Made available in DSpace on 2013-08-07T18:41:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000432578-Texto+Completo-0.pdf: 7523354 bytes, checksum: fb90e3b4e65279b64dfbdb3b93e8f365 (MD5) Previous issue date: 2011 / The consumption has been a scourge of mankind since ancient times. This illness have been charged a high price in human lives, so many efforts have been made in order to defeat the Mycobacterium tuberculosis. The complete genomics sequence of Mycobacterium tuberculosis opened a new era and had a major impact in our understanding of this pathogen and also in research for microbial drugs. The researches could identify genes and later validate the metabolic pathways. The better understanding of metabolic pathways present in Mycobacterium tuberculosis corresponds to a first step and configures a possibility of identification of new molecular targets that could be derail the bacilli. However, there is much more to do, since of the discovery of rifampicin, a first-line drug used effectively against TB, none new chemotherapy has been released. TB is nowadays responsible for two million of deaths/year and is a global emergency which needs to be urgently repressed. The present work aim to realize structural analysis of the enzyme Cytidine Deaminase (CDA; EC 3. 5. 4. 5) from Mycobacterium tuberculosis associated with substrates and products, allying techniques such as molecular docking and dynamics simulations. / A tuberculose tem sido um flagelo da humanidade desde os tempos antigos. Esta doença tem cobrado um preço alto em vidas humanas, por esta razão muitos esforços tem sido feitos com o intuito de derrotar o Mycobacterium tuberculosis. A sequência genômica do Mycobacterium tuberculosis deu início a uma nova era e foi de grande impacto para o presente conhecimento deste patógeno como também na pesquisa de drogas anti-microbiais. Com estes avanços foi possível identificar genes e mais tarde validar vias metabólicas. O melhor entendimento das vias metabólicas presentes no Mycobacterium tuberculosis corresponde ao primeiro passo e configura uma possibilidade de identificação de novos alvos moleculares que possam erradicar o bacilo. Entretanto, ainda há muito a fazer, desde a descoberta da Rifampicina, a droga de primeira linha efetivamente utilizada contra TB, nenhuma nova droga quimioterápica foi identificada. Nos dias de hoje, a TB é responsável pela morte de dois milhões de pessoas por ano, sendo considerada uma emergência global, a qual precisa ser urgentemente erradicada. O presente projeto tem o objetivo de realizar a análise estrutural da enzima Citidina Deaminase (CDA; EC 3. 5. 4. 5) de Mycobacterium tuberculosis associada com seus substratos e produtos, aliando técnicas de Dinâmica e Docagem molecular.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-04T16:49:40Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1298895 bytes, checksum: 72e4c92a5bd8740f6d06d50d7527f588 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-04T16:49:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1298895 bytes, checksum: 72e4c92a5bd8740f6d06d50d7527f588 (MD5) Previous issue date: 2015-03-05 / O setor suinícola brasileiro tem enfrentado nos últimos anos, barreiras para exportação da carne, principalmente relacionadas a questões sanitárias e ao bem-estar animal. Em relação às questões sanitárias, grande destaque tem sido dado às parasitoses intestinais causadas por helmintos e às falhas no processo de vermifugação decorrentes da resistência a antiparasitários. Portanto, é crescente a necessidade de se estudar o perfil epidemiológico dos parasitas que acometem os animais e a partir daí avaliar estratégias de controle alternativos e sustentáveis.O objetivo desse trabalho foi avaliar métodos alternativos de controle para Ascaris suum na produção de suínos. O trabalho foi dividido em quatro estudos, realizados em etapas distintas. No primeiro objetivou-se avaliar a epidemiologia do A. suum em rebanhos suinícolas localizado na micro-região de Ponte Nova, na Zona da Mata de Minas Gerais - Brasil. No segundo ensaio, foi avaliada a constituição fitoquímica do extrato aquoso produzido a partir das folhas da planta Piptadenia gonoacantha, sua açãosobre helmintos Panagrellussp. e sobre os parâmetros bioquímicos, hematológicos e histológicos de