Células eucarióticas contêm vários tipos de proteassomo que regulam o processo de degradação de proteína. Proteassomos são proteases multicatalíticas que são responsáveis pela maior parte de degradação não-lisossomal de proteínas em células eucarióticas. As três subunidades catalíticas do proteassomo são &beta;1, &beta;2 e &beta;5. Em condições de stress e resposta imune essas três subunidades são substituídas por &beta;1i, &beta;2i and &beta;5i, respectivamente, para formar o proteassomo imune. Estas três subunidades induzíveis, parecem alterar as especificidades de peptidase do proteassoma imune em células tratadas com IFN-<font face=\"symbol\">g. Nosso objetivo no presente trabalho foi caracterizar um modelo celular para a indução do proteassomo imune, e ainda investigar o repertório peptídeo intracelular produzido por esta forma particular do proteassoma, através da técnica de espectrometria de massas. Em resumo, os nossos dados mostraram um aumento de 3 vezes do peptídeo EL28 derivado da proteína RPT2 em células HeLa tratadas com o IFN-<font face=\"symbol\">g. O peptídeo EL28 pode ser de relevância clínica para o tratamento de distúrbios relacionados com a apresentação de antígenos, visto que ele parece ativar a atividade quimotripsina-like quando incubado com o extrato celular de células HeLa. / Eukaryotic cells contain several types of proteasome regulating the process of protein degradation. The proteasome are responsible for most non - lysosomal protein degradation in eukaryotic cells. The three catalytic subunits of the proteasome are &beta;1, &beta;2 and &beta;5. Under conditions of stress and immune response these three subunits are replaced by &beta;1i, &beta;2i and &beta;5i, respectively, to form the immune proteasome . These three inducible subunits, appear to alter the specificity of the immune proteasome peptidase in cells treated with IFN-<font face=\"symbol\">g. Our aim in this study was to characterize a cellular model for the induction of the immune proteasome, and even investigate the intracellular peptide repertoire produced by this particular form of the proteasome, through the technique of mass spectrometry. In summary, our data showed an increase of 3 times the peptide derived from RPT2 EL28 protein in HeLa cells treated with IFN-<font face=\"symbol\">g. The EL28 peptide may be of clinical relevance for the treatment of disorders related to antigen presentation, since it seems to activate the chymotrypsin-like activity when incubated with the cell extract of HeLa cells.

Células eucarióticas contêm vários tipos de proteassomo que regulam o processo de degradação de proteína. Proteassomos são proteases multicatalíticas que são responsáveis pela maior parte de degradação não-lisossomal de proteínas em células eucarióticas. As três subunidades catalíticas do proteassomo são &beta;1, &beta;2 e &beta;5. Em condições de stress e resposta imune essas três subunidades são substituídas por &beta;1i, &beta;2i and &beta;5i, respectivamente, para formar o proteassomo imune. Estas três subunidades induzíveis, parecem alterar as especificidades de peptidase do proteassoma imune em células tratadas com IFN-<font face=\"symbol\">g. Nosso objetivo no presente trabalho foi caracterizar um modelo celular para a indução do proteassomo imune, e ainda investigar o repertório peptídeo intracelular produzido por esta forma particular do proteassoma, através da técnica de espectrometria de massas. Em resumo, os nossos dados mostraram um aumento de 3 vezes do peptídeo EL28 derivado da proteína RPT2 em células HeLa tratadas com o IFN-<font face=\"symbol\">g. O peptídeo EL28 pode ser de relevância clínica para o tratamento de distúrbios relacionados com a apresentação de antígenos, visto que ele parece ativar a atividade quimotripsina-like quando incubado com o extrato celular de células HeLa. / Eukaryotic cells contain several types of proteasome regulating the process of protein degradation. The proteasome are responsible for most non - lysosomal protein degradation in eukaryotic cells. The three catalytic subunits of the proteasome are &beta;1, &beta;2 and &beta;5. Under conditions of stress and immune response these three subunits are replaced by &beta;1i, &beta;2i and &beta;5i, respectively, to form the immune proteasome . These three inducible subunits, appear to alter the specificity of the immune proteasome peptidase in cells treated with IFN-<font face=\"symbol\">g. Our aim in this study was to characterize a cellular model for the induction of the immune proteasome, and even investigate the intracellular peptide repertoire produced by this particular form of the proteasome, through the technique of mass spectrometry. In summary, our data showed an increase of 3 times the peptide derived from RPT2 EL28 protein in HeLa cells treated with IFN-<font face=\"symbol\">g. The EL28 peptide may be of clinical relevance for the treatment of disorders related to antigen presentation, since it seems to activate the chymotrypsin-like activity when incubated with the cell extract of HeLa cells.

