSpace on 2015-05-14T16:53:27Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-17Bitstream added on 2015-05-14T16:58:48Z : No. of bitstreams: 1 000828973.pdf: 2813224 bytes, checksum: 52559505ada0f60a041cdd3e78ecc4d3 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação do Instituto de Biociências (FUNDIBIO) / As espécies atualmente alocadas em Moenkhausia não formam um grupo monofilético. Estudos atuais buscam estabelecer novas relações e readequações destas espécies. No entanto, são verificados equívocos nas identificações que levam à relações não verdadeiras. O presente estudo reúne o conhecimento taxonômico sobre Moenkhausia, corrige, complementa e padroniza descrições das espécies. As espécies foram reunidas em grupos, com base em caracteres da morfologia externa e no conhecimento filogenético disponível para o gênero: Moenkhausia oligolepis - padrão de colorido reticulado e presença de banda escura no pedúnculo caudal; M. lepidura - mácula restrita ao lobo superior da nadadeira caudal; M. dichroura - mácula em ambos os lobos da nadadeira caudal; M. doceana - mácula umeral estendida horizontalmente ou duas máculas umerais, mácula no pedúnculo caudal ou nos raios medianos da nadadeira caudal; seis, ou mais, séries de escamas acima da linha lateral; M. xinguensis - maior altura do corpo na origem da nadadeira dorsal, mácula umeral ausente ou inconspícua e cinco series de escamas acima da linha lateral; M. eigenmanni - concentração de cromatóforos nas escamas, especialmente na região mediana dos flancos; corpo, geralmente, longo e caracteristicamente convexo na região pré-dorsal; M. ceros - baixa concentração de cromatóforos nas escamas, pequeno porte, faixa escura ou iridescente desde a região mediana do corpo ao pedúnculo caudal ou raios medianos da nadadeira caudal. Esses agrupamentos não são exclusivamente naturais e não devem ser tomados como relações filogenéticas. No entanto, são eficazes para a identificação das espécies e elaboração de futuras hipóteses de relações em Moenkhausia / The species currently allocated in Moenkhausia are not a monophyletic group. Current studies try to establish new relationships and adequation these species. However, identifications mistakes are usualy verified. What show wrong relationships. This study gathers the taxonomic knowledge of Moenkhausia, fixe, standardizes and complements species descriptions. Most species were grouped into groups, based on characters from the external morphology and phylogenetic knowledge available to the genre: Moenkhausia oligolepis – reticulate patters, presence of dark colored band on the caudal peduncle; M. lepidura – dark spot restricted to the upper lobe of the caudal fin; M. dichroura - spot in both lobes of caudal fin; M. doceana – one horizontally extended humeral spot or two humeral spot, spot presence in the caudal peduncle or in the middle rays of the caudal fin, six or more series of scales above lateral line; M. xinguensis - deep body at origin of dorsal fin, absent or inconspicuous humeral spot, five series of scales above lateral line; M. eigenmanni - concentration of chromatophores on the scales, especially in the middle part of the flanks, usually long body and characteristically convex pre-dorsal region; M. ceros - low concentration of chromatophores on the scales, small, dark or iridescent line from the middle region of the body to the caudal peduncle or middle rays of the caudal fin. These groupings are not natural and should not be taken as phylogenetic relationships. However, they are effective for species identification and development of future hypotheses of relationships in Moenkhausia

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-04-08Bitstream added on 2014-06-13T20:01:05Z : No. of bitstreams: 1 serra_jp_dr_sjrp.pdf: 3153770 bytes, checksum: 728398b4424d8a7553192af8e41e3af7 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Hemigrammus Gill, (1858) é um dos gêneros mais especiosos dentro da família Characidae, com 51 espécies distribuídas nas Américas do Sul e Central; porém, pouco se sabia sobre suas relações com outros táxons de Characidae, sendo considerado por muitos autores como um grupo não natural (Ellis in Eigenmann,1918; Böhlke, 1955; Weitzman & Palmer, 1997a; Marinho et al., 2008; Britski & Lima, 2008; Lima & Souza, 2009; Lima et al., 2009). As poucas propostas disponíveis