camundongos tratados por 10 dias consecutivos com diferentes doses do extrato.No terceiro, foram avaliadas soluções saturadas preparadas com quatro sais diferentes (NaCl, MgSO 4 , NaNO 3, ZnSO 4 ) e uma solução de açúcar, na realização da técnica de OPG (técnica de McMaster) em fezes de suínos, contaminadas com ovos de A. suum. E por último avaliou-se a atividade ovicida in vitro de diferentes concentrações de clamidósporos e de diferentes isolados fúngicos de Pochonia chlamydosporia(VC1 e VC4) sobre ovos de A. suum.Para o estudo epidemiológico,foram avaliados 108.073 fígados de suínos, abatidos durante o período de janeiro de 2011 a junho de 2013, quanto à presença de lesões hepáticas decorrentes da migração larval deA. suum, sendo9,75% (10.535 ixanimais) positivos.O levantamento epidemiológico demonstrou ineficiência dos protocolos de vermifugação utilizados e necessidade do desenvolvimento de xestratégiasalternativas de controle para este parasita na produção. No estudo com a planta, a análise fitoquímica revelou a presença de flavonóides, compostos fenólicos, taninos, antraquinona, saponinas, cumarinas, heterosídeos e cardiotônicos. A atividade anti-helmíntica in vitro de diferentes preparações do extrato aquoso foi demonstrada e sua alta eficácia justifica a sua utilização no controle de helmintos gastrointestinais de animais. De acordo com os parâmetros avaliados, a mesma se mostrou segura e com baixa toxicidade, possibilitando o avanço para a realização de estudos clínicos, a fim de comprovar possíveis benefícios em um programa de controle alternativo e sustentável para as parasitoses que acomentem os suínos.No terceiro trabalho, as cinco soluções estudadas foram capazes de flutuar ovos, sendo que a solução de nitrato de sódio (densidade 1.20) foi mais eficiente do que as demais (1533,33), e as soluções de açúcar e sulfato de zinco foram as que recuperaram menor quantidade de ovos. Na utilização de clamidósporos do P. chlamydosporia (VC1 e VC4) para a destruição de ovos de A. suum, in vitro, o maior efeito sobre os ovos, ou seja, efeito tipo 2, ocorreu na concentração de 1.000 clamidósporos por placa, apresentando 20.0% (VC4) e 7,33% (VC1) de ovos danificados.Estratégias alternativas e promissoras existem para detecção e controle de A. suum na produção de suínos. Contudo, mais testes devem ser realizados com a finalidade de aprimorar tais alternativas para que as mesmas possam ser utilizadas a campo, de maneira segura, dentro de um sistema intensivo de produção de suínos. / The Brazilian pig industry has faced in recent years, barriers to export of meat, mainly related to health issues and animal welfare. With regard to health issues, great emphasis is being given to intestinal helminth parasites and failures deworming process arising from resistance to these antiparasitic drugs. Therefore, there is a growing need to study the epidemiology of parasites that affect animals and from there to evaluate alternative and sustainable control strategies.The aim of this study was to evaluate alternative control methods to Ascaris suum in swine production. The work was divided into four studies carried out in different stages. The first objective was to evaluate the epidemiology of A. suum in pig herds located in Ponte Nova micro-region, the Zona da Mata of Minas Gerais - Brazil. In the second assay, was evaluated the phytochemistryconstitution of the aqueous extract made from the leaves of the plant Piptadenia gonoacantha, its action on helminthes Panagrellus sp. and on biochemical, hematological and histological parameters of mice treated for 10 consecutive days with different dosages of extract. In the third, saturated solutions prepared with four different salts were evaluated (NaCl, MgSO 4 , NaNO 3 , ZnSO 4 ) and a sugar solution, in performing the FEC technique (McMaster technique) in pig faeces, infected with Ascaris suumeggs. Finally, was evaluated the in vitro ovicidal activity of different concentrations of chlamydospores and different fungal isolates of P. chlamydosporia (VC1 and VC4) on A. suum eggs. For epidemiological evaluation, were evaluated 108 073 pigs slaughtered during the period January 2011 to June 2013, when possible liver damage due to the presence of A. suum and 9.75% (10,535 animals) were positive for the injury.The