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Une géomorphologie complexe avec d'importantes structures de mouvements de masse sous-marins a été mise en évidence lors de levés géophysiques dans l'estuaire du St-Laurent entre Betsiamites et Rimouski, Québec. Cette étude présente une description morpho-sédimentologique du secteur, une analyse spatio-temporelle des mouvements de masse et finalement une chronologie proposant l'âge pour certaines des ruptures de pente répertoriées. Les structures observées sont associées à au moins quatre épisodes de mouvement de masse. Un premier mouvement de masse paraglaciaire daterait de 9 ka BP. Un second aurait causé de larges couloirs de glissement sur le plateau ainsi qu'un cône de sédiments dans le Chenal laurentien et daterait de 7.25 ka cal BP. Un troisième événement plus récent aurait été causé par le séisme de 1663 AD (M~7) et serait associé au glissement subaérien identifié sur la côte. Finalement une dernière coulée daterait de l'an 1860 AD ou 1870 AD.

Élucider l'importance relative des processus neutres ou sélectifs à la base de la variation génétique et phénotypique demeure une problématique fondamentale en écologie évolutive. Un sujet d'intérêt dans ce domaine de recherche tourne autour du rôle de la plasticité phénotypique: est-ce que la plasticité représente une alternative neutre à l'adaptation aux environnements divergents ou est-ce que la plasticité peut même faciliter le processus d'évolution adaptative? Dans cette thèse, j'essaie d'explorer ces thèmes en étudiant les dèmes parapatriques d'épinoche à trois épines. L'épinoche (Gasterosteus aculeatus) est devenu une organisme modèle en écologie évolutive, grâce aux exemples répliqués de divergence morphologique, suite à sa colonisation en eau douce partout dans son aire de répartition. Cependant, la divergence adaptative n'est pas un phénomène universel, et le potentiel plastique chez ce modèle semble avoir été négligé dans des études récentes. L'estuaire du fleuve St-Laurent se présente comme un système idéal pour étudier les dynamiques évolutives sur une échelle contemporaine, grâce à son age relativement récent et son écosystème défini par une variation environnementale clinale et discrète. Pour ces recherches, j'utilise une combinaison d'observations et d'expériences pour décrire la variation au sein d'une population naturelle, ainsi qu'inférer les mécanismes responsables. Une analyse des données multi-locus et géoréférencées à l'aide d'un modèle bayésien a révélé que le paysage génétique est divisé prinicpalement en deux zones, eau douce et eau salée. Une modélisation des données écologiques a démontrée aussi que la plus grande proportion de la variation génétique (31,5%) est associée avec la co-variation environnementale. Les normes de réaction pour la survie confirment que les dèmes sont adaptés aux conditions de salinité locale. Des analyses comparatives en génétique quantitative du niveau d'expression des gènes candidats pour l'osmorégulation suggèrent un mécanisme putatif responsable pour la divergence adaptative. L'enzyme ATP-ase sodium-potassium (ATP 1 Al) est ciblée comme un candidat pour l'osmorégulation en eau douce. En plus de la variation héréditaire pour son expression, le niveau d'expression pour ce gène semble être corrélé avec un indice de fitness. Les dèmes se différencient aussi dans la fréquence des alleles, ainsi que dans les fréquences de divers groupes de parasites. Une analyse des substitutions nucléotidiques a indiqué de forts signaux de sélection naturelle, surtout chez le dème eau douce. Les relations entre les données par rapport aux niveaux de parasitisme ainsi que de diversités génétique en gènes immunitaires étaient indicatrices de sélection balancée. Par contre, les signaux pour la sélection des partenaires en fonction de la diversité CMH étaient faibles, et sembleraient être dépendants du contexte environnemental. Les individus provenant des deux dèmes, eau douce ou maritime, ressemblent à la forme ancestrale pour le nombre de plaques latérales. La morphologie corporelle différait entre les dèmes, mais plus entre les sexes. Quoiqu'il y ait de la variation héréditaire pour la morphologie, j'ai trouvé aucun indice de sélection diversifié entre dèmes, ce qui suggère que la variation entre dèmes était en relation avec de la plasticité phénotypique. Ensemble, ces données soulignent l'importance de considérer les traits autre que morphologiques, surtout les traits intrinsèquement plastiques tels que la physiologie, en écologie évolutive.

