O Pinus elliotti representa o principal produtor atual de exploração de resina no setor florestal brasileiro. Recentemente, plantios de P. elliottii X P. caribaea vêm se destacando, principalmente, pela sua maior produtividade em biomassa. Além disto, a resina do híbrido apresenta características químicas semelhantes aos seus parentais. Porém, poucas são as informações quanto a estaquia de espécies do gênero Pinus, e se focarmos na propagação de árvores adultas, tal carência é ainda maior, principalmente ao se considerar a dificuldade de rejuvenescimento/revigoramento do material genético. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivo geral avaliar o enraizamento adventício do P. elliottii var. elliottii e P. elliottii X P. caribaea adultos. Para tanto, o trabalho foi dividido em três diferentes estudos. O primeiro (Capítulo 2) avaliou o enraizamento adventício de estacas das matrizes adultas de P. elliottii e P. elliottii X P. caribaea no 5° estágio de enxertia seriada com e sem podas sucessivas, sob ação do AIB, talco com fungicida Cerconil® e terebentina. O segundo (Capítulo 3) foi baseado na avaliação do enraizamento adventício de estacas no 2° estágio de enxertia seriada de uma matriz adulta de P. elliottii var. elliottii submetida a um ano de podas sucessivas, sob ação do AIB, terebentina e paclobutrazol. Por sua vez, o terceiro estudo (Capítulo 4) consistiu na avaliação do enraizamento adventício de braquiblastos e brotos de duas matrizes adulta de P. elliottii e P. elliottii X Pinus caribaea, sob ação do AIB e paclobutrazol. Os resultados permitiram inferir que a sobrevivência e o enraizamento adventício aos diferentes tratamentos variaram de acordo com o genótipo e com as características morfológicas das estacas (grau de lignificação e tipo de estacas, brotos e braquiblastos). De maneira geral, os resultados evidenciaram a atuação das enxertias seriadas e das podas sucessivas na restauração da competência rizogênica das estacas dos brotos das matrizes adultas de P. elliottii e P. elliottii X P. caribaea, promovido pelo rejuvenescimento/ revigoramento parcial das matrizes. Além disto, a estaquia de braquiblastos mostrou ser uma ferramenta promissora para a propagação de espécies do gênero Pinus. / Pinus elliottii is the main current resin extraction producer in the Brazilian forest sector. Recently, plantations of P. elliottii X P. caribaea play a great importance in the production systems mainly by its high biomass productivity. In addition, the hybrid resin has chemical characteristics similar to their parents. However, there is little information on obtaining clones, and considering the propagation of mature trees, this lack of information is even greater, mainly concerning the difficulty to achieve the rejuvenation/ reinvigoration of the genetic material. Based on theses information, the present work was aimed to evaluate the adventitious rooting of mature P. elliottii var. elliottii and P. elliottii X P. caribaea cuttings. Therefore, the work was divided into three basic studies. The first study (Chapter 2) was based on the evaluation of adventitious rooting of mature P. elliottii and P. elliottii X caribaea cuttings of grafts up five sequential grafting with and without pruning, under the action of AIB, talc with fungicide and turpentine. The second (Chapter 3) was based on the evaluation of adventitious rooting of mature P. elliottii cuttings of grafts up two sequential grafting with pruning, under the action of IBA, paclobutrazol and turpentine. The third (Chapter 4) evaluated the adventitious rooting of brachyblast and shoots of mature P. elliottii and P. elliottii X caribaea cuttings, under the action of IBA and paclobutrazol. Results showed that the cutting survival and root growth, under the action of different treatments, varied according to the genotype and morphological characteristics of the material (cutting lignifications and type, brachyblast or shoot). Overall, our results showed the performance of serial grafting and pruning on the restoration of rooting competence in P. elliottii and P. elliottii X P. caribaea stem cuttings, promoted by the rejuvenation of trees. Moreover, the cutting of brachyblast can be a promising tool for the propagation of Pinus species.

