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Expressão e produção da fímbria ECP por Escherichia coli enteropatogênica atípica. / Expression and production of ECP by atypical enteropathogenic Escherichia coli.Munhoz, Danielle Dias 06 November 2015 (has links)
E. coli enteropatogênica atípica (aEPEC) é um importante patótipo causador de diarréia. As cepas de aEPEC não produzem BFP, sugerindo que outras fimbriais estão envolvidas na adesão de aEPEC ao hospedeiro. ECP é encontrada na maioria das cepas patogênicas e não patogênicas de E. coli. O objetivo do estudo foi avaliar a expressão e produção de ECP em cepas de aEPEC. A presença do operon ecp foi avaliada por PCR e a expressão avaliada por PCR utilizando cDNA obtido a partir do cultivo bacteriano em LB, DMEM e DMEM pré-condicionado. A produção de ECP foi avaliada por imunofluorescência. Foi observado que a expressão, por todas as cepas, só ocorreu quando foram cultivadas em DMEM pré-condicionado. Houve expressão diferencial do operon com o cultivo em LB ou DMEM. A produção de ECP foi observada apenas puma cepa quando cultivada em LB. Já em DMEM, três cepas produziram ECP. Houve um aumento do número de cepas produtoras da fímbria com o cultivo em DMEM pre condicionado. Esses resultados sugerem que a sinalização celular pode interferir na expressão e produção da ECP. / Atypical enteropathogenic E. coli (aEPEC) is an pathotype that causes diarrhea. aEPEC does not produce BFP, suggesting that other pili must be involved in aEPEC adhesion to the host cell. ECP is found in most pathogenic and non-pathogenic E. coli. The objective of this study was to evaluate the expression and production of ECP in aEPEC. The presence of ecp operon was assessed by PCR and the expression evaluated by PCR using cDNA obtained from bacterial growth in LB, DMEM and preconditioned DMEM. ECP production was evaluated by immunofluorescence. It was observed that the operon expression by all strains only occurred when they were grown in preconditioned DMEM. There was differential expression of ecp operon when strains were grown in LB or DMEM. ECP production was observed only by one strain when grown in LB. Three strains producted ECP grown in DMEM, but there was a higher production of the pili when strains were grown in DMEM preconditionated. These results suggest that cellular signaling may interfere with the expression and production of ECP.
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Expressão e produção da fímbria ECP por Escherichia coli enteropatogênica atípica. / Expression and production of ECP by atypical enteropathogenic Escherichia coli.Danielle Dias Munhoz 06 November 2015 (has links)
E. coli enteropatogênica atípica (aEPEC) é um importante patótipo causador de diarréia. As cepas de aEPEC não produzem BFP, sugerindo que outras fimbriais estão envolvidas na adesão de aEPEC ao hospedeiro. ECP é encontrada na maioria das cepas patogênicas e não patogênicas de E. coli. O objetivo do estudo foi avaliar a expressão e produção de ECP em cepas de aEPEC. A presença do operon ecp foi avaliada por PCR e a expressão avaliada por PCR utilizando cDNA obtido a partir do cultivo bacteriano em LB, DMEM e DMEM pré-condicionado. A produção de ECP foi avaliada por imunofluorescência. Foi observado que a expressão, por todas as cepas, só ocorreu quando foram cultivadas em DMEM pré-condicionado. Houve expressão diferencial do operon com o cultivo em LB ou DMEM. A produção de ECP foi observada apenas puma cepa quando cultivada em LB. Já em DMEM, três cepas produziram ECP. Houve um aumento do número de cepas produtoras da fímbria com o cultivo em DMEM pre condicionado. Esses resultados sugerem que a sinalização celular pode interferir na expressão e produção da ECP. / Atypical enteropathogenic E. coli (aEPEC) is an pathotype that causes diarrhea. aEPEC does not produce BFP, suggesting that other pili must be involved in aEPEC adhesion to the host cell. ECP is found in most pathogenic and non-pathogenic E. coli. The objective of this study was to evaluate the expression and production of ECP in aEPEC. The presence of ecp operon was assessed by PCR and the expression evaluated by PCR using cDNA obtained from bacterial growth in LB, DMEM and preconditioned DMEM. ECP production was evaluated by immunofluorescence. It was observed that the operon expression by all strains only occurred when they were grown in preconditioned DMEM. There was differential expression of ecp operon when strains were grown in LB or DMEM. ECP production was observed only by one strain when grown in LB. Three strains producted ECP grown in DMEM, but there was a higher production of the pili when strains were grown in DMEM preconditionated. These results suggest that cellular signaling may interfere with the expression and production of ECP.