Chez les mammifères, la date de naissance et les soins maternels peuvent moduler les chances de survie de la progéniture. Cette étude visait à évaluer l’impact des facteurs environnementaux (e.g. climat, océanographie, disponibilité des ressources alimentaires) et individuels (e.g. sexe de la progéniture) sur la phénologie des naissances, la croissance pré-sevrage et l’apport alimentaire lacté des chiots phoque commun du Saint-Laurent. Une méta-analyse sur 7 cohortes a révélé un impact positif de la température de l’eau à l’hiver sur les dates de mise-bas et une corrélation positive entre le succès d’élevage et l’abondance de hareng. L’étude montre différents patrons d’utilisation de l’espace pour l’allaitement et des soins maternels biaisés en faveur des mâles que nous expliquons par leur dépense énergétique et leur sollicitation supérieures aux femelles. Ce mémoire montre la sensibilité du phoque commun aux changements environnementaux et l’importance des considérations comportementales dans l’établissement du bilan énergétique des chiots allaités. / In mammals, birth date and maternal care can affect offspring survival probabilities. This project aimed to assess the impact of environmental (e.g. climate, oceanography and food availability) and individual (e.g. offspring sex) factors on birth phenology, pre-weaning growth and milk intake in the St. Lawrence harbour seal. A meta-analysis on 7 cohorts revealed a positive impact of water temperature during winter on birth dates and a positive correlation between rearing success and herring abundance. This study revealed different patterns of space utilisation for nursing and biased maternal cares towards males that we explain by their greater energy expenditure and solicitation compared to females. This study shows the harbour seal sensitivity to environmental change and the importance of behavioural considerations when assessing the energy budget of pups during lactation.

Les pinnipèdes adoptent des stratégies d’allaitement alternatives associées à plusieurs facteurs affectant les capacités du couple mère-petit à rester en contact, notamment la mobilité des jeunes et la fréquence des absences maternelles. Contrairement à la plupart des espèces de phocidés, les femelles phoque commun s’alimentent en mer en cours de lactation et leurs chiots sont très mobiles de la naissance au sevrage. Cette étude visait à caractériser le système de reconnaissance vocale mère-petit chez cette espèce. Les cris des chiots portent un niveau d’individualité intermédiaire comparativement aux valeurs généralement rapportées chez les deux grandes familles de pinnipèdes. Les femelles reconnaissent les cris de leur progéniture, capacité corrélée au niveau d’individualité vocale de leur chiot. Il existe d’importantes différences intra-colonies quant à l’efficacité de propagation des vocalisations. Ces résultats nous renseignent quant à l’influence des contraintes écologiques et environnementales sur l’évolution de la reconnaissance vocale chez le phoque commun. / Pinnipeds adopt contrasting maternal strategies, which are associated with ecological factors affecting the difficulties encountered by mother-pup pairs to maintain contact throughout the rearing period. These include offspring mobility and the frequency of maternal absences. As opposed to most phocid species, harbour seal females forage at sea during lactation and their pups are highly mobile from birth to weaning. The objective of this study was to characterize the mother-pup vocal recognition system in this species. Pup calls convey an individual stereotypy level intermediate between that typically found in the two main families of pinnipeds. Females recognize the calls of their pup among others, a capacity that is correlated to the individual stereotypy level of pup voice. The propagation efficiency of pup calls vary considerably among mother-pup reunion sites. These results provide insights as to the influence of ecological and environmental constraints on the evolution of vocal recognition in harbour seals.

