Made available in DSpace on 2014-12-02T11:16:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-16Bitstream added on 2014-12-02T11:21:33Z : No. of bitstreams: 1 000796546_20143112.pdf: 151390 bytes, checksum: 2cdd9ceb849d403547bf35b62b3da23c (MD5) Bitstreams deleted on 2015-01-05T11:00:53Z: 000796546_20143112.pdf,Bitstream added on 2015-01-05T11:01:49Z : No. of bitstreams: 1 000796546.pdf: 3078084 bytes, checksum: b325495a392fcd35616c530d3155be45 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A biogeografia tem como objetivo principal identificar os padrões de distribuição das espécies e propor hipóteses sobre os processos que resultaram nesses padrões. Os padrões de distribuição de espécies não são aleatórios e resultam de eventos históricos. A congruência entre esses padrões de distribuição, ou seja, a sobreposição de distribuição entre dois ou mais táxons, delimitam uma área de endemismo, que é fundamental para a formulação de hipóteses de biogeografia histórica. Áreas de endemismo na Mata Atlântica já foram delimitadas em estudos anteriores, porém nenhum estudo foi desenvolvido com serpentes para essa finalidade. Nesse estudo, foram identificadas 83 espécies endêmicas de serpentes para a Mata Atlântica, e a partir da análise de parcimônia de Endemicidade (PAE) e de endemismo (NDM/VNDM), quatro áreas de endemismo foram propostas: Alagoas, Sul da Bahia, Serra do Mar e Araucária. A partir da sobreposição de distribuição de serpentes e outros táxons endêmicos, foram definidas outras quatro áreas de endemismo: Ilha dos Alcatrazes, Ilha da Queimada Grande, Ilha de São Sebastião e Brejos de Altitude do nordeste. Essas oito áreas de endemismo foram analisadas em relação aos remanescentes de vegetação e área protegida por unidades de conservação. As espécies que delimitam as áreas de endemismo foram avaliadas em relação a ameaças de extinção de acordo com critérios propostos pela IUCN. Quatro espécies foram consideradas como “Criticamente Ameaçadas”, cinco “Em Perigo”, nove “Vulneráveis”, e sete “quase ameaçadas” de extinção. Essas áreas de endemismo devem ser consideradas como prioritárias para conservação pois representam unidades evolutivas únicas e abrigam serpentes endêmicas e ameaçados de extinção / Biogeography aims mainly to identify patterns of species distribution and to propose hypothesis about the process that have shaped those patterns. The distribution patterns are not random and are a result of historical events. The congruence among those distribution patterns, ie the distribution overlap of two or more endemic taxa, delimits an area of endemism, fundamental for formulation of hypothesis in historical biogeography. Areas of endemism in the Atlantic Forest have already been delimited in previous studies. However, there are no studies on snakes for this purpose. In the present study, 83 endemic snake species were identified in the Atlantic Forest. From Parsimony Analysis of Endemicity (PAE) and Endemism analysis (NDM/VNDM), four areas of endemism were proposed: Alagoas, Sul da Bahia, Serra do Mar, and Araucária. From the distribution overlap of snakes and other endemic taxa, additional four areas of endemism were defined: Ilha dos Alcatrazes, Ilha da Queimada Grande, Ilha de São Sebastião, and Northestern Brejos de Altitude. These eight areas of endemism were analyzed in order to quantify the vegetation remnants and protected areas in conservation units. The species delimiting areas of endemism were evaluated in the threat of extinction, according to the IUCN criteria. Four species were considered as “Critically Endangered”, five were “Endangered”, nine “Vulnerable”, and seven as “Near Threatened”. Those areas of endemism must be considered as priorities for conservation as they correspond to unique evolutionary unities and harbor endemic and threatened taxa / FAPESP: 08/50068-2

Orientador: Ricardo J. Sawaya / Banca: Fausto Erritto Barbo / Banca: Maria Fernanda Calio / Resumo: Um dos objetivos centrais da biogeografia histórica é a reconstrução da história de um determinado táxon ou um grupo baseado em hipóteses filogenéticas. A ideia de que as relações filogenéticas fornecem informações da distribuição geográfica passada é antiga, e apenas se tornou possível com a Sistemática Filogenética de Willi Hennig. Análises de Dispersão e Vicariância (DIVA) e modelos de Dispersão, Extinção e Cladogênese (DEC) são métodos amplamente difundidos para a reconstrução da distribuição geográfica ancestral de espécies. Essas análises incluem eventos anagenéticos e cladogenéticos. Recentemente, esses métodos foram implementados em um pacote do programa R denominado BioGeoBEARS. Além dos eventos anagenéticos e cladogenéticos já implementados nas versões originais de DEC e DIVA, o BioGeoBEARS apresenta a possibilidade de incluir a dispersão em saltos, ou jump dispersal, que tem se mostrado interessante mesmo quando consideradas espécies ou grupos que habitam o continente. O grupo Bothrops alternatus é um clado monofilético recuperado em diferentes filogenias do gênero Bothrops e inclui seis espécies de jararacas que habitam principalmente áreas de vegetação aberta: B. alternatus, B. itapetiningae, B. fonsecai, B. cotiara, B. ammodytoides e