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Associação do polimorfismo do gene da proteína catiônica eosinofílica com a eosinofilia tecidual associada aos tumores em carcinomas espinocelulares de boca / Association of eosinophil cationic protein gene polymorphism with tumor-associated tissue eosinophilia in oral squamous cell carcinomasPereira, Michele Conceição 22 August 2008 (has links)
A proteína catiônica eosinofílica (ECP) presente nos grânulos específicos dos eosinófilos apresenta atividade citotóxica, particularmente para células tumorais, entretanto a função exata dos eosinófilos e de seus produtos nas neoplasias malignas continua obscura. O objetivo desse trabalho foi investigar a prevalência do polimorfismo 434(G>C) do gene ECP em pacientes com carcinoma espinocelular (CEC) de boca e sua correlação com a eosinofilia tecidual associada aos tumores (TATE), bem como com as características demográficas, clínicas e microscópicas. O genótipo 434 do gene ECP em 165 pacientes saudáveis e em 157 pacientes com CEC de boca, tratados no Hospital do Câncer A.C. Camargo entre 1984 a 2002, foi detectado pela clivagem da seqüência específica de DNA amplificada com a enzima de restrição PstI e análise dos produtos de clivagem pela eletroforese em gel de agarose. A TATE foi determinada por análise morfométrica. A associação entre os genótipos, a intensidade da TATE e as variáveis demográficas, clínicas e microscópicas foi avaliada pelo teste qui-quadrado ou teste exato de Fisher. As análises das sobrevidas global, livre de doença e específica por câncer foram feitas pelo estimador limite de Kaplan-Meier e a comparação das curvas de sobrevida foi realizada utilizando-se o teste log-rank. Notou-se uma predominância dos indivíduos heterozigotos para o polimorfismo 434(G>C) do gene ECP. Nenhuma diferença estatística significativa foi obtida entre os diferentes genótipos, a intensidade da TATE e as variáveis demográficas, clínicas e microscópicas. Uma maior freqüência de esvaziamento cervical bilateral, recidiva local, embolização vascular, comprometimento das margens cirúrgicas e realização de radioterapia pós-operatória foi observada nos pacientes com CEC de boca, TATE intensa e genótipos 434GC/CC. Não houve correlação estatística significativa entre os diferentes genótipos 434 do gene ECP e as sobrevidas global, livre de doença e específica por câncer. Baseados em nossos resultados, concluímos que houve uma tendência de os pacientes com CEC de boca, intensa eosinofilia tecidual e genótipos 434GC/CC do gene ECP apresentarem uma evolução clínica desfavorável, quando comparados aos indivíduos com genótipo 434GG, provavelmente pela presença de uma variante genética dessa proteína com propriedades citotóxicas alteradas. / Eosinophil cationic protein (ECP), found in secretory granules of human eosinophils, presents cytotoxic activity, particularly against cancer cells. The specific functional role of eosinophils in solid malignant tumors remains unclear. The aim of this study was to investigate the prevalence of the ECP-gene polymorphism 434(G>C) in oral squamous cell carcinoma (OSCC) patients and its association with tumor-associated tissue eosinophilia (TATE), as well as demographic, clinical and microscopic variables. The 434 genotypes in the ECP-gene of 165 healthy individuals and 157 OSCC patients, submitted to surgical treatment at the Hospital A.C. Camargo from 1984 to 2002, were detected by cleavage of the amplified DNA sequence with restriction enzyme PstI and analyses of the cleaved product by agarose gel electrophoresis. TATE, in OSCC, was obtained by morphometric analysis. Chisquare test or Fishers exact test was used to analyze the association among ECP-gene polymorphism 434(G>C), TATE, demographic, clinical and microscopic variables. Diseasefree survival and overall survival were calculated by the Kaplan-Meier product-limit actuarial method and the comparison of the survival curves were performed using log rank test. Most of healthy individuals and OSCC patients showed the genotype 434GC. There was no statistical association among 434 genotypes, TATE intensity and demographic, clinical or microscopic variables of OSCC patients. Higher frequency of bilateral neck dissection, local recurrence, vascular embolization, involved resection margins and postoperative radiotherapy was detected in OSCC patients with intense TATE and 434GC/CC genotypes. No statistically significant differences on survival rates were found among 434 genotypes. In conclusion, these results suggest a tendency of worse clinical outcome in OSCC patients with intense TATE and 434GC/CC genotypes, probably due an ECP genetic variant with altered cytotoxic activity.