epidemiological survey showed inefficiency of used worming protocols and the need to develop and / or review of control strategies for this parasite in production. In the study with the plant,phytochemical analysis revealed the presence of flavonoids, phenolics, tannins, anthraquinone, saponins, coumarins, and cardiotonic glycosides.According to xithese parameters the same proved to be safe and low toxicity, enabling breakthrough for conducting clinical studies in order to demonstrate possible benefits and hence its use as a tool within an alternative control program and sustainable control for parasites that acomentem pigs. The anthelmintic activity in vitro of the aqueous extract was demonstrated its high efficacy and justifies its use in the control of gastrointestinal helminths of animals.In third study all five solutions were capable of floating eggs, and sodium nitrate solution (density 1.20) was more effective than the others (1533.33), and sugar and zinc sulfate solutions were to recover the smaller amount of eggs. When using chlamydospores of the fungus P. chlamydosporia (VC1 and VC4) for the destruction of Ascaris suum eggs in vitro the greatest effect on the eggs, or type 2 effect occurred at a concentration of 1.000 chlamydospores per plate, with 20.0% (VC4) and 7.33% (VC1) of damaged eggs. Alternative and promising strategies exist for detection and control of Ascaris suum in swine production. However further tests should be performed, in order to enhance such alternatives so that they can be used in the field safely within an intensive system of pig production.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-03-16T11:36:37Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1129168 bytes, checksum: bd7fe00d19a030146a8ff280ce2feafd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-16T11:36:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1129168 bytes, checksum: bd7fe00d19a030146a8ff280ce2feafd (MD5) Previous issue date: 2016-08-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A mastite bovina é uma enfermidade de grande ocorrência em rebanhos leiteiros de todo o mundo, constituindo assim, um cenário preocupante, devido aos impactos na saúde pública e também na economia dos países, principalmente o Brasil, pois é um dos maiores produtores de leite. Concomitantemente à ocorrência da mastite, é crescente o número de isolados bacterianos causadores desta doença que têm apresentado resistência antimicrobiana às mais diversas substâncias farmacológicas, principalmente, devido à utilização indiscriminada destas drogas. A investigação de novas moléculas com potencial antimicrobiano, assim como o uso de associações com as drogas tradicionais, tornou-se de grande necessidade. Este trabalho teve como objetivo, investigar a ação antimicrobiana de duas substâncias bioativas, a gutiferona-A (M11) e 7- epiclusianona (M6), sobre isolados de campo, Streptococcus uberis (Su959) e Streptococcus agalactiae (Sa4605) obtidos de leite de animais com mastite. Realizaram-se testes para definição da Concentração Inibitória Mínima (CIM) dos antimicrobianos sintéticos e das substâncias bioativas, as quais variaram a de 0,6 a 125 μg/mL. Foi confirmado o potencial antimicrobiano destes últimos, além da ineficácia da ampicilina e gentamicina no controle da multiplicação de ambos os isolados. Após esta constatação, foi investigada a presença de interações sinérgicas, utilizando o método Checkerboard a partir de combinações de M11 e M6 com ampicilina e gentamicina. Dentre oito associações determinadas, seis apresentaram interação sinérgica positiva, evidenciando a recuperação e potencialização da ação dos antimicrobianos sintéticos frente aos isolados bacterianos estudados, antes resistentes à ação individual dos mesmos. Usando a metodologia do teste do MTT ((3-[-4,5- dimetil-tiazol-2-il]-2,5-difenil tetrazolium brometo), avaliou-se a viabilidade celular quando da exposição individual de cada antimicrobiano (sintético e bioativo), a fim de conhecer o caráter citotóxico destas sobre as células MAC-T (células epiteliais da glândula mamaria de bovinos). O resultado obtido mostrou que somente a M11 foi citotóxica nas concentrações 2xCIM e 1xCIM determinada previamente na presença de Su959 e 2xCIM determinada previamente na presença de Sa4605. Porém, as