de relacionamento para o gênero, apresentavam Hemigrammus como mais proximamente relacionado à Hyphessobrycon, Parapristella, Bryconella, Thayeria e Hasemania (Géry, 1977; Serra, 2003; Benine, 2004; Mirande, 2009), porém, a maioria desses trabalhos analisaram poucas (1-3) espécies do gênero e nenhum deles teve como objetivo principal testar o monofiletismo de Hemigrammus. Sendo assim, os objetivos do presente trabalho foram: redescrever e descrever osteologicamente H. unilineatus, espécie-tipo do gênero, avaliar o monofiletismo de Hemigrammus com a utilização do maior número possível de suas espécies válidas e avaliar o relacionamento de suas espécies entre si e com outras de Characidae. Foram analisados 95 táxons e 165 caracteres osteológicos, de morfologia externa e de colorido; a matriz de caracteres foi analisada pelo programa PAUP (4.0b 10 2001), com busca heurística, algoritmo tree-bisection-reconnection para o branch-swapping, random taxon addition sequence, 1000 réplicas e otimização acctran, com repesagens sucessivas. A análise filogenética resultou em seis árvores igualmente parcimoniosas; após repesagens uma única árvore mais parcimoniosa foi gerada, com IC. 0,35 e IR. 0,61. Hemigrammus em seu sensu atual não aparece formando um grupo monofilético. De acordo com os resultados obtidos o gênero fica restrito a sua espécie-tipo e espécies de outros gêneros de Characidae... / Hemigrammus Gill, (1858) is one of the most specious genera within the family Characidae, with 51 valid species distributed in South and Central America. The phylogenetic relationships of the genus with other Characidae are poorly known, and many authors consider that Hemigrammus does not constitute a monophyletic assemblage (Ellis in Eigenmann, 1918, Böhlke, 1955; Weitzman & Palmer, 1997a; Marinho et al., 2008; Britski & Lima, 2008, Souza & Lima, 2009, Lima et al., 2009). The few hypotheses available concerning relationships of Hemigrammus, presented the genus as closely related to Hyphessobrycon, Parapristella, Bryconella, Thayeria, and Hasemania (Géry, 1977; Serra, 2003, Benine, 2004; Mirande, 2009), however, all these studies analyzed only few species (1-3) of the genus, and none aimed to test the monophyly of Hemigrammus. Therefore, the objectives of this study were: redefining and describing osteologically H. unilineatus, type species of the genus; evaluate the monophyly of Hemigrammus using the largest possible number of its valid species; and assess the relationships of its species among themselves and with other Characidae. Were analyzed 95 taxa and 165 characters concerning osteology, external morphology and color pattern. Phylogenetic analysis was performed using PAUP (4.0b 10 2001) with heuristic search algorithm, tree-bisection-reconnection for branch-swapping, random taxon addition sequence, 1000 replicates and optimization acctran, with successive reweighting. The phylogenetic analysis resulted in six most parsimonious trees; after reweighting, resulted in a single most parsimonious tree, with IC. 0.35 and IR. 0.61. Hemigrammus in its current sense does not form a monophyletic group. According to the results, the genus Hemigrammus is restricted to its type species and species of other genera of Characidae (Hyphessobrycon, Moenkhausia and Pristella)... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-04-20Bitstream added on 2014-06-13T18:29:20Z : No. of bitstreams: 1 silva_jr_me_botib.pdf: 572070 bytes, checksum: 91e0d84d7ce9e5bd73020942f3c5e9df (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Grande parte do genoma dos eucariotos é composta de múltiplas cópias de DNA, conhecidas como DNAs repetitivos, cuja função em relação à manutenção, estrutura e funcionamento do genoma ainda precisa ser melhor investigada. Os DNAs repetitivos classificados como elementos transponíveis vêm sendo considerados como um dos principais representantes do genoma de vertebrados e, de maneira particular, os peixes têm chamado atenção em relação à grande diversidade de classes destes elementos encontradas em seus genomas. Visando ampliar os dados acerca de elementos transponíveis em peixes, o presente trabalho teve como objetivos o isolamento e a caracterização de retrotransposons da família Rex em duas espécies de Characidae - Brycon amazonicus e B. orbignyanus - e realizar inferências acerca de sua organização e dinâmica