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Associação do polimorfismo do gene da proteína catiônica eosinofílica com a eosinofilia tecidual associada aos tumores em carcinomas espinocelulares de boca / Association of eosinophil cationic protein gene polymorphism with tumor-associated tissue eosinophilia in oral squamous cell carcinomasMichele Conceição Pereira 22 August 2008 (has links)
A proteína catiônica eosinofílica (ECP) presente nos grânulos específicos dos eosinófilos apresenta atividade citotóxica, particularmente para células tumorais, entretanto a função exata dos eosinófilos e de seus produtos nas neoplasias malignas continua obscura. O objetivo desse trabalho foi investigar a prevalência do polimorfismo 434(G>C) do gene ECP em pacientes com carcinoma espinocelular (CEC) de boca e sua correlação com a eosinofilia tecidual associada aos tumores (TATE), bem como com as características demográficas, clínicas e microscópicas. O genótipo 434 do gene ECP em 165 pacientes saudáveis e em 157 pacientes com CEC de boca, tratados no Hospital do Câncer A.C. Camargo entre 1984 a 2002, foi detectado pela clivagem da seqüência específica de DNA amplificada com a enzima de restrição PstI e análise dos produtos de clivagem pela eletroforese em gel de agarose. A TATE foi determinada por análise morfométrica. A associação entre os genótipos, a intensidade da TATE e as variáveis demográficas, clínicas e microscópicas foi avaliada pelo teste qui-quadrado ou teste exato de Fisher. As análises das sobrevidas global, livre de doença e específica por câncer foram feitas pelo estimador limite de Kaplan-Meier e a comparação das curvas de sobrevida foi realizada utilizando-se o teste log-rank. Notou-se uma predominância dos indivíduos heterozigotos para o polimorfismo 434(G>C) do gene ECP. Nenhuma diferença estatística significativa foi obtida entre os diferentes genótipos, a intensidade da TATE e as variáveis demográficas, clínicas e microscópicas. Uma maior freqüência de esvaziamento cervical bilateral, recidiva local, embolização vascular, comprometimento das margens cirúrgicas e realização de radioterapia pós-operatória foi observada nos pacientes com CEC de boca, TATE intensa e genótipos 434GC/CC. Não houve correlação estatística significativa entre os diferentes genótipos 434 do gene ECP e as sobrevidas global, livre de doença e específica por câncer. Baseados em nossos resultados, concluímos que houve uma tendência de os pacientes com CEC de boca, intensa eosinofilia tecidual e genótipos 434GC/CC do gene ECP apresentarem uma evolução clínica desfavorável, quando comparados aos indivíduos com genótipo 434GG, provavelmente pela presença de uma variante genética dessa proteína com propriedades citotóxicas alteradas. / Eosinophil cationic protein (ECP), found in secretory granules of human eosinophils, presents cytotoxic activity, particularly against cancer cells. The specific functional role of eosinophils in solid malignant tumors remains unclear. The aim of this study was to investigate the prevalence of the ECP-gene polymorphism 434(G>C) in oral squamous cell carcinoma (OSCC) patients and its association with tumor-associated tissue eosinophilia (TATE), as well as demographic, clinical and microscopic variables. The 434 genotypes in the ECP-gene of 165 healthy individuals and 157 OSCC patients, submitted to surgical treatment at the Hospital A.C. Camargo from 1984 to 2002, were detected by cleavage of the amplified DNA sequence with restriction enzyme PstI and analyses of the cleaved product by agarose gel electrophoresis. TATE, in OSCC, was obtained by morphometric analysis. Chisquare test or Fishers exact test was used to analyze the association among ECP-gene polymorphism 434(G>C), TATE, demographic, clinical and microscopic variables. Diseasefree survival and overall survival were calculated by the Kaplan-Meier product-limit actuarial method and the comparison of the survival curves were performed using log rank test. Most of healthy individuals and OSCC patients showed the genotype 434GC. There was no statistical association among 434 genotypes, TATE intensity and demographic, clinical or microscopic variables of OSCC patients. Higher frequency of bilateral neck dissection, local recurrence, vascular embolization, involved resection margins and postoperative radiotherapy was detected in OSCC patients with intense TATE and 434GC/CC genotypes. No statistically significant differences on survival rates were found among 434 genotypes. In conclusion, these results suggest a tendency of worse clinical outcome in OSCC patients with intense TATE and 434GC/CC genotypes, probably due an ECP genetic variant with altered cytotoxic activity.