Cette étude présente des estimations de la valeur économique du rétablissement des mammifères marins de l'estuaire du Saint-Laurent. Ces valeurs, appelées valeurs passives, sont estimées en utilisant la méthode d'évaluation économique des préférences déclarées via un sondage Internet réalisé en 2006 à l'échelle du Canada. La méthode des préférences déclarées identifie les compromis que les Canadiens sont prêts à faire entre les composantes de différents programmes de conservation, incluant le coût. Les choix des Canadiens révèlent implicitement une estimation de la valeur économique qu'ils accordent au rétablissement des mammifères marins de l'estuaire du Saint-Laurent, ce qui se traduit par une mesure des bénéfices économiques des plans de rétablissement des espèces en péril. Afin de développer les différents scénarios d'options, des groupes de discussions ont été formés pour identifier comment les gens caractérisent les problèmes inhérents aux programmes de conservation des espèces en péril. Le questionnaire a été prétesté afin de déterminer une gamme appropriée de valeurs monétaires, de corriger les problèmes d'ambiguïté et de réduire le temps nécessaire pour remplir le questionnaire. Recueillie en avril 2006, la base de données contient les réponses de 2006 Canadiens. Afin d'examiner les différences régionales, la province de Québec a été suréchantillonnée en ayant 400 répondants. Le sondage a aussi été élaboré de manière à y inclure une variété de contrôles de la validité. Deux types de résultats sont présentés dans ce mémoire : (1) des statistiques sur les attitudes, les connaissances et les opinions sur la protection de l'environnement et les mammifères marins de l'estuaire du Saint-Laurent et (2) l'estimation de la valeur accordée par les Canadiens aux différentes options de rétablissement des mammifères marins de l'estuaire du Saint-Laurent (valeur d'usage passif). Les analyses qui utilisent les résultats de cette étude devraient tenir compte du fait que ces estimations n'incluent ni les cobénéfices associés au rétablissement des mammifères marins tels les impacts positifs sur d'autres espèces, ni les valeurs d'usage actif. En réponse aux questions concernant les attitudes sur la protection de l'environnement, nous avons trouvé que, parmi un ensemble d'objectifs nationaux, les Canadiens désirent plus d'action pour la protection de l'environnement mais encore plus pour l'amélioration du système de santé qui est leur première priorité parmi une liste de huit enjeux. La protection des espèces en péril se positionne sixième en importance tandis que la réduction de la pollution de l'air et de l'eau arrive deuxième. Les gens qui pratiquent des activités de plein air sont plus disposés à payer pour une protection accrue des espèces en péril que ceux qui n'en pratiquent pas. Enfin, les Canadiens ne semblent pas accorder d'importance à la localisation des espèces en péril à l'intérieur du Canada; ils sont tout aussi soucieux pour les mammifères marins en péril de leur région que pour ceux vivant ailleurs au Canada. Les valeurs économiques ont été estimées pour plusieurs programmes de rétablissement des mammifères marins présentant différents impacts sur quelques espèces. Cette variété de programmes a été choisie afin d'identifier la valeur des différents niveaux d'efforts de conservation. Les estimés des consentements à payer (CAP) pour l'ensemble des niveaux de rétablissement des mammifères marins vont de 82 $ à 242 $ annuellement par ménage. Les CAP offrent de l'information sur la valeur des programmes de conservation et la valeur marginale des différentes tailles des programmes de conservation. Une série de tests a révélé que les gens sont prêts à payer plus pour les programmes qui contribuent à de plus grandes augmentations des populations de mammifères marins. Les résultats indiquent cependant que les répondants accordent une valeur relativement faible aux programmes qui amélioreraient le statut des mammifères marins au-delà du statut " préoccupant ". Autrement dit, les Canadiens sont clairement prêts à débourser pour un rétablissement des espèces ayant le statut " menacées " ou " en voie de disparition " vers un statut " préoccupant ", mais ils sont moins disposés à payer pour un rétablissement au-delà de ce niveau. Il semble que les Canadiens comptent beaucoup