O objetivo do presente trabalho foi realizar estudos acerca da degradação anaeróbia de proteínas no tocante à cinética de consumo de substrato e às rotas metabólicas presentes no processo. Inicialmente, realizou-se um estudo comparativo da degradação de efluentes sintéticos em reatores anaeróbios horizontais de leito fixo (RAHLFs) em escala de bancada. Nesse intuito, foi proposto um modelo cinética de primeira ordem de reações em série e paralelo, que permitiu a estimativa dos parâmetros cinéticos das várias etapas do processo estudado. As fontes de carbono nos efluentes sintéticos foram primeiramente compostas por compostos protéicos, tendo sido posteriormente adicionadas fontes de carboidratos e lipídeos à sua composição. Nesse intuito, utilizaram-se duas proteínas, caseína e soro albumina bovina (S.A.B.), e um hidrolisado protéico, peptona. Os resultados preditos pelo modelo cinético proposto apresentaram boa correlação com os dados experimentais e, com isso, foi possível o entendimento dos vários aspectos envolvidos na degradação de compostos protéicos em reatores que apresentam regime de escoamento predominantemente pistonado. A peptona foi mais rapidamente consumida, seguida pela caseína e finalmente pela S.A.B.. A presença de lipídeos nos efluentes sintéticos utilizados se constituiu no maior problema para o processo estudado. Análises de microscopia e biologia molecular mostraram que houve realocação da biomassa nos RAHLFs à medida que foram adicionadas fontes alternativas de carbono aos efluentes sintéticos à base de proteína. As morfologias encontradas foram comuns em todos os ensaios realizados, tendo predominado as semelhantes a Methanosaeta sp., bacilos fluorescentes e não fluorescentes, bacilos curvos e cocos não fluorescentes. Também foram visualizados três tipos de filamentos, espiroquetas e morfologias semelhantes a Methanosarcina sp. A segunda etapa do presente trabalho foi o estudo comparativo do processo de degradação de água residuária proveniente de abatedouro de aves em dois reatores um UASB e um RAHLF. O modelo cinético de primeira ordem se ajustou bem aos dados de decaimento de matéria orgânica em ambos os reatores. Dessa forma, foi possível concluir que no reator UASB, o mecanismo de adsorção do material colóide e solúvel nos grânulos parece ter regulado o processo, resultando em maior velocidade de remoção dessas frações de matéria orgânica. No RAHLF, o que parece ter regulado o processo foi a retenção de sólidos orgânicos, aumentando, dessa forma, a velocidade de remoção dessa fração de matéria orgânica. / This work reports on the anaerobic degradation of proteins from the standpoint of substrate consumption kinetics and metabolic routes. Initially, a comparative study of synthetic effluents in a bench scale horizontal-flow anaerobic immobilized biomass (HAIB) reactor was carried out. For this purpose, a kinetic model of irreversible first-order series-parallel reactions with two intermediate products was proposed. This allowed the estimative the kinetic parameters of several steps of the process. The carbon source in the synthetic effluents was composed primarily of casein, peptone and bovine serum albumin (B.S.A.). Then, sources of carbohydrate and lipid were added to the composition. The proposed model fitted the experimental protein degradation data well and allowed the best comprehension of the process. Thus it was possible to understand several aspects about the degradation of the protein substrates utilized in HAIB reactors. In relation to degradation rate, it was concluded that peptone was the most rapidly consumed, followed by casein, and finally BSA. Regarding substrate composition, the major problem for the studied process was the presence of lipids in the synthetics effluents. The results obtained from the microbiological analysis showed that relocation of biomass in the HAIBs reactors happened in correlation with the addition of alternative carbon sources to synthetic protein effluents. In all assays, common morphologies were found. These werepredominantly Methanosaeta sp. - like archaeas, fluorescent bacillus (three types), non-fluorescent bacillus (6 types), curved bacillus and non-fluorescent coccus. Three types of filaments, spirochetes and Methanosarcina sp. - like archaeas were also found. In a second phase, a comparative analysis of the degradation process of wastewater from a poultry slaughterhouse was carried out in two different reactors, one up flow anaerobic sludge blacked (UASB), and one HAIB. The first order kinetic model proposed fitted the experimental organic matter degradation data well in UASB and HAIB reactors treating residual water from avian abattoirs. In the UASB reactor, the adsorption mechanism of the granules for colloid and soluble material seems to regulate the process. This results in a higher rate of removal for these fractions of organic material. However, in the HAIB reactor, what seems to be controlling the process was the retention of organic solids, which increased the removal rate for this fraction of organic material.