B. jonathani. Os objetivos deste trabalho são: 1) inferir a origem do grupo B. alternatus; 2) compreender a diversificação e evolução da distribuição geográfica das espécies atuais e seus ancestrais hipotéticos; 3) analisar se a diversificação ocorreu a partir de áreas abertas ou florestais; e 4) entender como processos geológicos e 14 climáticos podem ter influenciado a distribuição atual do grupo. Revisamos e georreferenciamos 3.265 registros de distribuição geográfica de espécimes depositados em coleções zoológicas e dados da literatura. Utilizamos uma filogenia datada que inclui cinco das seis espécies do grupo, pois... / Abstract: One central aim of historical biogeography is the history reconstruction of a taxon or clade based on phylogenetic hypotheses. The idea that the phylogenetic relationships provide information on past geographical distribution is old, and it was only possible with the Willi Hennig's Cladistic method. Dispersal Vicariance Analysis (DIVA) and Models of Dispersal-Extinction-Cladogenesis (DEC) are among the most popular methods to reconstruct ancestral geographical distributions. Both analysis include anagenetic and cladogenetic processes. Both methods were recently implemented in the R software package BioGeoBEARS. Besides the anagenetic and cladogenetic processes of the original DEC and DIVA, BioGeoBEARS includes a parameter related to jump dispersal, that has been shown interesting even for non-insular species. The Bothrops alternatus group corresponds to a monophyletic clade, recovered in different phylogenies of the genus Bothrops and includes six lancehead snakes species that mainly inhabit open vegetation areas: B. alternatus, B. itapetiningae, B. fonsecai, B. cotiara, B. ammodytoides and B. jonathani. Our aims here are: 1) to infer the area origin of the B. alternatus group; 2) to comprehend the diversification and evolution of the geographic distribution of present species and their hypothetical ancestrals; 3) to analyze if diversification occurred in open vegetation or forested areas; and 4) to understand how geological and climatic processes may have influenced the present distribution of the group. We revised and georeferenced 3,265 records of geographic distributions of species via zoological collection records and 17 literature data. We used a phylogeny including five out six species of the group, because B. jonathani is a rare species lacking molecular data. The biogeographic units in which the species occur were delimited by intersection of geographic distribution of the species and shapefiles of provinces and Brazilian... / Mestre

Orientador: Otavio Augusto Vuolo Marques / Banca: Renato Silveira Bérnils / Banca: Marco Aurélio de Sena / Resumo: A composição de espécies em uma área pode ser influenciada por diversas variáveis, que também costumam influenciar a estrutura de tal comunidade. Estas variáveis podem ser bióticas, como as interações ecológicas entre as espécies e abióticas, tais como variações climáticas e de topografia, que costumam ocorrer em ambientes heterogêneos. Parece haver uma relação positiva entre heterogeneidade de hábitat e riqueza de espécies, embora essa relação seja de difícil descriminação na natureza, por ser influenciada também por fatores intrínsecos, como a biologia e história evolutiva das espécies e extrínsecos, como a história evolutiva do ambiente. Os campos nebulares, fisionomia singular encontrada em poucas áreas da Serra do Mar, possui uma história evolutiva importante na Mata Atlântica e é praticamente desconhecido quanto sua herpetofauna. Neste estudo, foi inventariada a composição de espécies de serpentes e lagartos do mosaico formado por matas e campos nebulares na área de planalto do Núcleo Curucutu do Parque Estadual da Serra do Mar. Além disso, investigou-se a distribuição e a diversidade beta destes grupos ao longo destas fisionomias. Foram encontradas 19 espécies, incluindo 13 de serpentes e seis de lagartos. A fisionomia florestada apresentou quase o dobro de espécies do que a fisionomia de campo. Do total de espécies, sete ocorrem em ambas. Os resultados obtidos sugerem que é necessário maior esforço amostral para inventariar esta comunidade, uma vez que as curvas de... / Abstract: The species composition in an area may be influenced by many variables, which also tend to influence the structure of such community. These variables can be biotic, like the ecological interactions between species and may also be abiotic, such as climate and topography variations, that usually occur in heterogeneous environments. There seems to be a positive relationship between habitat heterogeneity and species richness, although this relationship is difficult to discriminate in nature, because it is also influenced by intrinsic factors, as the biology and evolutionary history of species and extrinsic, as the evolutionary history of the environment. The nebular fields, singular physiognomy found in few areas of the Serra do Mar, have an important evolutionary history in the Atlantic Forest and its herpetofauna is practilly unknown. In this study, the species composition of snakes and lizards was catalogued for the mosaic formed by forests and nebular fields in the highland area of the