sur l'évaluation scientifique des niveaux de risque associés aux différentes populations de mammifères marins. À l'opposé des autres études qui ont montré que la valeur d'usage passif baisse avec la distance entre les répondants de l'emplacement où se situe l'enjeu environnemental, cette étude révèle que la valeur d'usage passif des mammifères marins ne varie pas avec la distance. Les Québécois qui habitent près de l'estuaire du Saint-Laurent ont le même consentement à payer pour le rétablissement des mammifères marins que ceux qui habitent loin. D'autre part, le consentement à payer des Québécois est moindre que celui des autres Canadiens. Cette différence provient probablement des différences économiques, démographiques et culturelles entre les Québécois et les citoyens du reste du Canada, plutôt que des différences géographiques liées à la distance de l'estuaire du Saint-Laurent. Parce que cette recherche fournit des estimations du consentement à payer des Canadiens pour les bénéfices perçus des différents scénarios de rétablissement des mammifères marins protégés selon la Loi sur les espèces en péril, les résultats peuvent être utilisés par Pêches et Océans Canada dans le processus de choix de politiques. Par exemple, les bénéfices mesurés dans cette étude peuvent être comparés aux coûts des différents programmes de rétablissement pour évaluer les bénéfices nets de ces programmes. Ces estimés sont supposés représenter les montants que le public est prêt à payer pour des programmes de rétablissement s'il se voit offrir le choix entre les programmes et les coûts. Comme pour toutes les évaluations basées sur des préférences déclarées, des préoccupations existent quant à l'adéquation entre les valeurs obtenues et celles d'un vrai référendum ou d'une décision d'allocation. Afin d'atténuer ce problème, un effort significatif a été fait pour vérifier la validité des résultats, réduire le biais hypothétique et fournir des estimés conservateurs. Bien entendu, il y a d'autres considérations au-delà des coûts et des bénéfices des programmes de rétablissement qui ont de l'importance dans le processus de choix de politiques de protection des espèces en péril.

La distribution et l'abondance de deux espèces d'algues vertes filamenteuses (Ulothrix flacca et Urospora penicilliformis) ont été étudiées le long d'un gradient d'émersion dans la zone intertidale de l'estuaire maritime du Saint-Laurent. Des régressions multiples ont été effectuées pour modéliser l'abondance de ces algues en fonction de la hauteur, de la pente, de l'orientation géographique, de l'abondance de l'autre espèce ainsi que du taux d'évaporation. Bien que les facteurs environnementaux varient selon le critère statistique utilisé, U. flacca apparaît moins tolérante à la dessiccation qu'U. penicilliformis puisqu'on la retrouve généralement dans des conditions où le stress d'émersion est réduit (e.g., plus bas sur la rive). Des transplantations réciproques ont montré qu'U. flacca adulte est apte à survivre en milieu plus aride mais qu'U. penicilliformis ne supporte pas la vie dans une zone plus longtemps immergée en raison de la compétition avec les diatomées. Cela est supporté par les résultats obtenus lors d'une expérience de perturbation du tapis d'U. flacca visant à réduire la compétition dans les zones inférieures. / The distribution and abundance of two species of co-occurring filamentous green algae (Ulothrix flacca and Urospora penicilliformis) were examined along a cross-shore intertidal gradient in the St. Lawrence maritime estuary. Multiple regressions were used to model the abundance of these algae with respect to tidal height, substratum slope, surface orientation, algae abundance, and evaporation rates. Although the environmental factor of importance varied according to the statistical criterion used, it appears that U. flacca is less tolerant to desiccation than U. penicilliformis as it was generally found in habitats where emersion stresses are reduced (e.g., lower on the shore). Reciprocal transplants demonstrated that adult stages of U. flacca are, however, able to survive in higher zones, but U. penicilliformis appears unable to thrive in the lower zone due to competition with diatoms, a result supported by experimental perturbation of the U.flacca mat to reduce competition in the lower zones.

