Orientador: Rogério Abdallah Curi / Resumo: Na raça Quarto de Milha de equinos (Equus caballus), diferentes objetivos de seleção levaram à formação de linhagens com distintas habilidades, entre as quais a de trabalho e a de corrida. A linhagem de trabalho destina-se às provas de caráter funcional, explorando habilidades como agilidade e obediência, características consideradas de grande importância no manejo do gado a campo. Os animais de corrida apresentam melhor desempenho em pistas de curtas distâncias do que qualquer outra raça de equinos. O objetivo deste estudo foi caracterizar, por meio da genotipagem de SNP em larga escala, o desequilíbrio de ligação (LD), calculado por r², nas linhagens de trabalho e de corrida de cavalos Quarto de Milha criados no Brasil. Também foi investigado o tamanho efetivo (Ne) das duas populações, bem como as suas estruturas e relações. Para tanto, foram utilizados 428 equinos Quarto de Milha, de ambos os sexos, registrados na associação Brasileira de criadores da raça (ABQM), sendo 68 da linhagem de trabalho e 360 da de corrida. Estes animais tiveram o sangue colhido no Jockey Club de Sorocaba (Sorocaba/SP) e em propriedades rurais localizadas em dezenas de cidades do interior do Estado de São Paulo. Cento e oitenta e oito animais, 68 da linhagem de trabalho e 120 da de corrida foram genotipados, no ano de 2011, utilizando arranjo de 54.602 SNP (54K). As demais amostras da linhagem de corrida (n = 240) foram genotipadas, no ano de 2015, com arranjo de 65.157 SNP (65K). Após a realizaç... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In the Quarter Horse breed (Equus caballus), different selection objectives led to the formation of lineages with different abilities, including cutting and racing. The cutting line intended for functional tests, exploring skills such as agility and obedience, characteristics considered of great importance in the management of cattle. Racing animals perform better on runways short distances than any other horse breed. The objective of this study was to characterize, by means of large-scale SNP genotyping, the linkage disequilibrium (LD), calculated by r², in the cutting and racing lines of Quarter Horses created in Brazil. The effective size (Ne) of the two populations was investigated, as well as their structures and relationships. For that, 428 Quarter Horses of both sexes, registered in the Brazilian Association of Breeders (ABQM) were used, of which 68 were from the cutting line and 360 from the racing. These animals had blood collected at the Jockey Club of Sorocaba (Sorocaba/SP) and on rural properties located in dozens of cities in the interior of the São Paulo State. One hundred and eighty-eight animals, 68 of the cutting line and 120 of the racing were genotyped in the year 2011, using a 54,602 SNP array (54K). The other racing line samples (n = 240) were genotyped in 2015, with an array of 65,157 SNP (65K). After the imputation process, the number of informative SNP in the racing line was 55,114. Thus, for the subsequent genetic analyzes performed on the cutting and... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Submitted by MARCELA APARECIDA DE MORAES null (ma_apmoraes@yahoo.com.br) on 2016-03-14T18:12:59Z No. of bitstreams: 1 Tese_MarcelaMoraes_11-03-2016.pdf: 3817894 bytes, checksum: dc95b3a70da2ac90d7bed012881cfc8b (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-03-15T12:31:11Z (GMT) No. of bitstreams: 1 moraes_ma_dr_ilha.pdf: 3817894 bytes, checksum: dc95b3a70da2ac90d7bed012881cfc8b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-15T12:31:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 moraes_ma_dr_ilha.pdf: 3817894 bytes, checksum: dc95b3a70da2ac90d7bed012881cfc8b (MD5) Previous issue date: 2016-02-05 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Os objetivos deste trabalho foram verificar o sistema de reprodução entre e dentro de frutos, a distância e padrões de fluxo de pólen, os níveis de endogamia e diversidade genética, a depressão por endogamia e a distribuição espacial de genótipos em duas populações de Hymenaea stigonocarpa: a primeira está presente em um fragmento e a segunda em árvores isoladas na pastagem. Para tanto, foram mapeadas e medidas todas as árvores adultas reprodutivas existentes nos dois locais. Foram coletadas sementes de 15 árvores matrizes no fragmento florestal e em 20 árvores matrizes isoladas na pastagem, sendo 30 sementes por árvore. Esta coleta propiciou a instalação de um teste de progênies na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da FEIS/UNESP. Foram feitas a genotipagem de todas as árvores adultas de ambas as populações e de todas as progênies. Adicionalmente, dentro do fragmento foram também amostrados, mapeados e medida a altura de juvenis. As análises genéticas permitiram avaliar os efeitos da depressão por endogamia para altura e sobrevivência, e as análises dos genótipos foram feitas para seis locos microssatélites, já transferidos para a espécie. O estudo do sistema de reprodução foi baseado no modelo misto de reprodução e modelo de cruzamentos correlacionados. A análise de paternidade das sementes permitiu determinar a distância e o padrão de fluxo efetivo de pólen dentro das populações, bem como o fluxo gênico externo das áreas amostradas. A análise