Núcleo Curucutu of the Parque Estadual da Serra do Mar. In addition, we investigated the distribution and the beta diversity of these groups along these physiognomies. Nineteen species were found, including 13 of snakes and six of lizards. The forested physiognomy showed almost twice as many species as the field physiognomy presented. Of the total species, seven occur in both. The results obtained so far suggest that a greater sampling effort is needed to inventory this community, since rarefaction curves showed no tendency to stabilize. Moreover, this effort should also be maximized to determine if the substitution of species between the physiognomies is really average and whether the distribution is random or structured, given that the use of statistical tests based on qualitative or quantitative data presented divergent results / Mestre

Orientador: Ricardo Jannini Sawaya / Banca: Hussam El-Dine Zaher / Banca: Sílvio Shigueo Nihei / Banca: Cristiano Nogueira / Banca: Otavio Augusto Vuolo Marques / Resumo: A biogeografia tem como objetivo principal identificar os padrões de distribuição das espécies e propor hipóteses sobre os processos que resultaram nesses padrões. Os padrões de distribuição de espécies não são aleatórios e resultam de eventos históricos. A congruência entre esses padrões de distribuição, ou seja, a sobreposição de distribuição entre dois ou mais táxons, delimitam uma área de endemismo, que é fundamental para a formulação de hipóteses de biogeografia histórica. Áreas de endemismo na Mata Atlântica já foram delimitadas em estudos anteriores, porém nenhum estudo foi desenvolvido com serpentes para essa finalidade. Nesse estudo, foram identificadas 83 espécies endêmicas de serpentes para a Mata Atlântica, e a partir da análise de parcimônia de Endemicidade (PAE) e de endemismo (NDM/VNDM), quatro áreas de endemismo foram propostas: Alagoas, Sul da Bahia, Serra do Mar e Araucária. A partir da sobreposição de distribuição de serpentes e outros táxons endêmicos, foram definidas outras quatro áreas de endemismo: Ilha dos Alcatrazes, Ilha da Queimada Grande, Ilha de São Sebastião e Brejos de Altitude do nordeste. Essas oito áreas de endemismo foram analisadas em relação aos remanescentes de vegetação e área protegida por unidades de conservação. As espécies que delimitam as áreas de endemismo foram avaliadas em relação a ameaças de extinção de acordo com critérios propostos pela IUCN. Quatro espécies foram consideradas como "Criticamente Ameaçadas", cinco "Em Perigo", nove "Vulneráveis", e sete "quase ameaçadas" de extinção. Essas áreas de endemismo devem ser consideradas como prioritárias para conservação pois representam unidades evolutivas únicas e abrigam serpentes endêmicas e ameaçados de extinção / Abstract: Biogeography aims mainly to identify patterns of species distribution and to propose hypothesis about the process that have shaped those patterns. The distribution patterns are not random and are a result of historical events. The congruence among those distribution patterns, ie the distribution overlap of two or more endemic taxa, delimits an area of endemism, fundamental for formulation of hypothesis in historical biogeography. Areas of endemism in the Atlantic Forest have already been delimited in previous studies. However, there are no studies on snakes for this purpose. In the present study, 83 endemic snake species were identified in the Atlantic Forest. From Parsimony Analysis of Endemicity (PAE) and Endemism analysis (NDM/VNDM), four areas of endemism were proposed: Alagoas, Sul da Bahia, Serra do Mar, and Araucária. From the distribution overlap of snakes and other endemic taxa, additional four areas of endemism were defined: Ilha dos Alcatrazes, Ilha da Queimada Grande, Ilha de São Sebastião, and Northestern Brejos de Altitude. These eight areas of endemism were analyzed in order to quantify the vegetation remnants and protected areas in conservation units. The species delimiting areas of endemism were evaluated in the threat of extinction, according to the IUCN criteria. Four species were considered as "Critically Endangered", five were "Endangered", nine "Vulnerable", and seven as "Near Threatened". Those areas of endemism must be considered as priorities for conservation as they correspond to unique evolutionary unities and harbor endemic and threatened taxa / Doutor

Orientador: Otavio Augusto Vuolo Marques / Banca: Ricardo Janini Sawaya / Banca: Fausto Errito Barbo / Resumo: Os processos que regulam a riqueza e a composição de espécies em diferentes comunidades têm sido cada vez mais abordados em ecologia e, atualmente, graças a um número razoável de estudos sobre a ecologia e história natural de comunidades de serpentes disponíveis na literatura, tornou-se mais fácil formular hipóteses sobre como esses processos moldaram as comunidades desse grupo. No presente estudo a, localidade da Fazenda Etá (24,30264° S, 47,96106° W), localizada no município de Sete Barras, São Paulo, sudeste do Brasil, foi amostrada entre abril de 2013 e março de 2014, onde nós realizamos amostragens mensais de 2 semanas, utilizando diferentes metodologias que diferiram fortemente quanto à sua eficiência. Nós encontramos 17 espécies