Notre étude avait pour objectif d'évaluer l'influence des covariables environnementales sur le comportement d'échouerie et de développer des facteurs afin de corriger, pour les individus non échoué durant les survols aériens, l'estimation de l'abondance de la population de phoques communs du St-Laurent. 14 phoques ont été équipés avec un transmetteur à très haute fréquence (VHF) pour déterminer la proportion de phoques à l'eau lors des comptages aériens. Nous avons utilisé des modèles additifs pour étudier la relation entre le nombre de phoques échoués à Métis durant l'été et différentes covariables; le nombre d'heures par rapport à la marée basse et son amplitude avaient la plus grande influence. Des facteurs de correctiçms de 2.4 (Juin) et de 2.5 (Août) ont été estimés. Les recensements futurs devraient avoir lieu en juin et pouraient d~buter quatre heures avant la marée basse. Depuis 1976, la population de phoques communs de l'Estuaire du St-Laurent augmente.

Le régime alimentaire est influencé par la disponibilité des ressources et les préférences des consommateurs. Dans l'estuaire Saint-Laurent, l'escargot Littorina saxatilis se nourrit de deux types d'algues: diatomées et algues vertes. Dans les expériences de laboratoire, les escargots préfère fortement les diatomées, mais lorsque les attributs structurels des algues sont enlevés, cette préférence a diminué, ce qui suggère que certaines caractéristiques alimentaires (ex. l'ingestion) affectent ces préférences. La densité des escargots sur terrain est plus élevée sur les diatomées. Les expériences sur le terrain et au laboratoire ont montré que le régime alimentaire a un effet sur les traits d'histoire de vie des escargots avec les diatomées offertes dans un régime monospécifique ou mixte qui a amélioré la croissance des escargots, mais pas la fécondité. Cette étude montre que cet herbivore a des préférences alimentaires et que le régime alimentaire préféré peut améliorer certaines caractéristiques de leurs traits de vie. / Diet is influenced by both food availability and the feeding preferences of consumers. In St. Lawrence maritime estuary, the herbivorous intertidal snail Littorina saxatilis feeds on two different functional groups of algae: chain-forming diatoms and filamentous green algae. In laboratory experiments, it strongly preferred diatoms, but when structural attributes of the algae were removed, this preference was weaker, suggesting that some aspect of feeding (e.g., ingestion) influences preferences. Densities of snails in the field were much higher on diatom-dominated habitats, consistent with preferences observed in the laboratory. Experiments in the field and laboratory found that diet also affected life history traits of snails with diatoms provided in monospecific or mixed diets increasing juvenile growth rates, but not fecundity. This study shows that this herbivore has dietary preferences and that a diet of its preferred food can positively affect certain life history characteristics.

On trouve sur les côtes de l’estuaire du Saint-Laurent des vestiges de quai dont la ressemblance mutuelle suggère leur contemporanéité. Les vestiges de ces «quais du gouvernement » relatent une importante conjoncture (1870-1930) caractérisée par l'intégration des localités côtières dans une économie interrégionale. Le quai, autrefois lieu d'interface entre la ruralité et le cabotage, devient pour l'archéologue une occasion de retracer les éléments entrant dans sa conception et sa réalisation. L’observation des éléments architecturaux permet de distinguer les traits architecturaux associés aux quais du gouvernement parmi l’ensemble des techniques de construction déjà employées dans l’estuaire au XIXe siècle. / In the St. Lawrence estuary, there are many ancient wharves whose mutual resemblance of their remains suggests they are contemporaneous. The remains of the “government wharves” relate an important conjecture (1870-1930) formed by the integration of the coastal localities in an interregional economic network. The wharf, formerly an interface between the rural land and the estuarial cabotage, presents an opportunity for the archaeologist to recognize the architectural character of the conception and the realization of the wharves. The examination of their frame construction allows us to distinguish the architectural character of the government wharves among the techniques already employed in the estuary in the 19th century.