da distribuição espacial dos genótipos foi realizada para árvores adultas localizadas dentro dos fragmentos, utilizando-se estimativas do coeficiente de coancestria entre pares de indivíduos dentro de diferentes classes de distância, tornando-se possível estimar o tamanho efetivo de variância e, assim, estabelecer estratégias para a coleta de sementes. Os resultados permitiram entender o processo de reprodução que indica a presença marcante de progênies de irmãos-completos, formação da estrutura genética espacial, vizinhança genética reprodutiva e depressão por endogamia na geração descendente proveniente de ambas as populações de H. stigonocarpa. A coleta de sementes deve ser feita em árvores espaçadas de pelo menos 350 m de distância em 78 árvores com 30 sementes cada árvore para reter o tamanho efetivo de referência de 150 nas amostras para garantir o estabelecimento destas gerações futuras em longo prazo na conservação “ex situ” e/ou reflorestamento em áreas degradadas. / The aim of this work were to study the mating system within and among fruits, distance and pollen flow patterns, inbreeding levels and genetic diversity, inbreeding depression and the spatial distribution of genotypes in two populations of Hymenaea stigonocarpa: first is present in a fragment and the second in isolated trees in the pasture. Therefore, were mapped and measures all existing reproductive adult trees in both sites. It was collected seed of 15 seed trees in the forest fragment and in 20 isolated trees in the pasture, with 30 seeds per tree. This collection allowed the installation of a progeny test in Farm of Teaching, Research and Extension from FEIS/UNESP. It was made genotyping of all adult trees of both populations and all progenies. Additionally, within the fragment were also sampled, mapped and measured the height of juveniles. Genetic analysis allowed to evaluate the effects of inbreeding depression for height and survival, and analysis of genotypes were made for six microsatellite loci, already transferred for the species. The mating system study was based on the mixed mating model and correlated mating model. The paternity analysis of the seeds allowed to determine the distance and the pattern of effective flow of pollen within the fragments, as well as the outside gene flow of the sampled areas. The spatial distribution analysis of genotypes was done for adult trees located within of the fragments, using estimates coancestry coefficient between pairs of individuals within different distances classes, making it possible to estimate the variance effective size and thereby establish strategies for seed collection. The results allowed understanding the process of mating that indicates the strong presence of progeny full-sibs, formation of spatial genetic structure, reproductive genetic neighborhood and inbreeding depression in the descending generation from both populations of H. stigonocarpa. Seed collection should be done in trees spaced of at least 350 m away in 78 trees with 30 seeds each tree to retain the effective size of the reference 150 in the samples to ensure the establishment of these future generations in the long-term conservation "ex situ "and / or reforestation in degraded areas. / CNPq: 141028/2012-2

Submitted by Cíntia Maria Marchiori (cintia-marchiori@hotmail.com) on 2018-05-16T23:45:36Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Definitiva.pdf: 1874440 bytes, checksum: e48c0b00ff81957eb607e25504e3a9ae (MD5) / Approved for entry into archive by Alexandra Maria Donadon Lusser Segali null (alexmar@fcav.unesp.br) on 2018-05-17T16:56:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 marchiori_cm_me_jabo.pdf: 1874440 bytes, checksum: e48c0b00ff81957eb607e25504e3a9ae (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-17T16:56:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 marchiori_cm_me_jabo.pdf: 1874440 bytes, checksum: e48c0b00ff81957eb607e25504e3a9ae (MD5) Previous issue date: 2018-04-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Na raça Quarto de Milha de equinos (Equus caballus), diferentes objetivos de seleção levaram à formação de linhagens com distintas habilidades, entre as quais a de trabalho e a de corrida. A linhagem de trabalho destina-se às provas de caráter funcional, explorando habilidades como agilidade e obediência, características consideradas de grande importância no manejo do gado a campo. Os animais de corrida apresentam melhor desempenho em pistas de curtas distâncias do que qualquer outra raça de equinos. O objetivo deste estudo foi caracterizar, por meio da genotipagem de SNP em larga escala, o desequilíbrio de ligação (LD), calculado por r², nas linhagens de trabalho e de corrida de cavalos Quarto de Milha criados no Brasil. Também foi investigado o tamanho efetivo (Ne) das duas populações, bem como as suas estruturas e relações. Para tanto, foram utilizados 428 equinos Quarto de Milha, de ambos os sexos, registrados na associação Brasileira de criadores da raça (ABQM), sendo 68 da linhagem de trabalho e 360 da de corrida. Estes animais tiveram o sangue colhido no Jockey Club de Sorocaba (Sorocaba/SP) e em propriedades rurais localizadas em dezenas de cidades do interior do Estado de São Paulo. Cento e oitenta e oito animais, 68 da linhagem de trabalho e 