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Padrões moleculares, diversidade genética e mapa parcial de ligação do cafeeiro / Molecular patterns, genetic diversity and partial linkage map of coffee plantCabral, Terezinha Aparecida Teixeira 24 July 2001 (has links)
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Previous issue date: 2001-07-24 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Cinqüenta e dois primers arbitrários foram utilizados para avaliar a reprodutibilidade e a influência do número de marcadores RAPD ( Random Amplified Polymorphic DNA) na estimação de distâncias genéticas entre 40 acessos do gênero Coffea do banco de germoplasma da UFV/EPAMIG (incluindo 4 espécies diferentes). A técnica RAPD mostrou-se adequada para a estimação de distâncias genéticas (complemento de Jaccard) entre acessos de Coffea, obtendo-se nível de reprodutibilidade de 76,88%. O número de locos não influenciou a formação dos grupos principais, mas influenciou a ordenação dos acessos dentro dos subgrupos. Para a caracterização molecular de 18 clones diferenciadores de raças de Hemileia vastatrix foram utilizados 35 primers da Operon Technologies, Inc. Os 35 primers identificaram 158 locos polimórficos. O agrupamento, utilizando o método UPGMA, foi realizado com base na matriz de valores de dissimilaridades (complemento de Jaccard), e os grupos formados foram compatíveis com as informações disponíveis na literatura sobre a origem genealógica. A técnica RAPD foi eficaz na caracterização dos clones diferenciadores, produzindo marcas específicas para cada clone. O mapa parcial de ligação gênica para Coffea arabica L. foi construído a partir de uma população segregante RC 1 obtida do cruzamento entre Mundo Novo (IAC 464-18) e Híbrido de Timor (CIFC 2570), sendo este último utilizado como genitor recorrente. Foram obtidos 93 marcadores RAPD, dos quais 87 (93,5%) apresentaram segregação 1:1 (P>0,01), quatro (4,4%) segregação 2:1 (P>0,05) e dois (2,2%) segregação 5:1 (P>0,05). Para construção do mapa, foram utilizados os 87 marcadores que segregaram 1:1, sendo que cinco não mostraram -se ligados aos grupos formados. Oitenta e dois marcadores RAPD resultaram em oito grupos de ligação cobrindo 540,6 cM. O s grupos obtidos tiveram uma boa densidade de marcadores, exceto dois grupos. O maior intervalo entre dois marcadores foi 36.4 cM, e 94,5% dos intervalos não excederam a 20 cM. O tamanho dos grupos de ligação apresentou alta correlação com o número de marcadores (r=0,887), indicando distribuição aleatória dos marcadores nos grupos. O número de grupos de ligação é inferior ao correspondente número haplóide de cromossomos (22) e, portanto, o genoma da espécie foi parcialmente explorado e muitas regiões ainda não foram identificadas. / Fifty two arbitrary primers were used to evaluate the reproductibility and the influence of the marker numbers RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) in estimating the genetic distances among 40 accesses of the Coffea genus from the germplasm bank of UFV/EPAMIG (including 4 different species). The RAPD technique was shown to be appropriate for estimating the genetic distances (Jaccard complement) among Coffea accesses, as a reproductibility level of 76.88% is obtained. The loci numbers did not influence the formation of the main groups, however it influenced the ordering of the accesses within subgroups. For molecular characterization of 18 coffee differentials to identify Hemileia vastatrix races , 35 primers from Operon Technologies, Inc were used. The 35 primers identified 158 polymorphic loci. The grouping by the UPGMA method was accomplished based on dissimilarity values matrix (Jaccard complement), and the formed groups were compatible to the information available in literature on genealogical origin. The RAPD technique was effective in characterization of the coffee differentials, so producing specific marks for each clone. The partial genetic linkage map for Coffea arabica L. was built from a segregative RC 1 population obtained from crossbreeding between Mundo Novo (IAC 464-18) and Timor Hybrid (CIFC 2570), with the latter used as recurrent genitor. The following were obtained: 93 RAPD markers, from which 87 (93.5%) showed segregation 1:1 (P>0.01), four (4.4%) segregation 2:1 (P>0.05), and two (2.2%) segregation 5:1 (P>0.05). For map construction those 87 markers segregating 1:1 were used, and five showed no linkage to the formed groups. Eighty two RAPD markers resulted into eight linkage groups covering 540.6 cM. The obtained groups showed to have a satisfactory marker density, exception for two groups. The wider range between two markers was 36.4 cM, and 94.5% of the ranges did not exceed to 20 cM. The size of the linkage groups highy correlated to the number of markers (r=0.887), indicating random distribution of the markers within groups. The number of the linkage groups is lower to the corresponding haploid number of chromosomes (22), therefore the species genoma was partially explored, and many areas were not still identified. / Tese importada do Alexandria
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Heterose, capacidade combinatória e divergência genética estimada por análise de marcadores RAPD em cruzamentos entre cafeeiros Catuaí (Coffea arabica L.) e híbrido de Timor / Heterosis, combining hability and genetic divergence estimated by RAPD analysis marker in crossings between coffee variety Catuaí (Coffea arabica l.) and Timor hybridFontes, José Roberto Macedo 05 March 2001 (has links)
