La tuberculose (TB) est une maladie infectieuse causée par M. tuberculosis. En 2009, la mortalité était élevée avec 1,7 millions de décès enregistrés dans le monde. La co-infection par le VIH, notamment en Afrique, et les tuberculoses à bacilles multi-résistants aux antibiotiques, rendent la maîtrise de la pandémie encore plus complexe. Les tests actuels de diagnostic présentent des lacunes notamment en terme de sensibilité pour la microscopie qui est le test le plus utilisé, ou en terme de praticité, en ce qui concerne la culture qui est le test de référence. Le développement de nouveaux tests pour le diagnostic de la TB active représente un enjeu majeur de nos sociétés modernes. Les tests immunologiques, en particulier les tests sérologiques actuellement disponibles, présentent une alternative aux tests bactériologiques couramment utilisés mais leurs performances restent faibles. Pour cela, il est indispensable de cibler de nouveaux biomarqueurs pour développer un test efficace, sensible, rapide et peu onéreux. C'est dans de cadre que s'inscrit ce travail de thèse.Nous rapportons dans ce mémoire, la recherche de marqueurs innovants dans le cadre de la mise au point d'un test de diagnostic de la tuberculose. Nous avons ciblé plusieurs marqueurs protéiques (OmpATb, LipY, Rv0183, Rv1984c et Rv3452) et un marqueur glycolipide, le tréhalose-6,6'-dimycolate (TDM). Parmi ces candidats, plusieurs présentent de réelles performances sur le plan diagnostique. Parallèlement à cette étude, nous avons mis au point une technique de séparation des différentes formes de TDM. La séparation des différentes formes de TDM devrait permettre de déterminer de façon précise les fonctions de ces composants majeurs de la paroi de M. tuberculosis et d'évaluer leur potentiel en terme de diagnostic.Mots clés : tuberculose, sérodiagnostic, détection antigène, détection anticorps, enzymes lipolytiques, glycolipide. / Tuberculosis (TB) is an infectious disease caused by M. tuberculosis. In 2009, mortality was high with 1,7 million of recorded deaths in the world. The co-infection by the HIV, in particular in Africa, and tuberculosis with multi-resistant bacilli to antibiotics, make the control of pandemia more complex. The current tests of diagnosis present gaps, in particular, in term of sensitivity for microscopy, which is currently the used test, or in term of praticity, for the culture which is considered as the gold standard.The development of new tests for the diagnosis of TB active represents a major challenge of our modern societies. The immunological tests, in particular the serologic tests available, can present an alternative to the currently bacteriological tests. However, their performances are not sufficient. That's why, it is essential to target new biomarkers which permit to establish an effective, sensitive, fast and cheap test. It is in this context that my study takes place.We report in this memory, the research of innovating markers for the development of a diagnostic test of tuberculosis. We targeted several protenic markers (OmpATb, LipY, Rv0183, Rv1984c and for Rv3452) and a glycolipid marker, the trehalose-6,6'-dimycolate (TDM). Among these candidates, several shown good performances for active TB diagnosis. In parallel to this study, a technique of separation of the various forms of TDM was developed. The separation of the various forms of TDM will permit to study their role on the biological activities and evaluate their potential in term of diagnosis.Key words: tuberculosis, serodiagnostic, antigen detection, antibody detection, lipolytic enzymes, glycolipid.

La tuberculose (TB) reste la maladie infectieuse la plus meurtrière au monde. L’absence de développement de médicaments accompagnée de l'émergence de la résistance aux molécules existantes se traduit principalement par l'échec du traitement et la mort. M. tb infecte l'homme par l'inhalation. Le patient peut rester en bonne santé sans aucun symptôme, on parle alors de tuberculose latente. Dans ce cas, la bactérie résider dans le macrophage. La principale caractéristique de M. tb est de rester cacher à l'intérieur de ces cellules, puis se réactiver lorsque le système immunitaire s’affaibli.Mon travail a été consacrée à l'étude de nouveaux analogues de Cyclophostin / Cyclipostins (CyCs) et Oxadiazolone. Nombreuses molécules présentaient des activités antibactériennes lorsque la bactérie était cultivée dans le milieu liquide ou à l'intérieur du macrophage sans aucun effet toxique sur les macrophages.En utilisant le meilleur inhibiteur de CyC17, nous avons identifié 23 protéines cibles potentielles, étant impliquées dans le métabolisme des lipides de M. tb et / ou dans la biosynthèse des lipides de la paroi cellulaire. Parmi ces cibles, Ag85C et TesA, ont été caractérisées biochimiquement et structurallemnent.De plus, nous avons établi que les CyC sont des inhibiteurs puissants et sélectifs de la croissance des mycobactéries. De manière intéressante, ces composés étaient également actifs contre de nombreuses souches cliniques de M. abscessus, un pathogène opportuniste également appelés « cauchemars pour les antibiotiques », ouvrant