O Pinus elliotti representa o principal produtor atual de exploração de resina no setor florestal brasileiro. Recentemente, plantios de P. elliottii X P. caribaea vêm se destacando, principalmente, pela sua maior produtividade em biomassa. Além disto, a resina do híbrido apresenta características químicas semelhantes aos seus parentais. Porém, poucas são as informações quanto a estaquia de espécies do gênero Pinus, e se focarmos na propagação de árvores adultas, tal carência é ainda maior, principalmente ao se considerar a dificuldade de rejuvenescimento/revigoramento do material genético. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivo geral avaliar o enraizamento adventício do P. elliottii var. elliottii e P. elliottii X P. caribaea adultos. Para tanto, o trabalho foi dividido em três diferentes estudos. O primeiro (Capítulo 2) avaliou o enraizamento adventício de estacas das matrizes adultas de P. elliottii e P. elliottii X P. caribaea no 5° estágio de enxertia seriada com e sem podas sucessivas, sob ação do AIB, talco com fungicida Cerconil® e terebentina. O segundo (Capítulo 3) foi baseado na avaliação do enraizamento adventício de estacas no 2° estágio de enxertia seriada de uma matriz adulta de P. elliottii var. elliottii submetida a um ano de podas sucessivas, sob ação do AIB, terebentina e paclobutrazol. Por sua vez, o terceiro estudo (Capítulo 4) consistiu na avaliação do enraizamento adventício de braquiblastos e brotos de duas matrizes adulta de P. elliottii e P. elliottii X Pinus caribaea, sob ação do AIB e paclobutrazol. Os resultados permitiram inferir que a sobrevivência e o enraizamento adventício aos diferentes tratamentos variaram de acordo com o genótipo e com as características morfológicas das estacas (grau de lignificação e tipo de estacas, brotos e braquiblastos). De maneira geral, os resultados evidenciaram a atuação das enxertias seriadas e das podas sucessivas na restauração da competência rizogênica das estacas dos brotos das matrizes adultas de P. elliottii e P. elliottii X P. caribaea, promovido pelo rejuvenescimento/ revigoramento parcial das matrizes. Além disto, a estaquia de braquiblastos mostrou ser uma ferramenta promissora para a propagação de espécies do gênero Pinus. / Pinus elliottii is the main current resin extraction producer in the Brazilian forest sector. Recently, plantations of P. elliottii X P. caribaea play a great importance in the production systems mainly by its high biomass productivity. In addition, the hybrid resin has chemical characteristics similar to their parents. However, there is little information on obtaining clones, and considering the propagation of mature trees, this lack of information is even greater, mainly concerning the difficulty to achieve the rejuvenation/ reinvigoration of the genetic material. Based on theses information, the present work was aimed to evaluate the adventitious rooting of mature P. elliottii var. elliottii and P. elliottii X P. caribaea cuttings. Therefore, the work was divided into three basic studies. The first study (Chapter 2) was based on the evaluation of adventitious rooting of mature P. elliottii and P. elliottii X caribaea cuttings of grafts up five sequential grafting with and without pruning, under the action of AIB, talc with fungicide and turpentine. The second (Chapter 3) was based on the evaluation of adventitious rooting of mature P. elliottii cuttings of grafts up two sequential grafting with pruning, under the action of IBA, paclobutrazol and turpentine. The third (Chapter 4) evaluated the adventitious rooting of brachyblast and shoots of mature P. elliottii and P. elliottii X caribaea cuttings, under the action of IBA and paclobutrazol. Results showed that the cutting survival and root growth, under the action of different treatments, varied according to the genotype and morphological characteristics of the material (cutting lignifications and type, brachyblast or shoot). Overall, our results showed the performance of serial grafting and pruning on the restoration of rooting competence in P. elliottii and P. elliottii X P. caribaea stem cuttings, promoted by the rejuvenation of trees. Moreover, the cutting of brachyblast can be a promising tool for the propagation of Pinus species.

Orientadores: Marco Antonio Garcia de Carvalho, Marco Aurelio Takita / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Tecnologia / Made available in DSpace on 2018-08-26T15:21:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Palma_EloaCarolinaNavaCardoso_M.pdf: 2004126 bytes, checksum: 618ad5da7f91e98f63bfdc0a41812387 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: O surgimento dos sequenciadores automáticos de DNA por volta dos anos 1990 fez com que a quantidade de sequências e informações a serem analisadas aumentasse exponencialmente. Sendo assim, os recursos computacionais são cada vez mais exigidos em diversas tarefas de armazenamento desses dados. Para atender essas e outras necessidades, surgiu a Bioinformática, que engloba diversas áreas como Ciência da Computação, Matemática, Estatística, e a Biologia Molecular. Neste trabalho, desenvolvemos um software denominado Biodonut, que consiste em manipular plasmídeos utilizando visualização 2D e 3D. Biodonut é um produto de software de plataforma web, open source para que os pesquisadores possam manipular plasmídeos in silico, visualizando em formato 2D e 3D e possibilitando uma análise diferenciada das áreas julgadas importantes. A base de dados utilizada no software é o GenBank, por ser mundialmente conhecida e respeitada. Uma comparação com dois importantes softwares da área foi efetuada e é apresentada neste trabalho. Os resultados apontam que usar Biodonut é vantajoso em relação os outros dois softwares / Abstract: The advent of automated DNA sequencers around 1990s led to the amount of information sequences to be analyzed and increased exponentially. Thus, computing resources are increasingly demanded in various tasks such data storage. To meet these and other needs arose Bioinformatics, encompassing diverse areas as Computer Science, Mathematics, Statistics, and Molecular Biology. In this work, we developed a software called Biodonut, which involves manipulating plasmids using 2D and 3D visualization. Biodonut is a product of web software platform, open source so that researchers can manipulate plasmids in silico, visualizing 2D and 3D format, enabling a differentiated analysis of the areas deemed important. The database software is used in GenBank, to be globally known and respected. A comparison with two important software of the area was conducted and is presented in this paper. The results show that using Biodonut is advantageous over the other two softwares / Mestrado / Tecnologia e Inovação / Mestra em Tecnologia

CHEK2 gene codes for serin/threonine kinase Chk2 (Checkpoint kinase 2). In response to genomic DNA damage, Chk2 phosphorylates its substrates (proteins Cdc25C, BRCA1 or p53), whose activation leads either to cell cycle arrest, DNA damage repair or induction of apoptosis. Germline mutations in CHEK2 gene increase risk of cancer development. Analysis of high risk breast cancer patients in Czech Republic reveals rare CHEK2 mutations (mainly missense) with yet unknown clinical significance. This work focuses on functional impact of these variants and analysis of kinase activity of variant isoforms of Chk2 kinase. For this purpose, recombinant constructs were expressed in bacterial cells of E. coli. Enzymatic activity of Chk2 kinase isoforms in crude cell lysates was measured by the phosphorylation of Chk2 arteficial substrate spectrophotometrically. Results of in vitro kinase assay were correlated to the results of in silico prediction software. The results show that from 15 analyzed mutations (together with one in frame deletion), kinase activity was abrogated in all variants affecting the kinase domain of Chk2, in concordance with in silico predictions. The same result has been found for a FHA domain variant p.R145Q. No significant changes in kinase activity were observed in case of two FHA domain variants...