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Ocorrência e identificação molecular de espécies do gênero Mycobacterium e marcadores de virulência em linhagens de Rhodococcus equi isoladas de linfonodos e das fezes de suínos de abatedeouro /Lara, Gustavo Henrique Batista. January 2013 (has links)
Orientador: Márcio Garcia Ribeiro / Banca: Antonio Carlos Paes / Banca: José Paes de Almeida Nogueira Pinto / Banca: Adolfo Carlos Barreto Santos / Banca: Rogério Giuffrida / Resumo: A linfadenite infecciosa em suínos representa uma das afecções mais preocupantes na criação de suínos em todo mundo, causada por patógenos de origem bacteriana, geralmente diagnosticada na linha de abate. Acarreta prejuízos econômicos com a condenação total ou parcial das carcaças, bem como reflexos em saúde pública, devido ao potencial zoonótico dos agentes causais. O presente estudo investigou a ocorrência e as principais espécies do gênero Mycobacterium, assim como marcadores de virulência plasmidial em linhagens de Rhodococcus equi (R. equi) isoladas de linfonodos e das fezes de suínos de abatedouros do interior do estado de São Paulo, com e sem linfadenite. Foram examinados 150 linfonodos (50 mesentéricos, 50 mediastínicos e 50 submandibulares) com lesões, 150linfonodos (50 mesentéricos, 50 mediastínicos e 50 submandibulares) sem lesões aparentes e 150 fezes de suínos, provenientes de animais destinados ao abate, em dois frigoríficos do interior do estado de São Paulo. As amostras de linfonodos e fezes foram submetidas ao cultivo microbiológico simultaneamente nos meios de ágar acrescido de sangue bovino (5%) desfibrinado, e meios seletivos de CAZ-NB, TCP e TVP para R. equi, e Stonebrink-Lesslie e Lowenstein-Jensen para micobactérias. As colônias sugestivas de R. equi e positivas no teste de CAMP, foram enviadas ao Japão para detecção de linhagens VapA ou VapB, associadas a virulência. As linhagens sugestivas no cultivo microbiano para o gênero Mycobacterium foram submetidas a caracterização de espécies por PCR pela técnica de PRA. Foram identificados nos linfonodos de suínos com lesões 48 (32,0%) linhagens de Mycobacterium spp.e 6 (4,0%) Rhodococcus equi. Nos linfonodos de suínos sem lesões foram identificados 11 (7,3%) isolados de Mycobacterium spp.e nenhuma linhagem de R. equi. Nas fezes foram identificadas 40 (26,6%) linhagens de Rhodococcus equi e ... / Abstract: The infectious lymphadenitis represents one of the most important diseases in pigs worldwide caused by bacterium, usually diagnosed on the slaughterhouses.The disease leads to economic losses due to total or partial condemnation of carcasses, as well as public health concern due to the zoonotic potential of microorganisms. The present study investigated the occurrence and the main species of the genus Mycobacterium as well as virulence markers of plasmid in Rhodococcus equi (R. equi) strains isolated from lymph nodes and feces from pigs of slaughterhouses in the state of São Paulo, with and without lymphadenitis. Were sampled 150 lymph nodes (50 mesenteric, 50 mediastinal and 50 submandibular) with lesions, 150 lymph nodes (50 mesenteric, 50 mediastinal and 50 submandibular) without visible lesions, and 150 feces from pigs of slaughterhouses of state of São Paulo, Brazil. The lymph nodes samples and feces were subjected to microbiological culture simultaneously indefibrinated bovine blood agar (5%), selective media of CAZ-NB, TCP, TVP for R. equi, and Stonebrink-Lesslie, and Lowenstein-Jensen for mycobacteria . The suggestive colonies of R. equi and positive to CAMP test were sent to Japan for evaluation of plasmid profile (VapA or VapB). The suggestive of Mycobacterium sp. were subjected to polymerase chain reaction (PCR) - based species identification using restriction enzyme pattern analysis (PRA). Among lymph nodes of pigs with lesions, 48 (32.0%) Mycobacterium spp. and 6 (4.0%) R. equi strains were identified. In the lymph nodes of pigs without lesions were identified 11 (7.3%) Mycobacterium spp. and none R. equi strain. From the fecal samples, 40 (26.6%) R. equi and 2 (1.3%) Mycobacterium spp. isolates were identified. From 48 Mycobcterium isolates from pigs with lesions, 37 (77.0%) were identified by PRA as M. avium type 1, and 11 (23.0%) M. avium type 2. Among limph nodes with lesions wer ... / Doutor