evolutiva. Desta forma, amostras de DNA foram utilizadas em PCR (Polymerase Chain Reaction) para amplificar segmentos dos retroelementos Rex1, Rex3 e Rex6 e os fragmentos obtidos foram clonados e sequenciados. Adicionalmente, estes segmentos de DNA foram utilizados como sondas em experimentos de hibridação in situ visando identificar a localização cromossômica destes retrotransposons. A identificação de elementos Rex em B. cephalus e B. orbignyanus demonstrou a presença destes retrotransposons não-LTR (Long Terminal Repetition) em um maior número de espécies de Characiformes e, especificamente, no grupo Characidae. Os segmentos analisados de Rex1 e Rex3 correspondem aos domínios codificantes 3-7 e 1, 2, 2A, A e B do gene da transcriptase reversa (RT), respectivamente. O fragmento de DNA relativo ao retroelemento Rex6 isolado codifica a porção C-terminal de uma endonuclease. Comparações entre sequências nucleotídicas de diferentes espécies de peixes... / A huge part of the eukaryote genome is constituted by multiple DNA copies, known as repetitive DNAs, which role regarding to the maintenance, structure, and function of the genome needs to be better understandable. The repetitive DNAs that are classified as transposable elements have been considered one of the main parts of the vertebrate genome and, particularly, fishes have gain attention due to the presence of many different classes of these elements in their genomes. In order to improve data on fish transposable elements, the present work intent to isolate and characterize retrotransposons of the Rex family in two Characidae species - Brycon amazonicus and B. orbignyanus - and infer on the organization and evolutionary dynamics of these elements. Therefore, DNA samples were used on PCR (Polymerase Chain Reaction) in order to amplify segments of the Rex1, Rex3, and Rex6 elements, and the obtained fragments were cloned and sequenced. Additionally, these DNA segments were used as probes throughout in situ hybridization procedures to identify the chromosome localization of these retrotransposons. The identification of Rex elements in B. cephalus e B. orbignyanus evidenced the presence of these non-LTR (Long Terminal Repetition) retrotransposons in a large number of Characiformes species and, specifically, in Characidae. The analyzed fragments of Rex1 and Rex3 correspond to the coding domains 3-7 and 1, 2, 2A, A and B of the reverse transcriptase (RT) gene, respectively. The DNA segment correlated to the Rex6 element codifies a C-terminal portion of an endonuclease. Nucleotide sequence comparisons among different fish species showed that these regions are highly conserved in diverse groups. Although the obtained data for B. amazonicus seemed to point to a higher similarity between Rex1 and Rex3 of... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2015-08-20T17:09:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-20. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:26:34Z : No. of bitstreams: 1 000841299.pdf: 1117680 bytes, checksum: 82417d01cae798e91cfee1b8826da5bf (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O mapeamento cromossômico de sítios de DNA repetitivo vem sendo realizado em vários estudos citogenéticos em peixes e tem permitido uma melhor caracterização da biodiversidade e evolução genômica da ictiofauna Neotropical. Dentre as diversas espécies de peixes distribuídas nesta importante área geográfica, podemos destacar o gênero Moenkhausia, um dos mais especiosos grupos de peixes da família Characidae. Do ponto de vista citogenético, este gênero demonstra variação do número diploide de 48 a 50 cromossomos, bem como a presença de microcromossomos B descritos para diferentes espécies/populações. No entanto, estudos citogenéticos de espécies de Moenkhausia coletadas em riachos de cabeceira da bacia Amazônica e bacia do Alto rio Paraguai ainda são incipientes, bem como os estudos relativos à distribuição de DNAs repetitivos nos genomas de diferentes espécies de Moenkhausia. Neste sentido, o presente trabalho teve como objetivo a caracterização cariotípica de Moenkhausia cosmops, M. cf. forestii, M. cf. nigromarginata, M. oligolepis e Moenkhausia sp. coletadas em diferentes rios e riachos de cabeceira da bacia Amazônica e bacia do Alto rio Paraguai. Todas as espécies foram analisadas através de técnicas citogenéticas clássicas (coloração com Giemsa, localização das RONs pela impregnação por Nitrato de Prata e bandamento C) e molecular (hibridação in situ fluorescente com sondas de DNAr 5S e 18S, histona H1, snDNA U2 e sequências teloméricas (TTAGGG)n). Todas as espécies/populações analisadas apresentaram 2n=50 cromossomos, porém com fórmulas cariotípicas distintas entre elas. O bandamento C revelou um padrão de bandas heterocromáticas similar entre essas espécies, exceto em M. cf. nigromarginata. A impregnação por Nitrato de Prata evidenciou Ag-RONs simples em todas as espécies analisadas. A FISH utilizando o DNAr 18S como sonda confirmou os resultados obtidos com o Nitrato de Prata e... / The cytogenetic mapping of repetitive DNA has been applied in several studies in fish, which allowed a better characterization about the biodiversity and genomic evolution of Neotropical ichthyofauna. Among the several fish species living in this area, the genus Moenkhausia, one of the specious groups inside Characidae, is remarkable. From a cytogenetic point of view, this genus show variations in diploid numbers of 48 to 50 chromosomes, as well as the occurrence of B chromosomes in different species/populations. However, cytogenetic studies in Moenkhausia collected at different rivers from the Amazon and Upper Paraguay River basins are scarce, as well as studies investigating the chromosomal distribution of repetitive DNAs in different species. In this sense, the present study aimed to characterize the karyotypes of Moenkhausia cosmops, M. cf. forestii, M. cf. nigromarginata, M. oligolepis and Moenkhausia sp. collected at different sites in the Amazon and Upper Paraguay River basins. All species were analyzed using classical (conventional staining with Giemsa, localization of NORs by impregnation with Silver nitrate and C-banding) and molecular (fluorescent in situ hybridization with 5S and 18S rDNA, H1 histone, U2 snDNA and telomeric sequences (TTAGGG)n probes). All the herein analyzed species showed 2n=50 chromosomes, with different karyotype formulas. C-banding evidenced similar patterns of heterochromatin distribution in all species, except in M. cf. nigromarginata. Silver nitrate staining evidenced simple Ag-NORs in all species and FISH with 18S rDNA probes confirmed these results e revealed additional sites in M. oligolepis. The 5S rDNA was interstitially located in multiple sites in all species. Notably, both ribosomal sites were found in synteny in one population of M. oligolepis. The H1 histone sites were co-located in a single pair with 18S rDNA and the U2 snDNA was located at multiple sites in all species. Additionally, the ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-04-28Bitstream added on 2014-06-13T20:49:32Z : No. of bitstreams: 1 simiele_d_me_sjrp.pdf: 1013538 bytes, checksum: 385884f8bd78a072e78616facfd6a25f (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O novo gênero é descrito com base em exemplares provenientes do Rio Quente (nascente), afluente do rio Corumbá, afluente do rio Paranaíba, sistema do alto rio Paraná e está inserido no “clado A” (Malabarba & Weitzman, 2003) pela presença de ii, 8 raios na nadadeira dorsal e quatro dentes na série interna do pré-maxilar. No presente trabalho, o novo gênero aparece como grupo irmão de Piabina + Creagrutus por compartilhar com aqueles gêneros a presença não ambígua de um processo medial dorsolateral no hiomandibular. O novo gênero é monotípico e se distingue de todos os demais Characidae por apresentar coracóide com um entalhe reto e oblíquo postero-ventral e palatino triangular. / A new genus is described from Rio Quente, affluent of rio Corumbá, rio Paranaíba, upper rio Paraná system, and belongs to Clado A (Malabaraba & Weitzman, 2003) by the presence of ii, 8 dorsal-fin rays and four teeth in the inner row of premaxilla. In this study, the new genus is shown as a sister group of Piabina + Creagrutus, sharing with them the presence not ambiguous of one dorsolateral buttress in the hiomandibular. The new genus is monotypic and is distinguished from all Characidae by having the coracoid postero-ventral incision straight and obliquious and a triangular palatine.