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Modelagem de equaÃÃes estruturais para analisar a estratÃgia corporativa sustentÃvel: estudo em empresas que atuam no Brasil / Structural equation modeling to analyze the sustainable corporate strategy: study companies operating in BrazilFranklin de Sousa Torres 11 August 2011 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / Esta dissertaÃÃo teve como objetivo principal avaliar as relaÃÃes entre os fatores componentes do modelo de estratÃgia corporativa sustentÃvel, modelo esse que tem como base o modelo ECP-Triplo de Abreu (2001). As discussÃes acerca da preocupaÃÃo ambiental e social que deve haver por parte das empresas e o retorno que elas devem aos seus diferentes stakeholders levam a novas consideraÃÃes nos modelos apresentados mais recentemente. Abreu (2001), diante da necessidade de avaliar a estratÃgia utilizada pela empresa, nÃo somente na dimensÃo econÃmica, mas tambÃm social e ambiental, propÃs o Modelo de AvaliaÃÃo da EstratÃgia TrÃplice, denominado de ECP-Triplo (Estrutura-Conduta-Performance). Diferente do modelo SCP que enfatiza apenas a dimensÃo econÃmica como aspecto de desempenho, o modelo ECP_Triplo inclui tambÃm os aspectos sociais e ambientais. Mas, mesmo assim, maioria dos modelos, incluindo aà o ECP-Triplo, baseia sua anÃlise unicamente em estatÃsticas descritivas sem poder explicativo das relaÃÃes entre as variÃveis de estrutura/conduta/performance. Chegou-se a realizar atà uma regressÃo linear mÃltipla, no caso de Abreu e outros (2009), no entanto, somente com um Ãndice social criado a partir das condutas e o desempenho. Em busca de um elo mais forte entre o construto teÃrico e sua medida, este trabalho utilizou-se de Modelagem de EquaÃÃes Estruturais (MEE) para avaliar e medir, por meio da anÃlise quantitativa multivariada, as relaÃÃes entre os atores e prÃticas das organizaÃÃes, bem como a relaÃÃo de ambos com os resultados da firma. Os dados utilizados foram da pesquisa de Abreu (2008) realizada no ano de 2009 com empresas que atuam no Brasil. Foram obtidos 112 questionÃrios vÃlidos na survey realizada por Abreu (2008). A maioria delas de mÃdio (42,0%) e grande porte (38,4%), com mais da metade de suas vendas para o mercado interno (54,5%) e um forte retorno de respondentes da indÃstria quÃmica (27,7%). Os resultados obtidos confirmaram a relaÃÃo existente entre os construtos que compÃem o modelo de estratÃgia corporativa sustentÃvel, no entanto, apenas a relaÃÃo entre a influÃncia dos stakeholders e a responsabilidade corporativa foi significante. As relaÃÃes entre stakeholders e estratÃgias de negÃcios, estratÃgias de negÃcios e responsabilidade corporativa, estratÃgias de negÃcios e vantagens competitivas, bem como entre a responsabilidade corporativa confirmaram a ser positivas, porÃm nÃo se apresentaram significantes, sendo necessÃrio um estudo mais aprofundado dessas relaÃÃes e com uma amostra mais robusta. Sob o ponto de vista de gestÃo, as organizaÃÃes podem se beneficiar dos resultados, pois, mesmo com amostra mÃnima necessÃria para tÃcnicas estatÃsticas mais sofisticadas (caso da AnÃlise fatorial e da MEE) a relaÃÃo entre os construtos influÃncia dos stakeholders e responsabilidade corporativa mostrou-se significativa, indicando o interesse cada vez maior das partes interessadas na forma como a empresa trata as questÃes social e ambiental. Assim, a partir do conhecimento gerado, pode-se alcanÃar vantagens competitivas a partir da relaÃÃo empresa-stakeholders.