120 da de corrida foram genotipados, no ano de 2011, utilizando arranjo de 54.602 SNP (54K). As demais amostras da linhagem de corrida (n = 240) foram genotipadas, no ano de 2015, com arranjo de 65.157 SNP (65K). Após a realização de processo de imputação, o número de SNP informativos na linhagem de corrida foi de 55.114. Desta forma, para as análises genéticas subsequentes realizadas nas linhagens de trabalho e de corrida foram utilizados 43.117 e 55.114 SNP, respectivamente. O r² genômico médio entre pares de marcadores foi 0,22 para a linhagem de trabalho e 0,27 para a de corrida. Na linhagem de trabalho o r² foi inferior a 0,2 entre 100 e 150 Kb, enquanto na de corrida foram encontrados valores de r² menores que 0,2 entre 300 e 350 Kb. A estimativa dos valores de Ne foi de 60 e 50 animais na última geração para as linhagens de trabalho e de corrida, respectivamente. A maior extensão do LD e o menor Ne na linhagem de corrida podem ser explicados pela sua estrutura populacional mais fechada em decorrência do maior rigor no registro genealógico dos animais, além da grande influência do Puro-Sangue Inglês na sua formação. O estudo da estrutura da população indicou clara distinção entre as duas linhagens da raça. Na linhagem de corrida, contudo, foram evidenciadas substruturas populacionais decorrentes da formação de famílias que descendem de diferentes e importantes reprodutores. / In the Quarter Horse breed (Equus caballus), different selection objectives led to the formation of lineages with different abilities, including cutting and racing. The cutting line intended for functional tests, exploring skills such as agility and obedience, characteristics considered of great importance in the management of cattle. Racing animals perform better on runways short distances than any other horse breed. The objective of this study was to characterize, by means of large-scale SNP genotyping, the linkage disequilibrium (LD), calculated by r², in the cutting and racing lines of Quarter Horses created in Brazil. The effective size (Ne) of the two populations was investigated, as well as their structures and relationships. For that, 428 Quarter Horses of both sexes, registered in the Brazilian Association of Breeders (ABQM) were used, of which 68 were from the cutting line and 360 from the racing. These animals had blood collected at the Jockey Club of Sorocaba (Sorocaba/SP) and on rural properties located in dozens of cities in the interior of the São Paulo State. One hundred and eighty-eight animals, 68 of the cutting line and 120 of the racing were genotyped in the year 2011, using a 54,602 SNP array (54K). The other racing line samples (n = 240) were genotyped in 2015, with an array of 65,157 SNP (65K). After the imputation process, the number of informative SNP in the racing line was 55,114. Thus, for the subsequent genetic analyzes performed on the cutting and racing lines, 43,117 and 55,114 SNP were used, respectively. The mean genomic r² between pairs of markers was 0.22 for the cutting line and 0.27 for the racing. In the cutting line the r² was less than 0.2 between 100 and 150 Kb, while in the racing r² values were lower than 0.2 between 300 and 350 Kb. The estimates of Ne values were 60 and 50 animals in the last generation for the cutting and racing lines, respectively. The longer extent of the LD and the smaller Ne in the racing line can be explained by its more closed population structure due to the greater rigor in the genealogical register of the animals, further on the great influence of the Thoroughbred in its formation. The population structure study indicated a clear distinction between the two lineages of the breed. However, in the racing line, population substructures were evidenced due to the formation of families that descend from different and important stallions.

Orientador: Alexandre Magno Sebbenn / Resumo: Os objetivos deste trabalho foram verificar o sistema de reprodução entre e dentro de frutos, a distância e padrões de fluxo de pólen, os níveis de endogamia e diversidade genética, a depressão por endogamia e a distribuição espacial de genótipos em duas populações de Hymenaea stigonocarpa: a primeira está presente em um fragmento e a segunda em árvores isoladas na pastagem. Para tanto, foram mapeadas e medidas todas as árvores adultas reprodutivas existentes nos dois locais. Foram coletadas sementes de 15 árvores matrizes no fragmento florestal e em 20 árvores matrizes isoladas na pastagem, sendo 30 sementes por árvore. Esta coleta propiciou a instalação de um teste de progênies na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da FEIS/UNESP. Foram feitas a genotipagem de todas as árvores adultas de ambas as populações e de todas as progênies. Adicionalmente, dentro do fragmento foram também amostrados, mapeados e medida a altura de juvenis. As análises genéticas permitiram avaliar os efeitos da depressão por endogamia para altura e sobrevivência, e as análises dos genótipos foram feitas para seis locos microssatélites, já transferidos para a espécie. O estudo do sistema de reprodução foi baseado no modelo misto de reprodução e modelo de cruzamentos correlacionados. A análise de paternidade das sementes permitiu determinar a distância e o padrão de fluxo efetivo de pólen dentro das populações, bem como o fluxo gênico externo das áreas amostradas. A análise da distribuição espacial d... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of this work were to study the mating system within and among fruits, distance and pollen flow patterns, inbreeding levels and genetic diversity, inbreeding depression and the spatial distribution of genotypes in two populations of Hymenaea stigonocarpa: first is present in a fragment and the second in isolated trees in the pasture. Therefore, were mapped and measures all existing reproductive adult trees in both sites. It was collected seed of 15 seed trees in the forest fragment and in 20 isolated trees in the pasture, with 30 seeds per tree. This collection allowed the installation of a progeny test in Farm of Teaching, Research and Extension from FEIS/UNESP. It was made genotyping of all adult trees of both populations and all progenies. Additionally, within the fragment were also sampled, mapped and measured the height of juveniles. Genetic analysis allowed to evaluate the effects of inbreeding depression for height and survival, and analysis of genotypes were made for six microsatellite loci, already transferred for the species. The mating system study was based on the mixed mating model and correlated mating model. The paternity analysis of the seeds allowed to determine the distance and the pattern of effective flow of pollen within the fragments, as well as the outside gene flow of the sampled areas. The spatial distribution analysis of genotypes was done for adult trees located within of the fragments, using estimates coancestry coefficient between pairs of ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Resumo: Myracrodruon urundeuva é uma espécie arbórea nativa suscetível à extinção. O objetivo foi avaliar a variação genética para caracteres silviculturais, a sobrevivência e a proporção sexual, em dois testes de progênies de M. urundeuva, visando fornecer subsídios para conservação ex situ. Foram analisadas 30 progênies em dois testes de progênies em sistemas de plantio distintos - misto (TP-MUE) e homogêneo (TP-DES). Os caracteres silviculturais avaliados foram altura (ALT), diâmetro a altura do peito (DAP), diâmetro médio de copa (DMC), sobrevivência (SOB), número de árvores com florescimento masculino (Nm), feminino (Nf), árvores monóicas (Mo) e sem florescimento (Sf). As estimativas dos parâmetros genéticos foram obtidas pelo procedimento REML/BLUP. A taxa de SOB foi alta para os dois testes (> 80%). A média para ALT variou de 7,58 m (TP-MUE) a 10,02 m (TP-DES); para DAP de 8,24 cm (TP-MUE) a 10,91 cm (TP-DES). A herdabilidade da média de progênies variou de moderada a alta (0,39 a 0,72). No TP-MUE, a proporção sexual foi de 2♂:1♀ e no TP-DES de 4♂:1♀. O tamanho efetivo (Ne) do TP-MUE representou 38% do Ne esperado e no TP-DES foi de 12%. Existe variabilidade genética para conservação genética ex situ de M. urundeuva a curto prazo. / Abstract: Myracrodruon urundeuva is a native tree species susceptible to extinction. The objective was to evaluate the genetic variation for silvicultural traits, survival and sex ratio, in two tests of progenies of Myracrodruon urundeuva, aiming to provide subsidies for ex situ conservation. Thirty progenies were analyzed in two progeny tests in different planting systems - mixed (TP-MUE) and homogeneous (TP-DES). The silvicultural characters evaluated were height (ALT), diameter at breast height (DBH), average crown diameter (DMC), survival (SOB), number of trees with male flowering (Nm), female (Nf), modern trees (Mo) and without flowering (Sf). Estimates of genetic parameters were obtained using the REML / BLUP procedure. The SOB rate was high for both tests (> 80%). The mean for ALT ranged from 7.58 m (TP-MUE) to 10.02 m (TP-DES); for 8.24 cm DAP (TP-MUE) to 10.91 cm (TP-DES). The heritability of the average of progenies varied from moderate to high (0.39 to 0.72). In the TP-MUE, the sex ratio was 2♂: 1♀ and in the TP-DES 4♂: 1♀. The effective size (Ne) of the TP-MUE represented 38% of the expected Ne and in the TP-DES it was 12%. Therefore, there is genetic variability for ex situ genetic conservation of M. urundeuva in the short term. / Mestre

Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Resumo: As ações antrópicas no bioma Cerrado levaram a perturbações do seu ecossistema e a fragmentação das florestas, colocando em risco de extinção a espécie Myracrodruon urundeuva. O objetivo do estudo foi avaliar os caracteres silviculturais para estimar os parâmetros genéticos nos bancos de germoplasma provenientes de populações naturais em Bauru-SP e Selvíria-MS, a fim de adquirir informações que possibilitem a formação de pomares de sementes melhoradas visando a qualidade da madeira. Aos 31 anos de idade, analisou-se os caracteres altura total (ALT), diâmetro médio da copa (DMC), diâmetro na altura do peito (DAP), forma do fuste (FOR), densidade básica da madeira (DBM), relação cerne/alburno (RC/Ab) e sobrevivência (SOB). Utilizou-se o procedimento REML/BLUP via metodologia dos modelos lineares mistos para estimar os componentes de variância, os parâmetros genéticos e as estimativas de correlações genéticas entre os caracteres. Para as análises de divergência genética foi utilizado o programa Genes. Os testes de progênies de ambas as populações apresentaram variação genética. Os caracteres referentes a qualidade de madeira (DBM e RC/Ab) foram os que apresentaram maiores herdabilidades, com cerca de 0,80 e coeficiente de variação genética (16,57% a 70,10%). As correlações genéticas mostraram diferentes resultados em ambas as populações, com Selvíria sendo a população com maiores correlações positivas significativas, permitindo o uso de seleção direta e indireta tanto para os ca... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Anthropic actions in the Cerrado biome led to disturbances of its ecosystem and the fragmentation of forests, putting the species Myracrodruon urundeuva at risk of extinction. The objective of the study was to evaluate the silvicultural traits to estimate the genetic parameters in the germplasm banks from natural populations in Bauru-SP and Selvíria-MS, in order to acquire information that allows the formation of improved seed orchards aiming at the quality of the wood. At 31 years of age, the characters total height (ALT), average crown diameter (DMC), diameter at chest height (DAP), stem shape (FOR), basic wood density (DBM), ratio heartwood / sapwood (RC / Ab) and survival (SOB). The REML / BLUP procedure was used via mixed linear models methodology to estimate the components of variance, genetic parameters and estimates of genetic correlations between the characters. For the genetic divergence analyzes, the Genes program was used. The progeny tests of both populations showed genetic variation. The characters referring to wood quality (DBM and RC / Ab) were those with the highest heritability, with about 0,80 and coefficient of genetic variation (16,57% to 70,10%). The genetic correlations showed different results in both populations, with Selvíria being the population with the highest significant positive correlations, allowing the use of direct and indirect selection for both growth and wood quality characters. In the dissimilarity analyzes, the Selvíria population was t... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Balfourodendron riedelianum (Engl.) Engl. e uma espécie arbórea tropical que ocorre na Mata Atlântica e está em perigo de extinção devido a fragmentação do bioma e a exploração de sua madeira. Atualmente três populações da espécie estão sendo conservadas em um teste de procedências e progênies implantado na Estação Experimental de Luiz Antonio, estado de São Paulo, Brasil. O teste e composto por procedências de Alvorada do Sul, estado do Paraná, Gália e Bauru, ambas do estado de São Paulo. Com o objetivo de verificar o potencial do teste como fonte de sementes para a recomposição florestal, esse estudo avaliou a biometria de frutos, geminação de sementes, mortalidade e sobrevivência de plântulas da espécie. Foram desenvolvidos, marcadores microssatélites para a análise da diversidade genética, endogamia, sistema de reprodução, fluxo e dispersão de pólen e depressão por endogamia (DE). A variação observada entre as matrizes para a biometria de frutos, assim como para germinação, mortalidade e sobrevivência sugerem que estas sejam decorrentes da variabilidade genética, não foi detectada correlação entre a biometria e germinação. Os microssatélites apresentaram alto nível de polimorfismo e ausência de desvios de segregação Mendeliana, ligação genética e desequilíbrio de ligação. A procedência Gália apresentou a maior riqueza alélica (R = 10,3), heterozigosidade esperada (He = 0,60) e índice de fixação (F = 0,11) e a procedência Alvorada do Sul apresentou a maior heterozigosidade observada (Ho = 0,58) e o menor índice de fixação (F = -0,01). As plântulas apresentaram a menor riqueza alélica (R = 9,4) e heterozigosidade observada (Ho = 0,48) e o maior índice de fixação (F = 0,16). A taxa de cruzamento (tm) foi alta (> 0,93), mas foi observado para as plântulas uma variação individual na taxa de cruzamento (tm = 0,68 a 0,99), cruzamento entre parentes (tm - ts = 0 a 0,18) e na correlação de paternidade (rp = 0,041 a 0,182), o que indica que a espécie se reproduz predominantemente por cruzamentos, e autocompatível e que a reprodução não foi aleatória. A distância média de dispersão do pólen (71 m) maior que a mediana (21 m) sugere um padrão de isolamento por distância. Aos 12 meses as plântulas oriundas de autofecundação apresentaram os menores valores de C e Ho e o maior F (2,98 mm; 0,25 e 0,61) do que as de cruzamento entre parentes (3,10 mm, 0,34 e 0,29, respectivamente) e não parentes (3,30 mm, 0,51 e 0,07, respectivamente). A autofecundação resultou em maior DE para circunferência a altura do colo (9,6%) e o cruzamento entre parentes para altura (2,6%). Para fins de conservação, sementes de no mínimo 53 arvores devem ser coletadas para alcançar um Ne(ref) de 150 indivíduos, da mesma forma, devem ser mantidos também pelo menos 53 indivíduos com a mesma fenologia de florescimento a cada ciclo de desbaste. A endogamia decorrente de cruzamentos entre parentes pode ser minimizada se apenas uma planta por família for selecionada dentro das parcelas e pode ser eliminada se apenas uma planta por família for selecionada no teste, sendo possível obter ganhos com a seleção em ambos os casos. / Balfourodendron riedelianum (Engl.) Engl. is a tropical tree species of the Atlantic Forest that is