O objetivo do presente trabalho foi realizar estudos acerca da degradação anaeróbia de proteínas no tocante à cinética de consumo de substrato e às rotas metabólicas presentes no processo. Inicialmente, realizou-se um estudo comparativo da degradação de efluentes sintéticos em reatores anaeróbios horizontais de leito fixo (RAHLFs) em escala de bancada. Nesse intuito, foi proposto um modelo cinética de primeira ordem de reações em série e paralelo, que permitiu a estimativa dos parâmetros cinéticos das várias etapas do processo estudado. As fontes de carbono nos efluentes sintéticos foram primeiramente compostas por compostos protéicos, tendo sido posteriormente adicionadas fontes de carboidratos e lipídeos à sua composição. Nesse intuito, utilizaram-se duas proteínas, caseína e soro albumina bovina (S.A.B.), e um hidrolisado protéico, peptona. Os resultados preditos pelo modelo cinético proposto apresentaram boa correlação com os dados experimentais e, com isso, foi possível o entendimento dos vários aspectos envolvidos na degradação de compostos protéicos em reatores que apresentam regime de escoamento predominantemente pistonado. A peptona foi mais rapidamente consumida, seguida pela caseína e finalmente pela S.A.B.. A presença de lipídeos nos efluentes sintéticos utilizados se constituiu no maior problema para o processo estudado. Análises de microscopia e biologia molecular mostraram que houve realocação da biomassa nos RAHLFs à medida que foram adicionadas fontes alternativas de carbono aos efluentes sintéticos à base de proteína. As morfologias encontradas foram comuns em todos os ensaios realizados, tendo predominado as semelhantes a Methanosaeta sp., bacilos fluorescentes e não fluorescentes, bacilos curvos e cocos não fluorescentes. Também foram visualizados três tipos de filamentos, espiroquetas e morfologias semelhantes a Methanosarcina sp. A segunda etapa do presente trabalho foi o estudo comparativo do processo de degradação de água residuária proveniente de abatedouro de aves em dois reatores um UASB e um RAHLF. O modelo cinético de primeira ordem se ajustou bem aos dados de decaimento de matéria orgânica em ambos os reatores. Dessa forma, foi possível concluir que no reator UASB, o mecanismo de adsorção do material colóide e solúvel nos grânulos parece ter regulado o processo, resultando em maior velocidade de remoção dessas frações de matéria orgânica. No RAHLF, o que parece ter regulado o processo foi a retenção de sólidos orgânicos, aumentando, dessa forma, a velocidade de remoção dessa fração de matéria orgânica. / This work reports on the anaerobic degradation of proteins from the standpoint of substrate consumption kinetics and metabolic routes. Initially, a comparative study of synthetic effluents in a bench scale horizontal-flow anaerobic immobilized biomass (HAIB) reactor was carried out. For this purpose, a kinetic model of irreversible first-order series-parallel reactions with two intermediate products was proposed. This allowed the estimative the kinetic parameters of several steps of the process. The carbon source in the synthetic effluents was composed primarily of casein, peptone and bovine serum albumin (B.S.A.). Then, sources of carbohydrate and lipid were added to the composition. The proposed model fitted the experimental protein degradation data well and allowed the best comprehension of the process. Thus it was possible to understand several aspects about the degradation of the protein substrates utilized in HAIB reactors. In relation to degradation rate, it was concluded that peptone was the most rapidly consumed, followed by casein, and finally BSA. Regarding substrate composition, the major problem for the studied process was the presence of lipids in the synthetics effluents. The results obtained from the microbiological analysis showed that relocation of biomass in the HAIBs reactors happened in correlation with the addition of alternative carbon sources to synthetic protein effluents. In all assays, common morphologies were found. These werepredominantly Methanosaeta sp. - like archaeas, fluorescent bacillus (three types), non-fluorescent bacillus (6 types), curved bacillus and non-fluorescent coccus. Three types of filaments, spirochetes and Methanosarcina sp. - like archaeas were also found. In a second phase, a comparative analysis of the degradation process of wastewater from a poultry slaughterhouse was carried out in two different reactors, one up flow anaerobic sludge blacked (UASB), and one HAIB. The first order kinetic model proposed fitted the experimental organic matter degradation data well in UASB and HAIB reactors treating residual water from avian abattoirs. In the UASB reactor, the adsorption mechanism of the granules for colloid and soluble material seems to regulate the process. This results in a higher rate of removal for these fractions of organic material. However, in the HAIB reactor, what seems to be controlling the process was the retention of organic solids, which increased the removal rate for this fraction of organic material.