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Previous issue date: 2001-03-05 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Neste estudo, foi utilizada uma população do programa de melhoramento do cafeeiro do Departamento de Fitopatologia da UFV, descendente de cruzamentos entre 14 linhagens de Catuaí (Vermelho e Amarelo) e 12 seleções do Híbrido de Timor. Com o objetivo de identificar plantas e matrizes superiores para utilização per si, e para serem utilizadas na formação de uma população-base destinada a programa de melhoramento intrapopulacional, realizou-se o estudo da heterose manifestada para produção na geração F 1 e da capacidade de combinação geral e específica de seus progenitores. Foi estudado um total de 71 híbridos F 1 (total de 561 plantas). Foi realizada uma análise descritiva a partir dos dados das quatro primeiras colheitas. Alguns híbridos foram avaliados também nos seis, oito e até dez anos de colheita, conforme a disponibilidade de dados. Foi realizada também uma avaliação da reação dos híbridos F 1 e RC 1 (Catuaí como progenitor recorrente) à ferrugem do cafeeiro e um estudo, através da técnica do uso de marcadores moleculares, da natureza híbrida dos genótipos da geração F 1 mais produtivos e da distância genética existente entre vários genótipos avaliados. Na avaliação da resistência genética das plantas à ferrugem foi realizado o teste em discos de folhas, inoculados com a Raça II de H. vastatrix. 11 progenitores (Híbrido de Timor: UFV 376-2; UFV 427-15; UFV 439-2; UFV 440-22; UFV 445-46; UFV 529, e Catuaí: UFV 2143-193; UFV 2143-236; UFV 2144-32; UFV 2144-35; UFV 2144-36) serviram de testemunhas para os 18 híbridos F 1 e 107 híbridos RC 1 . A avaliação foi realizada aos 49 dias após inoculação. No estudo da diversidade genética, foi analisado um total de 51 genótipos (10 progenitores Catuaí, 12 progenitores Híbrido de Timor e 29 híbridos F 1 ). Para os melhores genótipos F 1 classificados quanto à produção, foi realizado também um estudo para a certificação da natureza híbrida dos mesmos. Em ambos os estudos, a técnica do uso de marcadores moleculares RAPD foi utilizada. Através da seleção baseada nas produções dos híbridos em geração F 1 , observou-se a superioridade de produção dos híbridos H 341-11, H 429-1, H 427-2, H 418-6, H 506-3, H 505-9, H 513-5, H 419-8, H 419-10, H 511-1, H 342-8 e H 430-1. Os progenitores Catuaí Vermelho, UFV 2144-35 e UFV 2145-113, e Híbrido de Timor, UFV 378-33 e UFV 445-46, foram os melhores quanto à capacidade geral de combinação em relação à produção. Para a capacidade específica de combinação, o cruzamento UFV 2144-36 x UFV 439-2 foi o melhor nos primeiros quatro e seis anos de produção. Na produção acumulada dos oito anos, o cruzamento UFV 2148-57 x UFV 439-2 foi o melhor. O híbrido H 429 foi o que melhor expressou, em média, o seu valor heterótico. O híbrido H 287-3 apresentou heterose de 195%, calculada com base na produção acumulada dos primeiros quatro anos. Os valores de heterobeltiose confirmaram a superioridade de produção de grande parte dos híbridos obtidos nos cruzamentos realizados. Na avaliação da reação dos genótipos à ferrugem-do- cafeeiro, os progenitores Catuaí apresentaram reação de suscetibilidade, enquanto os progenitores Híbrido de Timor, com exceção do UFV 427-15, e os híbridos F 1 , com exceção do H 415-2, apresentaram-se resistentes. Dos 107 híbridos RC 1 estudados, 81 deles foram resistentes à ferrugem-do-cafeeiro. No estudo da diversidade genética, foi realizado um total de 157 reações, com 86 primers diferentes, onde 53,5% deles apresentaram polimorfismo, totalizando 108 bandas polimórficas, polimórficas/primer. Dentre com os média primers que de 2,35 apresentaram bandas maior número de bandas polimórficas estão: OPA-8, OPC-10, OPA-5 e OPA- 10. Com um limite de dissimilaridade genética de 54%, o Híbrido de Timor UFV 427-15 permaneceu no grupo das cultivares Catuaí. Onze dos doze genótipos mais produtivos na geração F 1 , tiveram sua natureza híbrida confirmada. / This study used a population of coffee breeding program of the Plant Pathology Department of the Federal University of Viçosa, descendant of crossings between 14 ancestries of 'Catuaí' with red and yellows berries and 12 selections of the Timor Hybrid. The objective was to identify coffee plants and progenitors use to per itself, and to be used in the formation of a population-base for the intrapopulational improvement program. The heterosis of the hybrids F 1 and the specific and general combining ability of their progenitors was studied. 71 hybrids F 1 were studied (total of 561 plants). A descriptive analysis from the data of the four first harvests was carried through. Some hybrids had been evaluated also in the six, eight and up to ten years of harvesting. It was also carried through an evaluation of the reaction of hybrids F 1 and RC 1 ('Catuaí' as recurrent ancestor) to the coffee rust reaction and a study, through the technique of the use of molecular markers, of the hybrid nature of the genotypes of the generation F 1 more productive and the genetic distance between some evaluated genotypes. In the evaluation of the genetic resistance of the plants to the coffee rust, the test in leaf disks, inoculated with Race II of H. vastatrix was carried through. 11 ancestors (Timor Hybrid: UFV 376-2; UFV 427-15; UFV 439-2; UFV 440-22; UFV 445-46; UFV 529, and 'Catuaí': UFV 2143-193; UFV 2143-236; UFV 2144-32; UFV 2144-35; UFV 2144-36) control plants for the 18 hybrids F 1 and 107 hybrids RC 1 . The evaluation was carried through to the 49 days after inoculation. In the study of the genetic diversity, 51 genotypes were analyzed (10 'Catuaí' ancestors, 12 Timor Hybrid ancestors and 29 hybrids F 1 ). The technique of RAPD molecular markers was used. For the certification of the hybrid nature of the best genotypes F 1 classified according berry yields the RAPD analysis was used. Twelve primers out of thirty were selected. The best hybrids as far as yield is concerned were: H 341-11, H 429-1, H 427-2, H 418-6, H 506-3, H 505-9, H 513-5, H 419-8, H 419-10, H 511-1, H 342-8 and H 430-1. The progenitors 'Catuaí', UFV 2144-35 and UFV 2145-113, and Timor Hybrid, UFV 378-33 and UFV 445-46, were the best for general combining ability in relation to the yield. For the specific combining ability, hybrids from crossing UFV 2144-36 x UFV 439-2 were the best in first four and six years of yield. In the accumulated yield of the eight years, crossing UFV 2148-57 x UFV 439-2 was the best. The hybrid H 429 was one that better expressed the heterosis value. The hybrid H 287-3 presented heterosis of 195%, calculated on the basis of the accumulated yield of first four years. The values of heterobeltiosis had confirmed the superiority of production of great part of the hybrids in the crossings. In the evaluation of the reaction of the genotypes to the coffee rust, the 'Catuaí' progenitors were susceptible while the ancestors Timor Hybrid, with exception of UFV 427-15, and the hybrids F 1 , with exception of H 415-2, were resistant. Of 107 studied hybrids RC 1 , 81 of them were resistant to the coffee rust. In the study of the genetic diversity, a total of 157 reactions, with 86 different primers were carried through, where 53,5% of them