ainsi la voie à la recherche de solutions alternatives pour lutter contre les souches mycobactériennes résistantes. / Tuberculosis (TB) is one of the deadliest infectious diseases worldwide. The stagnation in drug development accompanied with the emergence of drug resistance mainly results in treatment failure and death. M. tb infect human through inhalation. Patient can remains healthy without any symptom in which case it is known as latent TB. In latent TB, the bacteria is known to be reside in the macrophage - a type of white blood cell of the immune system, that engulfs and digests infected microorganisms. The famous characteristic of M. tb is the ability to stay inside and avoid to be killed by these cells, then reactivate when the immune system is weak.My work was devoted to the study of two series of new compounds, namely analogs of Cyclophostin/Cyclipostins (CyCs) and Oxadiazolone (OXs). Many molecules exhibited antibacterial activities when the bacteria was grown in the liquid medium or inside the macrophage without any toxic effect to the macrophages.Using the best CyC17 inhibitor, we identified 23 potential candidate target proteins, being involved in M. tb lipid metabolism and/or in cell wall lipid biosynthesis. Among these targets, two important protein, i.e. Ag85C and TesA, were biochemically and structurally characterized.Moreover, we clearly established that the CyCs are powerful and selective growth inhibitors of mycobacteria, with no effect on Gram-negative or Gram-positive bacteria. Interestingly, these compounds were also active against numerous M. abscessus clinical strains, an opportunistic pathogens also called “nightmare for antibiotic”, thus opening the way to find alternative solutions to fight against resistant mycobacterial strains.

Les enzymes lipolytiques sont solubles en phase aqueuse mais hydrolysent des substrats insolubles. Leurs activités lipolytiques dépendent donc fortement de l’organisation des substrats lipidiques présents sous forme de structures interfaciales telles que des émulsions, des micelles, des liposomes, ou des bicouches lipidiques. Les propriétés cinétiques et la spécificité de substrat de ces enzymes résultent de l’étape initiale d’adsorption à l’interface lipide-eau et des interactions entre le substrat et le site actif. Dans le cadre de ce travail de thèse, la technique des films monomoléculaires a été utilisée pour étudier en détail les étapes séquentielles d’adsorption, de catalyse et d’inhibition de l’enzyme à l’interface lipide-eau. Dans une première partie, nous avons réalisé la caractérisation physico-chimique de la lipase gastrique de chien (DGL), avec l’étude :  de son adsorption sur un film non substrat de dilauroylphosphatidylcholine ; ‚ de l’hydrolyse interfaciale de la 1,2-dicaprine dans des films mixtes en présence d’Orlistat. Concernant l’étape de catalyse, nous avons étudié l’effet du propeptide sur la spécificité de substrat et l’activité interfaciale de la phospholipase A2 sécrétée de groupe X de souris. Enfin, dans une troisième partie, nous avons comparé les propriétés interfaciales de la lipase YLLIP2 de la levure Yarrowia lipolytica qui serait un bon candidat pour l’enzymothérapie de substitution chez les patients atteints d’insuffisance pancréatique exocrine (IPE), la lipase pancréatique humaine et la DGL. Nos résultats ont confirmé le rôle d’YLLIP2 en tant qu’excellent « substitut » non seulement de la HPL en cas d’IPE, mais aussi de la DGL. / Lipolytic enzymes are water-soluble whereas their substrates are insoluble in water. Their lipolytic activities depend strongly on the organization of the lipid substrates present in interfacial structures such as oil-in-water emulsions, micelles, liposomes, and membrane bilayers. The kinetic properties and substrate specificity of these enzymes result from both their adsorption at the lipid-water interface, and the interactions occurring between the substrate and the active site. In this thesis work, the monomolecular film technique was used to study in details the sequential steps of adsorption, catalysis and inhibition of model enzymes at the lipid-water interface. In a first part, we performed the physico-chemical characterization of the dog gastric lipase (DGL), by studying:  its adsorption onto a dilauroylphosphatidylcholine non-substrate film; ‚ its interfacial hydrolysis of 1,2-dicaprin in mixed films with various amounts of Orlistat. Regarding the catalysis step, we studied the effect of the propeptide on the substrate specificity and interfacial activity of the murine group X secreted phospholipase A2. A model of this enzyme with its propeptide was built from the available 3D structure of the corresponding mature human enzyme. Finally, in the third part, we compared the interfacial kinetic properties of YLLIP2 lipase of the yeast Yarrowia lipolytica which has been identified as a good candidate for enzyme replacement therapy for patients with exocrine pancreatic insufficiency (EPI), human pancreatic lipase and DGL. Our results confirmed the role of YLLIP2 as an excellent "substitute" not only for HPL in case of PEI, but also for the DGL at acidic pH values.