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Optimal cruise control of heavy-haul trains equipped with electronic controlled pneumatic brake systemsChou, Ming-Shan 24 January 2006 (has links)
In this study a closed-loop cruise controller to minimise the running costs of the heavy-haul train is proposed. The running costs of a heavy-haul train are dependent on its travelling time, maintenance costs and energy consumption during the trip. The Coallink train with the new train technologies, Distributed Power (DP) traction and Electronically Controlled Pneumatic (ECP) brake system, is the centre of the study. A literature study on existing train control, both passenger and heavy-haul trains, is carried out to build up a knowledge base. Many different techniques for train handling were observed, their features in relation to heavy-haul ECP trains are discussed. From these backgrounds, a comprehensive longitudinal train model is proposed and successfully validated with real-life data from Spoornet. In the model, both static and dynamic in-train forces are studied, as well as energy consumption. This is possible by modelling each locomotive and wagon as an individual unit. The equations of motion for the train with coupled units and additional non-linearities, such as traction power limits, are considered. An open-loop controller for maintaining equilibrium velocity is designed. During transient velocity changes, a transient controller for calculating the required additional acceleration and deceleration is designed and validated. Because locomotive traction settings are only available in discrete notches, quantisation conversion from force into notches results in input chattering. In addition, during brake to traction transitions, the locomotives receive a sudden traction demand which results in spikes in in-train forces. To avoid these problems, input filtering is performed for these inputs. Closed-loop controllers based on LQR method, optimised for in-train forces, energy consumption and velocity regulation respectively, are designed and compared. To overcome the communication constraints, a fencing concept is introduced whereby the controller is reconfigured adaptively to the current track topology. Different train configurations in terms of availability of additional control channels for both traction and braking are compared, as well as their effects on dynamic and static in-train force. These configurations are unified, distributed and individual traction and brake controls. The results from these different configurations are compared to recorded train data and given in this study. From the results, it is found that the closed-loop controller optimised for in-train force is able to provide the best overall improvement out of the three controllers. / Dissertation (MEng)--University of Pretoria, 2007. / Electrical, Electronic and Computer Engineering / Unrestricted
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Emergency Contraception in Brazil: Exploring the Journey of the Medication and Current AvailabilityRocha Tavares, Marilia Paula January 2017 (has links)
Brazil’s healthcare system currently offers a wide range of contraception options and emergency contraception (EC) has been among them since the late 1990s. Abortion, however, is severely legally restricted and high rates of both teenage pregnancy and unsafe abortion plague the country. Given this context, levonorgestrel emergency contraceptive pills (ECPs) could play a significant role women’s health and lives. This research aimed to examine the journey of this medication in Brazilian society and assess its availability in three cities located in different regions of the country. To address these research objectives, I performed a textual and discourse analysis of written materials as well as a mystery client study. Despite the wide availability of ECPs in retail pharmacies, I found that religious beliefs and conservative values still hinder accessibility. The results suggest that awareness raising campaigns are needed and long overdue. However, there is also a need to employ novel strategies for improving access and engaging healthcare professionals. Further research and advocacy related to women’s reproductive health and rights in general, and EC in particular, appears warranted.