had presented polimorfic bands, totalizing 108 polimorfic bands, with 20 average of 2.35 polimorfic bands/primer. The primers that presented the greater number of polimorfic bands were: OPA-8 meets, OPC-10, OPA-5 and OPA-10. With a limit of genetic distance of 54%, the Timor Hybrid UFV 427-15 remained in the group of 'Catuaí'. Eleven of the twelve more productive genotypes in the generation F 1 , confirmed their hybrid nature. / This study used a population of coffee breeding program of the Plant Pathology Department of the Federal University of Viçosa, descendant of crossings between 14 ancestries of 'Catuaí' with red and yellows berries and 12 selections of the Timor Hybrid. The objective was to identify coffee plants and progenitors use to per itself, and to be used in the formation of a population-base for the intrapopulational improvement program. The heterosis of the hybrids F 1 and the specific and general combining ability of their progenitors was studied. 71 hybrids F 1 were studied (total of 561 plants). A descriptive analysis from the data of the four first harvests was carried through. Some hybrids had been evaluated also in the six, eight and up to ten years of harvesting. It was also carried through an evaluation of the reaction of hybrids F 1 and RC 1 ('Catuaí' as recurrent ancestor) to the coffee rust reaction and a study, through the technique of the use of molecular markers, of the hybrid nature of the genotypes of the generation F 1 more productive and the genetic distance between some evaluated genotypes. In the evaluation of the genetic resistance of the plants to the coffee rust, the test in leaf disks, inoculated with Race II of H. vastatrix was carried through. 11 ancestors (Timor Hybrid: UFV 376-2; UFV 427-15; UFV 439-2; UFV 440-22; UFV 445-46; UFV 529, and 'Catuaí': UFV 2143-193; UFV 2143-236; UFV 2144-32; UFV 2144-35; UFV 2144-36) control plants for the 18 hybrids F 1 and 107 hybrids RC 1 . The evaluation was carried through to the 49 days after inoculation. In the study of the genetic diversity, 51 genotypes were analyzed (10 'Catuaí' ancestors, 12 Timor Hybrid ancestors and 29 hybrids F 1 ). The technique of RAPD molecular markers was used. For the certification of the hybrid nature of the best genotypes F 1 classified according berry yields the RAPD analysis was used. Twelve primers out of thirty were selected. The best hybrids as far as yield is concerned were: H 341-11, H 429-1, H 427-2, H 418-6, H 506-3, H 505-9, H 513-5, H 419-8, H 419-10, H 511-1, H 342-8 and H 430-1. The progenitors 'Catuaí', UFV 2144-35 and UFV 2145-113, and Timor Hybrid, UFV 378-33 and UFV 445-46, were the best for general combining ability in relation to the yield. For the specific combining ability, hybrids from crossing UFV 2144-36 x UFV 439-2 were the best in first four and six years of yield. In the accumulated yield of the eight years, crossing UFV 2148-57 x UFV 439-2 was the best. The hybrid H 429 was one that better expressed the heterosis value. The hybrid H 287-3 presented heterosis of 195%, calculated on the basis of the accumulated yield of first four years. The values of heterobeltiosis had confirmed the superiority of production of great part of the hybrids in the crossings. In the evaluation of the reaction of the genotypes to the coffee rust, the 'Catuaí' progenitors were susceptible while the ancestors Timor Hybrid, with exception of UFV 427-15, and the hybrids F 1 , with exception of H 415-2, were resistant. Of 107 studied hybrids RC 1 , 81 of them were resistant to the coffee rust. In the study of the genetic diversity, a total of 157 reactions, with 86 different primers were carried through, where 53,5% of them had presented polimorfic bands, totalizing 108 polimorfic bands, with 20 average of 2.35 polimorfic bands/primer. The primers that presented the greater number of polimorfic bands were: OPA-8 meets, OPC-10, OPA-5 and OPA-10. With a limit of genetic distance of 54%, the Timor Hybrid UFV 427-15 remained in the group of 'Catuaí'. Eleven of the twelve more productive genotypes in the generation F 1 , confirmed their hybrid nature. 21 / Tese importada do Alexandria
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Crescimento e caracterização de pectina liase de Paenibacillus amylolyticus isolado de frutos de café (Coffea arabica L.) / Growth and characterization of pectin liase of Paenibacillus amylolyticus isolated from coffee beans (Coffea arabica L.)Paula, Evandro Marcus de 16 March 2001 (has links)
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Previous issue date: 2001-03-16 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A bactéria Paenibacillus amylolyticus, isolada de frutos de café que tiveram sua superfície devidamente desinfestada, foi cultivada em frascos Erlenmeyer de 125 mL, com 50 mL de volume de trabalho, em meio mineral suplementado com extrato de levedura 0,06% (p/v), com diferentes fontes de carbono, sempre a 0,3% (p/v) e pH 7,0, sendo a cultura incubada a 25 oC, com agitação de 150 rpm ou sem agitação. A bactéria também apresentou crescimento quando o extrato de levedura foi substituído por tiamina 50 mg L'1 e outras vitaminas do complexo B, mas nunca quando alguns desses fatores não eram adicionados ao meio mineral. Paenibacillus amylolyticus cresce na ausência de sulfato de amônio, desde que extrato de levedura 0,06% (p/v) esteja presente, porém o mesmo não se verifica quando se substitui o extrato de levedura por tiamina 50 mg L'l. O microrganismo não foi capaz de crescer em anaerobiose provocada pelo borbulhamento de nitrogênio gasoso, tanto na presença quanto na ausência de sulfato de amônio, indicando que tal bactéria não é capaz de crescer em anaerobiose e fixar nitrogênio nessa condição. P. amylolyticus é capaz de crescer em pectina como única fonte de carbono e, para tal, produz pectina liase (PL), para lise deste carboidrato. A enzima PL acumula- se no meio mais eficientemente após 24 horas de crescimento, apresentando maior especificidade por pectina cítrica, quando utilizada como substrato enzimático. A atividade ótima de PL ocorre a 40 ºC e a termoestabilidade, até 45 ºC. Entre os valores de pH avaliados, PL apresentou atividade entre pH 5,6 e 8,6, sendo o ótimo 7,9. A adição de EDTA e íons metálicos na mistura de reação mostrou pequeno efeito na atividade da enzima, e os valores de Km e Vmax aparentes foram, respectivamente, de 6,61 mg