concentrações necessárias para potenciar ação dos antimicrobianos sintéticos são doses iguais ou abaixo de 0,5xCIM, não indicadas como tóxicas no teste in vitro. Assim, pode-se afirmar que a gutiferona- A e 7-epiclusianona apresentaram eficaz ação antimicrobiana individual sobre os isolados de campo de Streptococcus uberis e Streptococcus agalactiae, além de se mostrarem promissoras candidatas para serem utilizadas em associações com os antimicrobianos sintéticos ampicilina e gentamicina, a fim de recuperar e otimizar a ação antimicrobiana dos mesmos. / Bovine mastitis is a disease of high occurrence and widespread in herds around the world, making it a worrying scenario due to the impacts on public health and also on the countries’ economies, especially Brazil, due its large produce of milk. In meanwhile, the number of resistant bacterial isolates has been increased against a variety of pharmacological medicines, mostly because of drug-indiscriminate use. The investigation of new molecules with antimicrobial potential, as well as the association with traditional drugs, became a great necessity nowadays. The aim of this study was to investigate the antimicrobial action of two bioactive substances, gutiferone-A (M11) and 7-epiclusianone (M6), on wild isolates Streptococcus uberis (Su959) and Streptococcus agalactiae (Sa4605) obtained from animals infected with mastitis. Analysis were conducted to define the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) of synthetic antimicrobials and bioactive molecules, ranging from 0.6 to 125 g/mL. The antimicrobial potential of the latter was confirmed, besides the inefficacy of ampicillin and gentamicin in control of the multiplication of both isolates. Later, the presence of synergistic interactions was investigated, using the Checkerboard method from combinations of M11 and M6 with ampicillin and gentamicin. Among the eight selected associations, six showed positive synergic interaction showing a recovery and powering the action of the synthetic antimicrobials against the bacterial isolates studied, previously resistant to their individual action. To assess the cell viability, we performed the method MTT (3 - [- 4,5-dimethyl-thiazol-2-yl]-2,5-diphenyl tetrazolium bromide), with individual exposure of each antimicrobial (synthetic and bioactive) targeting the MAC-T cells (bovine mammary gland epithelial cells). The results showed that only M11 was cytotoxic at 2xCIM and 1xCIM concentrations previously determined by Su959 presence. However, concentrations doses equal to or lower than 0.5x MIC are need to potentiate the action of synthetic antimicrobials, not indicated as toxic in the in vitro test. Thus, the gutiferone-A and 7- epiclusianone showed an effective antimicrobial action on the wild isolates of Streptococcus uberis and Streptococcus agalactiae, in addition to being promising candidates for use in combinations with the synthetic antimicrobials ampicillin and gentamicin, in order to recover and optimize their antimicrobial action.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-04-18T14:52:38Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2107997 bytes, checksum: 9af3c7a1788cd5f34e07226a97b0fc13 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-18T14:52:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2107997 bytes, checksum: 9af3c7a1788cd5f34e07226a97b0fc13 (MD5) Previous issue date: 2015-07-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A criação de aves em sistemas industrializados vem adquirindo, mundialmente, características que envolvem uma elevada densidade animal, o que, consequentemente, leva ao surgimento de condições epidemiológicas capazes de predisporem ao aparecimento de problemas sanitários. Diante deste contexto, aumenta-se a preocupação com as doenças infecciosas, dentre elas, a Bronquite Infecciosa das Galinhas (BIG), cujo agente etiológico é o Infectious bronchitis virus (IBV). O presente estudo teve como objetivo reconstruir a epidemiologia molecular do IBV, por meio de análises filogenéticas e filogeográficas dos genes estruturais N e S1, para estudo da evolução viral. Estas informações são importantes para estabelecer um padrão de dispersão em um contexto histórico geográfico, entender eventos biológicos no passado relacionados à dinâmica