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EFFECT OF EXTERNAL COUNTERPULSATION (ECP) ON DELAYED ONSET MUSCLE SORENESS (DOMS) IN LONG DISTANCE RUNNERSCatanese, Carly January 2007 (has links)
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Estudo do padrão de adesão agregativa de Escherichia coli do sorotipo O142:H34. / Study of aggreggative adherence pattern of Escherichia coli from serotype O142:H34.Vasconcellos, Francielli Mahnic de 29 August 2014 (has links)
Um estudo prévio descreveu uma cepa de Escherichia coli enteropatogênica (EPEC) do sorotipo O142:H34 (Ec48/66) que apresentava o padrão de adesão agregativa (AA), característico de E. coli enteroagregativa (EAEC), e os genes eae e aatA. O objetivo deste estudo foi avaliar o papel de fímbrias no padrão AA dessa cepa. A mesma aderiu no padrão AA nas linhagens HeLa, HEp-2, HT-29 e T84, além de causar a lesão A/E em células HeLa e HT-29. Foi detectada a presença dos genes que compõem o operon da fímbria AAF/I de EAEC e da fímbria E. coli common pilus (ECP). Ambos os operons foram sequenciados mostrando alta identidade com os operons presentes em EAEC (agg) e EPEC (ecp). Mutantes nos genes aggC e ecpC mantiveram o padrão AA e a capacidade de causar a lesão A/E em células HeLa. O mutante em aggC apresentou diminuição significativa da adesão. Análises filogenéticas posicionaram essa cepa em um grupo constituído por EPEC. A cepa Ec48/66 é uma EPEC atípica que expressa o padrão AA, o qual é parcialmente dependente de uma variante de AAF/I, mas não de ECP. / A previous study described a strain of enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), serotype O142:H34 (Ec48/66), presenting the aggregative adherence pattern (AA), typical of enteroaggregative E. coli (EAEC), and the eae and aatA genes. The aim of this study was to evaluate the role of fimbriae in the AA pattern of Ec48/66. This strain presented the AA pattern in HeLa, HEp-2, HT-29 and T84 cells, and the ability to cause the A/E lesion in HeLa and HT-29 cells. The presence of the genes comprising the operons of AAF/I fimbriae and E. coli common pilus (ECP) was detected. Both operons were sequenced showing high identity with the operons present in EAEC (agg) and EPEC (ecp). Mutants in the aggC and ecp genes maintained the AA pattern and the ability to cause the A/E lesion in HeLa cells. The aggC mutation significantly reduced the adherence. Phylogenetic analyzes located the strain in the group consisting of EPEC. The Ec48/66 strain is an atypical EPEC expressing the AA pattern, which is partially dependent on a variant of AAF/I, but not on ECP.
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Estudo do padrão de adesão agregativa de Escherichia coli do sorotipo O142:H34. / Study of aggreggative adherence pattern of Escherichia coli from serotype O142:H34.Francielli Mahnic de Vasconcellos 29 August 2014 (has links)
Um estudo prévio descreveu uma cepa de Escherichia coli enteropatogênica (EPEC) do sorotipo O142:H34 (Ec48/66) que apresentava o padrão de adesão agregativa (AA), característico de E. coli enteroagregativa (EAEC), e os genes eae e aatA. O objetivo deste estudo foi avaliar o papel de fímbrias no padrão AA dessa cepa. A mesma aderiu no padrão AA nas linhagens HeLa, HEp-2, HT-29 e T84, além de causar a lesão A/E em células HeLa e HT-29. Foi detectada a presença dos genes que compõem o operon da fímbria AAF/I de EAEC e da fímbria E. coli common pilus (ECP). Ambos os operons foram sequenciados mostrando alta identidade com os operons presentes em EAEC (agg) e EPEC (ecp). Mutantes nos genes aggC e ecpC mantiveram o padrão AA e a capacidade de causar a lesão A/E em células HeLa. O mutante em aggC apresentou diminuição significativa da adesão. Análises filogenéticas posicionaram essa cepa em um grupo constituído por EPEC. A cepa Ec48/66 é uma EPEC atípica que expressa o padrão AA, o qual é parcialmente dependente de uma variante de AAF/I, mas não de ECP. / A previous study described a strain of enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), serotype O142:H34 (Ec48/66), presenting the aggregative adherence pattern (AA), typical of enteroaggregative E. coli (EAEC), and the eae and aatA genes. The aim of this study was to evaluate the role of fimbriae in the AA pattern of Ec48/66. This strain presented the AA pattern in HeLa, HEp-2, HT-29 and T84 cells, and the ability to cause the A/E lesion in HeLa and HT-29 cells. The presence of the genes comprising the operons of AAF/I fimbriae and E. coli common pilus (ECP) was detected. Both operons were sequenced showing high identity with the operons present in EAEC (agg) and EPEC (ecp). Mutants in the aggC and ecp genes maintained the AA pattern and the ability to cause the A/E lesion in HeLa cells. The aggC mutation significantly reduced the adherence. Phylogenetic analyzes located the strain in the group consisting of EPEC. The Ec48/66 strain is an atypical EPEC expressing the AA pattern, which is partially dependent on a variant of AAF/I, but not on ECP.
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