mL'1 e 1,24 X 10'7 mol min 4 mL'l. / The bacterium Paenibacillus amylolyticus, isolated from surface- sterilized coffee beans, was cultured at 25 oC, with and without agitation, in 125 mL shaker flasks containing 50 mL of mineral media (pH 7.0) supplemented with yeast extract 0.06% (w/v) and different carbon sources at a concentration of 03% (w/v). P. amylolyticus also showed growth when yeast extract was replaced with thiamin 50 mg L'1 and other B complex Vitamins, but no growth was detected when one of these substances was not added to the media. This bacterium grows in absence of ammonium sulfate when yeast extract 0.06% (w/v) is added, although growth is not detected when yeast extract is replaced with thiamin 50 mg L'l. When submitted to na anaerobic environment, through of addition of gas nitrogen, no growth was verified in a medium with and without fixed nitrogen, indicating that this organism is not capable of fixing gas nitrogen. P. amylolyticus is capable of using pectin as a sole carbon source, a result that indicates production of pectin liase (PL). The production of this enzyme is detected in higher concentrations after 24 hours of growth, showing an increased affinity, or specificity , for citn'c pectin when this is used as the enzymatic substrate. Optimum activity for PL occurs at 40oC and is thermostable for up to 45 oC. PL shows activity between pH values of 5.6 and 8.6, although pH 7.9 is best. Addition of EDTA and metal ions to the reaction mixture present a small effect in enzyme activity, and the Km and Vmax values are 6.61 mg mL'1 and 1.24 x 10"7 mol min"l mL'l, respectively. / Dissertação importada do Alexandria
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Metabolismo do nitrogênio e senescência em razão da aplicação de níquel no cafeeiro arábica / Nitrogen metabolism and senescence process in coffee plants exposed to nickelTezotto, Tiago 18 May 2015 (has links)
O nitrogênio é o nutriente exigido em maior quantidade pelo cafeeiro e o segundo mais exportado pela planta. Usualmente se aplica ureia no cafeeiro e o N desta fonte é rapidamente metabolizado e incorporado na forma de aminoácidos e amidas. A assimilação do nitrogênio é afetada por diversos micronutrientes, entre eles o níquel (Ni), por ser este um constituinte da enzima urease, responsável pela degradação da ureia. O entendimento da interação do Ni com o metabolismo do N e o processo de senescência no cafeeiro é importante para o uso eficiente do nitrogênio pelas plantas. Pouco se sabe a respeito da nutrição com Ni no metabolismo do N, na senescência foliar e na interferência na absorção e transferência de outros nutrientes. A presente pesquisa foi realizada para avaliar se a aplicação de Ni (i) interferiria na absorção e transferência de outros nutrientes, bem como na partição de biomassa do cafeeiro e; (ii) aumentaria a eficiência de uso do N, tanto pela maior degradação da ureia, via atividade da urease, quanto pelo aumento da redistribuição de reservas de nitrogênio, por meio do incremento do catabolismo da arginina; e (iii) se o fornecimento de Ni atrasaria a senescência foliar, pela diminuição da produção de etileno endógeno na planta, o que aumentaria a duração foliar. A aplicação de Ni reduziu a biomassa do cafeeiro somente no maior teor do elemento disponível no solo (105 mg DM-3), e essa redução na biomassa afetou a concentração e acúmulo, principalmente, dos macronutrientes (N, P, K, Ca e Mg). Com relação aos micronutrientes metálicos (Cu, Fe, Mn e Zn), o incremento gradual no teor de Ni disponível, reduziu ou elevou gradualmente a concentração desses micronutrientes no cafeeiro. Os coeficientes de eficiência de uso de N pelo cafeeiro foram afetados somente em razão do nível de N, sem alteração em função do Ni disponível no solo. A aplicação de Ni no solo até teores de 60 mg dm-3 não afetou o crescimento da planta de cafeeiro, mas aumentou a retenção foliar no nível deficiente de N. O Ni reduziu a biossíntese de etileno na planta, apesar das concentrações de MDA e prolina aumentarem com o teor disponível de Ni no solo na pré-antese. Com relação ao N, houve incremento na redistribuição de N dos órgãos de reserva (ramo) para atender a demanda de folha e fruto. / Nitrogen is the nutrient required in greatest quantity by the coffee and the second most exported within the plant. Usually, N is applied as urea to coffee and urea-N is rapidly metabolized and incorporated into amino acids and amides. The assimilation of N is affected by several micronutrients, including nickel (Ni). Ni is a constituent of urease, the sole enzyme responsible for degradation (and subsequent assimilation) of urea. Understanding Ni interaction with N metabolism and the aging process is important for the efficient use of nitrogen by coffee, and by plants in general. Little is known about Ni nutrition as it relates to N metabolism in leaf senescence and its possible interference in the absorption and transfer of other nutrients. The present study was conducted in coffee to assess whether the application of Ni (i) interferes with the absorption and transfer of other nutrients as well as biomass partitioning; (Ii) increases the nitrogen use efficiency, both for greater degradation of urea via urease activity, and increased redistribution of nitrogen reserves by increased catabolism of arginine; and (iii) delays leaf senescence by decreasing endogenous ethylene production, thereby increasing leaf duration. Ni application reduced biomass of coffee only at the highest level of soil availability (105 mg dm-3). This level also brought about the reduction in biomass concentration and accumulation of macronutrients (N, P, K, Ca and mg). With respect to mineral micronutrients (Cu, Fe, Mn and Zn), gradual increases in available Ni content, either reduced or gradually increased the concentration of these micronutrients. N-use efficiency ratios in coffee were affected only by variations in management of N, and not by changes in available soil Ni . Soil Ni applications to 60 mg dm-3 did not affect the growth of the coffee plant, but increased foliar retention under N limitation. Ni reduced plant ethylene biosynthesis, in spite of the concentrations of MDA and proline increasing rising with increasing soil Ni during pre-anthesis. As Ni levels rose, there was an increase in the redistribution of N of storage organs (branch) to meet the demand of leaf and fruit.