populacional e ajudar no desenvolvimento de estratégias efetivas de controle do IBV. Para isso, foram montados dois bancos de dados com sequências moleculares completas e parciais dos genes N e S1 obtidos no GenBank. O primeiro banco de dados (IBV1) contemplou sequências completas de S1 (N=256) e N (N=154) e o segundo banco de dados (IBV2) foi montado com sequências parciais de S1 (N=390) e N (N=173). Importantes parâmetros para estudo da evolução viral foram analisados nesse trabalho para os genes S1 e N do IBV, incluindo estimativas de eventos de recombinação, taxa de mutação, pressão de seleção, dinâmica populacional e dispersão espacial. Os resultados apontam que, na ausência de uma elevada taxa de mutação e pelo fato da seleção purificadora ser a principal forma de seleção natural no IBV, o processo de recombinação tem um papel fundamental na evolução do IBV. As análises de dinâmica populacional sugerem que, até meados da década de 2000, os diferentes programas de vacinação, juntamente com os métodos de biosseguridade, foram eficazes para controlar o crescimento do tamanho efetivo populacional do IBV. Contudo, a partir de 2007, o aumento da população de variantes do IBV, pode indicar que os protocolos vacinais, usados no presente, não estão sendo mais eficazes. Os resultados das análises de dispersão viral do gene S1 e N foram analisados de forma conjunta, a fim de reconstruir um padrão de dispersão do IBV ao longo de sua história evolutiva. O ponto de origem de todas as cepas atuais do IBV foi a China que, após dispersão local, disseminou para os Estados Unidos e, por conseguinte, se dispersou para diferentes países e continentes até alcançar a ampla distribuição mundial encontrada nos dias atuais. Os principais centros de dispersão atuais do IBV foram a China, Estados Unidos, Brasil, Taiwan e Europa. / The intensification of poultry in industrial systems has acquired, worldwide, features that involve a high stock density, which, consequently, leads to the emergence of epidemiological conditions that may predispose to the appearance of health problems. Given this context, the concern with infectious diseases increases, among the diseases is the Avian Infectious Bronchitis (IB), whose etiologic agent is the Infectious bronchitis virus (IBV). This study aimed to reconstruct the molecular epidemiology of IBV through phylogenetic and phylogeographic analyzes of structural genes N and S1, to the study of viral evolution. These pieces of information are important to establish a pattern of dispersion in a geographical historical context, to understand biological events in the past related to population dynamics and to help develop effective strategies for control of IBV. To establish a better outlook for discussion of IBV molecular epidemiology, there were created two databases with complete and partial molecular sequences of genes N and S1 obtained from GenBank. The first database (IBV1) considered complete sequences of the S1 (N = 256) subunit and of the N (N = 154) gene of IBV. To increase the extension of countries from which sequences are available, a second database (IBV2) was created with partial sequences of the S1 (N = 390) gene and the N (N = 173) gene. Important parameters for the study of viral evolution were analyzed in this work for the S1 and N genes of the IBV, including estimates of recombination events, mutation rate, selection pressure, population dynamics and spatial dispersion. The results show that, in the absence of a high mutation rate and because of the purifying selection to be the main form of natural selection in IBV, the recombination process plays a key role in the evolution of IBV. The analysis of population dynamics suggest that, until the mid-2000s, the different vaccination programs, along with the biosecurity methods have been effective in controlling the growth of effective population size of the IBV. However, since 2007, the increase in the population of IBV variants may indicate that the vaccine protocols, used in the present, have not been effective anymore. The results of analyzes of the viral spread of the gene S1 and N were analyzed together, in order to reconstruct a pattern of the IBV dispersion along its evolutionary history. The point of origin of all current strains of IBV was China, which after local dispersion spread to the United States of America and thus dispersed to different countries and continents until reaching the worldwide distribution found today. The current main scattering centers of the IBV were China, the United States, Brazil, Taiwan and Europe.