endangered due to exploitation of its wood and biome fragmentation. Currently, three populations of the species are preserved in a provenance and progeny test established in the Luiz Antônio Experimental Station, São Paulo State, Brazil. The test consists of provenances from Alvorada do Sul, Parana State, and Galia and Bauru, both from São Paulo State. In order to verify the potential of the test as a seed source for forest restoration, this study evaluates the species\' fruit biometry, seed germination, mortality and seedling survival. Microsatellite markers were developed to analyze genetic diversity, inbreeding, mating system, pollen flow and dispersal, and inbreeding depression (ID). The variation observed between seed trees for fruit biometry, as well as for germination, mortality and survival, suggests a correlation with genetic variability. No correlation was detected between biometry and germination. Microsatellites presented a high level of polymorphism and an absence of deviation from Mendelian segregation, genetic linkage, and linkage disequilibrium. The Galia population had the highest allelic richness (R = 10.3), expected heterozygosity (He = 0.60), and fixation index (F = 0.11), and Alvorada do Sul had the highest observed heterozygosity (Ho = 0.58) and the lowest fixation index (F = -0.01). Seedlings showed the lowest allelic richness (R = 9.4) and observed heterozygosity (Ho = 0.48) and the highest fixation index (F = 0.16). The outcrossing rate (tm) was high (> 0.93). However, there was individual variation in seedlings for the outcrossing rate (tm = 0.68 to 0.99), mating between relatives (tm - ts = 0 to 0.18), and paternity correlation (rp = 0.041 to 0.182), indicating that the species has a predominantly outcrossed mating system, is selfcompatible, and that reproduction is not random. The mean pollen dispersal distance (71 m) was greater than the median (21 m), suggesting a pattern of isolation by distance. At 12 months, seedlings resulting from selfing had the lowest values of C, Ho, and higher F (2.98 mm, 0.25, and 0.61, respectively) than those from mating between relatives (3.10 mm, 0.34, and 0.29) and unrelated individuals (3.30 mm, 0.51, and 0.07). Selfing resulted in higher ID for root-collar circumference (9.6%) and mating between relatives showed a higher ID for height (2.6%). For conservation purposes, seeds of at least 53 trees must be collected to reach Ne(ref) of 150 individuals and at least 53 individuals with the same flowering phenology must be maintained at each thinning cycle. Inbreeding resulting from crosses between relatives can be minimized if only one plant per family is selected within the plots and can be eliminated if only one plant per family is selected in the test, thus enabling gains with selection in both cases.

Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Abstract: The forest fragment and progeny tests, with the function of assisting conservation, rehabilitation of ecological processes and promoting biodiversity conservation, play an important role in the restoration of degraded areas and reduce the negative effects of the destruction of natural environments. This work aimed to know the population structure, spatial distribution and effective size of native tree species present in a cerrado forest fragment, besides estimating the genetic variability in a test of mixed progenies of Myracrodruon urundeuva; Terminalia argentea and Astronium fraxinifolium; from silvicultural characters in Selvíria - MS, with a view to transforming them into an area to subsidize seed collection. In the forest fragment were measured and identified 1187 individuals with DBH ≥ 10 cm, which make up the arboreal forest canopy. In an area of 0,89 ha were sampled, belonging to 60 species distributed in 31 families, with emphasis on the Fabaceae family with 11 species. The Shannon-Weaver index showed a H '= 2,98 nats ind-1, which can be considered as a mean diversity. The species with the highest Import Value Index (IVI) were Copaifera landesdorffii, Diptychandra aurantiaca, Parapiptadenia rigida, Qualea grandiflora, Qualea parviflora, Vochysia tucanorum, Tapirira guianensis, Astronium fraxinifolium, Xylopia aromatica, and Mabea fistulifera. Thus, among the species found with the highest IVI can be classified as potential for the lease of matrix trees to subsidize t... (Complete abstract click electronic access below) / Resumo: O fragmento florestal e os testes de progênies, com a função de auxiliar a conservação, reabilitação dos processos ecológicos e promover a conservação da biodiversidade, tem um papel importante nos processos de restauração de áreas degradadas e diminuir os efeitos negativos da destruição dos ambientes naturais. Este trabalho objetivou conhecer a estrutura populacional, distribuição espacial e tamanho efetivo de espécies arbóreas nativas presente em um fragmento florestal de cerrado, além de estimar a variabilidade genética num teste de progênies misto de Myracrodruon urundeuva; Terminalia argentea e Astronium fraxinifolium; a partir dos carácteres silviculturais em Selvíria – MS, com vistas de transformá-las em área para subsidiar coleta de sementes. No fragmento florestal foram mensurados e identificados 1187 indivíduos com DAP ≥ 10 cm, que compõem o dossel arbóreo da floresta. Em uma área de 0,89 ha foram amostrados, pertencentes a 60 espécies distribuídas em 31 famílias, com destaque para a família Fabaceae com 11 espécies. O índice de ShannonWeaver apresentou um H’ = 2,98 nats ind-1 , o que pode ser considerado como uma diversidade média. As espécies de maior Índice de Valor de Importância (IVI) foram Copaifera landesdorffii, Diptychandra aurantiaca, Parapiptadenia rigida, Qualea grandiflora, Qualea parviflora, Vochysia tucanorum, Tapirira guianensis, Astronium fraxinifolium, Xylopia aromatica, e Mabea fistulifera. Assim, dentre as espécies encontradas com o maior IVI pod... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Resumo: A aroeira (Myracrodruon urundeuva) é uma espécie dioica e se encontra na lista de espécies ameaçadas de extinção, devido ao seu alto valor econômico e à destruição do seu habitat. Dessa forma, se faz necessária a adoção de estratégias para a conservação ex situ dessa espécie arbórea nativa, de tal modo que a variabilidade genética das populações seja mantida. O objetivo deste trabalho foi quantificar a proporção sexual, a sobrevivência e a variação genética do diâmetro à altura do peito (DAP), em seis testes de progênies de M. urundeuva provenientes de seis populações distintas originárias de três biomas (Caatinga, Cerrado e Mata Atlântica). O delineamento utilizado, em cada teste de progênies, foi o de bloco casualizado. As estimativas de componentes de variância e parâmetros genéticos, para os caracteres quantitativos para os caracteres quantitativos, DAP e sobrevivência, foram realizadas pelo método REML/BLUP (máxima verossimilhança restrita / melhor predição linear não viciada). O tamanho efetivo da população foi calculado com base no número de indivíduos com flores masculinas e femininas, em um modelo que não há controle de gametas (RS). Verificou-se com base nas estimativas dos parâmetros genéticos que as procedências de Itarumã e Seridó expressam maior variação genética para o caráter DAP, o que possibilita sua utilização na conservação e no melhoramento genético. Foram encontrados altos percentuais de sobrevivência o que caracteriza uma ótima adaptação da espécie no l... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aroeira (Myracrodruon urundeuva) is a dioecious species and is on the list of endangered species due to its high economic value and the destruction of its habitat. That way, becomes necessary the adoption of strategies for the ex situ conservation of native tree species, such that the genetic variability of populations is maintained. The objective of this work was to quantify the sex ratio, the survival and the genetic variation of the diameter at breast height (DBH), on six test progenies of Myracrodruon urundeuva from six distinct populations originating three biomes (Caatinga, Cerrado and Atlantic Forest). The design used, in each progeny test, was a randomized block design. Estimates of variance components and genetic parameters, for quantitative traits DBH and survival, were obtained by REML / BLUP method (restricted maximum likelihood / best linear prediction untainted). The effective population size was calculated based on the number of individuals with male and female flowers in the population, in a model that there is no control of gametes (RS). It was verified based on the estimates of the genetic parameters that the Itarumã and Seridó provenances express greater genetic variation for the DBH character, which allows their use in conservation and genetic improvement. High survival percentages were found, which characterizes an optimal adaptation of the species at the planting site. The sex ratio was biased, with predominance of male flowering plants (3♂:1♀), but ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Submitted by Jose Cambuim null (jcambuim@adm.feis.unesp.br) on 2017-06-30T14:04:04Z No. of bitstreams: 1 Jose_Cambuim_2017_Doc_Agronomia_VF.pdf: 2793103 bytes, checksum: 1e3d9b4c1f86030fbfa1d8761130e797 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-06-30T14:29:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 cambuim_j_dr_ilha.pdf: 2793103 bytes, checksum: 1e3d9b4c1f86030fbfa1d8761130e797 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-30T14:29:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 cambuim_j_dr_ilha.pdf: 2793103 bytes, checksum: 1e3d9b4c1f86030fbfa1d8761130e797 (MD5) Previous issue date: 2017-05-02 / O fragmento florestal e os testes de progênies, com a função de auxiliar a conservação, reabilitação dos processos ecológicos e promover a conservação da biodiversidade, tem um papel importante nos processos de restauração de áreas degradadas e diminuir os efeitos negativos da destruição dos ambientes naturais. Este trabalho objetivou conhecer a estrutura populacional, distribuição espacial e tamanho efetivo de espécies arbóreas nativas presente em um fragmento florestal de cerrado, além de estimar a variabilidade genética num teste de progênies misto de Myracrodruon urundeuva; Terminalia argentea e Astronium fraxinifolium; a partir dos carácteres silviculturais em Selvíria – MS, com vistas de transformá-las em área para subsidiar coleta de sementes. No fragmento florestal foram mensurados e identificados 1187 indivíduos com DAP ≥ 10 cm, que compõem o dossel arbóreo da