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Metabolismo do nitrogênio e senescência em razão da aplicação de níquel no cafeeiro arábica / Nitrogen metabolism and senescence process in coffee plants exposed to nickelTiago Tezotto 18 May 2015 (has links)
O nitrogênio é o nutriente exigido em maior quantidade pelo cafeeiro e o segundo mais exportado pela planta. Usualmente se aplica ureia no cafeeiro e o N desta fonte é rapidamente metabolizado e incorporado na forma de aminoácidos e amidas. A assimilação do nitrogênio é afetada por diversos micronutrientes, entre eles o níquel (Ni), por ser este um constituinte da enzima urease, responsável pela degradação da ureia. O entendimento da interação do Ni com o metabolismo do N e o processo de senescência no cafeeiro é importante para o uso eficiente do nitrogênio pelas plantas. Pouco se sabe a respeito da nutrição com Ni no metabolismo do N, na senescência foliar e na interferência na absorção e transferência de outros nutrientes. A presente pesquisa foi realizada para avaliar se a aplicação de Ni (i) interferiria na absorção e transferência de outros nutrientes, bem como na partição de biomassa do cafeeiro e; (ii) aumentaria a eficiência de uso do N, tanto pela maior degradação da ureia, via atividade da urease, quanto pelo aumento da redistribuição de reservas de nitrogênio, por meio do incremento do catabolismo da arginina; e (iii) se o fornecimento de Ni atrasaria a senescência foliar, pela diminuição da produção de etileno endógeno na planta, o que aumentaria a duração foliar. A aplicação de Ni reduziu a biomassa do cafeeiro somente no maior teor do elemento disponível no solo (105 mg DM-3), e essa redução na biomassa afetou a concentração e acúmulo, principalmente, dos macronutrientes (N, P, K, Ca e Mg). Com relação aos micronutrientes metálicos (Cu, Fe, Mn e Zn), o incremento gradual no teor de Ni disponível, reduziu ou elevou gradualmente a concentração desses micronutrientes no cafeeiro. Os coeficientes de eficiência de uso de N pelo cafeeiro foram afetados somente em razão do nível de N, sem alteração em função do Ni disponível no solo. A aplicação de Ni no solo até teores de 60 mg dm-3 não afetou o crescimento da planta de cafeeiro, mas aumentou a retenção foliar no nível deficiente de N. O Ni reduziu a biossíntese de etileno na planta, apesar das concentrações de MDA e prolina aumentarem com o teor disponível de Ni no solo na pré-antese. Com relação ao N, houve incremento na redistribuição de N dos órgãos de reserva (ramo) para atender a demanda de folha e fruto. / Nitrogen is the nutrient required in greatest quantity by the coffee and the second most exported within the plant. Usually, N is applied as urea to coffee and urea-N is rapidly metabolized and incorporated into amino acids and amides. The assimilation of N is affected by several micronutrients, including nickel (Ni). Ni is a constituent of urease, the sole enzyme responsible for degradation (and subsequent assimilation) of urea. Understanding Ni interaction with N metabolism and the aging process is important for the efficient use of nitrogen by coffee, and by plants in general. Little is known about Ni nutrition as it relates to N metabolism in leaf senescence and its possible interference in the absorption and transfer of other nutrients. The present study was conducted in coffee to assess whether the application of Ni (i) interferes with the absorption and transfer of other nutrients as well as biomass partitioning; (Ii) increases the nitrogen use efficiency, both for greater degradation of urea via urease activity, and increased redistribution of nitrogen reserves by increased catabolism of arginine; and (iii) delays leaf senescence by decreasing endogenous ethylene production, thereby increasing leaf duration. Ni application reduced biomass of coffee only at the highest level of soil availability (105 mg dm-3). This level also brought about the reduction in biomass concentration and accumulation of macronutrients (N, P, K, Ca and mg). With respect to mineral micronutrients (Cu, Fe, Mn and Zn), gradual increases in available Ni content, either reduced or gradually increased the concentration of these micronutrients. N-use efficiency ratios in coffee were affected only by variations in management of N, and not by changes in available soil Ni . Soil Ni applications to 60 mg dm-3 did not affect the growth of the coffee plant, but increased foliar retention under N limitation. Ni reduced plant ethylene biosynthesis, in spite of the concentrations of MDA and proline increasing rising with increasing soil Ni during pre-anthesis. As Ni levels rose, there was an increase in the redistribution of N of storage organs (branch) to meet the demand of leaf and fruit.