de serpentes (4 famílias, 14 gêneros) em campo e uma na segundo a literatura na área de estudo. As informações obtidas em campo permitiram comparar as diferentes fisionomias quanto à composição, riqueza e abundância e quanto ao uso dos recursos pelas espécies de serpentes. Também comparamos a comunidade da Fazenda Etá com outras comunidades de serpentes da Mata Atlântica, quanto à composição e riqueza de espécies. A comunidade apresentou composição e riqueza típicas das baixadas litorâneas do sudeste do Brasil, com diferenças nas abundâncias relativas entre as diferentes fisionomias. Além da clara influência da cobertura vegetal na diversidade de espécies, as variáveis climáticas, especialmente as temperaturas mínimas, tiveram influência em sua atividade. Analisando as características biológicas das espécies que compõem a comunidade em conjunto, ficou evidente que estas são filogeneticamente conservadas e, como em outras comunidades neotropicais, há uma grande sobreposição na utilização de recursos entre as espécies. A comparação entre as comunidades de serpentes ao longo de toda a Mata... / Abstract: The processes that regulate the richness and species composition in different communities have been increasingly addressed in the last decades and presently, thanks to a reasonable number of studies on ecology and natural history of snake communities available in the literature, it became easier to formulate hypotheses about how these processes shaped the communities of this group. In this study, the Etá Farm (24,30264° S, 47,96106° W), located in the municipality of Sete Barras, São Paulo, southeastern Brazil, was sampled frm April 2013 to March 2014, where we performed two-week samplings every month, using different methodologies that differed greatly in efficiency. We found 17 species of snakes in the study area (4 families, 14 genera) and found a record of an additional one in the literature. Based on specimens deposited in scientific collections and records in the literature, seven additional species occur in the region. The information obtained in the field made possible a comparison of the different vegetation types regarding species composition, richness and abundance and of the use of resources by species. We also compared the community of Etá Farm with other snake communities from the Atlantic Forest regarding species composition and richness. The studied community showed the typical composition and richness of snake communities from the coastal lowlands of southeastern Brazil, with differences in the relative abundances in the different vegetation types. Beyond a clear influence of vegetation cover on species richness, climatic variables, especially minimum temperatures, had a marked influence on snake activity. Comparing the biological features of the species that make up the community, it became clear that most of them are phylogenetically conserved and, as observed in other Neotropical communities, there is a great overlap in resource use between species ... / Mestre

Orientador: Otavio Augusto Vuolo Marques / Banca: Ricardo Jannini Sawaya / Banca: Fausto Erritto Barbo / Resumo: Neste trabalho investigamos a existência de diferenças no tamanho corporal, disponibilidade de presas e pressão de predadores em duas populações de Bothrops jararaca de dois parques do Município de São Paulo sujeitos a diferentes graus de urbanização. As serpentes não apresentaram diferenças de comprimento e robustez entre as duas populações, entretanto houve uma tendência de uma maior proporção de fêmeas maiores no parque com maior influência urbana. A oferta de recursos e a pressão de predadores foram significativamente maiores no ambiente com menor influência da cidade. Os resultados sugerem que a menor oferta de presas no parque urbano não diminui significativamente o crescimento de B. jararaca, porém a menor incidência de predadores pode resultar em um maior tempo de vida das serpentes e consequentemente maior proporção de serpentes com tamanho corporal superior / Abstract: Maintenance of suitable habitat is essential for animal population persistence. Quantitative and qualitative alterations in the environment may generate serious ecological consequences. One of the most common causes of alterations in quality, habitable area decrease and isolation is the forest fragmentation carried by urbanization. Forest remnants can function as oceanic islands, and the resident animal species may show morphological variation like dwarfism or gigantism, caused generally by the modification of diet and/or predator incidence. Here, we investigate the body size, prey availability and predation pressure in populations of Bothrops jararaca in two parks subject to different urbanization degree. We found no differences in snakes length, neither stoutness between the two populations. However the prey availability and predator incidence was significantly higher in the park with less urban influence. The results suggest that smaller food availability offer in the isolated urban park did not decrease significantly B. jararaca growth rate, but the lesser predators incidence can result in longer lifetime and consequently higher proportion of snakes with superior body length / Mestre