Made available in DSpace on 2015-04-01T14:16:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 1357815 bytes, checksum: a8f6776ded44373a63e29cc1331535eb (MD5) Previous issue date: 2013-04-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Reproductive disorders in bovines can be caused by various pathogens, which might already be present in the reproductive tract. The microbial community of the reproductive apparatus, when known, can provide information about the health of the host. The metagenomics has been used to characterize and obtain genetics information about microbial communities in various environments and can relate certain diseases with changes in community composition. In this study, samples were collected from the secretion of mucosa of vaginal surface of 05 healthy cows and 05 cows that showed symptoms of reproductive disorders. Metagenomics DNA samples were extracted of secretion samples and amplified with primers for the V5-V6 regions of the 16S rRNA and sequenced on the platform "Ion Torrent Personal Genome Machine - PGM". The data were processed to remove low quality sequences and chimeras, with the Mothur program, then the data were released in the Ribosomal Database Project for classification of OTU's. Local blastn was performed and this results was loaded in MEGAN program, for viewing profiles and taxonomic microbial attributes. The control profile showed a total of 15 taxa, being the taxa Bacteroides, Enterobacteriaceae and Victivallis, with the highest representation of OTU's; the positive profile showed 68 taxa, and Bacteroides, Enterobacteriaceae, Histophilus, Victivallis, Alistipes and Coriobacteriaceae, the taxa with more OTU's representation. The genus Histophilus have pathogenics species in reproductive tract of cattle. There was a change in the community composition, well as in microbial attributes of profiles there may be a relationship between the pathogen and of other representatives taxa, in production of metabolites to disease progression. / Distúrbios reprodutivos em bovinos podem ser causados por diversos patógenos, que poderiam já estar presentes no trato reprodutivos. A comunidade microbiana dos aparelhos reprodutivos, quando conhecida, pode fornecer informações a respeito da saúde do hospedeiro. A metagenômica tem sido utilizada para caracterizar e obter informações genéticas a respeito de comunidades microbianas de diversos ambientes, podendo relacionar determinadas doenças com alterações na composição das comunidades. Nesse trabalho, foram coletadas amostras de secreção de mucosa da superfície vaginal de 05 vacas sadias e 05 vacas que apresentaram sintomas de distúrbios reprodutivos. Amostras de DNA metagenômico foram extraídas das amostras de secreção e amplificadas com primers para as regiões V5-V6 do gene 16S rRNA e sequenciadas na plataforma Ion Torrent Personal Genome Machine PGM . Os dados foram tratados para retirada de sequencias de baixa qualidade e quimeras, com o programa Mothur; em seguida, os dados foram lançados no Ribosomal Database Project para classificação das OTU´s. Blastn local foi efetuado e seus resultados foram carregados no programa MEGAN, para visualização de perfis taxonômicos e atributos microbianos. O perfil controle apresentou um total de 15 taxa, sendo os taxa Bacteroides, Enterobacteriaceae e Victivallis, os de maior representação de OTU´s; o perfil com distúrbios apresentou 68 taxa, sendo Bacteroides, Enterobacteriaceae, Histophilus, Victivallis, Alistipes, e Coriobacteriaceae, os taxa com maior representação de OTU´s. O gênero Histophilus possui espécies patogênicas em trato reprodutivo de bovinos. Observou-se uma alteração na composição das comunidades estudadas, bem como nos atributos microbianos dos perfis podendo haver uma relação entre patógenos e representantes de outros taxa, na produção de metabólitos para progressão da doença.

Submitted by Sandro Camargo (sandro.camargo@unipampa.edu.br) on 2015-03-08T19:49:29Z No. of bitstreams: 1 127110023.pdf: 3874262 bytes, checksum: 443a132aba188e5f75a8c5e9224fdeab (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-08T19:49:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 127110023.pdf: 3874262 bytes, checksum: 443a132aba188e5f75a8c5e9224fdeab (MD5) Previous issue date: 2014-09-26 / Este estudo objetivou descrever os aspectos epidemiológicos e clinicopatológicos da seneciose na mesorregião Sudoeste Rio-Grandense, enfatizando a importância da doença para a pecuária da região e da biópsia hepática para o diagnóstico conclusivo. Foram realizados questionários em 16 propriedades rurais visitadas em municípios da região que apresentaram casos suspeitos da intoxicação entre agosto de 2011 e março de 2014, através dos quais foi possível observar que a doença é possivelmente a que mais causa prejuízos econômicos à bovinocultura. De um total de 88 bovinos que apresentaram baixo desenvolvimento corporal, de nove propriedades distintas, 69 animais (aproximadamente 80%) foram positivos para seneciose crônica, e apresentaram lesões características da intoxicação como fibrose periportal (83% dos casos), hepatomegalocitose (81% dos casos) e proliferação de ductos biliares (73% dos casos), e essas alterações foram classificadas como discreta, leve, moderada ou acentuada. Foram estudados ainda 21 casos positivos de seneciose crônica, dos quais quatro vacas apresentaram alterações ovarianas caracterizadas microscopicamente por acentuada megalocitose e pseudoinclusão em células luteínicas grandes (CLG). Esse estudo confirmou a existência de bovinos intoxicados nos rebanhos, além de outros com potencial para desenvolver a forma clínica mais grave da doença. Os resultados dessas avaliações foram fundamentais para orientar os proprietários e técnicos quanto às principais características da doença e às formas de controle a serem adotadas. O presente trabalho permitiu concluir que a seneciose é a principal causa de morte de bovinos adultos na região, bem como estabelecer a real situação da doença nos rebanhos, além de descrever pela primeira vez as lesões gonadais em vacas com seneciose crônica. / This work aimed to describe the epidemiological and clinicopathological findings of the seneciosis in the Southwest Mesoregion of Rio Grande do Sul, state of Brazil, emphazing the importance of disease to livestock in the region and the importance of the liver biopsy for definitive diagnosis Assessments were made through questionnaires in 16 rural properties in the region who had suspected cases of poisoning from August 2011 to March 2014. These assessments revealed that the disease is an important cause of mortality in adult cattle in the region and possibly the one that most causes economic losses to the raising cattle. From a total of 88 cattle that lower in the body development, from nine distinct properties, 69 animals (about 80%) were positive for chronic seneciosis after showing characteristic signs of the intoxication, as periportal fibrosis in 83% of cases, megalocytosis in 81% of cases and bile duct proliferation in 73% of cases, and these changes were classified as mild these changes were classified from mild to accentuated. Twenty-one positive cases of chronic seneciosis were also studied. These, four cows showed ovarian changes characterized microscopically by with marked megalocytosis and nuclear pseudo-inclusions in large luteal cells (LLC). This study confirmed the existence of cattle poisoned in herds, and others with potential to develop the most serious form of the disease. The results of these assessments were fundamental to guide owners and technicians about the main characteristics of the disease and forms of control to be adopted. The study showed that chronic seneciosis is the major cause of death in adult cattle in the region, as well as establish the real situation of the disease in herds, and describe the first time the gonadal lesions in cows with chronic seneciosis.