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Zoneamento agroclimatológico para a cultura do café conilon (Coffea canephora L.) e arábica (Coffea arabica L.), na bacia do Rio ltapemirim, ES / Climatological zoning for Conilon (Coffea canephora L.) and Arabic coffee (Coffea Arabica L.) tree plantation in the Itapemirim river basin, ES, BrazilSantos, Alexandre Rosa dos 12 July 1999 (has links)
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Previous issue date: 1999-07-12 / Com o objetivo de avaliar as áreas aptas, restritas e inaptas para o cultivo do café conilon (Coffea canephora L.) e arábica (Coffea arabica L.), utilizou-se o soltware ldrisi (versão 2.0 para Windows) para o zoneamento agroclimatológico e a análise da influência dos elementos climáticos sobre a produtividade para as duas espécies de café cultivadas na Bacia do Rio Itapemirim, situada no sul do Estado do Espírito Santo. Os resultados mostraram que o café conilon pode ser cultivado em 38,78% da área, podendo apresentar alguma restrição por temperatura, deficiência hídrica e classe de solo; que 7,32% da área total é considerada totalmente apta; e que 53,9% desta área é considerada inapta para o cultivo do café conilon. Os resultados obtidos para o café arábica mostraram que ele pode ser cultivado em 25,02% da área, podendo apresentar alguma restrição por temperatura, deficiência hídrica e classe de solo; que 53,56% da área total e' considerada totalmente apta; e que 21,42% desta área é considerada inapta para o cultivo do café arábica. Os municípios produtores de café conilon que apresentaram maior produtividade estão localizados na região central da bacia, exatamente nas áreas totalmente aptas ou aptas com alguma restrição, e os que apresentaram menor produtividade estão localizados nas áreas mais próximas do litoral, consideradas inaptas por deficiência hídrica ou classe de solo. Da mesma forma, os municípios produtores de café arábica que apresentaram maior produtividade estão localizados nas direções oeste e noroeste da bacia, em áreas aptas ou aptas com alguma restrição; já os municípios que apresentaram menor produtividade estão localizados em áreas de maior elevação, inaptas por temperatura, e nas áreas próximas do litoral, que são inaptas por deficiência hídrica e classe de solo. A diferença ocorrida entre as áreas propícias para o cultivo do café conilon e arábica pode ser explicada pelo fato de a região apresentar o relevo bastante montanhoso, com altitudes elevadas e, consequentemente, temperaturas mais favoráveis para o cultivo do café arábica. / A climatological zoning was established to determine the suitable, restricted and unsuitable areas for Conilon (Coffea canephora L.) and Arabic coffee (Coffea Arabíca L.) tree plantation. A raster geographical information system software was used in order to get the homogeneous climatic areas, and to analyse the influence of the climatic elements on the yield response for two coffee tree species planted at Itapemirim river basin area, in the Southern part of the State of Espirito Santo, Brazil. The results showed that the Conilon coffee can be planted in 38.78% of the basin, but with some restriction due to temperature, soil water deficit and soil type; 7.32% of the total area are considered totally suitable; and 53.9% of the area are unsuitable for Conilon coffee tree plantation. The results obtained for Arabic coffee showed that it can be planted in 25.02% of the area, but with some restriction due to temperature conditions, soil water deficit and soil type; 53.56% of the total area are totally suitable; and 21.42% of the area are unsuitable. The municipal districts that presented larger productivity of Conilon coffee are located in the central region of the Itapemirim river basin, which correspond to areas that are climatically suitable or suitable with some restriction. The areas that presented smaller productivity are located near the coast, which is unsuitable due to soil water deficit and soil type. Moreover, the municipal districts that are producers of Arabic coffee presented larger productivity when located in the west and northwest side of the basin, which are suitable or suitable with some restriction. The districts that presented smaller productivity are located in areas of higher elevation, and they are unsuitable because of low temperature conditions, and in the areas close to the coast, which are unsuitable due to soil water deficit and soil type. The topographic conditions of high altitude showed to be more adequate for Arabic coffee plantation mainly due to more favorable temperature conditions for that coffee.
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Análise radiográfica associada com o desempenho germinativo e determinação do vigor de sementes de café utilizando imagens digitalizadas de plântulas / Radiographic analysis associated with germination performance and vigor evaluation of coffee seeds using digitized images of seedlingsTrujillo Samboni, Heiber Andres 26 June 2018 (has links)
A análise radiográfica tem sido eficiente na identificação das principais alterações na morfologia interna de sementes e, juntamente com análise de imagens digitalizadas de plântulas, está sendo cada vez mais utilizada em programas de controle de qualidade de sementes devido à sua praticidade, objetividade e rapidez na obtenção dos resultados. Apesar dessas vantagens, ainda não existem pesquisas comprovando a eficiência dessas técnicas para análise de sementes de café. Assim, esta pesquisa teve como objetivos avaliar a morfologia interna de sementes de café (Coffea arabica L.) por meio da análise de imagens radiográficas e a sua relação com o desempenho germinativo e testar a eficiência da análise de imagens digitalizadas de plântulas pelo Seed Vigor Imaging System (SVIS®) na determinação do vigor, comparativamente com os testes convencionalmente utilizados. Foram utilizadas sementes dos cultivares Bourbon e Catucaí 20/15, cada cultivar representado por seis lotes. A pesquisa foi conduzida em dois experimentos. No experimento I foram avaliadas imagens radiográficas para identificação das principais alterações na morfologia interna das sementes e sua relação com o desempenho germinativo por meio do teste de emergência de plântulas. O experimento II foi realizado em duas épocas de avaliação e o vigor foi determinado por meio das avaliações de primeira contagem de germinação, envelhecimento acelerado, condutividade elétrica, velocidade de emissão de raiz primária e análise de imagens digitalizadas de plântulas com o SVIS®. Concluiu-se que a análise de imagens radiográficas é eficiente na identificação das principais alterações na morfologia interna das sementes, relacionadas com malformações, danos por deterioração de tecidos e danos ocasionados pela broca-do-café, permitindo relacionar a ocorrência destes com o desempenho germinativo dos lotes de sementes. A análise de imagens digitalizadas de plântulas aos vinte dias de idade pelo SVIS® é eficiente na avaliação do vigor de lotes de sementes de café. / Radiographic analysis has been efficient in identifying the main changes in the internal morphology of seeds and, together with the digital image analysis of seedlings has been increasingly used in seed quality control programs due to its practicality, objectivity and rapid results. Despite these advantages, there are still no studies demonstrating the efficiency of these techniques for coffee seed analysis. The objective of this research was to evaluate the internal morphology of coffee seeds (Coffea arabica L.) by radiographic image analysis and their relation with germination performance. Furthermore, this research aimed to evaluate the efficiency of the Seed Vigor Imaging System (SVIS®) in determining seed vigor from digital seedling images in comparison to conventionally vigor tests. Seeds of the cultivars Bourbon and Catucaí 20/15 were used being each one represented by six seed lots. The research was conducted in two experiments. In experiment I radiographic images were taken to identify the main changes in the internal morphology of the seeds and stablish a relationship with the germination performance by the seedling emergence test. The experiment II was carried out in two evaluation periods and seed vigor was determined by the germination first count, accelerated aging, electrical conductivity, primary root emission velocity and analysis of scanned seedlings images by SVIS®. It was concluded that radiographic analysis is efficient in identifying internal morphology alterations in the seeds related to malformations, damages by tissue deterioration and damages caused by coffee borer, allowing to relate the occurrence of these problems with germination performance. The digitized analysis of 20-day-old seedlings by SVIS® is efficient in evaluating the vigor of coffee seeds.