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-06Bitstream added on 2014-06-13T20:48:38Z : No. of bitstreams: 1 lorenzetti_er_me_botfca.pdf: 1497737 bytes, checksum: 301fad7ec025809e7f69e3df89b5a8b9 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Cymbopogon citratus (DC.) Stapf é uma gramínea perene, de grande importância para a indústria farmacêutica e alimentícia, fornecedora de óleo essencial. Um problema limitante para a produção comercial é a ferrugem, causada pelo patógeno Puccinia nakanishikii Dietel. O trabalho objetivou estudar a interação patógeno-hospedeiro e availar princípios ativos naturais no controle da doença. Para os estudos anatômicos foram elaborados cortes, objetivando analisar as estruturas lesionadas e o desenvolvimento do patógeno. Foram avaliadas as trocas gasosas nas diferentes severidades da doença. Realizaram-se testes in vitro, com diferentes agentes de controle sobre a germinação de esporos do patógeno, sendo estes: óleos essenciais de eucalipto, palma-rosa, cravo-da-índia, menta, limão, citronela e mil-folhas; extrato pirolenhoso de eucalipto e mentol cristalizado. A partir destes testes foram escolhidos quatro agentes para os testes em campo, óleo de citronela e de eucalipto, extrato pirolenhoso e mentol. A área foi preparada a partir de mudas, sendo manejadas até os seis meses. Quando todas as plantas apresentavam sintomas, iniciaram-se os tratamentos com aplicações semanais. Foi avaliada ainda a doença após um corte. Os sintomas iniciais manifestam-se como manchas amareladas evoluindo para a formação de pústulas bronzeadas alongadas. Quanto à avaliação anatômica, após a infecção houve o desenvolvimento das estruturas fúngicas, prosseguindo com o rompimento da cutícula, possibilitando a observação das estruturas do patógeno de forma clara sobre as células da epiderme. Nas regiões lignificadas dos feixes vasculares não há desenvolvimento dessas estruturas. Com o aumento da severidade da doença observou-se a redução da assimilação de gás carbônico. A concentração interna de gás carbônico foi maior em severidades mais altas. Tal fato relaciona-se... / Cymbopogon citratus (DC) Stapf is a perennial grass, that has a large importance to the pharmaceutical and food industry, supplier of essential oil. One limiting problem to the commercial production is the rust caused by pathogen Puccinia nakanishikii Dietel. This work aimed to investigate the pathogen-host interactions and contribute to the researches with alternative methods of disease control. For anatomical studies were prepared anatomical sections, with the objective to analyze the structures injured and the development of the pathogen with different corants. On cultivated plants were evaluated gas exchange in different severity levels. In vitro tests were performed with different control agents, to the germination of pathogen spores, which are: essential oil of eucalyptus, palmarosa, clove, peppermint, lemon, citronella and yarrow; pyroligneous extract of eucalyptus and crystallized menthol. From these tests four products were chosen for the tests in a camp experiment, citronella oil, eucalyptus oil, pyroligneous extract and menthol. The area was prepared from seedlings, which were managed by six months age. When all plants had symptoms the treatments begin, with weekly applications. One avaliation happened after the cut of the lemongrass. The initial symptoms manifest as yellow spots progressing to formation of elongated pustules. These symptoms beginning with the development of fungal structures, after occurred the disruption of the cuticle, so the structures of the pathogen may be clearly observed on epidermis parenchyma cells of the leaf abaxial surface, however, in regions of vascular bundles, no development of such structures, these regions that have lignified structures. With the increase of the disease severity was a significant reduction in the assimilation of carbonic gas. The internal concentration of carbon dioxide was major... (Complete abstract click electronic access below)