floresta. Em uma área de 0,89 ha foram amostrados, pertencentes a 60 espécies distribuídas em 31 famílias, com destaque para a família Fabaceae com 11 espécies. O índice de ShannonWeaver apresentou um H’ = 2,98 nats ind-1 , o que pode ser considerado como uma diversidade média. As espécies de maior Índice de Valor de Importância (IVI) foram Copaifera landesdorffii, Diptychandra aurantiaca, Parapiptadenia rigida, Qualea grandiflora, Qualea parviflora, Vochysia tucanorum, Tapirira guianensis, Astronium fraxinifolium, Xylopia aromatica, e Mabea fistulifera. Assim, dentre as espécies encontradas com o maior IVI podem ser classificadas como potenciais para a locação de árvores matrizes para subsidiar a coleta de sementes. Portanto, dispõem de tamanho efetivo que permite a formação de novas populações, a partir da coleta de sementes nessa área de Reserva legal. No teste de progênies misto aos 22 anos, os valores altos observados para o caráter SOB (M. urundeuva - 88,0%, A. fraxinifolium – 85,9% e T. argentea - 59,6%), indicam boa adaptação das espécies em estudo e potencial para uso em reflorestamentos. As estimativas do coeficiente de variação genética oscilaram de 3,03% a 49,50%, estimando o menor valor obtidos para a variável DAP nas três espécies. As herdabilidades individuais variaram de baixa (0,14) para T. argentea, e alta (>0,40) para M. urundeuva e A. fraxinifolium no caráter DAP. A proporção sexual para as duas espécies foi tendenciosa para sexo masculino, sendo que a proporção geral foi de 1,5 machos para 1 fêmea. O tamanho efetivo populacional variou conforme a proporção de machos e fêmeas, sendo que o que mais se aproximou do valor real de indivíduos reprodutivos foi Myracrodruon urundeuva. Portanto, a seleção dos indivíduos dentro dos testes de progênies não deve considerar apenas o caráter de crescimento (DAP), mas também com base na proporção sexual e no tamanho efetivo populacional para a sua futura transformação em um Pomar de Sementes por Mudas. As informações obtidas com este estudo são úteis para fins de conservação e melhoramento genético das espécies, como também para seleção de matrizes potenciais para recuperação ambiental, o que será fundamental para restauração ecológica em áreas do Bolsão Sul-Mato-Grossense. / The forest fragment and progeny tests, with the function of assisting conservation, rehabilitation of ecological processes and promoting biodiversity conservation, play an important role in the restoration of degraded areas and reduce the negative effects of the destruction of natural environments. This work aimed to know the population structure, spatial distribution and effective size of native tree species present in a cerrado forest fragment, besides estimating the genetic variability in a test of mixed progenies of Myracrodruon urundeuva; Terminalia argentea and Astronium fraxinifolium; from silvicultural characters in Selvíria - MS, with a view to transforming them into an area to subsidize seed collection. In the forest fragment were measured and identified 1187 individuals with DBH ≥ 10 cm, which make up the arboreal forest canopy. In an area of 0,89 ha were sampled, belonging to 60 species distributed in 31 families, with emphasis on the Fabaceae family with 11 species. The Shannon-Weaver index showed a H '= 2,98 nats ind-1, which can be considered as a mean diversity. The species with the highest Import Value Index (IVI) were Copaifera landesdorffii, Diptychandra aurantiaca, Parapiptadenia rigida, Qualea grandiflora, Qualea parviflora, Vochysia tucanorum, Tapirira guianensis, Astronium fraxinifolium, Xylopia aromatica, and Mabea fistulifera. Thus, among the species found with the highest IVI can be classified as potential for the lease of matrix trees to subsidize the collection of seeds. Therefore, they have an effective size that allows the formation of new populations, from the collection of seeds in this area of legal reserve. In the progenies test mixed at 22 years, the high values observed for SOB (M. urundeuva – 88,0%, A. fraxinifolium – 85,9% and T. argentea – 59,6%) indicated a good adaptation of the Species and potential for use in reforestation. Estimates of the coefficient of genetic variation ranged from 3,03% to 49,50%, estimating the lowest value obtained for the DAP variable in the three species. The individual heritabilities ranged from low (0,14) for T. argentea, and high (> 0,40) for M. urundeuva and A. fraxinifolium on the DAP character. The sex ratio for both species was biased for males, with the general proportion being 1,5 males for 1 female. The effective population size varied according to the proportion of males and females, and the one that most approached the real value of reproductive individuals was Myracrodruon urundeuva. Therefore, the selection of individuals within progeny tests should not only consider the growth character (DBH), but also on the basis of the sex ratio and the effective population size for its future transformation into a Seedling Seed Orchard. The information obtained from this study is useful for the conservation and genetic improvement of the species, as well as for the selection of potential matrices for environmental restoration, which will be fundamental for ecological restoration in areas of the Bolsão Sul-mato-grossense.