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Cobertura florestal vs. isolamento: efeito da paisagem sobre a provisão do serviço de polinização ao café. / Forest cover vs. forest isolation: the landscape effect on pollination service supply, demand and flow to coffee cropGonzalez Chaves, Adrian David 29 July 2016 (has links)
Na medida em que as demandas agrícolas continuam se expandido, aumenta a necessidade de que a produção agrícola garanta a conservação da diversidade e a provisão de serviços ecossistêmicos. O intuito do trabalho é avaliar independentemente o efeito da distancia aos fragmentos florestais e a cobertura florestal numa escala local. Quantificamos a diversidade de abelhas e a formação de frutos em 24 cultivos de café dentro de paisagens complexas de 2km de radio, compostas por mosaico de usos da terra, café, Mata Atlântica (20 - 27%) e outros usos. Adicionalmente estimamos a contribuição das espécies na formação de frutos depois de uma visita única, em cinco dos 24 pontos amostrais. No total foram identificadas 31 abelhas que visitam o café, a maioria abelhas sem ferrão (Meliponini) e abelhas da família Halictidae. No existiu diferencia na formação de frutos depois das visitas únicas das diversas especies de abelhas, o que sugere que há uma complementaridade na provisão do serviço. No entanto, a maior produtividade esteve associada à abundância de abelhas nativas. Em geral, 8% foi o incremento associado ao papel das abelhas o qual diminuiu com aumento da distancia para os fragmentos de mata assim como também conforme aumentava a quantidade de café na escala local (400 m de raio no entorno do ponto amostral). O efeito negativo da distancia aos fragmentos reforça a importância da vegetação natural em prover diversidade de abelhas e por tanto o serviço de polinização. O efeito negativo da cobertura de café sobre a frutificação sugere que há um excesso de demanda que excede a capacidade dos polinizadores de prover o serviço dentro de paisagens complexas. Nossos resultados mostram que a estrutura da paisagem afeta a densidade, riqueza e composição de espécies de polinizadores. Por tanto recomendamos como estratégia para incrementar a produção de café, sem necessidade de aumentar a cobertura florestal, manegar as áreas agrícolas para aumentar a dispersão entre fragmentos florestais e plantios de café, com o intuito de criar paisagens mais fragmentadas que facilitem o fluxo de polinizadores ao café / As the demands on agricultural lands continue to expand, effective strategies are urgently needed to manage agricultural production to guarantee biodiversity conservation and ecosystem service provision. Here we assessed independently the effect of forest isolation and local forest cover over bee diversity and on the provision of pollination service to coffee. We quantified bee diversity of flower visitors and fruit set in 24 coffee fields within three complex landscape of 2km radius surrounded by mosaic of coffee plantations, Atlantic forest fragments (20 - 27%), pastures and other lands uses. Additionally, we estimated species contribution to fruit set after single visit in five of the 24 coffee sites. In total we identified 31 bee species visiting coffee flowers, most being stingless bees (Meliponini tribe) and sweat bees (Halictidae). The absence of difference in fruit set after single visit by Apis and natives bee suggest that service complementation. Although, higher abundances of sweat bees and stingless bees were positively related to fruit set. Coffee fruit set was overall 8% higher in the presence of bees, and responded negatively to isolation from forest fragments and to high coffee cover at a local landscape scale (400 m radius landscape surrounding each sampled coffee bush). The negative association between isolation and fruit set reinforces the importance of natural vegetation to enhance bee diversity and therefore the provision of pollination service. The negative effect of coffee cover on fruit set suggests that the service demand can surpass pollinators\' capacity to provide service within complex landscape. Our results provide clear evidences that landscape structure can affect the abundance, richness and composition of pollinators\' species, and thus can indirectly regulate the provision of pollination service. Therefore we recommend, as a strategy to increase coffee yields without necessarily expanding forest cover, to manage agricultural landscapes in order to increase interspersion between forest fragments and coffee plantation thus a more patchy landscape mosaic that may facilitate pollinators flows to coffee crop
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Análise radiográfica associada com o desempenho germinativo e determinação do vigor de sementes de café utilizando imagens digitalizadas de plântulas / Radiographic analysis associated with germination performance and vigor evaluation of coffee seeds using digitized images of seedlingsHeiber Andres Trujillo Samboni 26 June 2018 (has links)
A análise radiográfica tem sido eficiente na identificação das principais alterações na morfologia interna de sementes e, juntamente com análise de imagens digitalizadas de plântulas, está sendo cada vez mais utilizada em programas de controle de qualidade de sementes devido à sua praticidade, objetividade e rapidez na obtenção dos resultados. Apesar dessas vantagens, ainda não existem pesquisas comprovando a eficiência dessas técnicas para análise de sementes de café. Assim, esta pesquisa teve como objetivos avaliar a morfologia interna de sementes de café (Coffea arabica L.) por meio da análise de imagens radiográficas e a sua relação com o desempenho germinativo e testar a eficiência da análise de imagens digitalizadas de plântulas pelo Seed Vigor Imaging System (SVIS®) na determinação do vigor, comparativamente com os testes convencionalmente utilizados. Foram utilizadas sementes dos cultivares Bourbon e Catucaí 20/15, cada cultivar representado por seis lotes. A pesquisa foi conduzida em dois experimentos. No experimento I foram avaliadas imagens radiográficas para identificação das principais alterações na morfologia interna das sementes e sua relação com o desempenho germinativo por meio do teste de emergência de plântulas. O experimento II foi realizado em duas épocas