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Ocorrência e identificação molecular de espécies do gênero Mycobacterium e marcadores de virulência em linhagens de Rhodococcus equi isoladas de linfonodos e das fezes de suínos de abatedeouroLara, Gustavo Henrique Batista [UNESP] 25 July 2013 (has links) (PDF)
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000741914.pdf: 1231278 bytes, checksum: 31828ab93cfccd06f552bc041efb2c26 (MD5) / A linfadenite infecciosa em suínos representa uma das afecções mais preocupantes na criação de suínos em todo mundo, causada por patógenos de origem bacteriana, geralmente diagnosticada na linha de abate. Acarreta prejuízos econômicos com a condenação total ou parcial das carcaças, bem como reflexos em saúde pública, devido ao potencial zoonótico dos agentes causais. O presente estudo investigou a ocorrência e as principais espécies do gênero Mycobacterium, assim como marcadores de virulência plasmidial em linhagens de Rhodococcus equi (R. equi) isoladas de linfonodos e das fezes de suínos de abatedouros do interior do estado de São Paulo, com e sem linfadenite. Foram examinados 150 linfonodos (50 mesentéricos, 50 mediastínicos e 50 submandibulares) com lesões, 150linfonodos (50 mesentéricos, 50 mediastínicos e 50 submandibulares) sem lesões aparentes e 150 fezes de suínos, provenientes de animais destinados ao abate, em dois frigoríficos do interior do estado de São Paulo. As amostras de linfonodos e fezes foram submetidas ao cultivo microbiológico simultaneamente nos meios de ágar acrescido de sangue bovino (5%) desfibrinado, e meios seletivos de CAZ-NB, TCP e TVP para R. equi, e Stonebrink–Lesslie e Lowenstein-Jensen para micobactérias. As colônias sugestivas de R. equi e positivas no teste de CAMP, foram enviadas ao Japão para detecção de linhagens VapA ou VapB, associadas a virulência. As linhagens sugestivas no cultivo microbiano para o gênero Mycobacterium foram submetidas a caracterização de espécies por PCR pela técnica de PRA. Foram identificados nos linfonodos de suínos com lesões 48 (32,0%) linhagens de Mycobacterium spp.e 6 (4,0%) Rhodococcus equi. Nos linfonodos de suínos sem lesões foram identificados 11 (7,3%) isolados de Mycobacterium spp.e nenhuma linhagem de R. equi. Nas fezes foram identificadas 40 (26,6%) linhagens de Rhodococcus equi e ... / The infectious lymphadenitis represents one of the most important diseases in pigs worldwide caused by bacterium, usually diagnosed on the slaughterhouses.The disease leads to economic losses due to total or partial condemnation of carcasses, as well as public health concern due to the zoonotic potential of microorganisms. The present study investigated the occurrence and the main species of the genus Mycobacterium as well as virulence markers of plasmid in Rhodococcus equi (R. equi) strains isolated from lymph nodes and feces from pigs of slaughterhouses in the state of São Paulo, with and without lymphadenitis. Were sampled 150 lymph nodes (50 mesenteric, 50 mediastinal and 50 submandibular) with lesions, 150 lymph nodes (50 mesenteric, 50 mediastinal and 50 submandibular) without visible lesions, and 150 feces from pigs of slaughterhouses of state of São Paulo, Brazil. The lymph nodes samples and feces were subjected to microbiological culture simultaneously indefibrinated bovine blood agar (5%), selective media of CAZ-NB, TCP, TVP for R. equi, and Stonebrink-Lesslie, and Lowenstein-Jensen for mycobacteria . The suggestive colonies of R. equi and positive to CAMP test were sent to Japan for evaluation of plasmid profile (VapA or VapB). The suggestive of Mycobacterium sp. were subjected to polymerase chain reaction (PCR) – based species identification using restriction enzyme pattern analysis (PRA). Among lymph nodes of pigs with lesions, 48 (32.0%) Mycobacterium spp. and 6 (4.0%) R. equi strains were identified. In the lymph nodes of pigs without lesions were identified 11 (7.3%) Mycobacterium spp. and none R. equi strain. From the fecal samples, 40 (26.6%) R. equi and 2 (1.3%) Mycobacterium spp. isolates were identified. From 48 Mycobcterium isolates from pigs with lesions, 37 (77.0%) were identified by PRA as M. avium type 1, and 11 (23.0%) M. avium type 2. Among limph nodes with lesions wer ...