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-02-24Bitstream added on 2014-06-13T19:28:29Z : No. of bitstreams: 1 tatsumi_fl_me_sjrp.pdf: 3972558 bytes, checksum: a2b978228f7cd32fa1e1bf09d421770d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Bryconamericus iheringii (Boulenger, 1887) é amplamente distribuída na bacia do rio da Prata e Sistema da Laguna dos Patos. Entretanto, há evidências de que a população de Bryconamericus do Alto rio Paraná, anteriormente identificada como B.iheringii seja diferente de B. iheringii descrita do Sistema da Laguna dos Patos, localidade-tipo da espécie, pelo menos na altura do corpo. Neste trabalho foram analisadas populações atribuídas a B. iheringii usando dados morfométricos, merísticos e osteológicos. Populações de B. iheringii do Sistema da Laguna dos Patos, rios Uruguai e Iguaçu, apresentaram diferenças significativas com as populações do Alto rio Paraná em diversos caracteres incluindo a altura do corpo, mas principalmente no diâmetro do olho e na presença de ganchos ósseos nos ramos anteriores dos raios ramificados da nadadeira anal. A redescrição de B. iheringii é apresentada, bem como a descrição da nova espécie da bacia do Alto rio Paraná e ambas são diagnosticadas de outras espécies do rio da Prata, rio São Francisco, drenagens litorâneas brasileiras e Sistema da Laguna dos Patos / Bryconamericus iheringii (Boulenger, 1887) is widespread in the La Plata river basin and Laguna dos Patos System. There is evidence however that Bryconamericus population from Upper rio Paraná basin previously identified as B. iheringii is different from B. iheringii described from Laguna dos Patos System, type-locality of the species, at least at the body depth. In this work we have analyzed the populations assigned to B. iheringii using morphometric, meristic and osteological data. Populations of B. iheringii from Laguna dos Patos System, Uruguay and Iguaçu rivers have presented significant differences with the population from Upper rio Paraná basin in several characters including body depth, but mainly in the eye diameter and in the presence of bony hooks on anterior branches of branched rays of anal fin. A redescription for B. iheringii is presented as well as a description of a new species from Upper rio Paraná basin and both are diagnosed from other congeneric species from La Plata river, rio São Francisco, Brazilian coastal drainages, and Laguna dos Patos System

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003-12-05Bitstream added on 2014-06-13T20:29:28Z : No. of bitstreams: 1 serra_jp_me_sjrp.pdf: 1629158 bytes, checksum: 3caf30068b852683e910c49a69ecfcd4 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / São apresentadas a análise filogenética e a revisão taxonômica de Hasemania Ellis, 1911. Hasemania, Ellis, 1911, compreende doze espécies; sete anteriormente descritas: H. nana (Lütken, 1875) descrita para a bacia do rio São Francisco; H. melanura Ellis, 1911 (espécie-tipo por designação original), bacia do rio Iguaçu; H. maxillaris Ellis, 1911, mesma localidade de H. melanura; H. hanseni (Fowler, 1949), Estado de Goiás; H. crenuchoides Zarske & Géry, 1999, bacia do alto rio Paraná; H. bilineata Ellis, 1911, bacia do rio Tietê, descrita originalmente em Hasemania mas transferida por Géry (1966) para Coptobrycon; H. negodagua Lima & Gerhard, 2001, bacia do alto rio Paraguaçu, descrita originalmente em Hyphessobrycon; e cinco espécies novas: H. sp.n.1, bacia do rio Tocantins-Araguaia, H. sp.n.2, bacia do rio Jequitinhonha, H. sp.n.3, bacia do alto rio Paraná, H. sp.n.4, bacia do rio Doce e H. sp.n.5, bacia do rio Tocantins-Araguaia. A análise filogenética envolvendo as espécies de Hasemania e outros Tetragonopterinae e Characidade resultou em uma única árvore filogenética (Passos: 602; IR: 0,5368; ICR: 0,1213). O gênero é hipotetizado como monofilético com base em uma apomorfia exclusiva (com reversão em H. hanseni): mesetmóide bastante delgado, com um estreitamento mediano muito acentuado, deixando boa parte do vômer visível em vista dorsal. Além das relações de Hasemania, são também discutidas algumas relações filogenéticas em Tetragonopterinae. INTRODUÇÃO GERAL Hasemania Ellis, 1911, originalmente abrigava três espécies: H. melanura (espécie tipo por designação original) descrita para Porto União, rio Iguaçu, bacia do rio Paraná, Estado do Paraná; H. maxillaris, Ellis, 1911, descrita para a mesma localidade, e H. bilineata, Ellis, 1911, descrita para Paranapiacaba (Alto da Serra), São Paulo, bacia do rio Tietê, Estado de São Paulo...