de avaliação e o vigor foi determinado por meio das avaliações de primeira contagem de germinação, envelhecimento acelerado, condutividade elétrica, velocidade de emissão de raiz primária e análise de imagens digitalizadas de plântulas com o SVIS®. Concluiu-se que a análise de imagens radiográficas é eficiente na identificação das principais alterações na morfologia interna das sementes, relacionadas com malformações, danos por deterioração de tecidos e danos ocasionados pela broca-do-café, permitindo relacionar a ocorrência destes com o desempenho germinativo dos lotes de sementes. A análise de imagens digitalizadas de plântulas aos vinte dias de idade pelo SVIS® é eficiente na avaliação do vigor de lotes de sementes de café. / Radiographic analysis has been efficient in identifying the main changes in the internal morphology of seeds and, together with the digital image analysis of seedlings has been increasingly used in seed quality control programs due to its practicality, objectivity and rapid results. Despite these advantages, there are still no studies demonstrating the efficiency of these techniques for coffee seed analysis. The objective of this research was to evaluate the internal morphology of coffee seeds (Coffea arabica L.) by radiographic image analysis and their relation with germination performance. Furthermore, this research aimed to evaluate the efficiency of the Seed Vigor Imaging System (SVIS®) in determining seed vigor from digital seedling images in comparison to conventionally vigor tests. Seeds of the cultivars Bourbon and Catucaí 20/15 were used being each one represented by six seed lots. The research was conducted in two experiments. In experiment I radiographic images were taken to identify the main changes in the internal morphology of the seeds and stablish a relationship with the germination performance by the seedling emergence test. The experiment II was carried out in two evaluation periods and seed vigor was determined by the germination first count, accelerated aging, electrical conductivity, primary root emission velocity and analysis of scanned seedlings images by SVIS®. It was concluded that radiographic analysis is efficient in identifying internal morphology alterations in the seeds related to malformations, damages by tissue deterioration and damages caused by coffee borer, allowing to relate the occurrence of these problems with germination performance. The digitized analysis of 20-day-old seedlings by SVIS® is efficient in evaluating the vigor of coffee seeds.
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Avaliação de diferentes combinações de tempo de revolvimento, em secador de camada fixa para café / Assessment of different revolving time combinations on coffee grains drying using a fixed-bed dryerGreco, Marcelo 27 September 2006 (has links)
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Previous issue date: 2006-09-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This assignment aimed to value the energetic efficiency on coffee drying (Coffea Arabica, L.), with different combinations of time revolvment on a fix layer dryer. The experiment was developed on July, 2004 in Jesuitas city, Paraná. The dryer was compound of: a drying chamber with a capacity to 4,5 m3 of grains, chamber plenum with volum of 2,9 m3, fan with leakage of 473,2 m3 mim-1, two motors with potency of 2 cv (one for the drive of the fan and another one for the drive of the revolvment system) and mechanical system with shovels, that kept the product in horizontal rotatory revolvment. The grain´s contents of damp were gotten by the standard method of greenhouse 105±1ºC for 24 hours. The sample´s collection was carried out with a collector segmented on four different points of the drying chamber at each two hours. The temperature and the air´s damp were gotten through digital thermhigrometer, installed in a meteorological shelter. The drying air´s temperature was 75ºC. The ventilation and the drying kept it continuous during the test, having as treatment the time´s interval and revolvment of one hour, two hours, three hours and continuous revolvment. It was observed the revolvment with intervals of three hours promoted the smaller energy electric (17,11 kWh) and firewood consume (208,25 kg). The average of the energetic efficiency between the treatments was 12,30 MJ kg--1. for the model of dryers used it is recommended the utilisation of the revolvment system with intervals of three hours and continuous dryer, considering that had not been difference in the final quality of the product in sensorial analysis / O presente trabalho objetivou avaliar a eficiência energética na secagem de café (Coffea arabica, L.), com diferentes combinações de tempo de revolvimento, em secador de camada fixa. O experimento foi desenvolvido no mês de julho de 2004, no município de Jesuítas-PR. O secador foi composto por: câmara de secagem com capacidade para 4,5m³ de grãos, câmara plenum com volume 2,9m³, ventilador com vazão de 473,2m³ mim-1, dois motores com potência de 2cv (um para o acionamento do ventilador e outro para acionamento do sistema de revolvimento) e sistema mecânico com pás, que mantinha o produto em revolvimento rotatório horizontal. Os teores de umidade dos grãos foram obtidos pelo método padrão de estufa 105±1ºC por 24 horas. A coleta de amostras foi realizada com um coletor segmentado em quatro diferentes pontos da câmara de secagem a cada duas horas. A temperatura e umidade do ar foram obtidas mediante o uso de termohigrômetro digital instalado em abrigo meteorológico. A temperatura do ar de secagem foi de 75oC. A ventilação e secagem mantiveram-se contínuas no teste, tendo como tratamentos os intervalos de tempo e revolvimento de: uma hora; duas horas; três horas e revolvimento contínuo. Observou-se que o revolvimento com intervalos de três horas promoveu o menor consumo de energia elétrica (17,11kWh) e de lenha (208,25kg). A média da eficiência energética entre os tratamentos foi de 12,30MJ kg--1. Para o modelo de secador utilizado recomenda-se a utilização do sistema de revolvimento com intervalos de três horas e secagem contínuas, uma vez que não foram observadas diferenças na qualidade final do produto em análise sensorial
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