Cette thèse propose d'identifier les effets de l'évaluation dans les établissements d'enseignement supérieur en France. Les questions de notre recherche se sont centrées autour des effets de l'autoévaluation (« évaluation interne ») proposée par le Comité national d'évaluation (CNE) à partir du guide d'évaluation interne le Livre des références (2003). Une étude de terrain, à base d'entretiens auprès de 37 responsables de 17 établissements d'enseignement supérieur évalués par cette procédure, examine les effets obtenus. Les responsables d'établissements ont exprimé librement ce qu'ils ont vécu pendant et après ces évaluations, quels en ont été les effets, quelle est leur position concernant la procédure et le guide d'évaluation utilisé. Les cadres de nos analyses ont été les sciences de l'éducation (pour l'« évaluation » et le système d'enseignement supérieur) et la sociologie des organisations (pour l'organisation et le fonctionnement des institutions publiques, universités et autres). On conclue sur la situation actuelle de l'évaluation institutionnelle : la création de la nouvelle Agence d'évaluation de la recherche et de l'enseignement supérieur (AERES, 2007), et le passage d'évaluations « formatives » développées par les CNE, à des évaluations « sommatives ». Les établissements sont mis devant de nouvelles responsabilités centrées, non sur les processus qu'ils mettent en oeuvre, mais sur les résultats à obtenir.