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Diagnóstico laboratorial de Mycobacterium spp. em Botucatu e região, utilizando a técnica Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) em material biológico e avaliação de condições associadasCalsolari, Regina Adriana de Oliveira. January 2016 (has links)
Orientador: Paulo José Fortes Villas Bôas / Coorientador: Adriana Polachini do Valle / Resumo: Estima-se que um em cada quatro brasileiros esteja infectado pelo bacilo de Koch, e apenas em 2013, 80 mil casos de tuberculose foram notificados ao Ministério da Saúde, dos quais 6,5 mil foram a óbito. O exame laboratorial para o diagnóstico da tuberculose é feito pelos seguintes métodos tradicionais: Baciloscopia (BAAR) e Cultura, considerada o padrão ouro, porém com um tempo de realização demorado (em torno de oito semanas). A Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) é um método de amplificação de DNA que pode ser útil no diagnóstico diferencial da tuberculose com outras infecções pulmonares. Além disso, a PCR pode confirmar a identificação da micobactéria em materiais clínicos que apresentem uma difícil positividade. Objetivos - Avaliar a positividade de Mycobacterium spp. em diferentes materiais biológicos utilizando a técnica de PCR para os alvos Internal Transcribed Spacer (ITS) 16S-23S rDNA e gene hsp 65. Material e métodos - Cento e trinta materiais biológicos de pacientes com suspeita de tuberculose pulmonar ou extrapulmonar foram investigados para pesquisa de Mycobacterium spp. por ITS-PCR e pesquisa de fragmento do gene hsp65, no período de março de 2012 a abril de 2013. Para identificação das espécies de micobactérias foi utilizada a pesquisa do gene IS6110, e técnica Restriction Enzyme Pattern Analysis (PCR-PRA). Para algumas amostras positivas pela PCR foi realizado o sequenciamento para identificação da espécie. Foram avaliados dados demográficos e condições ass... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: It is estimated that one in every four Brazilians is infected with Koch's bacillus, and just in 2013, eighty thousand cases of tuberculosis were reported to the Department of Health, of which 6.5 million died. The laboratory test for the diagnosis of tuberculosis is made by the following traditional methods: baciloscopy and culture, considered the gold standard, but with a long holding time (around 8 weeks). Polymerase chain reaction (PCR) is a DNA amplification method that can be useful in the differential diagnosis of pulmonary tuberculosis with other infections. In addition, PCR can confirm the identification of mycobacteria in clinical materials that exhibit a difficult positivity. Objectives - To evaluate the positivity of Mycobacterium spp. in different biological materials using the PCR technique for the Internal Transcribed Spacer (ITS) 16S-23S rDNA gene and hsp 65 targets. Materials and Methods - One hundred and thirty biological materials of patients with suspected pulmonary or extrapulmonary tuberculosis were investigated for Mycobacterium tuberculosis spp. by ITS-PCR research and gene fragment hsp65 research, from March 2012 to April 2013. To identify the species of mycobacteria was used the IS6110 gene research and PCR-PRA technique). For some positive samples was performed by PCR sequencing to species identification. They evaluated demographics and associated conditions. The comparison between the techniques was checked by χ² test. The samples surveyed in sput... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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